Caracas, 6 de marzo de 2012 Unidad Educativa Colegio Los Arcos Integrantes: Feliciano Acevedo, Matias Rizziteli A.

En qu consiste la tcnica de difraccin de rayos X? La Difraccin de Rayos X: Son interferencias pticas que se producen cuando una radiacin monocromtica atraviesa una rendija de espesor comparable a la longitud de onda de la radiacin. Los Rayos X tienen longitudes de onda de Angstroms, del mismo orden que las distancias interatmicas de los componentes de las redes cristalinas. Al ser irradiados sobre la muestra a analizar, los Rayos X se difractan con ngulos que dependen de las distancias interatmicas. El mtodo analtico del Polvo al Azar o de Debye-Scherrer consiste en irradiar con Rayos X sobre una muestra formada por multitud de cristales colocados al azar en todas las direcciones posibles. Para ello es aplicable la Ley de Bragg: n = 2d. sen, en la que d es la distancia entre los planos interatmicos que producen la difraccin. La difraccin de rayos-x es un mtodo de alta tecnologa no destructivo para el anlisis de una amplia gama de materiales, incluso fluidos, metales, minerales, polmeros, catalizadores, plsticos, productos farmacuticos, recubrimientos de capa fina, cermica y semiconductora. La aplicacin fundamental de la Difraccin de Rayos X es la identificacin cualitativa de la composicin mineralgica de una muestra cristalina. Otras aplicaciones son el anlisis cuantitativo de compuestos cristalinos, la

determinacin de tamaos de cristales, la determinacin del coeficiente de dilatacin trmica, as como clculos sobre la simetra del cristal y en especial la asignacin de distancias a determinadas familias de planos y la obtencin de los parmetros de la red.

2) Resee brevemente los mas resaltantes datos biogrficos y la participacin de Rosalind Franklin. Rosalind Elsie Franklin fue una mujer muy importante en nuestra historia. Ella ha naci un 5 de julio de 1920 en Londres, Inglaterra y, lleg a convertirse en una cientfica britnica que ha tenido un papel destacado en el mayor hito del desarrollo de la biologa molecular, el descubrimiento de la estructura del ADN. Rosalind se ha recibido en Qumica fsica en el ao 1945 en la Universidad de Cambridge.

Ella estudi las tcnicas de difraccin de rayos X durante tres aos en el Laboratorio Central de Servicios Qumicos del Estado, de Pars. Esta mujer luego de haber estudiado afuera, regresa a Inglaterra para trabajar como investigadora asociada en el laboratorio de John Randall en el King's College de Londres. Ella se ha caracterizado por ser una mujer de personalidad fuerte que ha mantenido una relacin compleja con Maurice Wilkins, quien ha mostrado sin su permiso sus imgenes de difraccin de rayos X del ADN a James Watson y Francis Crick.

Franklin vivi este hallazgo que no ha sido casual, sino que Franklin demostr su habilidad para obtener las mejores imgenes y para interpretarlas certeramente en la investigacin de otros objetos, como la estructura del grafito o la del virus del mosaico del tabaco.

Finalmente Franklin muere prematuramente, de cncer de ovario, en el ao 1958 en su ciudad natal; con toda probabilidad por efecto de las repetidas exposiciones a las radiaciones en el curso de sus investigaciones. Tiempo despus se le hace entrega del Premio Nobel de Fisiologa a Watson, Crcik y Wilkins. Esto produjo controversia debido a que en una de la reglas de dicho premio es que no puede ser otorgado personas que hayan fallecido, por lo que Rosalind Franklin que haba fallecido en 1958 no se poda tomar como candidata para ste. Por ello es que le dieron a Wilkins el premio en lugar de a ella. 3) Analice los resultados y el aporte relevante de Chargaff?

Hasta antes de los experimentos de Chargaff, se crea que los cidos nucledos se repetan en cadenas largas, sin tener variabilidad alguna, ni capacidad para almacenar informacin. Pero luego l comenz en 1950 con su experimentacin, utilizando la tcnica de la cromatografa mediante la cual separ los 4 tipos de bases nitrogenadas que componen el ADN, y utilizando medios cuantitativos, determin la cantidad:

Adenina (A) es similar en nmeros a la Timina (T)

Citosina (C) es similar en nmeros a la Guanina (G)

Despus de stas dedujo otras conclusiones: I. Que la cantidad de Adenina sumada con la de Guanina es igual a la cantidad de Timina sumada con la de Citosina. Sin embargo no necesariamente la cantidad de Citosina ms la de Guanina es igual a la de Adenina ms Timina. II. Rechaza la Hiptesis del Tetranucletido, al demostrar que A+T= C+G, vara de proporcin por cada individuo, de acuerdo a las caractersticas de su organismo. III. Asevera que hay patrones definidos en la composicin de bases, es decir, que stas no deben enlazarse de acuerdo al orden, sino de acuerdo a la pareja de cada una, ya que establece que debido al nmero similar que hay entre A y T y C y G; A siempre debe unirse con T, al igual que C debe enlazarse con G, mientras que este patrn de combinaciones se cumpla, se cumplir correctamente la constitucin del material gentico. IV. Como ltima acotacin, Chargaff menciona que para que la relacin A y T y C y G, l material gentico debe estar conformado por una doble hlice

6) Investigue las condiciones y caractersticas de los llamados puentes de hidrgeno Por qu los califican como enlaces secundarios? El puente de hidrgeno es un tipo de enlace muy particular, que aunque en algunos aspectos resulta similar a las interacciones de tipo dipolo-dipolo, tiene caractersticas especiales. Es un tipo especfico de interaccin polar que se establece entre dos tomos significativamente electronegativos, generalmente O o N, y un tomo de H, unido covalentemente a uno de los dos tomos electronegativos. En un enlace de hidrgeno tenemos que distinguir entre el tomo DADOR del hidrgeno (aquel al que est unido covalentemente el hidrgeno) y el ACEPTOR, que es al tomo de O o N al cual se va a enlazar el hidrgeno. El tomo dador representado por el enlace O-H, el cual est muy polarizado por la elevada electronegatividad del oxgeno y por el hecho de que el nico protn del ncleo del hidrgeno atrae dbilmente a los electrones del enlace. As, se estima que la carga positiva sobre el hidrgeno es de 0,4 unidades. En el caso de que el tomo electronegativo sea nitrgeno la situacin es similar, aunque dada la menor electronegatividad del nitrgeno la polarizacin del enlace va a ser algo menor. Por su parte, el aceptor va a ser un tomo electronegativo (otra vez oxgeno o nitrgeno) pero con una peculiaridad: el hidrgeno se va a unir a un orbital ocupado por dos electrones solitarios. Estos orbitales tienen una densidad de carga negativa alta, y por consiguiente se pueden unir a la carga positiva del hidrgeno. El enlace de hidrgeno presenta un cierto carcter covalente. O, lo que es lo mismo, podemos considerar que el enlace resuena entre estas dos posibles estructuras: En condiciones ptimas esto supone un 10% de carcter covalente. Una consecuencia importante de esta resonancia es que se pueden intercambiar los hidrgenos de una molcula con los hidrgenos del agua disolvente. Este fenmeno se aprecia fcilmente si la molcula se disuelve en agua pesada D2O;

si los hidrgenos son accesibles al disolvente, se intercambian por deuterio: La distancia interatmica entre el hidrgeno y el aceptor es menor que la suma de sus radios de Van der Waals, (0,27 nm, aprox. para un par Oxgeno-Hidrgeno), aunque estn ms separados que si estuvieran unidos por un enlace covalente puro: La energa del enlace de hidrgeno depende del ngulo de enlace; es mxima cuando los tres tomos (dador-hidrgeno-aceptor) estn alineados y disminuye cuando se disponen en ngulo. Es un enlace muy direccional aunque pequeas variaciones de hasta 20 no tienen demasiada importancia. Por ltimo, la energa de un enlace de hidrgeno depende de los aceptores y dadores. De mayor a menor energa de enlace tenemos las siguientes posibilidades: En condiciones ptimas la energa de un enlace de hidrgeno puede alcanzar unos 23 kJ/mol (unas 15 veces ms que la energa de las fuerzas de dispersin de London). La fuerza relativamente alta de estos enlaces y su direccionalidad hacen que sean muy importantes en la estructura de las macromolculas. Un ejemplo bien conocido es el emparejamiento de bases en el ADN. Por ejemplo, en este par GC perteneciente a un dodecmero cuya estructura en disolucin ha sido determinada por RMN, lo que permite visualizar los tomos de hidrgeno.

7) En qu consista y cmo ocurra el modelo de Watson y Crick? Antes del modelo de Watson y Crick se desarrollaron tres posibles hiptesis de replicacin del ADN: la conservativa, en que la doble cadena hace de molde de otra doble cadena igual; la semi-conservativa (propuesta en el modelo), en la que cada hebra sirve de molde para fabricar la cadena complementaria, con lo que se obtienen dos dobles hlices; y la dispersiva, en la que la replicacin se hace a trozos dispersos ms o menos al azar que luego se unen y forman dos dobles hlices con secuencias de distintos orgenes. Meselson y Stahl elaboraron, sobre la base del modelo de Watson y Crick, experimentos de centrifugacin diferencial de ADN en gradientes de CsCl segn tuviera el istopo 15N o el normal 14N. Los resultados de los ensayos slo son coherentes con el modelo semiconservativo y, adems, descartan cualquier otro propuesto hasta la fecha. El estudio de la estructura secundaria del ADN arranca desde el modelo de Watson y Crick de doble hlice de ADN. Ellos propusieron su modelo en una coyuntura cientfica en la que se saban los siguientes datos. Como ya desde Avery se haba confirmado que el ADN es el material gentico, se dedujo que ste tena que tener propiedades: Ser perpetuable, llevar a una compleja estructura la informacin, complementndose con las reglas conocidas de Chargaff, la estructura de doble hlice y, que deba existir un mtodo de replicar el ADN. Los datos de cristalografa de los que disponan Watson y Crick se determinaron a partir de aislado de ADN nuclear en solucin y no muy puro. Estos datos se determinan mediante el estudio de la difraccin de un haz de rayos X al atravesar una muestra convenientemente tratada y en estado cristalino. Como los rayos X tienen una longitud de onda comparable a la distancia internuclear, la desviacin que se provoque y la posterior impresin en una pelcula ser representativa de la estructura del material que se traspasa. Si ese material tiene estructura cristalina, es decir, repetitiva, se generar una difraccin coherente. En el caso del ADN, las molculas se pueden estirar y disponerse todas paralelamente de modo que los rayos X incidan perpendicularmente. Los expertos

de cristalografa consiguieron determinar algunas de las periodicidades del ADN: cada 3,4 y cada 34 , adems de una estructura helicoidal. Posteriormente se ha descubierto que estos datos son resultado de un promedio, porque el ADN presenta muchas estructuras distintas, aunque parecidas. Con los datos disponibles, Watson y Crick determinaron un modelo de ADN que ha sido plenamente demostrado y que, adems, se conoce como el tipo mayoritario de ADN en la clula. ste se estructura como una doble hlice antiparalela (cada cadena va en un sentido) y plectonmico (no se pueden separar estirando solamente de una de las dos cadenas) arrollada a derechas. En ella las bases estn en el interior y el esqueleto de azcar-fosfato en el exterior. En su modelo las bases aparean A con T y C con G, es decir, una purina con una pirimidina y en un plano perpendicular al eje de la hlice, pero que luego se ha visto que tiene un pequeo ngulo de -6. El apareamiento descrito es el nico posible compatible con el modelo de ADN, aunque luego se han determinado otros apareamientos diferentes merced a una configuracin distinta de puentes de hidrgeno y tautmeros. El paso de la hlice es de 35,7 (cercano a los 34 que se observaban en cristalografa), y la altura de cada residuo es de 3,4 , exactamente lo que se observaba en cristalografa. Cada par de bases provoca un giro de 34,3 en la hlice, lo que lleva a que cada vuelta tenga 10,5 pb por vuelta. El dimetro de la doble hlice es de 20 y es independiente de la secuencia, dado el apareamiento nicamente de purinas con pirimidinas, ya que de otro modo sera variable y hara la hlice inestable. Esto permite almacenar informacin siempre del mismo modo pero independientemente de la secuencia sin alterar la estructura. El eje pasa entre las bases de cada par, justo por las zonas de interaccin de puentes de hidrgeno. La doble hlice determina dos surcos de distinta anchura: el mayor y el menor. Esto se debe a las caractersticas antes citadas, principalmente por tres causas: I. II. La base no est centrada en la estructura del nucletido. Las cadenas corren antiparalelas.

III.

Las bases tienen que aparear, con lo que se determina bastante la estructura.

Esto provoca que las dos hlices no discurran exactamente una frente a la otra, sino ligeramente desplazadas, de ah los surcos de distinta anchura. Teniendo en cuenta la tautomera de las beses, los puentes de hidrgeno slo pueden se los que describe el modelo, y como el dimetro es constante, la distancia entre C1' tambin es constante, exactamente de 10,85 . Ya se ha mencionado que pueden aparecer en determinadas estructuras distintas de la del modelo de Watson y Crick puentes de hidrgeno diferentes entre tautmeros diferentes de cada base. As se generan apareamientos inversos de Watson y Crick, o tambin de Hoogsten, en los que cambia tanto la configuracin de los puentes de hidrgeno como los tomos implicados en su formacin. El modelo que describieron Watson y Crick es muy bueno porque aporta la idea del apareamiento de bases como algo bsico en Biologa molecular, permite e incluso sugiere un mtodo de replicacin, propone el antiparalelismo como uno de los elementos caractersticos de los cidos nucleicos. Adems, introduce el concepto de empaquetamiento de bases y excluye la posibilidad de la inclusin de molculas de agua entre ellas. Los modelos anteriores partan de la idea de una escalera en la que las bases fueran los peldaos, pero esto deja 6,8 de distancia, que es suficiente para que entren molculas de agua y la hagan inestable. El hecho de enrollar la escalera permite el acercamiento de los pares de bases hasta los 3,4 , que es justamente la distancia ptima de interaccin mediante fuerzas de Van der Waals e interacciones hidrofbicas, adems de excluir fsicamente el agua. Todo esto redunda en una mayor estabilidad del ADN. Como consecuencia del modelo de ADN de Watson y Crick se permite la creacin de teoras sobre la replicacin y la mutacin del ADN. El hecho de tener dos cadenas, cada una complementaria de la otra, provoca automticamente la aparicin de dos moldes, cada uno de los cuales puede dar lugar a una copia, cada una para cada clula hija. La duplicacin de la informacin provoca

automticamente el aumento de la seguridad y la proteccin del material gentico, adems de porque la estructura es muy cerrada y las bases estn protegidas en el centro frente a agresiones qumicas del exterior. Este modelo del ADN representa la estructura de ADN ms comn en la clula, llamada ADN-B. Adems de esta estructura, tambin se han encontrado otras variantes en determinados sitios del genoma. Estos cambios se producen en secuencias muy cortas y suelen tener implicaciones importantes en la regulacin de la expresin gnica porque representan cambios reconocibles en la superficie de la molcula de ADN. Los cambios estructurales responden a cambios en la conformacin de los enlaces de los nucletidos: conformacin endo o exo, anti o syn, y todos los dems enlaces que implican al fosfato y los carbonos del esqueleto externo.

8) Lectura: 8.1) Analiza en un mximo de 10 lneas, resuma su anlisis de la situacin planteada por los autores: En este texto se plasma la intencin de crear conciencia acerca del melanoma un tipo de cncer que causa el crecimiento de la tasa mortalidad en un alto porcentaje llegando a afectar hasta 44 mil personas en los Estados Unidos de Norte Amrica. Dando el ejemplo de la nadadora Raquel, cuya entrenadora al ver el lunar que presentaba en la piel le sugiri que fuera a ver a un mdico, para revisarlo. Al momento de la cita el doctor le recomend extrarselo, ya que podra ser un tumor maligno, cuando se obtienen los anlisis del lunar, sale positivo el resultado de ser cancergeno. Por ello siempre los nuestros padres y doctores nos sugieren que usamos cremas protectoras al momento de echarse al sol, cuando ests en la playa, en la piscina o en donde sea, porque el Sol es uno de lo ms dainos, si no se toman las medidas necesarias. 8.2) De forma genrica resalte la relacin planteada entre el ADN, ciclo celular y

el cncer. Los tumores que se producen en el organismo del humano, pueden ser causadas por diversas causas, aunque especficamente en el texto toman como referencia el efecto de la luz solar, que por una quemadura de tercer grado o simplemente por pasar una tarde calurosa en la playa, sin colocarse protector puede causar que el sol, afecte en el cdigo gentico presente en el ADN,

alterando en s la unin de la timina, colocndole en vez de la adenina una guanina. Para el desarrollo de estas consecuencias, debe pasar el ADN por muchas alteraciones gnicas. A medida que pasa el tiempo y, que las clulas se van contaminado cada vez ms, a su vez van disminuyendo su obediencia sin responder a las rdenes del mecanismo regular de ellas. Ya cuando se est en este punto, es porque se va culminando la transformacin de clulas normales a clulas cancergenas

8.3) Entendiendo que el ADN es poli nucletido Cmo se puede explicar la diversidad de informacin hereditaria y la afeccin citada en este articulo de la radiacin ultravioleta? Debido a las bases nitrogenadas, no a su composicin ni a su complementacin; sino a su orden y secuencia. Cada individuo tiene un material gentico diferente, porque el orden que tiene cada persona en su material gentico, lo que permite a su vez que haya tanta diversidad entre todos los habitantes del mundo. Tambin se debe destacar que el melanoma como agente infeccioso que es hace que los cidos nucledos se posean especificados, que le den la funcin contaminante. En estas especificidades recae alterando el ciclo nicamente en algunas clulas. el efecto de la luz ultravioleta,