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Classificao dos organismos vivos Woese (1978): baseado na sequncia de ribonucleotdeos do rRNA
Archaeobacteria : bactrias que produzem metano, requerem altas conc. de sal ou altas temperaturas (ambientes/condies extremas) Eubacteria: todas as demais bactrias (patognicas ou no) Eucaryotes: protozorios, fungos, algas, plantas e animais os trs domnios:
MICROBIOLOGIA: bsica e aplicada Microbiologia bsica conhecimento sobre clulas e populao microbiana 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. Caractersticas morfolgicas Fisiologia Metabolismo Caractersticas genticas Patogenicidade Ecologia (ocorrncia natural e interao com outros organismos) Classificao
Microbiologia aplicada utilizao de microrganismos em diversas reas: medicina, agricultura, produo de alimentos, indstria e meio ambiente -Produo de substncias em escala industrial (suplementos alimentares, combustvel, etc.) -Degradao de substncias txicas -Inseticidas biolgicos -Diagnstico de doenas e produo de vacinas -Produo de medicamentos -Etc...
Procariotos
bactrias e cianobactrias 5 100 m aerbico
Eucariotos
protistas, fungos, plantas e animais
circular no citoplasma, no associado a longas molculas organizadas em histonas cromossomos; protegido por envoltrio nuclear sintetizados no mesmo compartimento RNA: sntese/processado no ncleo; ribossomos 70S protenas, no citoplasma; ribossoms 80S ausncia de citoesqueleto; ausncia de endocitose e exocitose cromossomo se separa atracado membrana; fisso binria maioria unicelular em geral presente, composio qumica complexa ausncia de carboidratos e esterides citoesqueleto; endocitose e exocitose cromossomos se separam pela ao do citoesqueleto; mitose maioria multicelular, com diferenciao de muitos tipos celulares quando presente, quimicamente simples Esterides e carboidratos presentes
RNA e protena Citoplasma Diviso celular Organizao celular Parede celular Membrana plasmtica
1. PROTOZORIOS
eucariotos unicelulares; absorvem ou ingerem partculas alimentares; mobilidade atravs de pseudpodes, clios ou flagelos; variedade de formas podem ser parasitas ou de vida livre reproduo as(sexuada)
Esporozorios: tipo de protozorio que forma corpo de repouso durante o ciclo de vida
Spirogyra
Euglena
3. FUNGOS
Leveduras: apresentam forma variada (esfrica, elptica, filamentosa) espcies patognicas produo de bebidas fermentadas, panificao
Geotrichum candidum
Saccharomyces cereviae
Candida sp.
HIV
poliovrus
H1N1
Mosaico do tabaco
ESTRUTURA DE MICRORGANISMOS PROCARITICOS MORFOLOGIA DAS BACTRIAS Aspectos externos 1. tamanho: maioria entre 0,2-2,0 m de dimetro e 2-8 m de largura cocos < bacilos < espirilos
Staphylococcus Salmonella
Grande rea superficial relativa: favorece a absoro de nutrientes: alta taxa metablica e crescimento microbiano
Treponema
MORFOLOGIA DAS BACTRIAS 2. Forma: Bsicas esfrica (cocos), cilndricas (bacilos), espiraladas ou helicoidais (vibres, espirilos, espiroquetas); menor comuns: apendiculadas, filamentosas Cocos: arredondadas, ovides ou levemente achatadas Bacilos: tamanhos variados, podem ter extremidade arredondada, quadrada, afilada Espcies pleomrficas (ex.: Arthrobacter, Rhizobium, Corynebacterium)
Clostridium botulinum
MORFOLOGIA DAS BACTRIAS 3. Arranjo: espirilos so isolados; as demais formas apresentam-se agrupadas em arranjos caractersticos (depende do padro de diviso celular) Cocos: diplococos (pares), estreptococos (cadeias lineares), tetracocos, estafilococos (padro irregular, cachos), cbico (sarcinas)
Staphylococcus
Enterococos spp.
3. Arranjo Bacilos: maioria isolados; diviso no eixo maior/menor diplobacilos paliada (Corynebacterium) rosetas (Caulobacter) cadeias (estreptobacilos)
Caulobacter
Corynebacterium
Streptobacillus
Beggiatoa
ESTRUTURA DE BACTRIAS
Algumas estruturas celulares so comuns a todas as bactrias; outras so tpicas de espcies/condies ambientais Estrutura bsica de uma bactria tpica:
Componentes de clulas procariticas: -Estruturas externas parede celular -Parede celular -Estruturas internas parede celular
1. Glicoclice: (cpsula ou camada viscosa) polmero de polissacardeos e/ou polipeptdeos se apenas acares = polissacardeo extracelular (PSE) fixao/adeso a superfcies produzido no interior da clula e excretado em sua superfcie se firmemente aderido parede celular = cpsula (colorao tinta nanquim) em espcies patognicas: interfere na virulncia (protege da fagocitose) Ex.: Streptococcus pneumoniae, Bacillus anthracis, Klebsiella pneumoniae
ESTRUTURAS EXTERNAS PAREDE CELULAR 2. Flagelos longos apndices filamentosos; funo: movimentao arranjos: monotrquio, anfitrquio, lofotrquio, peritrquio
Estrutura flagelar - partes: - filamento (protena globular: flagelina) - ala - corpo basal: haste central inserida em uma srie de anis Gram-negativas: 2 pares de anis Gram-positivas: 1 par de anis mobilidade bacteriana: movimento rotacional do corpo basal (sentido horrio ou anti-horrio) padres de motilidade: nado e desvios (inverso na rotao flagelar)
Movimento flagelar ocorre em funo de um estmulo: taxia estmulos a receptores da parede celular: qumicos (= quimiotaxia) luz (= fototaxia) Estmulo positivo (atraente): aproximao estmulo negativo (repulso): maior frequncia de desvios
Protenas flagelares (antgeno H): usadas para identificar variedade patognicas de espcies (ex.: E. coli)
ESTRUTURAS EXTERNAS PAREDE CELULAR 3. Filamentos axiais (endoflagelos) tpico de espiroquetas (ex.: Treponema pallidum, Borrelia burgdorferi) confere movimento espiral (saca-rolhas) Feixe de fibrilas que se organizam em espiral (estrutura similar ao flagelo), interiormente a uma bainha externa, ao longo da estrutura da bactria;
ESTRUTURAS EXTERNAS PAREDE CELULAR 4. Fmbrias e Pili presente em Gram-negativas; estrutura semelhante a plos, composio proteics (pilina) so retos, mais curtos e finos que os flagelos Fmbrias localizao: plos celulares ou distribuio homognea; em geral numerosas; funo: fixao a superfcies e/ou clulas hospedeiras; auxilia a patogenicidade
E.coli Pili mais longos; apenas 1 ou 2 por clula; relacionado transferncia de DNA entre bactrias.
estrutura complexa e semi-rgida, externa membrana plasmtica; confere a forma da clula; protege a clula de alteraes do meio externo (ex.: alteraes da presso osmtica) constitui ponto de ancoragem dos flagelos; contribui para a patogenicidade; o alvo (local de ao) de vrios antibiticos; diferenas na composio qumica so usadas para diferenciar os principais tipos de bactrias
Composio : - rede de macromolculas: peptidoglicana (murena) unidades dissacardicas ligadas a polipeptdeos dissacardeo = N-acetilglicosamina (NAG) + cido N-acetilmurmico (NAM) NAM: apresenta cadeia lateral de aminocidos D e L formam uma cadeia polissacardica, intercruzada com cadeias polipeptdicas (pontes cruzadas; local de ao da penicilina)
cadeias laterais de tetrapeptdeos; so intercruzadas por pontes de aminocidos frequncia/tamanho das pontes cruzadas variam com a espcie
DIFERENAS NA PAREDE CELULAR: BACTRIAS GRAM-POSITIVAS E GRAM-NEGATIVAS Gram-positivas: muitas camadas de peptidoglicana; estrutura espessa e rgida (mais sensveis penicilina) contm cidos teicicos: polmeros fosfatados de glicerol e ribitol - tipos: c. lipoteicico (ligado membrana) e c. teicico da parede - grupos fosfato conferem carga: controle do movimento de ctions - estrutura confere especificidade antignica
colorao de Gram: violeta escuro ou prpura ex.: Estreptococos polissacardeos especficos de parede auxiliam a identificao; ex.: Mycobacterium (lcool-cido resistentes: cido miclico)
DIFERENAS NA PAREDE CELULAR: BACTRIAS GRAM-POSITIVAS E GRAM-NEGATIVAS Gram-negativas: poucas camadas de peptidoglicana membrana externa (fosfolipdeos, lipoprotenas, LPS); barreira para antibiticos, enzimas, alguns corantes; permeabilidade em funo de porinas peptidoglicana est no espao periplasmtico, ligada a lipoprotenas da M.E. no contm cidos teicicos LPS de membrana: diferenciam as espcies (polissacardeos O); poro lipdica txica ao hospedeiro (lipdeo A = endotoxina) mais resistentes penicilina
Diferenas na Parede Celular: bactrias Gram-positivas e Gram-negativas Colorao de Gram: (1884, Hans C. Gram) 1. Fixao da amostra em lmina; 2. Aplicao de corante prpura (violeta genciana) corante primrio (todas as clulas) 3. Lavagem 4. Aplicao de iodo (fixador, forma cristais) 5. Lavagem 6. Soluo de lcool-acetona (agente descorante) 7. Lavagem 8. Aplicao do corante safranina (contra-corante; vermelho) 9. Lavagem e secagem 10. Microscpio Reteno da colorao prpura = Gram positiva Descolorao e colorao vermelha = Gram negativa O lcool descora as bactrias Gram-negativas: dissolve os lipdeos da M.E. Remoo dos cristais de corante prpura Colorao com safranina = vermelho
Colorao de Gram
Staphyllococcus aureus
cocos
algumas bactrias no apresentam parede celular... Ex.: Mycoplasma, apresentam esterides de membrana Arquibactrias: estrutura incomum (pseudomurena) Danos parede celular bacteriana: A sntese da parede celular o alvo de muitos antibiticos: - substncias com ao na parede celular no lesam as clulas eucariticas (do hospedeiro) exposio lisozima (lgrima, saliva e muco): atua em Gram + (hidrlise da ligao -1,4 entre NAG e NAM) - bactria sem parede celular = protoplasto - Esferoplasto: bactria Gram-negativa aps remoo parcial da membrana externa (EDTA + lisozima) Protoplastos e Esferoplastos sofrem lise osmtica (em gua pura)
Endsporos:
no realizam reaes metablicas (citoplasma desidratado); contm DNA, RNA, ribossomos, enzimas, cido dipicolnico e ons clcio podem permanecer em dormncia por anos so resistentes a processos de controle microbiolgico (temperatura,
desidratao, radiao, substncias qumicas); ex.: C. botulinum colorao especial (usa calor): mtodo de Schaeffer-Fulton (verde malaquita) germinao = retorno ao estado vegetativo (ativado por estmulo fsico ou qumico)
Cistos
formas latentes com parede celular espessa, menor resistncia ao calor estrutura e composio diferente do endsporo ex.: Azotobacter
EUBACTRIAS: 3 grupos (critrio: presena e caractersticas de parede celular): 1.Gram-negativas 2.Gram-positivas 3.Micoplasmas
Eubactrias
Parede celular presente Gram-negativos:
-Espiroquetas -Bacilos encurvados aerbios e microaerfilos -Bacilos e cocos aerbios -Bacilos anaerbios facultativos -Bactrias anaerbias -Riqutsias e clamdias -Fototrficos anoxignicos -Fototrficos oxignicos -Bactrias deslizantes -Bactrias com bainha -Bactrias gemulantes e/ou apendiculadas -Quimiolitotrficas
Gram-positivas:
-Cocos -Bactrias esporuladas -Bacilos com forma regular -Bacilos com forma irregular -Micobactrias -Actinomicetos
Arqueobactrias
-Produtores de metano -Haloflicas extremas -Dependentes de enxofre -Termoplasmas
I. Eubactrias Gram-negativas coram-se de vermelho (colorao de Gram) subgrupos: caractersticas morfofisiolgicas (motilidade, necessidade O2) 1.1 Espiroquetas helicoidais; flexveis fibras axiais (flagelo periplasmtico) membrana externa = bainha externa podem ser saprfitas (ex.; Spirochaeta) ou parasitas (ex.: Treponema, Borrelia, Leptospira)
I. Eubactrias Gram-negativas 1.2 Bactrias encurvadas aerbias ou microaerfilas - espirilos (rgidos) -mobilidade: flagelos; ex.: Aquaspirillum comum em gua doce -Campylobacter (microaerfilo patognico: diarria) - vibries: ex.: Azospirillum (fixa N2 atmosfrico, razes)
I. Eubactrias Gram-negativas 1.3 Cocos e Bacilos aerbios Bacilos: muitos no solo/gua Ex.: Pseudomonas, Azotobacter (fixa N2 solo), Rhizobium (fixa N2 razes leguminosas), Zooglea (E.T.E.), Acetobacter (produo vinagre)
Azotobacter Rhizobium
Pseudomonas
Acetobacter
Zooglea
I. Eubactrias Gram-negativas 1.3 Cocos e Bacilos aerbios (cont.) Bacilos patognicos: Brucella (aborto em animais); Pseudomonas (imunodeprimidos, infeces de feridas); Xanthomonas (cancro ctrico); Agrobacterium (tumor em plantas) Cocos patognicos: ex.: Neisseria (N. gonorrhoeae, N. meningitidis)
Brucella abortus
N. gonorrhoeae
I. Eubactrias Gram-negativas 1.4 Bacilos facultativos - retos ou encurvados Ex.: famlia Enterobacteriaceae (T.G.I.) Escherichia coli No so diferenciveis ao M.O.: testes bioqumicos e sorolgicos Muitas espcies patognicas: Ex.: Salmonella (febre tifide e gastroenterite) Shigella (disenteria bacilar) Yersinia pestis (praga) Infeces urinrias: Escherichia, Proteus, Klebsiella, Enterobacter
Escherichia coli
Outras espcies patognicas: Vibrio cholerae (clera); Haemophilus influenza (meningite infantil)
Vibrio cholerae
I. Eubactrias Gram-negativas 1.5 Anaerbios bacilos retos, encurvados, cocos 2 grupos (necessidade de enxofre) Anaerbios que necessitam de enxofre: (reduo para gs H2S) Ex.: Desulfovibrio (lodo, brejo)
Anaerbios que no necessitam de enxofre: produzem cidos orgnicos; -presentes no rmen -espcies patognicas, ex.: Bacteroides fragilis
I. Eubactrias Gram-negativas 1.6 Riqutsias e clamdias parasitas intracelulares obrigatrios Riqutsias: - clulas ovais/bastes; parasitam clulas de artrpodos ou vertebrados; - transmisso = piolhos, pulgas, carrapatos Ex.: Tifo epidmico (Rickettsia prowazekii)
Clamdias: - cocos com ciclo de vida bastante distinto; - no apresentam peptidoglicano na parede celular - espcies patognicas: C. psittaci (psitacose em pssaros); C. trachomatis (tracoma, linfogranuloma venreo e uretrite)
I. Eubactrias Gram-negativas 1.7 Bactrias fototrficas anoxignicas fotossintetizantes, mas no produzem O2; apresentam bacterioclorofila (absorve radiao IR) e carotenides colorao de pigmentos divide em bactrias prpuras ou verdes so anaerbios habitat: gua estagnada, pntanos e fundos de lagos podem ser bastoneste, espirilos ou cocos reproduo por fisso binria ou brotamento Ex.: Rhodomicrobium (formam prosteca) e Rhodopseudomonas
I. Eubactrias Gram-negativas 1.8 Bactrias fototrficas oxignicas fotossintetizantes que produzem O2; apresentam clorofila a e o pigmento ficobilina (normalmente de cor azul) so comumente denominadas cianobactrias formas e arranjos variados (cocos, bacilos, filamentos multicelulares) no apresentam flagelos habitat: solo, gua doce/mar algumas espcies so termoflicas espcies filamentosas podem apresentar hetercitos (clulas diferenciadas)
Cylindrospermum
Chroococcus Oscillatoria
I. Eubactrias Gram-negativas 1.9 Bactrias deslizantes 2 tipos: - formadoras de esporos (corpos de frutificao) - no-formadoras de esporos Formadoras de esporos: bastonetes curtos e flexveis no apresentam flagelos movimento por deslizamento em superfcies midas denominadas myxobactrias (limosas) corpos de frutificao: conjunto de esporos (mixsporos) resistentes dessecao, podem se organizar em pednculos limosos contendo estruturas globosas contendo os mixsporos habitat: superfcie do solo, matria orgnica em decomposio
Chondromyces Stigmatella
I. Eubactrias Gram-negativas 1.9 Bactrias deslizantes No-formadoras de esporos: forma de bastonetes ou filamentosas; no formam mixsporos aerbios/microaerfilos habitat: solo, gua degradam polmeros naturais: celulose, quitina, pectina, queratina ex.: Flexibacter
I. Eubactrias Gram-negativas 1.10 Bactrias com bainha bastonetes envolvidos por estrutura tubular de composio orgnica habitat: gua doce/mar, ambientes poludos (problemas nas E.T.E.) Ex.: Sphaerotilus natans
I. Eubactrias Gram-negativas 1.11 Bactrias gemulantes e/ou apendiculadas comum em solo e gua podem ser aerbias, microaerfilas ou facultativas no fotossintetizantes alguns apresentam prosteca (fixao), outras pednculo (apndices tubulares) reproduo por fisso binria ou brotamento Ex.: Caulobacter (no-gemulante prostecada) Blastocaulis (gemulantes apendiculadas)
I. Eubactrias Gram-negativas 1.12 Bactrias quimiolitotrficas - obtm energia da oxidao de compostos inorgnicos - quando autotrficas utilizam CO2 como fonte de carbono - diferenciao: tipo de composto inorgnico que utilizam 1. Nitrobacter, Nitrococcus (oxidao de nitrito a nitrato) 2. Nitrosolobus (oxidao de amnia a nitrito) 3. Thiospira, Thiobacillus (espcies reduzidas de enxofre a sulfato) 4. Siderococcus (espcies de Fe ou Mn) - distribuio: solo, gua - importncia: reciclagem de nutrientes (ciclos biogeoqumicos)
Nitrosomonas
II. Eubactrias Gram-positivas parede celular com espessa camada de peptidoglicana, no apresentam membrana externa diviso: caractersticas morfolgicas e bioqumicas 2.1. Cocos dividem-se em subgrupos, conforme o arranjo e tipo de metabolismo Micrococcus: aerbios; disposio irregular das clulas; saprfitas (solo/gua) ex.: Deinococcus (alta resistncia UV) Facultativos: ausncia ou presena de O2; tipos: - Staphylococcus (arranjo irregular; habitat: pele e mucosas humana e de outros animais) ex.: S. aureus (infeces operatrias, choque txico, intoxicaes alimentares) - Streptococcus (cadeias de clulas); ex.: S. pyogenes (angina estreptoccica, escarlatina e febre reumtica); S. pneumoniae
II. Eubactrias Gram-positivas 2.2. Bactrias esporuladas formam endsporo resistente normalmente so bastonetes Ex.: Bacillus (podem ser aerbios ou facultativos) Clostridium (anaerbios) muitas espcies so saprfitas (solo, gua doce/mar) Patognicas ex.: B. anthracis (carbnculo ou antrax) C. perfrigens (gangrena gasosa, intoxicao alimentar) C. botulinum (botulismo, neurotoxina) C. tetani (ttano)
C. botulinum
C. perfrigens
II. Eubactrias Gram-positivas 2.3. Bacilos regulares bastonetes no-esporulados, aparncia uniforme (sem salincias, ramificaes) podem ser aerbios, facultativos ou anaerbios Ex.: Lactobacillus (saprfitas fermentadores, normalmente no-patognicos) Listeria monocytogenes (leite/queijo; aborto espontneo/natimorto)
Lactobacillus
Listeria monocytogenes
II. Eubactrias Gram-positivas 2.4. Bacilos irregulares No-esporulados; Bastonetes retos ou encurvados, apresentam salincias Ex.: Arthrobacter (pleomrfica, saprfita do solo) Corynebacterium (saprfitas ou patognicas: C. diphteriae)
C. diphteriae Arthrobacter
II. Eubactrias Gram-positivas 2.5. Micobactrias gnero: Mycobacterium caracterstica: bacilos lcool-cido resistentes (aps colorao com fucsina), devido a lipdeos de alto PM (cidos miclicos) na parede celular algumas espcies saprfitas patognicas: M. tuberculosis; M. leprae
M. leprae
M. tuberculosis
II. Eubactrias Gram-positivas 2.6. Actinomicetos grupo grande e variado; caractertica: formao de miclio (emaranhado de hifas) podem se reproduzir pela fragmentao de hifas ou formao de esporos (esporangisporos ou conidisporos); os esporos so resistentes dessecao (no ao calor) so saprfitas do solo (degradao de matria orgnica) ex.: Streptomyces (produo de antibiticos: tetraciclina, estreptomicina)
S. acrymicini
S. coelicolor
III. Micoplasmas no apresentam parede celular; coram-se como Gram-negativas (tm apenas membrana celular) caractersticas: - plasticidade (vrias formas) - sensveis a variaes osmticas - resistentes a penicilinas, sensveis a outros antibiticos muitas apresentam colesterol na membrana (cultura com soro) habitat: mucosas muitas so patognicas: Mycoplasma pneumoniae Ureaplasma urealyticum
Mycoplasma pneumoniae