Arqueobactrias Por Francisco Prosdocimi A vida mais primitiva na Terra pode ter surgido a temperaturas de 75C ou ainda mais

altas. Aberturas de gua quente no cho do mar e outros locais, tm abrigado o que cientistas chamam de micrbios termfilos, essencialmente, amantes do calor. Em 1977, em um anncio atordoante, Carl Woese, da Universidade de Illinois, anunciou a descoberta de uma nova forma de vida entre os termfilos. Eles foram denominados archaea ou archaebacteria, o que significa "os antigos". As arqueobactrias so um grupo heterogneo, de organismos procariticos, filogeneticamente distante das eubactrias. Ele inclui seres anaerbios, aerbios, auttrofos, hetertrofos, termfilos, acidfilos, halfilos, fotossintetizantes, etc., constituindo um grupo bastante diverso. Os principais pontos de distino entre arqueobactrias e eubactrias so: paredes celulares, fosfolpedes de membrana, sntese protica e fatores genticos. Quando foram descritas, acreditava-se que as arqueobactrias eram organismos que eram encontrados quase que exclusivamente em ambientes extremos da vida. Entretanto, recentemente, houve uma mudana nesse ponto de vista. Encontrou-se vrias eubactrias e organismos eucariticos que sobrevivem tambm em ambientes extremos e descobriu-se que boa parte das arqueobactrias pode viver tambm em ambientes normais. Dessas arqueobactrias mesoflicas, foi descrito recentemente que cerca de 20% da biomassa de picoplancton marinho composto por arqueobactrias. Entretanto, as arqueobactrias parecem ser os nicos organismos descobertos at o presente dia que podem sobreviver a temperaturas acima de 95C e o fentipo hipertermoflico s encontrado neste domnio da vida. Um outra caracterstica exclusiva de archaea o metabolismo metanognico, no se conhece eubactrias nem eucariotos capazes de produzir metano como resduo de seu metabolismo. Como um grupo, as arqueobactrias so morfolgica e fisiologicamente variadas. Muitas apresentam propriedades nicas que as permitem habitar ambientes caracterizados por condies extremas de temperatura, pH, salinidade, presso e/ou anaerobiose. Essa notvel capacidade tem estimulado esforos imensos para entender as adaptaes que as possibilitam viver nos extremos da vida e a sondar aplicaes biotecnolgicas de seus componentes celulares hiperestveis. Isso particularmente verdadeiro em relao s suas enzimas, que possuem a capacidade de permanecerem cataliticamente ativas em tais condies, que limitam a existncia de vrias outras formas de vida. Tal capacidade pode servir como uma resposta potencial aos conflitos biotecnolgicos entre condies industriais e a fragilidade dos compostos biolgicos. Alm disso, o metabolismo sem igual das arqueobactrias pode aumentar o repertrio de catalisadores substancialmente disponvel para reaes de biotransformao. Morfologicamente as arqueobactrias e eubactrias so bastante similares e no teria sido possvel a descoberta desse novo grupo de organismo no fosse os recentes avanos da biologia molecular. Apesar de que alguns poucos caracteres fisiolgicos permitem a distino entre archae, eubactria e eucariotos, a distino entre eles s pode ser feita corretamente atravs do sequenciamento de DNA. Portanto, a definio de uma arqueobactria deve permanecer filogentica, e no fenotpica. Filogenia bacteriana Atravs do sequenciamento do rRNA foi revelada uma filogenia antes imprevisvel, sendo que antes desse evento s eram observados os caracteres fenotpicos apresentados pelos organismos. Essa filogenia molecular, obtida primeiramente atravs do sequenciamento do rRNA de diferentes organismos mostrou que a vida na terra consiste principalmente de 3 linhagens principais, sendo que duas delas so compostas apenas de seres microbianos e procariotos. As trs linhagens ou os trs domnios da vida seriam: as bactrias, as arqueobactrias e os

eucariotos. O termo domnio utilizado hoje como o maior nvel taxonmico de todos, a ser utilizado acima de reino. A viso tradicional da biologia, como sendo vista dividida em 5 reinos: monera, protista, fungos, plantas e animais j est bastante ultrapassada e no se baseia em nenhuma caracterstica biolgica bem definida, consistindo apenas de uma subdiviso baseada no senso comum. A viso recente, onde os domnios tornam-se um grupo taxonmico acima de reino muito mais correta e embasada filogeneticamente e deve, em algum tempo, substituir a viso tradicional. A rvore filogentica universal, que pode ser vista abaixo, mostra a posio evolutiva dos trs maiores grupos de seres vivos que habitam a Terra. Pode-se notar que os eucariotos no tiveram uma origem recente e so, na verdade, to antigos quanto os procariotos. Antes dos eventos endossimbiticos que deram origem aos eucariotos atuais existiram seres eucariotos sem organelas habitando a terra e esses organismos dividiram ancestrais comuns com as outras duas linhas evolutivas. A raiz da rvore filogentica dos seres vivos ou o ancestral comum aos trs domnios conhecido como LUCA (Last Universal Cellular Ancestor). As caractersticas desse ancestral tm sido procuradas analisando as caractersticas comuns e as caractersticas diferentes entre os trs domnios da vida. Analisando tais caractersticas chega-se concluso de que a linha evolutiva desse ancestral universal se dividiu em duas, uma das quais deu origem s Eubactrias e a outra que deu origem s Arqueobactrias e aos Eucariotos, que seriam grupos irmos. Essa segunda linha teria se dividido logo depois dando origem aos dois grandes domnios. Atravs dessa anlise podemos chegar concluso que um dos grupos de procariotos, as arqueobactrias, tm mais em comum com o grupo dos eucariotos do que com o outro grupo de procariotos. Algumas caractersticas apontam para o fato de que as arqueobactrias teriam se divergido na rvore da vida num ponto mais perto do ancestral universal. Isso sugere que as arqueobactrias permanecem, ainda hoje, sendo os organismos mais similares ao ancestral comum universal. O fato das arqueobactrias estarem presentes em uma grande diversidade de ambientes extremfilos sugere tambm sua mais prxima ligao com a raiz da rvore filogentica, sendo que as condies ambientais presentes na origem da vida na Terra eram extremas. Fentipos de Arqueobactrias Aps serem divididos os trs grandes domnios partir do sequenciamento do rRNA, estudos subsequentes mostraram que cada domnio est associado a uma srie de fentipos. Alguns desses fentipos so nicos de cada domnio, enquanto outros so compartilhados entre dois domnios ou at por todos os trs. Paredes celulares Pode-se dizer que, apesar de algumas poucas excees, todas as bactrias possuem parede celular composta de peptideoglicanos. J os eucariotos podem no possuir paredes celulares ou possuir paredes celulares compostas de celulose ou quitina. J nas arqueobactrias pode existir uma enorme variedade de paredes celulares, entretanto, nenhuma delas composta de peptideoglicanos. Grande parte das halfilas, assim como as hipertermfilas e as metangenas, contm parede composta de glicoprotenas. Certas halfilas produzem parede composta de um heteropolissacardeo sulfatado, algumas metangenas produzem um tipo diferente de peptideoglicanos (pseudopeptideoglicano), outras fazem uma parede composta de polissacardeos extremamente cidos, mas a maioria das metangenas possui protena na parede celular. Lipdios A natureza da membrana lipdica o critrio no gentico mais utilizado para a diferenciao entre bactrias e arqueobactrias.

Bactrias e eucariotos sintetizam os lipdios de membrana com um esqueleto consistindo de cidos graxos ancorados atravs de uma ligao ster com uma molcula de glicerol. Diferentemente, os lpides de arqueobactrias consistem em molculas que possuem ligao ter. Na ligao ster os cidos graxos so molculas lineares, enquanto na ligao ter esses cidos podem estar ligados a cadeias de hidrocarbonetos. Alm disso, a quiralidade da molcula de glicerol tambm difere entre os domnios. Nas eubactrias e arqueobactrias o tomo de carbono central da molcula de glicerol um estereoismero R enquanto nos eucariotos ele um estereoismero L. RNA Polimerase A transcrio do DNA dependente da RNA polimerase em todos os organismos vivos, sendo que o DNA serve de molde e obtm-se o RNA como produto. As clulas de bactrias contm um nico tipo de RNA polimerase com estrutura quaternria simples, contendo 4 polipeptdeos. Existem vrios tipos de RNA polimerase de arqueobactrias e elas so estruturalmente mais complexas que as de eubactrias, sendo compostas, na maioria das vezes, de cerca de 8 polipeptdeos. As RNA polimerases de eucariotos so as mais complexas contendo, normalmente de 10 a 12 polipeptdeos e os tamanhos de seus peptdeos coincidem mais fortemente com os de arqueobactrias, como pode-se perceber observando o padro da eletroforese em gel de poliacrilamida mostrada direita. Alm disso, nos eucariotos, so conhecidas mais duas outras RNA polimerases, especializadas em transcrever certas partes especficas do genoma, uma para rRNA e outra para tRNA. Sntese de Protenas Devido s j provadas diferenas na estrutura do rRNA entre os 3 domnios, no surpreendente que a maquinaria da sntese de protenas seja diferente entre esses grupos. Apesar de que os ribossomos de arqueobactrias e eubactrias tenham o mesmo tamanho (70S), vrios passos na sntese de protenas das arqueobactrias assemelham-se mais aos eucariotos do que s eubactrias. A iniciao da traduo sempre se inicia no cdon de iniciao (AUG), entretanto nas eubactrias o primeiro tRNA carrega uma metionina modificada chamada formilmetionina, enquanto nos outros dois grupos o tRNA iniciador carrega uma metionina no modificada. A exotoxina produzida pela bactria Corynebacterium diphtheriae um potente inibidor da sntese de protenas nos eucariotos pois impede o ribossomo de se deslocar durante a sntese de protenas. Essa toxina tambm inibe a sntese de protenas em arqueobactrias, entretanto no afeta as bactrias. Algumas similaridades funcionais tm sido observadas entre a maquinaria da sntese protica das arqueobactrias e dos eucariotos. Organismos geneticamente alterados que produziam ribossomos hbridos, contendo a subunidade menor de arqueobactria e a maior de eucariotos realizavam normalmente a sntese de protenas na clula. J ribossomos hbridos de uma eubactria e de um eucarioto no conseguiram realizar a sntese protica. Esse resultado refora as concluses sobre as relaes mais prximas entre arqueobactrias e eucariotos. Arqueobactrias Halfilas Certas arqueobactrias so denominadas halobactrias ou bactrias do sal, porque requerem um ambiente que fornece cerca de 17% a 23% de NaCl para um bom crescimento. Elas no crescem em solues com menos de 15% - mesmo a gua do mar no suficientemente salgada para elas. Portanto, as halobactrias vivem em ambientes altamente salinos, formando uma enorme populao de um pequeno e distinto grupos de bactrias, podendo formar colnias imveis

(Halococcus) ou possurem um flagelo polarizado (Halobacterium). Apesar das diferenas celulares entre esses organismos, eles apresentam inmeras propriedades em comum, como as adaptaes ao alto teor de salinidade e intensa luminosidade que esto sujeitas em seu habitat natural. A concentrao mnima de NaCl que permite o crescimento varia entre 2,0 e 2,5M, apresentando crescimento timo a 4 ou 5M. A concentrao de Mg+2 tambm deve ser alta (algo em torno de 0,025M). A concentrao salina intracelular no mnimo igual a concentrao externa, embora a concentrao inica seja diferente, sendo composta principalmente por Na+, K+ e Cl- . A estrutura bioqumica da clula (enzimas e ribossomos) no s tolerante a salinidade excessiva, como a presena de alta concentrao de sal condio primordial para o perfeito funcionamento do metabolismo celular. Alguma bactrias extremamente halfilas apresentam pigmentos vermelhos (carotenides) na sua membrana, que funcionam como uma proteo natural alta intensidade luminosa caracterstica natural do meio onde vivem esse tipo de bactria. Arqueobactrias halfilas extremas so aerbias com um complexo metabolismo nutricional. Desenvolvem freqentemente um rastro colorido (vermelho/ alaranjado) sobre pele de peixes secos e outros alimentos tratados com sal, alm de crescerem otimamente em tanques industriais que produzem sal. Genoma das Halobactrias O genoma das halobactrias Halobacterium e Halococcus contm componentes com valores de G+C diferentes. A maior parte do DNA bacteriano formado de 66 a 68% de bases G+C, enquanto a minoria composta (associadas principalmente a um grande plasmdeo em Halobacterium) por 50 a 70% de G+C. A extenso total do genoma bacteriano das halobactrias contm um elevado nmero de vrias seqncias repetidas tanto no cromossomo quanto no plasmdeo. Pelo menos algumas molculas tem sua estrutura similar a estruturas moleculares de eubactrias. Parede celular O principal constituinte da parede celular so as protenas ou polissacardeos. Removendo essa glicoprotena em uma diluio ou por meio do tratamento com proteinases, a parede celular perde sua forma estrutural e acaba sofrendo lise osmtica. Esse componente glicoproteico consiste de 22 a 24 dissacardeos (glicosegalactose) reunidos via O-glicosdeo vinculado a resduos de treonina; 12 a 14 trissacardeos (constitudo de glicose-galactose). Aps a formao dos oligossacardeo, ocorre o movimento desse complexo atravs da membrana por meio de um carreador e transferncia de oligossacardeo para protena. Hidrlise por pirofosfato regeneram o carreador enquanto simultaneamente ele volta atravs da membrana. A parede celular de Halococcus se difere qumica e estruturalmente das paredes celulares de Halobacterium, sendo similar parede de eubactrias Grampositivas. So diferentes tanto em constituio protica quanto quimicamente, tendo um complexo heteropolissacardeosulfato, composto de vrios aucares neutros, cido rico e aminocidos. Os glicanos restantes so provavelmente permutados por resduos de glicina, que liga o grupo amino ao aminocido e o grupo carboxila ao Halobacterium cido rico. Fotofosforilao em Halobactrias A maioria das halobactrias so obrigatoriamente aerbias, entretanto algumas espcies de Halobacterium podem gerar ATP por fotofosforilao. Quando espcies de halobactrias esto sujeitas a competio por limitao de oxignio, elas sintetizam quimicamente uma modificao em sua parede celular. Em clulas aerbias, a membrana celular vermelha devido a alta concentrao de

carotenodes. A transformao para a anaerbias induz o crescimento e sntese de um novo componente: a membrana prpura. Essa membrana estabelece uma discreta mancha, que pode vir a cobrir metade (ou mais) da rea total da membrana e pode ser facilmente distinguido em eltron micrografia de clulas congeladas. composta por lipdeos (25% ) e uma nica espcie de pigmento chamado bacteriorrodopsina, devido a sua similaridade com o pigmento rodopsina (os dois pigmentos so estruturalmente muito semelhantes diferindo na fotoqumica). Esse pigmento possui sete regies de estrutura alfahelicoiodal, orientada transversalmente membrana, mantendo assim a protena em contato tanto com o meio externo quanto o meio intercelular. Em presena de luz, o pigmento bacterideofro age como uma bomba de prtons, convertendo a luminosidade em uma fora promotora atravs da membrana da clula, podendo ser usada para aumentar os nveis de ATP celular. Halobacterium pode gerar ATP anaerobicamente em presena de luz, mas no pode crescer sob essa condio. Fotofosforilao usada s para aumentar a viabilidade das clulas em crescimento. A impossibilidade de Halobacterium crescer anaerobicamente, mesmo em presena de luz, reflete a necessidade molecular do oxignio para a sntese do pigmento retinide a partir do beta-caroteno. Crescimento fotoheterotrfico ocorre somente se a quantidade de oxignio no meio baixa o suficiente para a sntese de bacteriorrodopsina, mas alta o suficiente sintetizar retinides. Arqueobactrias Termoacidfilas As arqueobactrias termoacidfilas compreendem um grupo heterogneo, definido pela capacidade dos organismos de crescerem em altas temperaturas e baixo pH. Foram identificados dois subgrupos: Sulfobactrias, Termoplasma. Sulfobactrias As fontes de cido quente e solos quentes de todo o mundo contm um nmero substancialmente alto de seres quimioautotrficos facultativos. A temperatura tima para seu crescimento varia entre 63C a 80C e o pH ideal em torno de 2. A extenso de condies que as sulfobactrias sobrevivem extremamente variada, com temperaturas que vo de 55o a 85oC e pH variando desde 1 at 5,9. A porcentagem de G+C varia de 60% a 68%. A parede celular de sulfobactrias composta principalmente por lipoprotena e carboidratos, que formam uma camada distinta, externa membrana celular. Portanto, as sulfobactrias em seu habitat natural realizam respirao quimioautotrfica. Geotermas de vapor ou gua quente lanam quantidades suficiente de ferro e sulfato, que rapidamente oxidado pelo oxignio em ferro frrico, quimicamente ou biologicamente. As sulfobactrias oxidam H2S, mas o princpio para essa oxidao ainda no foi revelado. O principal substrato de crescimento parece ser fontes quentes (e tambm solos quentes) de enxofre, oxidando tal elemento em cido sulfrico, responsvel pela acidez desse hbitats. A identificao de um aceptor de eltrons natural removendo a partir do enxofre pouco provvel. Termoplasmas Esse grupo de bactrias caracterizado pela ausncia de parede celular, sendo esses seres envolvidos apenas pela membrana citoplasmtica. A membrana composta por lipopolissacardeo de glicoprotena, que conferem uma rigidez substancial. So seres anaerbios facultativos e usam apenas uns poucos mono e dissacardeos como fonte de energia, sendo seu fator de crescimento satisfeito por um tipo peculiar de oligopeptdeo.

O tamanho do genoma de Termoplasmas foi estimado em 8 x 108 ou 10 x 108 daltons, o que corresponde ao menor genoma conhecido de um organismo de vida livre. Possuem a habilidade de crescerem sob altas temperaturas e condies cidas, tendo o crescimento timo em torno de 55C e 65C e pH 2. So encontradas em minas de carvo, nos restos de carvo incandescente com quantidades substnciais de FeS sulfato ferroso. Esse habitat peculiar resultado de ao antrpica recente, sendo o habitat original desses seres ainda um mistrio. Acredita-se que talvez as Termoplasmas vivessem em depsitos de carvo expostos a atmosfera por ao geolgica ou depsitos subterrneos. Arqueobactrias Metangenas As arqueobactrias desse grupo so anaerbicas restritas e liberam gs metano (CH4) como resduo metablico processo no realizado por nenhum outro grupo de organismos. So encontradas em ambientes com ausncia de oxignio e abundncia de matria orgnica, como brejos, audes, lagos, sedimentos marinhos e rmen de bovinos. Elas retiram hidrognio e gs carbnico desses ambientes e os utilizam em seu metabolismo. Os metanognios vivem como simbiontes de uma grande variedade de protozorios tambm anaerbicos, convertendo produtos finais de fermentao em gs metano ou CO2. So de grande importncia no ambiente no qual vivem pela alta eficincia de sua enzima hidrogenase, que, mantendo uma baixa presso parcial de H2 para que a metanognese ocorra permite que os demais organismos fermentadores faam reoxidao do NADH, o que corresponde a um maior rendimento de ATP e um aumento da biomassa. Esse fenmeno conhecido como Transferncia de Hidrognio Interespecfica. Os metanognios podem ser subdivididos em trs grupos; o primeiro contm os gneros Methanobacterium e Methanobrevibacter; o segundo, apenas o gnero Methanococcus; e, o terceiro, Methanospirillum e Methanosarcina. Eles se diferenciam principalmente pela estrutura da parede celular, reao de Gram, motilidade e substratos onde vivem. O metabolismo energtico das arqueobactrias metanognicas nico pela quantidade limitada de fonte de energia utilizada por elas, sendo que algumas usam fontes alternativas ao H2 e CO2, como acetato, formiato, metanol e metilaminas. O mecanismo de sntese de ATP desconhecido, mas a ausncia de quinonas e citocromos indica que a cadeia transportadora de eltrons clssica no est envolvida. possvel que a conservao da energia seja mediada pelo potencial osmtico da membrana. Taxonomia das Arqueobactrias To controversa quanto a evoluo do grupo de arqueobactrias a filogenia dentro desse grupo. Mostramos aqui uma classificao desses organismos sugerida por Burggraf et al., 1997 (Reino Crenarchaeota) e outros autores (Reino Euryarchaeota). Segundo esses autores as arqueobactrias so divididas em dois reinos, a saber: Reino Euryarchaeota apresenta a maior diversidade fenotpica, incluindo organismos halfilos, metangenos, termoacidfilos e hipertermfilos; Reino Crenarchaeota apresenta principalmente organismos mesfilos, mas tambm contm organismos psicrfilos e hipertermfilos; Referncias bibliogrficas 1. Brock, T. D., Madigan, M. T., Martinko, J. M., Parker, J. Biology of Microorganisms. 7ed. Prentice Hall: New Jersey, 1994. 909p.

2. Danson, M. J., Hough, D. W. Structure, function and stability of enzymes from the Archaea. Trends in Microbiology. Aug 1998. vol. 6. n 8. p. 307-313. 3. de Duve, C. The birth of complex cells. Scientific American. Apr 1996. p. 38-45. 4. Forterre P et al. Evolution of Archaea. Theoretical Population Biology 61: 409-422. 2002. 5. Pelczar Junior, M. J.; Reid, R. D. Microbiology. 2.ed. McGraw-Hill. 1965 6. Stanier, R. Y., Ingrahan, J. L., Wheelis, M. L., Painter, P. R. The microbial world. 5ed. Englewood Cliffs: New Jersey, 1986. 689p. 7. Woese, C. R., Gupta, R. S. Are archaebacteria merely derived prokaryotes? Nature. Jan 1981. vol. 289. p.95-96.