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La Gerarchia Biomolecolare
Molecole semplici costituiscono le unità per la costruzione di strutture complesse
Esiste uno schema organizzativo
Metaboliti e Macromolecole
Organelli
Membrane
L’unità della vita è la cellula
I processi metabolici assimilano alcuni precursori inorganici, (H2O, CO2 , NH4, NO3-, N2 ) trasformandoli
nelle molecole della vita. Solo nelle cellule eucariotiche (inclusioni cellulari, mitocondri, cloroplasti).
Le membrane definiscono i confini dell’ambiente acquoso delle cellule e degli organuli: induzione alla
compartimentalizzazione.
I legami H (12-30 KJ/mol) sono piu’ forti delle interazioni di Van Der Waals.
La prima legge
L’energia totale di un sistema isolato è conservata.
• I simboli E e U rappresentano l’energia interna. E e’ una funzione di stato cioe’ dipende dallo stato
reale di un sistema.
• E puo’ cambiare solo se l’energia fluisce dentro o fuori il sistema sotto forma di calore o lavoro.
• E è il calore scambiato a volume costante
• E2 - E1 = ΔE = q + w
• q è il calore assorbito DAL sistema
• w è il lavoro fatto SUL sistema
Entalpia
•H e’ una funzione a pressione costante, di solito i processi chimici avvengono a pressione costante
•H = E + PV
•Il volume è approssimazione costante nelle reazioni biochimiche (in soluzione)
•L’entalpia e l’energia interna spesso corrispondono •H è il calore assorbito a P costante.
La Seconda Legge
• I sistemi tendono a evolvere verso stati disordinati
• L’entropia (system + surroundings) non cambia in processi reversibili ed è positiva nei processi
irreversibili
• Tutti i processi procedono verso l’equilibrio – (energia potenziale minima)
Entropia
• Una misura del disordine
• Uno stato ordinato è a bassa entropia
• Uno stato disordinato è a alta entropia
• dSreversible = dq/T
• Definizione statistica S=KlnW dove W e’
in numero degli stati microscopici del sistema
La terza Legge
• L’entropia di una sostanza cristallina, perfettamente ordinata tende a zero con l’avvicinarsi della
temperatura a 0 K
• A T = 0 K, l’entropia è esattamente zero “concetto di zero assoluto”
Su questa base e’ possibile stabilire una scala QUANTITATIVA di entropia assoluta
Energia Libera
• E’ una quantità ipotetica - serve ai chimici per prevedere se una reazione avrà luogo
• G = H - TS
• Per ogni processo a P costante e T: ΔG = ΔH - TΔS
• Se ΔG = 0, la reazione è all’ equilibrio
• Se ΔG < 0, la reazione procede
• Si indica con G perche’ introdotta dallo scienziato J.Willard Gibbs
Il Trasferimento di energia
Una Necessità Biologica
• L’energia acquisita dal sole o dal cibo è usata per le reazioni endotermiche nell’organismo
• Due classi di biomolecole fanno questo:
– Coenzimi Ridotti (NADH, FADH2)
– Composti fosfatati ad alta-energia – energia libera di idrolisi > -25 kJ/mol)
Biomolecole ad Alta-Energia
• Alta en.- PEP (fosfoenolpiruvato) e 1,3-DPG (1,3,
difosfoglicerolo)
• Bassa en.- zuccheri fosfati, etc. • Media en. - ATP!