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GLUCOSIO DUE MOLECOLE LEGATE DA LEGAME GLICOSIDICO; AMIDO HA LEGAMI ALFA, GLICOGENO
LEGAMI ALFA, CELLULOSA LEGAMI BETA;
ACIDI NUCLEICI: DNA ED RNA; LE PIRIMIDINE (CITOSINA E TIMINA) SI TROVANO NEL DNA, LE PURINE
(ADENINA E GUANINA) SIA NEL DNA CHE NELL’RNA; NUCLEOTIDI SONO MATTONI DI DNA ED RNA.
LA CELLULA PROCARIOTICA
RAPPORTO SUPERFICIE VOLUME MOLTO ELEVATO RISPETTO AD EUCCARIOTI; VELOCITA’ SCAMBI MOLTO
RAPIDA; RISPOSTA RAPIDA ALLE VARIAZIONI AMBIENTALI; VELOCITA’ METABOLISMO; CRSCITA E POI
MOLTIPLICAZIONE.
DIMENSIONI MATTERI ESPRESSA IN MICROMETRI DIAMETRO O,1 O 0,8 MICROMETRI LUNGHEZZA ANCHE 3
O 8 MICROMETRI; MAI INFERIORE A 0,15 DI DIAMETRO PER CONTERE IL CONTENUTO CELLULARE; ARCHEA
SPESSO PIU’ PICCOLI, DIAMETRO ANCHE INFERORE A 0,1.
POCHE TIPOLOGIE MORFOLOGICHE; LA TIPOLOGIA MORFOLOGICA DIPENDE DALLA GENETICA E SERVE PER
FAR AVERE ALLA CELLULA LA MIGLIOE FITNESS POSSIBILE.
REGOLA GLI SCAMBI CON L’AMBIENTE; OMEOSTASI: CONDZIONI CELLULARE INDIMENDENTI DAI
CAMBIAMENTI DELLE CONDIZIONI ESTERNE (ES.PH) MA NON PROTEZIONE DA LISI OSMIìOTICA; LISI
MEMBRANA EQUIVALE A MORTE CELLULARE.
ALCUNI PROCARIOTI POSSONO CONTENERE OPANOIDI: SONO DELLE MOLECOLE PLANARI RIGIDE,
STRUTTURALMENTE SIMILI AGLI STEROLI, CHE SVOLGONO UN RUOLO IMPORTANTE NELLA
STABILIZZAZIONE DELLA MEMBRANA E NELL’ADATTAMENTO A CONDIZIONI AVVERSE.
PARETE CELLULARE: MAGGIOR PARTE DEI PROCARIOTI POSSIEDE PARETE CELLULARE GRAM+ E GRAM-;
ASSETE NEI TENERICUTES CHE POSSIEDE OPANOIDI; LE FUNZIONI PRINCIPALI RISIEDONO NELLA
PROTEZIONE DA EVENTI MECCANICI E CONTRASTA PRESSIONE OSMOTICA INTERNA ALLA CELLULA; FORMA
CELLULARE; ADEGUATA POROSITA’, PEPTIDOGLICANO O MUERINA ESCLUSIVO DI CELLULE BATTERICHE;
ARCHE HANNO PSEUDO MUERINA.
GRAM+ POSSIEDONO PEPTIDOGLICANO E MEMBRANA PLASMATICA, GRAM- MEMBRANA ESTERNA,
PEPTIDOGLICANO, SPAZIO PERIPLASMATICO, MEMBRANA PLASMATICA.
GRAM+: ACIDI TEICOICI E LIPOTEICOICI; AICIDI TEICOICI SONO FORMATI DA POLIMERI DI RIBITOLO
FOSFATO O GLICEROLO FOSFATO LEGATI A D-ALANINA E POLIMERI DI RESIDUI GLICOSILICI.
FIMBRIE E PILI SONO APPENDICI DI NATURA PROTEICA (PILINA) TIPICHE DEI GRAM-, CIRCA 1 MICROMETRO
DI LUNGHEZZA;
FIMBRIE: POSSONO ESSERE NUMEROSE SULLA SUPERFICIE CELLULARE, ADESIONE ALLE SUPERFICI, TESSUTI
ANIMALI, SUPERFICI SOLIDE IN AMBIENTE ACQUAICO, SUPERFICI VEGETALI, PARTICELLE DI SUOLO.
PILI: SONO SIMILI ALLE FIMBRIE MA MENO NUMEROSI E PIU’ LUNGHI, SONO SITI DI ATTACCO VIRUS.
DIVERSE CLASSI IN BASE A STRUTTURA E FUNZIONE: CONIUGAZIONE (PILI SESSUALI), ADESIONI DEI
PATOGENI AD OSPITI PER INFEZIONE, FUNZIONI DI MOVIMENTO.
ESISTE UNA MOBILITA’ PER SCIVOLAMENTO SU SUPERFICI SOLIDE (ES. CYTPHAGA): BASATO SULLA
EMISSIONE DI SOSTANZE MUCILLAGINOSE ALL’ESTERNO DELLA CELLULA.
RIVESTIMENTI EXTRACELLULARI: STRATO S (S-LAYER), CAPSULA, STRATI MUCOSI, GUAINA; ESTERNI ALLA
PARETE; FUNZIONE DI PROTEZIONE O ADESIONE.
STRATO S: PRESENTE IN ALCUNI BACTERIA ED ARCHEA; NON VITALE; NATURA PROTEICA O GLICOPROTEICA;
NEI GRAM+ RICOPRE LA SUPERFICIE ESTERNA DEL PEPTIDOGLICANO; NEI GRAM- ADERISCE O PENETRA
NELLA MATRICE DELLA MEMBRANA ESTERNA; RICOPRE INTERAMENTE LA PARETE CELLULARE ED E’
PRESENTE IN TUTTE LE FASI DI CRESCITA.
STRATO S COSTITUITO DA SUE SUBUNITA’ UGUALI CHE SI RIPETONO IN MODO ORDINATO FORMANDO
STRUTTURE CRISTALLINE; DISGREGAZIONE MEDIANTE DETERGENTI E RIASSOCIAZIONE IN VITRO;
INDIVIDUATI RECETTORI DI BATTERIOFAGI E COINVOLGIMENTO NEI PROCESSI DI ADESIONE.
CAPSULA: MATRICE POLISACCARIDICA; NON VITALE PER LA CELLULA; STRUTTURA PROTETTVA DI MATRICE
POLISACCARIDICA ESTERNA ALLA CELLULA CHE PER LA SUA VISCOSITA’ NON SI ALLONTANA DA
QUEST’ULTIMA E FUNGE ANCHE DA PROTEZIONE.
STRATI MUCOSI: RESPONSABILI DELLA MOTILITA’ PER SCIVOLAMENTO; BATTERI SCIVOLATORI SONO
CARATTERIZZATI DALLA SECREZIONE DI UNA SOSTANZA MUCOSA IN PARTE PERSA NELLA SCIA DI
TRAIETTORIA DELL’ORGANISMO.
GUAINE: ALCUNI BATTERI SINTETIZZANO UNO STRATO DENSO E RESISTENTE E ORGANIZZATO FORMATO DA
POLISACCARIDI E AMINOUCCHERI; BATTERI PRESENTI IN POSTI DOVE VI E’ CORRENTE E GUAINA PROTEGGE
DA EVENTUALI TURBOLENZE.
CITOPLASMA: 70-80% ACQUAE 20-30% PROTEINE AMMINOACIDI ACIDI NUCLEICI ZUCCHERI GRASSI
VITAMINE IONI INORGANICI; DENSO, TRASPARENTE ED ELASTICO; ELEVATA CONCENTRAZIONE DI
RIBOSOMI.
RIBOSOMI: SONO DEPUTATI DELLA SINTESI PROTEICA; COSTITUITI DAL 60% RNA E 40% PROTEINE;
POSSONO ESSERE DEBOLMENTE ASSOCIATI ALLA MEMBRANA PLASMATICA; RESPONSABILI ASPETTO
GRANULARE DEL CITOPLASMA; DURANTE LA TRADUZIONE (SINTESI MRNA) FORMAZIONE DI
POLIRIBOSOMI; 2 SUBUNITA’: 1 30S, 2 50S; SEQUENZA RNA 16S PER PROC E 18S PER EUCA USATI PER
ALBERO FILOGENETICO, ALCUNI ANTIBIOTICI BLOCCANO L’ATTIVITA’ RIBOSOMIALE
VESCICOLE GASSOSE: SOTTILE INVOLUCRO PROTEICO CHE FORMANO UNO SPAZIO CAVO CON CONTENUTO
DI GAS; FORNISCONO GALLEGIABILITA’ AI PROCARIOTI ACQUATICI E PERMETTONO SPOSTAMENTI
VERTICALI IN AMBIENTI ACQUATICI; MEMBRANE PROTEICHE IMPERMBEABILI ALL’ACQUA E PERMEABILI AI
GAS, 45 200 NANOMETRI; EFFICIENZA DI MOVIMENTO MAGGIORE CHE CON FLAGELLI.
GEMMAZIONE: MODALITA’ MENO COMUNE DEI BATTERI; CELLULA MADRE EMETTE ESTROFLESSIONE,
FORMAZIONE DI UNA PICCOLA GEMMA, ACCRESCIMENTO DELLA GEMMA, DISTACCAMENTO DELLA
GEMMA PER STROZZATURA, CELLULA MADRE MANTIENA PROPRIA IDENTITA’.
I PARAMETRI DI CRESCITA SONO INFLUENZATI DALLA SPECIE MICROBICA E DALLE CONDIZIONI AMBIENTALI;
L’ANDAMENTO DELLA CRESCITA VIENE MISURATO IN SISTEMI CHIUSI (COLTURE BACH); IN UN SISTEMA
CHIUSO UNA SPECIE SEGUE UNA DETERMINATA CURVA CHIAMATA CURVA CI CRESCITA; LA CURVA DI
CRESCITA E’ UN ESPRESSIONE GRAFICA IN UN GRAFICO SEMILOGARITMICO DELL’ANDAMENTO DELLA
CRESCITA MICROBICA.
SISTEMI CHIUSI: SPECIE COLTIVATA IN SISTEMI CHIUSI E POSSIAMO NOTARE DIVERSE FASI: FASE DI
LATENZA IN CUI NON SI VERIICA NESSUNA DIVISIONE CELLULARE; FASE DI CRESCITA ESPONENZIALE IN CUI
IL NUMERO DI MICROBI SI RADDOPPIA SEGUENDO UN ANDAMENTO COSTANTE DURA FINCHE’ NON
VENGONO ACCUMULATI TUTTI I METABOLITI; FASE STAZIONARIA IN CUI DIVISIONE E MORTE SONO
PERFETTAMENTE BILANCIATE; FASE DI MORTE IN CUI VI E’ UN DECLINO DELLA CRESCITA E LE MORTI SONO
SUPERIORI ALLE DIVISIONI.
INDIRETTI: SI CONTANO SOLO LE CELLULE VITALI SENZA UTILIZZARE MICROSCOPIO, SCEGLIENDO MEZZO DI
COLTURA ED INCUBAZIONE SI SELGONO GLI ORGANISMI DA CONTARE. (MISURE DELLA TORBIDITA’).
I METODI DI CONTA DIRETTA SONO PER ESEMPIO LA CAMERA DI BURKER; MA E’ IMPOSSIBILE DISTINGUERE
CELLULE VIVE DA CELLULE MORTE, DIFFICOLTA PER CONTE IN CAMPIONI POCO CONCENTRATI, RISULTATO
E’ INFLUENZATO DA DIVERSE FONTI DI ERRORE: CATTIVA MESSA A FUOCO, CELULE MOBILI, SOGGETTIVTA’
OPERATORE.
A SECONDA DELLA COMPOSIZIONE DEL MEZZO E DEI METODI DI INCUBAZIONE SI POSSONO CONTARE
TUTTE LE CELLULE O SPECIFICI GRUPPI MICROBICI. SONO CONTATE CELLULE VIVE E VITALI; E’ IMPORTANTE
ALLESTIRE DELLE SOLUZIONI IN RINGER.
CONTA SU PIASTRA: SI CONTANO SOLO LE CELLULE VITALI E COLTIVABILI; RISULTATO ESPRESSO IN UFC/ml
O UFC/g; COMPOSIZIONI MEZZO DI COLTRA SI ADATTA A DIVERSE ESIGENZE: PER CONTARE POPOLAZIONI
DIVERSE (MEZZI SELETTIVI/DISCIMINATIVI); PER CONTARE BATTERI IN ECOSISTEMI DIFFERENTI
(ACQUA/SUOLO).
PCA TERRENO COMPLESSO, USATO PER CONTARE MICROBI IN MATRICI RICCHE DI NUTRIENTI;
R2A TERRENO COMPLESSO, USATO PER CONTARE MICROBI IN MATRICI POVERE DI NUTRIENTI.
MATRICI LIQUIDE ES.ACQUA DOLCE, NON SI DILUISCE MA SI CONCENTRA PERCHE’ SONO MATRICI LIQUIDE
CON POCHE CELLULE.
CONTA VITALE IN SUBSTRATO LIQUIDO: MPN (MOST PROBABLE NUMBER), MPN/ml MPN/g, SI BASA SU
CALCOLO PROBABILISTICO; PASSAGGI: ALLESTIMENTO DILUIZIONI, INOCULO TUBI CONTENENTI MEZZO
LIQUIDO, INCUBAZIONE, VERIFICA TUBI POSITIVI E NEGATIVI IN BASE ALLA TORBIDITA’, DETERMINAZIONE
DEL NUMERO CARATTERISTICO E DILUIZIONE LIMITE. SI USANO LE TAVOLE DI MCCRADY PER MPN.
SI PUO’ USARE LA MISURA DELLA TORBIDITA PER CALACOLARE IL NUMERO, INFATTI MICROBI ASSORBONO
LA LUCE CHE PASSA PER IL MEZZO LIQUIDO CONTENENTE LE CELLULE, MISURA TORBIDITA’ PER MISURARE
QUINDI LA MASSA CELLULARE.
GLI SVANTAGGI SONO SOLO NEL FATTO CHE POSSONO ESSERCI BIOFILM E NECESSITANO L’UTILIZZO DI UN
AGITATORE PER LA CONTA.
PUO’ ESSERE EFFETTUATA UNA COLTURA PER SCOPI INDUSTRIALI, PER STUDIARE UNA SPECIE, PER
PREPARAZIONI FARMACEUTICHE.
ISOLAMENTO: UN INDIVIDUO CHE VIENE SEPARATO DAL SUO HABITAT E VIENE COLTIVATO PER CREARE
UNA COLTURA PURA. COLTURA PURA SIGNIFICA COLTURA CONTENENTE CELLULE DERIVANTI DA UN’UNICA
CELLULA MADRE.
TERRENO O SUBSTRATO DI COLTURA DEVE ESSERE ADATTO A FAR SINTETIZZARE ALLA CELLULA
COMPONENTI CELLULARI (ANABOLISMO) E A FAR PRODURRE ENERGIA (CATABOLISMO)
COLONIA: POPOLAZIONE MICROBICA CHE SI ORIGINA DA UNA SOLA CELLULA SU UNO STRATO SOLIDO;
ALCUNE DELLE TECNICHE DI CONTA E ISOLAMENTO PIU’ COMUNI SI BASANO PROPRIO SULL’ALLESTIMENTO
DI COLONIE.
PATINA MICROBICA: INSIEME DI COLONIE CHE PER LA LORO PROSSIMITA’ CAUSANO UN PATINA O STRATO
OMOGENEO SUL MEZZO DI COLTURA SOLIDO.
L’ASPETTO DELLA COLONIA SI DIFFERENZIA IN OGNI SPECIE; NELLE COLONIE FUNGINE INFATTI VI E’ UNA
DIFFERENZA DI MICELIO E DI PRODUZIONE DI SPORE.
LE FONTI DI CARBONIO SONO MONOSACCARIDI ESOSI SOLO POCHE VOLTE PENTOSI, POLIMERI COME
AMIDO CELLULOSA O LIGNINA, CO2; LE FONTI DI AZOTO SONO SALI AMMONIACALI, NITRATI, UREA,
PROTEINE E PEPTONI, N2; FONTI DI ZOLFO SONO MgSO4, CISTEINA, ESTRATTO DI LIEVITO; FONTI DI
FOSFORO FOSFATI (SALI), CATIONI, VITAMINE, AMMINOACIDI.
TERRENI SINTETICI POSSONO ESSERE SEMPLICI O COMPLESSI: SEMPLICI SONO CHIMICAMENTE DEFINITI;
USO DI CONCENTRAZIONI NOTE DI INGREDIENTI, BASE MINERALE, FONTE C, FONTE N, FONTE ENERGIA; I
TERRENI COMPLESSI SONO QUEI TERRENI DI CUI NON SI CONOSCE LA COMPOSIZIONE CHIMICA
DETTAGLIATA, SODDISFANO LE CARATTERISTICHE NUTIZIONALI DI CHEMIOETEROTROI ANCHE MOLTO
DIVERSI TRA LORO, GLI INGREDIENTI TIPO SONO PEPTONE, ESTRATTO DI CARNE O ESTRATTO DI LIEVITO,SI
PUO’ AGGIUNGERE ANCHE FONTE DI C O ENERGIA (CARBOIDRATI); PERMETTONO LA COLTIVAZIONE DI
SPECIE CON ESIGENZE NUTRIZIONALI NON NOTE, PREPARATI COMMERCIALI DISDRATATI.
TERRENI DI COLTURA POSSONO ESSERE LIQUIDI O SOLIDI: SOLIDI PER ESEMPIO AGAR (ESTRATTO DA ALGHE
ROSSE, MISCELA DI POLISACCARIDI SOLUBILIZZA H20 OLTRE I 85°C E GELIFICA TRA 32 E 39°C; NON E’
UTILIZZAZTO COME FONTE NUTRITIVA PER LE CELLULE TRANNE CHE PER I CYTOPHAGA).
DIFFERENZIALI: IN CUI SI DISTINGUONO TUTTE LE SPECIE COLTIVATE IN BASE ALL’ASPETTO ASSUNTO DALLE
COLONIE E SONO SIA LIQUIDI CHE SOLIDI.
INFLUENZA DEI PARAMETRI AMBIENTALI SULLE CELLULE MICROBICHE: OGNI SPECIE MICROBICA HA
CONDIZIONI OTTIMALI DI CRESCITA; SE LE CONDIZIONI NON SONO OTTIMALI LE CRESCITE RALLENTA FINO
AD ARRESTARSI; SE LE CONDIZIONI SONO TROPPO DISTANTI DA QUELLE OTTIMALI LA CELLULA NON SI
SVILUPPOA SINO AD ARRIVARE ALLA MORTE.
ANAEROBI OBBLIGATI: O2 DANNOSO E TOSSICO PER LO SVILUPPO E USANO ALTRE MOLECOLE PER LA
RESPIRAZIONE;
OSSIGENO POSSIEDE DELLE FORME TOSSICHE: DURANTE IL METABOLISMO SI FORMANO DELLE SPECIE
REATTIVE DELL’OSSIGENO DENOMINATE ROS; O2 (ANIONE SUPEROSSIDO); OH° RADICALE IDROSSILE; H2O2
PEROSSIDO DI IDROGENO; I MECCANISMI DI DIFESA DEGLI AEROBI ESISITONO GRAZIE A PARTICOLARI
ENZIMI: SUPEROSSIDO DISMUTASI, PEROSSIDASI, CATALASI.
IN RISPOSTA ALLO STRESS ACIDO PRODUZIONE PROTEINA ATR SE PH 5.5, ASP SE INFERIORE A 5.
NEI FUNGHI H+ATPASI POMPA ALL’ESTERNO IONI H+ UTILIZZANDO ENERGIA; NEI MEZZI DI COLTURA
DEVONO ESSERE UTILIZZATE SOLUZIONI TAMPONE PER MANTENERE COSTANTE IL VALORE DI PH; UTILIZZO
INDICATORI DI PH PER VISUALIZZARE CAMBIAMENTI.
DISPONIBILITA’ DI H20 è FONTAMENTALE PER LA CRESCITA DELLA CELLULA PROCARIOTICA; IN ESSA SONO
DISCIOLTE SOSTANZE NUTRITIVE PER LA CELLULA; DISPONIBILITA’ H2O E’ DIVERSO DA PRESENZA H2O.
ALOTOLLERANTI TOLLERANO FINO AD UN 15% DI NaCl; RISPOSTA ALLO STRESS OSMOTICO: STRATEGIA
SALT-IN ACCUMULO KCl O SALT OUT
NON TUTTI GLI ORGANISMI HANNO LE STESSE ESIGENZE NUTRIZIONALE E I NUTRIENTI SONO ASSIMILATI IN
MANIERA DIVERSA DAI MICROORGANISMI.
IL CICLO CELLUALRE DI BATTERI SPORIGENI CELLULA VEGETATIVA POI ENDOSPORA POI CELLULA
VEGETATIVA; NELLE COLTURE CHIUSE SPORULAZIONE A FINE FASE ESPONENZIALE O INIZIO FASE
STAZIONARIA; LA SPORULAZIONE E’ UNA DIVISIONE CELLULARE ASIMMETRICA INNESCATA DA SEGNALI
EXTRACELLULARI; SI INNESCA CON L’ESPRESSIONE DEI GENI SPO (FASE DI DETERMINAZIONE E
DIFFERENZIAZIONE). DURATA DEL PROCESSO DALLE 7 ALLE 15 ORE.
RESISTENZA E PROTEZIONE DEL DNA DA SITUAZIONI AVVERSE E’ DATA DAL DIPICOLINATO DI CALCIO.
QUIESCENZA/DORMIENZA: L’ENDOSPORA PUO’ ESISTERE PER PERIODI MOLTO LUNGHI PER POI DIVENTARE
RAPIDAMENTE CELLULA VEGETATIVA.
LA RESISTENZA AL CALORE DIPENDE DA: RESISTENZA DELLA CELLULA VEGETATIVA, SITUAZIONE IDRICA
DELL’AMBIENTE, CONDIZIONI TERMICHE IN CUI E’ AVVENUTA LA SPORIFICAZIONE.
MAGGIORANZA DEGLI SPORIGENI SI TROVA NEL SUOLO; DAL SUOLO RAGGIUNGONO ALTRI COMPARTI;
SPORIGENI ANAEROBI FACOLTATIVI ANCHE IN GRADO DI FERMENTARE A SECONDA DELLE CONDIZIONI
AMBIENTALI.
CATABOLISMO REAZIONI DEGRATATIVE CON LOS COPO DI PRODURRE ENERGIA; ANABOLISMO REAZIONI DI
SINTESI CON LO SCOPO DI CONSUMARE ENERGIA; CATALIZZATORI SONO ENZIMI.
PROCESSI ANABOLICI: TUTTE LE MOLECOLE HANNO BISOGNO DI CARBONIO, IN BASE ALLA FONTE DI C GLI
ORGANISMI SI DIVIDONO IN ETEROTROFI (RICAVANO C DA MOLECOLE ORGANICHE) AUTOTROFI
(RICAVANO C DA CO2); ESISTONO ANCHE I MIXOTROFI.
ATP E POTERE RIDUCENTE PRODOTTI TRAMITE UNA REAZIONE REDOX; FLUSSO DI ELETTRONI E REAZIONI
REDOX IN SEQUENZA; NEI PROCARIOTI CATENE DI TRASPORTO SULLA MEMBRANA CITOPLASMATICA E
NEGLI EUCARIOTI NEI MITOCONDRI.
ATP: ADENOSINTRIFOSFATO
TAPPE PRODUZIONE ATP: SI PARTE DAL GLUCOSIO, POI CICLO DI KREBS, POI TRASPORTO DI ELETTRONI, POI
FOSFORILAZIONE OSSIDATIVA, INFINE ATP.
GLICOLISI: CATABOLISMO DEL GLUCOSIO: GLUCOSIO E’ OSSIDATO AD ACIDO PIRUVICO PRODUCENDO ATP E
NADH.
GENERAZIONE DELLA FORZA PROTON MOTRICE:GLI ELETTRONI DI NADH E FADH2 ENTRANO NELLE CATENE
DI TRASPORTO DI ELETTRONI E FORMANO UN GRADIENTE DI H+.
CATENA DI TRASPORTO DEGLI ELETTRONI: ENZIMI REDOX IN MEMBRANA; L’ORDINE IN CUI SONO DISPOSTI
NELLA CATENA DI TRASPORTO DIPENDE DAL POTENZIALE DI RIDUZIONE.
GENETICA E TASSONOMIA:
SPECIAZIONE: PROCESSO FILOGENETICO DI FORMAZIONE DELLE SPECIE BIOLOGICHE; BATTERI HANNO UNA
RAPIDA EVOLUZIONE; EREDITA’ VERTICALE E TRASFERIMENTO GENICO ORIZZONTALE; MUTAZIONI.
MUTAZIONI: MODIFICHE NEL DNA EREDITABILI SOLO SE VANTAGGIOSE; ALLA BASE DELL’EVOLUZIONE;
PRESSIONE SELETTIVA AMBIENTALE; MUTAZIONI INDOTTE DALL’UOMO MA POSSONO ANCHE ESSERE
SPONTANEE.
TASONOMIA: SCIENZA CHE SI OCCUPA DELLA CLASSIFICAZIONE DEGLI ORGANISMI; MOSTRA RELAZIONI
NATURALI TRA ORGANISMI; L’OBIETTIVO E’ FORNIRE UN’IDENTIFICAZIONE UNIVERSALE; SCIENZA
SOGGETTA A CAMBIAMENTI; RAGGRUPPAMENTI DENOMINATI TAXA.
18 PHYLA PRICIPALI
SPECIE MICROBICHE MOLTO PIU’ VARIABILI DI ANIMALI E PIANTE; SONO CARATTERIZZATE DA DIFFERENZE
GENOTIPICHE E FENOTIPICHE; ESISTOONO CEPPI TIPO.
SPECIE E’ UNITA’ TASSONOMICA FONDAMENTALE; SPECIE IDENTIFICATE CON CONFRONTO CON CEPPI
TIPO; CEPPI DIVERSI INDICANO VARIABILITA’ NELLA STESSA SPECIE.
SPECIE: CEPPI CON DNA SIMILE A CIRCA IL 70%; OPPURE RNA 16S CHE DIFFERISCE SOLO DEL 3% E’
CONSIDERATO DELLA STESSA SPECIE.
HABITAT DEI FUNGHI: FORME DI VITA MOLTO ADATTABILI; COLONIZZANO UN’AMPIA GAMMA DI TESSUTI
ORGANICI; TESSUTI ANIMALI E VEGETALI; IMPORTANTI REGOLATORI DELL’ECOSISTEMA; CIRCA 100000
SPECIE; RILEVANTI IN ECOSISTEMI FORESTALI, INTERVENGONO NELLA PRODUZIONE DI ALIMENTI E
BEVANDE E FORMANO MICORRIZZE E LICHENI; TALVOLTA SONO TOSSICI (PATOGENI DELLE PIANTE E
DELL’UOMO).
SI RIPPRODUCONO PER MEZZO DI SPORE MITOTICHE E MEIOTICHE A SECONDA DELLA SPECIE E DELLE
CONDIZIONI AMBIENTALI; OGNI GRUPPO DI FUNGHI HA SPORE CARATTERISTICHE; MOLTIPICAZIOSE
ASESSUATA PIU’ COMUNE DI QUELLA SESSUATA; APOLIDI DIPLOIDI E DICARIOTICI; PARETE CELLULARE
SIMILE A QUELLA VEGETALE MA PRESENZA DI CHITINA; INIZIALMENTE LA CLASSIFICAZIONE FU DIFFICILE.
IFE POSSONO ESSERE SETTATE O CENOCITICHE; SETTI HANNO PORI ATTRAVERSO I QUALI POSSONO
PASSARE ORGANELLI E MATERIALI CITOPLASMATICI.
FASE VEGETATIVA O ASESSUATA: LE SPORE VEGETATIVE (CONIDI) SONO UNA PRESENZA COSTANTE
NELL’ARIA RESPONSABILI DELLA PROPAGAZIONE DELLA SPECIE; IL TIPO DI SPORE VARIA CON IL PHYLUM.
RIPRODUZIONE SESSUALE ED ASESSUATA POSSONO ESSERE SEPARATE NEL TEMPO E NELLO SPAZIO;
TELEOMORFO = FASI SESSUALI
ANAMORFO: CRESCITA E DIFFUSIONE DELLE IFE, DIVISIONE CELLULARE PER GEMMAZIONE, MITOSPORE
PRODOTTE DA FASE ASESSUATA COMUNEMENTE CHIAMATI CONIDI O SPORANGIOSPORE;
SPORE SESSUALI E ASESSUATE SI FORMANO DIRETTAMENTE SULLE IFE, NEGLI SPORANGI, CORPI
FRUTTIFERI.
ARTROSPORE SI FORMANO PER FRAMMENTAZIONE DELLA IFA; BLASTOSPORE SIMILI A GEMME DI LIEVITO
E SI FORMANO LUNGO LE IFE; CLAMIDIOSPORE FORMA SFERICA O OVOIDALE SI FORMANO LUNGO L’IFA O
ALLA SUA ESTREMITA’; CONIDIOSPORE SI FORMANO ALL’ESTREMITA’ DELLA IFA; SPORANGIOSPORE SI
PRODCONO DENTRO LO SPORANGIO.
OSSIGENO NEI FUNGHI: LA MAGGIOR PARTE AEROBI FACOLTATIVI: HANNO BISOGNO DI O2 MA POSSONO
FERMNTARE ZUCCHERI ANCHE IN ASSENZA DI OSSIGENO; POCHI ANAEROBI OBBLIGATI TIPO I
CITRIDYOMYCOTA CHE VIVONO NEL RUMINE. QUASI TUTTI I FUNGHI RICHIEDONO OSSIGENO ALMENO IN
QUALCHE FASE DEL LORO CICLO VITALE.
LA SOPRAVVVENZA DEI FUNGHI DIPENDE QUASI SEMPRE DA TEMPERATURA E UMIDITA’: MAGGIOR PARTE
DEI FUNGHI SONO MESOFILI E HANNO UN OPTIMUM COMPRE TRA I 20 E 30°C; ALCUNI TERMOFILI CON UN
OPTIMUM DI 40°C; ALCUNI PSICROFILI E IN GRADO DI CRESCERE SOTTO LO 0°C.
UMIDITA’. TUTTI I FUNGHI RICHIEDONO QUASI SEMPRE LA PRESENZA DI H2O PER LA DIFFUSIONE DEI
NUTRIENTI NELLE CELLULE; PER IL RILASCIO DEEGLI ENZIMI EXTRACELLULARE; PER IL MANTENIMENTO DEL
CITOPLASMA.
OPTIMUM DELLA MAGGIOR PARTE DEI FUNGHI E’ 5.0-7.0 DI PH; ALCUNI ACIDOTOLLERANTI ED ALTRI
BASOFILI. OMEOSTASI COMPORTA ATPasi.
FUNGHI SONO CLASSIFICATI IN BASE ALLA STRUTTURA, A CICLO VITALE, AL TIPO DI IFE, AL TIPO DI SPORE,
ALLA MODALITA’ DI RIPRODUZIONE.
CHYTRIDIOMYCOTA: FUNGHI PIU’ SEMPLICI, FILOGENESI NON RISOLTA, IL NOME DERIVA DALLA
STRUTTURA DEL CORPO FRUTTIFERO CHE CONTIENE LE ZOOSPORE, QUANDO RILASCIATE DAL CORPO
FRUTTIFERO LE ZOOSPORE SONO MOBILI PERCHE’ DOTATE DI FLAGELLO, SPECIE A CELLULA SINGOLA ED
ALTRE A MICELIO, SAPROFITI E PARASSITI.
ZYGOMYCOTA: FUNGHI CON LE PIU’ ANTICHE TESTIMONIANZE FOSSILI, LA MAGGIOR PARTE SONO FUNGHI
TERRESTRI POCO APPARISCENTI, SAPROFITI PARASSITI MICORRIZZE, IFE DI GRANDE CALIBRO NON SETTATE
MA CENOCITICHE, PARETE CELLULARE COSTITUITA DA CHITINA, PRODUTTORI DI CLAMIDIOSPORE; FASE
VEGETATIVA CONIDIOSPORE PRODOTTE NEL CONIDIANGIO PORTATA DA UN IFA SPECIALIZZATA CHIAMATA
CONIDIANGIOFORO, CONIDIANGIO DI SOLITO GROSSO E GLOBOSO E SI ROMPE LIBERANDO LE SPORE; FASE
SESSUALE ORGANISMO APLOIDE SEMPRE TRANNE CHE NELLA FASE SESSUALE, RIPRODUZIONE AVVIENE
PER FUSIONE DI NUCLEI APLOIDI CONTENUTI IN GAMETANGI, PORTATI DA DUE IFE DI SEGNO OPPOSTO
APPARTENENTI A CEPPI DIFFERENTI, FORMAZIONE DI ZIGOSPORA 2N.
Microrganismi sono coinvolti intimamente nel riciclo delle sostanze organiche, accade che ogni strato
“degradato” si accumula su un altro e così via. (ANDAMENTO CICLICO)
Microrganismi sono sicuramente raggruppati in base alle caratteristiche di decomposizione del materiale
organico e inorganico.
Tutti gli elementi sono in continua trasformazione: MINERALE E ORGANICO; OSSIDATO RIDOTTO;
IMMOBILIZZATO DISPONIBILE.
REAZIONI BIOTIHCE:
Prima degradazione molecole più semplici, poi produzione di CO2 e moltiplicazione delle cellule microbiche,
successivamente degradati amidi, emicellulose, pectine, proteine (biomassa microbica costante).
A seconda delle condizioni ambientali degli zuccheri, questi possono essere fermentati(con produzione di
C02 ATP cellule acidi organici e metano) o respirati( con produzione di CO2 ATP e cellule).
La capacità di degradare l’amido è molto comune tra i microorganismi: funghi; da Aspergillus si estraggono
amilasi; batteri Pseudomonas, streptomyces, bacillus.
EMICELLULOSE: associate alla cellulosa, fanno parte della parete cellulare vegetale.
PECTINE: polimeri delle pareti primarie delle cellule vegetali. Degradate in seguito attraverso microrganismi
che posseggono tutti gli enzimi (pectinasi).
CELLULOSA: DEGRATA IN SEGUTO DA CELLULOSITICI PRIMARI CHE HANNO TUTTI GLI ENZIMI (CELLULASI) O
CELLULOSITICI SECONDARI CHE NE HANNO SOLO ALCUNI. E’ UN POLIMERO LINEARE INSOLUBILE SI
DISPONGONO A FORMARE FIBRE E FIBRILLE.
IN ANAEROBIOSI: NEL SUOLO, SEDIMENTI, TUBO DIGERENTE, RUMINE; ALCUNI SONO AZOTOFISSATORI;
SPECIE STUDIATE SOO PER LA MAGGIOR PARTE SIMBIONTI DEI RUMINANTI E DEGLI INSETTI. SPESSO
POSSONO DEGRADARE ALTRE SOSTANZE OLTRE A CELLULOSA E FARE FERMENTAZIONE PRODUCENDO CO2,
ALCOL, ACIDI ORGANICI, METANO.
MARCIUME BRUNO: ATTACCONO TUTTI I POLIMERI DI PARETE MA NON APRONO GLI ANELLI AROMATCI
IL CICLO E’ QUESTO: PRIMA POLIMERI POI MONOMEREI (DEGRADAZIONE), POI FERMENTAZIONE, H2, CO2,
CH3COO-, POI METANOGENESI
METANOGENI: ARCHEA ATTIVI A POTENZIALI REDOX MOLTO BASSI.; METANOGENI OBBLIGATI; DIFFERENZE
NELLA MORFOLOGIA, 16 S, E PARETE CELLULARE (3 TIPI DIVERSI DI PARETE PSEUDOMUREINA,
ETEROPOLISACCARIDI, PROTEINE); AMPIA GAMMA DI HABITATI ANAEROBICI, FINO AD I PIU’ ESTREMI;
SOLFATI METALLI OSSIDATI E NITRATI INESISTENTI O CONSUMATI DA ALTRE REAZIONE ANAEROBICHE.
CICLO DELL’AZOTO
ENERGIA OTTENIBILIE A : PRESSIONI DI 100 MPA E 350°C (PROCESSO INDUSTRIALE PER LA SINTESI DI
FERTILIZZANTI), A PRESSIONE ATMOSFERICA E TEMPERATURA AMBIENTE (GRAZIE ALL’ENZIMA
NITROGENASI (AZOTOFISSAZIONE MICROBICA))
PUO’ ESSERE LIBERA E SIMBIONTICA: MICRORGANISMI LIBERI MOLTO DIVERSI TRA LORO (IN COMUNE
SOLO AZOTOFISSAZIONE). RESA DI AZOTO SICURAMENTE MINORE RISPETTO A SIMBIONTI; SI DIVIDONO IN
FOTOSINTETIZANTI E NON FOTOSINTETIZZANTI.
FOTOSINTETIZANTI: CIANOBATTERI TRA GLI AZOTOFISSATORI PIU’ DIFFUSI ED IMPORTANTI; AUTOTROFI
PER IL CARBONIO (FOTOAUTOTROFIA) E PER L’AZOTO (AZOTOFISSAZIONE); POTENZIALE INTERESSE
APPLICATIVO MA PRODUZIONE DI TOSSINE. (TRICOMA, ETEROCISTI)
SIMBIONTI: INTERAZIONI PROFONDE CON PIANTE SUPERIORI; RIZOBI (RYZOBHIUM) SONO I PIU’ STUDIATI;
FISSAO AZOTO IN NODULI RADICALI DELLE LEGUMINOSEE; DESCRITTE NUOVE SPECIE DI RIZOBI E CAMBIO
DELLA NOMENCLATURA.
L’AZOTO DATO DAI SIMBIONTI E’ SUPERIORE ALL’AZOTO DI QUELLI LIBERI, N E’ SUBITO DISPONIBILE ALLA
PIANTA.
SIMBIOSI: SECREZIONE FLAVONOIDI CHE STIMOLANO LA CRESCITA DEI RIZOBI E FAVORISCONO LA PIANTA,
EFFETTO CHEMOTATTICO E INDUZIONE TRASCRIZIONE GENI DI NODULAZIONE, INIZIO DELL’INFEZIONE
(BATTERIOIDI), PENETRAZIONE NELLE RADICI E FORMAZIONE NODULI RADICALI, LEGHEMOGLOBINA
PROTEGGE NITROGENASI DA OSSIGENO, DA DEGRADAZIONE NODULI CELLULE LIBERE PER CREARE NUOVE
SIMBIOSI.
INOCULAZIONE LEGUMINOSE (BATTERIZZAZIONE DEI SEMI) PIU’ ESTESA E ANTICA PRATICA DI RILASCIO
DELIBERATO DAI MICRORGANISMI DELL’AMBIENTE.
NELLA RIZOSFERA I MICRORGANISMI HANNO UNA GRANDE VARIABILITA’ DI FONTI ORGANICHE DA USARE
PER IMMAGAZZINARE C ORGANICO, FONTI DI ENERGIA E COME FONTI DI CRESCITA; RILASCIO DA PARTE
DEL VEGETALE DI ACIDI ORGANICI, AMMINOACIDI CHE SONO MOLECOLE ORGANICHE SUBITO DISPONIBILI
E FACILMENTE UTILIZZABILI; ASSORBIMENTO E RILASCIO DA PARTE DELLE RADICI DI COMPOSTI ORGANICI
ED INORGANICIDETERMINA NELLA RIZOSFERA LA FORMAZIONE DEI GRADIENTI RADIALI E LONGITUDINALI
DI ELEMENTI NUTRITIVI, PH E OSSIGENO.
ATTIVITA’ DEGLI APPARATI RADICALI DIFFERISCE IN FUNZIONE DEL TIPO E PORZIONE DELLA RADICE
CONSIDERATA, LA DISTRIBUZIONE DEGLI ELEMENTI NUTRITIVI NEL SUOLO NON E’ OMOGENEA, I
GRADIENTI CHE SI FORMANO NEL SUOLO PRESENTANO UN’AMPIA VARIABILITA’; CREAZIONE DI
MICROAMBIENTI ALL’INTERNO DELLA RIZOSFERA.
CONCENTRAZIONE DELLE CELLULE MICROBICHE NELLA RIZOSFERA E’ MAGGIORE CHE NEL SUOLO LIBERO;
CELLULE AD ALTO TASSI DI CRESCITA IN GRADO DI UTILIZZARE VELOCEMENTE LA SOSTANZA ORGANICA
SEMPLICE; DIVERSITA’ FILOGENETICA MINORE RISPETTO A RESTANTE SUOLO; POSSIBILE INIBIZIONE DEGLI
ORGANISMI FITOPATOGENI; INFLUENZA RIZOSFERA SU MICRORGANISMI DIPENDE DA CARATTERISTICHE
FISIOLOGICHE DEI DIVERSI GRUPPI MICROBICI.
PGPR: PROMOTORI DELLA CRESCITA DELLE PIANTE; BATTERI PGPR COLONIZANO LA RIZOSFERA E
SVOLGONO ATTIVITA’ POSITIVE PER LA CRESCITA DELLE PIANTE; STUDIO PGPR DI GRANDE INTERESSE
AGRARIO; ALCUNI RAPPORTI POCO SPECIFICI, ALTRI MOLTO SPECIFICI; RAPPORTO PGPR E BIANTE SI BASA
SU MECCANISMI DI SCAMBIO; LE PIANTE FORNISCONO SOTTOFORMA DI ESSUDATI RADICALI FONTE DI C ED
ENERGIA; I BATTERI PGPR, A SECONDA DELLA LORO ATTIVITA’ SPECIFICA, FAVORISCONO LA CRESCITA E LO
SVILUPPO VEGETALE.
PRODUZIONE DI FITORMONI: STRATEGIA UTILIZZATA DAI BATTERI PER MIGLIORARE L’INTERAZIONE CON LE
RADICI; MICRORGANISMI RIZOSFERICI RILSCIANO COMPOSTI CHE NELLE PIANTE FAVORISCONO
ALLUNGAMENTO, DIVISIONE E DIFFERENZIAMENTO CELLULARE; PRODUZIONE DI FITORMONI CHE
PROMUOVONO DIRETTAMENTE LA CRESCITA VEGETALE; PRODUZIONE DI ENZIMI CHE REGOLANO I LIVELLI
ORMONALI VEGETALI.
RESISTENZA SISTEMICA INDOTTA (ISR) : RENDE LA PIANTA RESISTENTE ALL’INFEZIONE; ALCUNI PGPR
POSSONO INDURRE TALE RESISTENZA; PER ESEMPIO TRAMITE PSEUDOMONAS SENSIBILITA’ RIDOTTA DEL
GAROFANO ALLA FUSARIOSI; ISR NON RICHIEDE CHE IL CEPPO SIA A CONTTATTO DIRETTO CON IL
PATOGENO; LA RESISTENZA DELLE PIANTE PUO’ ESSERE INDOTTA CON INOCULI DEL CEPPO PGPR NEL
SUOLO.
ECTOMICORRIZE FUNGO COLONIZZA LA RADICE SOLO ESTERNAMENTE; MANTELLO CHE AVVOLGE APICI
RADICALI;
FILLOSFERA: