Corso di laurea in Scienze Biologiche

BIOLOGIA MOLECOLARE I (2020-21)

(MF0269) CFU 9
LEZIONE 5

RNA

francesca.sironi@uniupo.it
https://upobook.uniupo.it/francesca.sironi
 L’ipotesi dell’adattatore
DNA

?
proteine

Figura 2F2.1 Alcuni membri dell’RNA Tie Club 1954.

1960 mRNA
Nota di Crick
RNA: la struttura chimica di base
 RNA: strutture a doppia elica

appaiamenti delle
basi non canonici

Stem-Loop (simile alla forma A)

• Sequenze complementari
- doppie (forma A)
- forcine
- anse interne
- gemme
- triple eliche

• Appaiamenti delle basi non Watson & Crick e non canonici

 MODIFICAZIONE
CHIMICA
DELLE BASI AZOTATE

Es: metilazioni -CH3

FUNZIONE: ruolo nei processi

biologici che coinvolgono il DNA e
gli RNA
RNA: strutture secondarie

Appaiamenti
< Reverse
Hoogsteen

Appaiamenti
non canonici
delle basi

Appaiamenti
tipo Hoogsteen
 RNA, strutture complesse, molteplici funzioni??

Struttura lineare

Struttura doppia elica

Struttura tridimensionale
 Funzioni – ruolo dell’RNA

• INTERMEDIARIO: mRNA

• RACCORDO: tRNA

• STRUTTURALE: rRNA

• REGOLATORE: piccoli RNA

• ENZIMA: ribozomi
tRNA: la struttura trifoglio -> L

forcine,
anse,
steli,
gemme,
anse interne
giunzioni a 4 vie.
 Strutture complesse
Fattori che influenzano i ripiegamenti / strutture

Legami – interazioni intramolecolari

• Appaiamenti delle basi non Watson & Crick e non canonici

• Sequenze complementari -> pseudonodi/ anse

• motivo A-minore

Legami – interazioni intermolecolari

• Proteine hnRNP

• Ioni, es Mg++
Legami – interazioni intramolecolari: PSEUDONODI

doppie e

triple eliche

Strutture secondarie Strutture terziarie

Molecular Cell Biology. 4th edition.

Legami – interazioni intramolecolari: anse

• poco stabili

• stabili: tetraloop

GC-UGUU-GU
Legami – interazioni intramolecolari: motivo A-minore
Legami – interazioni intermolecolari: proteine hnRNP
- ribonucleoproteine
- nucleari
- eterogene

Interazioni
- transienti
- stabili
 Struttura RNA, come identificarla

Siti di mutazione - RNA 3’ -> 5’

Siti di acetilazione - RNA 5’ -> 3’

Struttura terziaria dell’RNA ed EVOLUZIONE DIRETTA
Struttura tridimensionale RNA : riconoscimenti / interazioni struttura mediato

Aptamers

Aptamers, like antibodies, are capable of specifically binding to targets

and modulating or blocking their activity
They are used as sensors, and therapeutic tools, and to regulate cellular
processes, as well as to guide drugs to their specific cellular targets. Contrary
to the actual genetic material, their specificity and characteristics are not
directly determined by their primary sequence, but instead by their tertiary
structure.
Struttura terziaria dell’RNA ed EVOLUZIONE DIRETTA
Struttura tridimensionale RNA : riconoscimenti / interazioni struttura mediato

SELEX
Systematic Evolution
of Ligands
by exponential
enrichment

Aptameri
Aptameri – uso come biosensori