Il modello semiconservativo I due filamenti di DNA originario si separano
Ognuno di essi diventa uno stampo per l’assemblaggio
di un filamento complementare a partire da una riserva di nucleotidi liberi disponibili nell’ambiente
I nucleotidi si allineano uno alla volta lungo il
filamento stampo, seguendo la regola dell’appaiamento delle basi 4 La duplicazione del DNA dipende dallo specifico appaiamento delle basi azotate
Appositi enzimi uniscono i nucleotidi formando
il nuovo filamento di DNA
Per ogni molecola di DNA originaria si ottengono due
“molecole figlie” identiche, ognuna formata da un nuovo filamento e un filamento della molecola originaria 5 La duplicazione del DNA ha inizio simultaneamente in molti punti e procede grazie alla DNA polimerasi La duplicazione del DNA inizia in particolari punti di origine della duplicazione I filamenti di DNA si separano origine a bolle di duplicazione
La duplicazione procede quindi in entrambe
le direzioni allargando le bolle di duplicazione
All’estremità di ogni bolla si trova una forcella
di duplicazione, ossia un primo tratto di DNA, a forma di Y, con i due filamenti originari separati 5 La duplicazione del DNA ha inizio simultaneamente in molti punti e procede grazie alla DNA polimerasi In una cellula batterica di E. Coli il cromosoma, come molti altri cromosomi batterici, è circolare La duplicazione ha origine in un solo punto: si forma quindi un’unica bolla di duplicazione
Il processo avanza in entrambe le direzioni fino a che
l’intera molecola non viene duplicata 5 La duplicazione del DNA ha inizio simultaneamente in molti punti e procede grazie alla DNA polimerasi Nel cromosoma di una cellula eucariote: Ci possono essere centinaia o perfino alcune migliaia di punti di origine, dai quali la duplicazione può partire simultaneamente
Si formano così altrettante bolle che si fondono
l’una con l’altra, accelerando in questo modo la copia delle lunghe molecole di DNA 5 La duplicazione del DNA ha inizio simultaneamente in molti punti e procede grazie alla DNA polimerasi Il complesso di duplicazione: complesso di enzimi e proteine che partecipano alla duplicazione del DNA Elicasi: una proteina in grado svolgere e di aprire la doppia elica in corrispondenza della forcella di duplicazione
Proteine destabilizzatrici dell’elica
che mantengono distaccati i due filamenti una volta separati 5 La duplicazione del DNA ha inizio simultaneamente in molti punti e procede grazie alla DNA polimerasi Topoisomerasi: tagliano, girano e ricuciono i filamenti originari di DNA oltre la forcella di duplicazione, per rimuovere la tensione causata dallo svolgimento dell’elica
Primasi: sintetizza il cosiddetto innesco (o primer),
un piccolo frammento di RNA costruito aggiungendo una alla volta 5-10 ribonucleotidi al filamento stampo di DNA
I primer vengono eliminati e sostituiti da DNA
al termine della duplicazione 5 La duplicazione del DNA ha inizio simultaneamente in molti punti e procede grazie alla DNA polimerasi Dna polimerasi: sintetizzano il DNA aggiungendo i nuovi nucleotidi solo all’estremità 3' del filamento nascente e mai all’estremità 5‘
Un filamento di DNA di nuova sintesi può crescere
esclusivamente nella direzione 5’ 3’ 6 La duplicazione del DNA procede in modo differente sui due filamenti Dato che la DNA polimerasi può allungare il filamento in una sola direzione la sintesi procede in modo differente sui due filamenti Per ogni forcella di duplicazione La duplicazione del filamento che ha l’estremità 3’ libera rivolta alla forcella di duplicazione (il filamento veloce) procede senza interruzioni partendo da un solo primer di RNA 6 La duplicazione del DNA procede in modo differente sui due filamenti La duplicazione del filamento antiparallelo (il filamento lento) procede a ritroso e in modo discontinuo, per piccoli frammenti isolati (frammenti di Okazaki), ciascuno dei quali necessita di un primer Successivamente i frammenti di Okazaki vengono saldati tra loro dall’enzima DNA ligasi 6 La duplicazione del DNA procede in modo differente sui due filamenti In generale durante la duplicazione del DNA in una bolla di duplicazione accade: La primasi sintetizza un primer di RNA per ogni frammento di Okazaki La sintesi procede fino al primer del filamento precedente, dove la DNA polimerasi si stacca e ricomincia dal primer successivo Un’altra polimerasi rimuove i primer sostituendoli con nuovo DNA e lasciando un’interruzione tra due frammenti di Okazaki adiacenti La ligasi in seguito lega a due a due le estremità adiacenti e terminare così la sintesi del filamento lento 7 Le estremità 5’ dei filamenti, i telomeri, non vengono duplicate Una volta rimosso il primer all’estremità 5’ di un filamento la DNA polimerasi non è in grado di sostituirlo con DNA Per questo i filamenti si accorciano a ogni ciclo di duplicazione 7 Le estremità 5’ dei filamenti, i telomeri, non vengono duplicate Alle estremità di ogni cromosoma si trovano sequenze non codificanti ripetute chiamate telomeri Per impedire che i telomeri si accorcino troppo passando da una generazione all’altra, nelle cellule della linea germinale è presente l’enzima telomerasi, che ripristina la lunghezza dei telomeri fino al valore massimo 8 Gli errori di duplicazione vengono corretti grazie alla correzione di bozze e ad altri meccanismi di riparazione Raramente accade che venga inserito un nucleotide errato durante la duplicazione Nella maggior parte dei casi la stessa DNA polimerasi sostituisce il nucleotide con quello giusto
Quando ciò non accade intervengono altri enzimi
e correggono l’errore
Una piccola percentuale di casi sfugge a entrambi
i controlli 8 Gli errori di duplicazione vengono corretti grazie alla correzione di bozze e ad altri meccanismi di riparazione La riparazione per escissione In molti casi, un segmento del filamento danneggiato viene tagliato (escisso) da un enzima chiamato nucleasi, e la lacuna che ne risulta viene riempita di nucleotidi utilizzando il filamento non danneggiato come stampo
Gli enzimi coinvolti nel riempimento sono una DNA