Molécula

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Para otros términos similares, véase Molécula (desambiguación).

Representación esquemática de los átomos (bolas negras) y los enlaces moleculares (barras
blancas-grises) de una molécula de Fullereno C60, es decir, una sustancia elemental formado por
sesenta átomos de carbono.

En química, una molécula (del nuevo latín molecula, que es un diminutivo de la palabra moles,
'masa') es un grupo eléctricamente neutro y suficientemente estable de al menos dos átomos en
una configuración definida, unidos por enlaces químicos fuertes (covalentes o enlace iónico).1234
56

En este estricto sentido, las moléculas se diferencian de los iones poliatómicos. En la química
orgánica y la bioquímica, el término "molécula" se utiliza de manera menos estricta y se aplica
también a los compuestos orgánicos (moléculas orgánicas) y en las biomoléculas.

Antes, se definía la molécula de forma menos general y precisa, como la más pequeña parte de
una sustancia que podía tener existencia independiente y estable conservando aún sus
propiedades fisicoquímicas. De acuerdo con esta definición, podían existir moléculas
monoatómicas. En la teoría cinética de los gases, el término molécula se aplica a cualquier
partícula gaseosa con independencia de su composición. De acuerdo con esta definición, los
átomos de un gas noble se considerarían moléculas aunque se componen de átomos no
enlazados.7

Una molécula puede consistir en varios átomos de un único elemento químico, como en el caso
del oxígeno diatómico (O2),8 o de diferentes elementos, como en el caso del agua (H2O).9Los
átomos y complejos unidos por enlaces no covalentes como los enlaces de hidrógeno o los enlaces
iónicos no se suelen considerar como moléculas individuales.

Las moléculas como componentes de la materia son comunes en las sustancias orgánicas (y por
tanto en la bioquímica). También conforman la mayor parte de los océanos y de la atmósfera. Sin
embargo, un gran número de sustancias sólidas familiares, que incluyen la mayor parte de los
minerales que componen la corteza, el manto y el núcleo de la Tierra, contienen muchos enlaces
químicos, pero no están formados por moléculas. Además, ninguna molécula típica puede ser
definida en los cristales iónicos (sales) o en cristales covalentes, aunque estén compuestos por
celdas unitarias que se repiten, ya sea en un plano (como en el grafito) o en tres dimensiones
(como en el diamante o el cloruro de sodio). Este sistema de repetir una estructura unitaria varias
veces también es válida para la mayoría de las fases condensadas de la materia con enlaces
metálicos, lo que significa que los metales sólidos tampoco están compuestos por moléculas. En el
vidrio (sólidos que presentan un estado vítreo desordenado), los átomos también pueden estar
unidos por enlaces químicos sin que se pueda identificar ningún tipo de molécula, pero tampoco
existe la regularidad de la repetición de unidades que caracteriza a los cristales.

Casi toda la química orgánica y buena parte de la química inorgánica se ocupan de la síntesis y
reactividad de moléculas y compuestos moleculares. La química física y, especialmente, la química
cuántica también estudian, cuantitativamente, en su caso, las propiedades y reactividad de las
moléculas. La bioquímica está íntimamente relacionada con la biología molecular, ya que ambas
estudian a los seres vivos a nivel molecular. El estudio de las interacciones específicas entre
moléculas, incluyendo el reconocimiento molecular es el campo de estudio de la química
supramolecular. Estas fuerzas explican las propiedades físicas como la solubilidad o el punto de
ebullición de un compuesto molecular.

Las moléculas rara vez se encuentran sin interacción entre ellas, salvo en gases enrarecidos y en
los gases nobles. Así, pueden encontrarse en redes cristalinas, como el caso de las moléculas de
H2O en el hielo o con interacciones intensas pero que cambian rápidamente de direccionalidad,
como en el agua líquida. En orden creciente de intensidad, las fuerzas intermoleculares más
relevantes son: las fuerzas de Van der Waals y los puentes de hidrógeno. La dinámica molecular es
un método de simulación por computadora que utiliza estas fuerzas para tratar de explicar las
propiedades de las moléculas.

Índice

1 Definición y sus límites

2 Tipos de moléculas

3 Descripción

4 Moléculas en la teoría cuántica

4.1 Aproximación de Born-Oppenheimer

5 Véase también

6 Referencias

6.1 Bibliografía

6.2 Enlaces externos

Definición y sus límites

De manera menos general y precisa, se ha definido molécula como la parte más pequeña de una
sustancia química que conserva sus propiedades químicas, y a partir de la cual se puede
reconstituir la sustancia sin reacciones químicas. De acuerdo con esta definición, que resulta
razonablemente útil para aquellas sustancias puras constituidas por moléculas, podrían existir las
"moléculas monoatómicas" de gases nobles, mientras que las redes cristalinas, sales, metales y la
mayoría de vidrios quedarían en una situación confusa.

Las moléculas lábiles pueden perder su consistencia en tiempos relativamente cortos, pero si el
tiempo de vida medio es del orden de unas pocas vibraciones moleculares, estamos ante un
estado de transición que no se puede considerar molécula. Actualmente, es posible el uso de láser
pulsado para el estudio de la química de estos sistemas.

Las entidades que comparten la definición de las moléculas pero tienen carga eléctrica se
denominan iones poliatómicos, iones moleculares o moléculas ion. Las sales compuestas por iones
poliatómicos se clasifican habitualmente dentro de los materiales de base molecular o materiales
moleculares.

Ejemplo de Molécula Poliatómica: el agua

Las moléculas están formadas por partículas. Una molécula viene a ser la porción de materia más
pequeña que aún conserva las propiedades de la materia original. Las moléculas se encuentran
fuertemente enlazadas con la finalidad de formar materia. Las moléculas están formadas por
átomos unidos por medio de enlaces químicos.

Una molécula es una unidad de sustancia que puede ser monoatómica o poliatómica. La unidad de
todas las sustancias gaseosas es la molécula.10

Tipos de moléculas

Las moléculas se pueden clasificar en:

Moléculas discretas: constituidas por un número bien definido de átomos, sean estos del mismo
elemento (moléculas homonucleares, como el dinitrógeno o el fullereno) o de elementos distintos
(moléculas heteronucleares, como el agua).

Molécula de dinitrógeno, el gas que es el componente mayoritario del aire

Molécula de fullereno, tercera forma estable del carbono tras el diamante y el grafito

Molécula de agua, "disolvente universal", de importancia fundamental en innumerables procesos

bioquímicos e industriales

Representación poliédrica del anión de Keggin, un polianión molecular

Macromoléculas o polímeros: constituidas por la repetición de una unidad comparativamente

simple -o un conjunto limitado de dichas unidades- y que alcanzan pesos moleculares
relativamente altos.

Representación de un fragmento de ADN, un polímero de importancia fundamental en la genética

Enlace peptídico que une los péptidos para formar proteínas

Representación de un fragmento lineal de polietileno, el plástico más usado

Primera generación de un dendrímero, un tipo especial de polímero que crece de forma fractal

Descripción

La estructura molecular puede ser descrita de diferentes formas. La fórmula molecular es útil para
moléculas sencillas, como H2O para el agua o NH3 para el amoníaco. Contiene los símbolos de los
elementos presentes en la molécula, así como su proporción indicada por los subíndices.

Para moléculas más complejas, como las que se encuentran comúnmente en química orgánica, la
fórmula química no es suficiente, y vale la pena usar una fórmula estructural o una fórmula
esqueletal, las que indican gráficamente la disposición espacial de los distintos grupos funcionales.

Cuando se quieren mostrar variadas propiedades moleculares, o se trata de sistemas muy

complejos como proteínas, ADN o polímeros, se utilizan representaciones especiales, como los
modelos tridimensionales (físicos o representados por ordenador). En proteínas, por ejemplo,
cabe distinguir entre estructura primaria (orden de los aminoácidos), secundaria (primer
plegamiento en hélices, hojas, giros…), terciaria (plegamiento de las estructuras tipo
hélice/hoja/giro para dar glóbulos) y cuaternaria (organización espacial entre los diferentes
glóbulos).

Figura 1. Representaciones de la terpenoide, atisano, 3D (centro izquierda) y 2D (derecha). En el

modelo 3D de la izquierda, los átomos de carbono están representados por esferas azules; las
blancas representan a los átomos de hidrógeno y los cilindros representan los enlaces. El modelo
es una representación de la superficies molecular, coloreada por áreas de carga eléctrica positiva
(rojo) o negativa (azul). En el modelo 3D del centro, las esferas azul claro representan átomos de
carbono, las blancas de hidrógeno y los cilindros entre los átomos son los enlaces simples.

Moléculas en la teoría cuántica

La mecánica clásica y el electromagnetismo clásico no podían explicar la existencia y estabilidad de

las moléculas ya que de acuerdo con sus ecuaciones una carga eléctrica acelerada emitiría
radiación por lo que los electrones necesariamente perderían energía cinética por radiación hasta
caer sobre el núcleo atómico. La mecánica cuántica proveyó el primer modelo cualitativamente
correcto que además predecía la existencia de átomos estables y proporcionaba explicación
cuantitativa muy aproximada para fenómenos empíricos como los espectros de emisión
característicos de cada elemento químico.

En mecánica cuántica una molécula o un ion poliatómico se describe como un sistema formado
por {\displaystyle N}N electrones de masa {\displaystyle m}m y {\displaystyle M}M núcleos de
masas {\displaystyle m_{j}}{\displaystyle m_{j}}. En mecánica cuántica las interacciones físicas de
estos elementos se presentan por un hamiltoniano cuántico, cuyos autovalores serán las energías
permitidas del sistema y cuyas autofunciones describirán los orbitales moleculares de la molécula,
y de esos objetos se podrán deducir las propiedades químicas de la molécula. En lo que sigue se
designará mediante e, la carga de cada electrón, mientras que la de cada núcleo, con {\displaystyle
Z_{j}}{\displaystyle Z_{j}} protones, será {\displaystyle Z_{j}e}{\displaystyle Z_{j}e}. Para estudiar
este sistema es necesario analizar el siguiente hamiltoniano cuántico:

(1){\displaystyle {\hat {H}}_{mol}=-\sum _{j=1}^{N}{\frac {\hbar ^{2}}{2m}}\nabla _{x_{j}}^{2}-\sum

_{j=1}^{M}{\frac {\hbar ^{2}}{2m_{j}}}\nabla _{y_{j}}^{2}+V(x,y)}{\displaystyle {\hat
{H}}_{mol}=-\sum _{j=1}^{N}{\frac {\hbar ^{2}}{2m}}\nabla _{x_{j}}^{2}-\sum _{j=1}^{M}{\frac
{\hbar ^{2}}{2m_{j}}}\nabla _{y_{j}}^{2}+V(x,y)}

definido sobre el espacio de funciones antismetrizadas de cuadrado integrable {\displaystyle

L_{sym}^{2}(\mathbb {R} ^{3(N+M)})}{\displaystyle L_{sym}^{2}(\mathbb {R} ^{3(N+M)})}, las
coordenadas asociadas a las posiciones de los electrones vienen dadas por {\displaystyle
x=(x_{\dot {a}}2,\dots ,x_{N})\in \mathbb {R} ^{3N}}{\displaystyle x=(x_{\dot {a}}2,\dots
,x_{N})\in \mathbb {R} ^{3N}} y la de los núcleos atómicos vienen dadas por {\displaystyle
y=(y_{1},\dots ,y_{M})\in \mathbb {R} ^{3M}}{\displaystyle y=(y_{1},\dots ,y_{M})\in \mathbb {R}
^{3M}}. Y las interacciones electrostáticas entre electrones y núcleos vienen dadas por el potencial
{\displaystyle V(x,y)}{\displaystyle V(x,y)} que se puede escribir como:

(2){\displaystyle V(x,y)={\frac {1}{2}}\sum _{i\neq j}{\frac {e^{2}}{\|x_{i}-x_{j}\|}}-\sum _{i,j}{\frac

{Z_{j}e^{2}}{\|x_{i}-y_{j}\|}}+{\frac {1}{2}}\sum _{i\neq j}{\frac {Z_{i}Z_{j}e^{2}}{\|y_{i}-y_{j}\|}}}
{\displaystyle V(x,y)={\frac {1}{2}}\sum _{i\neq j}{\frac {e^{2}}{\|x_{i}-x_{j}\|}}-\sum _{i,j}{\frac
{Z_{j}e^{2}}{\|x_{i}-y_{j}\|}}+{\frac {1}{2}}\sum _{i\neq j}{\frac {Z_{i}Z_{j}e^{2}}{\|y_{i}-y_{j}\|}}}

donde el primer término representa la interacción de los electrones entre sí, el segundo la
interacción de los electrones con los núcleos atómicos, y el tercero las interacciones de los núcleos
entre sí. En una molécula neutra se tendrá obviamente que:

{\displaystyle \sum _{j=1}^{M}Z_{j}=N}{\displaystyle \sum _{j=1}^{M}Z_{j}=N}

Si {\displaystyle M=1}{\displaystyle M=1} se tendrá un átomo polielectrónico si {\displaystyle

Z_{1}>1}{\displaystyle Z_{1}>1}, y un átomo hidrogenoide si {\displaystyle Z_{1}=1}{\displaystyle
Z_{1}=1}.

Aproximación de Born-Oppenheimer
Resolver el problema de autovalores y autofunciones para el hamiltoniano cuántico dado por (1)
es un problema matemático difícil, por lo que es común simplificarlo de alguna manera. Así dado
que los núcleos atómicos son mucho más pesados que los electrones (entre 103 y 105 veces más)
puede suponerse que los núcleos atómicos apenas se mueven comparados con los electrones, por
lo que se considera que están congelados en posiciones fijas, con lo cual se puede aproximar el
hamiltoniano (1) por la aproximación de Born-Oppenheimer dada por:

(3){\displaystyle {\hat {H}}_{mol,N}^{BO}(y)=-\sum _{j=1}^{N}{\frac {\hbar ^{2}}{2m}}\nabla

_{x_{j}}^{2}+V(x,y)}{\displaystyle {\hat {H}}_{mol,N}^{BO}(y)=-\sum _{j=1}^{N}{\frac {\hbar ^{2}}
{2m}}\nabla _{x_{j}}^{2}+V(x,y)}

definido sobre el espacio de funciones {\displaystyle L_{sym}^{2}(\mathbb {R} ^{3N})}{\displaystyle

L_{sym}^{2}(\mathbb {R} ^{3N})} y donde {\displaystyle y\in \mathbb {R} ^{3M}}{\displaystyle
y\in \mathbb {R} ^{3M}} es la posición de los núcleos que para el análisis se considera fija. El
resultado básico de este análisis viene dado por el siguiente resultado matemático:

Teorema de Kato

Los operadores {\displaystyle {\hat {H}}_{m}ol}{\displaystyle {\hat {H}}_{m}ol} y {\displaystyle {\hat

{H}}_{mol,N}^{BO}(y)}{\displaystyle {\hat {H}}_{mol,N}^{BO}(y)} son autoadjuntos y acotados
inferiormente.

Tosio Kato

La propiedad de ser autoadjunto implicará que las energías son cantidades reales, y el que sean
acotados inferiormente implicará que existe un estado fundamental de mínima energía por debajo
del cual los electrones no pueden decaer, y por tanto, las moléculas serán estables ya que los
electrones no pueden perder y perder energía como parecían predecir las ecuaciones del
electromagnetismo clásico. Dos resultados matemáticos adicionales nos dicen como son las
energías permitidas de los electrones dentro de una molécula:11

Teorema HVZ para átomos y moléculas BO

El espectro esencial {\displaystyle \sigma _{ess}({\hat {H}}_{mol,N}^{BO})=[\Sigma _{N},\infty )}
{\displaystyle \sigma _{ess}({\hat {H}}_{mol,N}^{BO})=[\Sigma _{N},\infty )}, donde {\displaystyle
\Sigma _{N}=\inf({\hat {H}}_{mol,N-1}^{BO})}{\displaystyle \Sigma _{N}=\inf({\hat {H}}_{mol,N-
1}^{BO})}, la energía {\displaystyle \Sigma _{N}}{\displaystyle \Sigma _{N}} se denomina umbral de
ionización.

W. Hunziker, C. Van Winter y G. M. Zhislin

Además dentro de la mecánica cuántica puede demostrarse que pueden existir iones positivos
(cationes, con carga positiva comparable al núcleo atómico), mientras que no es igual de fácil
tener iones negativos (aniones), el siguiente resultado matemático implica tiene que ver con la
posibilidad de cationes y aniones:11

Teorema

Para {\displaystyle N<\sum _{j}Z_{j}+1}{\displaystyle N<\sum _{j}Z_{j}+1}, el hamiltoniano

{\displaystyle {\hat {H}}_{mol,N}^{BO}}{\displaystyle {\hat {H}}_{mol,N}^{BO}} tiene un número
infinito de autovalores (energías permitidas) por debajo del umbral de ionización {\displaystyle
\Sigma _{N}}{\displaystyle \Sigma _{N}}, además los estados ligados {\displaystyle \Psi _{N}^{(i)}
(x_{1},x_{2},\dots ,x_{N})}{\displaystyle \Psi _{N}^{(i)}(x_{1},x_{2},\dots ,x_{N})}, con energías
{\displaystyle E_{N}^{(i)}<\Sigma _{N}}{\displaystyle E_{N}^{(i)}<\Sigma _{N}} satisfacen la cota
exponencial

{\displaystyle \int _{\mathbb {R} ^{3N}}|\Psi _{N}^{(i)}(x)|^{2}e^{2\alpha \|x\|}d^{3N}x<\infty

,\qquad \forall \alpha <{\sqrt {\Sigma _{N}-E_{N}^{(i)}}}}{\displaystyle \int _{\mathbb {R}
^{3N}}|\Psi _{N}^{(i)}(x)|^{2}e^{2\alpha \|x\|}d^{3N}x<\infty ,\qquad \forall \alpha <{\sqrt {\Sigma
_{N}-E_{N}^{(i)}}}}

Véase también

Compuesto químico

Nanotecnología

Número de Avogadro

Volumen molar
Referencias

Unión Internacional de Química Pura y Aplicada: (1994) /M04002.html molecule, Compendium of

Chemical Terminology, conocido como Gold Book.

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5.

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43302-9.

Brown, T. L. (2003). Chemistry - the Central Science, 9th Ed. Nueva Jersey: Prentice Hall. ISBN 0-
13-066997-0.

Chang, Raymond (1998). Chemistry, 6th Ed. Nueva York: McGraw Hill. ISBN 0-07-115221-0.

Zumdahl, Steven S. (1997). Chemistry, 4th ed. Boston: Houghton Mifflin. ISBN 0-669-41794-7.

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Thibodeau, Gary A.; Patton, Kevin T. (2008-06). Estructura y función del cuerpo humano. Elsevier
España. ISBN 9788480863551. Consultado el 5 de febrero de 2018.

Vaquerizo, Dulce María Andrés (2016). Ciencias aplicadas a la actividad profesional 4º ESO. Editex.
ISBN 9788490788097. Consultado el 5 de febrero de 2018.

Ocampo, Dapueto, Piovano (2009). «1». En Universidad Nacional del Litoral, ed. Química General.
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Bibliografía

Gustafson, S. J. & I. M. Sigal (2011): Mathematical Concepts of Quantum Mechanics, Springer-

Verlag, ISBN 978-3-642-21866-8.