Suscríbete a DeepL Pro para poder editar este documento.

Entra en www.DeepL.com/pro para más información.

Resumen

El cromosoma bacteriano debe ser compactado más de 1000 veces para que quepa en su compartimiento
celular. La forma en que se condensa, organiza y finalmente segrega ha sido un rompecabezas durante más de
medio siglo. Los recientes avances en las imágenes de células vivas y los análisis a escala de genoma han
llevado a nuevos conocimientos sobre estos problemas. Sostenemos que la característica clave de la
compactación es el plegado ordenado del ADN a lo largo de los segmentos adyacentes, y que esta
organización proporciona un acceso fácil y eficiente para las transacciones de proteína-ADN y desempeña un
papel central en el impulso de la segregación. En los eucariotas se utilizan principios similares y proteínas
comunes para condensar y resolver las cromátidas hermanas en la metafase.

Introducción

La visualización y caracterización del material genético de las bacterias ha tenido una historia accidentada y
controvertida. En eucariotas, la segregación ordenada de las cromátides hermanas en la mitosis se describió
con un detalle impresionante en la década de 1880 1; por el contrario, durante muchos años se creyó que el
cromosoma bacteriano, que tiende a teñirse uniformemente con tintes básicos, estaba desestructurado. No fue
hasta el decenio de 1930 que los microscopistas de luz que utilizaban tintes de ADN con células tratadas con
ácido demostraron de manera convincente que el cromosoma bacteriano se concentraba en cuerpos
confinados con contornos suaves e irregulares (Fig. 1A)2,3 . Estas imágenes cambiaron la visión del
cromosoma bacteriano de un material sin forma a una estructura discreta que insinuaba un comportamiento
ordenado y predecible4. Estos cuerpos nucleares parecidos a nubes fueron llamados nucleótidos.

La microscopía crioelectrónica de secciones vítreas de los nucleóides reveló estructuras con características
similares a las observadas utilizando colorantes de ADN (Fig. 1B), con morfologías irregulares y dispersas
que ocupaban aproximadamente la mitad del espacio intracelular. Dos características sorprendentes de estas
imágenes fueron la presencia de muchas proyecciones tipo corral que se extendían en el citoplasma y la
exclusión de los ribosomas del nucleóide 4. Desde entonces se ha observado una compartimentación similar
utilizando el microscopio de fluorescencia 5 (Fig. 1C).

Estas imágenes todavía provocan nuestra idea del cromosoma bacteriano. Imaginamos un núcleo nucleico y
una superficie de ADN que interactúa con las proteínas del citoplasma. Aunque las proteínas pueden penetrar
y residir en el interior del nucleóide, se cree que la mayoría de las transacciones de ADN ocurren en su
periferia.

A principios de los años 70, Pettijohn y sus colegas desarrollaron métodos para lisar suavemente la
Escherichia coli y obtener nucleóides para la visualización directa de la EM 6-8, proporcionando una imagen
duradera del cromosoma bacteriano como una colección de bucles plectonémicos (entrelazados) que emanan
de un núcleo denso (Fig. 1D) que se sugiere que está organizado por proteínas y ARN 6,7,9,10. La
composición, organización, función (¡e incluso la existencia!) del núcleo siguen siendo cuestiones
importantes y pendientes en este campo. Estos estudios condujeron al modelo de roseta del cromosoma
bacteriano en el que los bucles entrelazados están organizados por un andamiaje de nucleóidos (Fig. 1D y Fig.
2A) creando una estructura que se asemeja a un cepillo de botellas. Sin embargo, la naturaleza molecular de
este agregado compacto de ADN, su localización y organización celular y su dinámica local y global en las
bacterias vivas seguían siendo difíciles de alcanzar.

Los avances en la microscopía de fluorescencia y la obtención de imágenes de células vivas, junto con el
desarrollo de enfoques moleculares y analíticos de todo el genoma (véase el Recuadro 1), están
proporcionando nuevos y apasionantes conocimientos sobre la organización y la dinámica de los cromosomas
bacterianos. En este caso, nos basamos en estudios recientes para examinar nuestra comprensión actual de dos
problemas: cómo se organiza y compacta el cromosoma en la célula bacteriana y cómo se desenredan y
segregan los cromosomas replicados. Discutimos estos temas por separado pero, como verán, están
íntimamente conectados. Nuestra premisa rectora es que el plegado ordenado del cromosoma a lo largo de los
segmentos de ADN adyacentes (llamado condensación longitudinal), en sintonía con su replicación, genera su
organización de orden superior y funciona como la fuerza motriz de la segregación cromosómica en masa. A
lo largo de este artículo, destacamos qué principios y mecanismos moleculares son compartidos con los
eucariotas, y qué aspectos son específicos de la dinámica cromosómica única de las bacterias.

Compactación y organización del cromosoma bacteriano

La mayoría de las bacterias contienen un único cromosoma circular de 2-8 megabases (Mb) de tamaño que se
replica bidireccionalmente desde un origen único (oriC). Si se estirara, esta molécula de ADN tendría una
longitud de >1 mm, mientras que el compartimento celular en el que reside tiene un diámetro de <1 μm. Por
consiguiente, el cromosoma bacteriano debe compactarse linealmente más de 1.000 veces para que quepa
dentro de la célula bacteriana 11,12. El ADN se condensa de forma ordenada y jerárquica y describimos esta
compactación y organización desde su unidad más pequeña hasta su mayor dominio.

Microdominios topológicos

El principal mecanismo por el cual el cromosoma bacteriano se compacta es por superenrollamiento negativo
del ADN. Este superenrollamiento del dúplex de ADN genera bucles y ramas plectonémicas como las
observadas por el EM en las dispersiones de los nucleótidos. El superenrollamiento condensa el cromosoma
pero también atrae el ADN sobre sí mismo, alejándolo del ADN no contiguo (como el ADN hermano
replicado). A diferencia de los plásmidos, que pueden relajarse por una sola rotura de hebra, se requieren
varias muescas para relajar completamente el cromosoma, lo que sugiere que el ADN cromosómico está
organizado en dominios superenrollados que están aislados topológicamente entre sí 7. Elegantes
experimentos moleculares que aprovechan las actividades sensibles al superenrollamiento (como la
transcripción y la recombinación) sugieren que los dominios topológicos independientes varían en tamaño
pero son en promedio de 10 kb 13-15. Así pues, un genoma de 4 Mb tendría aproximadamente 400 dominios
topológicamente aislados. En el contexto del modelo de cepillo de botella altamente esquematizado para el
nucleóide, estos dominios son los bucles plectonémicos ramificados que forman las cerdas (Fig. 1D y Fig.
2A). Además de su función en la condensación del cromosoma, estos dominios topológicos protegen al
cromosoma de la relajación del ADN, ayudan a la decatenación de los enlaces cromosómicos y se ha
propuesto que ayuden a reparar las roturas de doble cadena manteniendo los extremos rotos en estrecha
proximidad 14.

Para que estos bucles entrelazados estén aislados topológicamente, necesitan elementos límite (llamados
domainins) que restrinjan la libre rotación del ADN. Se cree que los dominios funcionan restringiendo los
bucles y es probable que se concentren en el núcleo del nucleóide. Se ha propuesto que muchos factores
sirvan como domaininas, entre ellos abundantes proteínas pequeñas asociadas a los nucleóides, el
mantenimiento estructural de los complejos condensados de los cromosomas (SMC), las topoisomerasas, la
ARN polimerasa e incluso el ARN 14,16,17 (Fig. 2B). La mayoría de estos factores

y sus funciones en la organización y compactación de los cromosomas se examinan con mayor detalle a
continuación. Es importante señalar que no parece haber elementos de secuencia específicos que definan los
límites del dominio. A pesar de la imagen de una roseta con un núcleo estático que evocan los nucleóides
esparcidos, la opinión actual es que los bucles entrelazados y sus límites (y por extensión, los dominios que
los definen) son muy dinámicos, cambiando en respuesta a las transacciones de ADN que se producen dentro
de ellos y entre ellos 13,14,16. En consonancia con esta idea, los loci cromosómicos muestran una movilidad
notable, aunque limitada, dentro del nucleóide 18-20. Por lo tanto, imaginamos un núcleo nucleico dinámico o
andamiaje compuesto de un conjunto suelto de dominios. Este andamiaje fluido proporciona estructura y
organización a los bucles superenrollados sin imponer rigidez.
La homeostasis del superenrollamiento está principalmente gobernada por las acciones opuestas de la ADN
girasa, que introduce superenrollos negativos, y la topoisomerasa I (Topo I) que los relaja 21-23. La girasa y el
Topo I se localizan y actúan en todo el cromosoma 24,25. Sin embargo, la girasa también se enriquece antes de
las bifurcaciones de replicación y las burbujas de transcripción donde alivia las superbobinas positivas
introducidas por el desenrollamiento del ADN. Las superbobinas positivas delante de los horquillas de
replicación que no son atendidas por la girasa pueden difundirse hacia atrás, generando hebras hermanas
enmarañadas (llamadas pre-catenarios)26,27 (Fig. 2C). La topoisomerasa IV (Topo IV) es la principal enzima
responsable de la eliminación de estos enredos 28-30; como tal, desempeña un papel central en la segregación
de los cromosomas replicados. En los eucariotas, la topoisomerasa II desempeña una función análoga a la de
la Topo IV, eliminando los enredos generados por la replicación del ADN para resolver las cromátides
hermanas durante las primeras etapas de la mitosis31.

Las superbobinas sin restricciones por sí solas no pueden explicar el grado de compactación exhibido por el
cromosoma bacteriano. Se cree que aproximadamente la mitad del cromosoma está restringido por pequeñas y
abundantes proteínas de unión de ADN 32 (Fig. 2B). Estas proteínas son el equivalente bacteriano de las
histonas eucarióticas. En lugar de envolver el ADN en los nucleosomas, se unen de manera específica y no
específica a lo largo del genoma y facilitan la compactación y organización de los cromosomas introduciendo
pliegues en el ADN y tendiendo puentes entre los loci cromosómicos. La curvatura facilita la condensación de
los segmentos adyacentes de ADN mientras que el puenteo estabiliza los bucles de ADN 33-40. Esta última
actividad sugiere que estas proteínas funcionan como domaininas 32,37. En E. coli, las principales proteínas de
esta clase son HU, IHF, Fis y H-NS. Otras bacterias (como el Bacillus subtilis y el Caulobacter crescentus)
tienen un subconjunto de esta clase de proteínas. Las células que carecen de estos factores tienen defectos en
la segregación cromosómica. Sin embargo, el nucleóide no parece dramáticamente decondenado en su
ausencia, lo que plantea la posibilidad de que otros factores puedan desempeñar un papel más significativo en
la restricción de los dominios superenrollados.

El complejo condensado de SMC altamente conservado es, quizás, el mejor candidato para restringir los
bucles plectonémicos y para funcionar como un andamiaje dinámico de nucleóidos 41,42 (Fig. 2B). En los
eucariotas, los complejos de SMC funcionan en la condensación de cromosomas, la cohesión de las
cromátides hermanas, la recombinación y la compensación de dosis del cromosoma X 43,44. El complejo
bacteriano SMC está compuesto por la proteína SMC, una subunidad de kleisina (cierre) llamada ScpA, y una
tercera proteína llamada ScpB 45-48. Los análogos estructurales y funcionales de este complejo (llamados
MukB, MukF y MukE) se encuentran en E. coli49,50. Las células que carecen de alguna de las proteínas del
complejo de la condensina son inviables a 37°C. A menor temperatura, las bacterias sobreviven sin este
complejo, pero tienen nucleóides decondensados y graves defectos en los cromosomas

segregación 45,47,48,51. El mecanismo por el cual estos grandes complejos se organizan y compactan el ADN
sigue siendo enigmático y es objeto de intensas investigaciones. Los estudios bioquímicos indican que los
complejos SMC o los multímetros de orden superior pueden puentear y restringir los bucles de ADN 17,41,52.
Nuestra opinión es que esta actividad de puenteo funciona de la mano del superenrollamiento y de las
pequeñas proteínas asociadas a los nucleóides para doblar el cromosoma a lo largo de los segmentos
adyacentes. Si es correcto, entonces estos complejos probablemente actúen localmente en los tramos vecinos
de ADN, a pesar de su gran tamaño. Comprender cómo funciona este complejo in vitro e in vivo es la clave
para entender cómo se organiza y compacta el cromosoma bacteriano y cómo se segregan las hermanas.

Macrodominios

El nucleóide se organiza además en estructuras de orden superior llamadas macrodominios, que están
físicamente aisladas unas de otras. Estas grandes regiones (800 kb - 1 Mb de tamaño) han sido identificadas
en E. coli pero sospechamos que son una característica común de muchos cromosomas bacterianos. La
organización de orden superior que define un macrodominio no parece desempeñar un papel central en el
proceso de segregación cromosómica, pero lo refina y aumenta su fidelidad 53 (véase más adelante). La
organización del cromosoma en macrodominios se reconoció por primera vez mediante la hibridación
fluorescente in situ (FISH) 54. Grandes regiones del genoma que abarcan el origen (Ori) y la terminación
(Ter) exhibían patrones de localización espacialmente restringidos que eran distintos del resto del cromosoma,
lo que sugería que los loci de esas regiones se agrupaban. Curiosamente, un ensayo genético basado en la
recombinación para evaluar la frecuencia de las colisiones aleatorias entre diferentes sitios del cromosoma
identificó los mismos macrodominios Ori y Ter. Este ensayo delineó además dos dominios aislados
adicionales que flanquean el macrodominio Ter (llamados macrodominios izquierdo y derecho) y dos
regiones flexibles o no estructuradas que se encuentran a ambos lados del macrodominio Ori 55. De acuerdo
con la idea de macrodominios estructurados y regiones flexibles no estructuradas, se encontró que las
imágenes en lapso de tiempo de los loci cromosómicos marcados con fluorescencia tenían diferentes
comportamientos dinámicos dependiendo de su posición en el cromosoma 56. Los loci de las regiones no
estructuradas mostraban mayor movilidad que los de los macrodominios.

El mecanismo molecular que subyace a la organización de los macrodominios es aún desconocido. Sin
embargo, pruebas recientes sugieren que las proteínas de unión de ADN específicas de la secuencia participan
en esta organización de orden superior. El análisis bioinformático identificó un motivo de secuencia (matS)
que estaba muy sobrerrepresentado en el macrodominio E. coli Ter y virtualmente ausente en el resto del
genoma 53. Este elemento de la secuencia permitió el descubrimiento de una proteína de unión de ADN
(MatP) que une los 23 sitios de matS in vivo. Curiosamente, MatP se localiza como un foco que se superpone
a los loci presentes en el macrodominio Ter, lo que sugiere que reúne u organiza los sitios matS. En esta
capacidad podría actuar como un dominio de sitio específico; alternativamente podría funcionar agrupando
bucles entrelazados en la región terminal. En apoyo de la idea de que MatP es el organizador del
macrodominio Ter, los loci de este dominio se vuelven más móviles en las células que carecen de MatP y se
recombinan con los dominios vecinos con mayor frecuencia. El mecanismo por el cual MatP organiza la
región terminal; la identidad de las proteínas que especifican los otros macrodominios en E. coli; y si existen
o no dominios similares en otras bacterias son todas áreas activas de investigación.

La organización celular del cromosoma

Hasta ahora, hemos considerado la organización y compactación del cromosoma sin la referencia espacial de
la célula bacteriana en la que reside. El desarrollo de métodos para visualizar los loci cromosómicos
individuales en las células vivas utilizando la microscopía de fluorescencia (véase el recuadro 1) 57-60 reveló
un grado de organización espacial que no había sido previamente

apreciada 60-64. Esta robusta organización espacial refuerza nuestro pensamiento sobre cómo se compacta el
cromosoma e informa a nuestros modelos sobre cómo se segrega el ADN recién replicado.

Los primeros estudios citológicos destinados a definir la localización subcelular de los loci cromosómicos se
realizaron en B. subtilis62. El análisis de un locus adyacente al origen reveló que la replicación se inicia en la
célula media o cerca de ella y que los orígenes recién replicados se segregan rápidamente en los bordes
exteriores del nucleóide. La localización subcelular de cuatro posiciones cromosómicas sugiere que al
completarse la replicación el nucleóide adopta una organización en la que los orígenes están presentes cerca
de polos celulares opuestos, los terminales en la célula media y los brazos cromosómicos izquierdo y derecho
se encuentran entre ellos 61 (Fig. 3A).

Queda por abordar cómo y cuándo el origen se desplaza a la mitad de la célula para iniciar una nueva ronda
de replicación y si este movimiento afecta a la organización general del cromosoma. Curiosamente, utilizando
un elegante ensayo genético 65, se identificó una disposición de nucleóides similar "ori-ter ter-ori" en las
células esporuladas de B. subtilis (Fig. 3A). Durante la esporulación, los cromosomas replicados se ensamblan
en una estructura alargada que se extiende de un polo celular al otro 62,66,67. Dentro de esta estructura
serpentina, los orígenes replicados se localizan en polos celulares opuestos y los terminales residen en la
célula media.
El análisis de la organización cromosómica en C. crescentus y E. coli siguió a los primeros estudios
citológicos en B. subtilis y se benefició de las proteínas fluorescentes mejoradas, los métodos de seguimiento
de los loci cromosómicos y los enfoques a nivel de todo el sistema. En C. crescentus, el análisis de >100 loci
separados reveló que la ubicación física de los loci dentro de la célula recapitula el mapa genético 64. En las
células que aún no han iniciado la replicación, el origen y la terminación están presentes en polos opuestos,
todos los demás loci están organizados a lo largo del eje largo de la célula en un orden que se correlaciona
directamente con su posición en el genoma (Fig. 3B). A diferencia del inicio de la replicación en la célula
media en B. subtilis, la replicación se inicia en C. crescentus en el polo de la célula que contiene el origen, y
luego uno de los orígenes se desplaza rápidamente al polo opuesto. Los loci replicados en los brazos izquierdo
y derecho siguen el mismo camino. Así, cuando la replicación se completa, los cromosomas hermanos tienen
una organización ori-ter ter-ori (Fig. 3B). La organización lineal de los brazos cromosómicos sugiere un
plegado ordenado de los segmentos de ADN adyacentes. Sin embargo, la resolución de este enfoque
citológico no es suficiente para evaluar si los dos brazos cromosómicos están resueltos o enredados
espacialmente 68.

Experimentos recientes en C. crescentus utilizando un ensayo de captura de la conformación del cromosoma

de alto rendimiento (llamado 5C) (véase el Recuadro 1) y la modelización computacional han abordado la
disposición de los dos brazos y han proporcionado el primer modelo tridimensional de un cromosoma 69
bacteriano (Fig. 3B). En consonancia con los estudios de microscopía de fluorescencia, el modelo sugiere que en
C. crescentus los brazos derecho e izquierdo del cromosoma están simétricos y organizados linealmente a lo
largo del eje oriente. Es importante señalar que los dos brazos están separados espacialmente aunque se giran
suavemente uno alrededor del otro aproximadamente una vez y media (Fig. 3B). Así, parece que esta bacteria
condensa su cromosoma a lo largo de su longitud, generando dos cepillos de botellas, uno para cada brazo
cromosómico. Esta representación tridimensional del cromosoma C. crescentus recuerda a las estructuras
nucleóicas retorcidas observadas por microscopía de fluorescencia en B. subtilis70 y E. coli71.

Se realizaron análisis citológicos sistemáticos y de todo el genoma similares en E. coli utilizando células de
crecimiento lento con un ciclo celular similar al de las eucariotas, de manera que la progenie recién nacida
tenga una sola copia del cromosoma (Fig. 3C). Estos estudios revelaron que la organización del cromosoma
E. coli es sorprendentemente diferente de la de C. crescentus. Al nacer, el origen se localiza cerca de la media
célula con los brazos cromosómicos izquierdo y derecho en las mitades de las células opuestas 72-74. Para
completar el círculo, la región terminal está en una organización alargada que abarca la longitud de la célula
para unir los dos brazos. Durante el proceso de replicación (y después de su finalización) los cromosomas
hermanos se organizan en una conformación izquierda-or-derecha, izquierda-derecha (Fig 3C), de tal manera
que la división celular recapitula la organización original en las células hijas. A pesar de la diferencia en la
organización global de los cromosomas, como en el caso de C. crescentus, los brazos cromosómicos
izquierdo y derecho están organizados linealmente y tienen una densidad de empaquetamiento
aproximadamente constante de 72-74. La organización izquierda-or-derecha observada es consistente con la
baja frecuencia de recombinación entre los loci en los macrodominios izquierdo y derecho. Sin embargo, el
papel de la región ter como conector de los brazos izquierdo y derecho parece estar en desacuerdo con un
macrodominio Ter estructurado. Queda por descubrir cómo encaja este macrodominio en el contexto de la
organización celular del cromosoma. En resumen, aunque hay diferencias fundamentales en la disposición del
cromosoma en diferentes bacterias, el tema emergente y unificador es que el ADN está organizado
linealmente y condensado a lo largo de su longitud con una densidad de empaquetamiento aproximadamente
constante.

La segregación de cromosomas

Las dos últimas décadas han revelado un grado asombroso de organización espacial del cromosoma
bacteriano. Es importante, como hemos discutido, que esta organización se genere al mismo tiempo que la
replicación y como parte del proceso de segregación. Con este telón de fondo, ahora nos centramos en cómo
se segregan las hermanas replicadas. La segregación de la mayoría de los cromosomas bacterianos puede
dividirse en tres pasos discretos: separación de los nuevos orígenes replicados, segregación de los
cromosomas a granel, y resolución y transporte de los terminales de replicación en el tabique de división. Un
conjunto sorprendentemente pequeño de proteínas altamente conservadas ha sido implicado en estos pasos.
Discutimos cada paso por separado y en el contexto de los patrones de organización de los nucleóides
descritos anteriormente y su recreación en la próxima generación.

Segregación de origen

A diferencia de las células eucarióticas que tienen fases temporalmente distintas para la replicación del ADN,
la condensación de cromosomas y la segregación de cromátidas hermanas, las bacterias organizan, compactan
y segregan sus cromosomas progresivamente a medida que se generan los cromosomas hermanos 64,75,76 (con
las excepciones que se describen a continuación 77) . En consecuencia, se ha prestado mucha atención a la
forma en que se segregan los orígenes, ya que la reubicación de los orígenes proporciona un camino y un
destino para el resto del cromosoma.

El mecanismo por el cual se segregan los orígenes recién replicados ha sido objeto de especulación e
investigación durante más de medio siglo. El modelo de fijación del origen propuesto por Jacob, Brenner y
Cuzin en 1963 fue uno de los primeros y duró más de tres décadas 78. Este modelo postula que los dos
orígenes recién replicados están atados a la envoltura celular cerca de la media célula y están separados por el
crecimiento celular entre ellos. Ahora está claro que la elongación celular en las bacterias con forma de vara
no está restringida al crecimiento zonal en la célula media, sino que se produce en todo el cilindro celular.
Además, el movimiento de los orígenes lejos de la célula media es mucho más rápido que la tasa de
crecimiento celular 18,64,79,80. Por lo tanto, este atractivo modelo simple no puede explicar la segregación de
los orígenes.

A diferencia de la segregación pasiva incorporada en el modelo de fijación del origen, los sistemas de
partición activa se identificaron por primera vez en los plásmidos en la década de 1980 81. Estos sistemas de
separación son esenciales para el mantenimiento estable de los plásmidos de bajo número de copias 82-86 y su
caracterización molecular sigue desempeñando un papel importante en nuestra comprensión de cómo se
segregan los orígenes cromosómicos. Sorprendentemente, más del 65% de todos los genomas bacterianos
secuenciados contienen un locus de partición (par) cromosómicamente codificado 87. Estas especies incluyen
B. subtilis88,89, C. Crescentus90 y Vibrio cholerae91. En cambio, E. coli y sus parientes cercanos no poseen
este sistema. Los cromosomas par loci (como sus homólogos plasmídicos) constan de dos genes, parA y
parB, y un sitio de ADN que actúa como cis llamado parS. Este elemento de ADN de tipo centrómero suele
estar presente en múltiples copias y casi siempre se encuentran muy cerca del origen de la replicación 87. La
inserción de este módulo de partición de tres componentes en un plásmido inestable mejora el mantenimiento
del plásmido incluso en bacterias huésped no relacionadas (incluida la E. coli) 84,92,93. Así pues, este locus
tiene toda la información necesaria para particionar el ADN que alberga la secuencia parS. Wang et al.

Página 7

Durante años, los biólogos de células bacterianas han buscado un aparato mitótico similar a la maquinaria
empleada por los eucariotas para segregar las cromátidas hermanas. El sistema Par es probablemente la
contraparte bacteriana más cercana. Sin embargo, en lugar de segregar cromátidas hermanas completamente
replicadas, este sistema ayuda a separar los orígenes recién replicados (Fig. 4A). La ParB es una proteína de
unión de ADN que se une específicamente a los sitios de la parS generando un gran complejo de
nucleoproteínas adyacentes al origen 89,94. El ParA es una ATPasa con actividad de unión al ADN no
específica que actúa sobre este complejo centromérico 85,95. En lugar de microtúbulos y proteínas motoras, el
motor de ParA utiliza el nucleóide (un verdadero mar de ADN inespecífico) para arrastrar los nuevos orígenes
replicados hacia polos celulares opuestos 96 (Fig. 4A). Elegantes análisis bioquímicos y citológicos han
comenzado a descubrir los fundamentos mecánicos de este simple sistema de segregación (ver Fig. 4A para
más detalles). Remitimos al lector interesado a las recientes revisiones sobre este tema 85,97,98.
Curiosamente, en algunas bacterias el sistema Par juega un papel tanto en el establecimiento como en el
mantenimiento de la organización celular del cromosoma. Por ejemplo, en C. crescentus, después de que el
origen se replica en el polo de la célula, uno de los complejos de origen ParB-parS es arrastrado al polo
opuesto de la célula de una manera dependiente de ParA 99-102. Cuando llega allí, el ParB unido a ParS
interactúa con una proteína de anclaje polar llamada PopZ 103,104. En consecuencia, el sistema de partición
junto con PopZ ayuda a regenerar la organización lineal de origen del cromosoma.

Segregación de origen para-independiente

A pesar del alto grado de conservación entre los parajes, muchas bacterias, incluyendo la E. coli, carecen de
estos módulos de separación. Sin embargo, los orígenes replicados de E. coli se alejan rápidamente de la
célula media 60,63,76. Además, cuando se elimina este locus de las especies que lo contienen, en la mayoría de
los casos sólo hay defectos modestos en la segregación de los cromosomas y la separación de los orígenes
replicados se ve perjudicada pero no eliminada 79,88,105-107 En consecuencia, estos módulos funcionan para
perfeccionar la segregación de los orígenes y mejorar su eficiencia, pero en la mayoría de los casos pueden no
ser el motor de la misma.

¿Cuál es entonces el mecanismo subyacente por el cual se segregan los orígenes? La condensación y
resolución longitudinal ordenada de los orígenes replicados (que se examina más adelante) podría explicar su
separación, pero no explica la mayor velocidad de movimiento de los orígenes en comparación con los loci
cromosómicos más distales108. Es posible que los factores que aún no se han descubierto sean responsables
de la reubicación de los orígenes. Sin embargo, un intrigante modelo alternativo propuesto por Kleckner y sus
colegas postula que las regiones de origen son extruidas hacia los polos celulares como resultado de las
fuerzas de empuje de los intranucleóides. En este modelo, los orígenes replicados sufren condensación y
resolución entre sí, pero permanecen cohesivos en sitios específicos de origen-próximos (llamados
chasquidos). Mientras tanto, la replicación y compactación del ADN continúa sin disminuir. La acumulación
de estos cuerpos de ADN en el espacio confinado de la célula bacteriana genera fuerzas de empuje internas.
Cuando estas fuerzas exceden la fuerza de los chasquidos, la cohesión se pierde, resultando en la abrupta y
rápida extrusión de las regiones de origen condensadas hacia los polos opuestos. Como la replicación
probablemente se inicia en la periferia del nucleóide, el ADN recién replicado se compartimenta naturalmente
a partir del cromosoma no replicado. Esto ayuda a prevenir enredos y proporciona un camino sin obstáculos
para los orígenes extruidos. La base molecular de los broches de presión es actualmente desconocida. Sin
embargo, recientemente se han descrito dos regiones proximales de origen estrechamente espaciadas en el
cromosoma E. coli con propiedades similares a los chasquidos 76,77. Este modelo requiere más investigación
y perfeccionamiento pero, si es correcto, podría ser ampliamente pertinente tanto en las bacterias que lo
poseen como en las que carecen de loci de partición.

La segregación del origen debe ser más altamente orquestada y matizada de lo que este convincente modelo
sugiere. Una observación que resalta esto es el fuerte sesgo posicional en la