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Escuela de Medicina

Generalidades de las enzimas

Mg. Juan Damian Icanaque Ordinola


Generalidades Enzimas

Catalizadores biológicos específicos que aumentan la velocidad de las


reacciones bioquímicas.

▪ Aumentan la velocidad de reacción hasta por un factor de 1017

▪Casi todas las enzimas son proteínas excepto las ribozimas (formadas por
RNA sólo o asociado a proteínas)
Generalidades Enzimas

▪ Las enzimas son necesarias para que las reacciones bioquímicas:


• Se produzcan a una velocidad adecuada para la célula

• Se dirijan hacia rutas útiles y necesarias según necesidades energéticas


y necesidad de producción de distintas sustancias.

▪ Características
▪ Gran poder catalítico
▪ Alto grado de especificidad
▪ Actúan en soluciones acuosas en condiciones determinadas de Tª y pH
▪ Su actividad puede regularse

▪ Importancia
▪ Agricultura

▪ Industria alimentaria

▪ Medicina
Generalidades Enzimas

▪ Características catalíticas

E+S ES E+P

▪ Las enzimas aceleran las reacciones multiplicando su velocidad.

▪ No se alteran en el proceso, no se modifican en su actuación.

▪ No llevan a cabo reacciones que sean energéticamente desfavorables, no


modifican la constante de equilibrio de la reacción, sino que aceleran su
consecución.
Algunos enzimas necesitan cofactores

A veces la actividad catalítica depende de componente químico adicional

▪ Cofactor: metales o iones inorgánicos pequeños, Fe, Mg, Mn, Zn, Co

▪ Coenzima: moléculas orgánicas pequeñas

Apoenzima + Cofactor = Holoenzima


Algunos enzimas necesitan cofactores

▪ Contribuyen alineamiento enzima-sustrato


▪ Sitio adicional de enlace

(FAD)
(NAD)
Vitaminas como cofactores enzimáticos

Enfermedades
VITAMINAS FUNCIONES
carenciales

C (ácido Coenzima de algunas peptidasas. Interviene en la síntesis de


Escorbuto
ascórbico) colágeno

Coenzima de las descarboxilasas y de las enzima que


B1 (tiamina) Beriberi
transfieren grupos aldehídos

B2 Dermatitis y lesiones
Constituyente de los coenzimas FAD y FMN
(riboflavina) en las mucosas

B3 (ácido Fatiga y trastornos del


Constituyente de la CoA
pantotinico) sueño

B5 (niacina) Constituyente de las coenzimas NAD y NADP Pelagra


B6 Interviene en las reacciones de transferencia de grupos
Depresión, anemia
(piridoxina) aminos.
B12
(cobalamina) Coenzima en la transferencia de grupos metilo. Anemia perniciosa

Coenzima de las enzimas que transfieren grupos carboxilo, en


Biotina Fatiga, dermatitis...
metabolismo de aminoácidos.
Tipos de enzimas

▪ Ribozimas
Se llama así toda molécula de RNA que tiene actividad catalítica. Algunas de
las ribozimas constan solo de RNA, y otras están asociadas a proteínas, pero
éstas realizan una mera función estructural.

▪ Telomerasa
Es una ribonucleoproteína con funciones enzimáticas que participa en el
alargamiento de los telómeros de los cromosomas.
▪ Ribozimas
Son anticuerpos que funcionan como enzimas, van dirigidos contra
substratos y moléculas análogas. Los abzimas llevan a cabo reacciones
catalíticas sobre substratos a los que se unen y dan lugar a una modificación
covalente del substrato y la formación, por tanto, de un producto.
▪ Granzimas
Son serín-proteasas que se encuentran dentro de los gránulos de las NK y
que son capaces de inducir la apoptosis a través de la activación de las
caspasas, especialmente la caspasa 3.
Nomenclatura de enzimas

▪ Código numérico encabezado por las letras EC (enzyme commission)


▪ Cuatro números separados por puntos

• El 1º indica a cual de las seis clases pertenece la enzima

• El 2º se refiere a distintas subclases dentro de cada grupo

• El 3º y el 4º se refieren a los grupos químicos específicos que


intervienen en la reacción.

▪ Nombre sistémico

Sustrato preferente + reacción + “asa”

Etanol Alcohol DH Acetaldehído

Alcohol deshidrogenasa E.C. 1.1.1.1


Clasificación de enzimas

1.- Oxidorreductasas: Reacciones de oxido-reducción

2.- Transferasas: Transferencia de grupos intactos de una molécula a


otra

3.- Hidrolasas: Reacciones de hidrólisis


(ruptura de enlaces con participación del agua)

4.- Liasas: Adición de grupos a dobles enlaces


(sin participación del agua)

5.- Isomerasas: Transferencia intramolecular de grupo


(cis/trans, L/D, aldehído/cetona)

6.- Ligasas: Unión de dos sustratos a expensas de la hidrólisis del ATP


Clasificación de enzimas

Hidrolasas
Oxidorreductasas
Esterasas
Deshidrogenasas Transferasas Glucosidasas
Oxidasas Peptidasas
Reductasas Fosfatasas
Transaldolasas y transcetolasas Tiolasas
Peroxidasas
Acil-, metil-, glucosil- y fosforil- transferasas Fosfolipasas
Catalasas
Quinasas Amidasas
Oxigenasas
Fosfomutasas Desaminasas
Hidroxilasas
Ribonucleasas

Liasas Isomerasas
Descarboxilasas
Racemasas
Ligasas
Aldolasas
Hidratasas Epimerasas
Sintetasas
Deshidratasas Isomerasas
Carboxilasas
Sintasas Mutasas
Liasas
Modo de acción de los enzimas

Centro activo: Región del enzima que se une al sustrato y donde se realiza
la catálisis

▪ Es un bolsillo o hendidura tridimensional compuesto por residuos de


aminoácidos de diferentes partes de la molécula que producen un
microambiente específico.

▪ Es relativamente pequeño en comparación con el volumen total del enzima.

▪ Los sustratos se unen mediante múltiples interacciones débiles. Las


interacciones proveen de la energía necesaria para reducir la energía de
activación.

▪ Proporciona la especificidad al enzima.


Especificidad enzimática: especificidad de sustrato

Modelo llave – cerradura (Fischer 1894)

Modelo del ajuste inducido (Koshland 1958)

“Bioquímica” Mathews, van Holde y Ahern. Addison Wesley 2002


Especificidad enzimática: especificidad de sustrato

Sustrato
Modelo llave – cerradura
Centro
activo (Fischer 1894)
Complejo ES

Enzima

Sustrato
Modelo del ajuste inducido
Centro (Koshland 1958)
activo

Complejo ES

Enzima
Especificidad enzimática: especificidad de sustrato

Cambio conformacional inducido por la glucosa en la hexoquinasa

D-Glucosa
Especificidad enzimática: estereoespecificidad

Los enzimas son estereoespecíficos porque forman varias interacciones entre


aminoácidos del centro activo y los distintos grupos del sustrato

1 CH2OH CH2OH
Glicerol quinasa
Glicerolquinasa
2 CHOH OH C H
ATP
3 CH2OH CH2OPO3

Glicerol L-Glicerol 3-fosfato

1 CH2OH
2 C

3
HH
OH
Especificidad enzimática: especificidad de función

Un mismo compuesto puede ser sustrato de varios enzimas, que lo modifican


de distinta forma.

Glucosa 6 P DH
6P-Gluconolactona
Fosfatasa
Glucosa + Pi
Isomerasa
Fructosa 6P
Mutasa
Glucosa 1P
Tipos de catálisis

▪ Catálisis ácido-base

▪ Catálisis covalente

▪ Catálisis por iones metálicos


Tipos de catálisis

▪ Catálisis ácido-base
Reacciones por transformación intermediarios cargados inestables por
captación o cesión de H+

A pH fisiológico [H+] y [OH-] bajas Baja velocidad

Enzimas donantes o aceptores de [H+] Aumentan velocidad


Tipos de catálisis

▪ Catálisis ácido-base
Triosa fosfato isomerasa

His 95

Glu 165

Intermediario enediol, se
G3P se une al forma por transferencia de DHAP unida al
centro activo un protón de C2 al Glu 165 y centro activo
un protón de His 95 al
carbonilo

E + G3P E- G3P E-enediol E- DHAP E + DHAP


Tipos de catálisis

▪ Catálisis covalente
Se forman enlaces covalentes transitorios E-S para facilitar la formación de
producto. Ej: Transaminaciones

A-B + X: A-X + B A + X: + B
X: = Núcleo nucleofílico de la enzima

GRUPOS NUCLEÓFILOS Y ELECTRÓFILOS DE IMPORTANCIABIOLÓGICA

a) Grupos nucleófilos en sus formas básicas


b) Los grupos electrófilos contienen un átomo con deficiencia de electrones (rojo)
Tipos de catálisis

▪ Catálisis por iones metálicos


Participan de diferentes formas en la catálisis:
▪ Fijando y orientando adecuadamente al sustrato para que reaccione
▪ Estabilizando estados de transición de compuestos cargados
▪ Intervienen en reacciones redox cambiando su propio estado de oxidación

SITIO ACTIVO DE LA ANHIDRASA CARBÓNICA HUMANA

CO2 + H2O HCO3- + H+

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