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Enzimas

By: Fenol
Clasificación
• Oxidorrecudtasas (redox)
• Liasas (remueven átomos y generan doble
enlace)
• Sintetasas (unen dos compuestos usando ATP) Holoenzima

• Hidrolasas (rompe enlaces con H2O)


Cofactor Apoenzimas
• Isomerasas (generan isómeros)
• Transferasas (transferir grupos de átomos) Metalicos Coenzima
(inorganic) (organic)
Características (todas estas también son
definición) Grupo
• Naturaleza proteica (a excepción de ribozimas) prostetico
• Aceleran reacciones
(Ej. Hidrolisis de Sacarosa, sin enzimas Cosustrato
demoraría un año a 37ºC, con enzima
demoraría un minuto o menos) El grupo prostético se une a la apoenzima
• No modifican la energía libre ni la Keq de la covalentemente y solo se disocia cuando la enzima
reacción se destruye, el cosustrato se une de forma laxa
• No se consumen, modifican, ni producen (electrostática) y se puede disociar cuando quiere.
durante una reacción Isoenzimas
• Alta especificidad “Formas múltiples de una enzima generadas a
• Actúan sobre uno o limitado sustratos y bajo partir de diferencias genéticamente determinadas
un rango de temperatura y pH en su estructura primaria, mas no aquellas que
• Requieren de un mínimo de energía derivan de modificaciones de su estructura
• Disminuyen la energía de activación de primaria”
reacciones que catalizan (Ej. Lactato deshidrogenasa, Creatin kinasa 3 o MM
(Energía de activación NO ES energía libre) (en musculo) y Creatin kinasa 2 o BB (en el cerebro)
Importancia Sitio activo
• Diagnosticar algunas enfermedades • Sitio de unión enzima-sustrato
• Ayudan a crear nuevos medicamentos • Conformación complementaria al sustrato
• Comprensión de procesos bioquímicos • Al ligarse el sustrato y hacer reacción se
• Descripción patológica a nivel celular denomina producto
• Permite describir la transformación de los • Disposición tridimensional, grupos (R)adicales
alimentos de los aminoácidos interactúan con el sustrato
Enzimas y coenzimas
Coenzimas: compuestos no proteicos que
“ayudan” a las enzimas a ejercer acción catalítica.
• Bajo peso molecular
• Termoestabilidad
• Se une a la enzima en el sitio activo con Especificidad enzimática
diferente fuerza de interacción
• Principal característica
• La especificidad de reacción dependen de la
• Determinada por:
enzima a la que se unen
a) Grupos funcionales de la enzima
• Vitaminas son coenzimas
b) “ “ del sustrato
c) Cofactores (no en todas las enzimas) Briggs Haldane
d) Proximidad enzima-sustrato • Velocidad de formación del complejo enzima-
• Permite un metabolismo ordenado sustrato = velocidad de transformación del
• Presenta grados complejo
a) Muy elevada especificidad • El complejo enzima-sustrato puede ser enzima
(Ej. Enteroquinasa transforma en el y sustrato, o enzima y producto
tripsinogeno en tripsina)
b) Altamente especifica
(Ej. Fosfatasa acida solo actúa sobre
paranitrofenilfosfato y fenilfosfato)
c) Relativamente especifica
(Ej. Fosfatasa alcalina actúa sobre
paranitrofenilfosfato, fenilfosfato, glicerol
3-fosfato, glucosa 6-fosfato y todas las que
tenían fosfato)
d) Para el primero si y para el segundo no
(Ej. Alcohol deshidrogenasa es súper Datos extra
especifica con el NAD, pero inespecífica
Factores que afectan a la concentración de
ante cualquier alcohol)
e) Estereoespecificas sustrato correspondiente a la mitad de la
(Ej. todas aquellas que actúan sobre Vel. Max (Km), y a la Vel. Max en si misma
isómeros) • Naturaleza del sustrato
Enzimas interconvertibles • pH del medio de reacción
• Existen por lo menos en 2 formas definidas • Temperatura
• Su modificación ocurre al modificar covalente • Concentración de enzima (solo a Vel. Max)
de las cadenas laterales Ecuación de Michaelis y Menten
• No consideradas modificaciones durante la
catálisis

Ecuación y gráfica de Lineweaver Burk


Hipótesis Invirtieron la ecuación
Michaelis y Menten
• La enzima es un catalizador
• Se forma rápido el complejo enzima-sustrato
• Un sustrato y un complejo enzima-sustrato
participan en la reacción
• El complejo enzima-sustrato se descompone
en enzima+producto
• Las enzimas, sustratos y complejos enzima-
sustrato están en equilibrio Importancia del valor de Km
• Establece un valor aprox del nivel de sustrato
intracelular
• Comparar enzimas de distintas fuentes
• Determinar la concentración de sustrato
Km depende de…

• Del tipo de sustrato
• Del valor del pH del medio
• De la temperatura
Km siempre se expresa como molaridad (Ej.
2.3x10-7 Mol)
Inhibición enzimática
Proceso por disminución de actividad enzimática
Explica procesos de regulación metabólica,
diseñar medicamentos, descubrir plaguicidas, etc.
Reversible Irreversible
Competitiva Por afinidad
• El inhibidor se liga al sitio activo de la enzima Inhibidor simula al sustrato, inactiva la enzima
(complejo enzima-inhibidor) pero no se une al (Ej. Medicamentos para pacientes con gastritis, el
complejo enzima-sustrato primero se liga a las dos COX, pero el segundo solo
• Gráfico de doble recíproca (no se modifica Vel. es específico para la COX2)
Max y Km se incrementa


No competitiva
• El inhibidor forma el complejo enzima-
inhibidor, o enzima-sustrato-inhibidor (en
todo lugar menos en el sitio activo)
• Gráfico de doble recíproca (Km no se modifica
y Vel. Max disminuye)

Activados por la enzima (sustrato suicida)
Medicamento similar al sustrato que engaña a la
enzima haciéndola pensar que es un sustrato y
empieza a transformarlo en producto, en el
proceso se forma un enlace covalente y la enzima
se inactiva de por vida)
Efectos
Acompetitiva De la concentración de enzimas
• El inhibidor solamente se liga al complejo Concentración de sustrato saturante, la velocidad
enzima-sustrato formando enzima-sustrato- de la reacción es directamente proporcional a la
inhibidor concentración de enzimas V=K2(Et)
• Gráfico de doble recíproca (disminuye Vel. Activador enzimático
Max y Km) Compuesto que incrementa la actividad catalítica
• Esenciales: su presencia es imprescindible
(Ej. NAD para la lactato deshidrogenasa o
alcohol deshidrogenasa)
• No esenciales: puede estar presente como
también no
a) Mantienen estructura tridimensional
b) Interactúan con sustrato
c) Responsables de catálisis


De la temperatura

• Velocidad de reacciones enzimáticas aumenta
Enzimas alostericas
con la temperatura
Enzimas por varias cadenas polipeptidicas con
• Temperatura especifica = caída de velocidad
varios sitios activos
(50º-60ºC)
Curva de fijación de sustrato = sigmoidea
• Afecta a la estabilidad de la enzima y Km, Vel.
Comúnmente en regulación de vías metabólicas
Max, etc.
Efecto activador o inhibidor fijado en distintos
• Mucha temperatura = bye estructura terciara =
sitios activos
desnaturalización
• Temperatura optima = enzima con actividad
constante


Hipótesis
De los metales
Modelo concentrado (Monod)
• Algunos no afecta a la actividad (Na, K, H)
Enzimas alostericas en dos estados de equilibrio:
• Metales pesados inhiben completamente (Pb,
TT (baja afinidad) – RR (alta afinidad)
Ag, Hg)
TT <-> RR <-> RR-S <-> S-RR-S
• Algunos metales pueden inhibir, como
Modelo secuencial (Koshland)
también ser necesitados (Fe, Cu, Ca)
Enzimas alostericas existen en una sola forma (TT)
• Ciertos metales ayudan como coenzimas (+
que aumenta su afinidad (RR) por el sustrato al
actividad)
acercarse a este.
• Mantienen estructura terciaria, ayudan en
TT <-> TR-S <-> S-RR-S
catálisis (al unirse a la enzima o al sustrato)
Del pH Moduladores alostericos
• Se ligan a la enzima fuera del sitio activo
• Ionización de enzima depende de número,
• Lugar específico para moduladores positivos
clase y localización de grupos ionizables
(activadores) y otro para negativos
• Hay sustratos ionizables y también que no
(inhibidores)
• Cambios de pH altera la velocidad de reacción
• Positivos estabilizan RR para más afinidad
• Actividad enzimática f(x) pH = curva con forma
• Negativos estabilizan TT para menos afinidad
de campana
• No compiten con el sustrato por el sitio activo
• pH que da máxima eficiencia = pH optimo
• Variación de pH afecta a grupos ionizables que:

Mecanismos de acción
Principios que rigen la catálisis son:
• Catálisis covalente
• Catálisis acido base.
2 Hipótesis
• Llave cerradura: sitio activo de la enzima posee
un sitio activo de encaje perfecto con su
sustrato


• Encaje inducido: sitio activo de la enzima se
amolda a la forma del sustrato


Energía de activación
Energía necesaria para que se inicie una reacción
bioquímica (con enzima se requiere menos)


Regulación de enzimas
Se realiza de dos formas:
• Regulación de la concentración de enzima
a) Inducción de síntesis de enzima
b) Represión de síntesis de enzima
• Regulación de la eficiencia catalítica
a) Concentración de sustrato, de activadores,
de inhibidores, de iones metálicos, de
coenzimas
b) Modificación de temperatura, covalente
de la enzima, estructural de la enzima
c) Variación de pH

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