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Ámbito Investigativo

Volume 4 | Issue 1 Article 12

2019

Estrategias para la búsqueda y evaluación de


agentes antimicrobianos frente a bacterias
resistentes
Vanessa Gómez
Universidad de La Salle

Patricia Hernández-Rodríguez
Universidad de La Salle

Ludy Cristina Pabón Baquero


Universidad de La Salle

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Citación recomendada
Gómez, Vanessa; Hernández-Rodríguez, Patricia; and Pabón Baquero, Ludy Cristina (2019) "Estrategias para la búsqueda y
evaluación de agentes antimicrobianos frente a bacterias resistentes," Ámbito Investigativo: Iss. 1 , Article 12.
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Gómez et al.: Estrategias para la búsqueda y evaluación de agentes antimicrobia

Estrategias para la búsqueda


y evaluación de agentes
antimicrobianos frente
a bacterias resistentes

VANESSA
GÓMEZ RAMÍREZ
PATRICIA
HERNÁNDEZ-RODRÍGUEZ
LUDY CRISTINA
PABÓN BAQUERO

Published by Ciencia Unisalle, 2019 1

Art 04-1-11.indd 91 19/09/19 12:20


Ámbito Investigativo, Vol. 4 [2019], Iss. 1, Art. 12
Ámbito Investigativo

L
a aparición cada vez mayor de Resistencia bacteriana
cepas resistentes a múltiples a los antibióticos en el
fármacos se ha convertido en mundo y en Colombia
una emergencia de salud pública
mundial, lo que ha incrementado la La resistencia bacteriana es un
frecuencia de infecciones bacteria- problema que se presenta en el
nas. El uso inadecuado y excesivo contexto mundial y que afecta a la
de los antibióticos ha propiciado salud pública. Principalmente, se ha
en los microorganismos el desarro- generado en centros hospitalarios,
llo de resistencia, y de esta forma en unidades de cuidado intensivo,
vienen aumentado las enfermeda- que son espacios donde es frecuente
des infecciosas, que representan el el uso no controlado de antibióticos
25 % de las muertes a escala mun- y fármacos para prevenir infecciones.
dial. El 31 % de estas son debidas Esto ha sido confirmado por Ferri
a microorganismos resistentes a los et al. (2017), quienes mencionan
antimicrobianos. que se presentan muchos cambios
Por causa de las especificidades en el DNA y resistencia de los
de cada huésped y de la resistencia microorganismos a una diversidad
desarrollada por los microorganis- de antibióticos.
mos, se han propuesto modificacio- Con el desarrollo de los prime-
nes de las estrategias para tratar ros antibióticos, que proporcionaron
las enfermedades infecciosas. De beneficios en la salud humana fren-
esta manera, en la práctica clínica te al control de múltiples infeccio-
es cada vez más común combinar nes, su uso se fue extendiendo y la
agentes antimicrobianos. aplicación en sectores como el ve-
Así mismo, se ha sugerido a es- terinario llevó a un uso inadecuado
cala mundial la búsqueda de nuevos en la medicina humana y veterinaria
compuestos que puedan evadir los que ha incrementado la resistencia
mecanismos de resistencia microbia- antimicrobiana.
na, reducir la resistencia bacteriana, De esta problemática se han
potenciar el efecto de las sustan- derivado políticas de control fren-
cias, lo que genera menores efectos te al uso de los antibióticos tanto
secundarios para el huésped. Aquí la para humanos como para animales,
combinación de sustancias sintéti- debido a las interacciones que pre-
cas y naturales se convierte en una sentan con la población humana
estrategia novedosa. El propósito y también por ser productores de
de este artículo es mostrar algunas alimentos. En este sentido, la Orga-
estrategias para la búsqueda y eva- nización Mundial de la Salud (OMS),
luación de agentes antimicrobianos la Organización Mundial de Sanidad
frente a bacterias resistentes. Animal (OIE) y la Organización de

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las Naciones Unidas para la Alimen- SAMR adquiridos en la comunidad


tación y la Agricultura (FAO) han en países de Suramérica, que pos-
promovido el marco legal y la imple- teriormente se extendieron a Nor-
mentación de políticas para reducir teamérica y Europa. Para Klebsiella
y controlar el uso de antimicrobianos y Escherichia coli, este mismo autor
en todo el mundo. También han pro- menciona un aumento de resistencia
movido el desarrollo de nuevos an- a cefalosporinas. El principal meca-
timicrobianos; mejorar las medidas nismo involucrado es la producción
de control de uso de antibióticos en de ß-lactamasas de espectro exten-
las granjas; fortalecer el sistema de dido (BLEE) que confiere resisten-
vigilancia de la resistencia antimicro- cia a las cefalosporinas de primera,
biana en humanos y animales; me- segunda y tercera generación. De
jorar el conocimiento de la ecología estas se ha reportado que en paí-
de bacterias resistentes y genes de ses de Latinoamérica las tasas de
resistencia, y sensibilizar a la pobla- producción de BLEE por las entero-
ción sobre las consecuencias para la bacterias son las más altas frente
salud pública y el medio ambiente de a otras regiones del mundo. Se ha
la resistencia antimicrobiana. encontrado el 34 % para América La-
Como ha sido reportado por tina, seguido del 19,7 % para Europa
García (2012), la resistencia bacte- y el 10 % para Norteamérica.
riana a los antibióticos ha sido es- En Colombia, diversos estudios
tudiada en diferentes países de muestran la problemática de la resis-
Latinoamérica. De esta manera, las tencia antimicrobiana; sin embargo,
infecciones por Staphylococcus au- un estudio realizado por Maldonado
reus meticilinorresistente (SAMR) et al. (2014) relaciona los resultados
se han identificado en pacientes de seis años de vigilancia, determi-
hospitalizados, con cirugía previa, nando la tendencia de la resistencia
cateterismo endovenoso, diálisis, a antibióticos en Medellín y en los
entre otros. Se ha encontrado que municipios del área metropolitana,
en varios hospitales de Lima (2008- en los que se encontraron una dis-
2009), el 50 % de los aislamientos minución de la resistencia a oxaci-
de hemocultivos de S. aureus fueron lina en S. aureus, y un incremento
resistentes a meticilina y más del de la resistencia a vancomicina en
70 % de las cepas de SAMR fueron Enterococcus faecium.
portadoras del SCCmec, un elemen- Por su parte, en E. coli y Serratia
to móvil en el ADN asociado con la marcescens se observó un incremen-
resistencia a meticilina. to de la resistencia a ceftazidima,
Hacia la década de los noven- en contraste con una disminución
ta la presentación de casos por in- en K. pneumoniae y Enterobacter
fecciones por SAMR en ambientes cloacae. Frente a los carbapenémi-
no hospitalarios fue más evidente cos se observó un incremento de
y se reconocieron infecciones por la resistencia en K. pneumoniae, S.

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marcescens y E. cloacae y una dis- que pueden bloquear cualquiera


minución en Pseudomonas aerugi- de esas etapas son los ß-lactá-
nosa y Acinetobacter baumannii. micos, como las penicilinas, o los
glucopéptidos, como vancomicina
Mecanismos de resistencia y teicoplanina, entre otros.
bacteriana
2. Inhibidores de ß-lactamasas: las
Con el fin de desarrollar o identificar ß-lactamasas son enzimas de la
moléculas candidatas para su uso bacteria que degradan los anti-
como antibióticos en bacterias re- bióticos ß-lactámicos; por lo cual,
sistentes, es necesario inicialmente moléculas que bloquean estas en-
conocer la forma como actúan los zimas no son responsables por sí
antimicrobianos ya existentes y las solas de la muerte celular, sino que
formas que encontraron las bacterias permiten que el antibiótico ß-lac-
para escapar a la acción de estos. támico ejerza su función. Ejemplos
de antibióticos son: ácido clavulá-
¿Cómo trabajan nico, sulbactam y tazobactam.
los antibióticos?
3. Agentes activos sobre la mem-
Un antibiótico es una sustancia que brana celular: son moléculas que
mata o impide el crecimiento de bac- afectan la membrana citoplasmá-
terias por alguna de las siguientes es- tica de la bacteria. Tienen algu-
trategias que han sido reportadas por nas desventajas por la toxicidad
Calvo y Martínez-Martínez (2009): que pueden presentar en células
humanas, debido a que algunos
1. Agentes activos sobre la pared componentes de esta membrana
celular: estos actúan inhibiendo son comunes en las dos especies.
la formación de la pared celular, Ejemplos de estos antibióticos
vital para la bacteria, ya que les son: colistina, daptomicina y gra-
da resistencia e impide la ruptu- micidina, entre otros.
ra en condiciones no favorables.
La formación de la pared celular 4. Inhibidores de la síntesis de ARN/
involucra tres etapas: primero, se ADN: son antibióticos que inhiben
da la biosíntesis de los compo- enzimas que participan en los pro-
nentes que van a integrar la pared cesos de duplicación del ADN y
celular, como el peptidoglucano; transcripción. Al bloquear estos
segundo, se da el transporte procesos se detiene la replicación
de los componentes fuera de la celular y se afecta la supervivencia
membrana celular de la bacteria; de la bacteria. Ejemplos de anti-
y tercero, se ensambla la pared bióticos que actúan de esta mane-
celular. Ejemplos de antibióticos ra son: norfloxacino y rifampicina.

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5. Inhibidores del metabolismo: los pueden ser obtenidos de otras bac-


organismos necesitan de folatos terias por transferencia de ADN. Las
para la síntesis de algunos ami- estrategias para sobrevivir que usan
noácidos, purinas y pirimidinas. las bacterias y que se conocen hasta
Estos folatos se pueden obtener el momento han sido descritas por
del medio tal como ocurre en las varios investigadores como Cag et
células humanas; sin embargo, al. (2016):
muchas bacterias son incapaces
de conseguirlos del medio exter- 1. Disminución de la incorporación
no, y por tanto deben sintetizar- de antibióticos: los antibióticos
los. Los antibióticos que perte- ingresan a la célula a través de la
necen a este grupo inhiben las membrana externa por dos méto-
enzimas de la ruta biosintética de dos, dependiendo de la estructu-
los folatos. Ejemplos son: sulfa- ra del antibiótico: uno es a través
metoxazol y pirimetamina. de la bicapa lipídica, de la cual
está compuesta la membrana ce-
6. Inhibidores de la síntesis de pro- lular; el otro es por medio de una
teínas: los sitios donde se da la especie de poros formados por
síntesis de proteínas, es decir los las proteínas llamadas porinas.
ribosomas, son diferentes en bac- Aunque los mecanismos de per-
terias y en eucariotes, razón por meabilidad de la membrana no
la cual la inhibición de la síntesis son completamente entendidos,
de proteínas en bacterias es uno se han observado diferencias en
de los mecanismos más usados esta propiedad en bacterias mul-
por los antibióticos. Ejemplos son: tirresistentes; por ejemplo, en P.
gentamicina, cloranfenicol, azitro- aeruginosa, donde los antibió-
micina, tetraciclina, entre otros. ticos carbapenémicos entran a
través de la porina OprD, se ha
¿Cómo una bacteria puede observado que en cepas resis-
sobrevivir a la acción de los tentes ha ocurrido una pérdida
antibióticos? de la porina, probablemente por
una mutación sobre el gen que
Las bacterias evitan la acción de codifica para la porina OprD.
los antibióticos por diversos meca-
nismos. Ya que a veces un simple 2. Aumento del eflujo del antibió-
mecanismo no es eficiente, algunas tico: los sistemas de las bombas
de estas desarrollan otro mecanis- de eflujo sacan el antibiótico del
mo simultáneo que en combinación interior de la célula, lo que impi-
resulta ser bastante útil para la su- de que este tenga acción sobre
pervivencia celular. Los mecanismos el blanco. Las bombas de eflujo
pueden ser naturales o desarrollados trabajan con un sistema de tres
por la misma bacteria, pero también proteínas, donde una de ellas es

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la transportadora que usa ener- la y desactivan las propiedades


gía en la forma de una fuerza mo- microbianas. Ya que los ß-lactá-
triz de protones para transportar micos son naturales de algunos
drogas y otras sustancias a tra- microorganismos que los usan
vés de la membrana interna. En como mecanismo de defensa, las
bacterias multirresistentes estas ß-lactamasas existían desde an-
proteínas de la bomba de eflujo tes de los tratamientos médicos;
se encuentran sobreexpresadas sin embargo, el mal uso de los an-
o en mayor cantidad que en bac- tibióticos y la presión que estos
terias sensibles a los antibióticos. generan ha causado la evolución
y diseminación de las ß-lactama-
3. Modificación del blanco: las bac- sas, especialmente en bacterias
terias reemplazan o modifican el gramnegativas que ahora produ-
blanco de los antibióticos para cen de forma simultánea varias
evitar su daño. Por ejemplo, los ß-lactamasas y las convierte en
antibióticos ß-lactámicos inacti- resistentes a múltiples clases de
van las proteínas de anclaje de antibióticos ß-lactámicos.
penicilinas (PBP), con el fin de
alterar la síntesis del peptidogli- 5. Formación de biofilm: el biofilm
cano de la pared celular que lleva o la biopelícula es un sistema en
a la muerte bacteriana, pero bac- el que los microorganismos vi-
terias como S. aureus resistente ven en asociación como una ca-
producen una enzima homologa pa delgada sobre una superficie.
PBP, con baja afinidad por este ti- Los microorganismos dentro del
po de antibióticos, siendo capaz biofilm pueden interactuar entre
de restaurar las funciones vita- sí y con el ambiente y para ello
les y evitando la muerte celular. secretan polisacáridos, proteí-
Otras formas de modificación del nas, lípidos y ADN extracelular.
blanco incluyen alteración de una La matrix del biofilm provee una
subunidad del rARN, metilación capa mecánica y bioquímica que
de genes ribosomales, proteínas proporciona las condiciones ne-
que protegen el blanco y modifi- cesarias para atenuar la activi-
caciones postraduccionales. dad de medicamentos. De hecho,
en el 70 % de las infecciones cró-
4. Modificación enzimática de los nicas reportadas en humanos en
antibióticos: las bacterias pueden los últimos 15 años, se ha eviden-
tener enzimas que transforman ciado la formación de biofilm. Las
la estructura de los antibióticos principales bacterias que forman
para que estos no tengan efecto. biofilm son S. aureus, P. aerugino-
Un ejemplo son las ß-lactamasas, sa, A. baumannii, y K. pneumo-
que se unen a los antibióticos niae. El mecanismo responsable
ß-lactámicos, alteran la molécu- de la formación del biofilm es el

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quorum sensing, una forma de optimizado por millones de años de


comunicación entre bacterias. evolución, que están embebidos en
la información genómica de varias
Alternativas para reducir bacterias, hongos y plantas, son una
la resistencia bacteriana fuente que se debe estudiar con el
fin de encontrar moléculas poten-
Analizando el presente y el pasado, ciales para la búsqueda de nuevos
se puede decir que los antibióticos antibióticos.
dirigidos contra un único blanco son Se debe tener en cuenta que en
menos exitosos que aquellos dirigi- esos organismos las sustancias anti-
dos contra múltiples blancos o con- microbianas no trabajan solas si no
tra multisubunidades de una maqui- que es una mezcla de moléculas para
naria macromolecular o estructura. lograr la complementariedad y siner-
Es por ello por lo que se debe gia. De hecho, hoy en día, en muchos
pensar en estrategias para el des- tratamientos con antibióticos se usa
cubrimiento de nuevos antibióticos una mezcla de estos con cuatro fines,
basado en múltiples blancos celula- reportados por Tyers y Wright (2019):
res. Adicionalmente, productos an- primero, para ampliar la probabilidad
timicrobianos naturales que se han de eliminar el agente infeccioso si se

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desconoce cuál es; segundo, para lo- 3. Síntesis de nuevas moléculas para
grar efectos sinérgicos y así mejorar mejorar los compuestos ya conoci-
la eficacia; tercero, para suprimir la dos: modificar la estructura de una
emergencia de la resistencia, y cuar- molécula ya conocida que tiene
to, para minimizar la toxicidad en el acción antibiótica puede mejorar
huésped. Teniendo en cuenta esto, su eficiencia y evitar la resistencia
los métodos para el descubrimiento que algunas bacterias han adquiri-
de nuevos antibióticos incluyen las do contra la molécula original. Un
siguientes estrategias: ejemplo de esta estrategia es la
propuesta de Saisho et al. (2018),
1. Acercamientos basados en culti- que consiste en la modificación de
vos: consiste en mostrar la inhibi- cefalosporina que condujo al de-
ción de una cepa probada sobre sarrollo de cefiderocol, el cual de-
una cepa indicadora cultivada cer- mostró ser útil para el tratamiento
canamente. El objetivo es deter- de infecciones urinarias.
minar qué especies pueden inhibir
el crecimiento de otra especie. 4. Búsqueda en los genomas: actual-
mente hay miles de genomas de
2. Descubrimiento de efectos anti- procariotes secuenciados y se
microbianos desde compuestos han generado miles de grupos de
ya conocidos: debido a que varios genes que pueden codificar para
millones de compuestos químicos sustancias desconocidas con un
son conocidos y están registra- posible potencial antimicrobiano,
dos en bases de datos generales, de acuerdo con estudios realiza-
de productos naturales o de fár- dos por Durand, Raoult y Dubourg
macos, estos pueden ser evalua- (2018).
dos para determinar su eficacia
como antibióticos. Miro-Canturri, 5. Sinergia usando mezclas de anti-
Ayerbe-Algaba y Smani (2019) re- bióticos o productos naturales: la
portan como principal inconve- sinergia es el aumento o mejora
niente de este tipo de meto- en la acción de dos sustancias
dologías, la selección y la gran que actúan conjuntamente para
cantidad de evaluaciones expe- lograr una mayor eficiencia. Esas
rimentales que deben realizarse. mezclas pueden darse entre an-
Para la selección se pueden usar tibióticos, entre productos natu-
técnicas computacionales que rales o combinaciones de ellos.
permitan hacer la filtración con el También incluso puede ser una
fin de obtener compuestos pro- combinación de una molécula que
bables, esos compuestos pue- tenga actividad con otra que no
den evaluarse mediante diversas la tenga, pero que al combinarse
técnicas, como las técnicas mi- mejore su efecto. Para su evalua-
crobiológicas y moleculares. ción se usa el tablero de damas

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que consiste en mezclar las dos Martínez-Romero (2009) establecen


sustancias a concentraciones por que los estudios con estas herra-
debajo de la letalidad y evaluar el mientas permiten identificar nuevos
crecimiento de la bacteria. objetivos para medicamentos y el
diseño de antibióticos específicos
Estudios genómicos y para precisar los tratamientos frente
moleculares para búsqueda a las infecciones bacterianas. Igual-
de sustancias que inhiban mente, estas técnicas también faci-
litan la identificación de los genes
genes asociados con
que confieren resistencia a los an-
resistencia tibióticos e identificar integrones,
La resistencia de un microorganismo estructuras genéticas complejas
frente a un antibiótico impulsa deci- que participan en la propagación de
siones médicas que llevan al uso de genes que confieren resistencia a
otros antibióticos, lo cual fomenta múltiples fármacos. Adicionalmente,
la presión de selección para el desa- muchos de los medicamentos cuya
rrollo de resistencia contra otro anti- base es un péptido han sido aproba-
biótico. Es por ello por lo que Nolte dos con éxito por la Administración
(2014) ha mencionado el interés de de Alimentos y Medicamentos (FDA,
realizar estudios orientados a la bús- por sus siglas en inglés: Food and
queda de nuevas alternativas para Drug Administration). Esto debido
el control bacteriano que presenten a la alta especificidad, selectividad
menos efectos adversos; en tal senti- y eficacia que presentan, así como
do, buscar en sustancias naturales o mayor capacidad de penetración y
sintéticas estas características se ha menor acumulación en los tejidos.
convertido en objeto de estudio para Además, estos péptidos antimi-
muchos grupos de investigación. crobianos (AMP) son naturalmente
Para evaluar el efecto de estas abundantes, lo que permite desarro-
alternativas farmacológicas es im- llar moléculas peptídicas semisintéti-
portante conocer a profundidad la cas con actividad bacteriana y capa-
fisiología y la estructura de las bac- cidad para limitar los mecanismos de
terias y los mecanismos involucrados inducción de resistencia de los mi-
en la resistencia a los antibióticos y crobios, como ha sido reportado por
para este han sido de mucho apoyo Ferri et al. (2017). Actualmente en el
las herramientas moleculares, genó- grupo de investigación Biomigen de
micas y proteómicas. Entre ellas se la Universidad de La Salle, en colabo-
pueden citar la reacción en cadena ración con el grupo Estudio Químico
de la polimerasa en tiempo real (qP- y de Actividad Biológica de Rutaceae
CR), la pirosecuenciación de ADN, y Myristicaceae Colombianas de la
la espectrometría de masas, los mi- Universidad Nacional de Colombia,
croarreglos de ADN y la bioinformá- se están desarrollando dos proyec-
tica. Garza-Ramos, Silva-Sánchez y tos de investigación financiados

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por Colciencias y la VRIT sobre la medicamentos seleccionados me-


búsqueda de antimicrobianos fren- diante estrategias computacionales
te a P. aeruginosa. La búsqueda se con verificación experimental me-
realiza teniendo como objetivo blo- diante técnicas moleculares y micro-
quear el quorum sensing y los genes biológicas. La finalidad es encontrar
asociados a este proceso. Se están sustancias prometedoras y evaluar
evaluando extractos de productos algunas mezclas que podrían tener
naturales, compuestos naturales y efectos sinérgicos sobre la bacteria.

Bacterias resistentes, mecanismos frente a los antibióticos


y alternativas de control

Políticas en salud pública


• Estudios de resistencia antimicrobiana en
humanos, animales y medio ambiente
• Reducción en la incidencia de enfermedades
infecciosas desde la prevención
• Diagnóstico de los agentes etiológicos y
seguimiento a los tratamientos
2da y 3ra
causa de muerte
Bacterias con prioridad crítica
Acinetobacter baumannii,
Pseudomonas aeruginosa,
Klebsiella, Escherichia coli,
Serratia y Proteus

Mecanismos de resistencia
Pared Nuevos antimicrobianos
Modificación
bacteriana Productos
sitio activo Tratamientos combinados naturales

Inactivación
Bombas enzimática
eflujo

Disminución resistencia
Material genético
foráneo

Clasificación de antibióticos
Bactericidas: Bacteriostáticos: Microbiología:
Molecular:
estudios de
• Beta-lactámicos • Macrólidos tablero de damas
expresión génica
• Glicopéptidos • Tetraciclinas
• Aminoglucósidos • Cloramfenicol
• Quinolonas • Clindamicina, lincomicina
• Polimixinas • Sulfamidas Tipo de efecto
Mecanismos de acción de los antibióticos
• Inhibición de la síntesis de la pared celular
• Disrupción de la membrana citoplasmática Sinergia Inhibición
• Inhibición de la síntesis de proteínas Antagonismo de genes
• Interferencia en la síntesis o metabolismo de Indiferencia asociados a
los ácidos nucleicos Aditivo resistencia
• Antimetabolitos que bloquean la síntesis de
ácido fólico

Conclusión posibles antimicrobianos, principal-


mente, que actúen en mezclas si-
La OMS emitió una lista de bacte- nérgicas para tener varios blancos
rias con prioridad crítica por pre- simultáneos y disminuir la posibili-
sentar resistencia a antibióticos y dad de generación de resistencia. Si
causar muchas muertes. Por ello la estos antimicrobianos provienen de
investigación en esta área es funda- productos naturales, tienen una ma-
mental. Con el conocimiento que se yor probabilidad de éxito debido a
tiene de los mecanismos de resis- que han sido optimizados a lo largo
tencia se debe buscar y desarrollar de la evolución.

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Estrategias para la búsqueda y evaluación de agentes antimicrobianos 101


Published by Ciencia Unisalle, 2019 11

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