UNIVERSIDAD NACIONAL DE SAN ANTONIO

ABAD DEL CUSCO

DEPARTAMENTO ACADEMICO DE
QUIMICA

BIOQUÍMICA

Mgt. Quim. CIRO TOMAYLLA CRUZ

C.T.C.
 Bioquímica
• es la ciencia que estudia las estructuras
químicas de las células y los tejidos, así como
las modificaciones que ocurren en las mismas
dentro del organismo” Thomas Devlin
• Eso último, es lo que llamamos y entendemos
como metabolismo.
• Etimológicamente es la ciencia que estudia las
bases bioquímicas de la vida.

C.T.C.
Ejemplo de la organización jerárquica de las estructuras biológicas

f<,) O<a,,n,s,n. huo'T"I- ,,..,ng

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C.T.C. t---1 .-m---;

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 BIOQUIMICA Y MEDICINA

C.T.C.
 ,
L S ELEMENTOS QUIMICOS DE LA VIDA

• 30 elementos naturales son esenciales para los seres vivos

• La mayoría tienen un número atómico bajo
• Bioelementos primarios o principales: C, H, O, N
• Bioelementos secundarios: S, P, Mg, Ca, Na, K, CI
• Oligoelementos: Fe, Mn, z», Na, CI, Cu, Se, st, c-,
F, 1, B, etc.

• El agua es el compuesto mas abundante.

• El carbono es mas abundante en los organismos
v i v os que en todo el resto del universo.
C. T .C.
 masa para masa para
Elemento una persona Elemento una persona
de701m de701m
oxíe;eno 43kg selenio 15 rng
carbono 16kg cromo 14gm
hidr6s!eno 7 kg mane:aneso 12 mz
nitr6tzeno l,8kg arsenico 7 mg calcio
1,0 kg litio 7mg
fósforo 780 g cesio 6mg .,..
.._
ootasio 140g mercurio 6mg dro l-1.
azufre 140g e;ermanio 5 mg
1
sodio IOOg molibdeno 5mg
cloro 95 g cobalto 3mg
mae:nesio 19 g antimonio 2mg ,,...
'
hierro
fluor
4,2 g
2,6 g
plata
niobio
2mg
1,5 mg
o�
zinc 2,3 g zirconio 1 mg 1
sílice 1,0 g lantano 0,8 mg I'\ 1 i

..
rubidio 0,68 g galio 0,7 mg
estroncio 0,32 g telurio 0,7 mg �
bromo 0,26g itrio 0,6mg
plomo 0,12 g talio 0,5 mg cobre
72mg indio 0,4mg aluminio 60mg
oro 0,2 mg cadmio 50mg
escandio 0,2 mg cerio 40mg tantalio
0,2 mg bario 22mg vanadio 0,11 mg
yodo 20mg torio 0,1 mg
20mg uranio 0,1 mg
titanio 20mg samario 50 ug
boro 18 mg berilio 36 ug
C.T.C.
niquel 15 mg tungsteno 20 ug
 Bioelementos secundarios
•
Azufre Aminoácidos cisterna y rneuoruna
Coenz,maA
Nucleót,dos que forman los aedos nucleicos
-Coenz,mas
Fósforo
Fostoupoos. componentes de las membranas celulares
Sales minerales

Clorofila
Magnesio
Catahzador ¡unto con las enzimas en muchas reacciones químicas

Estructuras esqueléticas
Contracción muscular
Calcio
Coagulación sanguínea
Transmisión del impulso nervioso

Conducción nerviosa
Sodio
Contracción muscular

Conducción nerviosa
Potasio
Connaccon muscular

Cloro Mantenimiento balance de agua en la sangre y fluido mtersncar

C.T.C.
 OLIGOELEMENTOS

C.T.C.
 Enlaces de Carbono

. .
·C· + ·O: e· .o: 'e
/

. .
(b) .. -,
C ,N ·
/
C-N-

«)

C.T.C.
 Grupos funcionales comunes en bioquimica
c;oon ........ t,
hl.wlll H H
H.,N-C H •••
1

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e� 11 Oll l e,
2 """' N,.._<" e-e{ ,c-011

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H' OH

Histidina Adrenalina
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1
 HO-P--0
Acetil-coenzima A bH r ,.f ,nlo
 Biomoléc u las
Bioelementos

1/
Biomo1éculas "-
Inorgánicas (agua, gases, cationes, aniones)
Aminoácidos - Proteínas
Monosacáridos - Polisacáridos
Orgánicas
Nucle - Ácidos
ótidos nucleicos
Ac -Lipidos
Graso
s

Pohsacándo
C.T.C.

Ácido
nucrerco-
v-.
Am

M
a
os
 Organización molecular de las células
Nh•rl �: Nh,:I :1: Nh.,l :.!: Si,·,·11:
1• c,,!1ul" comf)lej<J, ,n .. crunoolkul1111 unid.üdc:,,
y�,,. or,r,l.,ulo- >U¡H",.mu!L'CUl<1n,,� monomérlce ....

Cru ..... ....,11

�l•mbnona
pl•ami<ica

C.T.C.
 �"'"

C.T.C.
llfflls que,1ntervienel'I en el mantenimiento de las estructuras de los seres
vivos

0
,.._ • Enlaces covalentes (C-C)
• Interacciones débiles:
lónicas
Fuerzas de van der Waals
Hidrofóbicas
Enlaces de hidrógeno
 Puentes de hidrógeno comunes
�e � �e�
o11 N :{
�
: _;_º/
11
o/
H H H H H H
DonadOfde
1 1 1 1
hodrógeno
o o o N
1 1 1

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1 ¿ R

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'
.•
H ,,....., 11
'
,.. Agua
Agua con otras moléculas

" �º
-l., P
Proteínas y áC!dos nucle,cos
 Interacciones débiles entre biomoléculas

Pro1eina A Proteína B Proteína A Proteína C

�o••tabt• Comp,lefo m.no. fftabt•

C.T.C. https://www.youtube.com/watch?v=44Iqso8xfG8
El agua es la sustancia más abundante en los
sistemas vivos, constituyendo un 70% o más del
peso de la mayoría de los organismos. Está
presente en todos los lugares de la célula, es el
medio de transporte de los nutrientes celulares y
el medio de reacción en el que tiene lugar la
inmensa mayoría de las reacciones químicas del
metabolismo; es, en definitiva, el medio en el
que se mueven e interactúan las biomoléculas.
La abundancia y ubicuidad del agua en la
materia viva no deben conducirnos al error de
considerarla como un líquido inerte con la única
misión de rellenar espacios vacíos en los
organismos vivos. Muy por el contrario, el agua
participa activamente como reactivo en muchas
reacciones químicas celulares y, lo que es más
importante, la estructura y propiedades de
muchas biomoléculas y otros componentes
celulares dependen de su interacción con las
moléculas de agua que los rodean.
C.T.C.
La existencia de cargas eléctricas
parciales permite que se establezcan Figura 4 3
interacciones electrostáticas entre
moléculas de agua vecinas: las
cargas parciales de signo contrario
•
situadas en una y otra molécula se ; ----.._Puentes
atraen mutuamente. Este tipo �· de
Hidrógeno
particular de interacción
electrostática se conoce con el
nombre de puente de hidrógeno.
Así, los puentes de hidrógeno
entre moléculas de agua vecinas
son las fuerzas intermoleculares
responsables de la elevada
cohesión interna del agua y, por lo
tanto, de sus excepcionales
propiedades físicas

C.T.C.
 ,Estructura de la molécula de agua
En la molécula de agua (H2O) cada átomo
de hidrógeno comparte un par electrónico
con el de oxígeno para formar un enlace
covalente simple. La geometría de la
molécula está determinada por la forma de
los orbitales electrónicos más externos del
-
-
Puente de hidrógeno
átomo de oxígeno que son los que 0,177 nm
participan en los enlaces. Estos orbitales
describen un tetraedro casi regular con los Enlace covalente
electrones compartidos con el hidrógeno 0,0965 nm
en dos de sus vértices y los electrones sin ¡,+
compartir en los otros dos. De este modo,
los tres átomos de la molécula forman un
ángulo de 104,51, algo menor que los Disposición no lineal
Gran cohesividad
109,51 de un tetraedro regular, debido a
que la repulsión entre los orbitales no
enlazantes del oxígeno comprime
ligeramente a los orbitales enlazantes con
el hidrógeno.
 PROPIEDADES DEL AGUA

a) El agua es liquida en un amplio margen de temperaturas

(0-100°C) esto permite que la vida pueda desenvolverse en
condi-

C.T.C.
 · agu· jpe'rmite la disociación de la mayoría de las sales mi-
nerales, porque debilita las fuerzas electrostáticas entre los ione
,..·
.; ºene una c o-ri s t a rrte dielécrrica elevada).
.
d) El agua es un dipolo. y por lo tanto sus moléculas tienden a
r::odear a los iones aislándolos unos de otros y facilitando también
así la disolución de las sales. Se dice que los iones quedan hidra-
rados o so/varados. Los dipolos del agua también solvatan otras
moléculas polares, no iónicas, como el etanol.
e) El agua posee un elevado calor espec(fico* por lo que el
hombre puede absorber o perder bastante calor con- escasa modifi-
cación de la temperatura corporal; por esta razón la circulación de
la sangre ayuda a rrra'rrt e n e r- constante y unif"orme la
temperatura del cuerpo.
f) El agua tiene un calor de vaporización** muy elevado.
Por ello, se puede eli'minar el exceso de calor vaporizando
cantidades de agua relativamente pequeñas a través de los
pulmones o de la piel, y así mantener la temperatura corporal
incluso por debajo de la temperatura ambiente. Por eso, los
perros y los cocodrilos man- tienen la boca abierta cuando
aprieta el calor.
g) El ·agua se caracteriza por una elevada tensión supeif,cial.
es decir, que sus moléculas se ordenan de modo que la superficie
libre sea mínima. Las sustancias llamadas tensoactivas -como
Jabones y detergentes- son capaces de disminuir la tensión super-
ficial del agua, lo que facilita la mezcla o emulsión de las grasas
en un rne d io acuoso; las sales biliares actúan como agentes
tensoac- tivos facilitando la digestión de las grasas en el intestino
delgado. De modo semejante, ciertos fosfolipidos hacen
disminuir la ten- sión superficial del agua en los alveolos
pulmonares, evitando que se colapsen.
C.T.C.
 PROPIEDADES
CAPILARIDAD: El agua tiene capacidad
de ascender por las paredes de un capilar
debido a la elevada cohesión o adhesión
molecular.
BAJO GRADO DE IONIZACIÓN: La
mayor parte de las moléculas de agua no
están disociadas. Sólo un reducido
número de moléculas sufre disociación,
generando iones positivos (H+) e iones
negativos (OH-). En el agua pura, a 25ºC,
sólo una molécula de cada 10.000.000
está disociada, por lo que la concentración
de H+ es de 10-7. Por esto, el pH del agua
pura es igual a 7.
Como se puede comprobar en la tabla
adjunta, el agua tiene un punto de fusión,
punto de ebullición, vaporización y tensión
superficial más elevados que la mayoría
de los líquidos comunes (Tabla) Otras
sustancias químicamente afines a ella,
como el NH3 y el H2S, son gases a
temperatura ambiente, mientras que el
agua, como es obvio, se encuentra en
C.T.C.
estado líquido a esa temperatura.
FUNCIONES DEL AGUA DENTRO DEL ORGANISMO VIVO
Disolvente polar universal.

Medio donde se realizan reacciones químicas.

Participa en muchas reacciones químicas .

Función de transporte. Por ser un buen disolvente, debido a su

elevada constante dieléctrica

Función lubricante. Debido a su elevada cohesión molecular, el agua

sirve como lubricante entre estructuras que friccionan y evita el
rozamiento.
Función termorreguladora. Al tener un alto calor específico y un alto
calor de vaporización el agua es un material idóneo para mantener
constante la temperatura, absorbiendo el exceso de calor o cediendo
energía si es necesario.

C.T.C.
 Interacciones del agua con otras biomoléculas
tmow1d,u ,n lo,nu lonk:• 1 pH
.1.i,unot •jtmplo• dt b�lkuln pol1,n, 1;,ol1tu � 1nN�hcH
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Polares
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Antipáticas
c-11,uu,,..cn, i,
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C.T.C.
 ,
Interacciones del agua con moléculas IONICAS
El agua disuelve sales cristalinas hidratando sus iones
� Cap11 de hidratación alrededor de los lo,

el
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Ion Na'

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o

"esferas de
hidratación"
Interacciones del agua con moléculas POLARES
Mediante la formación de enlaces de hidrógeno.

El agua compite con las interacciones intermoleculares.

"j:¡,,;n
•••

Enlace de H interno Enlace de H con el agua

Alcoholes, aminas, ésteres, -SH,

COOH (capaces de formar enlaces
de H)
Interacciones del agua con moléculas NO POLARES
El agua no interacciona con moléculas no
polares
Adaptación del H,O al salute

sustancia no polar estructura ordenada del agua,

parecida a la dol hielo
l
Reorganización de los enlaces de
H del H,O

agrupación
espontiinaa
l
Unión de las cajas de solvatación

l
Las moléculas no polares se
excluyen del medio acuoso

C.T.C.
l
EFECTO HIDROFOBO
•
 Interacciones del agua con moléculas ANFIPÁTICAS

, Grupo hídrofilíco
Hidratación del grupo polar (polar)

Exclusión del grupo no polar

H20
Grupo polar

Grupo apolar

C.T.C.
Estructura ordenada de moléculas de agua
"jau las"
 Interacciones débiles entre biomoléculas en disolución acuosa

Cuatro tipos de interacciones no covalentes ("débiles")

entre biomoléculas en disolución acuosa
Puentes de hidrógeno
Entre gruDOS neutros 'C=O" •ti-O-
/

'C=O•••H-N
Entie enlaces cecttcicos
'
/
/

lnte1acc1ones iónicas o
11
Alr.tcción - · NH3 -··- -o-
e-
Repuls16n

lnte1acc,ones hidrofób,cas

rote-ecceoes de"ª" der Waals Dos átomos cualesquiera

muy próximos
C.T.C.
 DISTRIBUCION DEL AGUA EN EL ORGANISMO

BALANCE HIDRICO

C.T.C.

https://www.youtube.com/watch?v=gUTTgcS0eEc
Prácticamente, todas las reacciones químicas que se dan en el
organismo tienen lugar en un medio acuoso, en el que el
comportamiento de las moléculas depende de su estado de
ionización

• Ionización del agua

• Equilibrios ácido-base
• Disoluciones amortiguadoras

C.T.C.
 Ionización del agua. El pH

Kw = [H+J [OH·] = 10- 14 M2 [H+J = [OH·] = 1 Q·7 M

I pH = - log [H+J I
[H+] =[OH-]= 10-7 M = pH 7
 Neutras: [H•] = [OH·] = 1 Q-7 M = pH 7

Ácidas: [H•] > [OH·] • [H•] > 1 Q-7 M • pH < 7

Básicas: [H•] < [OH·] • [H•] < 1 Q-7 M • pH > 7

aumento de la acidez aumento de la alcalinidad

)
o 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14
-1
t ju!s
11 JI
!fl
1
t t
11
leche !fl ¡ t !fl
I
H CI gástricos cerveza pan
limón
plasma sanguíneo
sudor. lágrimas detergentes
bicarbonato
am
oniaco
hidróxido sódico
t
sódico
 Equilibrios ácido-base
Disociación de ácidos y bases

Acido: cede H-

Base: capta H-

Ácidos y bases fuertes están totalmente disociados

HCI

NaOH-- Na ' »

OH-

Ácidos y bases débiles están parcialmente disociados

ácido
CH3-COO- + H+
base conjugada
 AH

[A-] [H+]
Keq =
[AH]
= Ka I pKa = - lag Ka I

pKa: es el valor de pH al cual el 50°/o del ácido se encuentra disociado

Ka grande . pKA pequeño . ácidos fuertes

Ka pequeña . pKAgrande . ácidos débiles

AH A- + H+

:10 1
A-

.: I1
[HA] - [A-:1

•
T-TA
41 pH- p.K_.

2
C.T.C.
0.5 J.O
Equ.ivalent...s of' C>f-J- addcd
 SOLUCIONES AMORTIGUADORAS

C.T.C.
 AH
A Na

Ka [AH]
Ka=
[A·]
og Ka -
- log
l
o
g
j
[A·]
[ pH = pKa +
H log
•
]
=
-
l
 [
A A [ace
pH
H · ------

] [donad
] C

E
c
u
a
c
i
ó
n

d
Sistemas tampón de la sangre y del citosol celular
Amortiguador fosfato

pKa = 6.86
Puede resistir cambios de pH en el intervalo entre 5.9 y 7.9
Concentración baja en plasma
Importante en líquidos intracelulares y compartimentos citoplasmáticos

Amortiguador bicarbonato

H2C03 HC03• + H+
pKa = 6.1
Principal tampón extracelular, tanto en sangre como en líquidos intersticiales

Permite pH sangre arterial a pH = 7.4

Permite pH sangre venosa a pH = 7.35

C.T.C.
Sistemas tampón de la sangre y del citosol celular
Órganos implicados

-Pulmones. Controlan el intercambio de dióxido de carbono y oxigeno

entre la sangre y la atmósfera exterior.

-Eritrocitos. Transportan gases entre los pulmones y los tejidos

(hemoglobina).

- Riñones. Controlan la concentración de bicarbonato en el plasma y

excretan el ión hidrógeno en la orina.
 Acidosis y alcalosis respiratorias
Amortiguador bicarbonato
C02(g) + H20 C02(d) + H20 H2C03 HCO 3 - + H'

ca,
HIPERVENTILACIÓN
- baja la cene. H2C03
AIRE
- baja la concentración de
H+
- alcalosis metabólica

HIPOVENTILACIÓN
- sube la cene. H2C03
- sube la concentración de
H+
- acidosis metabólica SANGRE H4C0 3

�•HCO,
H•

C.T.C.

https://www.youtube.com/watch?v=NHNXW-uNJBY
 PROF. CIRO
cel: 969724442