QTL

QUANTITATIVE
TRAIT LOCI

Mauricio Peñuela
 Rasgo
MARCADOR

 PREDICCIÓN

 LOCALIZACIÓN
 El mapeo de características cuantitativas
a través de la identifi cación de loci de
caracteres cuantitativos (QTL,
Quantitative Trait Loci) se considera una
herramienta importante dentro del
mejoramiento genético de plantas

 Los QTLs son identificados dentro del

genoma de una planta basado en el
principio de asociación entre los
marcadores moleculares polimórficos y el
fenotipo de los individuos de una
población de mejoramiento.
 Existen varios procedimientos para
el mapeo de QTLs

 Evaluación por un solo marcador

 Mapeo por intervalos
 Mapeo por intervalos compuesto
 LOD: COMPARA LA PROBABILIDAD DE QUE DOS LOCI
ESTÉN LIGADOS, A LA PROBABILIDAD DE QUE NO LO
ESTÉN Y SE ENCUENTREN LIGADOS POR CASUALIDAD
 Conceptualmente QTL se basa en la
existencia de loci con mayor importancia
para la expresión de características
cuantitativas

 El uso de mapas genéticos de marcadores

moleculares para el estudio de la
herencia de características cuantitativas,
permite la identificación de cromosomas
(o grupos de ligación) los cuales son
importantes para determinar la expresión
de un carácter
 Los programas de mejoramiento genético
consideran la selección de plantas basado
en diversas características de interés
agronómico y económico. En este sentido
el mapeo de QTLs usualmente considera
un análisis del tipo univariado, de un
carácter
MAPEO POR UN SOLO
MARCADOR
Partir de
Pob Puras
 Efecto fenotípico δ de un QTL, es el
promedio aditivo sustituyendo los alelos
 AyB
δ=A+B
Un simple alelo tiene el efecto 1/2 δ,
Si se asume aditividad

Wright (1968): en un retrocruce la

segregación de un QTL con efecto δ
contribuye a una cantidad de δ^2/16 de la
varianza genética.
 La
varianza explicada por el
QTL es escrita como:
σ^2 exp = δ^2/16

Mientras la varianza residual es

σ^2res = σ^2B1 - σ^2 exp
ESCOGENCIA DE LAS LINEAS
 Entre más pequeño el efecto que uno
desea detectar, mayor cantidad de
progenie es requerida. Por lo tanto son
deseables los efectos grandes

 Wright (1968) comprobó que un número K

de QTL segregantes en un retrocruce
entre dos cepas con diferencial fenotípico
D puede ser estimado por la fórmula
 K = D^2/ 16σ^2G
 Asumiendo que:

 i) los QTLs tienen efectos de igual magnitud

 ii) no están ligados
 iii) los alelos de la cepa mayor incrementan el fenotipo,
mientras aquellos de la cepa menor reducen el
fenotipo.

 Así que la varianza explicada por un simple QTL sería

 σ^2G = (1/k)(D^2/16)

 Infortunadamente , si estos supuestos no son satisfechos

como ocurre en la mayoría de los casos. El número de
factores efectivos K pueden subestimar el número de
QTLs.
Medidas: Fenotipos

Teniendo los
fenotipos y los
genotipos de cada
individuos se puede
plantear una
regresión

 ALELOS: GENOTIPOS
 El modelo general de mapeo de QTL, utilizado
en el análisis de regresión es:

donde Yij y es el valor fenotípico de

lacaracterística en estudio;
μ es el promedio de la característica en la
población;
a es el efecto aditivo del locus que está siendo
estudiado;
d es el efecto de dominancia del locus
estudiado;
Xij y Zij son las variables condicionantes y
dependientes de los genotipos de los marcadores
moleculares que rodean el QTL;
εij es el error aleatorio.
EJEMPLO:
MAPEO - QTL

 Cada gen que contribuye a un rasgo cuantitativo es

llamado QTL
 ¿Cuantos QTLs afectan el rasgo y donde se encuentran
localizados en el genoma?
 ¿Qué son los productos proteínicos y qué efectos tienen
sobre el fenotipo?

 EXISTEN MUCHAS APLICACIONES TALES COMO INGENIERÍA

GENÉTICA Y PREDICCIÓN DE LOS RIESGOS DE
ENFERMEDADES
 Encontrar los marcadores de los loci – tener loci con
alelos conocidos – esparcidos aleatoriamente por el
genoma.
 Se necesita por lo menos conocer un marcador por cada
cromosoma

 EL QTL INFLUENCIA EL FENOTIPO, PERO ES

DESCONOCIDO. LOS MARCADORES NO TIENEN EFECTO
SOBRE EL FENOTIPO, PERO SON CONOCIDOS.
 Si hay una correlación entre el fenotipo y el genotipo
del marcador, la única explicación es que estén en
desequilibrio de ligamiento con el QTL y esta
probablemente muy cerca en el cromosoma.
REFERENCIAS

 Mora, F. Santos, A.I. Scapim, C. A. 2008. Mapeo de loci

de caracteres cuantitativos (QTL) usando un enfoque
multivariado. Cien. Inv. Agr. 35(2):137-145.
 Lander, E. S. Botstein, D. 1989. Mapping mendelian
factors underlying quantitative traits using RFLP linkage
maps. Genetics 121:185-199.

 QTL MAPPING:
 https://www.youtube.com/watch?v=1JSw1gl3-RI