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FORMATO PARA PRACTICAS DE LABORATORIO

PROCESO: GESTIÓN DE RECURSOS, INFRAESTRUCTURA Y


LABORATORIOS
GRL-F-005 Versión: 6 Fecha: 2017-08-22 Página 1 de 15

INFORMACIÓN BÁSICA
PRÁCTICA No.:
NOMBRE DE LA PRÁCTICA:
Transmisión y visualización de imágenes DICOM entre servidores.
08
ASIGNATURA:
Telemedicina
TEMA DE LA PRÁCTICA:
Estándar DICOM 3.0 (Imagen digital y comunicaciones en medicina).
LABORATORIO A UTILIZAR:
Laboratorio de Proyectos Especiales

TIEMPO: 4 TRABAJO GRUPAL: TRABAJO INDIVIDUAL

CONTENIDO DE LA GUÍA
COMPETENCIAS DISCIPLINARES.

Describe los principios básicos de los servicios de una arquitectura cliente/servidor utilizando
el estándar DICOM.

Implementa el visualizador DICOMWORKS para el análisis y procesamiento de imágenes.

COMPETENCIAS INVESTIGATIVAS.

Propone un modelo de comunicación cliente/servidor para la transmisión de imágenes DICOM a


través de la aplicación MIPAV.

MARCO TEORICO

Las tecnologías de la comunicación e información orientadas en el campo medico permiten la


transmisión de imágenes a través de aplicaciones de especialidad para ofrecer servicios de alta
calidad en diagnóstico, tratamiento y rehabilitación de patologías, es por esto que el desarrollo de
arquitecturas cliente/servidor es pieza clave para la Telemedicina.

DICOM es un estándar que establece las reglas que permiten que las imágenes médicas y la
información asociada puedan intercambiarse entre equipos de imagen de diferentes usuarios, centros
especializados y entidades de salud, entre otros; la transmisión de datos está fundamentada en una
pieza clave para asegurar que los dispositivos sean capaces de comunicarse mediante una
declaración de conformidad la cual contiene de forma detallada todos los servicios soportados.
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Sistema de Almacenamiento y Comunicación de Imágenes Médicas.

(PACS - Picture Archiving and Communication Systems) Un PACS (o IMACS: Image Management and
Communication System, como también se conoce) permite la integración de las imágenes digitales en
un hospital a través de la interconexión de diferentes equipos médicos, sistemas de almacenamiento,
bases de datos, estaciones de visualización y dispositivos de impresión

Un PACS ofrece los siguientes servicios:

• Visualización de imágenes para diagnóstico, reporte y consulta desde estaciones de trabajo;


• Almacenamiento sobre soportes magnéticos y/o ópticos para consulta a largo o a corto plazo;
• Comunicaciones utilizando redes locales, globales o servicios de comunicación públicos;
• Interfaces que permitan unir las distintas modalidades y el PACS con los sistemas de
Información de la institución.

DICOM facilita la interoperabilidad entre equipos especificando:

 Los protocolos que deben cumplir los equipos para comunicación en red.
 La sintaxis y la semántica para realizar las comunicaciones.
 Los servicios, formato de archivos y directorios utilizados para el almacenamiento en medios.
 La información que debe ser suministrada por los desarrolladores en la Declaración de
Conformidad.

DICOM

Elemento de Datos

• La imagen es un elemento de datos codificado de manera especial:


– Forma nativa.
– Forma encapsulada o comprimida (JPEG, RLE, MPEG)

• La forma de representar cada pixel depende de otros elementos de datos: bits allocated, bits
stored, high bit, etc.

• Cuando se trabajan esquemas comprimidos, los elementos de datos de la imagen deben adecuarse

DICOM

Sintaxis de Transferencia

• Son conjuntos de reglas de codificación que permiten comunicar dos entidades de aplicación.

• Definen:
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– La forma de codificar la representación de valor (explícita o implícita).


– El orden de los bytes en las palabras: little-endian o big-endian.
– El formato de compresión, si corresponde: JPG, RLE, MPEG, etc.

• La negociación de las Sintaxis de Transferencia se realiza al establecer la asociación (P8).

• Sintaxis de transferencia por defecto:

– DICOM Implicit VR Little Endian Transfer Syntax

– Lossless JPEG Image Compression coding Process 14

CONSULTA PREVIA
1. ¿Cuáles son las principales características que tiene el estándar DICOM?
El formato DICOM cuenta con objetos IOD (information Object Definition), formados por la imagen y su
información asociada (Con su representación lógica de objetos del mundo real) y DIMSE (DICOM Message
Service Element), operaciones que pueden realizarse sobre un objeto IOD y DICOM forman SOP, la unidad
funcional de DICOM. Un IOD se compone de IEs (Entidades de información) (Hay IE de paciente, de estudio, de
serie de equipo, de imagen) que a su vez se componen de uno o varios modulos que contiene varios atributos.
Un atributo se define con nombre, etiqueta, tipo y descripción.
Sus características principales son:
•Intercambiabilidad de objetos en redes y medios de almacenamiento a través de protocolos y servicios.
•Identidad de objetos en forma única, como instancias con operaciones permitidas definidas a través de clases.
•Flexibilidad al definir nuevos servicios.
•Mantiene una comunicación eficiente entre el usuario de servicios y el proveedor de los mismos.
•Sigue las directivas de ISO en la estructura de su documentación multi-partes. De esta forma facilita su
evolución, simplificando la adición de nuevas partes.

2. ¿Especifique las características del formato de fichero DICOM?


DICOM® (Digital Imaging and Communivation in Medicine) es el estándar internacional para transmitir,
almacenar, recuperar, imprimir, procesar y mostrar información médica de imágenes. DICOM®: hace que la
formación de imágenes édica sea interoperable, integra dispositivos de adquisición de imágenes, PACS,
estaciones de trabajo, VNA es impresoras de diferentes fabricantes se desarrolla activamente y se mantienes
para cumplir con las tecnologías en evolución y las necesidades de imágenes médicas, es gratis para descargar
y usar

 Los ficheros DICOM establecen como almacenar información de imágenes médicas en un medio
extraíble. se deben incluir los metadatos de la imagen.
 DICOM restringe los nombres de los ficheros a nombres de 8 caracteres, de los ficheros de DICOM no
se debe extraer ninguna información.
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 DICOMDIR proporciona un índice e información de resumen para cada uno de los ficheros DICOM y de
esta forma se elimina la necesidad de generar nombres de fichero con significado.
 Cada fichero contiene, además de la imagen, información sobre el paciente, el estudio en el que se
encuadra la toma de la imagen, la serie a la que pertenece la imagen e información sobre la propia
imagen.
 Archivos DICOM suelen tener una extensión de archivo. DCM si no son parte de una comunicación
DICOM.
 El tipo MIME para los archivos DICOM se define en el RFC 3240 como application/DICOM.
 El Tipo Identificador Uniforme de archivos DICOM es org.nema.dicom

3. ¿Qué protocolos de comunicación tienen interoperabilidad con el estándar DICOM?


DICOM es una estándar que facilita el manejo de información médica entre hospitales y centros de investigación.
Su gran importancia radica en que da la posibilidad de interconectar sistemas informáticos de diferentes
fabricantes y hace posible la comunicación entre ellos; es un hospital donde los equipos médicos son de marcas
diferentes debido a la especialización. Este estándar incluye la definición de i formatos de fichero y un protocolo
de comunicación de red que utiliza a la familia de protocolos TCP/IP para comunicar a diversos sistemas. Los
ficheros DICOM constan de una cabecera con campos estandarizados y campos de forma libre, y un cuerpo con
la imagen propiamente dicha.

La cabecera de archivos DICOM presenta etiquetas o campos que permiten situar a la imagen en contexto,
identificando la correctamente y vinculándola a un paciente concreto. Como estándar de comunicación define un
amplio conjunto de servicios como el almacenamiento de imágenes (DICOM Storage), búsqueda y recuperación
de imágenes (DICOM Q/R -Query & Retrieve-), impresión (DICOM Print), captura secundaria por conversión de
imágenes no digitales o analógicas (DICOM SC -Secondary Capture-), gestión de listas de trabajo (DICOM MWL
-Modality Worklist-) entre otras.

La mayoría de estos servicios vinculan la transmisión de datos sobre la red. Sucede que muchos fabricantes de
dispositivos DICOM no implementan todos los servicios previstos por el estándar, debido a las funcionalidades
que realizan, lo que dificulta en algunos casos la integración con otros dispositivos. Es decir, HL7 CDA.

4. ¿Cómo se lee una image DICOM en MATLAB?


Se utilizan los comandos dicominfo y dicomread por ejemplo:
info = dicominfo('CT-MONO2-16-ankle.dcm');
Y = dicomread(info);
Figure
imshow(Y,[]);

X = dicomread(filename) lee los datos de imagen del archivo compatible de Digital Imaging and Communications in
Medicine (DICOM) filename. Para leer un grupo de archivos DICOM que contienen una serie de imágenes que
comprenden un volumen, utilice dicomreadVolume.
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X = dicomread(info) lee datos de imagen DICOM del mensaje al que se hace referencia en la estructura de
metadatos de DICOM info.

X = dicomread(___,'frames',f) lee solo los cuadros especificados por fde la imagen.

X = dicomread(___,Name,Value) lee datos de imagen DICOM usando Name,Valuepares para configurar el analizador.

[X,cmap] = dicomread(___) También devuelve el mapa de colores, cmap.

[X,cmap,alpha] = dicomread(___) También vuelve alpha, una matriz de canal alfa para X.

[X,cmap,alpha,overlays] = dicomread(___) También devuelve cualquier superposición del archivo DICOM.

5. ¿Qué características integra la declaración de conformidad?

La conectividad entre dos equipos puede evaluarse anticipadamente usando las declaraciones de conformidad
con DICOM de cada equipo. En el caso de las aplicaciones de radioterapia, la determinación de la
interoperabilidad del sistema requiere a menudo efectuar pruebas extensas. Sin embargo, las declaraciones de
conformidad proporcionan una base para determinar la conectividad y evaluar la interoperabilidad potencial de
dos productos, y en algunos casos identificar posibles problemas sin haberlos conectado físicamente.

Las diferentes máquinas, servidores y estaciones de trabajo tienen una declaración de conformidad DICOM
(conformance statements) que establece claramente las clases DICOM que soportan. DICOM ha sido adoptado
ampliamente por hospitales y está haciendo incursión en pequeñas aplicación de oficinas de dentistas y de
médicos.

6. ¿Qué ventajas y desventajas ofrece el estándar DICOM al compararlo con otro tipos de
formatos para la representación de imágenes?
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Ventajas:
 Menor cantidad de material fílmico impreso, disminuyendo costos y tiempo.
 Contribuye la tele consulta de profesionales de otras instituciones.
 Posibilita brindar servicios a distancia.
 Centraliza las imágenes de toda la institución, ahorrando tiempos de acceso y búsqueda.
 Permite crear copias de seguridad y registro de todos los estudios de imágenes realizados.

Desventajas:
 Posibilidad de elaborar demasiados campos opcionales. Mostrando inconsistencia de rellenar todos los
campos con los datos.
 Algunos objetos de imágenes son a menudo incompletos porque algunos campos se dejan en blanco y
algunos son lleno de datos incorrectos.

7. ¿En qué consiste la aplicación MIPAV?

La aplicación MIPAV (Procesamiento, Análisis y Visualización de Imágenes Médicas) permite el análisis


cuantitativo y la visualización de imágenes médicas de numerosas modalidades, como PET, MRI, CT o
microscopía. Mediante el uso de la interfaz de usuario estándar y las herramientas de análisis de MIPAV, los
investigadores en sitios remotos (a través de Internet) pueden compartir fácilmente datos y análisis de
investigación, mejorando así su capacidad para investigar, diagnosticar, monitorear y tratar trastornos médicos.

PALABRAS CLAVE

METODOLOGIA
La práctica deberá desarrollarse en forma grupal cumpliendo a cabalidad con los objetivos planteados
y siguiendo paso a paso cada ítem de la guía.

Esta guía está definida para las sesiones 12, 13 y 14.

MATERIALES, EQUIPOS Y REACTIVOS A UTILIZAR (Indicar las cantidades)


Materiales y Equipos Reactivos Materiales Estudiante
1 Pc No aplica Guía de Laboratorio.
Software libre radiantviewer No aplica
(1)
Software libre MIPAV (1) No aplica
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Software microdicom No aplica


http://www.microdicom.com/downloa
ds.html

PRECAUCIONES Y MANEJO DE MATERIALES Y EQUIPOS. CONSULTA DE EQUIPO


ESPECIALIZADO.

No llevar alimentos a la sala de cómputo, utilizar de forma correcta el computador asignado para realizar la
práctica, tener las consideraciones y precauciones para el manejo del equipo electrónico.

Nivel de riesgo bajo.

PROCEDIMIENTO A UTILIZAR

INICIO

Recibir las
indicaciones
del profesor

Descargar la
aplicación
(Visualizador de
imágenes DICOM
y MIPAV)
necesaria para la
práctica
Desarrollar la
guía, siguiendo
paso a paso cada
ítem de la
práctica.
Responder las
preguntas y
realizar
conclusiones

FIN

1. Descargue el siguiente visualizador de imágenes dicom e instalarlo en un servidor XAMPP


Para descargar Ver link https://www.apachefriends.org/es/download.html
Para descargar Ver link https://github.com/hrhrprasath/NgDicomViewer
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2. Descargue el visualizador de imágenes RadiAnt (Aquí podrá familiarizarse con la barra de


herramientas que permite configurar los parámetros de la imagen según las necesidades requeridas
ejemplo: brillo, contraste, etc.) en:
http://www.radiantviewer.com/es/
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Descargue la aplicación MIPAV (Para la transmisión de imágenes DICOM entre servidores) en:
http://mipav.cit.nih.gov/clickwrap.php

3. Realice el análisis de las imágenes utilizando el software MicroDicom

Este software puede ser descargado a partir del siguiente link:


http://www.microdicom.com/downloads.html

BIBLIOGRAFÍA RECOMENDADA.

SERNA SERNA, W. A. L. T. E. R., TRUJILLO LEMUS, J. P., & RIVERA PIEDRAHITA, J. H.


(2010). Descripción del estándar DICOM para un acceso confiable a la información de las imágenes
médicas. Scientia et technica, 16(45).

Pérez, P. A. C., García, J. R., & Ibáñez, J. J. R. (2006). Ingeniería biomédica: Imágenes médicas (Vol.
49). Univ de Castilla La Mancha.
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PIANYKH, Oleg S... Digital Imaging and Communications in Medicine (DICOM). En línea.
http://books.google.com/books?id=tFgSRghUzGsC&printsec=frontcover&dq=dicom&hl=es&ei=Emne
TeuKL4ibtwfp4t3uCQ&sa=X&oi=book_result&ct=result&resnum=1&ved=0CD4Q6AEwAA#v=onepage
&q&f=false. Citado el 26 de mayo de 2011.

DICOM, Homepage. Documento principal (PROCESS). En línea.


http://medical.nema.org/. Citado el 26 de mayo de 2011.

ELABORÓ REVISÓ APROBÓ

Grupo o Programa de: Director de Programa de: Jefatura de Laboratorios


Ingeniería Biomédica- Ing. Daissy Carola Toloza
Ricardo Andrés Diaz Suárez Cano.
Fecha: Mayo de 2019 Fecha: Mayo de 2019 Fecha:
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INFORME DE LABORATORIO
GRUPO:

ESTUDIANTES:
 Edwin Gustavo Reyes Barajas
NOTA:

CARRERA: TRABAJO GRUPAL: TRABAJO INDIVIDUAL:


Ing Biomédica

FORMULE TRES HABILIDADES QUE DESEE ADQUIRIR O DESARROLLAR A TRAVÉS DE LA


PRÁCTICA DE LABORATORIO. El estudiante formulará desde la revisión de la guía las habilidades que
desarrollará a través de la práctica
 Reconocer los formatos del estándar DICOM e identificar las aplicaciones de estos.
 Interactuar con los software y formatos estipulados en la práctica para reconocer el funcionamiento
de cada uno.
 Identificar los elementos de cada formato para analizar las imágenes diagnósticas.
Elabore un Mapa conceptual del tema a tratar en la Práctica de Laboratorio.
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RESULTADOS

CUESTIONARIO

 ¿Cuáles son los servicios de arquitectura cliente/servidor de DICOM? Explique


detalladamente cada uno.

Las componentes fundamentales son las aplicaciones clientes del sistema, el servidor, y la base de datos.

La arquitectura del sistema está dividida en dos partes, los clientes Web (navegadores o
browsers con aplicaciones empotradas) y el servidor Web que posibilita comunicarse de forma
directa con los clientes Web. Este servidor posee las capacidades incorporadas de intercambiar
información con un servidor DICOM que se encarga de interactuar con la base de datos en
ambos sentidos del flujo de la información como se visualiza en el esquema.

Una de las características de estos sistemas consiste en realizar búsquedas en bases de datos de imágenes
locales y remotas, para posteriormente obtener los datos e imágenes correspondientes y visualizarlos. DICOM
facilita este tipo de operaciones, proporcionando un modelo de información, conocido como PatientRoot, que
organiza la información de pacientes, estudios, series e imágenes de forma jerárquica

 Realice un esquema que explique paso a paso como se envían y reciben imágenes
DICOM en la aplicación MIPAV.
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 Buscar en la red imágenes en formato DICOM y visualice con los visores presente los
Resultados, utilizando los diferentes software descritos en la metodología.

----Hecho en la metodología

 Analice las características del formato DICOM que se incorporan dentro del simulador.

El formato genérico del archivo de DICOM consiste en dos partes: Header seguido inmediatamente por
un Data Set de DICOM. El Data Set de DICOM contiene la imagen o las imágenes especificadas. El
Header contiene sintaxis de transferencia UID (identificador único) que especifica la codificación y la
compresión del Data Set.
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CAUSAS DE ERROR Y ACCIONES PARA OBTENER MEJORES RESULTADOS:

CONCLUSIONES

APLICACIÓN PROFESIONAL DE LA PRÁCTICA REALIZADA

BIBLIOGRAFIA UTILIZADA

ANEXOS. En este espacio presente los anexos si la práctica lo requiere

RUBRICA DE EVALUACIÓN.

RUBRICA DE EVALUACIÓN GUIA TELEMEDICINA


INDIVIDUAL CRITERIOS DE EVALUACIÓN NOTA
Estudiante 0 – 1,5 1,6 - 2,9 3,0 - 3,9 4,0 - 4,5 4,6 - 5,0
1. Propositivas
2. Argumentativas
Habilidad

3. Investigativas
4.
5.
6.
GRUPAL % 0 – 1,5 1,6 - 2,9 3,0 - 3,9 4,0 - 4,5 4,6 - 5,0 NOTA
Procedimental

Son organizados Son organizados,


competencia

No son precisos Son organizados Son precisos y


Organiza los resultados obtenidos a través y algunas veces precisos y
o no ayudan a la y ayudan a la ayudan a la
35%

del uso de dibujos, gráficas, tablas y ayudan a la ayudan a la


comprensión del entendimiento comprensión del
formulas. comprensión del entendimiento del
tema del tema tema
tema tema
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(aprender a conocer)Cognitiva (aprender a hacer) GRL-F-005 Versión: 6 Fecha: 2017-08-22 Página 15 de 15

Infiere la
Se limita a la Hace relaciones Analiza la
Hace uso adecuado de los conceptos al Hace referencia información
recopilación de básicas de la información
momento de aplicarlos en la práctica a la información obtenida y la
la información información con relacionada con
propuesta en la práctica relaciona con su
solicitada la práctica la práctica
realidad

Realiza el análisis y visualización de


imágenes DICOM.
No evidencia el Realizó la
La visualización
No presenta la uso de uno o visualización de Presento otros
de imágenes no
visualización de varios la imágenes en visualizadores de

25%
coincide con los
imágenes DICOM visualizaciones formato DICOM las imágenes en
resultado
propuestos en la de imágenes de forma formato DICOM.
esperados.
guía. DICOM. correcta

Hace parte del Participa en el Participa


Parcialmente trabajo trabajo activamente el
No hace parte
Desarrolla habilidades de trabajo en hace parte del propuesto por el propuesto por el trabajo propuesto
del trabajo
(aprender a ser)Socio afectiva

equipo, priorizando la toma de decisiones trabajo equipo de equipo de por el equipo de


propuesto por el
y la escucha de diferentes propuestas propuesto por el acuerdo a manera manera
equipo
equipo parámetros responsable y responsable y
básicos puntual puntual
A veces muestra
15%

Frecuentemente una actitud Muestra una Muestra una


Muestra una
reprocha el favorable frente actitud favorable sobresaliente
buena actitud
trabajo de sus a la clase y se frente a la clase actitud frente a la
Cuida, respeta y exige respeto frente a la frente a la clase
pares y docente, limita a e interactúa clase e interactúa
interacción con sus pares y docentes e interactúa con
y justifica sus responder por ocasionalmente frecuentemente
sus pares y
carencias en el las condiciones con sus pares y con sus pares y
docente
trabajo en grupo básicas del docente docente
trabajo
(aprender a convivir)Comunicativa

Construye el
Construye el Construye de
informe de Construye de
Practica el uso de lenguaje escrito como No construye el informe de manera
laboratorio de buena manera el
medio de identificación y diferenciación informe de laboratorio de sobresaliente el
acuerdo a los informe de
en la elaboración de informes laboratorio manera informe de
requerimientos laboratorio
incompleta laboratorio
mínimos
15%

No hace uso de Ocasionalmente Hace un buen Hace un uso


Hace uso de un
un lenguaje hace uso de un uso del lenguaje sobresaliente del
Utiliza lenguaje técnico para referirse a lenguaje técnico
técnico lenguaje técnico técnico lenguaje técnico
los diferentes conceptos que relaciona en apropiado para
apropiado para apropiado para apropiado para apropiado para la
la práctica experimental la práctica de
la práctica de la práctica de la práctica de práctica de
laboratorio
laboratorio laboratorio laboratorio laboratorio
Las fuentes de Las fuentes de Las fuentes de Las fuentes de Las fuentes de
información son información son información son información son información son
Realiza la búsqueda bibliográfica en
Investigativa

pocas o restringidas o relevantes e variadas e variadas y


fuentes confiables que permitan dar ausentes. Si las con poca pertinentes.
informativas. informativas.
10%

respuesta a las situaciones problema usa son poco diversidad. Además están
Presenta los Adicionalmente
evidenciados en la consulta previa y en el confiables y no Además no están actualizadas y
parámetros son fiables y
informe de laboratorio contribuyen a la actualizadas y contienen
aceptables por el contribuyen al
construcción del contienen docente tema información
eje central información relevante al tema

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