Curso: HERRAMIENTAS MOLECULARES PARA LA

IDENTIFICACIÓN Y CARACTERIZACIÓN DE HONGOS

FILAMENTOSOS Y LEVADURAS

Fecha: 23 de junio al 27 de junio de 2014.

Horario:
Teóricos:
• Lunes de 9:00 a 13:00 hs.
• Martes a jueves de 14:00 a 18:00 hs.
• Viernes de 9:00 a 18:00 hs.
Prácticos:
• Lunes de 14:00 a 18:00 hs.
• Martes a jueves de 9:00 a 13:00 hs.
Lugar: Teóricos: Aula Píriz Mc Coll, Instituto de Química (Gral. Flores
2124). Prácticos: Salón de Usos Múltiples, Subsuelo de Edificio
Central (Gral. Flores 2124).

Docente responsable: Dra. Silvana Vero Méndez – Profesora Agregada

de la Cátedra de Microbiología del Departamento de Biociencias,
Facultad de Química.

Docente co-coordinadora: Dra. Gabriela Garmendia, Asistente de la

Cátedra de Microbiología, del Departamento de Biociencias, Facultad
de Química.

Docente participante:

• Dra. Silvana Alborés, Asistente de la Cátedra de Microbiología,

del Departamento de Biociencias, Facultad de Química.
• Dra. Gianna Cechetto, Profesora Adjunta de la Cátedra de
Microbiología, del Departamento de Biociencias, Facultad de
Ciencias.
 • Dra. Ana Acevedo, Profesora Adjunta de la Cátedra de
Microbiología, del Departamento de Biociencias, Facultad de
Química
• Dr. Carlos Pérez, Profesor Adjunto Fitopatología, Facultad de
Agronomía.

Curso dirigido a egresados de Química, Agronomía, Lic. Bioquímica o

Biología.

Objetivos: Curso teórico y práctico que discute y analiza la utilidad

de herramientas moleculares para la identificación y caracterización
de hongos filamentosos y levaduras.

Programa:

Teórico
Día 1
• Principios básicos sobre identificación molecular de hongos
• Identificación a nivel de especie:
- Regiones génicas utilizadas para la identificación.
- Análisis de las regiones: Secuenciación, RFLP.
- Bases de datos
• Análisis de secuencias. Alineamiento y construcción de árboles
filogenéticos usando
el programa Mega. Programas para determinar perfiles de RFLP
Día 2
• Análisis multigénico en la determinación de especies fúngicas
• Pasos del análisis molecular:
-Extracción ADN de hongos filamentosos y levaduras
-Purificación de ADN, Amplificación de regiones de interés.
• Diseño de primers
Día 3
• Tipificación: subespecie, quimiotipo, cepa
Métodos: RAPD, AFLP. Microsatélites, RFLP mitocondrial.
• Cuantificación de hongos por Real Time PCR.
• Determinación de resistencia a fungicidas por métodos moleculares.
Día 4
Casos aplicados
• Identificación a nivel de especie de hongos del género Pleurotus por
métodos de
biología molecular.
• Uso de PCR en tiempo real para cuantificar Fusarium graminearum
en trigo.
• Uso de PCR en tiempo real para cuantificar Aspergillus carbonarius
en uva.
• Métodos moleculares aplicados a la identificación de levaduras de
origen clínico.
Día 5
• Prueba teórica

Práctico
El curso práctico consiste en la resolución de una situación problema,
la cual se entregará el primer día del curso. Se plantearán 6
situaciones problema que consistirán en identificar un hongo
problema, dentro de un contexto que limitará las especies a las
cuales pueda pertenecer. Los estudiantes deberán proponer los
métodos moleculares adecuados para la resolución del problema,
discutirlos y llevar a cabo en forma práctica el método más adecuado.
Cada subgrupo de 4 o 5 estudiantes será guiado por un docente.

Las situaciones problema serán:

1. Identificación a nivel de especie de un aislamiento de Pleurotus
2. Identificación a nivel de especie de un aislamiento de Aspergillus
de uva
3. Identificación a nivel de especie de un aislamiento de Alternaria
patógeno de manzana
4. Identificación a nivel de especie de un aislamiento de Fusarium
patógeno de trigo
5. Identificación a nivel de especie de un aislamiento de levaduras
6. Verificación de la identidad de un aislamiento de Penicillium
utilizado en la producción comercial de queso azul
Día 1
· Entrega de problemas. Planteo del problema por el docente
encargado.
· Extracción y purificación de ADN genómico de la muestra.
Comparación de métodos.
· Entrega de trabajos para seminarios
Día 2
· Análisis informático de regiones génicas para la identificación del
hongo. Alineamiento y análisis de secuencias. Bases de datos. Uso de
programas para análisis de restricción
· Visualización de ADN extraído el día anterior. Amplificación de la
región génica a estudiar
· Día 3
· Visualización de producto de PCR obtenido el día anterior.
· Preparación del RFLP de la región amplificada para la identificación
del hongo o levadura problema.
· Día 4
· Análisis de la secuencia de la región amplificada
· Análisis del resultado del RFLP obtenido.
· Discusión sobre los resultados obtenidos frente al problema
planteado. Preparación de la presentación de resultados.
· Día 5
· Presentación y discusión de las situaciones problemas planteadas en
el curso práctico.

Costo: $ 2.300
Se deben abonar en la Sección Tesorería de Facultad de Química
(Isidoro de María 1620 planta baja, de lunes a viernes de 10 a 13
hrs), o realizando depósito en el BROU (cuenta corriente nº
1840015257), el talón se debe enviar por fax al 2924 6079 con el
nombre del participante y presentar el primer día de clase.

Inscripción previa requerida, enviando la ficha de inscripción cuyo link

se encuentra debajo, a ep@fq.edu.uy o por fax al 2924 6079

Descarga de ficha: http://www.fq.edu.uy/node/778