UNIVERSIDAD FRANCISCO DE PAULA SANTANDER CUCUTA/NORTE DE SANTANDER 2016 BIOTECHNOBASE: Es una base de datos que brinda información actualizada en el campo de la biotecnología. Mediante ella se puede acceder a las referencias bibliográficas y a los resúmenes de los artículos publicados en las revistas más importantes de todo el mundo relacionadas con esta multidisciplinaria esfera. La información que se puede obtener por su conducto, resulta de utilidad lo mismo a científicos inmersos en investigaciones primarias, que a los generadores de productos, a los hombres de negocios, a los dedicados a la labor docente y a otros interesados.
BASE DE DATOS BIOLOGICOS-INSTITUTO DE BIOTECNOLOGIA UNI
NACIONAL. Esta ubicada en la ciudad universitaria – Bogota D.C – Colombia. Edificio “Uriel Sanchez” transversal 38 N° 40-01 El trabajo del CBIB se ha centrado en la implementación de herramientas bioinformáticas para su aplicación en los análisis propios de la investigación en biotecnología, siendo este tema de gran interés para investigadores de otras instituciones como el Instituto Suizo de Bioinformática (SIB), con el cual se han realizado cursos de proyección internacional en el área y se han desarrollado proyectos conjuntos de investigación, tales como la creación de una base de datos relacional para la colección de archivos de PROSITE y la construcción de un sistema de manejo de bases de datos para un laboratorio de Proteómica, desarrollados por medio de pasantías en Suiza. Mision: Establecer y desarrollar la bioinformática como área de investigación,docencia y extensión en Colombia. Vision: Formar un grupo de personas capacitadas trabajando permanentemente en la implementación y desarrollo de herramientas en bioinformática, reconocido como asesor y colaborador experto con grupos de investigación en áreas como la genética, biología molecular, ingeniería genética y biotecnología tanto dentro como fuera de la Universidad Nacional de Colombia. Lineas de investigacion: El CBIB en la actualidad maneja 3 grandes líneas de investigación, de las cuales se derivan proyectos desarrollados por miembros del grupo, estudiantes de maestria y pregrado. Biodiversidad y Bioinformática El objetivo de esta línea de trabajo, es contribuir al conocimiento de la biodiversidad colombiana a través del desarrollo e implementación de un sistema bioinformático que permita el almacenamiento, recuperación y análisis de datos moleculares, a partir de los cuales se desarrollen modelos de análisis filogenéticos que integren comprensivamente datos morfológicos, fisiológicos, bioquímicos y moleculares. Dentro del marco de esta línea de investigación, se han generado diversos proyectos: Aproximación Filogenética Molecular para Probar una Hipótesis de Distribución de Anfibios en los Andes Colombianos. (Sonia Mahecha Vahos, John Lynch, Emiliano Barreto, Ramón Mantilla). Abstract Búsqueda de dominios específicos para la Clase Hexapoda (Daniel R. Matute, Emiliano Barreto-Hernández, Laurent Falquet). Abstract Diseño de una Estrategía para la Evaluación de Atributos Funcionales Edáficos Mediante Sondas de ADN. (Diana Vera, Fabio Aristizábal, Emiliano Barreto) . Abstract La Bioinformática en la Salud El objetivo de esta línea de trabajo es contribuir a la obtención, almacenamiento y análisis de datos producto de estudios moleculares, para la clasificación y aprovechamiento de información biológica relacionada con el área de la salud. Dentro del marco de esta línea de investigación, se han generado diversos proyectos: Uso de herramientas bioinformáticas combinado con estudios moleculares para identificar redes de genes expresados en islotes pancreáticos durante el desarrollo de diabetes tipo I. (Gina Gutiérrez, Camila Manrique, Jaime Peña, Nikolai Petrovsky, Diego G Silva, Emiliano Barreto Hernández) Abstract Modelo para la Identificación de Genes para Betalactamasas de Espectro Extendido (BLEE) (Carlos Andrés Gil Durán, Emiliano Barreto Hernández, José Ramón Mantilla Anaya, María Teresa Reguero RezaEmilia María Valenzuela de Silva) Abstract Desarrollo de herramientas Bioinformáticas El objetivo de esta línea de trabajo es desarrollar herramientas de computo orientadas al modelamiento y biúsqueda de informacíon a partir de datos moleculares de gran escala. Sequence Retrieve System federation Server - IBUN_UNAL SRS Federation es un trabajo en progreso. Consiste en utilizar un grupo disperso de servidores de SRS que actua de manera concertada para proveer a los usuarios una fuente de alta calidad y disponibilidad de datos biológicos, moleculares, entre otros. El proyecto se adelanta con base en el trabajo voluntario de los miembros de la EMBnet (inicialmente Suecia, Eslovaquia y Belgica, a la que se unieron mas adelante Brasil, Colombia y Polonia) con la ayuda activa de LION Bioscience. Identificación de sitios de unión de proteínas por métodos de aprendizaje de máquina. (Bobadilla Leonardo, Niño Luis Fernando, Gonzalez Fabio, Barreto Emiliano) Con este proyecto se pretende desarrollar un modelo computacional para localizar sitios funcionales a partir de la estructura tridimensional de una proteína. Esta iniciativa se adelanta en conjunto con el Laboratorio de Sistemas Inteligentes de la Facultad de Ingeniería de la Universidad Nacional de Colombia- Sede Bogotá.
CORPOICA (Corporacion colombiana de invertigacion agropecuaria)
Esta ubicada en el Km 14 via Mosquera, Cundinamarca – Colombia. C.I. Caribia: Corregimiento de Sevilla, municipio Zona Bananera, departamento del Magdalena, a 65 km al sur de la capital de Santa Marta. C.I. Carimagua: Kilómetro 330, Vía Villavicencio -Puerto Carreño, Vichada C.I. El Mira: Kilómetro 38, Vía Tumaco-Pasto, Nariño C.I. El Nus: Corregimiento San José del Nus, municipio de San Roque, Antioquia. C.I. La Libertad: Kilómetro 17, Vía Puerto López, Meta C.I. La Selva: Kilómetro 7, Vía a Las Palmas, vereda Llano Grande, Antioquia C.I. La Suiza: Km 32 vía al mar, vereda Galápagos, Ríonegro-Santander C.I. Motillonia: kilómetro 5 vía a Becerril, Agustín Codazzi – Cesar C.I.Nataima: Kilómetro 9, Vía Espinal-Chicoral, Tolima C.I. Obonuco: Kilómetro 5, Vía Pasto-Obonuco, Nariño C.I. Palmira: Diagonal a la intersección de la Carrera 36A con Calle 23, Palmira, Valle del Cauca. C.I. Tibaitatá: Kilómetro 14, Vía a Mosquera, Cundinamarca C.I. Turipaná: Kilómetro 13, Vía Montería-Cereté, Córdoba La Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria, Corpoica, es una entidad pública descentralizada de participación mixta sin ánimo de lucro, de carácter científico y técnico, cuyo objeto es desarrollar y ejecutar actividades de Investigación, Tecnología y transferir procesos de Innovación tecnológica al sector agropecuario. Mision: Contribuir al cambio técnico para mejorar la productividad y competitividad de la agricultura del país, mediante su accionar como: Motor: La construcción social y actualización de la Agenda Nacional de I+D+i, la coordinación de los actores del SNCTA y el desarrollo y administración de la plataforma Siembra; Actor: Procesos de investigación, desarrollo y de vinculación tecnológica de calidad, fundados en su rigor y pertinencia a través de la gestión del conocimiento en redes; Soporte: SSATA por medio de desarrollos metodológicos, y la sistematización y transmisión de tecnologías y conocimiento. Vision: Ser una organización de referencia a nivel mundial por su sostenibilidad y capacidad de acción concertada y coordinada en la generación de conocimiento y productos de innovación que contribuyan a la competitividad del sector agropecuario colombiano. Lineas de investigacion: Cacao, frutales, ganaderia y especies menores, hortalizas y menores, cultivos permanentes, raices y tuberculos, cultivos transitorios y agroindustriales. servicios y productos de caña de azucar, algobon, cacao, berenjena, maiz, palma de aceite, sorgo,soya Genotipos de cacao seleccionados por atributos de interés (resistencia a enfermedades, calidad sensorial y fisicoquímica, rendimiento) Estrategia de transferencia de la oferta tecnológica disponible y prioritaria para el sistema productivo de la guayaba con énfasis en la comunidad de Asistentes Técnicos. Estrategias integradas de recuperación y manejo de suelos y aguas para aumentar la oferta forrajera. Desarrollo de tecnologías para la optimización de modelos de producción orgánica en hortalizas