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D. ECOLOGÍA MICROBIANA: Los microorganismos en la naturaleza. Ciclos biogeoquímicos.

La ecología microbiana es el campo de la ciencia que estudia el comportamiento y las actividades de los
microorganismos en sus ambientes naturales. Los hábitats naturales de los microorganismos son muy diversos,
incluso en condiciones extremas donde no parece posible la presencia de seres vivos. Los microorganismos
desempeñan papeles ecológicos imprescindibles en los ecosistemas. Los productores primarios (fotosintéticos y
quimiosintéticos) fijan el carbono utilizando luz solar o energía procedente de reacciones químicas. Los hongos
y bacterias quimioheterótrofas descomponen la materia orgánica (son organismos saprofitos). Algunos
protozoos son consumidores de otros protozoos, bacterias, hongos o algas.

 ¿Qué es un ciclo Biogeoquímico?

En los ecosistemas, la energía entra como energía luminosa o química (por oxidación de moléculas orgánicas o
inorgánicas reducidas) y fluye unidireccionalmente de nivel en nivel trófico hasta disiparse en forma de calor.
Por el contrario, la materia se mantiene prácticamente constante en la Tierra: los bioelementos circulan
cíclicamente dentro de la biosfera,
de los seres vivos a la materia
mineral, y viceversa, constituyendo
los ciclos biogeoquímicos.
Los microorganismos tienen un
papel destacado en los ciclos
biogeoquímicos. En algunos casos
son los únicos capaces de reciclar
formas de un bioelemento, por lo
que sin su intervención la vida no
sería posible.

a. Ciclo del Carbono:


Es necesario diferenciar los
procesos que ocurren en un medio
aerobio de los que ocurren en un
medio anaerobio.
En un medio aerobio:
1. El C en forma de CO2 es absorbido
de la atmósfera y utilizado para la
síntesis de moléculas orgánicas,
mediante los procesos de
fotosíntesis (realizado por algas,
plantas verdes y Cianobacterias) y quimiosíntesis (bacterias).
2. Los compuestos orgánicos son oxidados en el proceso de respiración celular, realizado tanto por plantas,
como animales y microorganismos; como sabemos, en la respiración el C se libera como CO2 que se reintegra
así a la atmósfera.
En un medio anaerobio:
A. Las bacterias fotosintéticas transforman el CO2 en compuestos orgánicos; éstos son degradados por los
procesos de respiración anaerobia y fermentación, llevados a cabo por microorganismos. Estos procesos
también liberan CO2, que es devuelto al medio.
B. Como sabemos, en la fermentación se produce una degradación incompleta de los compuestos orgánicos,
liberándose ácidos orgánicos y alcoholes. Estas moléculas pueden ser transformadas en metano (CH4) por las
llamadas bacterias metanógenas.
C. Si el metano pasa a ambientes aerobios es oxidado a CO2 por las bacterias metanotróficas, bacterias
quimiosintéticas que viven en el suelo y realizan esta oxidación para obtener energía.
Puesto que la desnitrificación supone pérdida de N para el suelo, es necesario que no se produzca en los suelos
de cultivo. Esta es una de las razones por la que se ara el suelo, pues al removerlo se airea y se evita que se
produzcan condiciones anaeróbicas que favorezcan este proceso.

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b. Ciclo del Nitrógeno: La principal reserva de N es la atmósfera, donde se encuentra como N 2 gaseoso
(constituye el 78% del aire). Como sabemos, es un componente esencial de las proteínas y de los ácidos
nucleicos. Los microorganismos desempeñan un papel fundamental en el ciclo del N, ya que son los únicos que
pueden realizar algunas de sus etapas.
1. Sólo ciertas bacterias fotosintéticas, como las del género Rhizobium (viven en las raíces de las leguminosas),
Azotobacter y algunas Cianobacterias (viven en el suelo), pueden absorber directamente el N del aire y reducirlo
a NH3. Éste es asimilado por estas bacterias que lo utilizan para formar los grupos –NH2 de los aa; este proceso
se conoce como fijación del N2
2. El NH3 que hay en el suelo es oxidado por bacterias quimiosintéticas conocidas como nitrificantes: las del
género Nitrosomonas oxidan el NH3 a nitritos (NO2-); las del género Nitrobacter oxidan los nitritos a nitratos
(NO3-). Estos últimos son absorbidos por las raíces de las plantas que los reducen para formar los grupos –NH2.
Estos grupos pasarán posteriormente a los animales. Este proceso se conoce como nitrificación
3. Por descomposición bacteriana de animales y plantas muertas, los grupos –NH2 se liberan como NH3, que se
reintegra así al suelo.
4. Ciertas bacterias que viven en zonas profundas del suelo, realizan respiración anaerobia, utilizando los NO 3-
del suelo como último aceptor de electrones, liberando N2; este proceso se conoce como desnitrificación. El N2
se reincorpora a la atmósfera, aunque parte del mismo es fijado por bacterias fotosintéticas anaeróbicas
(Clostridium que lo reducen a NH3, a partir del cual forman los grupos –NH2.

c. Ciclo del azufre: La mayor parte del azufre de la superficie terrestre se encuentra en forma de sulfatos
(SO2-4 ) y las plantas, algas y microorganismos fotosintéticos lo absorben y lo reducen entrando a formar
parte de la materia orgánica, como componentes de las proteinas (asimilación reductora del azufre). A
partir de estos organísmos productores pasará al resto de los niveles tróficos. Cuando se descomponen
los compuestos proteínicos, pasa al suelo como sulfuro de hidrógeno (H 2S) y ciertas bacterias realizan
diferentes procesos:
- En condiciones aerobias, bacterias quimiolitotrófas lo oxidan a sulfato.
- En anaerobias, puede pasar a azufre (So ) por acción de las sulfobacterias y también por oxidorreducción,
otras bacterias transformar el azufre en sulfatos.
- A la atmósfera se emiten H2S y SO2 en procesos volcánicos y actividad industrial, lo que puede producir
lluvia ácida y contaminar algunas zonas.
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E. PATOGENICIDAD MICROBIANA. Algunas enfermedades causadas por microorganismos.

Mecanismos mediante los cuales los microorganismos causan enfermedad:

ENTRADA Estrategias de supervivencia dentro del huésped:


 Piel  Cápsulas que impide ser fagocitados
 Mucosa  Proteínas resistentes en la pared celular al calor,
 Vía parental: picaduras ácido, fagocitosis…
inyecciones…  Exoenzimas producidas por bacterias para poder
romper barreras y moverse

Daños a las células hospedadoras TRANSMISIBILIDAD


 Sideróforos: proteínas que producen las  Contacto: directa o por saliva, moco,
bacterias para obtener el hierro de la tos…
hemoglobina  Vehículos: por el agua, alimentos o el
 Daños directos: al matar o debilitar a la célula aire
 Toxinas: son veneno  Vectores: utilizando a insectos como el
mosquito
 Algunas enfermedades causadas por microorganismos en el anexo I

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F. MICROBIOLOGÍA INDUSTRIAL Y BIOTECNOLOGÍA.

La microbiología industrial cultiva microorganismos a gran escala para realizar importantes transformaciones
químicas o para obtener productos comerciales de gran valor. Su origen tuvo lugar con la fabricación del vino y
la cerveza 6000 a. C.
En la actualidad, la biotecnología permite modificar los microorganismos genéticamente (OGM), para que
fabriquen productos útiles que de forma natural no lo harían. Tres son los grupos de microorganismos que
tienen interés industrial: Actinomicetos (bacterias heterótrofas aerobias gram+), mohos y levaduras. Actúan
mediante procesos llamados fermentaciones industriales, verdaderas o no.

Los microorganismos industriales deben:


- Crecer rápidamente en un medio de cultivo líquido y producir sustancias de interés en poco tiempo.
- Cultivos que se puedan mantener largo tiempo.
- Ser estables y actos para la manipulación genética.

Los productos de la microbiología industrial son:


- Compuestos farmacéuticos y médicos como: Antibióticos, hormonas (insulina, del crecimiento
humano…).Vacunas. Esteroides transformados (cortisona, estrógenos, progesterona…) y alcaloides.
- Ácidos orgánicos: cítrico, láctico, etanol, acético…
- Aditivos alimentarios: vitaminas, aminoácidos…
- Productos industriales: enzimas, acetonas…
- Biocombustibles: hidrogeno, metano, etano…

INDUSTRIA ALIMENTARIA: Las levaduras son las más utilizadas en estos procesos. La especie Saccharomyces
cerevisiae, se usa para fabricar vino (está de forma natural en la piel de las uvas) por fermentación alcohólica
del zumo de uva. También con la misma especie de levadura se fabrica la cerveza y el pan (se le añade como
agente estimulante del esponjado de la masa de harina, agua y sal antes de la cocción)
La fabricación de yogur, mantequilla, queso y otros derivados lácticos se realiza mediante el proceso de
fermentación láctica e implica la participación de microorganismos como las bacterias del ácido láctico que se
encuentran de forma natural en la leche.

BIORREMEDIACIÓN: es el empleo de plantas, microorganismos y enzimas bacterianas para eliminar y


neutralizar contaminantes en el suelo y en el agua.

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