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Toda substancia que tiene la capacidad de unirse a una enzima y, al hacerlo, reducir su actividad es
un inhibidor de ésta enzima. Los inhibidores existen en la naturaleza como parte de mecanismos de
control de actividad o interacción entre especies (venenos, sistema de protección). Para nosotros
los inhibidores son importantes tanto en el área de investigación (estudios de cinética, estructura
del sitio activo, estudios de afinidad y rutas metabólicas) como en aplicaciones industriales
(fármacos, antibióticos, conservadores, herbicidas, insecticidas, armas químicas, etc.).
Los inhibidores pueden clasificarse bajo dos criterios diferentes:
1) Por su sitio de unión a la enzima.
A) Isostéricos. Se unen en el sitio activo.
B) Alostéricos. Se unen fuera del sitio activo.
2) Por su efecto sobre los parámetros cinéticos de la enzima.
A) Reversibles. Enzima e inhibidor interactúan mediante interacciones débiles, una vez
unidos, se pueden liberar uno de otro, por lo que la interacción y formación del
complejo EI es un proceso regido por el equilibrio. Dependiendo su afectación a las
constantes cinéticas se conocen al menos 4 clases.
B) Irreversibles. Al interaccionar con la enzima, se unen de manera covalente a ésta, siendo
el proceso de formación del complejo EI un proceso regido por la velocidad de
inhibición.
A) INHIBIDORES IRREVERSIBLES.
1) INHIBIDORES COMPETITIVOS.
Son inhibidores que compiten con el sustrato para unirse con la enzima, es decir, al estar unido uno
no puede unirse el otro, y viceversa. Esto puede deberse a que el inhibidor es similar al sustrato y
puede unirse al sitio activo, pero no ser catalizado, que la unión de S o I bloquee el sitio de unión
del otro a la enzima, que la unión de S o I altere la estructura de la enzima, deformando el sitio de
unión de la otra molécula o alguna otra situación. Para éste inhibidor, el equilibrio se representa de
la siguiente manera:
Dónde
Y replanteamos la concentración de enzima como
Esto transforma la ecuación de Michaelis Menten en:
1
Si definimos km aparente: 1
Podemos reescribir el modelo:
La necesidad de definir una km aparente es el resultado de la competencia de S e I por unirse a E, lo
que “desplaza” el equilibrio de unión entre E y S, ya que se requerirá mayor concentración de S para
lograr desplazar por completo a I y lograr saturar a E. Esto se puede observar en la representación
gráfica del modelo Michaelis Menten:
En ésta se observa que eventualmente se alcanza la misma velocidad máxima, pero se requiere
mayor cantidad de sustrato para alcanzar dicha velocidad. Por lo tanto, se observa también en el
modelo de Lineweaver‐Burk (dobles inversos) un cambio en el comportamiento gráfico,
manteniéndose la ordenada al origen (1/vmax), pero cambiando la ordenada a las abscisas (‐1/km) y
pendiente (km/vmax) debido a la diferencia en Kmap:
Finalmente, es importante calcular la constante de inhibición (kI), pues es el parámetro que
caracteriza la capacidad inhibitoria del inhibidor. Se puede hacer una interpretación similar a la de
km para kI: un valor bajo implica alta afinidad por la enzima, y por tanto se trata de un inhibidor
eficiente, y viceversa. El cálculo de kI es diferente para cada tipo de inhibidor, en el caso de un
inhibidor competitivo, se obtiene de la siguiente regresión y su correspondiente gráfica:
De modo que se puede obtener kI al despejar de la pendiente kI, utilizando km de la enzima sin
inhibidor.
2) INHIBIDORES NO COMPETITIVOS.
Los inhibidores competitivos son aquellos en los que la unión del sustrato a la enzima no inhibe la
unión del inhibidor a ésta, ni la unión del inhibidor inhibe la del sustrato. Ambas moléculas pueden
estar unidas a la enzima a la vez, sin embargo, cuando el inhibidor se encuentra unido, la enzima es
catalíticamente inactiva. El equilibrio de éste sistema queda representado de la siguiente manera:
Ahora:
Esto reduce de manera efectiva la cantidad de enzima total activa en el sistema, y recordando que
vmax es una función de [E]T, ésta es la constante que se verá afectada:
1
Dónde:
1
En éste caso, el modelo de Michaelis Menten muestra que se ve reducida la velocidad máxima al
verse reducida la cantidad de enzima catalíticamente disponible, pero no hay variación en km:
Igualmente, se observará un cambio en la gráfica de Lineweaver‐Burk:
Ahora, se observa que no hay cambio en km (ni la ordenada a las abscisas), pero la vmax, (y por tanto
la ordenada al origen) presentan variación. Para el cálculo de una kI no competitiva, se emplean la
siguiente regresión y gráfica:
Siguiendo para el cálculo de kI el mismo procedimiento que en la inhibición competitiva.
3) INHIBIDORES ACOMPETITIVOS.
Los inhibidores acompetitivos son aquellos que son incapaces de unirse a la enzima, únicamente se
unen al complejo enzima sustrato, haciendo a éste más estable.
Ahora:
Esto conlleva a una alteración del modelo de Michaelis Menten, el cuál presenta variación
significativa respecto a su forma tradicional:
1
1
A causa de la estabilización del complejo ES, aparentemente la enzima incrementa su afinidad por
el sustrato, lo que se ve reflejado en una disminución de km, pero al ser catalíticamente inactivo el
complejo ESI, se reduce su velocidad. El modelo de Michaelis Menten se ve alterado de la siguiente
manera:
El modelo de Lineweaber‐Burk genera, para éste tipo de inhibición, líneas paralelas:
Y el cálculo de la constante de inhibición se hace mediante la extrapolación hasta la ordenada a las
abscisas, correspondiendo éste punto con –kI:
4) INHIBIDORES MIXTOS.
Éste tipo de inhibidor presenta un modelo de equilibrio similar al del inhibidor no competitivo,
siendo posible que inhibidor y sustrato se unan a la enzima independientemente de la presencia del
otro. Sin embargo, en éste caso la unión de una u otra molécula si afecta la afinidad de la molécula
aún no unida por la enzima:
Ahora:
Pero : ´ ´
Nuevamente, hay una alteración significativa al modelo de Michaels Menten:
1
´
1
1
1
´
Pese a que éste modelo, así como el da la inhibición acompetitiva no se ajustan del todo a la forma
tradicional del modelo de Michaelis Menten, el cálculo de las constantes cinéticas puede hacerse a
partir de la forma tradicional de éste. Sin embargo, para estimar el comportamiento de la velocidad,
es necesario emplear los modelos aquí presentados. En el caso del modelo de Michaelis Menten
para un inhibidor mixto, se observan características de la inhibición competitiva y no competitiva
(de ahí su nombre), es decir, una diminución en la velocidad máxima y un aumento en km (pérdida
de afinidad ES).
Se observa también la alteración del modelo de dobles inversos:
En éste caso, son necesarios tanto el cálculo de kI como el de kI´:
B) INHIBIDORES IRREVERSIBLES.
La mayoría de los inhibidores con mayor toxicidad (biocidas) son los irreversibles, ya que al unirse
de manera covalente a la enzima, la inutiliza de manera permanente, impidiendo por completo su
actividad en lugar de sólo reducirla, como los reversibles. En muchas ocasiones, estas interacciones
son con aminoácidos en el sitio activo (particularmente el sitio catalítico), aunque no excluyen otro
tipo de interacciones. Mientras que en el caso de un inhibidor reversible es posible restaurar la
actividad de la enzima al retirar el inhibidor (purificar la enzima) en un proceso relativamente fácil,
los inhibidores irreversibles son imposibles de separar de la enzima y conservar la actividad de ésta.
Su comportamiento cinético es aparentemente similar al del inhibidor no competitivo, pero
recordando que éste proceso está regido por un tiempo y no por un equilibrio de inhibición. Por lo
tanto, en lugar de alteración de constantes cinéticas, se observa una velocidad de formación del
complejo EI, inactivo.
Si consideramos: [E]=e, [I]=i y [EI]=z, tenemos:
Integrando ésta ecuación, tenemos:
1
Cuando i>>>e, la solución anterior puede reducirse a un modelo de pseudo primer orden:
´
Dónde k´ es la constante de pseudo primer orden. El término i desaparece pues al ser mucho mayor
que e, su variación se vuelve muy poco significativa, por lo que i permanece prácticamente
constante. k´ es la pendiente obtenida al graficar ln(e‐z) contra el tiempo.