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Guía de inicio rápido

Chromeleon 7
Sistema de datos de cromatografía
Versión de software 7.2 SR3 • Agosto de 2015
Chromeleon 7

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documentos.
Historial del documento
Revisión: 1.4, Origen: Quick Start Guide,
Chromeleon 7 Chromatography Data System, Rev. 1.4

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Chromeleon 7

Índice
Índice ............................................................................................. 4
1. Introducción ............................................................................ 6
1.1 Sobre este documento ..................................................... 6
1.2 Convenciones del documento .......................................... 6
1.3 Otros documentos ........................................................... 7
2. Uso de Chromeleon ................................................................. 8
2.1 Descripción general .......................................................... 8
2.2 Inicio de Chromeleon ....................................................... 9
2.3 Inicie su instrumento ....................................................... 9
2.3.1 Comprobación de que Instrument Controller Service
se está ejecutando ............................................................. 10
2.3.2 Establecimiento de una conexión ........................... 11
2.3.3 Control y supervisión el instrumento ..................... 11
2.4 Creación de una secuencia ............................................. 13
2.4.1 Creación de un Instrument Method (Método de
instrumento) ...................................................................... 14
2.4.2 Creación de un Processing Method (Método de
procesamiento) .................................................................. 15
2.4.3 Creación de una Report Template (Plantilla de
informe).............................................................................. 16
2.4.4 Creación de una secuencia ..................................... 16
2.5 Inicio de análisis ............................................................. 19
2.5.1 Comprobación de preparación del instrumento .... 19
2.5.2 Inicio de la secuencia: ............................................. 20
2.5.3 Supervisión de un análisis en curso ........................ 21
2.6 Procesamiento de datos ................................................ 22
2.6.1 Revisión de datos en Chromatography Studio ....... 22
2.6.2 Trabajo con cromatógrafos..................................... 24

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2.6.3 Detección e integración de picos ............................ 25


2.6.4 Identificación de picos ............................................ 32
2.6.5 Calibración y cuantificación .................................... 36
2.7 Revisión e informes de resultados ................................. 39
2.7.1 Revisión de resultados ............................................ 40
2.7.2 Impresión de resultados ......................................... 41
2.8 Espectrometría de masas (MS) en Chromeleon............. 42
2.8.1 Control de instrumentos de MS .............................. 43
2.8.2 Obtención de datos con un instrumento MS .......... 43
2.8.3 Visualización de datos de MS.................................. 43
2.8.4 Procesamiento de datos de MS (Processing Method)
46
3. Apéndice: Descripción general de Chromeleon .................... 54
3.1 Introducción ................................................................... 54
3.2 Instrument Controller Service ........................................ 55
3.3 Chromeleon Client ......................................................... 56
3.3.1 Chromeleon Console............................................... 57
3.3.2 Chromatography Studio.......................................... 63

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1. Introducción

1.1 Sobre este documento


Esta guía proporciona una referencia rápida para facilitar el uso
del sistema de datos de cromatografía Thermo Scientific™
Dionex™ Chromeleon™ 7. Antes de trabajar con Chromeleon,
revise la Guía de inicio rápido a fondo.
La Guía de inicio rápido consta de dos partes:
• Uso de Chromeleon: Orientación para iniciar un análisis
simple, procesar los datos y notificar los resultados.
• Apéndice: Descripción general de Chromeleon:
Un acercamiento a las interfaces de Chromeleon y
las funciones más comunes.

Esta guía se proporciona “tal cual”. Se ha realizado todo lo


posible para proporcionar información completa y precisa, y
todos los programas y las especificaciones técnicas se han
desarrollado con el máximo cuidado. No obstante, Thermo
Fisher Scientific no asume ninguna responsabilidad ni puede ser
hecha responsable de ningún error, omisión, daño o pérdida
que pueda resultar del uso de este manual o de la información
contenida en el mismo.

1.2 Convenciones del documento


Se utilizará el siguiente formato en todo el documento para
indicar la especial importancia del texto.

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Atención: Indica que el texto se debe leer con detenimiento


para evitar posibles problemas.

Nota: Indica que la información es de especial interés.

Consejo: Indica que la información le ayudará a usar el


software con mayor eficiencia.

1.3 Otros documentos


Chromeleon se proporciona con otros documentos que le
ayudarán a conocer mejor el software. El ámbito de aplicación
de los documentos se detalla en Documentation Overview
(descripción de la documentación), disponible en formato
electrónico en la carpeta Documents del disco de instalación. El
original en inglés de la descripción de la documentación se
incluye también en forma impresa junto con los medios para la
instalación de Chromeleon. La ayuda en línea de Chromeleon
está disponible en formato electrónico en la carpeta Online
Help.

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Chromeleon 7

2. Uso de Chromeleon

2.1 Descripción general


Todos los análisis realizados utilizando Chromeleon siguen los
mismos seis pasos básicos:
1. Iniciar Chromeleon.
2. Iniciar el instrumento.
3. Crear una secuencia.
4. Obtener datos.
5. Procesar los datos.
6. Revisar y notificar los resultados.

Esta guía proporciona información suficiente para llevar a cabo


cada uno de estos seis pasos como parte de un análisis simple.
Para un uso de Chromeleon más avanzado, incluidos los análisis
más complejos, consulte la ayuda de Chromeleon.

Nota: Se da por sentado que se ha instalado Chromeleon y


se ha conectado y configurado al menos un instrumento.
Para obtener detalles sobre la instalación y la conexión y
configuración de los instrumentos, consulte la
Chromeleon 7 - Guía de Instalación.

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2.2 Inicio de Chromeleon


Para iniciar el software Chromeleon:
• Haga doble clic en el icono de Chromeleon 7 en el

escritorio:
-O BIEN-
• Utilice el menú Inicio de Microsoft™ Windows™: Seleccione
Inicio > Todos los programas >Thermo Chromeleon 7 >
Chromeleon 7.

Se abre la ventana Chromeleon Console (Consola). Si user


management (administración de usuarios) está activado, se le
solicitará que inicie sesión en el software. Introduzca el nombre
de usuario y la contraseña proporcionados por el administrador
de Chromeleon para continuar. Para obtener más información
acerca de la administración de usuarios, consulte Managing
Users:Open the Chromeleon User Manager en la ayuda de
Chromeleon.

2.3 Inicie su instrumento


Para controlar y supervisar un instrumento en Chromeleon,
debe hacer lo siguiente:
• Asegúrese de que Instrument Controller Service (Servicio de
controlador de instrumentos) se esté ejecutando.
• Establezca una conexión.

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2.3.1 Comprobación de que Instrument Controller


Service se está ejecutando
El Instrument Controller Service de Chromeleon administra las
comunicaciones y el control del instrumento, así como la
obtención de datos. Se ejecuta en segundo plano como un
servicio de Windows en cualquier PC al que los instrumentos
están conectados físicamente. El estado del Instrument
Controller Service se representa mediante un icono en el área
de notificación de la barra de tareas de Windows:

El Instrument Controller Service se está ejecutando.

El Instrument Controller Service está detenido.

Si el Instrument Controller Service está detenido, inícielo


siguiendo estos pasos:
1. Haga clic con el botón derecho en el icono de bandeja de
Chromeleon del área de notificación de la barra de tareas.
2. Haga clic en Start Chromeleon Instrument Controller
(Iniciar Chromeleon Instrument Controller).

Consejo: Si el icono de bandeja de Chromeleon no está


presente en la barra de tareas, haga clic en Inicio >
Programas (o Todos los programas, dependiendo del
sistema operativo), abra la carpeta Thermo Chromeleon 7 y
haga clic en Services Manager (Administrador de servicios).

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Chromeleon 7

Nota: Puede configurar el Instrument Controller Service de


Chromeleon para que se inicie automáticamente cada vez
que se encienda el ordenador. Para obtener más
información, consulte Controlling Instruments and Modules
en la ayuda de Chromeleon.

2.3.2 Establecimiento de una conexión


Antes de poder controlar un instrumento, debe establecerse
una comunicación entre los módulos y el Instrument Controller
de Chromeleon. Esto se conoce como “conectar los módulos”.
Para conectar los módulos siga estos pasos:
1. En la Console, elija la categoría Instruments (Instrumentos)
y haga clic en el nombre del instrumento en el Navigation
Pane (Panel de navegación).
2. En el área de trabajo seleccione la pestaña ePanel para el
módulo correspondiente (por ejemplo Pump [Bomba]).
3. En el ePanel, haga clic en Connect (Conectar).

Nota: Los conjuntos del ePanel se generan


automáticamente para admitir los módulos de una serie de
instrumentos específica (por ejemplo, UltiMate™ 3000, ICS-
5000). Al combinar los módulos de estos instrumentos,
puede que los ePanels de algunos módulos no se muestren
automáticamente. Consulte Managing ePanel Sets and
ePanels en la ayuda de Chromeleon para obtener detalles
sobre la adición manual de ePanels a un conjunto.

2.3.3 Control y supervisión el instrumento


Por lo general, las muestras se analizan como parte de una
secuencia con un conjunto predefinido de comandos del

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instrumento. Dichos comandos se guardan en un Instrument


Method (Método del instrumento). A veces (normalmente
entre ejecuciones de secuencias) es necesario ejecutar
comandos individuales a los módulos de los instrumentos, como
para iniciar o detener el flujo, o para supervisar la línea base.
Para ejecutar comandos de instrumentos, siga estos pasos:
1. En la Console, elija la categoría Instruments. Seleccione el
instrumento haciendo clic en su nombre en el Navigation
Pane (Panel de navegación).
2. En el área de trabajo seleccione la pestaña ePanel para el
módulo correspondiente.
3. Utilice los controles del ePanel para ejecutar comandos de
instrumentos (por ejemplo, establecer la longitud de onda
de un detector UV/VIS o iniciar el flujo de fase móvil de una
bomba).

Cuando se está ejecutando un análisis, puede supervisar


parámetros y salidas del instrumento, como la salida de la señal
del detector o la presión de la bomba, desde el ePanel del
módulo. Para supervisar las señales del detector sin iniciar una
secuencia, haga clic en Monitor Baseline (Supervisar línea base)
en la barra de herramientas que se encuentra encima del
conjunto del ePanel. Haga clic en el botón de nuevo para
detener la supervisión de la línea de base. También puede
guardar los datos de la línea base de la supervisión. Para
obtener más detalles, consulte Monitor the Baseline en la ayuda
de Chromeleon.

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Nota: Los comandos más comunes están disponibles en los


ePanels. Si tiene que ejecutar un comando que no está
disponible, puede acceder a todos los comandos del
instrumento disponibles en un cuadro de diálogo mediante
el botón Command (Comando) en la barra de
herramientas Instruments.

Consejo: Para determinados instrumentos, Chromeleon


Proporciona procedimientos para iniciar o apagar de forma
automática un sistema de cromatografía, o bien hacerlo
entrar en el modo de espera. Estos procedimientos se
conocen como Smart Startup, Smart Shutdown (Inicio
inteligente, Apagado inteligente) y Smart Standby (Espera
inteligente), respectivamente. Para obtener detalles sobre
qué instrumentos pueden controlarse de este modo y cómo
utilizar esta función, consulte Smart Startup, Smart
Shutdown, and Smart Standby en la ayuda de Chromeleon.

2.4 Creación de una secuencia


Una secuencia determina cómo debe procesarse un grupo de
inyecciones. La lista de inyecciones (consulte el capítulo 3.3.2)
es el elemento principal de la secuencia. La lista agrupa las
inyecciones por orden de procesamiento e incluye las variables
de las mismas (nombre, tipo, etc.) que caracterizan cada
inyección.
Se pueden crear secuencias en la Console o por medio de un
eWorkflow (flujo de trabajo electrónico). Los eWorkflows son
simples pero potentes herramientas que permiten crear
secuencias a partir de plantillas y reglas predefinidas. Para

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Chromeleon 7

obtener más información sobre la creación y el uso de


eWorkflows, consulte Creating eWorkflows en la ayuda de
Chromeleon.
Para crear una secuencia mediante el Sequence Wizard
(Asistente de secuencias) de la Console, deben prepararse los
siguientes archivos:
• Instrument Method (Méthodo de instrumento)
• Processing Method (Método de procesamiento)
• Report Template (Plantilla de informe)

2.4.1 Creación de un Instrument Method (Método


de instrumento)
Un instrument method es un conjunto de instrucciones
almacenado que permite controlar un instrumento. Un
instrument method se crea mediante el Instrument Method
Wizard y se puede editar en el Instrument Method Editor (Editor
de métodos del instrumento). Parar crear un instrument
method, siga estos pasos:
1. En la categoría Instruments de la Console, seleccione el
instrumento en el Navigation Pane para el que desea crear
el instrument method.
2. En el menú Create (Crear), haga clic en Instrument Method.
3. Complete todos los pasos del asistente y haga clic en Finish
(Finalizar). El método de instrumento creado se abre en
Chromatography Studio.
4. Revíselo seleccionando las vistas del módulo en el
Navigation Pane. Modifique los valores, en caso necesario.

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5. Guarde el método del instrumento mediante el icono Save


Changes (Guardar cambios) de la Quick Access Toolbar
(Barra de herramientas de acceso rápido) y especifique una
ubicación y un nombre de objeto.
6. Cierre Chromatography Studio.

2.4.2 Creación de un Processing Method (Método


de procesamiento)
Un processing method es un conjunto de parámetros que se
utiliza para analizar nuevos datos de cromatografía sin procesar.
Un processing method normalmente incluye valores de
procesamiento de señales, parámetros de detección de picos,
un conjunto definido de componentes con parámetros de
identificación de picos y valores de calibración. Parar crear un
processing method, siga estos pasos:
1. En la Console, en el menú Create, haga clic en Processing
Method.
2. Seleccione uno de los diseños predefinidos y haga clic en
Next (Siguiente).
3. Introduzca un nombre, seleccione una ubicación de archivo
y escriba un comentario (opcional).
4. Haga clic en Finish para guardar el método de
procesamiento y cerrar el asistente.

El nuevo processing method se abre en


Chromatography Studio.

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2.4.3 Creación de una Report Template (Plantilla de


informe)
Una report template es un archivo similar a una hoja de cálculo
que define cómo se muestran, imprimen o exportan los datos.
Parar crear una plantilla de informe, siga estos pasos:
1. En la Console, en el menú Create, haga clic en
Report Template.
2. Seleccione una de las plantillas predefinidas y haga clic en
Next.
3. Seleccione una ubicación para el archivo y escriba un
nombre de archivo.
4. Haga clic en Finish para guardar la plantilla de informe y
cerrar el asistente.

2.4.4 Creación de una secuencia


Para crear una secuencia mediante el Sequence Wizard de la
Console:
1. En la categoría Instruments de la Console, seleccione el
instrumento en el Navigation Pane para el que desea crear
el instrument method.
2. En la Console, en el menú Create, haga clic en Sequence.
3. Complete los ajustes de configuración de inyección para las
inyecciones:
Pattern for Permite indicar cómo se llamarán las
Injection Name inyecciones.
(Patrón de
Se trata de un campo de texto libre en
nombre de
el que se pueden incluir los códigos #n
inyección):
#p #i y #r.

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Chromeleon 7

(Haga clic en el botón situado a la


derecha del campo Pattern for Injection
Name para ver definiciones de dichos
códigos)
Number of Vials Permite especificar el número total de
(Número de viales en el análisis.
viales):
Injections per Permite especificar el número de
Vial (Inyecciones inyecciones por vial en el análisis.
por vial):
Start Position Permite especificar la posición de inicio
(Posición de la secuencia del análisis. Especifica la
de inicio): posición del primer vial en el
muestreador automático. El asistente
incrementa automáticamente los
siguientes viales.
Injection Permite especificar el volumen de la
Volume inyección.
(Volumen
de inyección):
Rack View Si el muestreador automático dispone
(Vista de de la función de vista previa, Rack View
gradilla): proporciona una representación gráfica
de las bandejas y las gradillas que se
han instalado en el instrumento
seleccionado. La vista previa también
permite determinar de manera práctica
la posición de la primera muestra en la
bandeja del muestreador automático.
Simplemente, haga clic en un vial para
especificar la posición de inicio
requerida. La información del campo

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editable Start Position se actualiza


automáticamente.

Figura 1: Rack View

4. Haga clic en Next.


Nota: Cuando cree una secuencia mediante el asistente,
solo puede añadir inyecciones de tipo Unknown
(Desconocido). Una vez creada la secuencia, puede
modificar los tipos de inyección y sus posiciones.

5. Métodos de selección y preferencias de informes: Para cada


campo, utilice el botón para navegar hasta el
archivo que desea utilizar y seleccionarlo. Una vez
completados todos los campos, haga clic en Next.
6. Introduzca un comentario para la secuencia (opcional) y
haga clic en Finish.

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7. Se abre el cuadro de diálogo Save (Guardar).


8. Especifique dónde desea guardar la secuencia, introduzca
un nombre de archivo y haga clic en Save.
9. Si es necesario, cambie los nombres, los tipos y las
posiciones de las inyecciones, así como otras entradas. Para
obtener una descripción general de los tipos de inyección,
consulte la sección 3.3.1.

La secuencia aparece ahora en el Navigation Pane de la


Chromeleon Console.

2.5 Inicio de análisis


Una vez creada la secuencia y preparado el instrumento, puede
iniciar la obtención de datos.

2.5.1 Comprobación de preparación del instrumento


Para comprobar si el instrumento está preparado, haga lo
siguiente:
1. En la Console, elija la categoría Instruments. Seleccione el
instrumento haciendo clic en su nombre en el
Navigation Pane (Panel de navegación).
2. En el área de trabajo seleccione la pestaña ePanel para el
módulo correspondiente. Para comprobar la línea base, por
ejemplo, seleccione el ePanel del detector y haga clic en el
botón Monitor Baseline.

Cuando esté satisfecho con el estado de preparación del


instrumento para el análisis, inicie la secuencia.

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2.5.2 Inicio de la secuencia:


1. Seleccione la categoría Data (Datos) en la Console.
2. En el Navigation Pane, seleccione la secuencia que desee
ejecutar haciendo clic en ella. A continuación, la secuencia
se abre en el área de trabajo.
3. Realice una de las acciones siguientes:
 Haga clic en la flecha hacia abajo del botón Start
(Inicio). Haga clic en Add to Queue (Añadir a la cola).
-O BIEN-
 Haga clic en el botón de la barra de control de
secuencia, encima de la lista de inyecciones, a fin de
añadir la secuencia a la cola e iniciar la cola de
inmediato.

La secuencia se añade a la cola. Si la cola está vacía, debe


realizarse una Ready Check (Comprobación de preparación). La
cola se inicia si no hay errores.

Figura 2: Secuencias en ejecución

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Chromeleon 7

Nota: La Chromeleon queue (Cola de Chromeleon) puede


utilizarse para programar varias secuencias que se ejecuten
consecutivamente. Consulte Managing Queues en la ayuda
de Chromeleon para obtener información acerca del uso de
colas.

Consejo: Con Chromeleon, puede iniciar o apagar un


sistema de cromatografía de forma automática, o bien
activar el modo de espera para el mismo. Estos
procedimientos se denominan Smart Startup, Smart
Shutdown y Smart Standby, respectivamente. Para obtener
detalles sobre los instrumentos compatibles y cómo utilizar
esta función, consulte Smart Startup, Smart Shutdown, and
Smart Standby en la ayuda de Chromeleon.

2.5.3 Supervisión de un análisis en curso


Durante el análisis, resulta útil supervisar la señal del detector y
otros parámetros del instrumento (como presión y
temperatura).
Para supervisar un análisis en curso:
1. En la Console, elija la categoría Instruments y haga clic en el
nombre del instrumento en el Navigation Pane.
2. Seleccione Home ePanel (Panel electrónico de inicio) en el
área de trabajo a fin de supervisar la señal del detector y las
trazas de auditoría.

Nota: Los valores de otros módulos pueden supervisarse en


los respectivos ePanels.

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2.6 Procesamiento de datos


Una vez obtenidos los datos de espectrometría cromatográfica
o de masa (MS), estos se pueden procesar. Todos los pasos de
procesamiento se llevan a cabo en Studio y se guardan en un
processing method.
Para abrir Studio desde la Console, haga doble clic en cualquier
objeto de una secuencia, o bien haga clic en el botón .
Chromeleon cuenta con diversas herramientas que permiten
simplificar o acelerar las tareas de procesamiento de datos,
como el asistente de integración SmartPeaks™, aunque en esta
guía solo se describen los pasos de procesamiento más
comunes.

Nota: Al realizar un cambio en el processing method, los


resultados de todas las inyecciones de la secuencia que
utilizan dicho processing method se calculan de nuevo al
instante. No es necesario volver a procesar la secuencia o
actualizar los resultados manualmente.

2.6.1 Revisión de datos en Chromatography Studio


Una vez obtenidos los datos para todas las muestras de una
secuencia, es útil revisar los cromatógráfos y los datos pico
antes de generar un informe con los resultados. A menudo, los
ajustes de detección de picos, integración y calibración deben
ser modificados antes de incluir los resultados en un informe.
Para obtener más información, consulte la sección 2.6.2 y
posteriores.

Página 22 Guía de inicio rápido


Chromeleon 7

Para revisar datos en Studio de cromatografía realice lo


siguiente:
1. En la Chromeleon Console, seleccione la categoría Data.
2. Abra la primera inyección de la secuencia en el Studio de la
cromatografía haciendo doble clic en una inyección en el
área de trabajo de la Consola de Chromeleon. Se abre el
Studio de la cromatografía.
3. Abra la categoría Data Processing y, en el Navigation Pane,
seleccione la inyección que desee ver. Los datos de dicha
inyección se muestran en el área de trabajo, utilizando la
vista preestablecida por defecto.
Consejo: Hay varias vistas en Chromeleon que se pueden
seleccionar en el grupo Presets de la pestaña Data
Processing Home (Inicio de procesamiento de datos).
También puede crear nuevas vistas y almacenarlas para ser
utilizadas de nuevo. Consulte Create New View Settings en
la ayuda de Chromeleon para obtener detalles sobre la
configuración de vistas personalizadas.

4. Puede navegar por los datos:


 Utilizando los botones del grupo Navigation de la
pestaña Data Processing Home.
 Selección de inyecciones, canales o componentes en el
Navigation Pane.
-O BIEN-
 Doble clic en un componente o una inyección en la
tabla Integration o Resumen en el panel Interactive
Results pane (Figura 3).

Guía de inicio rápido Página 23


Chromeleon 7

Figura 3: Selección en la tabla Interactive Results (Resultados


interactivos)

Esta sección describe cómo:


• Trabajar con cromatógrafos
• Detectar e integrar picos
• Identificación de picos
• Calibración y cuantificación

2.6.2 Trabajo con cromatógrafos


Puede ver el cromatógrafo integrado de la inyección actual en el
trazado de cromatógrafo (Figura 4).
Si la evaluación de los datos no es la deseada, puede, por
ejemplo, cambiar los delimitadores de pico y la línea basal
directamente en el cromatógrafo. Por supuesto, puede adaptar
el diseño del cromatógrafo a sus necesidades. También es
posible superponer otros cromatógrafos para su comparación.
Para obtener más detalles, consulte Working with
Chromatograms en la ayuda de Chromeleon.

Página 24 Guía de inicio rápido


Chromeleon 7

Figura 4: Trazado de cromatógrafos

Consejo: Puede superponer los cromatógrafos de diferentes


inyecciones o canales mediante las patillas del
Navigation Pane o seleccionando los canales del Navigation
Pane (para seleccionar dos o más canales, mantener
pulsado CTRL o MAYÚS y, a continuación, hacer clic en los
canales).

2.6.3 Detección e integración de picos


Para la correcta cuantificación o calificación de un
cromatógrafo, todos los picos de interés se deben detectar e
integrar correctamente. Para ello puede:
• Crear un nuevo conjunto de parámetros de detección.
-O BIEN-
• Modificar un processing method existente.

A efectos de esta guía, se considera que el usuario crea primero


un nuevo conjunto de parámetros de detección (mediante el
algoritmo de detección Cobra™) y posteriormente los modifica
para mejorar la detección e integración de picos.

Guía de inicio rápido Página 25


Chromeleon 7

Nota: En la página de la pestaña MS Detection (Detección


de MS) del Processing Method, puede seleccionar un
algoritmo de detección de picos (Chromeleon 6, Cobra,
Genesis, o ICIS) para los datos MS. Puede aplicar la
configuración de detección de pico a todo el cromatógrafo
o definir diferentes configuraciones de detección de picos
para cromatógrafos de iones extraídos individuales. El
algoritmo y la configuración definidos se aplican solo a este
cromatógrafo de iones extraídos. Para todos los datos
diferentes a MS, el algoritmo de detección puede
establecerse en la página de la pestaña Detection del
Processing Method.

CREACIÓN DE UN NUEVO CONJUNTO COBRA DE PARÁMETROS


DE DETECCIÓN.
Esta sección proporciona información sobre cómo configurar un
nuevo método de procesamiento y utilizar el Cobra™ Wizard
para detectar picos con el fin de determinar los ajustes de
integración iniciales para un cromatógrafo. Para obtener más
información sobre la creación de processing methods, consulte
la sección 2.4.2.
Para crear un nuevo conjunto Cobra de parámetros de
detección, siga estos pasos:
1. Abra la secuencia en el Studio de cromatografía (haciendo
doble clic en la inyección de la Console) y abra la categoría
Data Processing.
2. Seleccione el cromatógrafo haciendo clic en alguna parte en
el área de trazado de cromatógrafos.

Página 26 Guía de inicio rápido


Chromeleon 7

3. Haga clic en la pestaña Processing y active el asistente de


detección de picos Cobra seleccionando Cobra Wizard
en el grupo Detection Parameters (Parámetros de
detección). Se abre el Cobra Wizard.
4. Seleccione el área del cromatógrafo que debe integrarse. Si
la sección seleccionada contiene picos negativos (por
ejemplo, picos de disolvente), se puede especificar que se
ignoren durante la detección de picos Cobra activando la
casilla Consider Void Peak (Considerar picos nulos). De lo
contrario, deje esta casilla desactivada. Haga clic en Next.
5. Elija una de las siguientes posibilidades para definir un
rango con el fin de determinar el ruido de línea base:
 Seleccione la opción Use Auto Range (Usar rango
automático) (predeterminada), que calcula un rango de
tiempo adecuado.
-O BIEN-
 Introduzca una línea base manualmente.
Haga clic en Next.
6. Realice una de las acciones siguientes para suavizar los
datos cromatográficos:
 Seleccione la opción Use Auto Smoothing Width
(Utilizar ancho de suavizado automático)
(predeterminada) para suavizar los datos
automáticamente.
-O BIEN-
 Seleccione el pico más estrecho del cromatógrafo para
definir el ancho de suavizado Cobra que se utilizará
para la detección de picos.
Haga clic en Next.

Guía de inicio rápido Página 27


Chromeleon 7

7. Elija una de las siguientes posibilidades para definir el


umbral del área de pico que determina el área de pico
mínimo. Cualquier pico cuya área se encuentre por debajo
de dicho umbral se ignorará durante la detección o la
integración:
 Seleccione la opción Use Auto Minimum Area (Utilizar
área mínima automática) (predeterminada), que
calcula automáticamente un área mínima.
-O BIEN-
 Seleccione el pico más pequeño del cromatógrafo que
desea que se detecte (el área mínima se establecerá en
el 90 % del área del pico seleccionado).
Haga clic en Next.
8. Utilice el menú desplegable Channel (Canal) para
seleccionar el canal, y el campo Tipo de inyección para
especificar los datos a los que se aplican los ajustes de
integración. Haga clic en Finish.

9. Haga clic en el icono de Chromeleon y seleccione Save


> Save en el menú para guardar el processing method
actualizado.

El Cobra Wizard determina los mejores ajustes de integración


iniciales para un cromatógrafo. Para cromatógrafos simples,
donde todos los picos están bien resueltos, estos ajustes
resultan ideales. Para cromatógrafos complejos o donde los
picos solo estén resueltos parcialmente, además puede ser
necesaria la adición de otros parámetros de detección.

Página 28 Guía de inicio rápido


Chromeleon 7

MODIFICACIÓN DE UN PROCESSING METHOD EXISTENTE


Inserción de un nuevo parámetro de detección
Para insertar un nuevo parámetro de detección, siga estos
pasos:
1. Haga clic en el trazado de cromatógrafo.
2. Haga clic en la pestaña Processing (Procesamiento).
3. Si no han aparecido, muestre los parámetros de detección
del cromatógrafo, haciendo clic en Detection Parameters
en el grupo Detection Parameters.

4. Haga clic en la flecha del botón Insert (Insertar).


5. Seleccione el parámetro de detección adecuado en la lista.
Se indican aquí los parámetros normalmente más
necesarios.
Si necesita otros parámetros de detección, seleccione Other
Parameter (Otros parámetros). Para obtener una lista y
detalles adicionales sobre todos los parámetros de
detección de Chromeleon, consulte Detection Parameters
(Overview) en la ayuda de Chromeleon.
6. Mueva el cursor a la ubicación del cromatógrafo en la que
desea insertar este parámetro y haga clic en ella.
El nuevo parámetro de detección se coloca en el
cromatógrafo y la integración de picos se actualiza
automáticamente.

Los parámetros de detección tienen una etiqueta que muestra


los detalles del parámetro y una línea discontinua vertical que
muestra el punto exacto del parámetro de detección del
cromatógrafo.

Guía de inicio rápido Página 29


Chromeleon 7

Movimiento, modificación y eliminación de parámetros de


detección
Para mover, modificar y eliminar parámetros de detección, haga
lo siguiente:
1. Haga clic en el trazado de cromatógrafo.
2. Haga clic en la pestaña Processing.
3. Si no han aparecido, muestre los parámetros de detección
del cromatógrafo, haciendo clic en Detection Parameters
en el grupo Detection Parameters.
4. En el grupo Pointer / Zoom (Puntero / Zoom), asegúrese de
haber seleccionado la herramienta Automatic
(Automático).

Para mover un parámetro de detección:


• Arrastre el parámetro de detección a la ubicación deseada
(puede arrastrar un parámetro de detección por su pestaña
o línea).

Para modificar el valor de un parámetro de detección:


• Haga doble clic en la pestaña y seleccione un nuevo ajuste
de la lista.

Para modificar el tipo de un parámetro de detección:


1. Haga clic con el botón derecho en el parámetro de
detección y seleccione Edit Detection Parameter (Editar
parámetro de detección). Se abre el cuadro de diálogo Edit
Cobra Detection Parameter (Editar parámetro de detección
Cobra).

Página 30 Guía de inicio rápido


Chromeleon 7

2. Seleccione un nuevo tipo de parámetro de detección en el


campo Parameter Name (Nombre de parámetro) y
establezca cualquier valor de parámetro necesario.
3. Haga clic en OK (Aceptar) para guardar el cambio y cierre el
cuadro de diálogo Edit Cobra Detection Parameter.

Para eliminar un parámetro de detección:


• Haga clic en el parámetro de detección y seleccione Delete
Detection Parameters (Eliminar parámetros de detección).

Integración de picos no resueltos


Los picos resueltos parcialmente pueden resultar difíciles de
integrar. El asistente de integración SmartPeaks (Picos
inteligentes) le ayuda a integrar estos picos:
1. Haga clic en cualquier parte del trazado de cromatógrafo.
2. Haga clic en la pestaña Processing .
3. En el grupo Detection Parameters, haga clic en SmartPeaks
.
4. Utilice el cursor para arrastrar un rectángulo al
cromatógrafo alrededor del área que contiene los picos
parcialmente resueltos.
Se abre el cuadro de diálogo SmartPeaks: Select
Alternative (Picos inteligentes: seleccionar alternativa)
(Figura 5).

Guía de inicio rápido Página 31


Chromeleon 7

Figura 5: Cuadro de diálogo Smart Peaks – Select alternative

Consejo: Para consultar más opciones, haga clic en la


pestaña Advanced (Avanzado) en el cuadro de diálogo
SmartPeaks: Select Alternative. Para obtener más detalles
sobre cómo utilizar estos ajustes, consulte
SmartPeaks:Select Alternative en la ayuda de Chromeleon.

5. Seleccione el archivo de detección de picos preferido y haga


clic en OK.
6. Los parámetros de detección del método de procesamiento
se actualizan ahora y los nuevos parámetros de detección
se muestran en el cromatógrafo.

2.6.4 Identificación de picos


Una vez detectados e integrados los picos satisfactoriamente, se
pueden utilizar para los informes o cálculos de resultados. Al
generar informes, es útil asignar nombres a los componentes de

Página 32 Guía de inicio rápido


Chromeleon 7

un cromatógrafo. Al realizar la calibración y la cuantificación, es


esencial asignar nombres al menos a los picos de calibración de
un cromatógrafo.
El proceso de asignar un nombre a un componente se llama
identificación. Los nombres y los tiempos de retención
esperados de los componentes con nombre se almacenan en
una component table (tabla de componentes) de Chromeleon.
En las secciones siguientes se describe cómo:
• Crear una tabla de componentes.
• Actualizar los tiempos y las ventanas de retención
esperados.

CREACIÓN DE UNA TABLA DE COMPONENTES


Hay tres formas de crear una tabla de componentes:
• A través del Component Table Wizard (Asistente de tablas
de componentes)
• En el panel del cromatógrafo de forma interactiva
• A través de component table en el processing method

A través del Component Table Wizard


Para crear una tabla de componentes por medio del Component
Table Wizard:
1. Haga clic en el trazado de cromatógrafo.
2. Haga clic en la pestaña Processing.
3. Si no han aparecido, muestre las ventanas de picos del
cromatógrafo, haciendo clic en Peak Windows
(Ventanas de picos) en el grupo Component Table.

Guía de inicio rápido Página 33


Chromeleon 7

4. Haga clic en el botón Component Table Wizard .


Se abre el cuadro de diálogo Component Table Wizard.
El asistente de 5 páginas le guía por el proceso de
asignación de nombres de componentes. En las cuatro
primeras páginas puede especificar si desea mantener los
componentes existentes (añadiendo nuevos componentes a
los ya existentes), el rango de tiempo durante el que desea
considerar componentes y un área mínima por debajo de la
cual se ignoran los componentes. En la página final puede
nombrar todos los componentes encontrados, modificar el
tiempo de retención y la peak window y añadir
comentarios.
5. Haga clic en Finish para guardar las actualizaciones de la
tabla de componentes y cerrar el Component Table Wizard.
La vista del cromatógrafo del área de trabajo del Studio de
cromatografía se actualiza automáticamente para mostrar
nuevas ventanas de componentes.

En el panel del cromatógrafo de forma interactiva


Para añadir un componente del trazado de cromatógrafo:
1. Haga clic en el trazado de cromatógrafo.
2. Haga clic en la pestaña Processing.

3. Active las opciones Peak Windows y Add Component


(Agregar componente) en el grupo Component
Table.
4. Arrastre un rectángulo alrededor del pico que desea
agregar a la tabla de componentes. El pico se agrega a la
tabla de componentes con un nombre genérico (por
ejemplo, Component 1 [Componente 1]) y la ventana de
picos aparece en el trazado de cromatógrafo.

Página 34 Guía de inicio rápido


Chromeleon 7

5. Haga doble clic en la etiqueta de la ventana de pico y


escriba el nombre del componente.

A través de la tabla de componentes (método de


procesamiento)
Para crear la tabla de componentes en el processing method:
1. Haga clic en la pestaña Data Processing Home.
2. En el grupo Panes, haga clic en Processing Method para
mostrar el método de procesamiento.
Consejo: Puede maximizar el espacio de la pantalla
ocultando los otros paneles y ver así solamente el
processing method. En el grupo Panes, desactive los
paneles que no son necesarios actualmente.

3. En el processing method, seleccione la pestaña Component


Table.
4. Haga clic en el enlace Click here to add a new component
(Clic aquí para agregar un nuevo componente) en la parte
inferior de la tabla de componentes.
Se abre el cuadro de diálogo Create new Component (Crear
nuevo componente).
5. Escriba el nombre del componente en el campo Name
(Nombre) y haga clic en Create (Crear).
Se crea un nuevo componente y se muestra en la tabla de
componentes.
6. Actualice el tiempo de retención de componentes y la
ventana de componentes en la columna Ret.Time (Tiempo
de retención) o Window (Ventana) de la tabla de
componentes.

Guía de inicio rápido Página 35


Chromeleon 7

Consejo: Durante un período de tiempo, los tiempos de


retención de picos pueden desviarse de sus valores
esperados. Por tanto, a veces es útil establecer ventanas de
picos anchas en la tabla de componentes. Cuando la
desviación del tiempo de retención de picos es demasiado
grande para su compensación con este método, se puede
utilizar el tiempo de retención de un pico anterior para la
identificación de picos. Para obtener detalles sobre la
corrección de la desviación del tiempo de retención,
consulte Identify Peaks en la ayuda de Chromeleon.

MODIFICACIÓN DEL TIEMPO DE RETENCIÓN Y LAS VENTANAS.


Puede modificar el tiempo de retención y el ancho de la ventana
de picos modificando las propiedades en la tabla de
componentes o arrastrándola en el trazado de cromatógrafo.

2.6.5 Calibración y cuantificación


Para convertir el área por debajo de un pico o la altura del pico
en valores de concentración o cantidades absolutas, es
necesaria una calibración antes del análisis. Los coeficientes de
calibración obtenidos durante la calibración se pueden utilizar
para calcular las cantidades desconocidas.
Esta sección le mostrará los pasos necesarios para realizar una
calibración estándar externa simple (utilizando un estándar de
componente único en varias concentraciones). Chromeleon
admite varios métodos de calibración, incluidos los estándares
internos y la adición estándar. Para obtener información sobre
el uso de estos métodos de calibración, consulte Calibration and
Amount Calculation en la ayuda de Chromeleon.
Para realizar una simple calibración en Chromeleon debe:

Página 36 Guía de inicio rápido


Chromeleon 7

• Especificar qué inyecciones son estándares de calibración.


• Crear niveles de calibración y asignarlos a los estándares de
calibración.
• Introducir la cantidad o concentración de estándares de
calibración.
• Revisar la curva de calibración.

ESPECIFICACIÓN DE QUÉ INYECCIONES SON ESTÁNDARES DE


CALIBRACIÓN
Los estándares de calibración están marcados como tales en la
lista de inyecciones:
1. Haga clic en la categoría Injection List (Lista de inyecciones)
de la ventana Studio de cromatografía de Chromeleon.
2. Para cada inyección de estándar de calibración, haga clic en
el campo Type y seleccione Calibration Standard (Estándar
de calibración) en la lista de tipos.

CREACIÓN Y ASIGNACIÓN DE NIVELES DE CALIBRACIÓN


1. Haga clic en la categoría Injection List de la ventana Studio
de cromatografía de Chromeleon.
2. Haga clic en la celda Level (Nivel) para el primer estándar
de calibración y seleccione Create new level (Crear nuevo
nivel). Se añade el valor 01. Asigne este nivel a todas las
inyecciones de este estándar de calibración.
3. Repita el paso 2 para todos los niveles de calibración.

INTRODUCCIÓN DE CANTIDADES O CONCENTRACIONES DE


ESTÁNDARES DE CALIBRACIÓN
1. Haga clic en la categoría Data processing de la ventana
Studio de cromatografía de Chromeleon.

Guía de inicio rápido Página 37


Chromeleon 7

2. En el grupo Panes de la pestaña Data Processing Home,


haga clic en Processing Method.
3. En el processing method, seleccione la pestaña
Component Table (Figura 6).

Figura 6: Tabla de componentes

4. Introduzca la cantidad estándar para cada nivel del


componente de calibración en la celda apropiada
(Level “01”, Level “02”, etc.).

Las curvas de calibración se actualizan automáticamente al


realizar cambios en los estándares de calibración.

VISUALIZACIÓN DE CURVAS DE CALIBRACIÓN


Puede ver las curvas de calibración (Figura 7) en la categoría
Data Processing del Studio de cromatografía:
1. Haga clic en la categoría Data processing de la ventana
Studio de cromatografía de Chromeleon.
2. Haga clic en la pestaña Data Processing Home.
3. Realice una de las acciones siguientes:
 Seleccione un diseño de área de trabajo preestablecido
que contenga un panel de calibración del grupo Presets
(Valores predeterminados).

Página 38 Guía de inicio rápido


Chromeleon 7

-O BIEN-
 Seleccione Calibration Plot (Trazado de calibración) en
el grupo Panes (Figura 7).

Figura 7: Una curva de calibración

Consejo: Puede ver la curva de calibración de cada


componente de un estándar de varios componentes
haciendo doble clic en el componente en la tabla de
calibración, seleccionando el pico en el cromatógrafo, o
utilizando los botones de pico anterior y
siguiente en el grupo Navigation de la pestaña Data
Processing Home.

2.7 Revisión e informes de resultados


Una vez adquiridos los datos y realizada la calibración, puede
revisar los resultados y generar informes con ellos.
Puede crear plantillas de informes (qué resultados de salida y
otros datos) en cualquier formato y diseño que desee, o bien
utilizar una de las plantillas predeterminadas de Chromeleon.
Esta Guía de inicio rápido proporciona información sobre cómo
utilizar las plantillas predeterminadas solamente; para obtener

Guía de inicio rápido Página 39


Chromeleon 7

información acerca de cómo modificar las plantillas de informes


o crear nuevas plantillas, consulte Designing Reports en la ayuda
de Chromeleon.
Para revisar y crear informes con los resultados, primero debe
asociar una plantilla con la secuencia. Una vez hecho esto
puede:
• Revisar los resultados.
• Imprimir los resultados.
• Exportar un informe.

En Chromeleon, puede crear un electronic report (informe


electrónico) con hojas de cálculo que contengan cromatógrafos,
tablas, cuadros, curvas de calibración y otros instrumentos o
resultados. Estos informes electrónicos se pueden someter a un
proceso de firma electrónica para su aprobación. Para obtener
más información sobre la creación y el uso de informes
electrónicos y la función de firma electrónica, consulte
Electronic Reports en la ayuda de Chromeleon.

2.7.1 Revisión de resultados


Los resultados se pueden revisar haciendo clic en la pestaña
correspondiente del área de trabajo de la plantilla del informe.
Puede navegar por la secuencia de los modos siguientes:
• Utilizando los botones anterior y siguiente del grupo
Navigation de la pestaña Home (Inicio).
• Seleccionando la inyección o el canal que desea ver en el
Navigation Pane.

Página 40 Guía de inicio rápido


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2.7.2 Impresión de resultados


Al imprimir los resultados, puede:
• Imprimir solo la inyección seleccionada actualmente.
• Imprimir la secuencia completa.

Ambos procesos se describen en las siguientes secciones.


Consejo: Con la función autorepeat area (área de repetición
automática), puede crear una plantilla de informe adecuada
para diversos métodos. Esto es independiente de si un
método utiliza un canal de datos o varios, tanto si analiza
solo un compuesto o varios. Chromeleon genera un informe
con los resultados relevantes de manera automática. Para
obtener detalles, consulte Define Autorepeat Areas en la
ayuda de Chromeleon.

IMPRESIÓN DE RESULTADOS PARA UNA SOLA INYECCIÓN


Para imprimir los resultados de la inyección seleccionada
actualmente:
1. Seleccionar la categoría Report Designer (Diseñador de
informes) en el Studio de cromatografía.
2. En el Navigation Pane, seleccione la inyección que desea
imprimir.
3. En el menú Studio, seleccione Print para abrir el cuadro de
diálogo Print.
4. En el cuadro de diálogo Print, seleccionar:
 Aplicar a la inyección actual.
 La printer (impresora) que desea utilizar.
 Las sheets (hojas) que se deben imprimir para la
inyección actual.

Guía de inicio rápido Página 41


Chromeleon 7

Los resultados de la inyección seleccionada se han imprimido.


IMPRESIÓN DE RESULTADOS DE LA SECUENCIA COMPLETA
Para imprimir los resultados de la secuencia completa, siga los
pasos de “Impresión de resultados para una sola inyección”,
pero en el cuadro de diálogo Print:
• Seleccionar Apply to Current Sequence (Aplicar a la
secuencia actual).
• Al seleccionar las hojas que se deben imprimir, puede hacer
clic en la flecha hacia abajo de la columna Condition
(Condición) para aplicar las condiciones de impresión de la
hoja seleccionada.

Consejo: Para imprimir varias inyecciones de una secuencia,


seleccione primero la fila o filas de las inyecciones que
desea imprimir, haga clic con el botón derecho en ellas y, a
continuación, haga clic en Print.

2.8 Espectrometría de masas (MS) en


Chromeleon
El control de instrumentos de MS y la visualización de datos /
soporte de procesamiento se proporcionan a partir de
Chromeleon 7.2. Muchas de las funciones que se pueden utilizar
para análisis de LC, IC y GC, se pueden utilizar también para
análisis de MS. En esta sección se describen las características
exclusivas de MS.

Página 42 Guía de inicio rápido


Chromeleon 7

2.8.1 Control de instrumentos de MS


El control de instrumentos directo se realiza a través del
controlador de MS y el programa externo proporcionado con el
hardware de MS. Consulte el manual de usuario incluido con su
modelo MS específico para obtener instrucciones sobre cómo
utilizar el programa externo.

CREACIÓN DE UN MS INSTRUMENT METHOD (MÉTODO DE


INSTRUMENTO MS)
Consulte el manual de usuario incluido con su hardware
específico.

2.8.2 Obtención de datos con un instrumento MS


La obtención de datos con MS después de crear un método de
instrumento de MS es idéntica a la obtención de datos con
configuraciones de instrumentos que no son de MS. Consulte la
sección 2.5 para obtener más detalles.

2.8.3 Visualización de datos de MS


La visualización de datos de MS se puede llevar a cabo con el
trazado espectral independiente o dependiente del trazado de
cromatógrafo. En esta sección se describen las funciones
básicas.

TRAZADO DE MS
El trazado de MS se puede activar haciendo clic en el botón
del grupo Panes de la pestaña Data Processing
Home (Figura 8).

Guía de inicio rápido Página 43


Chromeleon 7

Figura 8: Trazado de espectros de masas

Para mostrar los espectros, el usuario debe seleccionar uno de


los elementos siguientes:
• Un pico del cromatógrafo
• Un componente del Panel de navegación
-O BIEN-
• Un punto de datos que utilice la Time Spectra Tool
(Herramienta de espectros temporales) en la categoría Data
Processing, pestaña Layout (Diseño), grupo Peak Purity
(Pureza de pico).

Plot Mode (Modo de trazado): Los datos MS se pueden obtener


en el modo de perfil (continuo) o centroide (discreto). Los datos
del perfil se pueden convertir a formato centroide mediante
algoritmos, pero la conversión no es posible a la inversa.
Seleccione un trazado de espectros de masas para visualizar la
cinta Spectral Plot Tools (Herramientas de trazado de
espectros). A continuación, haga clic en la pestaña Diseño. Para
ver datos en modo centroide, haga clic en el botón de opción
Centroid (Centroide) en el grupo Plot Mode (Modo de trazado)
o Automatic (Automático) para ver todos los datos tal como se
obtuvieron originalmente.

Página 44 Guía de inicio rápido


Chromeleon 7

Overlays (Superposiciones): Para ver los espectros


complementarios, haga clic en , o
, en el grupo Overlays. El grupo Overlays es igual a
Plot Mode en la página de la pestaña Layout de la cinta Spectral
Plot Tools. Haga clic en Reference (Referencia) para ver
opciones adicionales con el fin de seleccionar el espectro de
referencia deseado. Algunas de la funciones de superposición,
como Background (Fondo), precisan la definición de ajustes
relevantes en el processing method.
Extracted Ion Chromatogram (XIC) (Cromatógrafo de iones
extraídos): Cuando se obtienen datos de MS cromatográficos,
esto se muestra como Total Ion Chromatogram (TIC)
(Cromatógrafo de iones totales), que se crea sumando todos los
picos de masa por cada punto de datos. Con el fin de aumentar
la especificidad de un componente y reducir el ruido de fondo,
se crea un XIC.
Un XIC se puede crear de dos formas:
• Haciendo clic en un pico de masa en el espectro de masas
cuando aparece el cursor .
-O BIEN-
• Haciendo clic con el botón derecho en un pico de masa en
el espectro de masas y seleccionando Extract Ion
Chromatogram… en el menú contextual. Se abre el cuadro
de diálogo Extract MS Channel (Figura 9).

Guía de inicio rápido Página 45


Chromeleon 7

Figura 9: Cuadro de diálogo Extract MS Channel.

Ambas acciones tienen como resultado un nuevo canal


cromatográfico que se crea a partir de la relación masa-carga o
el rango seleccionado.

2.8.4 Procesamiento de datos de MS


(Processing Method)
Los principios básicos del procesamiento de datos de MS son
similares a los del procesamiento de los datos que no son de
MS. Las diferencias para la MS se tratan en esta sección.
Consulte la sección 2.6 para obtener información general sobre
el procesamiento de datos.
Con el fin de mostrar los ajustes del procesamiento de datos de
MS, haga clic en la pestaña Processing Method de la categoría
Data Processing y seleccione el diseño All Settings (Todos los
ajustes) en el grupo Layout (Figura 10).

Página 46 Guía de inicio rápido


Chromeleon 7

Figura 10: Selección de All Settings en el grupo Layout

ALGORITMOS DE DETECCIÓN DE PICOS DE MS


Además de los algoritmos Cobra y Chromeleon 6, se presentan
dos algoritmos nuevos; Genesis e ICIS:
• Genesis: Este algoritmo se utiliza generalmente para el
procesamiento de datos con línea base con ruido, como los
datos de exploración completa de MS. En algunos casos, el
algoritmo se puede usar también con datos que no son de
MS. Dichos datos incluyen, entre otros, UV, CD y ED.
• ICIS: Se recomienda este algoritmo cuando se trata de
datos con muy bajo ruido o abstraídos como los que se
obtienen en los modos SIM o SRM, o bien extraídos
después de la obtención, como XIC.

PESTAÑA MS DETECTION (DETECCIÓN DE MS)


En esta página de pestaña, en el processing method, puede
definir los ajustes de detección de MS predeterminados o los
ajustes de detección por componentes. En el menú desplegable
Extracted Ion Chromatogram, todos los componentes marcados
con utilizan ajustes de detección específicos de ese
componente. Todos los demás componentes utilizan los
parámetros de detección de MS predeterminados.

Guía de inicio rápido Página 47


Chromeleon 7

Al seleccionar los algoritmos ICIS y Genesis por primera vez,


todos los parámetros están completados con los valores
predeterminados recomendados.

PESTAÑA MS COMPONENT TABLE


Con el fin de procesar y cuantificar los componentes mediante
XIC a partir de datos de MS, debe definir un canal especial para
los componentes deseados.
En la columna Channel de la tabla de componentes, todos los
componentes que se cuantifican mediante un XIC deben
establecerse en MS Quantitation (Cuantificación de MS) a
través del menú desplegable (Figura 11 y Figura 12).

Figura 11: Selección de MS Quantitation en la tabla de componentes de


MS

Página 48 Guía de inicio rápido


Chromeleon 7

Figura 12: Canal de cuantificación de MS

PROPIEDADES DE TABLA DE COMPONENTES –


CROMATÓGRAFOS DE IONES EXTRAÍDOS
1. Seleccione un componente resaltando una fila completa en
la tabla de componentes, haga clic en Show Properties
(Mostrar propiedades) para mostrar el cuadro de diálogo
Properties (Propiedades) y, a continuación, seleccione
Extracted Ion Chromatograms en el panel de navegación
de las propiedades (Figura 13).
2. Haga clic en para crear un nuevo Quantitation XIC (XIC
de cuantificación).
Si actualmente no hay ningún XIC definido, se agrega la
página de pestañas MS Quantitation Peak (Pico de
cuantificación de MS). En caso contrario, se crea la página
de pestañas MS Confirming Peak (Pico de confirmación de
MS).
A fin de ayudarle a definir parámetros de detección
adicionales, Chromeleon muestra el espectro de masas en
el tiempo de retención especificado. Tenga en cuenta que
no puede existir ningún espectro de masas en el momento
preciso de retención. En este caso, la página de pestañas
MS Quantitation Peak muestra el espectro más cercano del
tiempo de retención definido en el XIC.

Guía de inicio rápido Página 49


Chromeleon 7

Figura 13: Página de propiedades de cromatógrafos de iones extraídos

3. En el campo Type, realice la selección adecuada:


 TIC – Utilizado normalmente para el procesamiento de
la obtención de experimentos SIM o SRM no
multiplexados.
 Mass Range (Rango de masas) – Se utiliza
normalmente para el procesamiento de los
experimentos de exploración completa.
Nota: Si selecciona TIC, omita los pasos 4 y 5.

Página 50 Guía de inicio rápido


Chromeleon 7

4. (Opcional). Si se han obtenido datos SRM, escriba la masa


en el campo Precursor Mass (Masa de precursor). Si existe
un gran número de filtros de obtención, le ayudará a limitar
los filtros seleccionables solamente a los de interés
(Figura 14).

Figura 14: Filtrado de la lista de exploración mediante la introducción


de la masa de precursor SRM

5. Escriba una masa o un rango de masas de iones de


producto SIM / SRM en el campo XIC Mass(es) or Range(s)
(Masas o rangos XIC). Similar al campo Precursor Mass, este
campo le ayudará a limitar los filtros seleccionables a
solamente los de interés. Asimismo, este campo también
definir qué masas se utilizan para crear el XIC.
6. Seleccione el filtro adecuado en el desplegable del campo
Filter (Filtro). En función de la combinación del Filter y las
Mass(es) o Range(s) de XIC, se crea un XIC de evaluación en
esta IU (Figura 15).

Guía de inicio rápido Página 51


Chromeleon 7

Figura 15: XIC basado en parámetros

(Pasos opcionales para configurar confirming XIC [XIC de


confirmación] para el componente):
7. Haga clic en para crear un nuevo confirming XIC (XIC de
confirmación).
8. Repita los pasos 3 a 6 anteriores para un pico de
confirmación .
9. Haga clic en Enable (Activar) debajo del encabezado de
proporción.
10. Establezca el porcentaje de Target Ratio% (área de pico)
relativo al pico de cuantificación.
11. Seleccione tolerancia Relative (Relativa) o Absolute
(Absoluta) para el Target Ratio Window Type (Tipo de
ventana de proporción objetivo).
12. Establezca el porcentaje de la Window (Ventana) de
tolerancia.
Si la target ratio (proporción objetivo) se establece en 50 %
y Window en 10 %, las proporciones de área de pico
siguientes tendrán como resultado un componente
confirmado:
Absolute: 40–60 %
Relative: 45–55 %
13. Establezca la tolerancia absoluta en minutos para el pico de
confirmación del campo Ion Coelution (Coelución de iones).

Página 52 Guía de inicio rápido


Chromeleon 7

Tras la finalización de estos pasos, combinados con los pasos


descritos en la sección 2.6, será posible revisar e informar sobre
los datos resultantes. Para obtener más información, consulte
Extracted Ion Chromatograms en la ayuda de Chromeleon.

Guía de inicio rápido Página 53


Chromeleon 7

3. Apéndice: Descripción general de


Chromeleon

3.1 Introducción
Chromeleon es un sistema de datos de cromatografía que le
permite controlar los instrumentos de cromatografía y evaluar,
procesar los datos, así como crear informes y copias de
seguridad de los mismos.
Chromeleon cuenta con varios componentes de software:
• Instrument Controller Service: El Instrument Controller
Service administra las comunicaciones con los
instrumentos, así como la obtención de datos de los
mismos.
• Client: El Chromeleon Client (Cliente Chromeleon)
proporciona la interfaz de usuario para todas las tareas
relacionadas con el funcionamiento del instrumento, el
análisis de datos y la administración de datos.
• Services Manager: Muestra el estado del Instrument
Controller Service y proporciona una interfaz de usuario
para controlarlo. También se muestra el estado de todos los
demás servicios de Chromeleon.
• Instrument Configuration Manager (Administrador de
configuración de instrumentos): Permite la configuración de
los instrumentos conectados al PC controlador del
instrumento.
• Administration Console: Punto de acceso central para
tareas administrativas, como:

Página 54 Guía de inicio rápido


Chromeleon 7

 License Manager (Administrador de licencias):


Proporciona herramientas para la administración de
licencias para estaciones y usuarios de Chromeleon.
 Scheduler (Programador): Proporciona herramientas
para programar la transferencia de datos.
 User Database (Base de datos de usuarios):
Proporciona herramientas para administrar políticas
del sistema, usuarios y roles, privilegios de acceso y
privilegios operativos.
 Global Policies (Políticas globales): Proporciona ajustes
para las políticas globales de Chromeleon.
 Discovery (Descubrimiento): Repositorio central que
contiene información sobre los instrumentos
disponibles y los repositorios de datos.
 Local Machine(Máquina local): Proporciona
herramientas para administrar repositorios de datos
locales de Chromeleon 7 (Create, Mount and
Dismount) (Crear, Montar y Desmontar) y orígenes de
datos de Chromeleon 6 (Mount and Dismount) (Montar
y Desmontar), y le permite cambiar el Chromeleon
Domain Controller (Controlador de dominio de
Chromeleon).

3.2 Instrument Controller Service


El Chromeleon Instrument Controller Service administra los
procesos de los instrumentos en tiempo real (comunicaciones,
control y obtención de datos). Se ejecuta en segundo plano
como un servicio de Windows en los PC a los que los
instrumentos están conectados físicamente. Su estado se

Guía de inicio rápido Página 55


Chromeleon 7

representa mediante el icono en el área de notificación


de la barra de tareas de Windows:
Puede añadir, configurar o eliminar instrumentos y módulos,
realizar conexiones a los instrumentos y realizar un seguimiento
de los cambios aplicados a los instrumentos en el Instrument
Configuration Manager.

3.3 Chromeleon Client


El Chromeleon Client (Cliente de Chromeleon) proporciona la
interfaz de usuario para todas las tareas relacionadas con el
funcionamiento del instrumento, el análisis de datos y la
administración de datos.
El Client de Chromeleon consta de dos ventanas:
• Consolede Chromeleon: La ventana principal de
Chromeleon en la que puede controlar los instrumentos,
explorar todos los datos y utilizar o administrar eWorkflows
(flujos de trabajo electrónicos).
• Studio: Se abre una ventana independiente desde la
Console, en la que puede trabajar con datos y objetos
relacionados con una secuencia seleccionada. Aquí puede
ver y optimizar todos los aspectos de los datos, modificar
los métodos de los instrumentos y los métodos de
procesamiento, definir y generar informes y administrar
bibliotecas de espectros.

Página 56 Guía de inicio rápido


Chromeleon 7

3.3.1 Chromeleon Console


Al iniciar Chromeleon 7, la ventana Console es la primera que
aparece. La ventana Console consta de cinco partes importantes
(Figura 16).

barra de control
Navigation Pane de secuencias
área de trabajo

Figura 16: Consola de Chromeleon


barras de barra de estado
categorías

• Barras de categorías: Utilice las barras de categorías para


alternar entre las tres categorías: Instruments, Data y
eWorkflows (Figura 17).

Guía de inicio rápido Página 57


Chromeleon 7

Figura 17: Barras de categorías

• Navigation Pane: Permite navegar por los objetos


relacionados con la categoría seleccionada. El Navigation
Pane cuenta con un filtro de nivel superior que le permite
controlar qué instrumentos, data vaults (Repositorios de
datos) o eWorkflows, se muestran:
 Locals (Locales): Los elementos disponibles en la
estación de trabajo local de Chromeleon
 All (Todos): Los elementos disponibles en el dominio
de Chromeleon
 Favorites (Favoritos): Filtro para la visualización de
artículos de uso común
 Custom (Personalizado): Filtro basado en la
introducción de texto

• Área de trabajo: Esta área muestra el contenido de los


objetos seleccionados en el Navigation Pane. En ella
puede trabajar en objetos de Chromeleon.
• Barra de control de secuencias: Esta barra, situada encima
de la lista de inyecciones, indica el estado de la secuencia
(New, Running, Complete, Interrupted e Incomplete [En
ejecución, Completada, Interrumpida e Incompleta]) y
puede utilizarse para iniciar y detener una secuencia. Solo
está disponible al seleccionar una secuencia en el Navigation
Pane.

Página 58 Guía de inicio rápido


Chromeleon 7

Nota: Cuando se configura una secuencia para la firma


electrónica, hay disponibles estados adicionales.

• Barra de estado: La barra de estado muestra


información general, como el usuario conectado
actualmente.

INSTRUMENTS (INSTRUMENTOS)
La categoría Instruments proporciona acceso a todos los
instrumentos de la red (esto podría estar limitado por los
privilegios del usuario).
Cuando se selecciona la categoría Instruments, los instrumentos
configurados se muestran en el Navigation Pane. El área de
trabajo proporciona detalles sobre el instrumento seleccionado
en el Navigation Pane.
En el área de trabajo puede revisar el estado del instrumento y
realizar cambios en los parámetros del mismo. En la parte
superior del área de trabajo se muestran una serie de pestañas
ePanel (Panel electrónico). Los ePanels se pueden utilizar para
supervisar el funcionamiento del instrumento y controlarlo
directamente.
Nota: Al seleccionar un instrumento en el Navigation Pane
que esté desconectado actualmente, aparece un mensaje
en el área de trabajo.

DATA (REPOSITORIO DE DATOS)


La categoría Data proporciona acceso a todos los datos
almacenados en cada data vault conectado ( recipiente de
todos los datos).

Guía de inicio rápido Página 59


Chromeleon 7

Nota: Los orígenes de datos de Chromeleon 6 son


visibles en Chromeleon 7. No es posible hacer cambios en
estos orígenes de datos, pero los datos se pueden copiar de
ellos a los Chromelon 7 data vaults.

El acceso y la organización de los datos pueden realizarse desde


el Navigation Pane. El área de trabajo muestra el contenido del
objeto seleccionado y le permite editar el objeto.
Un data vault puede contener los objetos siguientes:

• Folder: Un recipiente para objetos. Utilice las carpetas


para organizar los datos en un repositorio de datos.
• Sequence: Grupo de inyecciones relacionadas. Una
secuencia típica consta de un instrument y processing
method, una plantilla de informes y un archivo de ajustes
de vista.
• Instrument Method: Conjunto de comandos
temporizados para su ejecución por parte de un
instrumento durante un análisis cromatográfico.
• Processing Method: Un conjunto de parámetros
(incluidos parámetros para la calibración y detección de
picos) que se utilizan en la evaluación de los cromatógrafos.

• Report Template: Un archivo que define cómo se


muestran, imprimen o exportan los datos. Una plantilla de
informe también puede contener cálculos. Cuando se aplica
a una secuencia (para ver, imprimir o exportar los
resultados) el resultado se denomina informe.
• Electronic Report (Informe electrónico): Versión
electrónica de los resultados de una secuencia.

Página 60 Guía de inicio rápido


Chromeleon 7

• View Settings (Ajustes de vista): Definición de cómo se


presentan los datos en la pantalla.
• UV Spectral Library (Biblioteca de espectros UV): Un
conjunto de espectros que se utiliza para la identificación
de picos.

• Query (Consulta): Búsqueda de un data vault para


encontrar inyecciones que coincidan con uno o varios
criterios.
• Instrument Audit Trails (Trazas de auditoría de
instrumentos): Registro de los eventos de instrumentos
como configuración del sistema, comandos ejecutados y
mensajes de error.

Una secuencia es un conjunto de inyecciones analizadas y


procesadas juntas en series. Cada inyección está representada
por una fila de la secuencia (las inyecciones duplicadas se
representan con varias filas). Las inyecciones pueden pertenecer
a uno de los siguientes tipos de inyecciones:

• Unknown (Desconocido): Una muestra para la que la


cantidad, la presencia o la ausencia de los componentes
debe determinarse durante el análisis.

• Calibration Standard: Una muestra con concentraciones


conocidas de los componentes. Los estándares de
calibración se utilizan en la creación de curvas de
calibración.

• Check Standard (Estándar de comprobación): Una


muestra con concentraciones conocidas de los
componentes. Los estándares de comprobación se utilizan
para verificar la calibración.

Guía de inicio rápido Página 61


Chromeleon 7

• Blank (Nula): Una inyección que se utiliza para


caracterizar la señal de fondo (línea base) o para garantizar
que no se detectan componentes no deseados. En la
inyecciones “nulas” se puede practicar o no una inyección
real.

• Matrix (Matriz): La matriz de muestra. Las áreas de picos


de la matriz pueden restarse de las áreas de picos
correspondientes en las demás inyecciones de la secuencia.

• Unspiked (No enriquecida): Una muestra desconocida


que se analiza con el método Standard Addition (Adición
estándar).

• Spiked (Enriquecida): Una muestra desconocida que se


analiza con el método Standard Addition, con la adición de
cantidades conocidas de componentes.

eWORKFLOWS
Los eWorkflows son procedimientos electrónicos para
automatizar los procesos de laboratorio relacionados con un
análisis cromatográfico.
Un eWorkflow contiene un conjunto de plantillas (como
métodos de instrumentos, ajustes de vista o plantillas de
informes) y un conjunto de reglas. Las reglas permiten definir,
por ejemplo, el diseño de la secuencia (como el número máximo
de inyecciones Unknown permitidas entre Calibration
Standards) y la lista de instrumentos de la red adecuados para el
análisis. Cuando inicia un eWorkflow, se crea una secuencia con
archivos asociados predefinidos y una estructura bien definida.
La lista de eWorkflows disponibles está visible en el Navigation
Pane. En el área de trabajo, se ofrece una vista general de los
instrumentos (incluyendo su estado) que se pueden utilizar con
el eWorkflow seleccionado. Desde la misma, puede ejecutar un

Página 62 Guía de inicio rápido


Chromeleon 7

eWorkflow y recibir instrucciones para crear una secuencia


adecuada.

3.3.2 Chromatography Studio


En Chromatography Studio puede editar todos los objetos
relacionados con la secuencia seleccionada:
• Injection List
• Instrument Methods
• Processing Methods
• View Settings
• Report Templates
• Electronic Reports
• Spectral Libraries

Al abrir una secuencia de la Console, se abre el Studio de


cromatografía (Figura 18).

Guía de inicio rápido Página 63


Chromeleon 7

Nota: Al abrir un objeto fuera del contexto de una


secuencia, solo está disponible la categoría correspondiente
del Studio.

menú Studio

Navigation Pane cinta área de trabajo

Figura 18: Studio de cromatografía

barras de
categorías

La estructura del Studio de cromatografía es similar a la de la


Console de Chromeleon, y consta de las siguientes partes
principales:
• Barras de categorías (Figura 19): Permiten alternar la
visualización entre las seis categorías: Injection List,
Instrument Method, Data Processing, Non-targeted MS

Página 64 Guía de inicio rápido


Chromeleon 7

Processing, Report Designer, Electronic Report y UV


Spectral Library.

Figura 19: Barras de categorías

• Navigation Pane: Área en la que se puede navegar por los


objetos disponibles en la categoría seleccionada.
• Área de trabajo: El contenido varía conforme a la
categoría seleccionada.

Hay dos partes adicionales para la interacción del usuario:


• Cinta: La herramienta de menú de los comandos principales
de Studio. Los comandos se organizan en grupos, que se
aúnan en pestañas. Para reducir el desorden, algunas
pestañas solo se muestran cuando es necesario.
• Menú Studio: Para acceder al menú Studio, haga clic en el
icono de Chromeleon situado en la esquina superior
izquierda de la ventana Chromatography Studio. Desde este
menú, puede acceder a tareas generales como impresión,
exportación y guardado.

Guía de inicio rápido Página 65


Chromeleon 7

INJECTION LIST
Cuando se selecciona la categoría Injection List, puede editar,
imprimir y exportar la lista de inyecciones.
El Navigation Pane proporciona una vista general de todos los
archivos utilizados en la secuencia. El área de trabajo muestra
detalles de cada inyección, como el tipo de muestra (por
ejemplo Estándar de calibración) y el estado de la inyección.

Nota: También puede editar la lista de inyecciones


directamente en la Console. Si una secuencia se abre tanto
en la Console como en el Studio, los cambios realizados en
cualquiera de las ventanas se implementan
automáticamente en la otra, por lo que las copias de la
secuencia permanecen sincronizadas.

INSTRUMENT METHOD
Cuando se selecciona la categoría Instrument Method, puede
editar todos los métodos del instrumento.
El Navigation Pane enumera los métodos del instrumento de la
secuencia y proporciona una vista general de los módulos del
instrumento. El área de trabajo permite editar el método del
instrumento.

DATA PROCESSING
Al seleccionar la categoría Data Processing, puede ver los
resultados de cromatografía y espectrometría de masas, editar
el processing method e integrar los cromatógrafos
manualmente.

Página 66 Guía de inicio rápido


Chromeleon 7

El Navigation Pane proporciona una vista general de todas las


inyecciones, los canales, métodos de procesamiento y ajustes
de vista utilizados en la secuencia. Los resultados
cromatográficos se muestran en el área de trabajo.

Puede personalizar los paneles mostrados (como


Chromatogram, Interactive Results, Calibration Plot y
Processing Method) en la cinta seleccionando u ocultando cada
panel en el grupo Panes de la pestaña Data Processing Home
(Figura 20).

Figura 20: Selección de paneles en la cinta de Studio

Consejo: El grupo Presets (a la izquierda del grupo Panes de


la pestaña Data Processing Home) ofrece combinaciones de
paneles típicas.

NON-TARGETED MS PROCESSING
En la categoría Non-Targeted MS Processing puede analizar
conjuntos de datos LC-MS de gran complejidad mediante
algoritmos de análisis diferencial sin etiqueta.
El Navigation Pane proporciona acceso a las listas de
inyecciones, canales y bastidores que se pueden seleccionar y
ver en el trazado de bastidor. El área de trabajo contiene el
panel Processing, que incluye:
• Las páginas de pestañas (Setup [Configuración],
Preparation [Preparación], Alignment [Alineación] y
Detection [Detección]) correspondientes a los pasos clave
de la ejecución del procesamiento de MS no objetivo.

Guía de inicio rápido Página 67


Chromeleon 7

• Un Frame Plot que muestra cromatógrafos de iones


reducidos (RICs) de la inyección seleccionada y la inyección
de referencia.
• Una Frame Table (Tabla de bastidores) que muestra todos
los bastidores encontrados en el paso de detección.

REPORT DESIGNER
En la categoría Report Designer, puede ver informes y editar
plantillas de informes.
El Navigation Panemuestra una lista de todos los canales, las
inyecciones y las plantillas de informes disponibles en la
secuencia. En el área de trabajo puede ver y modificar el
informe.

ELECTRONIC REPORT
En la categoría Electronic Report, puede crear y gestionar
informes electrónicos. Es una instantánea de los resultados
capturada electrónicamente.
El Navigation Pane muestra una lista de todas las inyecciones y
hojas disponibles en el propio informe electrónico. El área de
trabajo muestra el informe electrónico o, si no hay informe
electrónico disponible, la opción de generarlo.

UV SPECTRAL LIBRARY
La vista UV Spectral Library del Studio de cromatografía
proporciona herramientas para gestionar y comparar los
espectros extraídos de los datos de campos 3D.

Página 68 Guía de inicio rápido


Chromeleon 7

MENÚS
Se puede acceder a los comandos de Chromeleon 7 Studio a
través de la cinta o del menú Studio. Para acceder al menú
Studio, haga clic en el icono de Chromeleon .

Guía de inicio rápido Página 69


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Índice
Administrador de repositorios de Instrument Configuration Manager,
datos, 55 54
Administration Console, 54 Instrument Controller Service, 55
Área de trabajo, 58, 65 instrument method, 14
Barras de categorías, 57, 64 Instrument Method, 60, 66
Blank, 62 InstrumentControllerService, 54
calibración, 36 Calibration Instrumento, 9
Standard, 61 Canal de MS, 48 Integración, 25
Check Standard, 61 Inyección desconocida, 61
Cinta, 65 Ion Coelution, 52
Client, 56 License Manager, 55
Cliente, 54 Mass Range, 50
Cobra, 28 Matrix, 62
Cola, 20 Menú Studio, 65, 69
component table, 33 Método de procesamiento, 15, 35
Conectar, 11 Módulo, 11
Console, 9, 56, 57 Navigation Pane, 58, 65
Control de instrumentos de MS, Niveles de calibración, 37
43 Cromatógrafo, 24 Obtención de datos, 43
cuantificación, 36 Panel de navegación, 19
Cuantificación, 48 Parámetros de detección, 26
Curvas de calibración, 38 Pico de confirmación, 52
Data Processing, 66 Picos no resueltos, 31
Data Vault, 59 Plot mode, 44
de cromatografía, 56 Precursor Mass, 51
Detección de picos, 25, 47 Procesamiento de datos, 22
Electronic Report, 60, 68 Processing Method, 46, 60
Espectrometría de masas, 42 Query, 61
Estándar de calibración, 37 Report, 60
eWorkflow, 56, 62 Report Designer, 65, 68
ExtractedIonChromatogram, 45 Revisión de datos, 22, 39
Genesis, 47 Scheduler, 55
ICIS, 47 Secuencia, 13, 60
Identificación de picos, 32 Services Manager, 54
Imprimir, 41 Servicio Discovery, 55
informe, 16 Spectral Library, 61, 68
Informe, 41 Spiked, 62
Informes, 39 Studio, 22, 63
Iniciar, 9 Supervisar, 11, 21
Injection List, 66 Tabla de componentes, 35, 48, 49
Instrument, 59 Target Ratio, 52

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TIC, 50 User Manager, 55
Tiempo de retención, 36 Visualización de datos de MS, 43
Tipos de inyecciones, 61 XIC, 45
Trazado de MS, 43
Unspiked, 62

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