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Rommel Granja
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Enzimas
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Enzimas
• SON Proteínas que se comportan como
catalizadores a excepción de las ribozimas
• CARACTERISITCA aceleran la velocidad de las
reacciones
• COMO LO HACEN Disminuyen la energía que
requiere la reacción para poder ser realizada = Ea.
Energía de activación
• ACTUA sobre usa molécula específica denominada
sustrato que será convertido en producto de interés
• La enzima No sufre ningún cambio durante la
reacción que participa
DEFINICIONES
• Velocidad de reacción : Es la cantidad de
producto formado por unidad de tiempo
• Energia de activacion Es la minima cantidad
de energia que se necesita para iniciar una
reaccion quimica
• Sustrato: Es la molecula sobre la cual actua la
enzima para formar productos
• Sitio activo Es la zona de la enzima en la cual
se une el sustrato, para que se produzca la
reaccion
Enzimas
• Apoenzima Es la parte proteica de la enzima, sin
cofactores o grupos prostéticos. Es catalíticamente
inactivo.
• Cofactor. Pequeñas moléculas orgánicas o
inorgánicas, que requiere la apoenzima para ser
activa
• Grupo prostético. Es similar al cofactor, pero esta
fuertemente unido al apoenzima
• Holoenzima Es la enzima activa. Formada por la
adición de cofactores o grupos prostéticos a la
apoenzima
Enzima
Apoenzima
Holoenzima
Cofactor Disociable: coenzima o
cosustrato
No disociable: grupo
prostético.
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VITAMINAS
Enzimas
• Las enzimas catalizan la reacción bajando la energía
requerida para pasar de sustrato a producto.
Enzimas
Enzimas como catalizadores
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Lehninger, A. (2009). Principios de Bioquímica. Barcelona, España:
Omega
Triosa fosfato isomerasa
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Triosa fosfato isomerasa
15
Triosa fosfato isomerasa
16
Triosa fosfato isomerasa
His95
Glu165 17
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Triosa fosfato isomerasa
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PDB: 3UWU
Factores que afectan la actividad
enzimática
• Temperatura
T óptima = T en la que se obtiene la máxima actividad
enzimática
T óptima en humanos = 37 ºC – 37,5ºC
Factores que afectan la actividad
enzimática
• pH
• Concentración del
sustrato
Enzimas - Inhibidores
• INHIBICIÓN REVERSIBLE -
COMPETITIVA
El inhibidor es una molécula
que presenta un cierto
parecido estructural con el
sustrato de manera que
puede competir con él por
acceder al centro activo
complejo enzima-inhibidor
Enzimas - Inhibidores
• Inhibidores: Reducen o detiene actividad catalítica de
la enzima, bloqueando o distorsionando el sitio activo.
• Inhibición irreversible: inhibidores se combinan de
modo permanente con el enzima uniéndose
covalentemente a algún grupo funcional esencial para la
catálisis con lo que el enzima queda inactivado
irreversiblemente
• Inhibición reversible: Los inhibidores reversibles se
combinan transitoriamente con el enzima, de manera
parecida a como lo hacen los propios sustratos. Algunos
inhibidores reversibles no se combinan con el enzima
libre sino con el complejo enzima-sustrato.
"(...) Desgraciadamente, estas descripciones de las clases de enzimas se
solapan y muchos son dominados por dos o más nombres. La succinil -
CoA sintetasa, por ejemplo, es conocida también como succinato
tioquinasa; el enzima es una sintetasa en el ciclo del ácido cítrico y una
quina cuando actúa en la dirección de la síntesis de succinil - CoA. Esto
origina una nueva fuente de confusión en la nomenclatura de los enzimas.
Una enzima puede haber sido descubierto gracias a un ensayo enzimático
en el que, por ejemplo, A se convierte en B. El enzima recibe entonces un
nombre por dicha reacción. Sin embargo, se puede llegar a demostrar en
trabajos posteriores que en la célula el enzima actúa mayoritariamente
convirtiendo B en A. Normalmente continúa utilizándose el nombre inicial
aun cuando el papel metabólico del enzima estaría mejor descrito si lo
llamáramos en virtud de la reacción opuesta. (...) Comités internacionales
han hecho esfuerzos heroicos para sistematizar la nomenclatura
enzimática, pero algunos nombres sistemáticos han demostrado ser
demasiado largos, de difícil manejo y de uso no muy frecuente (...).
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Lehninger, A. (2009). Principios de Bioquímica. Barcelona, España:
Omega
CLASIFICACION - ENZIMAS
• Primer número = mecanismo de acción.
• Hay 6 grandes clases de enzimas:
– EC1: oxidorreductasas
– EC2: transferasas
– EC3: hidrolasas
– EC4: liasas
– EC5: isomerasas
– EC6: ligasas http://www.brenda-
enzymes.org/ 26
CLASIFICACION - ENZIMAS
4. Liasas
C3H7O6P.
CLASIFICACION - ENZIMAS
6. Ligasas
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Actividad enzimática
• Entonces:
dp ds
act v = =−
dt dt
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Actividad enzimática
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46
Actividad enzimática
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Actividad enzimática
• Se “normaliza” la medición.
• La velocidad de reacción es siempre la
velocidad inicial:
dp ds
act vt →0 = = −
dt t →0 dt t →0
Requiere detener la
No requiere detener la
reacción a un tiempo
reacción
específico
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Actividad enzimática
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Actividad enzimática
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Actividad enzimática
V
Velocidad de la reacción (v)
𝑉𝑚𝑎𝑥 ⋅ 𝑠
𝑣=
V/2 𝐾𝑀 + 𝑠
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Significado de K
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Significado de V=k3e
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En la conversión de sacarosa en glucosa y fructosa mediante la
enzima invertasa, se ha obtenido el resultado que muestra la
tabla:
Tiempo (min) Glucosa (g/L)
0 0
1 0,084
1,5 0,119
2,0 0,152
2,5 0,198
3,0 0,238
5,0 0,415
8,0 0,661
10 0,895
15 1,251
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1400
1200
t (min) g (mM) 1000
0 0 800
2 150 600
4 307 400
y = 19.655x + 321.41
6 461 200 R² = 0.6633
8 597 0
0 20 40 60
12 912
18 942
26 976 1000
36 999 800
48 1015
600
400
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Inhibición enzimática
e i d
E+ I
⎯→ EI
• Si el proceso no fuese reversible se habla de inactivación.
V s VAP s
v= Inhibición v=
K +s K AP + s
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Inhibición enzimática
• Competitivo: K AP = f (i)
VAP = V
afecta la afinidad
• No competitivo: K AP = K
VAP = f (i)
afecta la reactividad
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Inhibición Mixta
𝐾𝐼 = 𝐾𝐼 ′ 𝐾 = 𝐾′
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Inhibición acompetitiva
Inhibición acompetitiva
𝑉𝑚𝑎𝑥
𝑖 𝑠 Inhibición no competitiva
1+
𝐾𝐼 ′ 𝑉𝑚𝑎𝑥
𝑣= 𝑖 𝑠
𝐾𝑀 1+
𝑖 +𝑠 𝑣=
𝐾𝐼
1+ 𝐾𝑀 + 𝑠
𝐾𝐼 ′
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Inhibición por sustrato
• La inhibición se da por el mismo sustrato, cuando
éste se halla a elevadas concentraciones.
𝑉𝑚𝑎𝑥 ∙ 𝑠
𝑣=
𝑠2
𝐾𝑀 + 𝑠 +
𝐾′
𝑠 ∗= 𝐾𝑀 ⋅ 𝐾′
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En un cultivo de bacterias, la velocidad de reacción de un
enzima E fue de 20 μg/min para una concentración de
sustrato de 3 mM. Si la concentración de sustrato es igual o
superior a 7 mM, la velocidad no supera los 40 μg/min. Al
añadir un inhibidor competitivo, la velocidad de la reacción
fue de 20 μg/min para una concentración de sustrato de 8
mM. Calculese la Km, la Vmax y la Ki para este enzima,
sabiendo que la concentración de inhibidor añadido es de 6
mM.
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1. Habiéndose conseguido aislar de Salmonella tyfpimurium una
enzima que cataliza la reacción A→P, se decidió hacer un estudio
estructural y cinético de dicha enzima:
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Inmovilización de enzimas
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Dumitriu, S. & Chornet, E. (1998). Inclusion and release of proteins
from polysaccharide-based polyion complexes. Advanced Drug
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Delivery Reviews, Volume 31, Issue 3, 4 May 1998, Pages 223-246
Enzimas inmovilizadas
✓ Eficiencia de uso
✓ Flexibilidad operacional
✓ Control de reacción
✓ Pureza del producto
✓ Costo fabricación X
E. inmovilizadas E. agregadas
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Soporte de inmovilización
✓ alta razón
✓regenerabilidad
superficie/volumen
✓ flexibilidad
✓ alta capacidad de
unión de proteína ✓ compatibilidad
✓ hidrofilicidad ✓ disponibilidad
✓ insolubilidad ✓ bajo costo
✓ estabilidad
✓ rigidez
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Enzimas inmovilizadas
O
Grupos aldehído Grupos ε-amino
(soporte activado)
C
H + NH2
lisinas
pH 10
CH N C N
Reducción
Estabilización de la enzima
por unión covalente multipuntual
A través de:
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Enzimas inmovilizadas
CLEA
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A
PEG Glutaraldehído
PEG Glutaraldehído
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Ingeniería de enzimas
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Ingeniería de enzimas
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Exposiciones enzimas en industria alimentaria
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