doi: 10.14720 / aas.2020.115.1.

1 Artículo original de investigación / izvirni znanstveni Článek

Evaluación de la diversidad genética de las especies ovinas nativa turcos y argelinos

Abdelkader AMEUR AMEUR 1, 2, Onur Yilmaz 3, Nezih ATA 3, Ibrahim CEMAL 3, Semir Bechir Suheil GAOUAR 1

Recibido 18 de julio 2019; aceptado el 27 de diciembre de 2019. Delo je

prispelo 18. julija 2019, sprejeto 27. decembra 2019.

Evaluación de la diversidad genética de las especies ovinas tivos turcos y argelinos Pregled genetske pestrosti turskih en alžirskih avtohotnih po- pulacij OVAC
na-
Resumen: En Argelia y Turquía, los sistemas de producción ovina se basan Izvleček: Sistemi REJE v OVAC Alžiriji en Turčiji temeljijo na ekstenzivni
en las condiciones rurales bajo extensos y su gestión genética ha dado lugar a un Kmecki reji, upravljanje s temi populacijami pa je privedlo hacer povečanja
aumento de la homocigosis y por lo tanto la pérdida de productividad. La homozigotnosti en s tem hacer poslab- Sanja proizvodnih lastnosti. Ocena
identificación de entrecruzarse y se reproducen dentro de la diversidad genética medpasemske en znotraj- pasemske Genske pestrosti IGRA ključno vlogo pri
juega un papel clave en el ing shap- de los programas de conservación y oblikovanju programov za ohranjanje teh PASEM. Pričujoča Studija je bila
reproducción. El presente estudio se realizó para investigar la diversidad genética de izvedena z namenom raziskovanja Genske pestrosti avtohto- NIH PASEM
las especies ovinas autóctonas criadas en Turquía y Argelia. Un total de 240 ani- OVAC v Turčiji en v Alžiriji. Skupno 240 živali štirih alžirskih (Hamra, ouled
mals de cuatro Argelia (Hamra, Ouled Djellal, Sidaou y Tazegzawt) y cuatro (blanco
Djellal, sidaou en tazegzawt) en turskih štirih (karaman blanco, Karaman sur,
Karaman, Sur Karaman, Karacabey Merino, y Kivircik) razas de ovinos turcos nativos
Karacabey Merino en Kivircik) PASEM je bilo genotipiziranih s štirinajstimi mi-
se ge- otyped con catorce marcadores microsatélites recomendados por FAO. Se
krosatelitnimi markerji, ki jih priporoča FAO. Na štirinajstih analiziranih
detectaron un total de 340 alelos de catorce marcadores estudiados. Todas las ocho
markerskih lokusih je bilo zabeleženih 340 alelov. Vseh osem PASEM je imelo
razas mostraron moderados a altos nive- les de diversidad genética, con una ligera
zmerno hacer visoko stopnjo Genske pestrosti z rahlo prevlado alžirskih
superioridad de las razas ovinas argelinos. El valor global del FIS fue baja, pero
PASEM OVAC. Skupna vre- dnost FIS je bila Nizka, vendar statistično značilna
altamente significativa ( p < 0,001). Puede haber sido debido a la alta endogamia
( p < 0001). Para je verjetno posledica visokega inbridinga v populaciji. POV
dentro de la población. El coeficiente global media de gen diferenciación (GST)
prečni globalni koeficient diferenciacije genov (GST) je poka- zal, da je približno
mostró que aproximadamente el 94,0% de la variación genética era dentro de la
94,0% Genske pestrosti znotraj populacije. Največ privatnih alelov s
población. Se observó el mayor número de alelos privados con una frecuencia
pogostostjo nad 5% je bilo ugoto- vljenih pri ovcah pasme ouled Djellal. Analiza
superior a 5% en ovejas Ouled Djel- lal. análisis de la estructura de las poblaciones
strukture pobla- lacij je pokazala, da je K, ki predvideva štiri genetske klastre
estudiadas reveló la K más adecuada con cuatro grupos genéticos. Como resultado,
najprimernejši. Dendrograma, ki je rezultat studije, je pokazal, por lo que da
el dendrograma mostró que las razas de ovinos argelinos fueron completa- mente
separadas de las razas de ovinos turcas, además, la agrupación Bayesiano
alžirske pasme OVAC popolnoma ločene desde turskih, poleg tega je pa

revelaron un alto nivel de mezcla, espe- cialmente en las poblaciones de oveja Bayesovo klastriranje pokazalo visoko stopnjo kri- Zanja, v zlasti alžirskih

Argelia. populacijah OVAC.

palabras clave: pequeños rumiantes; razas ovinas autóctonas; diversidad genetica; Ključne besede: drobnica; avtohtone pasme OVAC; ge- ska pestrost;
microsatélite; distancias genéticas mikrosateliti; genetske distancia

1 Universidad de Tlemcen, Departamento de Biología, Laboratorio de Fisiopatología y Bioquímica de la Nutrición, Argelia 2 Autor para correspondencia,
e-mail: ameurabdelkader@gmail.com
3 Adnan Menderes Universidad, Facultad de Agricultura, Departamento de Ciencia Animal, Aydin, Turquía

Acta Agriculturae Slovenica, 115/1, 5-14, Ljubljana 2020

 A. AMEUR AMEUR et al.
1 INTRODUCCIÓN
ovejas nacional ( Ovis aries) ha sido una muy impor- tantes
especies de animales de granja para las personas económicamente y
culturalmente ya que su tiempo de domesticación en todo el mundo
(Ryder de 1983). Argelia y Turquía están dotados de recursos
genéticos de animales de granja di- versos incluyendo las razas de
ovejas que son favorecidos por los diferentes climas y la vegetación
existían, que desde entonces ha generado una oveja muy específica la
práctica de cría. La mayoría de las ovejas pobla- ción de Turquía y
Argelia se compone de usos múltiples nativa producir raza carne, leche
y lana. Según la Agencia de Estadísticas de Turquía, hay 31,2 millones
de cabezas de ovejas distribuidas en veinte razas de ovejas han sido
registradas oficialmente mientras que Argelia tiene una gran población
de ovejas locales con alrededor de 28 millones de cabezas
(FAOSTAT, 2016),
2017).
Turquía tiene una gran diversidad genética que puede ser
carac- terizado por numerosas razas de ovejas se clasifican en
cuatro grupos principales: Fat-cola, cruces-delgadas de cola, y
razas extintas (Yilmaz et al, 2013).. Sur Karaman raza ovina, que es
una de estas razas y, especialmente, criado en las montañas de
Taurus ubicados en la región del Mediterráneo, es una raza de
oveja nativa cola gorda. Se informó de que las pieles de esta raza,
que es muy similar a la raza Karagul, se podrían usar en la
fabricación de pieles interior debido a que tiene un patrón rizado de
vellón (Ertuğrul et al, 2009;. Kiraz et al, 2014).. Blanco Karaman
ovejas raza es la raza más utilizada en el centro de Anatolia en
Turquía para la producción de cordero, con una población de
alrededor de 16.000,000 que representa más del 50% de la cabaña
nacional ovejas (TUIK, 2018).
Figura 1: ubicación geográfica de Argelia y las especies ovinas turcos WK: Blanco Karaman, SK: Sur Karaman, KM: Karacabey Merino, KIV: Kivircik, HR:
Hamra, OD: Ouled Djellal, SD: Sidaou, TG: Tazegzawt
6 Acta Agriculturae Slovenica, 115/1 - 2020
conocidos por su calidad de la carne, lana, y la producción de carne (Öner et
al, 2014;. Yilmaz et al, 2011, Karaca et al., 2009).. Karacabey Merino fue
desarrollado por el cruzamiento de Kivircik y alemán Negro Cabeza de
carnero (Yalcin, 1986).
razas de ovejas domésticas argelinos se clasificaron AC- cording a
muchos métodos diferentes, tales como datos fenotípicos, descripciones
morfológicas y moleculares pasantes a cabo la historia (Chelig, 1992; Djaout
et al, 2017).. La raza Ouled Djellal (blanco raza árabe), que constituye más
de la mitad de la población ovina de Argelia y es ampliamente creció en
Argelia. Esta raza tiene una buena formación con- cuerpo, tiene un alto nivel
de capacidad de adaptación a diferentes condiciones matic CLI- (Chelig,
1992; Djaout et al, 2017).. La raza de ovejas Hamra conocido como Deghma
es una raza de ovejas muy importante para terneza de la carne en Argelia
(Chelig, 1992; Djaout et al, 2017).. La raza Sidaou, conocido como Targuia,
se eleva en el Sahara entre Libia-Níger y parte sur de Argelia con varios más
de un millón de cabeza (Chelig, 1992; Djaout et al, 2017).. Tazegzawt raza
de ovejas que está constituido 0,02% de la población total criado en cabila y
jamón en la región de Mechria (Chelig, 1992; Moulla, 2015;. Djaout et al,
2017). En los últimos años, no sistemática cruzamiento de las prácticas y los
cambios en hábitos de los consumidores han provocado una reducción
cuantitativa de esta raza y rápidamente se enfrenta el riesgo de amenaza de
extinción (Moulla, 2015).
microsatélites autosómicos son un conocido tivo effec- y poderosa
herramienta para investigar la estructura genética y la diversidad han sido
ampliamente utilizados en las especies ovinas, en todo el mundo, para las
especies ovinas turcos (Koban, 2004;. Gutiérrez-Gil et al, 2007 ; Yılmaz y
Karaca, 2012; Yilmaz et al .; 2013; Cemal et al, 2013;.. Yilmaz et al, 2014) y
para las razas de ovinos argelinos (Gaouar et al, 2014;.. Gaouar et al, 2015;
Gaouar et al., 2016A;. Ghernouti et al, 2017;. Ameur Ameur et al, 2018).
 Evaluación de la diversidad genética de las especies ovinas nativa turcos y argelinos

El primer paso para un programa de conservación bien estructurado y
la cría de animales y sostenible es revelar información detallada sobre la
diversidad genética intra e inter-reproducirse. Esta situación indica lo
importante que es para revelar la estructura genética de las razas. El
objetivo del presente estudio fue determinar la diversidad genética y la
estructura de la población de las diferentes razas de ovejas nativa
planteadas en dos países diferentes.
2. MATERIALES Y MÉTODOS
AISLAMIENTO 2.1 DNA MATERIAL Y ANIMAL
Las muestras de sangre se obtuvieron a partir de 240 ovejas, que
consisten en Hamra (30), Ouled Djellal (30), Sidaou (30), Tazegzawt (30)
planteadas en Argelia y blanco Karaman (30), South Karaman (30),
Karacabey Merino ( 30) y ovejas Kivircik (30) razas planteadas en Turquía
(Figura 1).
dispositivo Tometer se utilizó para determinar la calidad y cantidad de
muestras de ADN.
2.3 PCR y el fragmento ANÁLISIS
Catorce marcadores de microsatélites marcados con un colorante
fluorescente (D2, D3, y D4) se utilizaron de acuerdo a la recomendación de
la FAO (2011). Dos grupos multiplex fueron creados de acuerdo con la
longitud de los fragmentos de los microsatélites. protocolos Touchdown
PCR reportados por Hecker y Roux, (1996) se utilizaron para la
amplificación de regiones genómicas específicas (Tabla 1). El volumen total
de la mezcla de amplificación asciende a 25 l. mezcla ficación amplifica
contenía 0,1! M / cada cebador, dNTPs 0,2 mM (Applied Biological
Materials Inc., Canadá), MgCl 2,0 mM 2, 1X tampón de PCR, 1 U de Taq
ADN polimerasa (Applied Materiales Biológicos Inc .. Canadá) y ~ 50 ng de
ADN genómico. La electroforesis capilar se utilizó para la separación de los
fragmentos de PCR marcado con colorante rescent fluo- en el Lyzer ana-
genética Beckman Coulter GeXP (Beckman Coulter. EE.UU. Inc.) Tamaño
DNA ™ .GenomeLab Standard Kit 400 se utilizó para la determinación de
tamaño de fragmento .

AISLAMIENTO 2.2 DNA Y MÉTODO DE TOMA DE MUESTRAS

Las muestras de sangre se obtuvieron de 240 ovejas cabeza. Las

muestras de sangre se recogieron de la vena yugular en tubos que
contenían K3-EDTA como anticoagulante y se almacenaron a -20 ° C hasta
la extracción de ADN. Se extrajo el ADN utilizando la técnica de salting-out
reportado por Miller et al. (1988) y Montgomery y Sise (1990). NanoDrop
2000 (Thermo Scientific, Waltham, MA) espectrofotometría
2.4 Análisis estadístico
Las estadísticas de polimorfismo, como el número de alelos por
locus (Na), número medio de alelos (MNA), número fective EF- de alelos
(Ne), heterocigosidad observada

Tabla 1: condiciones del ciclo térmico de acuerdo con Touchdown PCR

grupo primero
Loci (colorante) multiplex desnaturalización Desnaturalización Recocido Extensión Ciclo extensión final

OarFCB193 (D3) 1 95 ° C (5 95 ° C (40 63-54 ° C (40 72 ° C (60 40 72 ° C (10

min) segundos) segundos) segundos) min)
OarFCB304 (D3)

INRA0023 (D3)

OarCP34 (D4) D5S2

(D4) BM1818 (D4)

BM8125 (D3)

2 95 ° C (5 95 ° C (40 60-50 ° C (40 72 ° C (60 34 72 ° C (10

min) segundos) segundos) segundos) min)
McM0527 (D3)

CSRD0247 (D3)

OarFCB128 (D2)

BM1329 (D2) HSC

(D2) OarJMP29 (D4)

MAF214 (D4)

Acta Agriculturae Slovenica, 115/1 - 2020 7

 A. AMEUR AMEUR et al.

(Ho), heterocigosidad esperada (He), estadístico F de Wright (F ESO, F ES, F S T), Hardy-Weinberg
valor K adecuado se determinó de acuerdo con el valor Delta K calculado por
y análisis de componentes princi- pal (PCoA) se realizó utilizando el
software Genalex (Peakall y Smouse, 2006) se calcularon utilizando
GenAlEx (Peakall y Smouse, 2012). de contenido de información
polimórfica (PIC) y nula alelo frecuencias se calcularon utilizando
CERVUS 3.0.3 (Mar- deberá, 1998). Poblaciones 1.2.32 (Langella, 1999)
y FIGTREE 1.4.2. (Rambout, 2006) software se utilizó para eRate ge-
(NJ) árbol vecino a participar en árbol filogenético BE- razas tween según
la matriz de distancia Da de Nei (Nei et al., 1983). Robustez de la
topología dendrograma se ensayó mediante remuestreo bootstrap (n =
1000). FSTAT software versión 2.9.3 (Goudet, 2001) se utilizó para los
valores Tain obstructivas pertenecen a las estadísticas de diversidad
genética como la diversidad genética de Nei (H T), la diversidad entre razas
(D S T),
y el coeficiente de diferenciación gen (G S T). El análisis de varianza
molecular (AMOVA) se realizó usando el v3.5.2.2 ARLEQUIN
(Excoffier y Lischer, 2010). El software de estructura se utiliza para
analizar la estructura pobla- ción usando frecuencias de los alelos
independientes y un modelo de mezcla (quemadura de 20.000,
seguido de
100.000 iteraciones MCMC con 20 carreras replicados para cada
K) (Pritchard et al., 2000). Se identificó el número apropiado de grupos
usando valores Delta k (k = 2 a 8) que expresa la proporción de
alteración en el logarith- probabilidad mic Pr (X | K) (Evanno et al.,
2005). la mayor parte
el programa ESTRUCTURA harvester (Earl y Vonholdt, 2012). El programa
CLUMPAK reportados por Kopelman et al. (2015) se utilizó para encontrar la
mejor alineación ción de los resultados obtenidos ESTRUCTURA.
3 RESULTADOS
En este estudio, un total de 340 alelos fueron identificados de catorce
microsatélites utilizados en el presente estudio. parámetros estadísticos
genéticos moleculares obtenidos a partir de los catorce microsatélites usados
​se dan en la Tabla 2.
El número de alelos varió de 17 (OarCP34, D5S2) a 32
(CSRD0247), mientras que el número promedio de alelos eficaces era
10,99. valores de heterocigosidad observada (HO) variaron de 0,67
(OarFCB304) a 0,85 (OarCP34). Se encontraron valores de PIC para estar
entre 0,87 y 0,93. F ES
valores que utilizan la piscina gen local como un punto de referencia se
obtuvieron como positivo en trece de catorce atellites microscopía. La F ESO valor
que expresa pérdida general heterocigosidad fue mayor en BM1329
(0.254) locus que el otro. F S T descrito como un indicador de la variación
genética entre individuos dentro de la población se observó variar desde
OarJMP29 (0.041) a BM1329 (0.107) con una media de 0.068. valor medio
de D S T que indica la diversidad genética entre las razas, G S T, que es un
indicador importante de

Tabla 2: parámetros de polimorfismo genético de los catorce loci investigados en razas de ovejas estudiadas

Lugar N Na Ne Él PIC Ho F ES* F ESO* F S T* re S T sol S T HT HWE F (Null)

OarFCB304 237 25 8,22 0,87 0,67 0,88 0,172 *** 0,252 *** 0,096 *** 0,074 0,084 0.88
***
0,134

OarFCB193 239 23 9,17 0,89 0,80 0,89 0,066 ** 0,105 *** 0,042 *** 0,033 0,036 0.89
***
0,053

BM1818 234 28 14,17 0,93 0,83 0,93 0,047 * 0,118 *** 0,075 *** 0,061 0,065 0.93
***
0,059

INRA0132 240 21 11,92 0,91 0,82 0,92 0,052 * 0,113 *** 0,064 *** 0,052 0,056 0.92
***
0,057

OarCP34 239 17 7,68 0,86 0,85 0,87 -0,029 ns 0,027 ns 0,055 *** 0,042 0,049 0.87
***
0,008

D5S2 207 17 8,19 0,87 0,73 0,88 0,109 ** 0,181 *** 0,080 *** 0,061 0,069 0.88
***
0,092

CSRD0247 230 32 13,21 0,92 0,76 0,92 0,120 *** 0,186 *** 0,075 *** 0,062 0,067 0.93
***
0,103

MCM0527 232 20 9,59 0,89 0,68 0,90 0,207 *** 0,252 *** 0,056 *** 0,044 0,049 0.90
***
0,140

BM8125 240 20 12,70 0,92 0,78 0,92 0,094 *** 0,169 *** 0,083 *** 0,068 0,074 0.92
***
0,083

HSC 231 24 14,48 0,93 0,72 0,93 0,191 *** 0,230 *** 0,048 *** 0,039 0,042 0.93
***
0,122

BM1329 237 31 14,13 0,93 0,70 0,93 0,164 *** 0,254 *** 0,107 *** 0,088 0,094 0.93
***
0,137

OarFCB128 240 22 10,22 0,90 0,76 0,90 0,116 *** 0,162 *** 0,052 *** 0,041 0,046 0.90
***
0,086

OarJMP29 240 31 11,20 0,91 0,81 0,91 0,081 *** 0,119 *** 0,041 *** 0,033 0,036 0.91
***
0,058

MAF214 240 29 8,92 0,88 0,77 0,89 0,071 * 0,142 *** 0,076 *** 0,060 0,068 0.89
***
0,077

Media 10,99 0,90 0,76 24,29 0,90 0,104 0,165 0,068 0,054 0,060 0.91

N: Número de individuos con genotipo, Na: número de alelos, Ne: número efectivo de alelos, PIC: contenido de información polimórfica, F ESO, F ES, F S T:
F-estadísticas de Wright, Ho: heterocigosidad observada, He: heterocigosidad esperada, HWE: Hardy-Weinberg, F (Null): null alelo frecuencia, H T: la diversidad genética de Nei, D S T: la diversidad
entre razas, G S T: coeficiente de diferenciación de genes, *: estadísticas de Wright de acuerdo con Weir y jamón Cocker- (1984), *: p < 0,05, **: p < 0,01, ***: p < 0,001

8 Acta Agriculturae Slovenica, 115/1 - 2020

 Evaluación de la diversidad genética de las especies ovinas nativa turcos y argelinos

Tabla 3: parámetros de polimorfismo genético de acuerdo con razas de ovinos turcos y argelinos estudiados a través de 14 loci

heterocigosidad media NPA

Frec. ≥ Frec.
razas MNA Ho (SE) Él (SE) F ES HWE 5% <5% Total

WK 9.93 0,78 (0,040) 0,80 (0,016) 0,047 ns 5 5 3 8

KIV 9.57 0,58 (0,056) 0,81 (0,012) 0,326 *** 9 3 1 4

KM 10.21 0,67 (0,058) 0,76 (0,030) 0,114 *** 11 1 5 6

SK 9.57 0,72 (0,063) 0,74 (0,059) 0,055 ** 2 2 3 5

HORA 14.71 0,84 (0,023) 0,89 (0,006) 0,055 *** 8 1 5 6

sobredosis 17.00 0,83 (0,022) 0,90 (0,005) 0,075 *** 5 - 17 17

Dakota del Sur 13.86 0,82 (0,028) 0,87 (0,010) 0,025 ns 4 1 7 8

TG 15.07 0,83 (0,028) 0,86 (0,014) 0,038 * 7 1 11 12

WK: Blanco Karaman, SK: Sur Karaman, KM: Karacabey Merino, KIV: Kivircik, HR: Hamra, OD: ouled Djellal, SD: Sidaou, TG: Tazegzawt,
MNA: número de alelos , Ho: heterocigosidad observada . Él: heterocigosidad esperada , HWE : número de loci no en el equilibrio de Hardy-Weinberg ( p < 0,05), NPA: alelos privados, dentro de una
raza, F ES: deficiencia de heterocigotos, *: p < 0,05, **: p < 0,01, ***: p < 0,001

la magnitud relativa de diferenciación genética, y H T,
descrito como la diversidad genética total, los valores se encontraron como
0,054, 0,060 y 0,91, respectivamente. loci de microsatélites genotipo en el
presente estudio se ensayaron usando el χ 2
prueba en términos de cumplimiento de HWE. Todo catorce loci
y SK) a 17.00 (OD). El más alto gosity heterocigotos esperado se observó en
OD (0,90) raza de ovejas criadas en Argelia. Todas las razas estudiadas
mostraron F positiva ES valores. A pesar de que un total de 66 alelos privados se
han identificado en todas las razas estudiadas, solamente catorce de ellos
tienen una fre-

Tabla 4: AMOVA de las ocho razas de ovinos genotipo con catorce marcadores de microsatélites

Las fuentes de variación DF SS VC PV (%) FI

entre la población 7 204.88 0,3893 Va 6.71 F IS = 0,092

Entre los individuos dentro de las poblaciones 232 1370.53 0,4964 Vb 8.56 F = ST 0,067

dentro de los individuos 240 1179.50 4,9145 Vc 84.73 F IT = 0,153

Total 479 2754.91 5,800

DF: grado de libertad, SS: Suma de cuadrados, VC: componentes de la varianza, PV: porcentaje de varianza, FI: índice de fijación

mayor cuencia de un 5%. Análisis de varianza molecular (AMOVA), que

es un método para detectar la población diferenciación utilizando
marcadores moleculares, se realizó para detectar la variación genética
entre los individuos y poblacio- nes (Tabla 4).
El número medio de alelos variaron de 9,57 (KIV
Se puso de manifiesto 84.73% de la varianza total se
la Tabla 3.
encuentra dentro de los individuos, mientras que 8,56% entre los
individuos dentro de las poblaciones y

20%. Los resultados de las estadísticas de diversidad genética para cada raza se resumen en
6,71% entre la población. En el análisis PCA (Figura 2) de la
distancia genética del Nei, los dos primeros ejes
representan
frecuen- cia perteneciente a loci de microsatélites utilizado se encontró que estar por debajo de 35,38% y 25,83% de la variabilidad genética total,
respectivamente. La red filogenético de ocho razas de ovejas
(Figura 3) confirma y complementa los resultados del análisis
de componentes principales para 8 poblaciones de ovejas. desviado de la HWE ( p < 0,001). Null alelo
de PCA. Cuatro racimo pertenecientes a ocho razas
estudiadas fue revelado en dendrograma basado en Da dis-

Figura 2: Análisis de componentes principales. Trama de la primera (PC1: eje X) y segundo (PC2: eje Y) tancia de Nei matriz. El primer grupo consistió en WK,

Acta Agriculturae Slovenica, 115/1 - 2020 9

 A. AMEUR AMEUR et al.
0.7
Figura 3: Dendrograma basado en matriz de distancia Da de Nei en razas de ovejas
estudiadas (bootstrap remuestreo metodología (1000 repeticiones)) (WK: Blanco
Karaman, SK: South Karaman, KM: Karacabey Merino, KIV: Kivircik, HR: Hamra, OD:
Ouled djel- lal , SD: Sidaou, TG: Tazegzawt)
SK y KIV, el segundo grupo estaba formado por raza KM ovejas criado en
Turquía, el tercer grupo estaba formado por raza OD ovejas y cuarto grupo
estaba formado por recursos humanos, animales de TG y ovejas SD
muestreados de Argelia.
Los resultados del análisis de la estructura de la población que contiene
diferentes números de agrupación (K = 2-8) y llevan a cabo para determinar la
estructura de la población de las razas estudiadas se da en la Figura 4.
K=2K
=3K=
4K=5
K=6K
=7K=
8
WK SK KIV KM TG OD HR SD
Figura 4: Estimación de la estructura de la población con diferentes valores de K
(WK: Blanco Karaman, SK: South Karaman, KM: Karacabey Merino, KIV: Kivircik,
HR: Hamra, OD: Ouled Djellal, SD: Sidaou, TG: Tazegzawt)
10 Acta Agriculturae Slovenica, 115/1 - 2020
Tabla 5: posterior probabilidades estimadas [Ln Pr (X | K)] para los números DIFERENTES
de racimos inferidos (K) y la estadística Delta K
K Mean LNP (K) Delta K
2 -16.760,605 -
3 -16.232,850 3.7415
4 -16.025,320 6.1730
5 -16.209,625 0.5631
6 -15.647,060 3.9293
7 -15.638,650 2.5657
8 -16.353,680 -
Para presentar el número de clúster adecuado (K) en los resultados del
análisis estruc- tura fueron dados en la Tabla 5.
Los resultados obtenidos a partir del sis ESTRUCTURA aná- fueron
similares a la dendrograma dibujado según la matriz de distancia Da de
Nei (Nei et al., 1983) como se esperaba. Se ve que el número óptimo de
grupos fue 4 Ering consi- el valor de Delta K obtenido por el método
descrito por Evanno et al. (2005).
4. DISCUSIÓN
Hoy en día, la conservación de las especies de animales de granja y la
determinación de la diversidad genética es actualmente en la agenda de los
criadores de animales. En este contexto, las actividades de conservación y
caracterización de la diversidad genética de los recursos genéticos iMAL an- han
vuelto muy importantes fenómenos en todo el mundo. La variación genética
necesaria para la mejora genética de los animales domésticos es un requisito
básico para la cría de animales (Askari et al., 2011).
número medio de alelos y valores de contenido de informa- ción
polimórficas observados en el presente estudio fueron más altos que los valores
obtenidos a partir de las otras razas de ovejas (Yilmaz et al, 2015;.. Guang-Xin
et al, 2016;. Kırıkçı et al,
2018). Esta situación puede considerarse como un indicador importante de la alta
diversidad genética en las poblaciones estudiadas ovejas.
F ES valores, que es una medida de la desviación de las frecuencias
genotípicas de panmixia en poblaciones en términos de deficiencia
heterocigótica o exceso, demostraron que la pérdida de heterozigosidad en un
solo locus de microsatélites (OarCP34). El valor de F en general ES fue baja,
pero altamente significativa ( p < 0,001). Puede haber sido debido a la alta
endogamia dentro de la población. El coeficiente de consanguinidad local (F ES) valores,
que se utiliza la reserva de genes local como el punto de referencia, fue baja
pero altamente significativa ( p < 0,01), excepto OarCP34.
Hallazgos similares se han encontrado en periments ex anteriores,
llevado a cabo en diferentes razas de ovinos (Yilmaz et al., 2015). En general
F S T valor indicó que un moderado
 Evaluación de la diversidad genética de las especies ovinas nativa turcos y argelinos
la deriva genética se produjo en las poblaciones. Se puede decir que esta situación
es un resultado esperado teniendo en cuenta que las poblaciones se crían en
condiciones extensivas y están ed mat- libremente.
El G mundial S T valor mostró que 94,00% de la variación genética
total puede explicarse por diferencias genéticas entre individuos. Puede
aceptarse que el valor de la diversidad genética general (DST) obtenido
a partir del presente estudio fue una indicación de que la variabilidad
inter-población no es alto. Este hallazgo apoya los resultados previ- FST
y GST ormente mencionados.
H global T descrito como valor diversidad genética de Nei fue 0,91, que
era mayor que los valores obtenidos a partir de las especies ovinas nativo
de Argelia (Ameur Ameur et al.,
2018), razas turcas ovejas nativo (Yilmaz et al., 2015) y razas de
Albania ovejas nativo (Hoda y Marsan,
2012) Este hallazgo apoyado los valores de Na y PIC es una indi- cación de que las
cabras tienen una alta diversidad genética de pobla- ciones estudiadas.
El equilibrio de Hardy-Weinberg (HWE), que se indica que el alelo y
genotipo frecuencias en una pobla- ción permanecerá constante de
generación en generación en ausencia de otros mecanismos evolutivos, se
analizó utilizando χ 2 prueba. resultados de las pruebas mostraron que el
alelo distribuciones de todos los loci estudiados se desviaron de
Hardy-Weinberg. Este es un hallazgo esperado debido a los estudios de
selección intensivos realizados en las poblaciones estudiadas durante
largos años.
alelo nulo, que se introdujo por primera vez por Paetkau y Strobeck
(1995), hace que la mala interpretación de los picos satélite micro. Se ha
informado por Dakin y Avise (2004) que nulo alelo frecuencias inferiores a
0,20 no tienen ningún efecto significativo en estudios de genética molecular
realizados con microsatélites. Cuando se examina la hipótesis nula alelo
frecuencias obtenidas, se ve que el alelo nulo valores frecuencia de catorce
microsatélites a ser estudiado están por debajo de 0,20. Tomando en
consideración este valor, se ha demostrado que el locus de trabajo puede ser
utilizado con seguridad en la diversidad genética.
En el presente estudio, los valores calculados MNa perteneciente a
poblaciones de ovinos argelinos estudiados resultaron ser más alta que los
valores indicados en algunos estu- dios en razas nacionales y extranjeros
(Gaouar et al, 2016b;. Loukovitis et al, 2016;. Naqvi et al., 2017), pero los
valores MNa observados en razas de ovinos turcos fueron inferiores a los de
las especies ovinas nativas criado en Túnez (Sassi-Zaidy et al., 2016). Esto
se cree que es debido a la diferencia en el número de microsatélites y
muestreo metodo- gy utilizados en este estudio. valor FIS, definido como el
coeficiente de endogamia, indicó que no hay pérdida de ty heterozygosi- en
las poblaciones. Las desviaciones del equilibrio de Hardy-Weinberg deben
considerarse como una consecuencia natural de las actividades de cría
intensiva de animales que han sido
practicado en las poblaciones de muchos años. Aunque el número de alelos
privados definidos como la fuente de la diversidad lidad genética que tiene una
frecuencia por encima del 5% son limita- das, se puede decir que cuentan con
suficiente eficiencia para identificar las poblaciones estudiadas.
Se ve que la diversidad genética esencial se ized real dentro de los
individuos cuando se examinan los resultados de los análisis de varianza
molecular (AMOVA). Los valores de índice de fijación dan una idea en cuanto
a las diferencias de consanguinidad ciente y de población coef-. Análisis de los
resultados de varianza molecular (AMOVA) señaló que estos ocho razas de
ovejas nativas se pueden diferenciar débilmente. La F S T
valor obtenido a partir del análisis AMOVA era paralela a la G S T valor. Este
hallazgo demuestra que la mayor parte de la diversidad genética es causada
por la diferencia entre los individuos en el presente estudio.
Se observó que había cuatro grupos, cuando se examinó el
dendrograma. Dendrograma, que se mostró la posición de las razas de
ovinos turcos en el presente estudio era diferente de los resultados ob-
CONTENIDAS desde el estudio llevado a cabo en las mismas razas por
Yilmaz et al. (2015). Se sabe que el Karacabey Meri- ninguna raza fue
obtenida por cruzamiento de las razas de ovinos de Kivircik criados en la
región de Mármara y alemán Negro Cabeza de carnero (Sezenler y Özder,
2009). Tiene un gran número de forma local de Kivircik que se adapta a
las diferentes regiones en Turquía (Öner et al., 2014). Kivircik raza de
ovejas que se utiliza como material de origen animal en el material de
estudio se eleva en la región del Egeo. En el contexto de esta información,
es resultado esperado que estas dos razas se llevarán a cabo en
diferentes clusters en el dendrograma obtenido.
resultados de la estructura mostraron un bajo nivel de diferenciación
y un alto nivel de mezcla, especialmente en poblaciones de oveja Argelia. El
valor de Delta K obtenido por el método descrito por Evanno et al. (2005)
muestra que el número óptimo de grupos es de cuatro como en el drogram
den-. Esto reveló que el análisis de estructura y los resultados del
dendrograma se apoyaron mutuamente. Se puede decir que hubo un alto
flujo de genes entre poblaciones de ovinos argelinos cuando se examinan
los resultados obtaoined por el software CLUMPACK.
5. CONCLUSIÓN
ovejas domésticas criadas en todo el mundo, son criados para la carne, la
leche, o la producción de fibra, o poses PUR conservación. prácticas de cruzamiento
no sistemáticas aplicadas para aumentar la capacidad de producción de anima- les
domésticos llevados a cabo por los criadores se encuentran entre los principales
proble- mas de la cría de animales en los países del Norte de África como en
Turquía (Karaca et al., 2009). Este tipo de cables de práctica
Acta Agriculturae Slovenica, 115/1 - 2020 11
 A. AMEUR AMEUR et al.
a una de las principales amenazas como la desaparición de la diversidad
genética local (Herold et al., 2012).
El presente estudio, que se llevó a cabo por primera vez, no se describió
ningún similitudes genéticas entre razas de ovinos Argelia y Turquía. Sin
embargo, los espectáculos de resultados que las poblaciones estudiadas tienen
un bajo nivel de diferenciación y un alto nivel de mezcla. Los resultados
obtenidos de la presente estudio reveló que Argelia y razas de ovinos ish Turk-
tienen una alta variabilidad genética. Mientras que el conocimiento de la
diversidad genética entre las razas es impor- tante, el beneficio de la
comprensión de la variación genética dentro de una población es considerable.
No hay ninguna investigación se centró en dentro y entre las variaciones
genéticas de razas en Argelia y razas de ovinos turcos. Los microsatélites
utilizados en el estudio tienen una potencia de identificación de alta precisión
para la diversidad genética de las razas estudiadas.
En conclusión, el presente estudio ha revelado un importante
conocimiento sobre la diversidad genética y la re- lación entre algunas
razas de ovinos criados en Argelia y Turquía. La información obtenida en
el estudio ha hecho una contribución significativa a la conservación
genética futuro animales y programas de mejoramiento.
6 AGRADECIMIENTOS
Reconocemos la Universidad Adnan Menderes Agro-Biotecnología
culturales y Aplicación de Seguridad Alimentaria y el Centro de Investigación
(ADU-TARBİYOMER) para proporcionar servicios de laboratorio para llevar a
cabo análi- sis genética molecular.
7 CONFLICTO DE INTERESES
Los autores declaran que no tienen ningún conflicto de in- terés.
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