Pruebas bioquímicas:

 Citrato
 Ureasa
 Voges-proskauer
 Rojo de metilo
 Sulfuro indol movilidad (sim)
 Movilida, indol, ornitina (mio)
 Triple azúcar herro (tsi)
 Agar lisina hierro (lia)

Las pruebas de sustrato muestran el estado nutricional, el pH y la CE actual del

sustrato y, por lo tanto, a lo que las raíces de las plantas tienen acceso
inmediato. 

Las Pruebas Bioquímicas se pueden resumir en los siguientes puntos:

 Sustrato (contenido en el medio de cultivo)

 Enzima o vía metabólica (secretada o en el interior del microorganismo)
 Producto
 Revelador y/o indicador (aunque algunas no los emplean)

Ejemplos:

 Hidrólisis del Almidón

 Degradación de la caseína
 Hidrólisis de la lecitina y reducción del telurito
 Licuefacción de la gelatina
 Fermentación de carbohidratos
 Oxidación/Fermentación
 Rojo de Metilo/Voges Proskauer