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Filogenia de los animales y sus implicaciones evolutivas

Artículo    en    Revisión Anual de Ecología Evolución y Sistemática · Noviembre 2014

DOI: 10.1146 / annurev-ecolsys-120213-091627

CITACIONES LEE

163 2737

4 autores:

Dunn Gonzalo Giribet

Universidad de Yale Universidad Harvard

221 PUBLICACIONES     4895 CITACIONES     520 PUBLICACIONES     15935 CITACIONES    

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Gregory D. Edgecombe Andreas Hejnol

Natural History Museum, Londres Universidad de Bergen

333 PUBLICACIONES     10536 CITACIONES     167 PUBLICACIONES     4530 CITACIONES    

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Algunos de los autores de esta publicación también están trabajando en estos proyectos relacionados:

La Genómica Alianza Global de invertebrados (GIGA) Ver Proyecto

La evolución profunda de Ecdysozoa Ver proyecto Casey W

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Filogenia de los animales y sus
implicaciones evolutivas *

Casey W. Dunn, 1 Gonzalo Giribet, 2


Gregory D. Edgecombe, 3 y Andreas Hejnol 4
1 Departamento de Ecología y Biología Evolutiva de la Universidad de Brown, Providence, Rhode Island 02912; correo

electrónico: casey_dunn@brown.edu

2 Museo de Zoología Comparada, Departamento de Organísmica y Biología Evolutiva de la Universidad de Harvard,

Cambridge, Massachusetts 02138; correo electrónico: ggiribet@g.harvard.edu


3 Departamento de Ciencias de la Tierra, el Museo de Historia Natural, Londres SW7 5BD, Reino Unido; correo

electrónico: g.edgecombe@nhm.ac.uk
4 Sars Centro Internacional de Biología Molecular Marina, Universidad de Bergen, 5008 Bergen, Noruega; correo electrónico:

andreas.hejnol@sars.uib.no

Annu. Rev. Ecol. Evol. Syst. 2014. 45: 371-95 Publicado por primera
Palabras clave
vez en línea como una revisión por adelantado el 29 de septiembre
Metazoos, morfología, biología del desarrollo evolutivo, fósiles, anatomía
2014 Revisión Anual de Ecología, Evolución y Sistemática está en línea

en ecolsys.annualreviews.org doi de este artículo:

Resumen

En los últimos años, los científicos han hecho progresos notables reconstruir la filogenia animal.
10.1146 / annurev-ecolsys-120213-091627 Derechos de
Existe un amplio consenso en relación con muchas relaciones profundas animales, incluyendo la
Autor c © 2014 Annual Reviews.
monofilia de los animales, Bilateria, Protostomia, Ecdysozoa y Spiralia. Esta estabilidad permite
Todos los derechos reservados
ahora a los investigadores para articular la disminución del número de preguntas que quedan en
* Este documento ha sido escrito por un empleado del gobierno
términos de fi nida hipótesis bien de alternativas. Estas preguntas restantes incluyen las relaciones
británico como parte de sus deberes de fi ciales y por lo tanto está
sujeto a derechos de autor de la Corona. Reproducido con el permiso en la base del árbol, animal, la posición de xenacoelomorpha, y las relaciones internas de Spiralia.
del controlador de Papelería de Su Majestad fi cina / impresora de la Los recientes avances en el campo de la filogenia animal tiene importantes implicaciones para
Reina de Escocia y el Museo de Historia Natural.
nuestra comprensión de la evolución del desarrollo, morfología, genomas, y otros personajes. Una
notable patrón emerge-hay mucho más homoplasia para todos estos personajes que previamente se
había anticipado, incluso entre muchos caracteres complejos tales como la segmentación y el
sistema nervioso. Las fechas de registro fósil más profundas ramas del árbol de los animales a una
radiación evolutiva en el Cámbrico temprano con raíces a finales de Neoproterozoica.

371
INTRODUCCIÓN

Desde la publicación del árbol de Haeckel (1866) de la vida animal, zoólogos han hecho grandes progresos en la comprensión de las
relaciones evolutivas de los animales. vistas de hoy del árbol de la vida animal son el resultado de décadas de investigación filogenética
intensa, tanto en términos de fi Data- primeros caracteres anatómicos y de desarrollo, y luego, más recientemente, los caracteres de la
evolución de análisis y moleculares. En los últimos años diez, los análisis filogenéticos de los genomas y transcriptomes han jugado un
papel clave en la re fi nir las relaciones de los animales. Aquí presentamos los avances recientes que han llevado a la comunidad
enfoque de consenso en muchas cuestiones fundamentales de la filogenia animal.

animales ( Figura 1, Adicional Figura 1; siga el Material Suplementario desde la página de Inicio Anual en http://www.annualreviews.org
) son un clado de organismos eucarióticos multicelulares caracteriza por varios sinapomorfias ( Tabla 1). Aquí usamos “animales”
como sinónimo de los miembros de metazoos y no en el sentido histórico más amplio que los organismos unicelulares móviles
también incluidos conocen como protozoos. En los últimos años, nuestra comprensión de las relaciones de los animales a otros
eucariotas ha hecho progresos notables ( Figura 1, Tabla 1). Animales, hongos y todos los descendientes de su más reciente
ancestro común forman el clado Opisthokonta (Torruella et al. 2012). Dentro Opisthokonta, los animales se unen con el
unicelulares Ichthyosporea, filasterea y Choano fl agellata para formar el subclade holozoa. WithinHolozoa, animales y choano
agellates fl son grupos hermanas (Torruella et al. 2012).

filogenia animal es interesante en sí mismo y es también fundamentales tomany otros aspectos de la biología animal. El árbol
nos permite hacer comparaciones entre taxones relacionados informadas. Las cuestiones relativas a la evolución de caracteres,
incluyendo la evolución de la complejidad (en términos de tipos de células, tejidos, órganos, etc.) no pueden ser contestadas sin
un árbol filogenético de sonido. Un árbol bien resuelto también nos permite comprender mejor la historia de la vida en la tierra,
incluyendo el tiempo de origen de los principales linajes y las tasas de evolución y diversi fi cación de los patrones en diferentes
ramas. Por último, una filogenia de los animales bien resueltas nos permite e fi cientemente organizar la información acerca de los
animales, y la diversidad de los animales clasificar, sobre la base de la historia evolutiva compartida. Esto nos ayuda a relacionar
los hallazgos basados ​en el estudio de los animales en particular,

La filogenia ANIMAL Avances recientes

La era moderna de la filogenética animales comenzó con análisis cladístico de secuencias parciales 18S rRNA (Field et al. 1988)
y los rasgos anatómicos (Eernisse et al. 1992, Nielsen et al. 1996, Schram
1991). Desde entonces, muchos análisis de fi PCR-ampli ed marcadores moleculares han encendido debates clave, y han llevado a
cabo algunas combinaciones de datos moleculares y morfológicas (Giribet et al.
2000, Glenner et al. 2004, Zrzav' Y et al. 1998). Estas y docenas de otros documentos dirigidos a un amplio

apoyo a lo que se denominó “la nueva filogenia animal” (Adoutte et al., 2000, Halanych 2004), en el que algunas agrupaciones
tradicionales, tales como el clado anélido-artrópodos Articulata, fueron rechazados en favor de nuevas hipótesis, tales como
Ecdysozoa. La mayoría de los recientes análisis filogenéticos profunda animales han hecho uso de transcriptomes y genomas
completos. Inicialmente, estos análisis se basaron en la secuenciación de Sanger (Bourlat et al., 2006, Delsuc et al., 2006, Dunn et
al., 2008, Hejnol et al., 2009, Philippe & Telford 2006, Philippe et al., 2005), pero las nuevas tecnologías de secuenciación que
proporcionan mucho más los datos están siendo ampliamente adoptados (Kocot et al. 2011, Lemmon y Lemmon

2012, Smith et al. 2011).


Los grandes progresos realizados en las últimas décadas en la filogenia de los animales profunda está concentrando la atención del campo en

un número cada vez menor de los problemas más difíciles que no han sido resueltos con

372 Dunn et al.


Porifera
animales
Placozoa

xenacoelomorpha
Parahoxozoa
Ambulacraria Echinodermata

planulozoa hemichordata
Deuterostomados

Urochordata
Chordata Cnidaria Ctenophora
Bilateria Craniata

Chaetognatha

Bryozoa

Entoprocta

Cycliophora
Nephrozoa
Annelida

Mollusca
Trochozoa
Gastrotricha
Gnathostomulida
Cephalochordata
braquiópodos

Spiralia Nemertea

Protostomia platelmintos

Micrognathozoa
Gnathifera
rotíferos
Kinorhyncha

orthonectida
Opisthokonta nucleariida Hongos
Phoronida
Rhombozoa
Ichthosporea filasterea
choanoflagellata Priapulida
holozoa scalidophora
Animales
loricíferos

Nematoida Nematoda

ecdysozoa Nematomorpha

Tardigrada

Panarthropoda Onychophora
Artrópodos

Figura 1

Una hipótesis de la filogenia animal, compilado a través de múltiples estudios. Los puntos negros denotan clados que tienen un amplio consenso
entre los estudios. Los puntos rojos indican clados que tienen el apoyo pobre o conflictivas o cuya composición exacta es incierta. Las siluetas
organismo fueron ilustrados por Noah Schlottman y sometidos a PhyloPic ( www.phylopic.org ). Están disponibles para su reutilización bajo la
licencia 3.0 de Creative Commons Atribución Compartir Igual.

enfoques anteriores. Algunos de los eventos diversi fi cación pertinentes ocurrió en sucesión rápida hace cientos de millones de
años, lo que resultó en relativamente pocos caracteres informativos para estas relaciones (Rokas y Carroll 2006). Aunque
algunos de estos problemas difíciles no se puede resolver, hay varias razones para ser optimistas de que los próximos años va a
ver un progreso continuo.

www.annualreviews.org • Filogenia Animal 373


Tabla 1 Algunos sinapomorfias para los clados marcadas en la Figura 1

clado sinapomorfias

Opisthokonta Quitina, un solo flagelo posterior

Animales (es decir, Metazoa) El colágeno, la oogénesis, espermatogénesis (cuerpos polares), la estructura especial de esperma, la reducción del

genoma mitocondrial

Todos los animales, excepto Ctenophora dominios apareadas vinculados a homeodomains (Ryan et al. 2010), los genes NR2A incluyen la unión al ADN de dominio

(Reitzel et al. 2011), el procesamiento de Drosha microRNA (Maxwell et al. 2012)

Parahoxozoa Los genes Hox y ParaHox (Ryan et al., 2010)

Planulozoa (sensu Wallberg et al. 2004) La serotonina

Bilateria Mesodermo, simetría bilateral, cefalización, circular y la musculatura longitudinal

Deuterostomados Enterocelia, faringe con ciliado hendiduras branquiales, archimery

Ambulacraria larva Dipleurula

Chordata notocorda

Protostomia manojos de neuritas principales localizadas ventralmente

Spiralia segmentación espiral

Trochozoa Las larvas con un prototroca

Gnathifera tipo especial de mandíbulas cuticularized

ecdysozoa cutícula mudada, epicuticula trilaminado

scalidophora Scalids sobre el introvertido

Nematoida Sólo músculos longitudinales, cloaca en ambos sexos, los espermatozoides sin flagelo

Panarthropoda Emparejado segmentaria ventrolateral apéndices con segmentada nervios y los músculos de las piernas,

Engrailed expresión en ectodermo posterior de cada segmento

Nephrozoa órganos excretores discretas tales como nefridios (Jondelius et al. 2002)

En primer lugar, sólo una pequeña fracción de los datos de potencial todavía no se ha examinado. Los enfoques basados ​en la PCR

utilizados hasta hace poco tiempo eran difíciles y costosas de aplicar a más de un puñado de genes. Las nuevas tecnologías de secuenciación de

ampliar el número de genes que pueden ser examinadas de forma rutinaria a los miles. Sólo ahora se está volviendo factible para los laboratorios

a los genomas de animales independientemente secuencia de enteros, que proporciona datos sobre genes adicionales y permite el análisis de

otras características del genoma evolución, tales como aumento de gen y la pérdida. Avances en las imágenes, como microtomografía de rayos X

y microscopía de fluorescencia de luz de hoja FL, han acelerado la descripción de las características morfológicas.

En segundo lugar, los datos adecuados para el análisis filogenético se han recogido por sólo una pequeña fracción de los animales vivos. Los

datos moleculares son casi en su totalidad carece de algunos clados importantes. En otros casos, están disponibles para sólo una o dos especies,

que luego se utilizan como los únicos representantes de grandes clados de datos. Las mejoras en la tecnología de secuenciación se ha indicado

anteriormente, en conjunción con los esfuerzos de recogida concertadas, será de gran ampliar taxón de muestreo de datos de secuencias

moleculares (Comunidad GIGA de Científicos 2014).

Últimos, los métodos de análisis de datos se han quedado atrás los avances en la adquisición de datos, pero ahora están avanzando

a un ritmo rápido. Hay una necesidad crítica de flujos de trabajo integrados fl computacional basado enteramente en métodos explícitos y

reproducibles (Dunn et al. 2013). Los avances en la inferencia filogenética, incluida la aplicación de los modelos de evolución de

secuencias complejas (Lartillot et al. 2009) y mejorado en gran medida e ciencia computacional fi, continuarán siendo esencial.

374 Dunn et al.


Amplio consenso

Muchas regiones del árbol animales nowhave amplios, soporte consistente a través de métodos de análisis, muestreo carácter, y la
selección de taxón ( Figura 1). monofilia animal está bien soportado, consistente con un solo originofmulticellularity y algunos otros
caracteres ( Tabla 1) en animales. Todos los animales vivos pertenecen a una de cinco clados: Porifera (esponjas), Ctenophora
(medusas peine), Cnidaria (corales, medusas, y sus parientes), Placozoa (un pequeño grupo de creeping animales marinos), o Bilateria
(la mayoría de los animales, incluyendo seres humanos). La monofilia de cada uno de estos clados es fuertemente apoyado a través de
los análisis de la muestra así. Algunos estudios sugieren que Porifera es paraphyletic (Sperling et al.

2009), pero estos estudios considerados un número relativamente pequeño de genes nucleares. Bilateria ( Figura 1) hasmore
que amillion describe especies, incluyendo las especies animales mejor-studiedmodel y casi todos los animales que los seres
humanos regularmente encuentro. Bilateria se compone de Deuterostomia, Protostomia, y posiblemente el clado mucho más
pequeño xenacoelomorpha, que algunos estudios lugar dentro Deuterostomia (ver la siguiente sección). Aparte de la colocación
de xenacoelomorpha, existe un amplio consenso sobre la composición de las relaciones y de las profundidades de
Deuterostomados (Delsuc et al., 2006, Dunn et al., 2008, Hejnol et al., 2009). Estas relaciones así soportado incluyen la relación
hermana-grupo entre hemichordata y Echinodermata (juntos formando Ambulacraria). Recientes análisis de datos de la
secuencia de genes han apoyado constantemente la colocación ofUrochordata, en lugar thanCephalochordata, como el grupo
hermana toCraniata (Delsuc et al. 2006),

El Protostomia clado ( Figura 1) es muy diversa en términos de número de especies, la disparidad morfológica, la
embriología, y muchos otros atributos. Dentro Protostomia hay tres subtipos: wellsupported Chaetognatha, Ecdysozoa y Spiralia.
Ecdysozoa se divide en tres subtipos: Panarthropoda, Nematoida y scalidophora. Análisis recientes tienen en gran medida clari fi
ed las relaciones dentro de Panarthropoda, incluyendo la colocación de Tardigrada como hermana a un clado que comprende
Onychophora y Arthropoda (Campbell et al. 2011). Las relaciones dentro de los artrópodos fueron revisados ​recientemente en
otra parte (Giribet y Edgecombe 2012). Nematoida comprende los clados hermana Nematoda y Nematomorpha
(Schmidt-Rhaesa 2013). Scalidophora consta de varios poco conocida pero taxones fascinante: Priapulida, que tiene tanto
celomados y los miembros pseudocoelomate (Storch 1991); loricíferos, con morfologías extraordinarios (Neves et al 2013.); y
Kinorhyncha, compuesto de los animales con un único tipo de segmentación (Herranz et al. 2014).

A pesar de las muchas preguntas que quedan sobre las relaciones dentro Spiralia, hay varias relaciones clave dentro de
este clado para el que existe un creciente consenso ( Figura 1). Varios grupos, incluyendo myzostomida, Echiura, y Sipuncula,
están anidados dentro de Annelida, la expansión de esta ya diversa clado para incluir animales adicionales con planes
corporales divergentes (Dordel et al.
2010, Dunn et al. 2008, Timón et al. 2012, Weigert et al. 2014). Trochozoa, un clado definido por la presencia de una larva
trochophore, incluye al menos Annelida, Mollusca, y probablemente Nemertea (Dunn et al. 2008, Nesnidal et al. 2013). El
enigmático Cycliophora, los animales que viven en las partes de la boca de langostas, forma un clado con Entoprocta (Hejnol et
al. 2009, Nesnidal et al.
2013). Acanthocephala es ahora reconocido como un clado derivado de rotíferos parasitarias (Sørensen y Giribet 2006) .Gnathifera,
un clado de animales con mandíbulas que consisten de al menos Rotifera, Gnathostomulida (Wey-Fabrizius et al. 2014),
andMicrognathozoa, está apoyada por datos morfológicos pero todavía no se ha probado a fondo con los datos molecular (Witek et
al. 2009).

Preguntas abiertas

Aunque muchas de las relaciones descritas anteriormente ahora encontramos un amplio apoyo, algunas relaciones críticas animales profundas

todavía tienen pobre o conflictivas de apoyo a través de los análisis. El progreso registrados

www.annualreviews.org • Filogenia Animal 375


anteriormente facilita en gran medida el trabajo sobre estas preguntas restantes, ya que la mayoría de ellos pueden ahora estar claramente articulado como

un número menor de específica, hipótesis alternativas (por ejemplo, Figura 2). El aumento de taxón de muestreo, la mejora de los métodos analíticos, y la

consideración de nuevos datos a nivel de genoma, tales como la ganancia y la pérdida de genes, ayudará a muchos determinación de estas preguntas en

los próximos años.

Raíz del árbol animal. La colocación de la raíz del árbol de animales ( Figura 2 un) ha sido una de las más di fi culto y desafíos polémicos
en la filogenética animales (Medina et al., 2001). Esto no es sorprendente teniendo en cuenta que estas relaciones representan las
divisiones más profundas en el árbol. Este reto se reduce a prueba las relaciones entre los cinco subtipos: Porifera, Ctenophora, Cnidaria,
Placozoa y Bilateria (Edgecombe et al 2011.). Tradicionalmente, Porifera ha sido pensado para ser el grupo hermano de todos los demás
animales, esta última agrupación colectivamente llamado Epitheliozoa ( Figura 2 un, Derecha). Esto se debe a esponjas carecen de
algunas características que se encuentran en otros animales [por ejemplo, los epitelios con desmosomas de cinta (Leys y Riesgo 2011)],
y sus coanocitos super fi asemejan cialmente choano fl agellates. estudios pormenorizados sobre la coanocitos y choano fl agellates, sin
embargo, revelan muchas diferencias y su homología ha sido cuestionada (Mah et al. 2014). A pesar de la aceptación generalizada de
Porifera como el grupo hermano de todos los demás animales, los análisis moleculares tempranos (Medina et al. 2001) no apoyan
fuertemente esta relación, y hasta hace poco no se habían probado en árboles bien muestreados. Sin embargo, fue sorprendente cuando
el primer análisis filogenómicos para incluir tanto las esponjas y los ctenóforos recuperaron ctenóforos, no esponjas, como el grupo
hermano de todos los demás animales (Dunn et al., 2008, Hejnol et al., 2009) ( Figura 2 un, izquierda).

Estudios posteriores encontraron apoyo a la hipótesis tradicional de Porifera como el grupo hermano de todos los demás animales

(Philippe et al., 2009, Pick et al., 2010), pero sólo cuando se excluyó la mayoría de los grupos externos o un conjunto reducido de lenta

evolución de los genes fue considerado. Un análisis phylogenomic más reciente de la base del árbol de animales (Nosenko et al. 2013)

reitera la conclusión de que la colocación de la raíz es sensible a la toma de muestras de genes, taxón de muestreo y los métodos

analíticos. Los retos de la resolución de estas relaciones a través de análisis de secuencia de genes evolución tienen esperanza inspirada

que otros tipos de datos de caracteres, tales como la ganancia y la pérdida de genes (Osigus et al. 2013b), podrían avanzar en el campo.

Los genomas secuenciados recientemente de dos ctenóforos (Ryan et al.

2013, Moroz et al. 2014) hace ahora esto es posible, y los análisis de ganancia de genes y apoyo de pérdida de la colocación de ctenóforos, en

lugar de esponjas, como el grupo hermano de todos los demás animales.

Hox y ParaHox genes se encuentran en Placozoa, Cnidaria, y Bilateria, pero ortólogos claras están ausentes en Porifera y Ctenophora

(ver la evolución del genoma, a continuación, para más detalles). Este hallazgo condujo a la hipótesis de que estos primeros tres grupos

forman un clado, Parahoxozoa (Ryan et al., 2010). Phylogenomic análisis que lugar esponjas como el grupo de la hermana a todos los

demás animales tienden a poner Ctenophora como el grupo hermano de Cnidaria, la reactivación de la edad clado Coelenterata (Nosenko

et al.

2013, Philippe et al. 2009). Esta construcción rechazaría Parahoxozoa e indicar que los genes Hox y ParaHox se habían perdido
en Ctenophora (Osigus et al. 2013b). La secuenciación del genoma ctenophore ha permitido a los científicos extienden análisis
de contenido gen más allá de genes Hox y ParaHox. Estos nuevos, mucho más amplio análisis fi nd fuerte corroboración para
Parahoxozoa (Ryan et al. 2013), lo que sugiere que la colocación de ctenóforos con cnidarios en algunos análisis puede ser un
artefacto. Dentro Parahoxozoa, existe un fuerte apoyo (Ryan et al. 2013) para planulozoa, un clado compuesto por Cnidaria y
Bilateria (Wallberg et al., 2004) ( Tabla 1).

La colocación de xenacoelomorpha. Aunque muchas de las características generales de las relaciones dentro de Bilateria fi nd
fuerte, consistente apoyo, muchas preguntas permanecen abiertos. Una pregunta se refiere a las relaciones más profundas dentro
Bilateria ( Figura 2 si). Algunos análisis han colocado xenacoelomorpha como el grupo hermano de Protostomia y Deuterostomados
(Hejnol et al., 2009) ( Figura 2 si, izquierda), mientras que otros han colocado xenacoelomorpha dentro Deuterostomia (Philippe

376 Dunn et al.


un La raíz del árbol animales

ctenophora Porifera

Porifera Placozoa
Animalia Animalia Bilateria
Placozoa
Epitheliozoa Cnidaria
Bilateria Ctenophora
Parahoxozoa Eumetazoa
planulozoa Coelenterata
Cnidaria

Ctenophora es grupo hermano de los otros animales Porifera es grupo hermano de los otros animales

Ryan et al. (2013) Philippe et al. (2009)

si La colocación de xenacoelomorpha dentro Bilateria

xenacoelomorpha

Bilateria Protostomia Bilateria Protostomia

Nephrozoa Chordata Deuterostomados Ambulacraria Chordata

Deuterostomados Ambulacraria Xenambulacraria Xenacoelomorpha

Xenacoelomorpha es grupo hermano de otra Bilateria Xenacoelomorpha está dentro Deuterostomados


Hejnol et al. (2009) Philippe et al. (2011)

C Las relaciones dentro de Ecdysozoa

Cycloneuralia scalidophora scalidophora

Nematoida Nematoida
ecdysozoa
ecdysozoa
Panarthropoda Panarthropoda

Cycloneuralia sin Cycloneuralia


Dunn et al. (2008) Pisani et al. (2013), Campbell et al. (2011)

re Las relaciones dentro de Spiralia

platelmintos platelmintos

Gastrotricha Gastrotricha

Gnathifera Gnathifera
Entoprocta Entoprocta

Spiralia Spiralia
Cycliophora Cycliophora

Briozoos Phoronida
briozoos
Lophophorata
Annelida braquiópodos
Mollusca
moluscos
Trochozoa
braquiópodos Lophotrochozoa Annelida

Kryptrochozoa Nemertea
Trochozoa
Brachiozoa Nemertea
Phoronida

Kryptrochozoa, Brachiozoa Lophophorata, Lophotrochozoa


Hejnol et al. (2009) Nesnidal et al. (2013)

Figura 2

Las preguntas clave en la filogenia de los animales. Cada panel muestra dos hipótesis alternativas para ( un) la colocación de la raíz animal, ( si) la colocación de xenacoelomorpha, ( C) las relaciones
dentro de Ecdysozoa, y ( d) las relaciones dentro de Spiralia. No se muestran todas las alternativas para cada caso. Los puntos negros representan los nodos que tienen un amplio consenso entre
los estudios. Los puntos rojos representan los nodos que tienen pobres o con fl icto entre los estudios de apoyo, o cuya composición exacta es incierta. Las imágenes de animales son un
subconjunto de las que se muestran en Figura 1, que se ilustra por Noah Schlottman y sometido a PhyloPic ( www.phylopic.org ). Están disponibles para su reutilización bajo la licencia 3.0 de
Creative Commons Reconocimiento-Compartir bajo la misma.

www.annualreviews.org • Filogenia Animal 377


et al. 2011) ( Figura 2 si, Derecha). Fue sólo en el pasado cinco años que la unión de Xenoturbella y Acelos recibió el apoyo de
datos molecular (Hejnol et al. 2009, Philippe et al. 2011). Varios caracteres morfológicos, tales como raicillas epidérmica ciliares
distintivos (Lundin 1998), sugirieron su afinidad. Los organismos dentro de xenacoelomorpha son gusano-como las criaturas sin un
ano o cualquier forma de órganos excretores; también carecen de muchos otros personajes que se encuentran en otros miembros
de Bilateria.

Protostomia. Protostomia consiste en Chaetognatha, Ecdysozoa y Spiralia. Aunque ahora está claro frommolecular de datos y
caracteres del sistema nervioso que se chaetognaths protostomes, queda fuera tanto Ecdysozoa y Spiralia, y aún no se sabe
cómo estos tres clados se relacionan entre sí (Marl '
etaz et al. 2006, Matus et al. 2006, Pérez et al. 2014). La interpretación de
quetognatos como un linaje profundo de ramificación de protostomes es consistente con la aparición de sus espinas de agarre
entre los primeros fósiles animales esqueléticos cerca de la base de la Cambrian (Kouchinsky et al. 2012), así como la presencia
de algún deuterostome-como características durante su desarrollo (deuterostomy, enterocelia, la división radial).

A pesar de un fuerte apoyo para cada uno de los tres clados que componen Ecdysozoa (scalidophora, Nematoida, y
Panarthropoda), sus interrelaciones siguen siendo inciertas ( Figura 2 C). Campbell et al. (2011) encontraron una polytomy de las
relaciones entre estos clados ecdysozoan. Un clado compuesto de scalidophora y Nematoida, llamado Cycloneuralia ( Figura 2 C,
izquierda), ha sido recuperado en múltiples análisis, aunque a menudo con escaso apoyo (Dunn et al., 2008). Cycloneuralia
generalmente se favoreció bymorphologists becausemost los miembros comparten un cerebro circumoral, en forma de collar
compuesto de un neuropil anillo con anterior y somata posterior que contrasta con las comisuras circumoral encuentran en otros
ecdisozoos (Richter et al. 2010, Schmidt-Rhaesa y Rothe 2014). Otros análisis moleculares sugieren que Cycloneuralia es
parafilético con respecto a Panarthropoda ( Figura 2 C, Derecha), con Nematoida más estrechamente vinculada a Panarthropoda
que a scalidophora (Pisani et al. 2013), aunque soporte anatómico para un grupo nematoid-panarthropod no es obvia. recursos
genómicos todavía no están disponibles para grupos ecdysozan importantes, en particular loricíferos y Kinorhyncha.

Las relaciones internas de Spiralia son aspectos inmany THEMOST mal resolvedof el árbol animales ( Figura 2 d), tantas
preguntas abiertas se superponen de manera compleja. La mayoría de las especies spiralian caen en Trochozoa, un clado definido
por trocófora larvas que incluye, al menos, moluscos y anélidos. Cada uno de estos dos clados tiene decenas de miles de
species.Most análisis también placeNemertea dentro Trochozoa (Dunn et al., 2008, Giribet et al., 2000, Glenner et al., 2004, Hejnol
et al., 2009, Paps et al., 2009, Zrzav '
Y et al. 1998). El prototroch de los trochophores y una banda de células no ciliadas
de desarrollo detenido en el pilidium nemertean se proponen para ser homóloga (Maslakova et al., 2004), consistente con esta
hipótesis filogenética y la derivación de las larvas de larvas nemertean trocófora. Un estudio reciente (Nesnidal et al. 2013) en
lugar coloca Nemertea con Platyhelminthes, fuera Trochozoa, en algunos análisis.

La cuestión de qué clados cae dentro Trochozoa es inseparable de un tema relacionado, los clados hipotéticos
Lophophorata y Lophotrochozoa. Lophophorata consta de un conjunto de organismos (Brachiopoda, Phoronida, y Bryozoa) con
una estructura de alimentación rastrillo-similares. Varios análisis sugirieron que Lophophorata es polifilético ( Figura 2 re, izquierda),
la colocación de Brachiopoda y Phoronida withinTrochozoa y Bryozoa fuera Trochozoa (Funch y Kristensen 1995, Hejnol et al.
2009). Otros análisis, en contraste, la resolución Lophophorata como monofilético y que cae fuera Trochozoa (Nesnidal et al.
2013) ( Figura 2 re, Derecha). Dependiendo de la colocación de los taxones lophophorate dentro Spiralia, Lophotrochozoa,
definida como un clado compuesto de Mollusca, Annelida, y Lophophorata (Halanych et al. 1995), es o bien un subclade de
Spiralia ( Figura 2 re, Derecha) o un sinónimo de Spiralia.

378 Dunn et al.


Animales dentro Spiralia que están claramente fuera Trochozoa incluyen Gnathifera (Gnathostomulida, rotíferos, y
probablemente Micrognathozoa), Bryozoa, Platyhelminthes, Gastrotricha, y el clado que comprende Entoprocta y Cycliophora.
Sus relaciones entre sí y con Trochozoa siguen sin estar claros. Resultados contradictorios sugieren que Platyhelminthes,
Gnathifera, Gastrotricha, y tal vez otros varios de estos organismos o bien forman un clado, referidos como Platyzoa (Giribet et
al.
2000, Hankeln et al. 2014), o son paraphyletic con respecto a Trochozoa. Asimismo, el polizoos clado se ha propuesto para
Bryozoa, Cycliophora, y Entoprocta. Estos animales tienen gemación asexual de soporte (Funch y Kristensen 1995), pero
molecular similar para este clado ha sido débil (Hejnol et al. 2009).

La posición filogenética de Gastrotricha es especialmente inestable a través de los análisis. La presencia de Conciliación,
protonephridia, y otros personajes sugiere, como lo hacen los análisis moleculares, que cae dentro de Gastrotricha Spiralia
(Schmidt-Rhaesa 2013), aunque no está claro dónde exactamente. Además, los datos son escasos durante varios taxones que
son difíciles de obtener. La posición de Mesozoa (orthonectida y rhombozoa) todavía es inestable, aunque los análisis recientes
sugieren una afinidad a protostomes (Ogino et al. 2010, Suzuki et al. 2010). Diurodrilida se considera tradicionalmente un grupo
aberrante de anélidos con algunas similitudes convergentes a Gastrotricha (Kristensen y Niilonen 1982) hasta que los estudios
anatómicos detallados traído anélido af fi nidades en tela de juicio (Worsaae y Rouse 2008). Sin embargo,

2013). Los datos moleculares de Micrognathozoa todavía están restringidos a unos pocos fragmentos de genes basados ​en Sanger (Giribet et

al. 2004), y la posición del grupo se mantiene no probado en los análisis phylogenomic más nuevos. No hay datos moleculares en el

enigmático psammicola Lobatocerebrum, anteriormente se cree que estar estrechamente relacionada con anélidos y platelmintos

(Platyhelminthes) (Rieger, 1980), aún no han sido publicados.

EL evolución de la morfología Y DESARROLLO

El creciente consenso respecto a muchos aspectos de la filogenia de los animales ofrece la oportunidad de evaluar hipótesis sobre la
evolución de caracteres. mejoras simultáneas en imágenes y tecnologías de secuenciación han hecho morfológico disponibles y los
datos del desarrollo a través de un conjunto más amplio de los taxa animales. Estos avances proporcionan una imagen más nítida y
más detallada de la evolución de caracteres en los animales e indican extensa homoplasia en caracteres de interés central ( Figura 3).

epitelios

En el sentido más amplio, un epitelio es una lámina continua de células que están conectados entre sí por uniones. Tales
estructuras son una sinapomorfía para animales ( Tabla 1). barreras forma epitelios entre el organismo y el mundo exterior, así
como entre las estructuras organismal internos. Son selectivamente permeable o casi impermeable y son críticas para la
compartimentación del cuerpo animal.

El termepithelium se utiliza a veces tomore se refiere estrechamente al tejido que fi ts los criterios anteriores, pero también se une
a un membrana basal extracelular. Ctenophora, Cnidaria, andBilateria incluyen animales cuya epitelios fi t thismore estrictas definición.
Themembers de Placozoa no tienen las membranas basales, aunque su genoma incluye genes para muchas proteínas de la matriz
extracelular que se encuentra en las membranas basales de otros animales (Srivastava et al. 2008). La falta de una membrana basal
en placozoans podría explicarse por la pérdida secundaria, como se observa en Acoelomorpha. La naturaleza de los epitelios en las
esponjas se ha confundido un poco en la literatura, en parte porque los epitelios de esponja son diversas. Debido a que las esponjas
han sido a menudo presentada como el tejido que carece

www.annualreviews.org • Filogenia Animal 379


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Echinodermata
hemichordata

Deuterostomados
Urochordata
Cnidaria Ctenophora
Bilateria Craniata

Chaetognatha

Bryozoa

Entoprocta

Cycliophora

Annelida

Mollusca
Protostomia Gastrotricha
Gnathostomulida
Cephalochordata
braquiópodos

Nemertea
Spiralia platelmintos

Micrognathozoa
rotíferos
Kinorhyncha

orthonectida
Phoronida
Rhombozoa

Priapulida

loricíferos

Nematoda

ecdysozoa Nematomorpha

Tardigrada

Onychophora
Artrópodos

figura 3

Seleccionar los caracteres morfológicos aplicados sobre el árbol de Figura 1. Oscuras barras azules indican caracteres que están presentes, y las barras de color azul claro indican clados con
presencia / ausencia de caracteres mixto. Ver tabla 1 para los caracteres adicionales que son sinapomorfias de clados. Las imágenes de animales son un subconjunto de las que se muestran
en Figura 1, que se ilustra por Noah Schlottman y sometido a PhyloPic ( www.phylopic.org ). Están disponibles para su reutilización bajo la licencia 3.0 de Creative Commons
Reconocimiento-Compartir bajo la misma.

380 Dunn et al.


que bene fi la más estricta definición de los epitelios, y debido a la posición de Placozoa ha sido inestable, el clado hipotético de
todos los animales, excepto los Porifera, ha sido nombrado Epitheliozoa (Ax
1995) ( Figura 2 un, Derecha). Trabajos adicionales han revelado que la complejidad de los tejidos esponjosos menudo se ha
subestimado (Leys y Riesgo 2011). Esponjas poseen claramente uniones de las células que sellan la capa de tejido, y las esponjas
homoscleromorph tienen membranas basales (Leys y Riesgo 2011).

Los sistemas nerviosos

El sistema nervioso y el origen de sus diferentes arquitecturas en diferentes linajes de animales son uno de los aspectos más
estudiados de la morfología animal. Esto se debe tanto al interés funcional y a su diversa morfología a través de taxones. Las células
nerviosas están presentes en Ctenophora, Cnidaria, y Bilateria pero están ausentes en Placozoa y Porifera. Se ha pensado, a
continuación, que no había un único origen de los nervios antes de la diversificación de Eumetazoa (un clado la hipótesis de que
consistir en Ctenophora, Cnidaria, y Bilateria) y no hay pérdidas. Soporte para Parahoxozoa en contraposición a Eumetazoa, sin
embargo, indica que se ha producido homoplasia en la evolución de las células nerviosas (Ryan et al.

2013, Moroz et al. 2014). Esto se debe a los animales con y sin nervios se encuentran tanto dentro andoutsideParahoxozoa,
requiringmultiple ganancias o pérdidas de nervios evolutivos. Hay aremany patrones de ganancia de los nervios y pérdida que podrían
explicar su presencia y ausencia en animales vivos. Los nervios pueden haber surgido de forma independiente en Ctenophora y el clado
compuesto de Cnidaria y Bilateria. Alternativamente, los nervios pueden haber tenido un origen único seguido por la pérdida en Placozoa
solo (si Porifera es el grupo hermano de todos los demás animales) o ambos Placozoa y Porifera (si Ctenophora es el grupo hermano de
todos los demás animales).

Ctenóforos carecen de muchos genes que son esenciales para el desarrollo del sistema nervioso y la función de los
cnidarios y los bilaterales, lo que sugiere que los ctenóforos tienen sistemas nerviosos que son bastante diferentes de las de
otros animales (Ryan et al. 2013, Moroz et al. 2014). El sistema nervioso de ctenóforos y cnidarios son en forma de red, con
cierta especialización regional (Jager et al.
2010, Schmidt-Rhaesa 2008). Dentro Bilateria, una pregunta central acerca de las preocupaciones de la evolución del sistema nervioso,
el número de veces que un cerebro complejo y un sistema nervioso centralizado con varios cables surgieron a partir de una red de
nervios o que un sistema nervioso centralizado convirtió reducido de nuevo a una red de nervios (Holland et al. 2013, Holanda 2003,
Northcutt 2012). Todos bilaterians poseen más nervios y células sensoriales en la parte anterior del cuerpo que en otras partes, lo que es
ampliamente de acuerdo en que cefalización es un sinapomorfía para Bilateria. La complejidad del cerebro bilaterian ancestral, sin
embargo, es motivo de debate (Northcutt 2012). El número de eventos evolutivos que llevaron a la formación de cuerpos de hongos y
subdivisiones del cerebro (bipartito / tripartita) y las reducciones en muchos linajes de animales sigue siendo poco conocida (Holland et
al. 2013). Sin embargo, todos bilaterians utilizan genes similares a la formación de control cerebral (Holland et al. 2013), que es
coherente con un origen único del cerebro, aunque el número exacto de tipos de células y la estructura de un cerebro ancestral putativa
siguen sin estar claros (Tessmar-Raible 2007 ). Una pequeña condensación compuesto de un pequeño número de tipos de células
multifuncional es una posibilidad probable, ya que muchos linajes tienen ya sea un anillo de nervio (Cycloneuralia) o un pequeño
conjunto de neuronas y células sensoriales (polizoos, Platyzoa).

Una cuestión relacionada es de gran interés, ¿cuántas veces evolucionaron los cordones nerviosos cordados, anélidos, y
panarthropod complejos fromeither un Orthogon parecido o similar a una red del sistema nervioso (Holland et al. 2013, Lowe 2008)? Un
sistema nervioso ortogonal se compone de ventral múltiple, lateral, y las cuerdas dorsales conectados por comisuras más o menos
regular, como se encuentra en Platyhelminthes y Acelos. redes nerviosas Basiepidermal, además de la cuerda-como las estructuras, se
encuentran en la epidermis y se encuentran en hemicordados, Xenoturbella, nemertodermatids, y muchos otros animales bilaterales.
Filogenia claramente indicatesmultiple eventos de condensación independientes a pesar de que moléculas similares se utilizan para
desarrollar estas estructuras, lo que sugiere que las redes moleculares tenían una

www.annualreviews.org • Filogenia Animal 381


función ancestral en (neuro) patrón ectodérmica y se co-optó por el modelado de estructuras avanzadas (Pani et al. 2013).
sistemas nerviosos Ventralmente condensados ​se pueden derivar de un Orthogon por la pérdida de cordones dorsales, dejando
ventral y ventrolateral cuerdas como remanentes-una arquitectura neural encuentra en nemertinos y moluscos. Por el contrario,
ambos múltiples condensaciones independientes de tractos de axón y reubicación subepidermal son mecanismos probables
Contabilidad para múltiples orígenes evolutivos de dorsal más complejo o cordones nerviosos ventrales.

Gut y Gastrulación

La gastrulación es el proceso por el cual las células se vuelven internalizados para producir el endodermo, una capa de tejido que
forma el intestino y otras estructuras asociadas. La gastrulación se ha descrito en detalle para Ctenophora, Cnidaria, y Bilateria. La
embriología de Placozoa es desconocida, y no queda claro cómo las células interna surgen y si este proceso es homóloga a la
gastrulación en otros linajes de animales. Si está presente en la gastrulación Porifera ha sido una fuente de debate extenso
(Degnan et al., 2005, pero ver Ereskovsky y Dondua 2006). A pesar de que la embriología esponja carece de muchas
características de la gastrulación visto en otros animales, que pueden derivarse de animales que tienen la gastrulación.

El intestino animal puede tener una abertura, la base de que es funcionalmente ciego (ctenóforos, esponjas, cnidarios,
xenacoelomorphs, platelmintos, gnathostomulida, y algunos braquiópodos), o dos aberturas, incluyendo aquellos casos en que
el intestino es un tubo que se abre externamente en ambos extremos. Filogenético,, datos andmorphological desarrollo sugieren
que el ancestro común más reciente de cnidarios y Bilateria tenía una tripa con una sola abertura que funcionaba como tanto
una boca y un ano, y que esta apertura es homóloga a la boca de los animales después de un pase intestino ( Hejnol y
Martindale 2009). En este escenario, el intestino a través surgió con la novela origen de una abertura posterior adicional, el ano.
El número de veces que una abertura posterior ha evolucionado es objeto de debate (Schmidt-Rhaesa 2008). El ano y el pase
del intestino puede haber surgido sólo una vez,

Mesodermo celomas, y excretor y circulatorio Sistemas

El mesodermo es la capa embrionaria en bilaterians que da lugar a celomas, sistemas vasculares sanguíneos, hemolinfática fl uid,
huesos, tejido conectivo, y células musculares individuales. La mayoría de estos tejidos y sistemas de órganos están asociados
con tamaños más grandes del cuerpo, lo que facilita la alimentación de las células o la estabilización del cuerpo, y, a menudo se
reducen en animales más pequeños. La homología del mesodermo dentro Bilateria fue una vez en disputa (Ruppert 1991), pero
los estudios moleculares y de desarrollo ahora indican un origen único. Hay consenso en que en Bilateria (Chiodin et al. 2013,
Ladurner y Rieger 2000), el mesodermo se originaron a partir del endodermo (Martindale

2004). células nefridiales están presentes en protostomes y deuterostomes (Ruppert & Smith 1988). Ellos son la hipótesis de
compartir un único origen común (Bartolomaeus y Axe 1992, Jondelius et al., 2002) y para ser un sinapomorfía para el clado
Nephrozoa ( Figura 2 si, izquierda). Existe una variación sustancial entre estos tipos de células (protonefridios y metanefridios) a
través de Bilateria, así como en los sistemas excretores de los que forman una parte. Una estrecha relación de protonephridia y
metanefridios a las complejas metanefros del riñón de vertebrados ha planteado la hipótesis, aunque los metanefros es de
origen mesodérmico mientras que las células nefridiales se originan a partir del ectodermo (Ruppert 1994). Curiosamente, un
estudio reciente molecular de la regeneración planaria mostró que los ortólogos de genes que el patrón de los metanefros en los
vertebrados son responsables de la regeneración de protonephridia planaria (Scimone et al. 2011) a pesar de su diferente
ontogénica

382 Dunn et al.


origen. Un examen más detenido molecular de protonephridia y metanefridios de otros linajes Protostomia este modo se justifica.

Los avances en la filogenia de los animales y en las imágenes de herramientas ahora dejan claro que la vasculatura y cavidades

celómicas, dos derivados del mesodermo clave, muestran una amplia homoplasia dentro Bilateria. Esto difiere notablemente de las perspectivas

clásicas que presume que estos rasgos eran demasiado complejos para mostrar la ganancia y la pérdida convergente (Koch et al. 2014). Los

resultados de estos avances sugieren que los tamaños más grandes del cuerpo que están presentes en varios linajes (Arthropoda, Annelida,

Nemertea, Chordata, Ambulacraria) tienen orígenes evolutivos independientes.

Segmentación

Segmentación, la anteroposterior repetitionof unidades de cuerpo, es una característica importante de algunos animales en Bilateria.
Una clara definición de la segmentación ha sido difícil de conseguir (Hannibal y Patel
2013, Scholtz 2002), pero por lo general es distinguir de metamery y serialidad. Panarthropods y anélidos, que son parientes
lejanos y filogenéticamente incrustado entre muchos animales no segmentados, tienen cierto segmentación, en el que las
subestructuras de segmentos (por ejemplo, músculos, Nefridios) tienen específicos patrones espaciales c. Sólo una más amplia
definición de segmentación puede incluir taxones adicional, tal como vertebrados (subdivisión de la columna vertebral y
somitas), kinorhyncha (en serie repetidos zonites), y algunos clados moluscos (por ejemplo, múltiples glándulas shell en
chitones, y nefridios en serie repetida y músculos dorsoventral en chitones y monoplacóforos). Incluso más amplia de fi niciones
de la serialidad también pueden incluir dispuestas en serie musculatura anillo similar a la encontrada en acoelomorphs.

2012). Además la resolución de las relaciones internas en Spiralia y Ecdysozoa especificará cuando segmentación surgió en el
mismo, y las investigaciones moleculares puede aclarar cómo estos procesos de segmentación eran modi fi.

La evolución del genoma genomas

nucleares

Además de ayudar a resolver la filogenia de los animales, los genomas de animales secuenciados han revelado varios patrones de
primordial importancia para nuestra comprensión de la evolución animal. En particular, muchos genes inicialmente se pensó que ser
específica para determinadas innovaciones, como multicellularity, preceden a estas innovaciones (Suga et al. 2013). Este hallazgo se
erosiona la expectativa de que debemos buscar nuevos genes asociados con cada novela morfológica, de desarrollo o de carácter
funcional. Surgen muchas nuevos fenotipos a través de Modificación de las funciones de e interacciones entre genes existentes, y el
número de genes inferidos a estar presentes en los genomas ancestrales es mucho mayor que se pensaba.

La mayoría de los genomas secuenciados animales pertenecen a unos clados dentro Bilateria, especialmente vertebrados, insectos y

nematodos (GIGA comunidad de científicos 2014). Ctenophora tiene dos genomas secuenciados (Ryan et al. 2013, Moroz et al. 2014).

Porifera (Srivastava et al., 2010) y Placozoa (Srivastava et al., 2008) tienen un genoma secuenciado cada uno. El muestreo de los

genomas cnidarios es sólo un poco mejor (Chapman et al., 2010, Putnamet al., 2007, Shinzato et al. 2011). La secuenciación de los

genomas de los parientes más cercanos unicelulares de los animales también es fundamental para comprender la evolución de las

secuencias de los genomas del genoma de los animales están ahora disponibles para dos choano fl agellates, brevicollis Monosiga y Rosetta

Salpingoeca, y la fi lasterean owczarzaki Capsaspora ( Suga et al. 2013).

Los genomas de animales secuenciados hasta la fecha, aunque todavía limitados en su alcance taxonómico, hacen posible la reconstrucción de

algunos aspectos de los eventos clave en la historia de la evolución del genoma. Una comparación

www.annualreviews.org • Filogenia Animal 383


de genomas de animales a los de holozoans unicelulares revela que muchos genes de adhesión celular y la regulación
transcripcional esenciales para animales preceden animales multicellularity (Suga et al.
2013). En contraste, muchos genes de señalización intercelular parecen ser específico a los animales. El contenido de genes de
ctenóforo y esponja genomas son similares en muchos aspectos (Ryan et al. 2013). Por ejemplo, ambos grupos de animales
tienen algunos genes que tienen funciones neuronales en Bilateria y cnidarios, a pesar de que las esponjas carecen de un
sistema nervioso. Otros genes esenciales para systemdevelopment nervioso inBilateria andCnidaria están ausentes en
ctenóforos y esponjas, a pesar de que ctenóforos tienen un sistema nervioso. Esto sugiere que el sistema nervioso ctenóforo es
bastante diferente de la de otros animales. Muchos genes son específico a Parahoxozoa, un clado inicialmente definida por la
presencia de genes Hox y ParaHox (Ryan et al. 2013). Algunos científicos han argumentado que las firmas de los genes Hox y
ParaHox están presentes en todos los clados de animales,

La primera genomas de animales a ser secuenciado eran de ecdisozoos y vertebrados. Muchos de los genes que estaban presentes en

los genomas de vertebrados, pero no en los genomas ecdysozoan se pensaba que eran innovaciones vertebrados únicas. La secuenciación

del primer genoma cnidarian, la de vectensis Nematostella ( Putnam et al. 2007), modificado radicalmente esta creencia. Muchos de los especí

fi cos-vertebrados genes eran, de hecho, presente en cnidarios, y por lo tanto no eran vertebrados-específico en absoluto, pero se habían

perdido en ecdisozoos.

Genomas, por supuesto, incluyen muchas características distintas de genes codificantes de proteínas. Estos incluyen microRNAs, pequeñas moléculas que modulan

la degradación y la traducción del ARN mensajero. Los microARN están presentes en todos los animales, excepto Ctenophora (Maxwell et al. 2012) y Placozoa (Srivastava

et al. 2008). -Procesamiento de microARN genes no están presentes en Ctenophora, coherente con la posible divergencia de este grupo de otros animales antes de la

origen de microARN (Maxwell et al. 2012). Algunos componentes de la maquinaria microRNA-procesamiento están presentes en Placozoa (Srivastava et al. 2008),

sugiriendo que microRNA se puede haber perdido secundariamente en este grupo. Una vez que la maquinaria microRNA-procesamiento estaba en su lugar, diferentes

microRNAs han sido adquirida en diferentes linajes de animales, y se ha deducido que, una vez presente, que sólo en muy raras ocasiones se pierden (Tarver et al. 2013).

Un bajo nivel de homoplasy haría que la presencia o ausencia de particulares microRNAs marcadores filogenéticos altamente informativos. Como taxonómica de muestreo

ha mejorado, sin embargo, se ha vuelto cada vez más claro que microRNAs, otros caracteres likemany, son más homoplastia lo que se pensaba inicialmente (Fromm et al.

2013). Un nuevo análisis reciente de estudios de microARN indica que homoplasy, las tasas de heterogéneas de ganancia y la pérdida, el muestreo de artefactos, y el

modelado de insuficiencia puede afectar la utilidad de microARN para el análisis filogenético de las relaciones de los animales (Thomson et al. 2014). likemany otros

caracteres, son más homoplastia lo que se pensaba inicialmente (Fromm et al. 2013). Un nuevo análisis reciente de estudios de microARN indica que homoplasy, las tasas

de heterogéneas de ganancia y la pérdida, el muestreo de artefactos, y el modelado de insuficiencia puede afectar la utilidad de microARN para el análisis filogenético de

las relaciones de los animales (Thomson et al. 2014). likemany otros caracteres, son más homoplastia lo que se pensaba inicialmente (Fromm et al. 2013). Un nuevo

análisis reciente de estudios de microARN indica que homoplasy, las tasas de heterogéneas de ganancia y la pérdida, el muestreo de artefactos, y el modelado de

insuficiencia puede afectar la utilidad de microARN para el análisis filogenético de las relaciones de los animales (Thomson et al. 2014).

Los genomas mitocondrial

Los genomas mitocondriales de animales ( Figura 4) son mucho más pequeñas que las de los eucariotas estrechamente
relacionados (Lavrov 2007), lo que facilita en gran medida su secuenciación y ensamblaje. secuencias del genoma mitocondrial
de miles de especies animales muestreados en todos los principales clados animales ya están disponibles. La evolución de los
genomas mitocondriales de origen animal es interesante en sí mismo y puede proporcionar caracteres filogenéticamente
informativos. Aunque los genomas mitocondriales han mejorado nuestra comprensión de las relaciones internas de algunos
subtipos de animales, su utilidad para resolver las relaciones filogenéticas más profunda ha sido limitado. Recientes análisis
mitocondriales de secuencia que dirigen Bilateria (Bernt et al. 2013) y la raíz del árbol de animales (Osigus et al. 2013a), por
ejemplo, se recuperaron algunos clados bien reconocidos pero estaban mal resueltas en otros nodos de interés particular.

384 Dunn et al.


Tamaño genes de tasa de evolución de
clado (kilobases) Estructura ARNt Los intrones secuencias

ctenophora 10-11 0-2 Ninguna Extremadamente rápido

Porifera 17-50 2-27 raras ( COX1) Lento rápido

Placozoa 37-43 24 ubicua ( COX1, Lento


nad5,
y / o 16S)
Bilateria 14-16 0-22 Muy raro ( COX1) Rápido

Cnidaria 15-28 1-3 ocasional ( cox1, Lento


nad5)

Figura 4

Diversidad de genoma mitocondrial cuenta, en gran parte de Bernt et al. (2013), Osigus et al. (2013a), Papillon (2004), y referencias en el mismo. La topología es una simplificación de la
mostrada en la Figura 1. Este resumen se ve afectada por algunos valores atípicos dentro de cada clado. el poriferan Clathrus Clathrina es extrema en varios aspectos: es la única esponja
sabe que tienen un genoma mitocondrial lineal, y su genoma mitocondrial es mucho más grande (50 kb) que la siguiente más grande conocido para esponjas (28 kb). El genoma mitocondrial
de la quetognatos cephaloptera Spadella no tiene genes de ARN de transferencia (ARNt) (Papillon 2004), mientras que la mayoría de otros bilaterians tienen 22 genes de ARNt. En la
columna de la estructura, un círculo indica una organización del genoma circular y una línea indica una organización del genoma lineal Las imágenes de animales son un subconjunto de los
que se muestran en Figura 1, que se ilustra por Noah Schlottman y sometido a PhyloPic ( www.phylopic.org ). Están disponibles para su reutilización bajo la licencia 3.0 de Creative Commons
Reconocimiento-Compartir bajo la misma.

El tamaño, la composición de genes, el orden de genes, andother características estructurales ofmitochondrial genomas varían en gran

medida a través del árbol de animales ( Figura 4). Ha habido un interés considerable en el uso de estas características para ayudar a las

relaciones de los animales resolución. Como se secuenciaron los genomas mitocondriales más animales, sin embargo, cada vez es más claro

que muchos de estos caracteres estructurales exhiben extensa homoplasia (2007 Lavrov, St ¨

Oger y Schröder ¨ ODL 2013). genomas mitocondriales de origen animal

tener al menos una variación fi vefold en tamaño, desde ~ 10 kb en un ctenophore (Pett et al. 2011) a> 50 kb en una esponja (Lavrov
et al. 2013). genomas mitocondriales tienen diferentes formas (circular frente a lineal), la composición de genes, el orden de genes,
y orientaciones de genes. Ha habido por lo menos dos turnos independientes de circular a genomas mitocondriales lineales, uno en
Medusozoa (Kayal et al.
2012), un subclade de Cnidaria, y otro en Porifera (Lavrov et al. 2013).
pérdida diferencial de genes es una característica estructural importante de los genomas mitocondriales de animales. Hay varias
categorías de genes mitocondriales: genes codificantes de proteínas, ARN ribosómico (rRNA) genes, y los genes de ARN de
transferencia (ARNt). genomas mitocondriales animales tienen un número relativamente pequeño de genes codificadores de proteínas,
y algunos se han perdido en grupos particulares pero retenido en otros (Lavrov 2007). También ha habido un pequeño número de
ganancias de genes en los genomas mitocondriales de origen animal (Bilewitch y Degnan 2011). La evolución del contenido de ARNt
ha sido particularmente dinámico ( Figura 4), con múltiples reducciones en el número y ARNt importantes implicaciones para los
cambios en el código genético mitocondrial (Lavrov 2007). La historia evolutiva de intrones en el genoma mitocondrial de animales
también es complejo ( Figura 4). intrones mitocondriales no se han encontrado en ctenóforos, mientras que todos los placozoans
secuenciados tienen intrones mitocondriales. intrones mitocondriales se encuentran dentro de clados aisladas en otros animales:
dentro Hexacorallia en Cnidaria, dentro homoscleromorpha en Porifera, y dentro de un anélido ( Nephtys sp.) en Bilateria (Vall `

ES et al. 2008). La variación de la esponja genomas mitocondriales es particularmente sorprendente

www.annualreviews.org • Filogenia Animal 385


(Lavrov 2007, Osigus et al. 2013a, W orheide et al. 2012), y esta variación puede ser informativo
para resolver las di fi culto relaciones filogenéticas internos en este grupo.

El fósil RECORD TEMPRANA DE ANIMALES

La mayoría de los grandes linajes de animales primeras aparecen en el registro fósil en el Cámbrico ( Figura 5), y la compresión de la

mayoría de estas apariciones primero hace entre 541 (la base del Cámbrico) y 520 millones de años (Ma) es la base empírica de la

explosión cámbrica. Algunos animales de concha que soportan tales como moluscos primera aparecen entre los llamados pequeños

fósiles exfoliado en el primer Cambrian. Chaetognaths aparecen como los fi protostomes primera biomineralizada, representados por

protoconodonts en rocas tan antigua como 535 Ma (Kouchinsky et al. 2012). Otros grupos de animales bilaterian biomineralizada tales

como artrópodos y equinodermos son primera representado en el registro fósil cuerpo en Cambrian Etapa 3 (aproximadamente 520 mA).

Para algunos grupos, tales como artrópodos y priapula, trazas fósiles proporcionan evidencia de orígenes más tempranas que fósiles

cuerpo hacer, en la extensión de nuevo a cerca de la base de la Cambrian este caso (Vannier et al. 2010). El betweenwhen discrepancia

grupos nonbiomineralized aparecen en los registros fósiles cuerpo y fósiles traza sugiere un sesgo preservational en el primero, limitado

por la aparición de condiciones que favorecen la preservación de la anatomía suave como compresiones carbonosos, conocidos como de

tipo de esquisto Burgess preservación (Gaines et al . 2008). El conocimiento combinado de los fósiles corporales y localizar, sin embargo,

proporciona una imagen coherente de la rápida animales diversificación en el Cámbrico temprano.

La búsqueda de animales stem- o corona-grupo en el Neoproterozoic ha centrado durante mucho tiempo en los restos
macrofósiles de entre aproximadamente 575 y 541 Ma, en el Período de Ediacaran, y La identificación de determinados fósiles
Ediacara como metazoos sigue teniendo sus defensores. Por ejemplo, se han presentado argumentos recientes que Dickinsonia es
un animal placozoan grado (Sperling y Vinther 2010), Kimberella es un molusco (Fedonkin et al. 2007), Eoandromeda es un
ctenophore (Tang et al. 2011), y Thectardis es una esponja (Sperling et al. 2010). Ninguno de estos cationes fi metazoan identi ha
sido enfáticamente abrazado. Los paleontólogos están divididos sobre si la mayoría si no todos macrofósiles ediacáricos
representan clados extintos aliadas entre sí en lugar de metazoos o incluyen un conjunto filogenéticamente variado de tallo de
grupos de animales (Xiao & La FL amme 2009).

El descubrimiento de microfósiles de edad Ediacaran de theDoushantuo Formación inChina (Xiao et al. 1998) condujo a
identificaciones de animales que datan de al menos 580 millones de años. fósiles de Doushantuo han sido asignados a diferentes
grupos cnidarios, a Demospongiae sobre la base de espículas putativos (posteriormente reinterpretados como abiogénico), y para
Bilateria. interpretaciones Metazoan de fósiles Doushantuo han recibido críticas debido a estructuras anatómicas putativos han
sido objeto de una amplia alteración tafonómica (Cunningham et al. 2012). La interpretación de los embriones putativos ha sido
especialmente polémico, ya que estos fósiles han sido identi fi ed como embriones stem- o corona-grupo metazoos, algas,
bacterias o protistas (Huldtgren et al. 2011).

Otros tipos de datos bioquímicos y paleontológicos han sido citados como evidencia de animales neoproterozoicas.
Ciclopentanoperhidrofenantreno biomarcadores se han argumentado para indicar la existencia de Demospongiae en el Criogénico
(Love et al., 2009), precediendo ampliamente la primera espículas de esponjas confiables en el Cámbrico. Precaución ha instado con
respecto a esta interpretación, porque otros organismos, incluyendo las algas, pueden producir estos compuestos (Antcliffe 2013). Otro
indicador propuesto de metazoos en la Ediacaran es acritarcos conocidos como grandes microfósiles ediacáricos ornamentados,
algunos de whichhave sido interpretado como el reposo enquistadas etapas ofMetazoa (Cohen et al. 2009). Estos acritarcos tienen un
alcance temporal de aproximadamente 635 a 560 Ma. Sus afinidades precisa no son claros y parecen ser variado filogenéticamente
(Liu et al. 2014), Aunque algunos de estos acritarcos ornamentados encajona en el embrión como Doushantuo fósiles discutidos
anteriormente (Yin et al. 2007). Esta asociación refuerza el caso de que tales acritarcos pueden ser quistes de huevo.

386 Dunn et al.


Hace
millones
de años

Porifera Cnidaria Protostomia Deuterostomados


480

500
Ordovician

520

Spiralia Ecdysozoa
540

Burgess Shale–type preservation Small


Archaeocyatha
Ctenophora

Chaetognatha
Bilaterian trace fossils

Ambulacraria
Hexactinellid

Medusozoa

Chordata

Calcite sea
Anthozoa
spicules
Cambrian

560
Early skeletal fossils

shelly fossils
640 Gaskiers glaciación

Aragonite sea
Doushantuo microfossils

Ediacaran fossils

580

600
Large ornamented Ediacaran microfossils
Ediacaran

glaciación Marinoan
620

Figura 5

Cronograma para el Late Cryogenian a través de la Cambrian, mostrando fi apariciones primeros fiables de los principales grupos de animales ( barras rojas),
estilos de preservación de fósiles, y las relaciones a eventos clave en la historia de la Tierra. Sombreado en gris barras indican los intervalos de fechas establecidos por fósiles de incertidumbre fi
liación. Las imágenes de animales son un subconjunto de las que se muestran en Figura 1, que se ilustra por Noah Schlottman y sometido a PhyloPic ( www.phylopic.org ). Están disponibles para su
reutilización bajo la licencia 3.0 de Creative Commons Reconocimiento-Compartir bajo la misma.
Cryogenian

www.annualreviews.org • Filogenia Animal 387


evidencia molecular que los linajes de animales primeras divergieron mucho antes de que aparecieran en el registro fósil
(Erwin et al. 2011) da fundamentalmente en las tasas de evolución en la explosión cámbrica. Se ha supuesto que la
condensación de la radiación animales basales en el relativamente estrecha ventana Cámbrico Ediacaran-principios sugeridos
por el registro fósil (es decir, la aceptación de la explosión cámbrica tan ampliamente precisa en lugar de un artefacto de fósiles
en su defecto para preservar los caracteres diagnósticos de los linajes más antiguos ) requeriría tasas prohibitivamente rápidos
de evolución morfológica y molecular. De lo contrario,

El marco general aprobado para animales diversificación predice divergencias neoproterozoicas y la radiación Cambrian
(Erwin et al. 2011). Este intervalo temporal corresponde a un tiempo de cambios profundos en el océano y la química atmosférica,
en el clima, y ​en paleogeography (reviewedbyErwin y Valentine 2013). Por ejemplo, las hipótesis que implican origen animal en
theCryogenian, como se predijo por muchas fechas moleculares, requieren estos linajes a han persistido a través de glaciaciones
neoproterozoicas geográficamente generalizadas ( Figura 5). sedimentos ediacáricos también registran fluctuaciones masivas fl de
isótopos de carbono, incluyendo algunas anomalías de larga duración (Grotzinger et al.

2011), y la curva de carbono orgánico volátil se mantuvo a través de la Cambrian temprano. Las concentraciones de calcio en
los océanos muestran otra tendencia geoquímica importante a través de la ráfaga principal de la explosión cámbrica, uno que
tiene una consecuencia clara para esqueletos de animales. El Cámbrico fue testigo de un aumento de varias veces en calcio
oceánica, que coincidió con una proliferación de animales skeletonized (Kouchinsky et al. 2012). Un cambio en las proporciones
entre el magnesio y el calcio en el agua de mar en el Cámbrico temprano ha llegado a ser conocido como una transición de un
mar aragonita a un mar calcita (Porter 2007). Figura 5).

AN INTEGRATED viewof ANIMAL EVOLUCIÓN

Las preguntas abiertas en la filogenia de los animales están ahora bien de fi nido, gracias a los progresos realizados en muchas otras

regiones del árbol, y hay formas claras hacia adelante para tratar de resolverlos. Otros avances vendrán de la utilización e fi ciente de nueva

adquisición de datos enfoques, la mejora de muestreo taxonómico (quizás incluyendo el descubrimiento de linajes de animales previamente

desconocidos), y los métodos analíticos diseñados fi específicamente para hacer frente a los retos planteados por los datos ahora

disponibles. La gran ampliación secuenciación y análisis del genoma es probable que desempeñar un papel central en el tratamiento de

cuestiones abiertas en la filogenia de los animales profunda (GIGA Comunidad de Científicos 2014). Además de resolver cómo las especies

animales están relacionados entre sí, responder a tales preguntas proporcionará una visión muchmore matizada de la evolución del

genoma. El conjunto mínimo de genes del ancestro común reciente la mayoría de los animales que ya es mucho más grande de lo previsto.

En algunos casos, los genes que se creían primer surgen bien dentro de los animales (asociados con especí fi co clados y caracteres) en

realidad preceder a la radiación de los animales.

Amplio muestreo de los datos genómicos, morfológicas y funcionales a través de los animales es fundamental para comprender la

evolución animal, ya que, junto con una filogenia de los animales bien resuelto, que nos permite reconstruir la serie de cambios evolutivos

que llevaron a la diversidad de animales. La extensa homoplasy que ahora es aparente en el árbol de animales indica que muchos

animales que se encuentren en simple

388 Dunn et al.


algunos aspectos, tales como la estructura del sistema nervioso o el número de células, son complejas en otros aspectos, tales como la composición del

genoma. El totalmente arti constructo fi cial de los animales superiores e inferiores es mucho más allá de su utilidad fecha de caducidad.

Como esta revisión espectáculos, muchos de los rasgos que antes se consideraba altamente conservadas son muy variables a través de

diferentes planes corporales en el árbol animal. Esta toma de conciencia no debería ser demasiado de una sorpresa. La mayoría de los intentos

tempranos a la filogenia de los animales determinación presume que era difícil de ganar o personajes pierdan tal como la segmentación, el

sistema nervioso, y las cavidades celómicas y árboles construidos que intentó reducir al mínimo los cambios en estos personajes. Este esfuerzo

se garantiza para llevar a la historia evolutiva más simple posible para estos rasgos, pero no era realmente una prueba independiente de la

historia de estos personajes. Dado que los datos y los análisis adicionales han venido a apoyar con firmeza árboles que contradicen aspectos

de estos escenarios simples, ahora es cada vez más evidente que las historias evolutivas de personajes complejos pueden por sí mismos ser

bastante complejo.

DECLARACIÓN DE DIVULGACIÓN

Los autores no tienen conocimiento de ninguna af fi afiliaciones, membresías, la financiación, o participaciones financieras que podrían ser percibido

como que afecta a la objetividad de esta revisión.

EXPRESIONES DE GRATITUD

Agradecemos a Catriona Munro y Rosalyn precio-Waldman para proporcionar retroalimentación sobre los borradores de este manuscrito.

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Adicional Figura 1. Una visión general de la diversidad animal. El número de especies descritas se estiman a partir de una variedad
de fuentes (GIGA Comunidad de Científicos 2014). Este cladograma es la misma que la mostrada en la Figura 1. Algunos nombres
comunes en inglés se indican en negrita en la columna Descripción.

pa str ce
l

r ia
rre u
te ua d

ra e
ta
de a

si
in
ag
ar
Número de

M
Descripción
especies

medusas peine. carnívoros gelatinosas que se mueven con cilios y captura de presas con células de

Ctenophora 192 pegamento.

Esponjas. filtradores que bombean agua a través de sus cuerpos.


Porifera 8579 1
animales

Placozoa 13 138
Ameba animales con tres capas de células y sin boca o los órganos. Pastan medida que se
mueven a lo largo de superficies sólidas.

Cnidaria
Corales, medusas “verdadero”, y sus familiares. Estos carnívoros presa de captura de células
urticantes únicas, y algunos puerto simbiontes fotosintéticos.

xenacoelomorpha
Gusanos con una sola abertura intestinal que actúa como tanto la boca y el ano.

Echinodermata 7330 estrellas de mar, erizos, estrellas de mar, estrellas de plumas, y los pepinos de mar,

y parientes. Herbívoros, detritívoros, carnívoros y se alimentan por filtración. Natación larvas

y adultos con simetría quíntuple. Cavar o arrastrarse gusanos con cuerpos divididos en una

trompa, cuello y tronco.

hemichordata 118
Deuterostomados
Lancelets. Filtrar la alimentación de los animales se parecen superficialmente a los peces pequeños.

Cephalochordata 33 3.020

filtradores que incluyen especies con una natación renacuajo larvas y adultos sésiles,

Urochordata 64.832 así como otras especies que se nadan libremente toda su vida.

Hagfish, lampreas, y vertebrados. animales altamente móviles con endoesqueletos

Bilateria Craniata 129 5.900 bien desarrollados.

Flecha gusanos. carnívoros natación que capturar presas con espinas venenosas.

Chaetognatha 172 2 21

briozoos
alimentadores de filtro que forma incrustante y la hoja-como colonias.

707 74
3241 380
Entoprocta
Animales pequeños sésiles con un anillo de tentáculos que las partículas de filtro desde el agua.
374

Muy pequeños animales con ciclos de vida complejos que viven en las partes de la boca de langostas.

Cycliophora
285 97 1
Muy diverso grupo de gusanos que incluye especies segmentados y no segmentados.
Annelida Incluye especies sésiles, excavadores, andadores, nadadores, y muchas otras formas.

Mollusca
Las almejas, caracoles, calamares, pulpos conchas, colmillo, chitones, y parientes. Vermiforme y

849 29 sin cáscara animales que son diversos y abundantes.

Protostomia gusanos aplanados. Los depredadores que disparan una probóscide muy extensible en la presa.

Gastrotricha 1280

braquiópodos 388 18 conchas lámpara. filtradores cáscara que se asemejan superficialmente almejas.

animales de gusano con un anillo de tentáculos que se utilizan para la alimentación del filtro. Algunas especies

segregan tubos que las que viven.

Nemertea Pequeño ciliada animales parecidos a gusanos que viven en detritus y sedimentos.

Spiralia
platelmintos
Los gusanos planos. La mayoría de las especies son parásitas, incluyendo tenias y trematodos, pero

muchos otros son de vida libre.

Gnathostomulida gusanos pequeños que viven en los sedimentos marinos, a menudo en zonas con bajos niveles de oxígeno. animales

minuto con relativamente grandes mandíbulas encuentran en manantiales y estanques de agua dulce.

Micrognathozoa
Muy abundantes animales pequeños. En la mayoría de las especies, una corona ciliada crea corrientes

rotíferos de agua para la alimentación y la locomoción.

parásitos reducidos con pocos tipos de células. Búsqueda larvas libres de la natación para los nuevos anfitriones.

orthonectida
parásitos reducidas encuentran en las estructuras de excreción de los cefalópodos.

rhombozoa
Phoronida 1280 19

Priapulida 26 182 gusanos pene. Falo en forma de madriguera gusanos marinos.

Los animales pequeños encontrados en los sedimentos marinos, a veces en zonas pobres en oxígeno.

loricíferos 24 773
espinas elaboradas rodean la boca.

Los animales pequeños encontrados en los sedimentos marinos. Espinas rodean la boca y el cuerpo

Kinorhyncha 361 1168


se divide en 13 segmentos.

Nematoda 177
Los nemátodos. La enorme diversidad de gusanos con muchos ciclos de vida y estilos de vida.

ecdysozoa Nematomorpha
gusanos de pelo. gusanos alargados que parasitan los artrópodos.

Tardigrada
osos de agua. Los animales pequeños, con cuatro pares de miembros, encontrar en una variedad de
hábitats. Son muy resistentes al estrés y pueden sobrevivir a la desecación prolongada y la exposición a la
radiación.

gusanos de terciopelo. Carnivires que la captura de presas por disparos de cola de glándulas

Onychophora especializadas.

Artrópodos > 1200000


Insectos, crustáceos, arañas, ciempiés, y parientes. animales altamente
abundantes y diversas con exoesqueletos bien desarrollado.

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