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INTRODUCCION
Las enzimas funcionan como
catalizadores, que son sustancias que
facilitan (acelerar) reacciones sin llegar
a entrar en la reacción. Se utilizan una
y otra vez, y una sola molécula de
enzima puede mediar miles de
reacciones en un solo segundo. Incluso
reacciones simples, como la disolución
de dióxido de carbono en el agua no
tendría lugar en gran medida por sí
sola. Pero podemos hacer que se
disuelva en el agua en concentraciones
más altas a alta presión. Las bebidas
carbonatadas tienen CO2 a alta
presión. Al soltar la presión al retirar la
tapa, un montón de burbujas de CO2
se liberan. Pero en sistemas biológicos
la disolución de CO2 se lleva a cabo en
condiciones normales a una tasa más
de 10,6 veces mayor que la de las
reacciones no catalizadas. Esto es
posible gracias a una enzima llamada
anhidrasa carbónica, que interviene en
la reacción. Del mismo modo, todas las
reacciones en los sistemas biológicos
son mediados por una o más enzimas y
así las reacciones tienen lugar a
velocidades más altas.
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Las enzimas son biocatalizadores que controlan casi todas las reacciones celulares. Un
catalizador es un compuesto que acelera una reacción química sin sufrir ningún cambio en la
calidad o cantidad. Las enzimas son proteínas globulares, cada uno con una estructura
específica (conformación nativa), función, distribución de las cargas eléctricas, y la geometría
de la superficie cuya especificidad depende de su estructura terciaria. La estructura terciaria
determina la forma tridimensional. Ellos son responsables del control de una sola reacción y
por tanto son responsables por el control del metabolismo. Hay alrededor de 700 enzimas en
una célula procariota típica y hay miles de enzimas en una célula eucariota.
Las enzimas funcionan como catalizadores, que son sustancias que facilitan (acelerar)
reacciones sin llegar a entrar en la reacción. Se utilizan una y otra vez, y una sola molécula de
enzima puede mediar miles de reacciones en un solo segundo. Incluso reacciones simples,
como la disolución de dióxido de carbono en el agua no tendría lugar en gran medida por sí
sola. Pero podemos hacer que se disuelva en el agua en concentraciones más altas a alta
presión. Las bebidas carbonatadas tienen CO2 a alta presión. Al soltar la presión al retirar la
tapa, un montón de burbujas de CO2 se liberan. Pero en sistemas biológicos la disolución de
CO2 se lleva a cabo en condiciones normales a una tasa más de 10,6 veces mayor que la de las
reacciones no catalizadas. Esto es posible gracias a una enzima llamada anhidrasa carbónica,
que interviene en la reacción. Del mismo modo, todas las reacciones en los sistemas biológicos
son mediados por una o más enzimas y así las reacciones tienen lugar a velocidades más altas.
Las enzimas operan en los reactivos, los cuales son conocidos como Y YY, para luego
convertirlos en productos. La reacción puede requerir energía o puede liberar energía. La
enzima no se ve afectada por la reacción.
A + B + Enzima AB + Enzima
Las reacciones químicas dependen de la energía de los sustratos suficiente para causar que las
moléculas se mueven y por lo tanto chocan. Esto se logra generalmente con el calor.El calor
aumenta el movimiento de las moléculas y hace que la colisión sea más probable. El calor
necesario para lograr esto es a menudo inadecuado dentro de una celula. Las enzimas pueden
ser utilizadas en lugar de calor para aumentar la probabilidad de que los reactivos se chocan
en la posición correcta. Las enzimas juntan los reactivos y los mantiene en la posición correcta
con respecto a la otra. Las reacciones se producen entre los átomos e implican cambios en la
distribución de los electrones. Antes de entrar en detalles sobre el mecanismo de acción de la
enzima, vamos a discutir la velocidad de una reacción.
VVelocidaddeaeacció
La velocidad de reacción se define como la velocidad con la que ocurre una reacción. La
velocidad de una reacción se puede expresar de dos maneras. Se puede expresar en términos
del producto formado o el sustrato consumido. La tasa o velocidad de una reacción también
puede ser definida como la cantidad de producto formado por unidad de tiempo (por segundo
o por minuto) o la cantidad de sustrato consumido por minuto. La cantidad puede ser
expresada en miligramos (mg) o microgramos (ug), y también se puede expresar en moles (M),
milimoles (mM), o micromoles (lM).
V
Velocidad de una reacción = cantidad de producto formado por minuto
En el caso de las reacciones mediadas por enzimas, la velocidad de reacción suele ser
representado como actividad de la enzima, que se relaciona con la cantidad de enzimas. La
cantidad de las enzimas se expresa en unidades. Es la unidad internacional (UI) para expresar
la cantidad de enzimas. Una unidad de las enzimas se define como la cantidad de enzimas
necesarias para convertir 1 lM de sustrato a producto o para producir un lM producto por
unidad de tiempo en condiciones fisiológicas (temperatura ambiente, presión normal, y el pH
fisiológico).
Vaseimassoaltameteespecificas
Las moléculas de la enzima, en comparación con las moléculas de sustrato, son muy grandes.
Las moléculas de sustratose unen a la moléculas de la enzima en ciertos sitios específicos en la
superficie de la molécula de la enzima, conocidos como uniones de sustrato o ͞sitios activos͟,
para formar el complejo enzima sustrato (complejo ES). El complejo ES finalmente termina en
el producto con el lanzamiento de la enzima libre e intacta. El sitio activo de la enzima es
responsable de las reacciones que conducen a la formación del producto. El sitio activo de la
molécula de la enzima es sólo una porción muy pequeña y es complementaria a la forma
molecular del sustrato. Esta es la razón principal de la especificidad de sustrato de una enzima.
Las reacciones químicas que normalmente se producen se deben a las colisiones moleculares
entre los reactivos o los sustratos, en las reacciones enzimáticas las moléculas de sustrato son
llevados en la proximidad de tenerlos en los sitios activos de la enzima. Así, la molécula
enzimática facilita la reacción entre los sustratos sin ninguna colisión entre ellos. La capacidad
de una molécula de la enzima para acelerar una reacción es en varios órdenes de magnitud
mayor de lo normal que los catalizadores inorgánicos.
Vecaismodeaccióeimática
Las reacciones implican la realización y la ruptura de enlaces. Algunos enlaces deben ser
quebrado en el inicio de una reacción, y esto requiere de energía. No importa que tan
exergónica (reacciones que proceden a la liberación de energía) pueda ser la reacción global,
algo de energía debe ser añadida al principio para romper los enlaces necesarios y conseguir
que empieze la reacción (por ejemplo, el rasgado de papel, la chispa en el cilindro). Esta es la
energía de activación (Ea). La energía de activación puede ser definida como la energía
necesaria para que una molécula tome parte en una reacción. Esta energía es suministrada a
menudo en forma de calor, pero esto puede no ser práctico en una celula.
Todas las moléculas orgánicas contienen energía que puede ser liberado por la
descomposición de la molécula. Tal reacción sería fuertemente exergónica, y no espontánea,
porque la energía de activación debe ser suministrada para conseguir que empiece la reacción
u ANTHONY MARCO ORTIZ HUANQUI
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Vfectodelacocetaciódesstato
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La concentración del sustrato es uno de los factores que afectan a la velocidad de una reacción
enzima-catalizador. La velocidad de una reacción catalizada por la enzima a diferentes
concentraciones de sustrato se puede medir, y los valores se pueden representar en un gráfico
con la concentración de sustrato sobre el eje X y su velocidad correspondiente en el eje Y. Se
puede observar en el gráfico que a medida que la concentración de sustrato aumenta hay un
correspondiente aumento en la velocidad de reacción. Sin embargo, más allá de una
concentración de sustrato, la velocidad se mantiene constante sin ningún tipo de aumento.
Esta velocidad máxima de una reacción enzima-catalizada en la saturación del sustrato se
llama la Vmax. Una reacción alcanza su Vmax cuando todos los sitios activos de las moléculas
de enzima están saturados con las moléculas de su sustrato de modo que la tasa de formación
de producto estará en su máximo. Hay una concentración de sustrato en el que la reacción
alcanza su Vmax. Del mismo modo, hay una concentración de sustrato en el que la velocidad
de la reacción es la mitad de la Vmax. Esta concentración de sustrato es una constante para
una enzima en particular y que es conocida como Km o constante de Michaelis-Menton . El
valor Km de una enzima es inversamente proporcional a la afinidad de la enzima a su sustrato.
Si el valor de Km de una enzima es baja indica su alta afinidad hacia el sustrato. La relación
entre la V, Km, Vmax, y la concentración de sustrato [S] se puede representar por una
ecuación, la ecuación de Michaelis-Menton
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Vfectodelacocetaciódelaeima
VfectodelatempeataelpH
Las enzimas siempre muestran la temperatura típica y óptimo de pH que son características de
esta enzima y apropiado para su función. La mayor parte de la enzima trabaja en el pH
fisiológico, que es de 7,5, a pesar de que su pH óptimo es diferente. las enzimas de mamíferos,
por ejemplo, siempre muestran temperaturas optimas de alrededor de 37 ° C mientras que las
de los peces de hielo alrededor de 0 ° C. La mayoría de las enzimas se desnaturalizan a 45 ° C o
menos, pero no los de los organismos termófilos.
Vlasificaciódelaseimas
Las enzimas se clasifican en seis grandes grupos o clases sobre la base de las reacciones que
catalizan. Se enumeran en la Tabla 5.3, junto con la reacción que catalizan.
Inhibición de l enzim
Las enzimas pueden ser reguladas de varias maneras por la temperatura y el pH como se
mencionó anteriormente, o por el control de la síntesis o de forma local (es decir, después de
su síntesis). Estamos interesados en este último aquí. Hay ciertos compuestos llamados
inhibidores de la enzima, que inactivan la enzima de forma permanente o temporal. Hay
muchos tipos de inhibidores. Algunos son perjudiciales (venenos) y algunos son importantes
mecanismos de regulación. Algunas inhibiciones son mecanismos de control deliberado, y
algunos son perjudiciales para el organismo. Las enzimas se han inactivado por alguna
molécula (un inhibidor) que cambia su forma o bloquea el sitio activo.
a iidoescompetitivos
Estas son moléculas que se unen de forma reversible o irreversible al sitio activo. Ellos
compiten con el sustrato para el espacio en el sitio activo. La mayor parte de origen natural
inhibidores competitivos son irreversibles.
i ompetidoevesile Estos competidores no son las moléculas de sustrato, pero
las moléculas similares a las moléculas de sustrato. Por lo tanto, compiten con el substrato
para ocupar el centro activo de la molécula enzimática. Si están en alta concentración, que
esencialmente puede inactivar la enzima. Estos son de escasa importancia en los sistemas
naturales. La competencia es reversible y el competidor puede ser abrumado por la alta
concentración de sustrato. Por ejemplo, el ácido fumárico es el inhibidor competitivo de la
enzima deshidrogenasa succínico. La estructura del ácido fumárico es similar a la del ácido
succínico, el sustrato real de la enzima.
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ompetido ievesile El competidor y el sustrato compiten por el sitio activo,
pero el competidor ocupa el sitio activo de forma permanente por lo tanto desactiva la
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En el control alostérico de la molécula del producto final a menudo actúa como un inhibidor de
una de las enzimas en la vía, por lo general el primero.
Cuando las altas concentraciones del producto final se acumulan, algunas de ellas reacciona
con las enzimas por primera vez en su sitio de reglamentación y hacerlo inactivo. Esto se
traduce finalmente en una disminución en la concentración del producto. Cuando esto ocurre,
el inhibidor se retirará del sitio de reglamentación y la enzima se activa de nuevo. Este es un
ejemplo de retroalimentación negativa. Este es un tipo de reacción que veremos una y otra vez
en la biología, en todos los niveles de la célula a los ecosistemas. La retroalimentación negativa
impide que las reacciones fuera de control. El termostato de los aires acondicionados, hornos,
ofactoes
Las proteínas se asocian a menudo con grupos de otras sustancias químicas conocidas como
cofactores o grupos prostéticos. Las enzimas no son una excepción. A menudo las moléculas,
átomos, iones o otros como las proteínas son necesarias para el funcionamiento de las
moléculas de enzima. Estos pueden ser una parte permanente de la molécula, como la
mayoría de los iones (Zn, Mg, Fe) o puede ser sólo temporalmente asociados a la proteína. Los
pequeños grupos , prostéticos orgánicos son a menudo llamados coenzimas. La mayoría de las
coenzimas son derivados de vitaminas.
oeimas
Los coenzimas son cofactores orgánicos no proteicos, termoestables, que unidos a una
apoenzima constituyen la holoenzima o forma catalíticamente activa de la enzima. Tienen en
general baja masa molecular (al menos comparada con la apoenzima) y son claves en el
mecanismo de catálisis, por ejemplo, aceptando o donando electrones o grupos funcionales,
que transportan de un enzima a otro.
ecaismodeacciódelascoeimas
El mecanismo de acción básico de las coenzimas es el siguiente
Este último paso es esencial para no agotar la dotación de coenzimas de una célula ya que las
enzimas junto con las que actúa no pueden realizar la reacción química sin el concurso de su
coenzima.
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iV iticaimática
La velocidad de una reacción puede medirse monitoreando la formación del producto o por la
desaparición del sustrato. Una cantidad específica de enzimas se le permite interactuar con un
exceso de sustrato por un período específico de tiempo. El producto formado puede medirse
mediante la explotación de cualquiera de sus características físicas o propiedades químicas,
tales como el desarrollo del color, la absorbencia a una longitud de onda particular de la
radiactividad de la luz, etc Por ejemplo, si el producto que se forma es de color o se puede
desarrollar cualquier color con algún otro reactivo, la intensidad del color puede ser medido
por un espectrofotómetro de absorción. La reacción mediada por la enzima tiene que llevarse
a cabo bajo condiciones fisiológicas, proporcionando un buffer de pH adecuado y la
temperatura óptima por lo general entre 20 ° C y 37 º C. También es necesario establecer
cofactores y los iones de metal esencial para las enzimas específicas. Todos estos factores
fisiológicos tienen que ser mantenidas in vitro para mantener la proteína en su conformación
específica en tres dimensiones y estado activo. Cambios en algunos de estos parámetros, en
particular factores como la temperatura, el pH y fuerza iónica puede destruir la
conformación de la enzima o de la estructura tridimensional. Este cambio de conformación en
la estructura tridimensional de una enzima seguido por la pérdida de actividad se denomina
desnaturalización.
La cinéic enzimáic estudia la velocidad de las reacciones catalizadas por enzimas. Estos
estudios proporcionan información directa acerca del mecanismo de la reacción catalítica y de
la especifidad del enzima. La velocidad de una reacción catalizada por un enzima puede
medirse con relativa facilidad, ya que en muchos casos no es necesario purificar o aislar el
enzima. La medida se realiza siempre en las condiciones óptimas de pH, temperatura,
presencia de cofactores, etc, y se utilizan concentraciones saturantes de sustrato. En estas
condiciones, la velocidad de reacción observada es la velocidad máxima (Vmax). La velocidad
como ya hemos dicho se puede determinar bien midiendo la aparición de los productos o la
desaparición de los reactivos
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Los estudios sistemáticos del efecto de la
concentración inical del sustrato sobre la actividad
enzimática comenzaron a realizarse a finales del siglo
XIX. Ya en 1882 se introdujo el concepto del complejo
enzima-sustrato como intermediario del proceso de
catálisis enzimática. En 1913, Leonor Michaelis (foto de
la izquierda) y Maud Menten (foto de la derecha) desarrollaron esta teoría y
propusieron una ecuación de velocidad que explica el comportamiento cinético de los
enzimas.
Para explicar la relación oservada entre la velocidad inicial (v0) y la concentración inicial de
sustrato ([S]0) Michaelis y Menten propusieron que las reacciones catalizadas enzimáticamente
ocurren en dY epY En la primera etapa Ye fm el cmplej enzimY Y y en la
segunda, el complejo enzima-sustrato da lugar a la fmción del pd c, liberando el
enzima libre
En este esquema, k1, k2 y k3 son las constantes cinéticas individuales de cada proceso y
también reciben el nombre de cnYneY micYcópicY de velcidd. Según esto, podemos
afirmar que
ÿV V0V1V234V254V
ÿV V0V1V2354V
ÿV 6V0V16V2354V
Se puede distinguir entre enzim libe (E) y enzim nid l Y Y (ES), de forma que la
cncención l de enzim, [ET], (que es constante a lo largo de la reacción) es
Como [E] = [ET] - [ES], resulta que v1= k1[S] [ET] - k1 [S] [ES]
Este modelo cinético adopta la hipóeYiY del eYd eYcini, según la cual la
concentración del complejo enzima-sustrato es pequeña y constante a lo largo de la reacción
(Figura de la derecha). Por tanto, la velocidad de formación del complejo enzima-sustrato (v1)
es igual a la de su disociación (v2+ v3)
v1 = vi + vë
Además, como [ES] es constante, la velocidad de formación de los productos es constante
v = v3 = k3 [ES] = constante.
Ü
v = v3 = k3 [ES] =
Para cualquier reacción enzimática, [ET], k3 y KM son constantes. Vamos a considerar dos casos
extremos
ÂV À cncencineY de Y Y peq eñY ([S] << KM) v = (k3 [ET]/KM) [S]. Como los
términos entre paréntesis son constantes, pueden englobarse en una nueva constante,
kobs, de forma que la expresión queda reducida a v = kobs [S], con lo cual la reacción es
un pceY cinéic de pime den.
un pceY cinéic de den ce. Además, tanto k3 como [ET] son constantes, y nos
permite definir un nuevo parámetro, la velcidd máxim de l ección (Vmax) Vmax =
k3 [ET], que es la velocidad que se alcanzaría cuando todo el enzima disponible se
encuantra unido al sustrato.
ÿV La pendiente es KM/Vmax
ÿV La abscisa en el origen (1/v0 = 0) es -1/KM
ÿV La ordenada en el origen (1/[S]0 = 0) es 1/Vmax
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http//www.ehu.es/biomoleculas/enzimas/enz3.htm#e