Documenti di Didattica
Documenti di Professioni
Documenti di Cultura
2. Clicar em Scan New Images (normalmente já está habilitado) e em Start Expert Mode.
1
3.1. Clicar em File.
3.2. Clicar no botão New
3.3. Selecionar o diretório D.
3.4. Nomear o banco de dados.
3.5. Clicar em Create.
SELECIONAR OS LASERS
1. Clicar no botão Acquire.
2. Clicar no botão Laser.
2
5. Clicar em Standby para os lasers que requerem tempo para aquecimento (Argon/2) e clicar
em On para os demais (HeNe). Para obter imagens de maior resolução, esperar o
aquecimento dos lasers por 30 minutos para adquirirem estabilidade.
6. Estabelecer a força de saída do laser Argon/2 (Output [%]) em 25%.
FOCALIZAR A AMOSTRA
1. Clicar no botão VIS.
2. Clicar no botão Micro.
3. Selecionar a objetiva:
3.1. Clicar no botão Objective para visualizar as opções disponíveis.
3.2. Clicar na objetiva que se deseja usar. A objetiva selecionada move-se automaticamente
para o caminho do feixe.
Com fluorescência:
1. Verificar se a lâmpada HBO está ligada (botão POWER SUPPLY com luz verde acesa).
3. Colocar a amostra na mesa do microscópio com a lamínula voltada para baixo.
2. Clicar no botão Reflector e selecionar o filtro desejado clicando sobre ele (azul, verde ou
vermelho).
3. Clicar no botão Reflected Light.
4. Usar o cursor do foco (macrométrico e micrométrico) para focalizar a amostra.
5. Buscar região desejada da amostra movendo a mesa em x e y usando o charriot.
4
2. Selecionar Channel Mode.
3. Escolher a configuração Single Track ou Multi Track.
Cada track é uma unidade separada que pode ser configurada independente dos outros
tracks em relação a espelhos dicróicos, filtros de emissão, canais e detectores. Quando um
track está escaneando, o outro está desligado, reduzindo a sobreposição.
Cada track permite selecionar até 2 canais e podem ser definidos, simultaneamente, no
máximo, 4 tracks, ou seja, no máximo 8 canais podem ser ativados e varridos um após o outro
(4 varreduras sequenciais com 2 varreduras simultâneas cada).
6
O 1º dicróico (HFT, dicróico do feixe principal) recebe a luz proveniente do laser,
direcionando (refletindo) apenas os λ indicados para a amostra e permitindo a passagem de
todos os outros λ.
Na tabela abaixo estão relacionados os espelhos dicróicos encontrados no Microscópio
Confocal do NMM com a função de 1º dicróico:
7
KP545 > 545 < 545nm
NFT635Vis é usado para excitação de fluoróforos em 635 (far red) e
observação no espectro visível (verde e vermelho).
O 3º dicróico tem a função de direcionar a luz refletida pelo 2º dicróico para o canal
Ch2 ou Ch3 e a luz transmitida para o canal ChS ou para Fiber Out. O NFT (dicróico do feixe
secundário) reflete λ menores que o indicado para o canal 2 (Ch2) e transmite (deixa passar)
λ maiores para o canal 3 (Ch3) ou reflete λ menores que o indicado para Fiber out (Ch2) e
transmite (deixa passar) λ maiores para o canal ChS. O filtro KP (short pass filter) absorve λ
maiores que o indicado e transmite λ menores em direção ao canal 3 (Ch3). No Microscópio
Confocal de Varredura a Laser do NMM os espelhos dicróicos das posições 2 e 3 são iguais
conforme visualizado na tabela abaixo.
3º DICRÓICO
ESPELHO REFLETE OS λ TRANSMITE OS λ
None Nenhum Todos
Plate Nenhum Todos
Mirror Todos Nenhum
NFT515 < 515nm > 515nm
NFT545 < 545nm > 545nm
NFT635Vis < 635nm > 635nm
FILTRO ABSORVE OS λ TRANSMITE OS λ
KP545 > 545 < 545nm
8
Filtros de faixa de λ (Band Pass ou BP)
São mais seletivos, pois absorvem λ > e < que os valores indicados, e permitem a
passagem de λ situados no intervalo.
5. Ativar o canal desejado (Ch2 e/ou Ch3) clicando na caixa. Se desejar, é possível alterar a cor
do canal clicando no canal e habilitando a cor desejada.
6. Salvar a configuração (apenas configurações não existentes e com autorização dos técnicos
responsáveis).
6.1. Clicar no comando Config.
6.2. Nomear e clicar em Store.
6.3. Fechar em Close.
9
Usar configuração existente:
1. Clicar no comando Config.
2. Selecionar a configuração desejada na caixa de lista.
3. Clicar em Apply.
10
2. Clicar em Add Track para inserir o número de tracks desejado. Se desejar remover o track,
clicar sobre ele e, em seguida, clicar em Remove.
3. Clicar 2 vezes no ícone Track para nomear adequadamente cada track.
4. Para mudar a posição dos tracks, selecionar o track e clicar nos botões seta para cima ou
para baixo, para deslocar o track para uma posição acima ou abaixo na caixa de lista,
respectivamente.
5. Configurar cada track:
5.1. Selecionar um track (clicar na caixa e sobre o track de modo que fique em azul).
5.2. Selecionar a linha de laser:
Clicar em Excitation.
Marcar a linha de laser desejada.
Definir a força do laser (Laser Power) entre 10-15%.
Clicar em Close para fechar a janela.
11
Selecionar os espelhos dicróicos apropriados como descrito para single track.
Selecionar os filtros apropriados como descrito para single track.
Ativar o canal desejado (Ch2 e/ou Ch3) clicando na caixa. Se desejar, alterar a cor do canal
da mesma forma como descrito para single track.
6. Repetir o descrito no tópico 5 para os demais tracks.
7. Salvar a configuração (apenas configurações não existentes e com autorização dos técnicos
responsáveis).
7.1. Clicar no comando Config.
7.2. Nomear e clicar em Store.
7.3. Fechar em Close.
12
1. Clicar em Scan.
2. Clicar em Mode.
3. Selecionar o modo de varredura como Frame.
4. Definir o tamanho do frame igual a 512 em Frame Size.
O tamanho do frame define o número de pixels da imagem. Por exemplo, uma imagem com
512x512 tem 262.144 pixels, isto é, 262.144 pontos formam a imagem. Imagens com nº de
pixels = 512x512 têm boa resolução para publicação, enquanto imagens com < 512x512 não.
tem boa resolução e aquelas com > 512x512 tem resolução excelente, mas são muito pesadas
e difíceis de serem trabalhadas no photoshop.
5. Caso deseja, clicar no botão Optimal (abaixo de Frame Size) para o software calcular o nº
ideal de pixels, de acordo com a objetiva e com o λ.
6. Ajustar a velocidade de varredura para 6 a 8 µseg/pixel em Scan Speed usando a barra
deslizante. O valor definido será a velocidade utilizada na varredura única (Single).
13
7. Definir o número de Bits por pixel em Data Depth:
Bit (Binary digit) é o número de tons de cinza de cada pixel de uma imagem. Uma imagem
com 8 bits tem 28 = 256 tons de cinza, enquanto uma com 12 bits tem 212 = 4096 tons.
8 para a maioria das imagens, pode ser convertida numa imagem de 12 bits.
LINE: a imagem é formada varrendo-se a cada linha o número de vezes definido em Number.
Resulta num melhor resultado e é o mais usado.
FRAME: a imagem é formada varrendo-se a imagem toda, linha por linha, o número de vezes
definido em Number.
MEAN (média): A imagem é formada pela soma dos pixels de cada varredura dividida pelo nº
de varreduras e apresenta melhor resolução (maior taxa sinal/ruído). É o mais usado.
8.3. Definir o nº de varreduras em Number para o cálculo da média ou da soma. Para
varredura rápida usar 2, para varrer a imagem a ser capturada usar 4 ou 8.
AJUSTAR O PINHOLE
14
1. Selecionar Channels.
2. Selecionar cada canal e definir o tamanho do pinhole em 1 Airy Unit.
OTIMIZAR A IMAGEM
15
8. Ajustar a intensidade de fluorescência:
8.1. Ajustar o ganho do detector (Detector Gain) até que apenas poucos pontos vermelhos
estejam presentes na imagem.
8.2. Aumentar o Amplifier Offset até que todos os pixels azuis desapareçam (imagem cinza
escuro) e, então, torne-o ligeiramente positivo (com poucos pontos azuis).
9. Clicar em Palette.
10. Selecionar No Palette.
16
6. Clicar em Save As.
7. Nomear a imagem em Name.
8. Preencher descrição em Description, se desejar.
9. Clicar em Ok.
17
FUNÇÃO HISTOGRAMA (HISTO)
1. Abrir a imagem.
2. Clicar em Histo.
3. Clicar em Area, Skip Black, Skip White ou Colocalisation de acordo com a forma de
apresentação desejada.
4. Para visualizar os dados na forma de tabela, clicar em Show Table.
Exemplo:
18
1: Pixels do canal 2 (Ch2)
2. Pixels do canal 3 (Ch3)
3. Pixels colocalizados
4. Background
O gráfico de frequência absoluta mostra em cores a freqüência dos pixels.
FUNÇÃO PROFILE
Permite exibir distribuição de intensidades de pixel de uma imagem ao longo de uma linha
reta ou curva.
1. Abrir a imagem.
2. Clicar em Profile.
19
3. Desenhar a linha ou curva na região que se deseja analisar a intensidade de fluorescência.
4. Para visualizar os dados na forma de tabela, clicar em Show Table
VARRER UM Z-STACK
1. Clicar em Z Settings.
2. Clicar em Z Stack.
3. Clicar em Frame.
20
13. Se desejar, clicar em Optimal Interval para que o software calcule automaticamente o nº
e o tamanho das fatias de acordo com a objetiva e tamanho do pinhole.
14. Se desejar, clicar no botão X:Y:Z = 1:1:1 para estabelecer o intervalo Z de forma que o
voxel tenha dimensões idênticas nas direções x, y e z (permite sobreposição exata dos stacks
para se obter uma imagem em forma de cubo).
15 . Clicar no botão Start para registrar o stack.
16. Clicar em Gallery para visualizar todas as fatias.
17. Clicar em Data para inserir a distância em Z (µm) de cada fatia.
16. Salvar o Stack.
IMAGEM 3D E VIDEO
1. Fazer o Z-stack.
2. Clicar em 3D View.
3. Clicar em Projection.
21
COMO FAZER IMAGEM DE DAPI NO CONFOCAL
1. Desligar os lasers.
2. Verificar se a HBO está ligada.
3. Clicar em Micro.
4. Selecionar o filtro para DAPI (azul) em Reflector.
5. Clicar em Reflected Light.
6. Clicar em Config.
7. Clicar em Channel Mode.
8. Selecionar Single Track.
9. Definir NT80/20 como o 1º dicróico.
10. Direcionar toda luz refletida para a amostra para o META, selecionando None como 2º e
3º dicróicos.
11. Clicar em ChS para definir a região do espectro a ser detectada pelo META (azul).
12. Clicar em Scan.
13. Clicar em Channel.
14. Abrir completamente o pinhole.
15. Clicar em Fast XY.
16. Mexer no micrométrico se necessário.
17. Aumentar o ganho até obter imagem.
18. Definir parâmetros de varredura como já descritos anteriormente.
19. Clicar em Single.
20. Salvar imagem.
21. Fazer imagem da mesma região, com os mesmos parâmetros, para os demais
fluorocromos.
22. Salvar imagem.
23. Sobrepor as imagens:
23.1. Na janela LSM 510 - Expert Mode, clicar em Process.
23.2. Clicar em Copy.
23.3. Selecionar a imagem de origem na janela superior e a imagem de destino na janela
inferior.
23.4. Na janela inferior, no campo Channel, selecionar New.
23.5. Clicar em Apply.
22
23.6. Salvar a imagem formada pela sobreposição das 2 imagens.
23