Asignacion de estructura.

Para bll5826.

>bll5826

MAENEAEGGAATEGAEAAPPKNKLKLIIMAVGLLAVLGGGAATWFFFFRHGDDEHHAEAA

PPPKPPAFVEVPDMMVNLAGAPGERVQYLKLKIVLELKEEKQIEAIKPAMPRVTDIFQTY

VRELRSSDLNGSAGIFRLKEELTKRVNAAVAPVQVSAVLFKEVVIQ

- Ingreso la secuencia en FFas03, y me da una lista de 10 hits. Se deben considerar significatvos

los menores de -9.5 (normalmente nombrado en negrita). Selecciono la unica que da buen
score (-15.100), y me lleva a la PDB.

Se corresponde con 6HAQ. La proteina FliL de Vibrio, correspondente con la cristalizacion que
se talizo en el paper de Takekawa2019.

- Ingreso la secuencia en Hmer: dice qye hay un dominio FliL en el C terminal, Que el dominio
transmembrana es del 26-47.

- Ingreso la secuencia en HHpred. DA unicamente dos con buen e-value:6AHP_A y 6AHQ_K.

Para bll6868

>bll6868

MMRLIAAIVALTLVAIGAGALAGLHLFAAAERVADAKKSPTPPPLASSYAGSARLRKLSP

IVTNLAAPANNWARVEASMVTDSMSDEDAGILAAHISEDIVTYLRSASAAQFEGSRGLQH

LRDDLAERANVRSSGKVRELIIETLVIQ

-Corriendo con FFas03 da una unica con score -11.600 que indica que la estructura es 6ahq.
- Corriendo en HHpred da las mismas dos que para FliLs

6AHP_A Flagellar protein FliL; Flagellar motor protein, MOTOR PROTEIN; 2.1A {Vibrio
alginolyticus}

Probabilidad 99.75 E-value 3.8e-20 SS 10.9 Cols 88 Length 110

6AHQ_K

Flagellar protein FliL; Flagellar motor protein, MOTOR PROTEIN; 3.398A {Vibrio alginolyticus}

Probabilidad 99.73 E-value 1.3e-19 SS 11.1 Cols 88 Length 129