La estereoquímica es el estudio de la estructura tridimensional
de las moléculas. Nadie puede entender la química orgánica,
bioquímica o biología sin la estereoquímica. Los sistemas biológicos son bastante selectivos, y con frecuencia discriminan moléculas con diferencias estereoquímicas sutiles. Hemos visto (sección 2-8) que los isómeros se dividen en dos grandes clases: isómeros constitucionales y estereoisómeros. Los isómeros constitucionales (isómeros estructurales) difieren en sus secuencias de enlace; sus átomos están conectados de manera distinta. Los estereoisómeros tienen la misma secuencia de enlace, pero difieren en la orientación de sus átomos en el espacio. Las diferencias relacionadas con la orientación espacial podría parecer intrascendente, pero a menudo los estereoisómeros presentan propiedades físicas, químicas y biológicas notablemente distintas. Por ejemplo, los isómeros cis y trans del ácido butenodioico son un tipo especial de los estereoisómeros llamados isómeros cis-trans isomers (o isómeros geométricos). Ambos compuestos tienen la fórmula HOOC!CH"CH!COOH, pero difieren en la forma en que están distribuidos en el espacio. El isómero cis se conoce como ácido maleico, y el isómero trans como ácido fumárico. Este último es un intermediario metabólico esencial tanto para las plantas como para los animales, pero el ácido maleico es tóxico e irritante para los tejidos.