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El “darwinismo cuántico” de Zurek y la noción de

información

Profesor Eugenio Andrade


Departamento de Biología
Marzo 12 de 2018
Biología y física.
• {Física {Biología}} = mecanicismo
• {Biología {física}} = “vitalismo”

• {Principios generales {Física, Biología}}


• Física = Cuántica, termodinámica
• Biología = latencia, emergencia,
desarrollo, evolución, …

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Física cuántica
1. Indivisibilidad del “quantum” de acción
Transiciones entre estados estacionarios es
discreta.
2. Dualidad propiedades de la materia (onda –
partícula).
3. Potencialidades en la materia. (vector en
espacio de Hilbert).
4. Correlaciones no causales (ERP).
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Biología
1. Indivisibilidad = relación parte/todo
2. Dualismos = (azar, necesidad),
(evolución, desarrollo), (metabolismo,
replicación), (internalismo, externalismo),
(deriva, adaptación), … etc.
3. Potencialidades intrínsecas.
4. Correlaciones multicausales entre: (micro
y macro estados), (genotipos y fenotipos),
(organismos y medio ambiente),
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Niels Bohr 1932
• “La existencia de la vida debería ser
considerada como un hecho elemental sin
explicación posible, como un punto de
partida para la biología, de la misma manera
que el quantum de acción que aparece como
un elemento irracional para la mecánica
clásica constituye con las partículas
elementales el fundamento de la física
atómica.”
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What is Life? Schrödinger (1944)
• “It is by avoiding the rapid decay into the inert
sate of equilibrium that an organism appears so
enigmatic … What an organism feeds upon is
negative entropy (free energy). Or, to put it less
paradoxically, the essential thing in metabolism is
that the organism succeeds in freeing itself from
all the entropy it cannot help producing while
alive”.

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What is Life? Schrödinger (1944)

In manifest contrast with thermodynamic systems, « incredibly


small groups of atoms, much too small to display exact statistical
laws, do play a dominating role in the very orderly and lawful
events within a living organism »

“…New physics should be involved…”

“…It is nothing else than


the principle of quantum theory…”
Light and Life. Szent Györgi (1961)
• “It is common knowledge that the ultimate source of
all our energy and negative entropy is the radiation of
the sun. When a photon interacts with a material
particle on our globe it lifts one electron from an
electron pair to a higher level. This excited state as a
rule has but a short lifetime and the electron drops
within 10-7 to 10-8 seconds to the ground state giving
off its excess energy in one way or another. Life has
learned to catch the electron in the excited state,
uncouple it from its partner and let it drop back to the
ground state through its biological machinery utilizing
its excess energy for life processes”.

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L = 10-35 m T = 10-43 seg

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Bohr y la medición cuántica
• Inseparabilidad:
• Aparato de medida, Propiedades del
sistema cuántico y la Medición.
• La realidad es dependiente del
contexto en que tiene lugar la
observación y la medición

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Bohr y la Medición
• Propiedades como “posición” y “momento” se
hacen reales cuando se miden.
• No existen los electrones, ni los fotones en
ausencia de la medición.
• La medición hace y modifica la realidad.
¿Qué es la realidad?

• “One must never forget that in the drama of existence


we are ourseleves both actors and spectators”
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Many-particle quantum coherence is a phenomenon where two or more particles take on the form of a wave and
combine to act as one large wave. A Bose–Einstein condensate (BEC) consists of a gas cooled to temperatures near
absolute zero, whereby quantum correlations become recognizable on a macroscopic scale and can be observed.
Image created by Lee O'Riordan,

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Engel, G. S., T.R. Calhoun, E. L. Read, T-K. Ahn, T. Manal, Y-C. Cheng,
R.E. Blankenship and G. R. Fleming,
‘Evidence for wavelike energy transfer through quantum coherence in photosynthetic systems’,
Nature, 446 (2007), 782–786.

• “We have obtained the first evidence that remarkably long-lived wavelike
electronic coherence plays an important part in energy transfer processes during
photosynthesis”.

• “The classical hopping description of the energy transfer process is both


inadequate and inaccurate, it gives the wrong picture of how the process
actually works, and misses a crucial aspect of the reason for the wonderful
efficiency”.

• “The remarkably long-lived wavelike electronic coherence can explain the


extreme efficiency of the energy transfer because it enables the system to
simultaneously sample all the potential energy pathways and choose the most
efficient ones”

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A scanning electron microscope image of cryptophytes. A UNSW Australia-led team has
discovered how cryptophytes that survive in very low levels of light are able to switch on and
off a weird quantum phenomenon that occurs during photosynthesis. Credit: CSIRO

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• Green sulfur bacteria transfer photonic energy at
virtually 100% efficiency via a chlorosome
antenna and a pigment protein complex (FMO
complex) (Ishizaki et al., 2010). The energy
transfer did not follow a randomized path but
rather the energy was found in both places at
once, in effect, a quantum superposition state
(Collini et al., 2010).

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Photosynthetic Light harvesting complexes
Quantum coherence over large distances?
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Quantum biology
N. Lambert, Y.Chen, Y.Cheng, C. Li, G. Chen & F. Nori
Nature Physics 9, 10–18 (2013) doi:10.1038/nphys2474

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Interpretación de los muchos universos
(Hugh Ewerett):

• No hay frontera entre lo clásico y lo cuántico.


• El universo es cuántico, no hay observador
externo.
• La superposición siempre se da.
• Cada vez que se da una interacción entre dos
sistemas cuánticos la función de onda se
divide. No hay selección.
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The role of the observer in the Everett interpretation
H. D. Zeh – www.zeh-hd.de (arxiv:1211.0196v3)

El observador puede existir simultáneamente en varias “versiones”


de acuerdo a von Neumann’s.

• A (aparato), S (sistema), O (observador)

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The role of the observer in the Everett interpretation
H. D. Zeh – www.zeh-hd.de (arxiv:1211.0196v3)

Existe un estado relativo del mundo exterior con respecto al


estado físico del observador. Se obtiene una superposición de
diferentes versiones de todos los observadores, descritos por
paquetes de ondas separados, en el espacio de configuraciones, al
igual que hay diferentes observadores en localizaciones diferentes
en el mundo clásico.

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The role of the observer in the Everett interpretation
H. D. Zeh – www.zeh-hd.de (arxiv:1211.0196v3)
• El indeterminismo cuántico refleja los múltiples futuros de
un observador en el mundo cuántico/determinista –
comparable al proceso de división celular en el mundo
clásico.
• La historia del observador se objetiva con respecto a las
versiones de observadores diferentes que se correlacionan
de acuerdo a su entrelazamiento.
• El entrelazamiento entre diferentes observadores es la
misma que hay entre un observador y su aparato de
medición.

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CERRADO
“demonio” No gasta ENERGIA
X “demonio” Ni para medir las
partículas
Ni para controlar el paso
X Eugenio Andrade 38
Información
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ENTROPIA
Cada vez que el “demonio” escoge una molécula extrae 1 bit
de información.

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Enzimas = demonios de Maxwell
(Monod 1970)

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El demonio de Maxwell = agentes
colectores y usuarios de información
(IGUS) W.H. Zurek (1989)
Información = proceso por medio
del cual se generan correlaciones
entre micro-estados y macro-
estados, y entre macro-estados y el
entorno.
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Características de los observadores no
conscientes tipo IGUS
• 1. Un macro-estado delimitado con apertura
selectiva al entorno.
• 2. Componentes discretos cuyo arreglo define
micro-estados.
• 3. Autonomía: habilidad para escoger entre ajustes
alternativos.
• 4. Autorreferencia: micro/macro-estados;
genotipo/fenotipo; fenotipo/entorno;
secuencia/estructura; registros análogo/digital.
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Los IGUS son sistemas
autorreferentes
• Para un observador externo un IGUS actúa de modo
no determinista o al azar.
• Los IGUS “eligen” guiados con la información que
han captado.
• Cada IGUS es único.
• La biología estudia poblaciones de IGUS no
equivalentes que cooperan y compiten.
• Los IGUS se adaptan a un entorno del cual forman
parte y que cambia como resultado de sus acciones.
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Information gathering and utilizing systems (IGUS) provide a general conceptual frame for systems which, as most
living organisms receive data on their environment from sources possibly far away in space and time, store and
process them forming cross-connections even between completely uncorrelated facts, to trigger effects that again can
be spatially and temporally very remote from the IGUS. (Dittrich, 2013).

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Elección indeterminista en contexto funcional

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Prigogine, I. 2001.El fin de las certidumbres. Editorial Taurus.
Energía total de una población de moléculas

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Information as propagation of organization
Stuart Kauffman (2000, 2008)
Actualization of form whenever a constraint acts on an
amorphous matter that tends to expand and vary isotropically.

Among all imaginable forms only a minor fraction are in fact


really possible and attainable in a precise moment of life
history.

The set of all real possibilities that can be reached in one


evolutionary step are dubbed “adjacent possible” and it tends
to growth with the increase of diversity of really existing
entities. Eugenio Andrade 56
“The strange and beautiful truth about the adjacent possible is that its
boundaries grow as you explore those boundaries”.
S. A. Kauffman, Investigations
(Oxford UniversityEugenio
Press, New York/Oxford, 2000).
Andrade 57
• Distinción cuántico-clásico.
• Cuántico: mundo potencial, virtual, interno, invisible,
superposición, indeterminación, potencial informativo, …

• Clásico: actual, real, visible, discreto, externo,


determinación, la información actualizada, …

• La vida transcurre en estados intermedios entre estas dos


situaciones límite.
• La vida refleja en el mundo macroscópico propiedades
cuánticas que se creían exclusivas del mundo
microscópico.
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Problema: ¿cómo relacionar el mundo cuántico con
el clásico? ¿Objetos o propiedades?

El espacio de Hilbert es inmensamente grande.


Principio de superposición = cualquier
combinación lineal arbitraria de estados cuánticos
es posible.

Los estados clásicos constituyen apenas una ínfima


fracción de los posibles.

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¿“Darwinismo clásico” vs “Darwinismo cuántico”?
¿Variaciones al azar? vs ¿Variaciones dependientes de la
interacción con el ambiente?

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El “darwinismo cuántico” es una teoría
sobre la decoherencia
• El medio ambiente “mide” constantemente destruyendo
estados en superposición y preservando los “estados
preferidos o indicadores”.
• El medio ambiente define la “base preferida” (lo que se
mide).
• La mayoría de las superposiciones son eliminadas nunca se
actualizan, solamente se actualizan algunos de los “estados
preferidos o indicadores”.
• Los “estados preferidos o indicadores” constituyen estados
realmente accesibles dentro de los cuales el sistema
“escoge” los que se actualizan.
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¿Objetividad? Selección inducida por el
ambiente (decoherencia cuántica)
• El entorno es un medio para la transferencia de
fotones.
• Los observadores (no conscientes) capturan
fotones (señales informativas) dispersos en el
entorno, emitidos por cosas que existen.
• Si la información capturada es redundante o
repetida en muchas copias, diferentes
observadores capturan la misma información y
llegan a un acuerdo “objetivo” sobre el mundo.
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Decoherencia (Zurek 2008)
• Cuando un sistema cuántico esta
entrelazado con una entidad presente en
su medio ambiente, las propiedades de
esta última determinan el tipo de
información potencial que pasa del
sistema cuántico al medio ambiente
(actualiza).
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Entrelazamiento
• Es imposible aislar el sistema compuesto -{sistema
cuántico/ aparato de medida}- de las influencias
externas.
• El entrelazamiento S y E (Obs+ ApM) da lugar a
mezcla estadística de estados punteros clásicos.
(Autorreferencia).
• El sistema cuántico pierde su estado original separado,
y el sistema compuesto -sistema cuántico/medio
ambiente- tendrá un estado definido, así sea
deslocalizado.
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Propuesta alternativa:
ni Copenhague, ni MWI

• La interacción o medición, genera ramas evolutivas o


“historias de vida consistentes”, fenómenos (más o
menos) decoherentes que aparecen como
actualizaciones reales de las posibilidades de un universo
cuántico.

• Los IGUS forman una red de observadores


interactuantes, no equivalentes que perpetuamente
generan observables exitosos y fallidos.
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Is Quantum Darwinism (a process of
multiplication of information about
certain favored states that seem to be
a “fact of quantum life”) in some
way behind the familiar natural
selection? I cannot answer this
question, but neither can I resist
raising it. (Zurek 2009)
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• (Neo)-lamarckismo: es imposible
separar la generación de variantes de las
condiciones de selección impuestas por
el contexto medio ambiental, razón por la
cual McFadden, Ogryzko, Asano, etc.,
recurren a esta formulación para tratar el
problema la evolución adaptativa.

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¿“Darwinismo clásico”? vs ¿“darwinismo cuántico”?
¿Variaciones al azar? vs ¿variaciones dependientes de la
interacción con el medio ambiente?

• Pero:
• 1. No hay independencia del medio ambiente en la
producción de las formas. El medio ambiente genera los
“estados indicadores o preferidos”, a partir de los cuales se
elige el que se actualiza.

• 2. La selección darwiniana actúa sobre poblaciones de


formas actualizadas, las cuales constituyen un subconjunto
pequeño del total de las posibles. Aquí se trata de estados
virtuales individuales.
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Sistemas complejos adaptativos poseen un
“modelo interno” del medio ambiente
• Tres variables: S, el efecto de E sobre el S, y el efecto de S sobre E.
• S posee representación interna de E.
• S incorporan información de E.
• S responden a los cambios de E.
• Variables:
• 1) S
• 2) E ⇒ S
• 3) S ⇒ E

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“Coherent states via decoherence”.

• El entrelazamiento sobrevive la decoherencia, si el


estado hace parte de la base preferencial.

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Una superposición estable en (1) se hace inestable en (2), de modo
que se convierte en uno de los estados de la nueva base preferencial.
La adaptación ocurre por reducción de la función de onda.

• Cambio de medio ambiente y adaptación

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Elección entre estados definidos por el medio
ambiente
• La reducción del vector de estado ocurre con
respecto a cierta base (determinada por el
aparato de medición).
• La reducción es una elección “aleatoria” entre
un conjunto de resultados posibles está
determinado por las condiciones del medio
ambiente.

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Mutación adaptativa
El estado de la célula puede descomponerse en una
combinación lineal de los valores propios del operador
correspondiente
|Ψ> = c1|ψ1> + c2|ψ2> + c3|ψ3>
En otro medio selectivo corresponderá a un operador
diferente y por tanto a una descomposición diferente del
mismo vector de estado :
|Φ> = b1|φ1> + b2|φ2> + b3|φ3>

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Neolamarckismo
• Los variantes no prexisten independientemente antes de
la selección, sino como componentes de un “estado
puro” individual en superposición.

• La selección inducida por el ambiente ocurre en una


“población” de estados virtuales de cada objeto
individual.

• Mientras que la selección darwiniana se da sobre una


población de individuos variantes prexistentes generada
al azar (“estados mixtos”).
Eugenio Andrade
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The basis of mutational change: How do mutations arise: the fluctuation test
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Información = Epigénesis
Conrad Hal Waddington (1905- 1975)
Epigenetic landscape. The Strategy of the Genes: A Discussion of Some Aspects of Theoretical Biology
(p. 29), by C. H. Waddington, 1957, London: Allen & Unwin. Copyright 1957 by Allen & Unwin.

Eugenio Andrade 93
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Adaptación del paisaje epigenético de Waddington Esther Thelen y Linda B. Smith . A dynamic systems approach to the development of
cognition and action. Cambridge, MA: Bradford Books/MIT Press. (1994).
El desarrollo se representa como una serie de atractores que evolucionan y se disuelven con diferentes grados de estabilidad.

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Cell as an open quantum(-like) system
Modelo de Asano et al.:
1) Generación de epimutaciones inducidas por el medio ambiente.
2) Selección de las epimutaciones.
3) Estabilización del fenotipo.

La célula elige consistentemente el patrón de las epi-mutaciones


que la conducen a su acoplamiento con el medio circundante.
A medida que la célula se hace más estable se entrelaza con el
ambiente, pasando de la “superposición cuántica” a la
“decoherencia”.

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Cell as an open quantum(-like) system
• Selección sucesiva de estados físicos estructurales y
funcionales, inducidos por el medio ambiente interno
y externo.

• Los estados epigenéticos se entrelazan con el medio


ambiente conformando un sistema unificado
“célula/medio ambiente” en el cual la célula pierde su
individualidad.

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Cell as an open quantum(-like) system
• Hepi: espacio de los estados QL del epigenoma
celular (información estadística sobre posibles
cambios fenotípicos).

• Henv : espacio de los estados QL del medio


ambiente.

• Hepi ⨂ Henv: espacio de estado del sistema


compuesto Eugenio Andrade 97
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Gorini-Kossakowski-Sudarshan-Lindblad Equation

Transición de estados de incetidumbre superposiciones QL a


probabilidades clásicas. Markovian aprox:

H: Hamiltoniano que describe la dinámica interna del estado epigenético de una


célula aislada. Es una magnitud sin dimensiones.

W: operador que describe la interacción de S con el E. W está determinado por las


propiedades del E, incluyendo el estado inicial del E.

ᵧ: Constante con dimensiones de tiempo, y que determina las escalas temporales


de evolución. La constante de Plank se elimina por cuanto no se están
describiendo procesos físicos reales al interior de la célula.

Representación mediante de la dinámica interna del estado epigenético o sea la


contribución de las fluctuaciones epigenéticas en las células.
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Cell as an open quantum(-like) system
A diferencia con la dinámica de Schrödinger: el término adicional determinado
por el E puede suprimir las fluctuaciones conduciendo el sistema a la solución
correspondiente al estado estacionario,

El estado estacionario es el resultado de una evolución epigenética en el Env


(representado por el operador W): La distribución de probabilidad limite:
describe la distribución de probabilidad de las epimutaciones que ocurren en una
población de células como consecuencia de la interacción con E.
El fenotipo estable aparece con la supresión de las fluctuaciones internas.
La decoherencia es el proceso de transición entre el estado de superposición, en
una mezcla estadística clásica de pocas posibilidades.
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La dinámica de una epimutación:
Consideremos el gene g y asumamos que la célula
interactúa con un medio ambiente tal que ocurre una
epimutación, μ en g.
La epimutación cambia los niveles de expresión de g.
Ignorando la presencia de otros genes y la correspondiente
expresión modelamos la mutación μ considerando un
espacio bidimensional de estados: Hepi (espacio qubit).
Los estados de (epi)mutación (m) y preservación (p) de la
estructura epigenética relacionada a la expresión de g se
representa por dos vectores ortogonales |m> y |p> .
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La dinámica de una epimutación
El estado QL es representado como superposición

Eugenio Andrade 101


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•Mutations are produced
by organism/environment
direct interaction
Lamarck

•Mutations are produced


at random but fixed by the
environment

•Mutations are produced


at random and fixed by
selection and/or random
genetic drift
Ni darwinismo, ni lamarckismo clásicos
• “Because developmental mechanisms exhibit,
variously, nonlinear, plastic and self-
organizational properties, evolutionary
transitions can be “saltational” (i.e.,
phenotypically abrupt), rapid, and influenced
by environmental change in a direct (i.e.,
Lamarckian) fashion and not just as a
consequence of selection of marginally
favorable variants” Newman (2009)
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Interpretación en la medición cuántica
Inseparabilidad: sistema observador/entorno
• El medio ambiente que es medido incluye información
sobre el sistema observador que lo mide.
• El sistema observador a su vez posee una representación
interna del medio ambiente que lo mide.
• La identificación de nuevos observables durante la
medición genera la posibilidad de considerar al sistema
y su entorno como un nuevo sistema que puede ser
medido.

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• Implicaciones para la biología teórica

• La información no es únicamente una noción epistémica


sino que además se refiere a una realidad ontológica, es
decir, a una actividad intrínseca de la naturaleza que da
forma a la “materia-energía” de acuerdo a procesos
físicos (termodinámicos y cuánticos) y al mismo tiempo,
semióticos, en el sentido que depende de la emergencia
de sistemas organizados que «interpretan» diversos
factores que coinciden contingentemente en un espacio-
tiempo definido.

Eugenio Andrade 106


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Nociones de Información
• Interpretación de perturbaciones
físicas como señales que orientan la
elección e acciones proyectadas al
medio externo y los ajustes
estructurales internos.
• Evolución y desarrollo a nivel
cosmológico, biológico, social y
cultural. Eugenio Andrade 108
IGUS as living quantum systems
• Los eventos morfo-genéticos emergen como
ajustes al medio ambiente al que intentan
adaptarse.
• La incertidumbre disminuye en el proceso de
formar nuevas estructuras emergentes con el
aumento de correlación entre el sistema y su
entorno.
• Sistemas semi-clásicos surgen de las elecciones
hechas por los IGUS de entre los ajustes
Eugenio Andrade 109
realmente posibles.leandradep@unal.edu.co
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Eugenio Andrade 111
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Eugenio Andrade 112
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EUGENIO ANDRADE 113
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EUGENIO ANDRADE 114
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Biological Observer-Participation and Wheeler's 'Law without Law'
Brian D. Josephson
(Submitted on 24 Aug 2011 (v1), last revised 3 Oct 2011 (this version, v4)).

• It is argued that at a sufficiently deep level the conventional quantitative


approach to the study of nature faces difficult problems, and that
biological processes should be seen as more fundamental, in a way that
can be elaborated on the basis of Peircean semiotics and Yardley's
Circular Theory. In such a world-view, Wheeler's observer-participation
and emergent law arise naturally, rather than having to be imposed
artificially. This points the way to a deeper understanding of nature, where
meaning has a fundamental role to play that is invisible to quantitative
science.
• Comments: 9 pages. Based on talk at ACIB '11 conference. To appear in "Integral
Biomathics: Tracing the Road to Reality", Proceedings of iBioMath 2011, Paris and ACIB
'11, Stirling UK, P. L. Simeonov, L. S. Smith, A. C. Ehresmann (Eds.), Springer-Verlag,
2012. v2: new subsection added; v3: URLs included in references; v4: Circular Theory and
other concepts elaborated
• Subjects: General Physics (physics.gen-ph)
• Cite as: arXiv:1108.4860 [physics.gen-ph]

EUGENIO ANDRADE 115


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EUGENIO ANDRADE 116
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KALEIDOSOPIC IN CAMERA LIGHT PAINTINGS | TACKY
31.01.2014

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