El proceso de hidrólisis en los ribosomas de las células eucariotas es catalizado por un complejo de

dos factores de liberación en las células eucariotas el cual es mediado por los factores; “ eRF1 y
eRF3” (proteínas unidas a codones de terminación) necesarios para facilitar la etapa de terminación
en el proceso de traducción, un estudio realizado con calorimetría de titulación ha determinado las
interacciones termodinámicas existententes, estos resultados exhiben la afinidad por una unión
estable en presencia o ausencia de GTP, GDP y Mg​2+​.
El eRF1 a través de su extremo N-Terminal posibilita la identificación de los codones de terminacion
UAG, UAA o UGA en el proceso de terminación en la traducción eucariota ademàs de tener un papel
indispensable en la transferencia de una señal para la activaciòn de la hidrólisis de la peptidil
transferasa (tRNA) en el centro para poder permitir la liberación de una cadena polipeptídica
naciente.
Por otra parte el factor eRF3 es un enzima GTPasa dependiente del ribosoma y del eRF1. la unión
entre los factores es mediada en los dominios C- terminales de ambos.
Existe la posibilidad de un aumento en la afinidad del eRF1 con un ribosoma cargado con un codón
de parada estimulada por parte del eRF3 similar a la manera en que actúa el EF-Tu en las células
procariotas el cual aumenta de igual manera la afinidad del aminoacil-tRNA al sitio A programado
con un codón de sentido.

El eRF3 unido a GDP presenta una débil dependencia cuando existe presencia de Mg​2+​.
Los factores de liberación eRF1 y eRF3 se unen entre sí independientemente de la presencia o
ausencia de nucleótidos de guanina o de magnesio. El complejo eRF1-eRF3 se une tanto a GDP
como a GTP mostrando preferencia por este último.
En el complejo eRF1-eRF3-GDP, GDP puede ser intercambiado por GTP y viceversa
(el desplazamiento de GDP por GTP se da con mayor facilidad que la reacción contraria).

Se sugiere una secuencia de interacciones de eRF3 con sus ligandos, la cual se divide en dos
posibles rutas: en una de las propuestas, el eRF1 se une al complejo eRF3-GDP con lo que
probablemente se modifica la conformación de eRF3. Dado que eRF3 es más afín a la asociación
con GDP y la constante de asociación para la reacción es 3.5 veces mayor que para la asociación
de eRF3 con eRF1 (segunda ruta alternativa), el complejo ternario eRF1-eRF3-GDP puede ser
formado más fácilmente que el complejo eRF1-eRF3.
En concentraciones fisiológicas de Mg​2+​, la afinidad de GTP por eRF1-eRF3 es seis veces mayor que
en ausencia de GTP. Para GDP, la unión con Mg​2+​ está ausente.
Cualquiera que sea la ruta que tome lugar, el producto final es el complejo ternario eRF1-eRF3-GTP.
Dado que Mg​2+ estabiliza a dicho complejo, se puede considerar que la estructura es más bien un
complejo cuaternario que incluye al Mg​2+​ coordinado con GTP y eRF3.

El eRF3 se une a GDP independientemente de la presencia o de la ausencia de eRF1 mientras que

el GTP se une solamente al complejo eRF1-eRF3. El complejo cuaternario eRF1-eRF3-GTP-Mg​2+ se
une al complejo de pre terminación ribosomal.