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Factores exógenos:
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REPARACIÓN DIRECTA
1. Fotorreactivación:
Efecto: originan dímeros de pirimidina ciclobutano (CPD), pirimida (6, 4) y pirimidonina (6, 4 PP)
Segundo efecto:
Es una reparación por fotorreactivación de la FOTOLIASA, pues necesita de luz de 400-500nm para
activarse. Esta enzima reconoce los dímeros en la oscuridad y se une a ellos, al estimularse con la luz,
rompe los enlaces covalentes de timina y los revierte, reparando el ADN. Después, se disocia y se
libera del ADN ya reparado.
De manera que el cromóforo variable capataría la luz y el FAD sería el centro de reacción fotoquímica —
transferencia de un electrón al ciclobutano—.
2. ALQUITRANSFERENCIA
Alquilo: separación de un átomo de hidrógeno de un hidrocarburo saturado o
alcano, para que así el alcano pueda enlazarse a otro átomo o grupo de átomos.
Por ejemplo:
Metilación de los restos de guanina
Antes: restos de guanina
Después: O-metilguanina
Enzima: alquitranferasas
Proceso: Desplazan el grupo metilo desde la guanina al centro activo de la
cisteína, llevando a la activación irreversible de la proteína O-metilguanina-ADN
metiltransferasa
3. DESMETILACIÓN OXIDATIVA
Primera causa: factores endógenos
Estrés oxidativo
Inflamación
Peroxidación de lípidos
Infecciones
Alteración de la microbiota intestinal
Segunda causa: metilación del ADN
Solución: remover las metilaciones
Solución: alquilaciones
Caso: E. coli
Proteína AlkB: se encarga de desmetilar oxidativamente las bases lesionadas,
revertiéndolas para adenina y citosina, liberando el grupo metilo en formaldehído
En el hombre: identificados homólogos, AlkB por ABH1, ABH2 y ABH3
REPACIÓN INDIRECTA
Son aquellos que interviene durante la replicación (fase S del ciclo celular),
transcripción o sobre hebras fragmentadas.
Participantes:
ADNpolimerasa
Solución: escisión de la lesión
OJO: si los nucleótidos de una hebra presentan daño, pueden ser eliminados
utilizando como molde a la cadena complementaria.
i. REPARACIÓN DE ESCISIÓN DE BASES O BER (BASE EXCISION
REPAIR)
CAUSAS: DAÑOS OXIDATIVOS; ALQUILACIÓN CELULAR Y
DESPURINIZACIÓN ESPONTÁNEAS.
Enzimas:
Glicosilasas
AP endonucleasas
Exonucleasas
Polimerasa B
Ligasa
http://fbio.uh.cu/sites/genmol/confs/conf6/p02.htm
En eucariotas
1. Global genome repair (GCR) https://youtu.be/bgUH9NfO2QM
Proceso aleatorio lento, activados en regiones que no se
transcriben.
2. Transcription coupled rapir (TCR)
Está en estrecha relación con el ARN polimerasa II (eficiente y
específico, activado en zonas de transcripción)
Patología: síndrome de Corkayne (CS), xeroderma pigmentoso
(XP), cáncer e inestabilidad genómica
https://youtu.be/9DRnoi8gfMU
http://fbio.uh.cu/sites/genmol/confs/conf6/p02.htm
IMPORTANCIA
Mantiene la estabilidad genómica
Reduce la mutación durante la replicación
Los MMR dirige la reparación de la hebra con error, mediante las
discontinuidades de cadena
CASO: E. COLI
Proteínas:
MutS
MutL
MutH
Aumentan la precisión de la replicación del ADN de 20-400veces
a. El reconocimiento de la lesión lo hace el complejo (MutSalfa),
compuesto por la unión de dos proteínas homólogas que forma un
dímero (MSH2-MSH6), el cual se une al sitio del apareamiento
erróneo.
b. Posteriormente, el complejo MutL (MLH1-PMS2) en presencia de
ATP, reconoce la secuencia de ADN hemimetilado generando un
rompimiento de la cadena debido a su actividad endonucleasa.
c. El segmento lesionado es removido por la helicasa UvrD y degrada
por una exonucleasa
d. La síntesis y ligación es realizada por ADN polimerasa III y la ADN
ligasa
https://youtu.be/Ld3ES9RQjQo
MECANISMO DE REPACIÓN DE QUIEBRES DE
DOBLE CADENA DSB (DOUBLE-STRAND
BREAKS)
Son daños más severos al ADN
Inestabilidad genómica por translocaciones y pérdida de material genético
Eucariotas: el DSB puede generar la inactivación de un gen, lo cual es
suficiente para generar apoptosis
SOLUCIONES:
1. Reparación por recombinación homóloga HR (homolohous
recombination)
Causas: radicales libres de derivados de un DSB en la fase G2
Causa de la eficiencia: cercanía de las cromátidas
Se lograr bloquear el ciclo celular
Proteínas:
XRCC2
XRCC3
RAD51B
RAD51C
RAD51
Quinasas ATR Y ATM (reconocen los DSB)___causante de la ataxia-
telangiectasia por pérdida.
Caso: LEVADURAS
MRN (RAD50/MRE11/NBS1) complejo proteico: reconoce
a. Actúa junto a la nucleasa Mre11 que degrada el ADN produciendo
hebras sencillas.
b. La proteína RAD52 protege el ADN de la acción de las
exonucleasas inespecíficas uniéndose a los extremos
c. RAD51 en presencia de ATP sintetiza un filamento nucleoproteico
que busca la secuencia homóloga y cataliza el intercambio y
apareamiento de las cadenas con ayuda de la RAD52
d. Durante este proceso, la RAD54 estimula a la RAD51 en el
alineamiento de cadenas, así se sintetiza la cadena, empleando
como molde la secuencia homóloga que repara la información
pérdida durante el DSB
e. Se forma una cadena entrecruzadas conocida como intercambio
HOLLIDAY que corta u liga el proceso de reparación, evitando
arreglos cromosomales
https://youtu.be/5DIzfaqP_so
2. (Non- homologous End-joining)
Se en extremos no homólogos
Unión de las cadenas por sus extremos
No necesita secuencia complementaria u homóloga
a) El sitio de corte es reconocido por dos proteínas KU70 y KU80
(COMPLEJO PROTEÍCO), estas protegen al ADN de la acción
exonucleasa y las mantienen unidas (cadenas)
b) El heretero dímero es asociado por acción catalítica a la quinasa
(ADN-Pkcs) que se activa por la interacción de la cadena sencilla
con el DSB
c) La ligasa IV (une extremos de ADN) y el XRCC4 unen las cadenas
d) El procesamiento es realizado por el complejo (MRE11-Rad50-
NBS1) que tienen actividad exonucleasa, endonucleasa y helicasa.
En humanos la repración de DSB puede provocar arreglos
cromosomales
https://www.academia.edu/29329710/Mecanismos_de_reparacion_del_DNA?aut
o=download
https://www.sebbm.es/BioROM/contenido/av_bma/apuntes/T8/t8_repar.htm