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Bioquímica Ambiental

Clase 13
Metabolismo del nitrógeno:
Síntesis
El nitrógeno se encuentra en una
variedad sorprendente de
biomoléculas. Ej:
• Aminoácidos
• Bases nitrogenadas (para síntesis de
proteínas y ácidos nucleicos)
• Porfirinas (como el grupo hem y clorofila)
• Ciertos lípidos de membrana
• Otras biomoléculas como
neurotransmirosres y glutatión
Ciclo del N

• La fijación del nitrógeno, su


incorporación a moléculas
orgánicas, inicia con la unión
(reducción) de N2 por los
microorganismos procariotas para
formar amoniaco (NH3).
• Cuando los organismos mueren, el
nitrógeno orgánico se mineraliza
(es decir, se convierte mediante la
acción de muchos tipos de
microbios en NH3 [amoníaco],
NO−3 [nitrato], NO−2 [nitrito] y al
final, N2).
Fijación del nitrógeno
• Restringido por el número limitado de especies
que pueden convertir N2 en NH3 (amoníaco), una
molécula con mayor reactividad química, y las
elevadas necesidades de energía para este
proceso (implica rotura del triple enlace).

• Ej: bacterias de vida libre (p. ej., Azotobacter


vinelandii y Clostridium pasteurianum), las
cianobacterias (p. ej., Nostoc muscorum y
Anabaena azollae) y bacterias simbióticas (p. ej.,
varias especies de Rhizobium).
• Las especies fijadoras de nitrógeno conviertenN2 en NH3:

• Todas las especies que pueden fijar nitrógeno poseen el complejo


nitrogenasa. Consta de dos proteínas que se denominan
dinitrogenasa (o proteína MoFe) y reductasa de dinitrogenasa (o
proteína Fe).
• Diagrama esquemático del complejo nitrogenasa que describe el
flujo de electrones y de energía en la fijación enzimática del
nitrógeno

• (alrededor de 16 ATP por cada molécula de N2).


• Asimilación de nitrógeno

• En las plantas, la asimilación de nitrógeno comienza en las raíces con


la transferencia de NH4+ (iones amonio) desde bacterias simbióticas
presentes en los nódulos radiculares de las leguminosas o con la
absorción de NH4 + o de NO3− (nitrato) desde la tierra.
• El nitrato lo producen bacterias nitrificantes del suelo. Organismos
como Nitrosomonas oxidan NH4+ para formar NO2− (nitrito), que se
oxida aún más a NO3− por medio de bacterias como Nitrobacter.
• En las plantas, la asimilación de nitrógeno inorgánico en
biomoléculas ocurre mediante la incorporación de nitrógeno amonio
en aminoácidos.

• La glutamina sintetasa, la enzima más importante en la asimilación


de nitrógeno, cataliza la reacción dependiente de ATP del glutamato
con el ion NH4+ para formar glutamina. Tras varias reacciones esta
glutamina se transforma en glutamato.
BIOSÍNTESIS DE LOS AMINOÁCIDOS
• Los vegetales y muchos microorganismos pueden
producir todos sus aminoácidos a partir de
precursores de fácil disposición, otros organismos
deben obtener de su entorno algunos aminoácidos
ya formados
• En el caso de los animales:
• Los aminoácidos no esenciales (NAA, nonessential amino
acids) se sintetizan a partir de los metabolitos disponibles.
• Los aminoácidos que deben obtenerse de la dieta se
conocen como aminoácidos esenciales (EAA, essential
amino acids).
• En general, las proteínas completas (aquellas que contienen cantidades
suficientes de EAA) son de origen animal (p. ej., la carne, la leche y los huevos).
Las proteínas vegetales con frecuencia carecen de uno o de varios EAA.

• Por ejemplo, la gliadina (proteína del trigo) tiene cantidades insufi cientes de
lisina, y la zeína (proteína del maíz) tiene concentraciones bajas de lisina y de
triptófano.
• Debido a que las proteínas de las plantas difieren en sus composiciones de
aminoácidos, los alimentos vegetales pueden proporcionar una fuente de buena
calidad de aminoácidos esenciales sólo si se ingieren en combinaciones
adecuadas.

• Después de la digestión de la proteína dietética en el tubo digestivo, los


aminoácidos libres se transportan a través de los enterocitos y hacia la sangre.
• Reacciones de los grupos amino
• El transporte de los aminoácidos al interior de las células se produce
con intervención de proteínas transportadoras de membrana (tipos
según especificidad por los aminoácidos que transportan y en si el
proceso de transporte está ligado al movimiento de Na+ a través de la
membrana plasmática).

• Una vez que las moléculas de aminoácidos han entrado en las


células, sus grupos amino pueden utilizarse para numerosas
reacciones de síntesis.
• Reacciones de los grupos amino

• TRANSAMINACIÓN: dominan el metabolismo de aminoácidos. En


estas reacciones, catalizadas por un grupo de enzimas llamadas
aminotransferasas o transaminasas (en citoplasma y mitocondrias),
los grupos α-amino se transfieren de un α-aminoácido a un α-
cetoácido
• INCORPORACIÓN DIRECTA DE IONES
AMONIO EN MOLÉCULAS ORGÁNICAS:
Existen dos medios principales mediante los
cuales los iones amonio se incorporan en
los aminoácidos y fi nalmente en otros
metabolitos:
• En la aminación reductora, los aminoácidos se
sintetizan por la incorporación de NH4+ libre o
del nitrógeno amida de la glutamina o de la
asparagina a los α cetoácidos.

• Los iones amonio se incorporan también a


metabolitos celulares por la aminación del
glutamato para formar glutamina.
• El cerebro, una fuente abundante de la enzima glutamina sintetasa,
es en especial sensible a los efectos tóxicos del NH4+. Las células
cerebrales convierten el NH4+ y el glutamato en glutamina, una
molécula neutra no tóxica.
• Luego, la glutamina se transporta al hígado, donde se libera el
nitrógeno amida en forma de NH4+.

• Después se desecha el ion amonio mediante su incorporación a la


urea, el principal producto de desecho de los mamíferos.
Síntesis de los aminoácidos
• A pesar de la colosal diversidad de vías de síntesis de aminoácidos,
todas tienen una característica común.
• El esqueleto carbonado de cada aminoácido procede de
intermediarios metabólicos de fácil disposición. Así, en los animales
todas las moléculas de NAA proceden del glicerato-3-fosfato, del
piruvato, del cetoglutarato o del oxaloacetato.
• La tirosina, que se sintetiza a partir del aminoácido esencial
fenilalanina, es una excepción a esta regla.
• Según las semejanzas de sus vías de síntesis, los aminoácidos pueden
agruparse en seis familias: glutamato, serina, aspartato, piruvato,
aromáticos e histidina
Síntesis de los aminoácidos
REACCIONES BIOSINTÉTICAS
QUE INVOLUCRAN AMINOÁCIDOS
• Los aminoácidos son precursores de muchas biomoléculas de
importancia fisiológica.

• Metabolismo de un carbono: Muchos de los procesos que sintetizan


estas moléculas implican la transferencia de grupos carbonados.
Debido a que muchas de estas transferencias implican grupos de un
carbono (p. ej., metilo, metileno, metenilo y formilo), el proceso
global se denomina metabolismo de un carbono.
• El ácido fólico, también conocido como folato o folacina, es una vitamina B
que se encuentra en frijoles, guisantes, brócoli, betabeles, espinaca y
semillas de girasol. En cuanto entra al cuerpo: mediante una enzima, se
transforma en la forma biológicamente activa, el ácido tetrahidrofólico.
• La S-adenosilmetionina (SAM) es el principal donador de grupos metilo en
el metabolismo de un carbono. Formada a partir de metionina y ATP

• El tetrahidrofolato, la forma biológicamente activa del ácido fólico, y la S-


adenosilmetionina son transportadores importantes de átomos de un
carbono en diversas reacciones de síntesis.
• Neurotransmisores:
• Más de 30 sustancias diferentes incluyendo varios aminoácidos, funcionan
como neurotransmisores.
• Entre las moléculas que se forman a partir de los amino ácidos se encuentran
varios neurotransmisores (p. ej., el GABA, las catecolaminas, la serotonina y la
histamina) y hormonas (p. ej., la melatonina).
• El glutatión
• Es un tripéptido que tiene un papel esencial en las células. El glutatión (GSH),
el tiol intracelular más común, participa en muchas actividades celulares.
• Además de reducir los grupos sulfhidrilo, el GSH protege a las células contra
las toxinas y promueve el transporte de algunos aminoácidos.
• Se trata del principal antioxidante de las células, es ubicuo y ayuda a
protegerlas de las especies reactivas del oxígeno (ROS), como los radicales
libres y los peróxidos
• Los nucleótidos
• Moléculas que se utilizan como estructuras fundamentales de los ácidos
nucleicos (así como fuentes de energía y reguladores metabólicos), poseen
bases nitrogenadas heterocíclicas como parte de sus estructuras. Estas bases,
que se denominan purinas y pirimidinas, se forman a partir de numerosos
aminoácidos.
• El hem

• Una de las moléculas más complejas que sintetizan las células de los
mamíferos, posee un anillo de porfirina que contiene hierro.
• Es un ejemplo de un sistema de anillo heterocíclico complejo que se forma a
partir de glicina y succinil-CoA.
• La vía de biosíntesis que produce el hem es semejante a la que produce la
clorofila en los vegetales.

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