ÍNDICE

PREFACIO ...................................................................................................................................VII
REVISORES .................................................................................................................................XVII
GUÍA DE ESTUDIOS ..................................................................................................................XIX

PARTE I
PRINCIPIOS DE MICROBIOLOGÍA 1

Capítulo 1: LA CIENCIA DE LA MICROBIOLOGÍA..........................................................3

El caso de James Greenlees ................................................................................................3

1.1 El mundo invisible y nuestro mundo ...................................................................................4

1.1.1 Microorganismos y enfermedad .................................................................................4

1.1.2 Los microorganismos y la vida en la actualidad.........................................................5
1.1.3 Formación en microbiología .......................................................................................5

1.2 Alcance de la microbiología .................................................................................................6

1.2.1 Bacterias .....................................................................................................................6

1.2.2 Algas ...........................................................................................................................8
1.2.3 Hongos ........................................................................................................................8
1.2.4 Protozoos ....................................................................................................................9
1.2.5 Virus ...........................................................................................................................9
1.2.6 Helmintos....................................................................................................................10

1.3 Breve historia de la microbiología .......................................................................................11

1.3.1 Los "animálculos" de Leeuwenhoek ..........................................................................11

1.3.2 Hooke y la teoría celular .............................................................................................12
1.3.3 La generación espontánea ...........................................................................................12
1.3.4 La teoría microbiana de la enfermedad ......................................................................12
Avances decisivos: La despensa de Frau Hesse .................................................................14
1.3.5 Inmunidad ...................................................................................................................14
1.3.6 Higiene pública ...........................................................................................................15

1.4 La microbiología en la actualidad .......................................................................................15

1.4.1 Quimioterapia .............................................................................................................15
1.4.2 Inmunología ................................................................................................................16
1.4.3 Virología .....................................................................................................................16
La fiebre puerperal ..............................................................................................................16
1.4.4 Ingeniería genética ......................................................................................................17
1.4.5 El futuro ......................................................................................................................17
RESUMEN

Capítulo 2: QUÍMICA BÁSICA ................................................................................................21

El caldo químico de la vida .................................................................................................21

2.1 Los bloques básicos ...............................................................................................................22

2.1.1 Átomos........................................................................................................................22
2.1.2 Elementos ...................................................................................................................23
2.1.3 Moléculas....................................................................................................................23

2.2 Enlaces y reacciones químicas .............................................................................................24

2.2.1 Enlaces covalentes ......................................................................................................25

Marcadores radiactivos .......................................................................................................25
2.2.2 Enlaces iónicos ...........................................................................................................27
2.2.3 Puentes de hidrógeno ..................................................................................................27
2.2.4 Reacciones químicas...................................................................................................28

2.3 El agua....................................................................................................................................29

2.3.1 Propiedades especiales del agua .................................................................................29

2.3.2 El agua como disolvente .............................................................................................30
2.3.3 Iones hidrógeno e hidroxilo ........................................................................................30

2.4 Moléculas orgánicas ..............................................................................................................32

2.4.1 Carbono ......................................................................................................................33

2.4.2 Grupos funcionales .....................................................................................................33

2.5 Macromoléculas ....................................................................................................................34

2.5.1 Proteínas .....................................................................................................................34

Peptidoglicano: una coraza molecular ...............................................................................36
2.5.2 Ácidos nucleicos .........................................................................................................38
Redescubridores de microbios: Una pregunta inquietante .................................................38
2.5.3 Hidratos de carbono ....................................................................................................40
Factores críticos: Pan del desierto.......................................................................................42
2.5.4 Lípidos ........................................................................................................................42
Notas clínicas: Productos bacterianos que curan ...............................................................43
RESUMEN .......................................................................................................................................43

Capítulo 3: MÉTODOS DE ESTUDIO DE LOS MICROORGANISMOS ..........................47

Todas las cosas suceden de acuerdo con un plan, hasta que... ...........................................47

3.1 Observación de los microorganismos ..................................................................................48

3.1.1 Las propiedades de la luz............................................................................................48

3.1.2 La microscopía ...........................................................................................................50
La medida de los microorganismos .....................................................................................51
3.1.3 El microscopio óptico compuesto...............................................................................52
3.1.4 Preparaciones en fresco ..............................................................................................54
3.1.5 Tinciones ....................................................................................................................55
Notas clínicas: En primer lugar, haz una tinción de Gram .................................................57
3.1.6 Microscopía óptica: otras formas de lograr el contraste .............................................59
3.1.7 Microscopía electrónica ..............................................................................................60
 3.1.8 Los usos de la microscopía .........................................................................................63

3.2 Cultivo de los microorganismos ...........................................................................................63

3.2.1 Obtención de un cultivo puro o axénico .....................................................................63

3.2.2 La esterilización ..........................................................................................................64
3.2.3 El aislamiento .............................................................................................................66
3.2.4 El crecimiento de los cultivos axénicos ......................................................................67
La importancia de ser puro .................................................................................................69
3.2.5 Condiciones ambientales idóneas para el cultivo en el laboratorio ............................70
3.2.6 Conservación de los cultivos axénicos .......................................................................72
3.2.7 Microorganismos que no pueden ser cultivados en el laboratorio .............................72
Redescubridores de microbios: Y crecieron felices para siempre .......................................73
RESUMEN .......................................................................................................................................73

Capítulo 4: LAS CÉLULAS PROCARIOTA Y EUCARIOTA .............................................77

Un buen equipo ....................................................................................................................77

4.1 Estructura y función .............................................................................................................78

4.2 La célula procariótica ...........................................................................................................78

4.2.1 Estructura: una visión general ....................................................................................78

4.2.2 Los apéndices .............................................................................................................80
4.2.3 La cubierta procariótica ..............................................................................................82
Notas clínicas: La cápsula dio la pista ................................................................................85
La consigna de los microorganismos: hay que estar preparados .......................................86
4.2.4 El citoplasma ..............................................................................................................89
4.2.5 Las endosporas ...........................................................................................................90
4.2.6 Las células de las arqueobacterias ..............................................................................90

4.3 La célula eucariótica .............................................................................................................91

4.3.1 Estructura: una visión general ....................................................................................92

4.3.2 Los apéndices .............................................................................................................92
Nadie lo sabe exactamente, pero en todo caso por un largo período de tiempo ................92
4.3.3 La pared celular ..........................................................................................................93
4.3.4 La membrana plasmática ............................................................................................93
4.3.5 El citoplasma y sus constituyentes .............................................................................93
Investigación pionera: ¿Un tipo diferente de mitocondria? ................................................95

4.4 El transporte a través de las membranas celulares ...........................................................99

4.4.1 Difusión simple...........................................................................................................99

4.4.2 Ósmosis ......................................................................................................................99
4.4.3 Difusión facilitada ......................................................................................................101
4.4.4 Transporte activo ........................................................................................................102
4.4.5 Translocación de grupo ..............................................................................................102
Endosimbiosis: algo viejo, algo nuevo ................................................................................103
4.4.6 Endocitosis y exocitosis..............................................................................................104
RESUMEN .......................................................................................................................................104
Capítulo 5: EL METABOLISMO DE LOS MICROORGANISMOS ..................................109

Presentación de Escherichia coli .........................................................................................109

5.1 Escherichia coli: un paradigma metabólico........................................................................110

5.1.1 Los materiales .............................................................................................................110

5.1.2 La fuerza conductora ..................................................................................................110
5.1.3 El plan .........................................................................................................................112

5.2 El metabolismo: una visión general .....................................................................................112

5.2.1 El flujo de materiales ..................................................................................................112

5.2.2 La fuerza conductora ..................................................................................................113

5.3 El metabolismo aerobio ........................................................................................................114

5.3.1 Los mecanismos de entrada ........................................................................................114

5.3.2 Las reacciones catabólicas ..........................................................................................114
Reducción del reduccionismo ..............................................................................................120
5.3.3 La biosíntesis ..............................................................................................................123
5.3.4 La polimerización .......................................................................................................123
Solamente las proteínas, nunca más....................................................................................125
5.3.5 El ensamblaje ..............................................................................................................126

5.4 El metabolismo anaeróbico ..................................................................................................127

5.4.1 La respiración anaeróbica ...........................................................................................127

5.4.2 La fermentación ..........................................................................................................128

5.5 Tipos nutricionales de los microorganismos .......................................................................129

Lo indicará el olor ...............................................................................................................129

5.5.1 Síntesis de metabolitos precursores por microorganismos autótrofos........................130
5.5.2 Síntesis de ATP y poder reductor por microorganismos fotoautotrofos ....................130
5.5.3 Síntesis de ATP y poder reductor por los microorganismos quimioautotrofos ..........131

5.6 Regulación del metabolismo .................................................................................................131

5.6.1 Finalidad .....................................................................................................................131

5.6.2 Tipos ...........................................................................................................................133
Regulación de la síntesis de los ribosomas .........................................................................135
RESUMEN .......................................................................................................................................136

Capítulo 6: LA GENÉTICA DE LOS MICROORGANISMOS ............................................139

La casualidad y la ciencia ...................................................................................................139

6.1 Estructura y función del material genético.........................................................................140

6.1.1 La estructura del DNA ................................................................................................140

 6.1.2 La función del DNA ...................................................................................................140

6.1.3 Replicación del DNA..................................................................................................140

6.1.4 Expresión génica: transcripción..................................................................................145
Redescubridores de microbios: Jannine Zeig ......................................................................147
6.1.5 Expresión génica: traducción......................................................................................147

6.2 Regulación de la expresión génica .......................................................................................150

6.2.1 Regulación de la transcripción ...................................................................................151

6.2.2 Regulación de la traducción .......................................................................................154
6.2.3 Regulación global .......................................................................................................154

6.3 Cambios en la información genética de una célula ............................................................155

6.3.1 El genoma ...................................................................................................................155

6.3.2 Mutaciones..................................................................................................................155
Avances decisivos: Redescubriendo a Pasteur ...................................................................156
Notas clínicas: Muerte por una mutación............................................................................159
6.3.3 La utilización de cepas mutantes ................................................................................160
6.3.4 Intercambio genético en bacterias ..............................................................................162
6.3.5 Intercambio genético en los microorganismos eucariotas ..........................................167
6.3.6 Dinámica de poblaciones ............................................................................................168
La genética de la resistencia a las antibióticos...................................................................168
RESUMEN .......................................................................................................................................169

Capítulo 7: TECNOLOGÍA DEL DNA RECOMBINANTE .................................................173

Feliz aniversario ..................................................................................................................173

7.1 Tecnología del DNA recombinante ......................................................................................174

7.2 Clonación de genes ................................................................................................................174

7.2.1 Obtención del DNA ....................................................................................................175

7.2.2 Unión de los genes a un vector de clonación..............................................................175
Redescubridores de microbios: Cohen, Boyer y la cecina de vaca .....................................178
7.2.3 Introducción del DNA recombinante en la célula hospedadora .................................180
El testimonio del árbol ........................................................................................................180
7.2.4 Localización del gen clonado .....................................................................................181
7.2.5 Hospedadores para el DNA recombinante .................................................................183

7.3 Aplicaciones de la tecnología del DNA recombinante .......................................................183

7.3.1 Producción de DNA....................................................................................................183

Clonación de dinosaurios ....................................................................................................184
7.3.2 Producción de proteínas..............................................................................................185
7.3.3 Amplificación de genes ..............................................................................................185
Lucha contra la TB -una nueva esperanza ..........................................................................185
7.3.4 Organismos manipulados genéticamente ...................................................................187
RESUMEN .......................................................................................................................................187
Capítulo 8: EL CRECIMIENTO DE LOS MICROORGANISMOS ....................................191

Un quimiostato andante.......................................................................................................191

8.1 Las poblaciones .....................................................................................................................192

8.2 Cómo crecen los microorganismos ......................................................................................192

8.2.1 Tiempo de duplicación y tasa de crecimiento ............................................................192

8.2.2 El crecimiento exponencial ........................................................................................192
8.2.3 Fases del crecimiento..................................................................................................194
8.2.4 Cultivo continuo de los microorganismos ..................................................................195
8.2.5 Crecimiento de una colonia ........................................................................................196

8.3 ¿Qué necesitan los microorganismos para crecer? ............................................................196

8.3.1 Nutrición .....................................................................................................................196

Redescubridores de microbios: Los supervivientes .............................................................197
8.3.2 El ambiente no nutritivo .............................................................................................199
El selenio: ¿banquete o veneno? .........................................................................................201

8.4 Medida del número de microorganismos............................................................................203

8.4.1 Turbidez ......................................................................................................................203

Luchando contra el frío .......................................................................................................203
¿Por qué el champán se envasa en una botella tan pesada? ..............................................204
8.4.2 Peso seco.....................................................................................................................205
8.4.3 Actividad metabólica ..................................................................................................205
8.4.4 Recuento directo .........................................................................................................205
8.4.5 Recuento en placa .......................................................................................................206
8.4.6 Número más probable.................................................................................................208
8.4.7 Filtración .....................................................................................................................209
RESUMEN .......................................................................................................................................209

Capítulo 9: CONTROL DE LOS MICROORGANISMOS ....................................................213

La protección de los más pequeños .....................................................................................213

9.1 La forma en que mueren los microorganismos ..................................................................214

9.2 El control físico de los microorganismos.............................................................................215

9.2.1 El calor ........................................................................................................................215

9.2.2 EI frío ..........................................................................................................................217
9.2.3 Las radiaciones ...........................................................................................................217
9.2.4 La filtración ................................................................................................................218
9.2.5 La desecación .............................................................................................................218
9.2.6 La presión osmótica ....................................................................................................218

9.3 El control químico de los microorganismos ........................................................................218

9.3.1 La selección de un germicida .....................................................................................218

 9.3.2 Evaluación de los germicidas .....................................................................................219
9.3.3 Los tipos de germicidas y sus mecanismos de acción ................................................219

9.4 La conservación de los alimentos .........................................................................................222

9.4.1 La temperatura ............................................................................................................223

9.4.2 La pasteurización ........................................................................................................223
9.4.3 El Ph ...........................................................................................................................223
9.4.4 El agua ........................................................................................................................224
9.4.5 Los compuestos químicos...........................................................................................224
RESUMEN .......................................................................................................................................224

PARTE II
LOS MICROORGANISMOS 227

Capítulo 10: CLASIFICACIÓN ................................................................................................229

Todos somos parientes.........................................................................................................229

10.1 Principios de clasificación biológica ..................................................................................230

10.1.1 Nomenclatura científica ............................................................................................230

10.1.2 Sistemas de clasificación artificiales y naturales ......................................................230
10.1.3 El registro fósil .........................................................................................................231
10.1.4 El concepto de especie ..............................................................................................231

10.2 Microorganismos y niveles superiores de clasificación ...................................................233

Avances decisivos: No hay trabajo pequeño .......................................................................233

10.3 Los métodos de clasificación microbiana ..........................................................................235

10.3.1 Taxonomía numérica ................................................................................................235

10.3.2 Caracteres utilizados para clasificar bacterias ..........................................................235
Buena pregunta....................................................................................................................239
El árbol genealógico de Escherichia coli ............................................................................241
10.3.3 Caracteres utilizados para clasificar los virus...........................................................242
Las apariencias engañan .....................................................................................................243
Notas clínicas: Los "kits" entran en el laboratorio de microbiología .................................243
10.3.4 Claves dicotómicas ...................................................................................................244
RESUMEN .......................................................................................................................................244

Capítulo 11: LAS BACTERIAS ................................................................................................247

La excepción confirma la regla ...........................................................................................247

11.1 Identificación bacteriana ....................................................................................................248

11.2 Taxonomía bacteriana ........................................................................................................248

11.3 El esquema del Manual de Bergey de sistemática bacteriana ........................................248

 11.3.1 Espiroquetas (Sección 1) ..........................................................................................251
11.3.2 Bacterias Gram negativas helicoidales/vibroides, móviles,
aerobias/microaerófilas (Sección 2) .........................................................................252
11.3.3 Bacilos y cocos Gram negativos aeróbicos (Sección 4) ...........................................252
11.3.4 Bacilos Gram negativos anaeróbicos facultativos (Sección 5) .................................254
11.3.5 Bacilos rectos, curvados y helicoidales Gram negativos anaerobios (Sección 6) ....256
11.3.6 Bacterias reductoras del azufre y metabolizadoras de sulfatos (Sección 7) .............256
11.3.7 Cocos Gram negativos anaerobios (Sección 8) ........................................................257
11.3.8 Ricuettsias y clamidias (Sección 9) ..........................................................................257
11.3.9 Micoplasmas (Sección 10)........................................................................................259
11.3.10 Cocos Gram positivos (Sección 12) .......................................................................259
11.3.11 Bacilos y cocos Gram positivos formadores de endosporas (Sección 13) .............260
Notas clínicas:
Infección por Staphylococcus aureus ..................................................................................261
11.3.12 Bacilos Gram positivos regulares no esporulados (Sección 14).............................261
11.3.13 Bacilos Gram positivos irregulares no esporulados (Sección 15) ..........................262
11.3.14 Micobacterias y grupo nocardiforme (Secciones 16 y 17) .....................................263
11.3.15 Bacterias fototrofas anoxigénicas (Sección 18)......................................................264
11.3.16 Bacterias fotosintéticas oxigénicas (Sección 19)....................................................264
11.3.17 Bacterias quimiolitotrofas aerobias y organismos relacionados (Sección 20) .......265
11.3.18 Bacterias con yemas y / o con apéndices (Sección 21) ..........................................265
11.3.19 Bacterias con vaina (Sección 22)............................................................................266
11.3.20 Bacterias deslizantes no fructificantes, no fotosintéticas (Sección 23) ..................266
11.3.21 Bacterias deslizantes fructificantes (Sección 24) ...................................................267
11.3.22 Arqueobacterias (Archaeobacteria) (Sección 25) ...................................................267
11.3.23 Actinomicetes con esporangios multiloculares (Sección 27) .................................269
11.3.24 Streptomyces y géneros relacionados (Sección 29) ...............................................269
¿Pueden crecer las bacterias en cualquier sitio? ¿Qué ocurre en Marte? ............................269
RESUMEN .......................................................................................................................................271

Capítulo 12: MICROORGANISMOS EUCARIOTAS,

HELMINTOS Y ARTROPODOS VECTORES................................................273

La parasitología: ¿Una lata de gusanos?

12.1 Microorganismos eucariotas ..............................................................................................274

12.1.1 Hongos ......................................................................................................................274

Redescubridores de microbios: Gerald Fink .......................................................................281
12.1.2 Algas .........................................................................................................................282
El fuego de San Antonio ......................................................................................................283
12.1.3 Líquenes....................................................................................................................285
12.1.4 Protozoos ..................................................................................................................287
12.1.5 Mohos viscosos.........................................................................................................289

12.2 Helmintos .............................................................................................................................290

Ni idos ni olvidados .............................................................................................................291

12.2.1 Platelmintos ..............................................................................................................291
12.2.2 Nematelmintos ..........................................................................................................294

12.3 Artrópodos vectores ............................................................................................................295

 12.3.1 Los organismos.........................................................................................................295
12.3.2 Los artrópodos y la salud humana ............................................................................295
Redescubridores de microbios: Una enfermedad, una bacteria, tres garrapatas ...............297
RESUMEN .......................................................................................................................................297

Capítulo 13: LOS VIRUS ...........................................................................................................301

Nuevas alianzas con viejos enemigos ..................................................................................301

13.1 Los parásitos extremos .......................................................................................................302

13.1.1 El descubrimiento de los virus..................................................................................302

13.1.2 ¿Son los virus organismos vivos? .............................................................................303

13.2 La clasificación de los virus ................................................................................................303

13.2.1 El espectro de hospedadores .....................................................................................303

13.2.2 El tamaño ..................................................................................................................303
13.2.3 La estructura .............................................................................................................303
13.2.4 El ciclo de vida .........................................................................................................305
13.2.5 Taxonomía ................................................................................................................306

13.3 Los bacteriófagos.................................................................................................................306

13.3.1 Los recuentos y la multiplicación de los bacteriófagos ............................................306

13.3.2 El ciclo de multiplicación vírica ...............................................................................309
13.3.3 La diversidad ............................................................................................................310

13.4 Los virus de animales ..........................................................................................................310

13.4.1 Los cultivos celulares ...............................................................................................310

Redescubridores de microbios: Werner Arber ....................................................................312
13.4.2 La multiplicación vírica ............................................................................................313
13.4.3 Virus de animales con un interés especial ................................................................316
Los receptores de los virus ..................................................................................................317
Notas clínicas: ¿Son los virus más listos que nosotros? .....................................................321

13.5 Los virus de vegetales .........................................................................................................322

13.5.1 La multiplicación vírica y su control ........................................................................322

13.5.2 El virus del mosaico del tabaco ................................................................................322

13.6 Los virus de los microorganismos eucariotas ...................................................................323

Redescubridores de microbios: ¿Cuánta seguridad proporciona lo seguro? .....................323

13.7 Los agentes infecciosos más simples que los virus ...........................................................324

13.7.1 Los viroides ..............................................................................................................324

13.7.2 Los priones ...............................................................................................................324
Buen ritmo ...........................................................................................................................325
13.8 El origen de los virus...........................................................................................................325

RESUMEN .......................................................................................................................................325

Apéndice I: MEDIDAS MÉTRICAS Y CONVERSIONES ...................................................A1

Apéndice II: ALGUNAS RAÍCES DE TÉRMINOS UTILIZADOS
EN MICROBIOLOGÍA .....................................................................................A3

Apéndice III: GUÍA DE INFORMACIÓN ÚTIL ....................................................................A7

Apéndice IV: RUTAS BIOQUÍMICAS ....................................................................................A9

GLOSARIO .................................................................................................................................G1

CRÉDITOS DE LAS ILUSTRACIONES ................................................................................C1

ÍNDICE ALFABÉTICO .............................................................................................................I1