Abdul Mutholib Shahroni

175090101111001

Task

1. SDS-page is a method used to analyze proteins for complex extracts. This method consists of two
resolving gels that function to break down proteins based on their molecular weight and arrange
concentrated proteins before entering the resolving gene. Electrophoretic buffer with constituent
gel can produce a system to complement proteins perfectly according to their molecular weight.
2. SDS-polyacrylamide gel is also called electrophoretic protein gel electrophoresis using a
polyacrylamide matrix. This is one method commonly used to characterize complex protein
mixtures. The benefits of this method are easy, fast and inexpensive because it only requires a
sequence of microgram protein amounts.
3. Domains issued by researchers about the part of the protein that has independent and approved
folds seen from the atomic structure of the multidomain protein will easily see the independent
domain. Modules are usually used to analyze DNA genomes and are DNA units that encode
proteins and have the functional significance needed in genome analysis of many genes and
biological experiments. The difference may be that the module does not have a well-defined
atomic structure.
4. X-Ray Crystalloghraphy is a technique commonly used to determine the structure of proteins and
biological macromolecules. The function of crystallization is to obtain the three-dimensional
molecular structure of the crystal. Samples that have been purified at high concentrations are
then crystallized and exposed to X-Ray rays. The resulting diffraction pattern can be processed to
produce information about crystal packaging symmetry.
5. Sterile Alpha Motif (SAM) is a protein interaction module that is included in various types of
proteins that are included in several biological processes. In eukaryotic habitats, the SAM domain
is spread around 70 residues.

Reference
Kim A. C. & Bowie U. J., (2003), SAM domains : uniform structure, diversity of function, Vol. 28 No. 12, USA
Smyth M. S. & Martin J. H. J., (2000), X-Ray crystallography, 53:8 – 14, F Clin Pathol, UK
Descalzo L. G., López E. G. Alcázar A., Baquero F. and Cid C., (2012), Gel Electrophoresis of Proteins, Spain

1. SDS-page merupakan metode yang digunakan untuk menganalisa suatu protein dalam ekstrak
kompleks. Metode ini terdiri atas dua gel penyelesai yang berfungsi untuk memecahkan protein
berdasarkan berat molekulnya serta menyusun tempat protein terkonsentrasi sebelum masuk
kedalam gen penyelesai. Buffer elektroforesis dengan gel penyusun dapat menghasilkan sistem
untuk menyelesaikan protein dengan sempurna sesuai berat molekulnya.
2. SDS-polyacrylamide gel elektroforesis disebut juga elektroforesis gel protein dengan menggunakan
matriks polyacrylamide. Hal ini merupakan salah satu metode yang umum digunakan untuk
mengkarakterisasi campuran protein kompleks. Keuntungan metode ini yaitu mudah, cepat dan
murah karena hanya membutuhkan urutan jumlah mikrogram protein.
3. Domain umumnya disebut oleh peneliti biologi sebagai bagian dari protein yang mempunyai lipatan
independen dan apabila dilihat dari struktur atom protein multidomainnya akan mudah melihat
domain independen. Modul biasanya digunakan untuk menganalisis genom DNA dan merupakan unit
 DNA yang mengkode protein serta memiliki signifikansi fungsional sebagaimana diidentifikasi dalam
analisis genom dari banyak gen dan eksperimen biologi. Perbedaannya adalah mungkin modul tidak
mempunyai struktur domain atom yang tterdefinisi dengan baik.
4. X-Ray Crystalloghraphy adalah teknik yang biasa digunakan untuk menentukan struktur protein dan
makromolekul biologis. Fungsi dari pengkristalan ini yaitu untuk memperoleh struktur molekul tiga
dimensi dari suatu kristal.Sampel yang telah dimurnikan pada konsentrasi tinggi kemudian
dikristalisasi dan dipaparkan pada sinar X-Ray. Pola difraksi yang dihasilkan, dapat diproses untuk
menghasilkan informasi tentang simetri pengemasan kristal.
5. Sterile Alpha Motif (SAM) merupakan modul interaksi protein putatif yang berada dalam berbagai
jenis protein yang termasuk dalam beberapa proses biologis. Pada organisme eukariotik, domain
SAM tersebar kurang lebih 70 residu.