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Objetivos docentes
Guía para discusiones grupales
Seminarios
Departamento de Bioquímica
Facultad de Medicina
2007
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Biología Celular 2007
Lun 24/9 Teórico: Introducción al metabolismo (1:30 hs)- Discusión Grupal (1:30 hs)
Mar 25/9 Discusión grupal (3 hs)
Mie 26/9 Teórico: Glucólisis (1:30 hs)- Discusión grupal (1:30 hs)
Jue 27/9 Teórico: Proliferación celular. Modelos (Biofísica)(1:30hs)- Discusión
Grupal (1:30 hs)
Vie 28/9 Seminario 1
Lun 8/10 Teórico: Vía de las Pentosas y Gluconeogénesis (1:30 hs) Discusión grupal
(1:30 hs)
Mar 9/10 Discusión grupal (3 hs)
Mie 10/10 Degradación y síntesis de ácidos grasos (1:30 hs)
Jue 11/10 Discusión grupal (3 hs)
Vie 12/10 Teórico: Integración del Metabolismo (1:30 hs)
Lun 22/10 Teórico: Bases Bioquímicas de la traducción. Modificaciones post traduccionales (1:30
hs)
Mar 23/10 Discusión grupal (3 hs)
Mie 24/10 Traducción y plegamiento proteico. Degradación proteica: el proteasoma.
Jue 25/10 Discusión grupal 3 hs)
Vie 26/10 Seminario 4
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Biología Celular 2007
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Biología Celular 2007
Bioenergética y Enzimas
(Martes 18/09/07 al jueves 20/09/07)
Objetivos de aprendizaje
1- La célula como un sistema termodinámico: Sistema, entorno y universo. Primera y segunda ley de
la termodinámica. La energía libre como energía capaz de efectuar trabajo (G =H - TS). Relación
entre el equilibrio y la energía libre estándar (Go = -RTlnKeq).
2- Termodinámica de las reacciones catalizadas por enzimas. Energía libre de activación y efecto de
catalizadores, G de activación. Ley de acción de masas, orden de una reacción. Teoría del estado de
transición.
3- Cinética enzimática. Cinética química. Definición de enzima. Formación del complejo enzima-
sustrato. Ecuación de Michaelis-Menten. Significado de Vm, Km, Ks y constante catalítica. Efecto del
pH y la temperatura sobre la actividad enzimática. Gráfico de doble recíprocas: determinación de V m y
Km. Inhibidores.
1- Calcule la variación de energía libre de hidrólisis del ATP a pH 7 y 25 oC bajo condiciones de estado
estacionario (tal como existen en las células), en las cuales las concentraciones de ATP, ADP y Pi son
mantenidas en 1.0 mM, 0.1 mM y 10 mM, respectivamente.
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Biología Celular 2007
b) ¿Qué cosas necesita la levadura del entorno y cuáles son eliminadas hacia el entorno?
c) ¿En qué se utiliza la energía libre de la fermentación alcohólica?
d) ¿Cuántos moles de ATP se forman por mol de glucosa oxidado a etanol y CO2 en condiciones
estándar?
e) En estado estacionario las levaduras tiene una concentración de glucosa de 5 mM y de etanol y
dióxido de carbono de 50 y 5 M, respectivamente. Las concentraciones de ATP, ADP y Pi son
mantenidas en 1.0 mM, 0.1 mM y 10 mM, respectivamente.
¿Cuántos moles de ATP se pueden formar por mol de glucosa oxidado en estas condiciones?
G-6-P F-6-P
G
(kCal)
a) Utilizando el gráfico, calcule la constante de equilibrio, Keq, y Gº para la reacción descrita,
considerando la temperatura como 25ºC.
b) Si se tienen iguales cantidades de G-6-P y F-6-P y se agrega la enzima, ¿hacia donde se desplaza la
reacción?
c) ¿Cuál será el G real de esta reacción en la célula si las concentraciones intracelulares medidas en
estado estacionario de G-6-P y F-6-P son de 83 y 14 M respectivamente?
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Biología Celular 2007
8- Considerando una enzima con cinética Michaeliana, ¿qué fracción de V max se observa cuando [S] = 2
Km, [S] = 6 Km, y [S] = 10 Km ?
9- Los siguientes resultados fueron obtenidos a partir de una reacción catalizada enzimáticamente:
[S] (mM) v (mol/l/min)
0.50 8.0
0.75 10.0
1.00 11.4
1.50 13.0
2.00 15.0
10- El sustrato de una enzima es el anión de un ácido débil A- (pKa=4.5). El sitio activo de la enzima
contiene un residuo de histidina (pKa=6.5) que tiene que estar protonado para la catálisis enzimática.
¿Cuál es la zona de pH óptimo de la reacción? Justifique su respuesta.
11- Un microgramo de una enzima pura (PM = 92.000) catalizó una reacción a una velocidad máxima
de 0.50 moles/min bajo determinadas condiciones de pH y temperatura.
Calcular:
a) Constante catalítica de la enzima (kcat)
b) ¿Cuánto dura un ciclo catalítico?.
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Biología Celular 2007
12- Muchas reacciones enzimáticas se inhiben por el producto de la reacción. Utilizando los siguientes
datos de la inhibición causada por el acetaldehído sobre la oxidación del etanol catalizada por la
alcohol deshidrogenasa, determinar:
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Biología Celular 2007
Objetivos de aprendizaje
1- La glucosa entra en la vía glucolítica por su fosforilación a glucosa-6-fosfato catalizada por dos
enzimas: la hexoquinasa, presente en todas las células (con un bajo Km para su sustrato) y la
glucoquinasa exclusiva del hígado pero con un alto Km para la glucosa.
a) ¿Cuáles son los posibles destinos de la glucosa 6-P en los distintos tejidos y frente a distintas
necesidades energéticas?
b) ¿Qué rol juega cada una de estas enzimas en el metabolismo de los carbohidratos?
c) Altos niveles de ATP y bajos de AMP inhiben a la fosfofructoquinasa. ¿Qué sucede con la
actividad de la hexoquinasa y glucoquinasa en esta situación?
2- Cada vez que una molécula de glucosa se transforma en dos moléculas de piruvato, ¿qué otras
moléculas consume y produce la célula? Plantee un balance.
3- Se determinaron los valores de variación de energía libre (G) para todas las reacciones de la
glucólisis en el músculo cardíaco. En la tabla se presentan estos valores y las variaciones de energía
libre estándar a pH 7 (Go’)
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Biología Celular 2007
b) ¿Qué enzimas serían candidatas a controlar el flujo de metabolitos por la vía glicolítica? ¿Por
qué?
c) ¿Cómo se explica la diferencia de energía en condiciones estándar y fisiológicas, de la reacción
catalizada por la aldolasa?
a) ¿Qué nombre recibe esta reacción de síntesis de ATP? ¿Qué otro mecanismo de síntesis de ATP
posee la célula?
b) El fosfoenolpiruvato tiene un Go’ de hidrólisis de –61.9 kJ/mol mientras que su precursor el 2-
fosfoglicerato tiene un Go’ de hidrólisis de –17.6 kJ/mol. Tomando en cuenta estos datos discuta
sobre el rol de la reacción catalizada por la enolasa.
11- El arsénico pentavalente o arsenato (HAsO42-) puede sustituir al fosfato (HPO42-) y formar ésteres
de arsenato que se hidrolizan espontáneamente. Su efecto se puede ilustrar en la reacción catalizada por
la gliceraldehído-3-P deshidrogenasa:
O O
NAD+ NADH
HC OAsOC
3
OH
OPO2HC OH
3
HAsO 2- 3 OPO2HC
4
gliceraldehído-3-P H2O
HAsO42-
O
-
OC
OH
OPO2HC
3
3-fosfoglicerato
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Biología Celular 2007
13- A continuación se muestran las concentraciones intracelulares de los sustratos que intervienen en la
fosforilación de la fructosa-6-fosfato por la fosfofructoquinasa 1 (PFK-1) del tejido cardíaco de rata,
medidas por técnicas de criocompresión:
14- Durante la actividad intensa el tejido muscular demanda altas cantidades de ATP comparado con el
tejido en reposo. Este proceso se produce casi exclusivamente por fermentación láctica y el ATP es
producido por las reacciones catalizadas por las enzimas fosfogliceratoquinasa y piruvato quinasa. ¿Si
el músculo esquelético fuera desprovisto de la enzima lactato deshidrogenasa podría llevar a cabo
actividad física intensa, es decir, generar ATP a alta velocidad por la glucólisis? Explique.
La PFK cataliza una reacción clave en la glucólisis. Se presentan a continuación datos experimentales
que ilustran su rol en la regulación de la vía glucolítica.
El ensayo cinético consistió en medir la desaparición de NADH (0.2 mM) a 340 nm en función del
tiempo en presencia de fructosa 6-fosfato, ATP, MgCl2, NADH y Pi, así como de las siguientes enzimas
acopladas: aldolasa, triosafosfato isomerasa y glicerol-3-fosfato deshidrogenasa. El ensayo fue
realizado a pH 7.0 con una concentración fija de F-6-P 2 mM o a una concentración fija de ATP 3
mM. En ambos casos se inició el ensayo con el agregado de 0.1 µg/ml de PFK.
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Biología Celular 2007
1- ¿Cual es la secuencia de reacciones en el ensayo acoplado para medir la velocidad de la PFK? ¿Por
qué se agrega MgCl2 en el ensayo enzimático?
2- Analice el diferente comportamiento de los sustratos ATP y GTP.
3- ¿Cual es la concentración intracelular de ATP en estado estacionario? ¿Cómo será la actividad de la
enzima en estas condiciones?
4- Si la concentración de ATP baja en la célula desde 2.5 mM a 1 mM, ¿qué sucede con la actividad de
la PFK?
1unidad (U) es la cantidad de enzima que cataliza la transformación de 1µmol de sustrato por minuto.
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Biología Celular 2007
¿Cuál es el efecto de AMP sobre la cinética de la PFK? ¿Cuál es la concentración de AMP intracelular
en estado estacionario?
b) Efecto del citrato
Citrato (mM)
0 0.2 1 5
F6P (mM) v (U/mg)
2 2 1.8 0.5 0.2
4 8 7.5 1 0.45
6 25 20 8 2
8 50 42 18 3
10 65 60 30 8
12 69 65 45 10
14 70 69 58 18
16 72 70 62 28
20 - - 65 45
25 - - 66 55
30 - - - 60
Objetivos de aprendizaje
1. Ciclo de Krebs. Localización subcelular del Ciclo de Krebs. Panorámica general del ciclo.
Decarboxilaciones oxidativas: isocitrato deshidrogenasa y -cetoglutarato deshidrogenasa.
Fosforilación a nivel de sustrato: succinil-CoA sintetasa. Balance energético del ciclo.
Regulación del ciclo. El ciclo de Krebs como ruta anabólica y reacciones anapleróticas.
5. Utilización del ATP por la célula: transporte de metabolitos a través de membranas, trabajo
mecánico y síntesis de biomoléculas.
Seminario: Problema Básico clínico: Análisis de la historia clínica de un niño con una patología
mitocondrial (patologías OXPHOS).
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Biología Celular 2007
3- En los experimentos que permitieron dilucidar el ciclo del ácido cítrico, Krebs observó que la
adición de malonato a extractos de músculo esquelético de paloma inhibe la utilización de piruvato y
provoca la acumulación de succinato.
a. ¿Por qué cree que Krebs utilizó preparaciones del músculo del vuelo de paloma en sus estudios?
b. ¿Por qué inhibe el malonato?
c. ¿Qué fue capaz de concluir cuando encontró que se acumulaba el succinato en las preparaciones
tratadas con malonato, luego de la adición de citrato, isocitrato o α-cetoglutarato?
d. ¿Por qué fue también significativa la acumulación de succinato en las preparaciones tratadas con
malonato cuando el sustrato añadido era fumarato, malato u oxalacetato?
4- Los enfermos de Beri-beri, enfermedad ocasionada por un déficit de tiamina en la dieta, tienen
niveles sanguíneos de piruvato y - cetoglutarato elevado, en especial después de comidas ricas en
glucosa. ¿Qué relación existe entre esos efectos y el déficit de tiamina?
5- Existen vías metabólicas que consumen intermediarios del Ciclo de Krebs. Un ejemplo es la síntesis
del neurotransmisor ácido -aminobutárico (GABA) a partir de glutamato en el tejido nervioso.¿A
partir de que intermediario del ciclo se sintetiza el neurotransmisor? ¿Cómo se repone el intermediario
para que el ciclo siga funcionando?
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8- -¿Cómo entran a la cadena respiratoria los equivalentes de reducción provenientes de: glucólisis, -
oxidación y Ciclo de Krebs?
10- Mucha de la información acerca de la cadena respiratoria se obtuvo utilizando inhibidores, los
cuales pueden ser inhibidores de la cadena respiratoria, inhibidores de la fosforilación oxidativa y
desacoplantes, ¿cuál es la diferencia entre ellos y a qué nivel actúan?
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Biología Celular 2007
Un niño que nació luego de 40 semanas de gestación desarrolló en las primeras 24 horas de vida
problemas respiratorios y a las 6 semanas problemas neurológicos y cardíacos, revelando los exámenes
la existencia de una miocardiopatía. Entre las 15 y las 16 semanas se detectó además una acidemia
láctica progresiva, con un valor de pH de 7.30 (rango normal 7.38-7.44), con valores de piruvato y de
la relación lactato / piruvato elevados.
La acidemia láctica persistió hasta que el niño murió de un paro cardio respiratorio a las 16 semanas de
vida.
A fin de comprender las bases moleculares de la patología que provocó la muerte de este niño se evaluó
la funcionalidad de las vías del metabolismo energético en el tejido cardíaco:
Las actividades de las enzimas de la vía glucolítica y de la piruvato deshidrogenasa eran
normales.
Estudios de resonancia paramagnética de electrones (EPR) indicaron que el contenido de hierro
de las mitocondrias era menor al normal y lograron identificar qué tipo de grupo prostético se
hallaba afectado.
Se purificaron mitocondrias de músculo cardíaco y se valoró su funcionalidad:
Piruvato/Malato
A ADP
Succinato
B
ADP
1 mol
de O2
1 min
a) ¿Qué conclusiones pueden sacar con respecto a la funcionalidad mitocondrial del tejido cardíaco de
este niño?
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Biología Celular 2007
b) Diseñe un esquema que presente las principales vías metabólicas mitocondriales y contenga a los
principales complejos enzimáticos. A partir de los datos obtenidos con las mitocondrias plantee a
que nivel podríamos encontrar un defecto en el metabolismo mitocondrial.
c) A partir de los datos de EPR plantee que cofactor o grupo prostético se encuentra afectado.
e) ¿Cuál es la relación P/O con succinato? ¿Es la esperada? ¿Se puede calcular la relación P/O con
piruvato/malato?
f) ¿Cómo puede explicar la debilidad muscular y los problemas neurológicos del niño tomando en
cuenta los datos aportados?
g) La enfermedad de este niño se encuentra dentro del grupo de las acidosis lácticas congénitas.
¿Porqué? ¿A que se debe el aumento del ácido láctico en sangre?
La mayoría de los casos reportados hasta el momento se deben a fallas en los componentes
codificados por el ADN mitocondrial. ¿A qué puede deberse esto?
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Biología Celular 2007
Objetivos de aprendizaje
1- Ruta de las pentosas fosfato: Etapa oxidativa y no oxidativa, regulación y balance de la ruta de las
pentosas fosfato. Utilización del NADPH y de la ribosa 5 fosfato por la célula.
1- Explicar el destino metabólico de la glucosa 6-fosfato bajo cada una de las siguientes condiciones:
a) las necesidades de NADPH son mayores que las de ribosa 5-fosfato
b) las necesidades de ribosa 5-fosfato son mayores que las de NADPH
c) las necesidades de ribosa 5-fosfato y de NADPH son del mismo orden.
2- Se realizó un estudio sobre los niveles de actividad de enzimas del metabolismo de la glucosa en los
eritrocitos. Se estudio una población de 100 individuos sanos de características comparables (edad,
peso). En 3 de ellos se detectó una actividad de la enzima glucosa –6-fosfato deshidrogenasa 10 veces
menor a la del resto de los individuos.
a) ¿Cómo serán los niveles de ATP, NADH y NADPH de estos individuos comparados con el resto?
b) ¿Cómo puede afectar esto al eritrocito y su función?
c) Si la actividad glucosa-6-fosfato deshidrogenasa se encontrara disminuida en otros tejidos ¿qué vías
metabólicas podrían estar afectadas?
3- Por cada glucosa 6-P que es completamente oxidada a CO 2 por la ruta de las pentosas, ¿cuál es el
rendimiento en NADPH? ¿En qué tejidos espera encontrar un mayor consumo de glucosa por esta ruta?
4- El músculo esquelético libera grandes cantidades de alanina (Ala) y lactato en distintas condiciones
metabólicas. A nivel hepático éstos son captados y utilizados para formar glucosa, la que es entonces
liberada desde el hígado al torrente sanguíneo.
a) ¿Qué reacciones sufren la Ala y el lactato para superar las etapas fuertemente exergónicas de la
glucólisis y formar glucosa?
b) ¿En qué compartimentos se produce este proceso?
c) Señale en que etapas se podrían producir ciclos fútiles. ¿Cuál sería el efecto a nivel celular de tales
ciclos y cómo se evitan?
Objetivos de aprendizaje
1- Síntesis de ácidos grasos. Etapas de la síntesis de ácidos grasos (acetil-CoA carboxilasa y complejo
ácido graso sintasa). Localización subcelular, regulación y balance. Reacciones de elongación e
insaturación de ácidos grasos. Almacenamiento de ácidos grasos como triacilglicéridos.
1- A una fracción soluble de hígado se le agrega [14C]acetil-CoA (marcada radiactivamente en todos los
carbonos) resultando en la formación de ácido palmítico con todos los carbonos marcados. Sin
embargo si al mismo preparado de hígado se le agregan pequeñas cantidades de [ 14C]acetil-CoA y un
exceso de malonil-CoA sin marcar, obtenemos ácido palmítico marcado solamente en los carbonos 15
y 16.
Utilizando sus conocimientos sobre las síntesis de ácidos grasos explique estas observaciones.
2- Plantee la ecuación de la síntesis de ácido palmítico en el hígado de la rata a partir de acetil CoA
mitocondrial, NADPH citosólico, ATP y CO2.
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Biología Celular 2007
4- Franz Knoop en 1904 propuso el nombre de -oxidación para el proceso biológico de oxidación de
ácidos grasos, mucho antes que se conociera la CoA y las enzimas involucradas (descubrimiento que
ocurre por 1950). Knoop alimentó perros con ácidos grasos modificados en el último carbono, llamado
carbono , con un anillo de benceno. Utilizó dos tipos de ácidos grasos: con número par de carbonos y
con número impar. Aisló de la orina de los perros los productos que poseían un grupo fenilo. Los perros
alimentados con ácidos grasos de número impar originaron ácido benzoico. Los perros alimentados con
ácidos grasos de número par produjeron en su orina ácido fenilacético:
COOH
COOH
ácido fenilacético
COOH COOH
ácido benzoico
a) ¿Por qué ambos grupos de perros no originaron el mismo producto final, ácido benzoico o
fenilacético?
b) ¿Por qué Knoop utilizó el nombre de -oxidación?
c) ¿Cómo son la mayoría de los ácidos grasos de la dieta, de número par o impar de átomos de
carbono? ¿Cuáles son los productos finales de oxidación para ambos casos?
6- Los ácidos grasos son convertidos a sus ésteres de coenzima A por una reacción reversible catalizada
por la acil:coenzima A sintetasa:
Si bien esta reacción posee una constante de equilibrio cercana a 1, la célula posee un mecanismo
que favorece la formación de acil-CoA. Explique.
7- En los últimos kilómetros de una maratón, los corredores obtienen la energía casi exclusivamente
por oxidación de los ácidos grasos y de algunos aminoácidos. Describa el mecanismo por el que se
detiene la oxidación de los ácidos grasos cuando los corredores descansan e ingieren una comida rica
en carbohidratos después de la maratón.
8- Durante el ayuno se hidrolizan triglicéridos presentes en el tejido adiposo. Los ácidos grasos viajan
por la sangre a los tejidos donde son oxidados en la mitocondria, produciendo grandes cantidades de
acetil CoA
a) ¿Qué ocurre en estas condiciones con la velocidad del flujo de metabolitos por el Ciclo del Ácido
Cítrico?
b) ¿Qué enzimas son responsables de esta variación en el flujo?
c) ¿Cuáles son los mecanismos de regulación de estas enzimas?
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Biología Celular 2007
9- Es bien conocido que las dietas ricas en carbohidratos se asocian con aumento de peso debido
principalmente a un aumento del tejido adiposo.
a) Explique esquemáticamente el mecanismo por el cual la glucosa se transforma en ácidos grasos.
b) ¿En qué órgano se produce principalmente dicha reacción?
c) ¿Es posible sustituir totalmente los carbohidratos de una dieta por lípidos?
10- El consumo de glucosa por el músculo cardíaco puede ser medido haciendo circular artificialmente
sangre a través de un corazón intacto aislado y midiendo la concentración de glucosa antes y después
de que la sangre pase por el corazón. Si la sangre es desoxigenada, el músculo cardíaco consume
glucosa a un nivel estacionario. Cuando se adiciona oxígeno a la sangre, la velocidad de consumo de
glucosa cae dramáticamente y luego continúa a una velocidad menor. ¿Por qué?
11- Analice las similitudes y diferencias, estructurales y funcionales, del NADH y NADPH.
12- Plantee cuáles pueden ser los diferentes destinos metabólicos de la glucosa 6-fosfato, el piruvato y
la acetil CoA en un hepatocito, en condiciones de ayuno y después de una comida abundante.
Las células animales (principalmente los hepatocitos) contienen la enzima citosólica alcohol
deshidrogenasa (ADH) que cataliza la oxidación del etanol a acetaldehído. El acetaldehído entra a la
mitocondria donde es oxidado a acetato por la acetaldehído deshidrogenasa (AcDH).
Los efectos metabólicos de la intoxicación con alcohol surgen de las acciones de estas dos enzimas que
llevan a un desbalance de la relación NADH/NAD+ en la célula. A continuación presentamos algunos
datos de la historia clínica de un paciente alcohólico, Alberto Martini, a fin de que sean analizados
desde una perspectiva molecular.
Alberto Martini es alcoholista, llegó a la emergencia del hospital confuso y tembloroso. Su vecina le
dijo al médico que había estado tomando mucho durante la última semana. En este tiempo su apetito
había disminuido y casi no había comido en los últimos tres días. Su nivel de glucosa en sangre era de
28 mg/dl (niveles normales luego del ayuno nocturno 80-100 mg/dl), y el de alcohol en sangre de 295
mg/dl (niveles de intoxicación 150-300 mg/dl). Los exámenes de laboratorio revelaron que tenía una
acidemia, acompañada de niveles altos del cuerpo cetónico ß-hidroxibutirato (40 veces mayores a los
normales) y de ácidos grasos en sangre. El análisis de acetona en orina dio negativo.
¿Qué ocurrirá con la gluconeogénesis a partir de lactato, a partir de glicerol y a partir de oxalacetato?
¿Qué vías metabólicas utilizará Alberto Martini para la síntesis de ATP en cerebro y músculo?¿Qué
ocurrirá en el hígado?
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Biología Celular 2007
¿Cómo explica que el test de acetona en la orina diera negativo y que el cuerpo cetónico predominante
sea el ß-hidroxibutirato?
¿ Porqué es frecuente que los alcohólicos desarrollen depósitos de triglicéridos en el hígado (síndrome
de hígado graso)?
¿Qué vías metabólicas hepáticas serán inhibidas por este aumento de la relación NADH/NAD+? ¿Qué
enzimas serán responsables de esta inhibición?
Objetivos de aprendizaje
1- Metabolismo del ADN. Estructura de los ácidos nucleicos: generalidades. Enzimas modificadoras
del ADN. ADN polimerasas procariotas y eucariotas. Mecanismo molecular de la replicación.
Precisión de la replicación. Mecanismos de reparación.
2- Metabolismo del ARN. Síntesis de ARN. ARN polimerasas dependientes de ADN. Inicio de la
transcripción: promotores. Mecanismo molecular de la transcripción. Maduración del ARN. mARNs:
modificaciones 5’ y 3’, escisión y empalme (splicing). ARN polimerasas dependientes de ARN:
transcriptasa reversa.
2- Supongamos que la densidad de un DNA de doble hebra normal (con 14N) es de 1,670 y la de uno
marcado por completo con 15N es de 1,685. Un cultivo de células se cambia de medio normal a medio
con 15N. ¿Cuál será la densidad del DNA en la 3ª generación (tras 3 divisiones)?
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Biología Celular 2007
5- Las DNA polimerasas avanzan por el DNA, sintetizando una nueva hebra, a la velocidad indicada en
la tabla (nucleótidos por segundo).
DNApol procarióticas
DNApol eucariótica
DNApol-I DNApol-II DNApol-III
16-20 nt/s 7 nt/s 250-1000 nt/s 100 nt/s
b) ¿Cuánto tardaría una única molécula de DNApol en replicar un genoma de E. coli o humano?
(Genoma de E.coli: 4.7 Mb ; genoma humano: 6600 Mb)
a) La tasa de errores en la replicación del DNA se ve reducida tanto por la corrección de pruebas de la
DNA polimerasa como por las enzimas reparadoras del DNA.
7- Dado el siguiente sector de ADN, discuta que partes se replicarán en forma continua y cuales en
forma discontinua:
5’AGGTGCTGCTTAAGCCTGATAGCCTG3’
5’TCCACGTACGAATTCGGACTATCGGAC3’
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Biología Celular 2007
8- ¿En qué etapa de la replicación intervienen las siguientes proteínas? ¿Hay alguna de ellas que no
participa en la duplicación?
maduración de los
iniciación elongación terminación
fragmentos de Okazaki
topoisomerasas
TF II D
DNA polimerasa
RNA polimerasa
helicasa
proteína ro
proteínas de unión a hebra sencilla
primasa
eIF3
ribonucleasa FEN1 y RNasa H1
telomerasa
polinucleótido fosforilasa
ligasa
amanitina
9- ¿Cuáles son las principales similitudes y diferencias entre la ADN-polimerasa y la ARN polimerasa,
desde un punto de vista enzimático?
13- Indique cuál es el número mínimo de reacciones de trans esterificación necesarios para cortar un
intrón y unir los exones adyacentes.
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Biología Celular 2007
15- La secuencia Kozak (en el mRNA de eucariotas) actúa como señal iniciadora de traducción. Se
aparea por tres de sus nucleótidos con el anticodón de primer aminoacil-tRNA (Met-tRNA), en
presencia de eIF-2 y GTP. ¿Es esto correcto?. Comentarlo.
16- En el proceso de traducción, ¿a qué se llama activación de un aminoácido? ¿Para qué aminoácidos
es necesaria?
17- ¿Qué se entiende por mARN monocistrónico y policistrónico?
19.-¿Qué posibles destinos tienen las proteínas que se pliegan en el retículo endopolásmico?
24.- En la degradación de las proteínas por la ruta de la ubiquitina tan solo los pasos 1 y 4 dependen del
ATP. ¿Por qué estos dos pasos y no los otros?
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Bibliografía:
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