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C.Clasificación e identificación: La
clasificación taxonómica busca describir y diferenciar la amplia
diversidad de especies bacterianas poniendo nombres y agrupando
organismos según sus similitudes. Las bacterias pueden clasificarse
con base en diferentes criterios, como estructura celular,
metabolismo o con base en diferencias en determinados
componentes como ADN, ácidos grasos, pigmentos, antígenos o
quinonas. Sin embargo, aunque estos criterios permitían la
identificación y clasificación de cepas bacterianas, aún no quedaba
claro si estas diferencias representaban variaciones entre especies
diferentes o entre distintas cepas de la misma especie. Esta
incertidumbre se debía a la ausencia de estructuras distintivas en la
mayoría de las bacterias y a la existencia de la transferencia
horizontal de genes entre especies diferentes, la cual da lugar a que
bacterias muy relacionadas puedan llegar a presentar morfologías y
metabolismos muy diferentes. Por ello, y con el fin de superar esta
incertidumbre, la clasificación bacteriana actual se centra en el uso
de técnicas moleculares modernas (filogenia molecular), tales como
la determinación del contenido de guanina/citosina, la hibridación
genoma-genoma o la secuenciación de ADN ribosómico, el cual no
se ve involucrado en la transferencia horizontal. La identificación de
bacterias en el laboratorio es particularmente relevante en medicina,
donde la determinación de la especie causante de una infección es
crucial a la hora de aplicar un correcto tratamiento. Por ello, la
necesidad de identificar a los patógenos humanos ha dado lugar a un
potente desarrollo de técnicas para la identificación de bacterias.La
técnica de tinción de membranas de bacterias de Gram, desarrollada
por Hans Christian Gram en 1884, ha supuesto un antes y un después
en el campo de la medicina, y consiste en teñir con tintes específicos
diversas muestras de bacterias en un portaobjetos para saber si se
han teñido o no con dicho tinte. Una vez se han adicionado los tintes
específicos en las muestras, y se ha lavado la muestra pasados unos
minutos para evitar confusiones, hay que limpiarlas con unas gotas
de alcohol etílico. La función del alcohol es la de eliminar el tinte de
las bacterias, y es aquí donde se reconocen las bacterias que se han
tomado: si la bacteria conserva el tinte, es una Gram positiva, las
cuales poseen una pared más gruesa constituida por varias decenas
de capas de diversos componentes proteicos; en el caso de que el
tinte no se mantenga, la bacteria es una Gram negativa, la cual posee
una pared de una composición diferente. La función biológica que
posee esta técnica es la de fabricar antibióticos específicos para esas
bacterias. Esta tinción es empleada en microbiología para la
visualización de bacterias en muestras clínicas. También se emplea
como primer paso en la distinción de diferentes especies de
bacterias, considerándose bacterias Gram positivas a aquellas que
se tornan de color violeta y Gram negativas a las que se tornan de
color rojo.
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Schizophyta
El término Schizophyta fue acuñado por Cohn en 1875, clasificando a los aún no
definidos como procariontes dentro del reino vegetal, pues antes de ese momento eran
considerados "animálculos".
Los dividía en dos grupos:
Clasificación
Una de las clasificaciones tradicionales de las bacterias va de acuerdo con su
morfología.
De forma espiral
Rígidos: Espirilos
Con espirales flexibles: Espiroquetas
Cortos, con apenas una espira: Vibriones
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ACTINOMYCETALES
Actinomycetales es un orden de las Actinobacteria. Son muy diversos, se
clasifican en una serie de subdivisiones y muchas muestras están todavía sin clasificar.
Algunos géneros son muy difíciles de clasificar debido a que su fenotipo es muy
dependiente del nicho ecológico que ocupan. Por ejemplo, Nocardia contiene varias
especies que presentan grandes diferencias debidas solamente a las condiciones
de crecimiento.
Las Actinomycetales son bacterias Gram-positivas. Sin embargo, varias especies tienen
complejas paredes celulares que hacen la tinción de Gram inadecuada; por ejemplo,
las Mycobacteriaceae. Varias Actinomycetales son patógenos para los seres
humanos o los animales, plantasu otras células. El patógeno de los humanos más
conocido es Mycobacterium tuberculosis.
Algunas especies se utilizan en la industria farmacéutica y en investigación debido a sus
propiedades. Streptomycetaceae tiene una singular morfología y ciclo celular y produce
una gran variedad de antibióticos. Corynebacteriaceae,
especialmente Corynebacterium glutamicum, se utiliza para producción en
biotecnología.
FILOGENIA
Según el análisis filogenético de genes codificadores de proteínas,2 los principales
subgrupos se relacionan del siguiente modo:
Actinomycetales
Corynebacterium
Kineosporiineae
Micrococcineae
Propionibacterineae
Streptomycineae
Streptosporangineae
Acidothermus
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Frankia
Micromonosporineae
Glycomycineae
Pseudonocardineae
ESPIROQUETAS
Las espiroquetas (Spirochaetes o Spirochaetae) son un filo de bacterias Gram-
negativas que tienen células alargadas y enrolladas helicoidalmente. Tienen una
longitud comprendida entre 5 y 500 µm y un diámetro de alrededor de 0,1-0,6 µm. Casi
todas son unicelulares, si bien se sospecha que Spirochaeta plicatis podría ser
pluricelular. Poseen una membrana externa formada por múltiples capas llamada
"envoltura celular" o "vaina externa" que rodea completamente el cilindro
protoplasmático.
Endoflagelo
Las espiroquetas se distingue de las demás bacterias por la presencia de unos flagelos
especializados denominados filamentos axiales situados entre la envoltura celular
externa y el cilindro protoplasmático (en el espacio periplasmático) que producen un
movimiento giratorio que permite a la bacteria entera desplazarse hacia adelante, como
si fuese un sacacorchos. Pueden tener (según la especie) de dos a 100 flagelos por
célula, uno de cuyos extremos se inserta cerca de un polo de la célula, quedando el otro
extremo libre. Los flagelos son de estructura y composición similar al resto de las
bacterias, diferenciándose en que son completamente intracelulares.
La movilidad de las espiroquetas es diferente al resto de las bacterias móviles. Pueden
emplear tres tipos de movimiento, en medio líquido, rotación alrededor de su eje,
contracciones flexulosas y movimiento helicoidal. También pueden desplazarse en
ambientes altamente viscosos, incluso en medios sólidos con un 1% de agar. Son
organismos quimioheterótrofos, la mayoría anaerobios que viven libremente, pero hay
numerosas excepciones de parásitos.
FILO
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El filo Spirochaetes se divide en familias, todas incluidas en un único orden,
Spirochaetales. Miembros de importancia médica de este filo son:
Leptospira, que causa leptospirosis o enfermedad de Weil.
Borrelia burgdorferi, que causa la enfermedad de Lyme.
Borrelia recurrentis, que causa la fiebre recurrente.
Treponema pallidum, que causa la sífilis.
Brachyspira, que causa la espiroquetosis intestinal.
El genoma es muy inusual y consta tanto de cromosomas lineales como de plásmidos.
Cavalier-Smith y otros autores han postulado que Spirochaetae forma parte de un clado
mayor denominado Gracilicutes.
FILOGENIA
La filogenia basada en el ARNr 16S es la siguiente:
EUBACTERIAS
Las Eubacterias, también llamadas “bacterias”, son uno de los tres dominios principales
de la vida, junto con las arqueas y las eucariotas. Las eubacterias son procariotas, lo
que significa que sus células no tienen núcleos definidos o limitados por membranas.
Como grupo, exhiben una gama impresionante de diversidad bioquímica, y sus
numerosos miembros se encuentran en cada habitat en la tierra. Las eubacterias son
responsables de muchas enfermedades humanas, pero también ayudan a mantener la
salud y constituyen partes vitales de todos los ecosistemas de la Tierra.
Tipos de Eubacterias
1) Cocos: Las eubacterias cocos son esféricas u ovales en su forma, como una
baya. De hecho, el nombre se deriva de la palabra griega “kokkos”, que significa
baya. Estas son algunas de las bacterias más pequeñas y más simples, con un
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tamaño promedio de aproximadamente 0,5 a 1,0 micrómetros de diámetro. (Un
micrómetro es de aproximadamente 1 / 1.000.000 de un metro.) Un número de
bacterias patógenas (causantes de enfermedades) pertenecen a esta categoría.
Algunos ejemplos de cocos son el estreptococo, que puede causar estreptococo
y escarlatina; estafilococo, específicamente Staphylococcus aureus, que puede
causar intoxicación alimentaria y síndrome de shock tóxico; y el meningococo,
que puede causar una serie de enfermedades meningocócicas, incluyendo la
meningitis bacteriana epidémica.
2) Bacilos: Las eubacterias bacilo tienen forma de varilla. Estas bacterias son
un poco más complejas que la familia de los cocos y, en promedio, son de 0,5 a
1,0 micras de ancho por 1,0 a 4,0 micras de largo. Algunas de estas bacterias
son patógenas, como Yersinia pestis, que pueden causar peste bubónica y
neumónica, o Bacillus anthracis, que es la causa del ántrax. Pero las bacterias
beneficiosas también pertenecen a esta familia, como los que se utilizan para
hacer antibióticos, así como los que colonizan el tracto intestinal humano,
ayudando en la digestión.
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Aunque muchos bacilos son patógenos para el ser humano, algunos no hacen
daño, pues son los encargados de producir algunos productos lácteos como el
yogur (lactobacilos).
Ejemplos
2. VIRUS
(Del latín, ‘veneno’), entidades orgánicas compuestas tan sólo de material genético,
rodeado por una envuelta protectora. El término virus se utilizó en la última década
del siglo pasado para describir a los agentes causantes de enfermedades más
pequeños que las bacterias. Carecen de vida independiente pero se pueden replicar
en el interior de las células vivas, perjudicando en muchos casos a su huésped en
este proceso. Los cientos de virus conocidos son causa de muchas enfermedades
distintas en los seres humanos, animales, bacterias y plantas.
2. Características
Los virus son parásitos intracelulares submicroscópicos, compuestos por ARN o por
ácido desoxirribonucleico (ADN) —nunca ambos— y una capa protectora de
proteína o de proteína combinada con componentes lipídicos o glúcidos. En
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general, el ácido nucleico es una molécula única de hélice simple o doble; sin
embargo, ciertos virus tienen el material genético segmentado en dos o más partes.
La cubierta externa de proteína se llama cápsida y las subunidades que la
componen, capsómeros. Se denomina nucleocápsida, al conjunto de todos los
elementos anteriores. Algunos virus poseen una envuelta adicional que suelen
adquirir cuando la nucleocápsida sale de la célula huésped. La partícula viral
completa se llama virión. Los virus son parásitos intracelulares obligados, es decir:
sólo se replican en células con metabolismo activo, y fuera de ellas se reducen a
macromoléculas inertes.
El tamaño y forma de los virus son muy variables. Hay dos grupos estructurales
básicos: isométricos, con forma de varilla o alargados, y virus complejos, con
cabeza y cola (como algunos bacteriófagos). Los virus más pequeños son
icosaédricos (polígonos de 20 lados) que miden entre 18 y 20 nanómetros de ancho
(1 nanómetro = 1 millonésima parte de 1 milímetro). Los de mayor tamaño son los
alargados; algunos miden varios micrómetros de longitud, pero no suelen medir más
de 100 nanómetros de ancho. Así, los virus más largos tienen una anchura que está
por debajo de los límites de resolución del microscopio óptico, utilizado para
estudiar bacterias y otros microorganismos.
3. Replicación
Los virus que contienen ARN son sistemas replicativos únicos, ya que el ARN se
autoduplica sin la intervención del ADN. En algunos casos, el ARN viral funciona
como ARN mensajero, y se replica de forma indirecta utilizando el sistema
ribosomal y los precursores metabólicos de la célula huésped. En otros, los virus
llevan en la cubierta una enzima dependiente de ARN que dirige el proceso de
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síntesis. Otros virus de ARN, los retrovirus, pueden producir una enzima que
sintetiza ADN a partir de ARN. El ADN formado actúa entonces como material
genético viral.
Entre las enfermedades virales se incluye el resfriado común, que afecta a millones
de personas cada año. Otras enfermedades tienen graves consecuencias. Entre
éstas se encuentra la rabia, las fiebres hemorrágicas, la encefalitis, la poliomielitis
y la fiebre amarilla. Sin embargo, la mayoría de los virus causan enfermedades que
sólo producen un intenso malestar, siempre que al paciente no se le presenten
complicaciones serias. Algunos de éstos son la gripe, el sarampión, las paperas, la
fiebre con calenturas (herpes simple), la varicela, los herpes (también conocidos
como herpes zóster), enfermedades respiratorias, diarreas agudas, verrugas y la
hepatitis. Otros agentes virales, como los causantes de la rubéola (el sarampión
alemán) y los citomegalovirus, pueden provocar anomalías serias o abortos. El
síndrome de inmunodeficiencia adquirida (SIDA), está causado por un retrovirus.
Se conocen dos retrovirus ligados con ciertos cánceres humanos, y se sospecha
de algunas formas de papilomavirus. Hay evidencias, cada vez mayores, de virus
que podrían estar implicados en algunos tipos de cáncer, en enfermedades
crónicas, como la esclerosis múltiple, y en otras enfermedades degenerativas.
Algunos virus tardan mucho tiempo en originar síntomas, y producen las llamadas
enfermedades víricas lentas, como la enfermedad de Creutzfeldt-Jacob y el kuru,
en las que se destruye el cerebro gradualmente.
5. Propagación
Los virus se propagan pasando de una persona a otra, causando así nuevos casos
de la enfermedad. Muchos de ellos, como los responsables de la gripe y el
sarampión, se transmiten por vía respiratoria, debido a su difusión en las gotículas
que las personas infectadas emiten al toser y estornudar. Otros, como los que
causan diarrea, se propagan por la vía oral-fecal. En otros casos, la propagación se
realiza a través de la picadura de insectos, como en el caso de la fiebre amarilla y
de los arbovirus. Las enfermedades virales pueden ser endémicas (propias de una
zona), que afectan a las personas susceptibles, o epidémicas, que aparecen en
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grandes oleadas y atacan a gran parte de la población. Un ejemplo de epidemia es
la aparición de la gripe en todo el mundo, casi siempre, una vez al año.
6. Tratamiento
Los tratamientos que existen contra las infecciones virales no suelen ser del todo
satisfactorios, ya que la mayoría de las drogas que destruyen los virus también
afectan a las células en las que se reproducen. La alfa-adamantanamina se utiliza
en algunos países para tratar las infecciones respiratorias causadas por la gripe de
tipo A y la isatin-beta-tiosemicarbazona, efectiva contra la viruela. Ciertas
sustancias análogas a los precursores de los ácidos nucleicos, pueden ser útiles
contra las infecciones graves por herpes.
7. Infecciones en plantas
Los virus originan gran variedad de enfermedades en las plantas y daños serios en
los cultivos. Las más comunes se producen por el virus del mosaico amarillo del
nabo, el virus X de la patata (papa) y el virus del mosaico del tabaco. Los vegetales
tienen paredes celulares rígidas que los virus no pueden atravesar, de modo que la
vía más importante para su propagación la proporcionan los animales que se
alimentan de ellos. A menudo, los insectos inoculan en las plantas sanas los virus
que llevan en su aparato bucal, procedentes de otras plantas infectadas. También
los nematodos, gusanos cilíndricos, pueden transmitir la infección cuando se
alimentan de las raíces.
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8. Papel en la investigación
Los virus son útiles como sistemas modelo para estudiar los mecanismos que
controlan la información genética, ya que en esencia son pequeñas piezas de esta
información. Esto permite a los científicos estudiar sistemas de replicación más
simples y manejables, pero que funcionan con los mismos principios que los de la
célula huésped. Gran parte de la investigación sobre los virus pretende conocer su
mecanismo replicativo, para encontrar así el modo de controlar su crecimiento y
eliminar las enfermedades virales. Los estudios sobre las enfermedades víricas han
contribuido enormemente para comprender la respuesta inmune del organismo
frente a los agentes infecciosos. Estudiando esta respuesta, se han descrito a fondo
los anticuerpos séricos y las secreciones de las membranas mucosas, que ayudan
al organismo a eliminar elementos extraños como los virus. Ahora, el interés
científico se centra en la investigación destinada a aislar ciertos genes virales. Éstos
podrían clonarse para producir grandes cantidades de determinadas proteínas, que
serían utilizadas como vacunas.
9. Bacteriófago T4
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propiedades infectivas del virus. Los hospedadores humanos deben producir
nuevas defensas inmunes cada vez que éstas mutan; de aquí las vacunaciones
anuales que se realizan.
Fuera de una célula hospedante, un virus es una partícula inerte. Pero una vez
dentro de la célula, el virus se reproduce muchas veces y forma miles de individuos
que abandonan la célula para buscar otras a las que parasitar. Los virus patógenos
actúan destruyendo o dañando las células cuando abandonan aquéllas en las que
se han reproducido.
3. RICKETSIAS
Rickettsia es un género de bacterias (colectivamente denominadas rickettsias) que
pertenece a la familia Rickettsiaceae (junto con los géneros Orientia y Wolbachia).
Las rickettsias son bacterias, muy pequeñas, Gram-negativas y no forman esporas.
Son altamente pleomórficas pues se pueden presentar como cocos (0,1 μm de
diámetro), bacilos (1-4 μm de longitud) o hilos (10 μm de largo). Se tiñen mal con la
tinción de Gram y al examinar cultivos debe haber especial cuidado por esta
característica. En el pasado eran considerados microorganismos intermedios entre
los virus y las eubacterias.
Microbiología general
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Genoma
Infección
Su mecanismo de patogenicidad es producido de la siguiente forma: la bacteria
entra en la célula al estimular la fagocitosis, ésta es mediada por las proteínas OMP
A y B; después de ser engullida debe degradar la membrana del fagolisosoma
mediante la producción de fosfolipasa D y Hemolisina C liberándose en el
citoplasma. Su movilidad intracelular se da gracias a la polimerización la actina por
las proteínas Rick-A y la ARP 2/3.
Una infección por rickettsias puede causar fiebre, erupción cutánea y una sensación
de enfermedad (malestar). Debido a que esta erupción característica no suele
aparecer durante varios días, es difícil establecer un diagnóstico precoz. La
infestación producida por pulgas o piojos o bien una mordedura de garrapata previa,
particularmente si se ha producido en un área geográfica en la que la rickettsiosis
es frecuente (endémica), es un dato importante a la hora de establecer el
diagnóstico.
Diagnóstico
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El diagnóstico de una infección por rickettsia puede confirmarse identificando el
organismo en cultivos especiales de muestras de sangre o tejido, identificando el
organismo con el microscopio, utilizando ciertas tinturas (tinturas colorantes), o bien
identificando anticuerpos contra el organismo en una muestra de sangre.
Últimamente se realiza por fijación de los factores del complemento. Algunos tipos
de tinciones que sirven para identificar el organismo, es la tinción de gimenez y
Naranja de Acradina. Se puede dar un diagnóstico diferencial entre rickettsia y la
fiebre de Zika.
Tratamiento
Los pacientes que estén demasiado enfermos como para tomar los antibióticos por
vía oral pueden recibirlos de forma intravenosa. Si una persona está muy enferma
y en una fase avanzada de la enfermedad, es posible administrar un corticosteroide
durante unos días además del antibiótico para aliviar los intensos síntomas tóxicos
y ayudar a reducir la inflamación de los vasos sanguíneos.
Especies
Las rickettsias de mayor importancia son:
R. rickettsii: No existe evidencia de que produzca toxinas, o de que la respuesta
inmune del huésped sea responsable de las manifestaciones patológicas de la fiebre
maculosa, aunque las manifestaciones clínicas parecen ser el resultado de la
replicación de las bacterias en las células endoteliales, con el posterior daño de estas
y la extravasación de los vasos sanguíneos. La hipovolemia y la hipoproteinemia
producidas por la pérdida de plasma en los tejidos pueden llevar a la reducción de la
perfusión de varios órganos y al fallo de estos. El tratamiento es a base
de tetraciclinas, cloranfenicol y fluoroquinolonas. La morbilidad y la mortalidad son
altas si se retrasan el diagnóstico y el tratamiento específico. No se cuenta con vacuna
para este padecimiento.
R. prowazekii: Es el agente etiológico del tifus epidémico, su principal vector es el
piojo del cuerpo humano, ocurre entre los individuos que viven en condiciones de
hacinamiento y malas condiciones sanitarias que favorecen la propagación de los
piojos. Tiene un periodo de incubación de 2 a 30 días, la sintomatología aparece entre
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los días 1 a 3, la fiebre desaparece en dos semanas pero la convalecencia completa
puede durar más de 3 meses.
Fiebre alta.
Cefalea grave.
Escalofríos.
Mialgias.
Artralgias.
Anorexia.
Exantema petequial o macular (menos del 40% de los enfermos).
El tratamiento es a base de tetraciclinas y cloranfenicol, aunque para manejar una
epidemia, el tratamiento antibiótico debe combinarse con medidas eficaces para el
control de los piojos.
R. typhi: es el agente causal del tifus murino o endémico; los roedores son su
principal reservorio y sus principales vectores son las pulgas de la rata y el gato. La
mayoría de los casos se dan en los meses cálidos.
El periodo de incubación es de 7 a 14 días, la sintomatología aparece de forma
brusca, los síntomas más frecuentes son:
Fiebre.
Cefalea.
Escalofríos.
Mialgias.
Náuseas.
Exantema (menos de la mitad de los pacientes, aparece hacia el final de la
enfermedad).
La enfermedad está restringida de forma característica al tórax y el abdomen, pero
pueden extenderse a palmas y plantas. La enfermedad dura menos de 3 semanas
incluso en pacientes no tratados.
El tratamiento es a base de tetraciclinas, doxiciclina o cloranfenicol.
4. CHLAMYDIA
Chlamydia es un género de bacterias gramnegativas perteneciente a la familia
Chlamydiaceae, orden Chlamydiales, filo Chlamydiae.
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sistemáticamente, el género Chlamydia incluye tres especies: C. trachomatis, C.
muridarum y C. suis.
Microbiología
Presentan una pared celular tipo bacteriana, sin embargo, el peptidoglicano está
ausente o casi imperceptible (a pesar de tener genes para su síntesis). Los
principales antígenos de las clamidias están presentes en la pared(en la "membrana
externa"), la cual contiene el lipopolisacárido (LPS), la proteína principal de la
membrana externa (MOMP, del inglés "Major Outter Membrane Protein") y otras
dos proteínas ricas en cisteína: una proteína de envoltura (62Kd) y una lipoproteína
(12Kd).
Tanto la MOMP como el LPS, son los componentes antigénicos más importantes.
Forma de vida
Taxonomía
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Chlamydia es un taxón genérico que fue acuñado en 1996 por Jones et al.,
presentando a Chlamydia trachomatis como especie tipo para el taxón.
Clásicamente, esto es, desde 1971 y hasta 1999, se aceptaban cuatro especies
dentro del género Chlamydia (según la clasificación de Stolz y Page):
Chlamydia trachomatis (Busacca 1935) Rake, 1957, cepa tipo: ATCC VR-
571.
Chlamydia pneumoniae;
Chlamydia pecorum;
Chlamydia psittaci (Lillie 1930) Page, 1968, cepa tipo: ATCC VR-125.
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Infecciones oculares como el tracoma y paratracoma, conjuntivitis neonatal,
neumonía intersticial del lactante.
Infecciones genitales o enfermedades de transmisión sexual, como las uretritis
no gonocócicas y el linfogranuloma venéreo.
Artritis reactiva, enfermedad autoinmune que puede persistir aún eliminada la
clamidia.
Se recomienda que las mujeres embarazadas pidan a su médico que les realice una
prueba de clamidia en la primera etapa del embarazo. En caso de infección se pueden
tomar antibióticos para tratar la infección y se evitarán complicaciones para la madre y
el feto.
Deben tener relaciones sexuales con una sola persona que no tenga ninguna
otra pareja sexual, que se haya hecho la prueba para la clamidia y no esté
infectada.
Deben usar un condón o preservativo de látex.
Si su médico receta antibióticos, deben asegurarse de tomarlo como fue
indicado.
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