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Bioquímica
Índice
Presentación de la unidad
En las unidades anteriores estudiaste varios procesos del metabolismo celular así como a
los carbohidratos y proteínas, moléculas que juegan un papel esencial en el desarrollo
celular. Esta unidad estará centrada en biomoléculas que también tienen un papel muy
importante en los seres vivos: los lípidos y los ácidos nucleicos.
También estudiarás cuáles son las funciones bioquímicas de los lípidos y cómo es su
anabolismo y catabolismo ya que después de la glucosa, los lípidos son la principal
reserva energética del organismo, además de tener una función crucial como parte
estructural de la membrana celular.
Por otro lado, conocerás cuál es la estructura y función de las moléculas encargadas de
preservar la información genética de los organismos vivos: los ácidos nucleicos. Al
finalizar esta unidad y la asignatura tendrás un conocimiento amplio de cada una de las
funciones y rutas metabólicas en las que participan todas las biomoléculas.
Propósitos
Competencia específica
La célula es la unidad fundamental de la vida. Una célula aislada es una entidad separada
de otras por una membrana (muchas células contienen, además, una pared celular
exterior a la membrana). Cada célula contiene una gran variedad de estructuras químicas
y componentes subcelulares.
Las actividades de las células pueden considerarse desde dos aspectos. Por un parte, las
células pueden ser como máquinas vivas que realizan transformaciones químicas.
Si realizarás la disección bioquímica de una célula encontrarías que el componente
principal es el agua; también encontrarías presentes grandes cantidades de
macromoléculas, cantidades menores de monómeros precursores de macromoléculas y
varios iones inorgánicos. Cerca del 95 % del peso seco de una célula es debido a las
macromoléculas y, dentro de estas, las proteínas son con mucho las más abundantes,
seguidas de los ácidos nucleicos y posteriormente los lípidos. Los lípidos tienen
propiedades hidrofóbicas e hidrofílicas y tienen funciones esenciales en la estructura de
las membranas y como depósitos de almacenamiento del exceso de carbono.
Las funciones que desempeñan los lípidos en los seres vivos se deben en gran parte a sus
estructuras hidrófobas. Como componentes destacados de las membranas celulares y
excelentes fuentes de energía.
Enlaces
Los lípidos tipo triglicéridos se acumulan en las células con la función principal de reservar
de energía ya que cuenta con largas cadenas hidrocarbonadas altamente reducidas, de
manera que la oxidación proporciona energía de manera rápida, la cual se transforma o se
disipa en calor. En este proceso se produce ATP y se lleva a cabo la segunda función más
importante de los lípidos: la producción de calor (Mathews, 2002).
Las micelas contienen una zona altamente hidrofóbica que no puede ser atravesada por
compuestos polares como los azúcares, es por ello que las membranas plasmáticas están
formadas además por proteínas que permiten transportar esas micromoléculas (como lo
revisarás en el siguiente apartado). De esta manera, las membranas se transforman en
estructuras semipermeables y selectivas de tal forma que solo se transporten aquellos
metabolitos que son necesarios para la vida celular. Además, las membranas tienen, en
su cara externa a la célula, un conjunto de oligosacáridos que le ayudarán en el
señalamiento intercelular (Lodish, 2007).
Los esfingolípidos también forman parte de la membrana plasmática y son los segundos
lípidos más importantes. Son más abundantes en las células del tejido nervioso de los
animales puesto que la esfingomielina junto con el ácido lignocérico y un aminoalcohol,
llamado colina, conforman las vainas de mielina (figura 4) que protegen y aíslan a las
células nerviosas, además de favorecer la sinapsis.
Tomado de http://www.liquidarea.com/2011/05/sclerosi-multipla-attesi-i-risultati-delle-
staminali-sugli-interruttori-di-mielina/.
Otro tipo de lípidos, como las ceras, tienen como función principal formar cubiertas
protectoras en los animales, ya sea en el pelo como es el caso de la lanolina de la lana
de las ovejas o en las plumas de las aves. En los vegetales se pueden encontrar en las
hojas, tallos y frutos recubriéndolos y protegiéndolos de la pérdida de agua por efecto de
la evaporación. En los insectos los podemos encontrar en el exoesqueleto y también en
un gran ejemplo en las ceras producidas por las abejas compuesta, principalmente, por
ésteres del ácido palmítico.
En el caso de los terpenos, éstos son importantes porque forman los aceites esenciales
que aportan olor y sabor a algunos vegetales, por ejemplo geraniol, mentol, limoneno,
alcanfor y pineno. Otro terpeno es el fitol que forma parte de la molécula de clorofila
(figura 5). Estos compuestos también generan otros pigmentos fotosintéticos, ejemplo de
ello son los carotenoides, los cuales pueden estar presentes en bacterias y hongos como
metabolitos secundarios con importancia biotecnológica.
Tomado de http://notodoloquerelucees.blogspot.mx/2015/01/verde-
que-te-quiero-verde-clorofila.html.
También existen terpenos con importancia fisiológica puesto que son vitaminas (A, K y E)
liposolubles o coenzimas como la coenzima Q que actúa como transportador de
hidrógeno en las oxidaciones biológicas de las mitocondrias (Nelson y Cox, 2009).
Una de las funciones de los eicosanoides es ser biocatalizadores, pues facilitan las
reacciones químicas que se producen en los seres vivos; además participan en la
comunicación celular, en los procesos de inflamación y la respuesta inmune (figura 6)
de vertebrados e invertebrados ya que las prostaglandinas son un tipo de eicosanoide que
tiene funciones en dicha respuesta.
Tomado de https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/36/Beta-
oxidacion.svg/640px-Beta-oxidacion.svg.png.
Para la degradación de los ácidos grasos de cadena impar o los insaturados se requiere
de distintas modificaciones, conformando rutas ligeramente diferentes como la α-
oxidación, la ω-oxidación o la oxidación peroxisómica.
Durante la β-oxidación se oxidan los ácidos grasos liberando en cada ciclo 2 carbonos en
forma de acetil-CoA que se incorpora al ciclo de Krebs; así como una molécula de FADH2
y un NADH que se van a la cadena transportadora de electrones. El ciclo está formado
por cuatro reacciones que se repiten según el número de carbonos del ácido graso de
que se trate.
Beta oxidación
El proceso completo de beta oxidación requiere llevar a cabo varias vueltas de las
reacciones que se mencionaron, pero la última vuelta se lleva a cabo cuando solo
quedan cuatro átomos de carbono en la cadena puesto que se producen dos acetil Co-
A. Por lo tanto, un ácido graso sufrirá tantas vueltas como la mitad menos uno del
número de átomos de carbono tenga.
Figura 8. Ejemplo de
β-Oxidación. Se
muestra la oxidación de
un ácido graso de 14
átomos de carbono para
la formación de 7
moléculas de Acetil-
CoA.
Modificado de
http://images.devilfinder.co
m/go.php?q=Beta+Oxidati
on+of+Very+.
La síntesis de lípidos ocurre a partir de moléculas más sencillas de Aceti–CoA que serán
reducidas hasta formar el ácido graso, como puedes observar en la figura 9, siendo una
reacción inversa a la que ocurre en la ß-oxidación. En las células eucariotas,
la ß-oxidación ocurre en la mitocondria, en cambio la síntesis es un proceso
citoplasmático, principalmente de las células del hígado.
Tomado de
http://laguna.fmedic.unam.mx/~evazquez/0403/sintesis%20acidos%20grasos.html
Fase preparatoria
A continuación se lleva a cabo el proceso de biosíntesis de los ácidos grasos, en una ruta
inversa a la β-oxidación y se construye por la adición secuencial de grupos de dos
carbonos que suministran la acetil-CoA.
Síntesis de lípidos
3. Se elimina una molécula de agua a partir del C-2 y C-3 del D-β-hidroxibutiril-
ACP, formándose un doble enlace en el producto trans-Δ2-butenoil-ACP con
ayuda de la enzima β-hidroxiacil-ACP deshidratasa.
De esta manera, cuando la célula tiene suficiente energía, utiliza el ATP y el NADH + H
para sintetizar moléculas que le permitan reservar energía como la glucosa (en forma de
glucógeno en las células animales y almidón en las células vegetales) o los triglicéridos.
Todas las biomoléculas, en su conjunto, son de gran importancia; unas tienen mayor
abundancia en el organismo que otras y desempeñan funciones vitales para el buen
funcionamiento celular. Todas las biomoléculas forman parte de un sistema que tiene
como resultado la conformación de seres extraordinarios. Las proteínas, los
carbohidratos, los lípidos y los ácidos nucleicos son los responsables de generar vida. Los
ácidos nucleicos son polímeros formados por nucleótidos y en las células se encuentran
dos tipos: el RNA y DNA. Después de las proteínas, el ácido ribonucleico (RNA) es el tipo
de macromoléculas más abundante en una célula en crecimiento. Esto se debe a que en
cada célula hay miles de ribosomas (“máquinas” que fabrican nuevas proteínas) y los
ribosomas se componen de RNA y proteínas. Además están presentes cantidades
menores de RNA en la forma de RNA mensajero y de transferencia que también
participan en la síntesis de proteínas. En contraste, el DNA representa un componente
cuantitativamente minoritario en la célula en especial bacteriana.
Las últimas biomoléculas que estudiarás son los ácidos nucleicos. Aunque su estructura
puede ser la más simple, son de vital importancia en todos los seres vivos porque en ellos
reside la información para la síntesis de todas las funciones del organismo.
Ácidos nucleicos
Los ácidos nucleicos son el material genético que cumple con cuatro funciones
principales en las células: replicación, almacenaje de la información, expresión
de esta información y variación por mutación.
Los monómeros que constituyen a los ácidos nucleicos se denominan nucleótidos (figura
10) y están conformados por tres componentes esenciales: una base nitrogenada, un
azúcar pentósido (azúcar con cinco carbonos) y un grupo fosfato. Hay dos tipos de bases
nitrogenadas: las purinas, un doble anillo de nueve lados y las pirimidinas, un anillo de
seis lados. En los ácidos nucleicos se encuentran generalmente dos tipos de purinas y
tres tipos de pirimidinas; las dos purinas son adenina y guanina, abreviadas como A y G,
respectivamente. Las tres pirimidinas son la citosina, la timina y el uracilo que se abrevian
El tipo de azúcar presente es la principal diferencia entre los dos tipos de ácidos
nucleicos: si está formado por desoxirribosa, como azúcar, entonces estamos hablando
del ácido desoxirribonucleico o DNA (por sus siglas en inglés desoxiribonucleic acid) y
si el azúcar es una ribosa entonces tenemos al ácido ribonucleico o RNA (por sus siglas
en inglés ribonucleic acid), los cuales también cumplen con funciones distintas que
analizaremos a continuación.
Una molécula compuesta por una base (purina o pirimidina) y por un azúcar (ribosa o
desoxirribosa) forma una unidad química denominada nucleósido. Si se añade un grupo
fosfato al nucleósido, la nueva molécula recibe el nombre de nucleótido. Los nucleósidos
y los nucleótidos reciben el nombre de la base nitrogenada específica que forma parte de
la molécula.
La unión entre los tres componentes de un nucleótido es muy específica. El átomo C-1 del
azúcar se une químicamente a la base nitrogenada, si la base es una purina, el átomo N-9
se une covalentemente al azúcar. Si la base es una pirimidina, la unión se efectúa por el
átomo N-1. Los nucleótidos pueden presentar el grupo fosfato unido al átomo C-2, C-3 o
C-5 del azúcar; sin embargo, la C-5 es la más frecuente en los sistemas biológicos (Klug,
et al., 2006).
Tomado de http://www.bionova.org.es/biocast/tema09.htm.
Modificado de http://www.vi.cl/foro/topic/7227-biomoleculas-metabolismo-
cuestiones-resueltas/page_st_100.
La unión entre dos mononucleótidos consiste en un grupo fosfato unido a dos azúcares
por medio de un enlace fosfodiéster ya que el ácido fosfórico se une a dos alcoholes
(grupos hidroxilo de los dos azúcares) por una unión éster en ambos lados, entre el OH
del carbono 3’ del nucleótido presente en la cadena con el fosfato del carbono 5’ del
nucleótido que se incorpora; de esta manera podemos observar cómo el crecimiento de
todas las moléculas de ácidos nucleicos siempre ocurre en dirección 5’-3’. La unión de
dos nucleótidos forma un dinucleótido, la de tres nucleótidos un trinucleótido y así
sucesivamente. Cadenas cortas de menos de 20 nucleótidos unidos reciben el nombre de
oligonucleótidos y cadenas más largas se denominan polinucleótidos (figura 14).
Modificado de http://cienciastella.com/ADN.html y
http://www.iesaltoalmanzora.es/centro/departamentos/biologia/2bto_bio/unid6.htm.
Modificado de http://www.fromquarkstoquasars.com/cells-and-dna-a-basic-
breakdown/.
Tomado de http://what-when-how.com/wp-
content/uploads/2011/05/tmp1E3128_thumb_thumb.jpg
En los últimos años se han descubierto otras tres formas de hélice de DNA dextrógiro en
condiciones de laboratorio que se han designado como DNA-C, -D y –E. El DNA-C se
encuentra en condiciones de mayor deshidratación que en las que se obtiene el DNA-A y –
B. Tiene solamente 9.3 pares de bases en cada vuelta y por lo tanto es menos compacto;
el diámetro de la hélice es igual que el del DNA-A con la diferencia que no tiene los pares
de bases dispuestos horizontalmente sino inclinados en relación al eje de la hélice. Las
otras dos formas, el DNA-D y DNA-E, se producen en hélices cuya composición de bases
carece de guanina y tienen menos número de bases por vuelta, 8 y 7 respectivamente (Klug
y et. al., 2006).
Los organismos procariontes (aquellos que no tienen núcleo como las bacterias) tienen el
DNA en forma circular, mientras que en los organismos eucariontes (células presentes
en algas, hongos, protozoos, vegetales y animales) se encuentra en forma lineal.
Esta estructura formada mide aproximadamente 30 nm. Crea una serie de dominios en
forma de lazo que condensan, todavía más, la fibra de cromatina cuyo diámetro es ahora
de 300 nm generando el tercer nivel de empaquetamiento. Posteriormente, las fibras se
enrollan en los brazos del cromosoma constituyendo una cromátida que a su vez forma
parte del cromosoma metafásico. Estos empaquetamientos permiten condensar todo el
material genético en un espacio muy reducido que estará contenido en el núcleo (Figura
18).
Los cromosomas bacterianos tienen una forma relativamente simple ya que solo
presentan una molécula de DNA de doble cadena compactada en una estructura que se
denomina nucleoide (Figura 19). El DNA está asociado a varios tipos de proteínas de
unión al DNA, como las HU y U que como las histonas contienen un alto porcentaje de
aminoácidos cargados positivamente que pueden unirse iónicamente a las cargas
negativas de los grupos fosfato del DNA (Klug y et. al., 2006).
Tomado de http://4.bp.blogspot.com/-
myWkM7HLrpc/UEStvIxKnHI/AAAAAAAAALk/4Ohzi5wD8lA/s1600/E+coli.jpg
El RNA es una molécula con estructura similar a la del DNA pero con varias excepciones
importantes. Aunque el RNA también tiene por piezas nucleótidos unidos en cadenas de
polinucleótidos, el azúcar ribosa reemplaza a la desoxirribosa y la base nitrogenada
uracilo reemplaza a la timina. Otra diferencia importante es que la mayor parte del RNA es
de cadena sencilla.
Figura 20. RNA mensajero. Estructura del ARNm presente en una célula
eucariota.
El RNAr o RNA ribosomal constituye alrededor del 80 % del ARN total de una célula.
Varios tipos de RNA, junto con diferentes proteínas, forman los ribosomas celulares, lugar
donde ocurre la síntesis de proteínas. En el caso de las células procariotas podemos
encontrar el RNAr 5S, 16S y 23S mientras que en los eucariotas están los RNAr 5S, 5,8S,
18S y 28S (figura 22). La S significa coeficiente de Svedberg y se refiere al
Tomado de http://genomasur.com/lecturas/11-21-G.gif
Al igual que el ATP, el GTP también es una molécula que almacena energía, otra de sus
funciones es ser la encargada de proveer la energía suficiente para que se produzcan los
enlaces peptídicos durante la síntesis de las proteínas.
También tenemos al AMPc y el GMPc derivados del ATP y GTP respectivamente, donde
el átomo de fosfato forma un anillo al estar unido al carbono 5’ y 3’ (figura 23). Estas
moléculas están implicadas en la regulación celular siendo uno de los principales
segundos mensajeros celulares. Todas las células se comunican unas con otras y
detectan el medio ambiente donde habitan para responder a los cambios que se
producen, para ello, en las membranas celulares existen proteínas cuya función es la
recepción de estos mensajes para comunicarlos a la célula y así actuar en consecuencia.
En la mayoría de los casos, esta señal se transmite utilizando segundos mensajeros que
llevan la señal de la membrana hasta el núcleo u organelo que deben responder a ella.
Desde hace años se ha demostrado que existen varios tipos de RNA con actividad
catalítica como las ribozimas. Otro ejemplo es el rRNA presente en el ribosoma y que se
encarga de formar el enlace peptídico durante la síntesis de proteínas. Los primeros en
sugerir esta actividad fueron Crick y Orgen en 1967, pero no fue hasta 1980 cuando Cech
Altman lo demostró de manera independiente.
Tomado de https://imperiodelaciencia.files.wordpress.com/2011/10/lo-que-creen-que-
es-el-dogma.jpg
Por otro lado, es importante que se produzcan las proteínas necesarias en cada situación
ya que un exceso de las mismas equivaldría a un gasto de energía innecesario y una falta
de alguna proteína podría conllevar la muerte de los organismos. Es por ello que la
regulación de los genes, que deben expresarse en cada momento, es de vital
importancia. Es ahí donde están involucrados los RNA reguladores como el ARN de
interferencia, el antisentido, los MicroARN o los Riboswith, entre otros.
Enlaces
Actividades
Autorreflexiones
Cierre de la unidad
La biotecnología es el uso de organismos vivos para fines industriales o comerciales. En
este sentido, la biotecnología abarca desde el uso de levaduras en la elaboración de
bebidas fermentadas hasta el uso de sanguijuelas para curar heridas, técnicas utilizadas
por el ser humano desde los albores de la civilización. No obstante, la palabra
biotecnología implica que los organismos utilizados para realizar el proceso han sido
modificados genéticamente mediante técnicas de ingeniería genética.
En este momento puedes identificar procesos que llevarán a una mejora continua de
innovaciones tecnológicas pero no es la única herramienta para tal fin, el conjunto de varias
ciencias te guiarán hacia una respuesta a los constantes cambios que obligan a afrontar
nuevos retos y seguir construyendo una nueva visión biotecnológica.
β-OXIDACIÓN
https://www.youtube.com/watch?v=mKp_GmmtLy0
Tipos de ARN
http://es.scribd.com/doc/23794366/Tips-de-arn
ADN y ARN
https://www.youtube.com/watch?v=BjEFRONjWIo
Fuentes de consulta