Departamento de Ingeniería Bioquímica

Biocatálisis
Unidad 1: Generalidades

Nelson Caicedo, Ph. D.

Carlos Alvarez-Vasco, Ph.D.
Universidad Icesi, Cali-CO. Enero 28, 2019
Importancia Ejemplos Terminos Propiedades

Guía del día.

 Unidad 1: Generalidades en Biocatálisis.

 Unidad 1: Nomenclatura de las Enzimas.

 Cierre: Unidad 1.

 Verificación de objetivos Unidad 1.

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Importancia Ejemplos Terminos Propiedades

Que es la Biocatálisis?

La velocidad de reacción aumenta en un factor 106-1012

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Importancia Ejemplos Terminos Propiedades

Que es la Biocatálisis?

La velocidad de reacción aumenta en un factor 106-1012

Como logra bajar la barrera (Ea):

• Los reactivos son posicionados muy
cerca el uno del otro, y en una
orientación que facilita la reacción.
• Cambian el ambiente local.
• Participando directamente en la
reacción (temporalmente).
−
k
R=cte gases, T= temp (K), Ea= Energía de activación 4
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 Importancia Ejemplos Terminos Propiedades

Ejercicio de practica 1.
La velocidad de reacción aumenta en un factor 106-1012
−
k
R=cte gases, T= temp (K),
Ea= Energía de activación

Actividad: One minute paper

1. Formar parejas (la que este en la fila del frente)

2. Discutir por 1 min que pasa con la velocidad de reacción cuando:
a) Disminuye la Ea, b) Aumenta la temperatura.
3. El profesor seleccionará aleatoriamente a una pareja para que explique los eventos a y b.

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 Importancia Ejemplos Terminos Propiedades

Ejercicio de practica 1.
−
k
R=cte gases, T= temp (K),
Ea= Energía de activación

Actividad: One minute paper

1. Formar parejas (la que te mire primero)

2. Discutir por 5 min el ejercicio de practica 1, pensando en la estrategia de solución:

a) Antes de empezar: Unidades?, b) Estrategia, c) Suposiciones?

3. El profesor seleccionará aleatoriamente por tiempos una pareja para que explique los
eventos a, b y c.

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 Importancia Ejemplos Terminos Propiedades

Ejercicio de practica 2.
−
k
R=cte gases, T= temp (K),
Ea= Energía de activación

Actividad: Consultar los ejercicios de

practica de la unidad 1 en Moodle.
Primero: Intente solucionarlos por usted mismo, sin ver la solución.
Segundo: Compare su solución, con la solución propuesta por el profesor.

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Importancia Ejemplos Terminos Propiedades

Ejemplos de procesos?
Catalizados por enzimas

Porque es importante eliminar el Oxigeno de los alimentos?

Glucosa Oxidasa

β-D-Glucosa + O2 → D-Glucono-lactona + H2O2

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Importancia Ejemplos Terminos Propiedades

Ejemplos de procesos?

Catalizados por complejos enzimáticos

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Importancia Ejemplos Terminos Propiedades

Catalizados por complejos enzimáticos

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CAAV2
Importancia Ejemplos Terminos Propiedades

Ejemplos de procesos?

Catalizados por células completas

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Diapositiva 11

CAAV2 A que se deben las cicatrices en la superficies de las celulas de levadura?

Carlos Andres Alvarez Vasco; 6/08/2018
Importancia Ejemplos Terminos Propiedades

Ejemplos de procesos?

Catalizados por células completas

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Importancia Ejemplos Terminos Propiedades

Generalidades
Son las enzimas estructuras rígidas?

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Importancia Ejemplos Terminos Propiedades

Generalidades
Son las enzimas estructuras rígidas?

Las enzimas son estructuras

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dinámicas 14

(se adaptan)
CAAV5
CAAV6
Importancia Ejemplos Terminos Propiedades
CAAV7
CAAV8
Clasificación de acuerdo al numero de fases

Biocatálisis
Homogénea

S, P y
biocatalizador
están disueltos en
una sola fase.

Biocatálisis Heterogénea

P
S P S,
S, P
Biocatalizador
S P 15
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Diapositiva 15

CAAV5 Biocatalisis Heterogenea

Carlos Andres Alvarez Vasco; 6/08/2018

CAAV6 1. El biocatalizador esta en la fase solida, el sustrato y el producto en la fase liquida.

Carlos Andres Alvarez Vasco; 6/08/2018

CAAV7 2. El biocatalizador en una fase liquida (hidrofilica, acuosa), el sustrato y el producto en las dos fases (equilibrio o separados por
membrana)
Carlos Andres Alvarez Vasco; 6/08/2018

CAAV8 3. El Sustrato y biocatalizador en una fase (acuosa), y el producto en otra fase (Hidrofobica)
Carlos Andres Alvarez Vasco; 6/08/2018
 Importancia Ejemplos Terminos Nomenclatura

Nomenclatura

A los inicios no se contaba con una guía sistemática para la asignación de nombres a las
enzimas.
Era posible que dos diferentes enzimas tuviesen el mismo nombre.

Ejemplo: catalasa, enzima de pH 5.

A partir de 1950, la International Union of Biochemestry and Molecular Biology

(IUBMB) estableció la comisión de enzimas.

Está en actualización permanente y puede ser consultada on-line.

La nomenclatura sugiere dos nombres para cada enzima:

1. Nombre común o recomendado.
2. Nombre sistemático.

Ambos están basados en la naturaleza de la reacción catalizada 16

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Importancia Ejemplos Terminos Nomenclatura

Nomenclatura

La comisión de enzimas (EC) desarrollo un sistema de identificación

numérico basado en algunos criterios. Normalmente se recomienda
referenciar los dos nombres para especificar a una enzima.

Numero EC consta de cuatro (4) dígitos.

EC (i).(ii).(iii).(iv)

(i) Hace referencia al tipo de reacción catalizada y esta asociado a las 7

clases.
(ii) Sub clase. Indica el tipo de sustrato, el tipo de grupo funcional
transferido o la naturaleza de un enlace especifico involucrado en la
reacción catalítica.
(iii) Sub clase. Da cuenta de la naturaleza del sustrato o del co-sustrato.
(iv) Numero arbitrario

http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/ 17
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 Importancia Ejemplos Terminos Nomenclatura

Nomenclatura

Clase Nombre Tipo de reacción Information adicional CAAV3

CAAV4
1 Oxidoreductasa Transferencia de electrones, Son estrictamente intracelulares. Están
hidrogeno o átomos de oxigeno involucradas en las rutas centrales del
metabolismo y requieren de coenzimas.

2 Transferasas Catalizan la transferencia de un Juegan un rol importante en el

grupo funcional de un donor a un metabolismo celular. Tag DNA polimerasa.
aceptor.

3 Hidrolasas Catalizan las reacciones de Son relevantes para el catabolismo. Muchas

hidrolisis. Rompimiento de un no requieren coenzimas, muchas son
enlace por acción del agua. extracelulares y robustas.

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Diapositiva 18

CAAV3 Oxidoreductasas: Porque requieren de coenzimas?

Carlos Andres Alvarez Vasco; 6/08/2018

CAAV4 Porque las especies reactivas d eoxigeno son altamente reactivas y podrian dañar la estructura proteica si los aminoacidos participaran.
Carlos Andres Alvarez Vasco; 6/08/2018
 Importancia Ejemplos Terminos Nomenclatura

Nomenclatura
Clase Nombre Tipo de reacción Information adicional
4 Liasas Catalizan reacciones de rompimiento Muchas son intracelulares y algunas no
de enlaces por vías distintas de la requieren de coenzimas. Nitrilo
hidrolisis y de oxido reducción. hidratasa.
Adición grupos a dobles enlaces o
formación de estos.
5 Isomerasas Convierten un sustrato en su isomero Muchas son intracelulares y requieren
de cofactor mas no de coenzimas.
Glucosa isomerasa.

6 Ligasas Catalizan las reacciones de unión
covalente de dos moléculas.
Requieren ATP, u otra fuente de
energía.
7 Translocasa Catalyse the movement of ions
(2018/10) or molecules across membranes
or their separation within
membranes
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Son las responsables del anabolismo.
Estrictamente intracelular y con
requerimiento de coenzimas. T4 DNA
ligasa.
Several of these involve the
hydrolysis of ATP and had been
previously classified as ATPases
19
(EC 3.6.3.-), although the
hydrolytic reaction is not their
primary function.
Importancia Ejemplos Terminos Nomenclatura

Nomenclatura: Ejemplos

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Importancia Ejemplos Terminos Nomenclatura

Nomenclatura: Ejemplos

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Importancia Ejemplos Terminos Nomenclatura

Nomenclatura

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Importancia Ejemplos Terminos Nomenclatura

Observaciones Nomenclatura

La fuente biológica de la enzima no está incluido en el sistema de nomenclatura.

Cuando se reporta una enzima es importante mencionar este origen.

Por ejemplo: la enzima empleada para catalizar la reacción química para

producir “Acrilamida” debería ser descrita así:
Nitrilo hidratasa (EC 4.2.1.84) extraída de Rhodococcus rhodochorous.

Nombres comerciales de algunas enzimas dificulta la selección de un

biocatalizador.

Novozyme 435TM (Novozymes).

Lipasa B C. antartica.
Triacilglicerol lipasa. (EC 3.5.1.11)
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Importancia Ejemplos Terminos Nomenclatura

Nomenclatura Ejercicios

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Importancia Ejemplos Terminos Nomenclatura

Nomenclatura Ejercicios

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 Importancia Ejemplos Terminos Nomenclatura

Resumen Unidad 1

Objetivos específicos
 Comprender la importancia de las reacciones catalizadas por células, enzimas o
complejos enzimáticos.

 Usar la terminología y comprender las variables y constantes de las ecuaciones que

se usan para describir reacciones catalizadas por enzimas.

 Clasificar las enzimas de acuerdo a las reacciones que ellas catalizan.

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