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INGENIERÍA BIOQUÍMICA
1
ÍNDICE
I. INTRODUCCIÓN ........................................................................................................................... 7
II. PROBLEMÁTICA A RESOLVER ................................................................................................ 9
III. JUSTIFICACIÓN ........................................................................................................................ 9
IV. OBJETIVOS ............................................................................................................................. 11
4.1. Objetivo general ....................................................................................................................... 11
4.2. Objetivo particulares ................................................................................................................ 11
V. Caracterización del área en que participó ............................................................................... 12
5.1. Antecedentes de la empresa ................................................................................................. 12
5.1.1. Misión ..................................................................................................................................... 12
5.1.2. Visión ...................................................................................................................................... 12
5.1.3. Política de Calidad ............................................................................................................... 12
5.1.4. Logo de la Empresa ............................................................................................................. 12
5.1.6. Descripción del área: Unidad de Biotecnología (UBT) ................................................... 14
VI. ALCANCES Y LIMITACIONES ............................................................................................. 15
VII. MARCO TEORICO .................................................................................................................. 16
7.1 El banano ................................................................................................................................... 16
7.1.1 Países productores de plátanos y banano ........................................................................ 16
7.1.2 Valor nutricional del banano ................................................................................................ 18
7.2 El hongo Mycosphaerella fijiensis .......................................................................................... 19
7.2.1. Distribución de la Sigatoka negra ...................................................................................... 20
7.2.2. Desarrollo de los síntomas de infección de la Sigatoka negra ..................................... 21
7.2.3. Ciclo de vida de Mycosphaerella fijiensis ......................................................................... 22
7.3 Protoplastos ............................................................................................................................... 23
7.4 Pared celular fúngica ................................................................................................................ 23
7.5 Componentes de la Pared Celular ......................................................................................... 24
7.5.1 Manoproteínas ....................................................................................................................... 24
7.5.2 Quitina ..................................................................................................................................... 25
7.5.3 Glucanos ................................................................................................................................. 25
2
7.6 Criopreservación ....................................................................................................................... 26
7.6.1 Factores que afectan la criopreservación .......................................................................... 27
7.7 Crioprotectantes ........................................................................................................................ 27
7.7.1 Crioprotectantes penetrantes .............................................................................................. 28
7.7.2 Crioprotectantes no penetrantes ......................................................................................... 29
7.8 Métodos de criopreservación de protoplastos...................................................................... 29
VIII. DIAGRAMA EXPERIMENTAL ............................................................................................... 33
IX. MATERIALES Y MÉTODOS ................................................................................................. 34
9.1 Material fúngico ......................................................................................................................... 34
9.2 Cultivo del hongo en medio PDB ........................................................................................... 34
9.3 Digestión enzimática de micelio ............................................................................................. 34
9.4 Lavado de la digestión ............................................................................................................. 34
9.5 Cuantificación de protoplastos ................................................................................................ 35
9.6 Efecto de crioprotectantes en la criopreservación de protoplastos .................................. 35
9.7 Tinción vital (viabilidad celular) ............................................................................................... 35
9.8 Generación de protoplastos .................................................................................................... 36
9.9 Cuantificación de protoplastos regenerados ........................................................................ 36
X. RESULTADOS ............................................................................................................................. 37
10.1 Material biológico .................................................................................................................... 37
10.2 Crecimiento del hongo Mycosphaerella fijiensis cultivado en medio líquido (PDB) ..... 37
10.3 Digestión enzimática .............................................................................................................. 38
10.4 Producción de protoplastos del hongo Mycosphaerella fijiensis ..................................... 38
10.4 Tinción vital (viabilidad celular) ............................................................................................. 39
10.5 Regeneración de protoplastos .............................................................................................. 40
XI. DISCUSIÓN .............................................................................................................................. 44
XII. CONCLUSIÓN Y RECOMENDACIONES ........................................................................... 45
XIII. BIBLIOGRAFÍA ........................................................................................................................ 46
3
LISTA DE CUADROS
Cuadro Página
4
LISTA DE FIGURAS
Figura Página
5
LISTA DE ABREVIATURAS
Abreviaturas Significado
SN Sigatoka Negra
DMSO Dimetilsulfóxido
PEG Polietilenglicol
PVP Polivinilpirrolidone
PROH Propanidiol
EG Etilenglicol
OM Medio osmótico
ml Mililitros
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I. INTRODUCCIÓN
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temperaturas de una variedad de tipos de células. Esta técnica está disponible para
la criopreservación de microorganismos, células de tejidos aisladas, pequeños
organismos multicelulares, y organismos a un más complejos, tales como embriones.
El proceso de criopreservación está clasificado de acuerdo a la velocidad de
congelamiento y descongelamiento, estos factores tienen un papel importante para la
preservación de células. Los métodos de criomicroscopia se utilizan para estudiar el
proceso de congelación y descongelación de los cultivos fúngicos. La
criopreservación depende en gran medida, de los agentes crioprotectores, los cuales
cumplen varias funciones durante el proceso de congelación. La elección de un
agente crioprotector depende del tipo de célula que se desea preservar. En la
actualidad, entre los más utilizados se encuentran el dimetilsulfóxido (DMSO) que
sirve para fomentar una mayor deshidratación de las células antes de la congelación
intracelular, el glicerol, que es un agente de selección que resulta menos tóxico para
la célula.
Con base en lo anteriormente expuesto, en el presente proyecto se generó un
método experimental para la criopreservación de protoplastos del hongo
Mycosphaerella fijiensis, con el objetivo de obtener protoplastos disponibles para la
realización de experimentos de transformación genética.
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III. JUSTIFICACIÓN
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IV. OBJETIVOS
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5.1.1. Misión
Realizar investigación científica, formar recursos humanos, divulgar
conocimiento, desarrollar y transferir tecnología e impulsar el desarrollo de la
sociedad en armonía con el medio ambiente.
5.1.2. Visión
Ser una institución líder, reconocida local, nacional e internacionalmente,
innovadora en la generación y aplicación del conocimiento en beneficio de la
humanidad.
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Agrobiotecnología
Farmacobiotecnología
Biotecnología de Combustibles Alternos
14
6.1. Alcances:
6.2. Limitaciones:
Para la realización de este estudio, las principales limitantes presentadas fueron que,
el hongo M. fijiensis tiene un crecimiento lento, por lo tanto para, obtener suficiente
biomasa se requiere largo periodo de tiempo, cerca de un mes para tener 1 cm de
diámetro. Además, no se conocen los factores determinantes para tener una
concentración óptima de protoplastos, (edad de cultivo, número de resiembra, la
cepa); esto fue variable.
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Golfo de México:
Pacífico sur:
Pacífico centro:
17
Grasas 0.2 g
Agua 75%
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A B
Figura 3. Estructuras de reproducción en Mycosphaerella fijiensis: A) Estructura
asexual; B) Estructura de reproducción sexual (Merchán, 1997).
20
21
Figura 4. Ciclo de Vida de M. fijiensis. Modificada de (Bennett y Arneson, 2003).
22
7.3 Protoplastos
Los protoplastos son células desnudas, sin la pared celular, únicamente
rodeados por la membrana plasmática; son aislados por eliminación mecánica o
enzimática de la pared celular. Tienen la capacidad de regenerar su pared celular,
formar colonias e incluso regenerar al organismo completo.
Una de las aplicaciones fundamentales de los protoplastos es su utilización en
diferentes manipulaciones genéticas. Además sirven como herramienta en
investigación fisiológica, biofísica y bioquímica.
En 1891 el Dr. Krierchle aisló por primera vez protoplastos mediante
tratamiento mecánicos a partir de cebolla, luego en el año 1960 el investigador
Cocking estableció el protocolo para el aislamiento de protoplastos en raíces de
tomate por método enzimática utilizando celulosa del hongo Myrothecium uarrucaria.
El primer aislamiento de protoplastos por actividad enzimática se realizó en células
de levaduras utilizando jugo gástrico de caracol, en el año 1996 (Purohit, 2012).
Por otro lado, no es lo mismo obtener protoplastos de células vegetales que
de hongos. Esto se debe a que contienen diferentes compuestos en la pared celular,
por lo que requiere diferentes enzimas para degradarlas; las más utilizadas en
plantas son: celulasas y en el caso de los hongos: Driselasa, enzimas líticas
(Ovando-Chacón y Waliszewsk, 2014).
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Figura 5. Esquema de la pared celular fúngico. Los polisacáridos de la pared están
representados en diferentes colores; quitina (rojo) ß-1,3-D-glucano (verde), ß-1,6-D-
glucano (azul) y mananos (negro). Las proteínas están representadas por
rectángulos de color naranja. Las subunidades de la ß-1,3-D-glucano sintetasa en la
membrana plasmática están coloreadas en verde. (Pontón, 2008).
7.5.1 Manoproteínas
Las manoproteínas determinan la porosidad y regulan el transporte de las
proteínas del espacio periplasmático y la entrada de macromoléculas del ambiente
(Damveld et al., 2005); Muchas de las proteínas funcionan integralmente, en
conjunto, en una matriz entrecruzada importante para la biogénesis de la pared; otras
24
7.5.2 Quitina
La quitina es un biopolímero lineal con carga neutra, formada por monómeros
de N-acetilglucosamina unido por enlaces β-(1,4) (Bueter et al., 2013). La quitina es
una parte esencial del esqueleto de carbohidratos de la pared fúngica y su síntesis
es realizada por las enzimas quitina sintasas asociadas a la membrana plasmática.
Esta enzimas usan como sustrato UDP-N- acetilglucana, localizado en la parte de la
membrana adyacente al (Free et al., 2013).
7.5.3 Glucanos
El Glucano es el principal polisacárido de la pared celular; representa el 50-
60% de ella. Este polímero posee la función de proteger a la célula de los
mecanismos de estrés biótico y abiótico. De acuerdo al tipo de unión con otros
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7.6 Criopreservación
La criopreservación es el mantenimiento de la viabilidad y funcionalidad celular
a bajas temperaturas. Los avances en la tecnología de criopreservación están
disponibles para la preservación por un largo periodo de tiempo de materiales
biológicos como por ejemplos tejidos, células de tejidos aislados, pequeños
organismos multicelulares y organismos más complejos, tales como embriones y
actualmente para ácido nucleico y proteínas (Woods et al., 2004).
El procesos de criopreservación incluye la congelación a temperaturas de -80
ºC y alcanzando hasta -196 ºC con él fin de mantener por largo tiempo en
condiciones de vida suspendida. La criopreservación depende mucho de los agentes
crioprotectantes, estos cumplen funciones importantes durante el proceso de
congelación.
Los métodos de criopreservación pueden ser clasificados de acuerdo a su
velocidad de congelamiento:
Una velocidad de congelación lenta intenta mantener un delicado balance
entre varios factores, los cuales pueden resultar en lesiones celulares provocadas
por la formación de cristales de hielo, los choques osmóticos, el efecto tóxico de los
crioprotectantes, la concentración de electrolitos intracelulares, los daños por
enfriamiento y las alteraciones de los organelos intracelulares, el citoesqueleto o el
contacto entre las células (Massip et al., 1995, Dobrinsky, 1996, Martino et al., 1996).
La vitrificación es un método convencional de criopreservación; es un proceso
físico de solidificación para conservar órganos, tejidos, y embriones. La vitrificación
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7.7 Crioprotectantes
Un crioprotectante es un compuesto químico hidrosoluble y de baja toxicidad
que permite el almacenamiento de tejidos o de células por largo tiempo en
temperaturas bajas (Day y Mclellan, 1995). Bioquímicamente son clasificados en tres
tipos de crioprotectores, que son los alcoholes, azúcares y el dimetilsulfóxido.
Los tipos de crioprotectantes utilizados principalmente en la criomicrobiología
son las siguientes: dimetilsulfóxido (Me2SO), metanol, etilenglicol, propilenglicol,
albúmina de suero y el suero (Cuadro 4), y con menos éxito polivinilpirrolidona (PVP),
glicerol, sacarosa, sorbitol, dextrano, extracto de levadura, sacarosa, glucosa,
metanol, peptona, suero de sangre, extracto de malta. Dependiendo del tipo de
organismo y célula, algunos de estos podrían resultar tóxicos para algunos. El que se
considera universal y con magníficos resultados es el Me2SO; combinaciones entre
dos o más de estos crioprotectantes también han aumentado la eficiencia de la
criopreservación (Hubalék, 2003).
Los crioprotectantes también se pueden clasificar en agentes penetrantes y no
penetrantes de acuerdo a la permeabilidad celular.
27
28
29
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En caso del hongo Pseudozyma flocculosa se obtuvo por primera vez un eficiente
protocolo específico para la obtención y la regeneración de protoplastos de esporas
de este moho descrito como agente de biocontrol. Los protoplastos fueron
criopreservados con diferentes tratamientos de las cuales son las siguientes 0.8 M
KCL, 0.8 M sacarosa, 0.8 M glucosa, 0.8 M sorbitol y 0.8 M manitol; para la
regeneración de protoplastos se utilizó el medio YMPDA. La digestión enzimática
óptima fue en la combinación 0.5 % novozym 234, 5 % glucanex preparados en 0.6
M KCL y 0.1 M buffer citrato. La tasa de regeneración de protoplastos en un medio
YMPDA resulto muy eficiente; cerca de 75 % de protoplasto vivos con el tramiento
0.8 de sacarosa (Chen – Belanger, 2000).
31
32
Producción de protoplastos
1: 20 % Dimetilsulfóxido
(DMSO) + 1 M sorbitol
2: 30 % Polivinilpirrolidona Almacenamiento de protoplastos
(PVP) + 2 M sorbitol a – 80°C.
3: 10 % Dimetilsulfóxido
(DMSO) + 20 % glucosa
Tinción vital (FDA)
Regeneración protoplastos en
medio (SOFT) agar
33
34
Fórmula:
0.02
FDA más 1 ml de PBS. Se mezcló en una proporción 1:1 con los protoplastos y se
observó con un microscopio óptico de epifluorescencia utilizando un filtro GFP de
390-509 nm. Esto permite ver la luminiscencia celular y determinar la viabilidad
celular.
36
X. RESULTADOS
Figura 6. Morfología del hongo M. fijiensis cultivado en un medio sólido PDA después de cuatro
semanas de cultivo.
37
38
A B
Figura 9. Protoplastos observados en el objetivo 20x del microscopio Nikon Eclipse, A) protoplastos y
pequeñas cantidades de hifas parcialmente digeridas sin ningún lavado, B) protoplastos lavado y
filtrados con OM.
Figura 10. Protoplastos observados con el microscopio Nikon Eclipsé E200 (20x) para determinar
viabilidad celular con FDA.
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B C D
Figura 11. Protoplastos regenerados después de 4 semanas de criopreservación a -80 °C en medio
"soft agar": A) Control sin crioprotectante, B) Tratamiento 1, C) Tratamiento 2, D) Tratamiento 3.
41
(C)
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XI. DISCUSIÓN
Los protoplastos son una herramienta muy importante en biología molecular y
genética. Sus aplicaciones son numerosas y su utilidad se basa en la suposición de
que son fisiológicamente normales, conservando todas las propiedades de la célula
intacta. Por lo cual, es pertinente el establecimiento de protocolos para la
conservación de los mismos.
EL resultado logrado con M. fijiensis estuvo también por encima de lo reportado para
la crioconservación de centeno (Secale cereale L), en el cual lograron 37% de
protoplastos regenerantes
44
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XIII. BIBLIOGRAFÍA
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