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1
Licenciados en ciclo de profundización
(hidrofóbicos, puentes de hidrógeno, atracciones electrostáticas) y covalentes (puentes de
disulfuro) que existen entre los grupos R de los aminoácidos. Los cambios de pH modifican las
cargas de los grupos R de los aminoácidos que no son neutros (como el aspartato, lisina, arginina
y glutamato) e interfieren con las atracciones electrostáticas y su estabilidad estructural
tridimensional, lo que provoca una pérdida total o parcial de la actividad enzimática (cada
enzima tiene un pH óptimo en relación con la actividad). (Quesada, 2007).
La cinética enzimática es el estudio de las reacciones químicas que son catalizadas por las
enzimas. Aquí, se determina la velocidad de la reacción y se investigan los efectos de variar
diversas condiciones de la reacción (como la temperatura o la concentración de enzima, por
ejemplo). Estudiar la cinética de la catálisis de una enzima, puede revelar su mecanismo
catalítico, su papel en el metabolismo, cómo se controla su actividad, y cómo un fármaco podría
inhibir a esta enzima. (González, López, Peréz, & Vázquez)
Las enzimas son generalmente moléculas de proteínas que transforman otras moléculas que se
denominan como los sustratos de la enzima. En toda reacción enzimática la enzima no es
consumida ni sufre modificación alguna, de manera que puede continuar transformando otra
molécula de sustrato en producto. Por lo tanto, si se garantiza que la concentración de sustrato no
será un elemento limitante, a mayor tiempo de reacción mayor será la formación de producto o la
degradación del sustrato; por otro lado, también la reacción se puede ver influenciada por la
concentración de enzima, si esta se incrementa se forma mayor cantidad de producto por unidad
de tiempo. El incremento de velocidad de reacción es directamente proporcional al incremento
de la concentración de enzima, siempre y cuando la cantidad de sustrato no sea un limitante.
(Quesada, 2007).
Para el desarrollo de estos análisis se aplica inicialmente la ecuación de Michaelis-Menten, ya
que se trabaja una proteína no alostérica. Se define como la situación en que una proteína se ve
alterada por su actividad como consecuencia de la unión de una molécula en un sitio diferente al
centro activo eje fundamental sobre el que gira la cinética enzimática y que describe la velocidad
de reacción de muchas reacciones enzimáticas:
𝑉𝑚𝑎𝑥 ∗ [𝑆]
𝑉=
𝐾𝑚 + [𝑆]
La ecuación de Michaelis-Menten es capaz de describir el cambio sufrido por la velocidad de
una reacción catalizada por una enzima al variar la concentración del sustrato. La reacción que se
establece entre la enzima y su sustrato va precedida de la formación de un complejo (Lopez &
Garcia, 2015):
Michaelis determinó la denominada constante de Michaelis (Km) que da una idea de la afinidad
que tiene la enzima por su sustrato, cuanto mayor es Km menor es la afinidad (predominan las
formas E y S libres), cuanto menor es Km mayor es la afinidad (predomina la forma ES).
𝑘−1 + 𝑘2
𝐾𝑚 =
𝑘1
La velocidad máxima Vmáx estima el número de centros activos del enzima. A la constante kcat
(poder catalítico del enzima) se la reconoce con el nombre de número de recambio, es el número
de moléculas de sustrato convertidas en producto por unidad de tiempo. Por lo que la Vmáx
depende de dos cosas, la cantidad de enzima presente y la capacidad catalítica de la enzima, es
decir la velocidad con que transforma al sustrato por unidad de tiempo (M. G. Claros et al,
2010), así como los factores que estimulan o inhiben dicha velocidad de reacción. Demostró que
las sucesivas adiciones de sustrato al medio de la reacción provocan un abrupto incremento de la
velocidad de reacción hasta un cierto punto en el que la enzima se satura y la adición posterior de
sustrato ya no afecta a la velocidad; es el momento en el que se alcanza la velocidad máxima de
reacción (Vmax). (Lopez & Garcia, 2015)
𝑉𝑚𝑎𝑥
𝑉𝑚á𝑥 = 𝑘2 [𝐸] 𝐾𝐶𝐴𝑇 = [𝐸]𝑡
El diagrama de Lineweaver-Burk que se emplea como herramienta gráfica para calcular los
parámetros cinéticos de una enzima. Dada la ecuación:
1 𝐾𝑚 1
= +
𝑉 𝑉𝑚𝑎𝑥 ∗ [𝑆] 𝑉𝑚𝑎𝑥
La representación gráfica de Lineweaver-Burk permite identificar la Km (constante de
Michaelis-Menten) y Vmax (velocidad máxima); el punto de corte con el eje de ordenadas es el
equivalente a la inversa de Vmax, y el de abscisas es el valor de –1/ Km. Es cierto que la
representación de Lineweaver-Burk presenta algunos inconvenientes ya que, al requerir de
dobles inversos, pequeños errores experimentales pueden conducir a grandes errores. (Clavijo,
2002).
Metodología
1. Preparación de reactivos
Buffer Fosfatos pH 7
3. Curva de calibracion
5. Efecto pH
0.600
0.500
Absorbancia
0.400
y = 0.0588x + 0.0256
0.300
R² = 0.9803
0.200
0.100
0.000
0 2 4 6 8 10 12
Concentraciòn (ppm)
Para establecer las concentraciones de NH₄⁺ y CO (NH₂)₂ en cada una de los factores
que pueden afectar la actividad enzimática de la ureasa, inicialmente se realiza la curva
de calibración como se muestra en la gráfica 1. Así mismos se establece el ajuste a la
ecuación de la recta con las correspondientes incertidumbres para los iones amonio
obteniendo Y= (0,0588 ± 0,00941 ) X + (0,0256 ± 0,01456).
C. Tratamiento de datos estadísticos.
Para establecer el tratamiento de datos obtenidos, se realizan los cálculos estadísticos,
así mismo la gráfica de la recta con los correspondientes intercepto y pendiente,
necesarios para definir los límites de detección, cuantificación e incertidumbres de las
medidas.
A continuación se presenta la ecuación de la línea recta, sus variables: intercepto,
pendiente y coeficiente de correlación lineal. En la segunda parte de la tabla el valor de
incertidumbre de las medidas experimentales Solución Patrón NH₄⁺ por
Espectrofotometría Visible a 530nm.
Valores obtenidos de la curva de calibración
Ecuación de la recta y = 0,0588x + 0,0256
Valor intercepto 0,0256
Valor pendiente 0,0588
Coeficiente de correlación lineal R² = 0,9803
Incertidumbre de las medidas experimentales
Sy/x 0,1943
Sb 0,0182
Sa 11,7681
Ajuste de la recta con valor de incertidumbre
Y= (0,0588 ± 0,00941 ) X + (0,0256 ± 0,01456)
𝑺𝒚⁄ ∑(Yi− ўi )2
𝒙
𝑠𝑦⁄ = √ (𝑛−2)
=0,1943
𝑥
E. Datos Experimentales según consumo de la urea con relación al tiempo rango 530 nm.
Y= (0,0588 ± 0,00941 ) X + (0,0256 ± 0,01456) 𝑪𝑶(𝑵𝑯𝟐 )𝟐 + 𝟐𝑯𝟐 𝑶 → 𝟐𝑵𝑯+𝟒 + 𝑪𝑶𝟐 + 𝑯𝟐 𝑶
5 0,246 3,742 0,748 1,336 0,267 6,2E+00 1,2E+00 8,0E-01 1,6E-01 1E+00 2,0E-01 1,0E+00 5,0E+00
10 0,380 6,025 0,602 1,660 0,166 1,0E+01 1,0E+00 1,0E+00 1,0E-01 1E+00 1,0E-01 1,0E+00 1,0E+01
15 0,493 7,957 0,530 1,885 0,126 1,3E+01 8,8E-01 1,1E+00 7,5E-02 1E+00 6,7E-02 1,0E+00 1,5E+01
20 0,801 13,193 0,660 1,516 0,076 2,2E+01 1,1E+00 9,1E-01 4,6E-02 1E+00 5,0E-02 1,0E+00 2,0E+01
25 0,845 13,930 0,557 1,795 0,072 2,3E+01 9,3E-01 1,1E+00 4,3E-02 1E+00 4,0E-02 1,0E+00 2,5E+01
30 0,839 13,827 0,461 2,170 0,072 2,3E+01 7,7E-01 1,3E+00 4,3E-02 1E+00 3,3E-02 1,0E+00 3,0E+01
F. Datos del estudio cinético del efecto tiempo de incubación Se determina el tiempo óptimo
de incubación de la enzima ureasa en el cual es posible formar la mayor concentración
de NH₄⁺ formado a partir de la CO (NH₂)₂, corresponde al intervalo de la variable
tiempo entre de 20 a 30 min teniendo como resultado [13,193 - 13,827] ppm de
producto, como se establece en los siguientes resultados:
Tiempo vs [NH+4]
16.0
14.0
12.0
Concentracion (ppm)
10.0
8.0
6.0
4.0
2.0
0.0
0 5 10 15 20 25 30 35
-2.0
Tiempo (min)
2.0
1/Velocidad 1.5
1.0
0.5
0.0
0.000 0.050 0.100 0.150 0.200 0.250 0.300
1/ concentracion
800000
600000
1/Velocidad
400000
200000
0
0.0E+00 5.0E+00 1.0E+01 1.5E+01 2.0E+01 2.5E+01
-200000
-400000
1/ concentracion
Grafico 4. Actividad enzimática de la ureasa con respecto a la concentración de [CO (NH₂)₂] consumida
Mientras que en la gráfica 4. (Actividad enzimática de la ureasa con respecto a la
concentración de [CO (NH₂)₂] consumida) se puede observar la relación de la velocidad
de reacción de la urea va disminuyendo proporcionalmente al consumo de dicho sustrato,
existiendo un equilibrio de los complejos o productos intermedios (E + S) que contribuyen
en la producción de amonio. Así mismo en la gráfica 5 Curva actividad enzimática de la
ureasa con respecto a la concentración de [CO (NH₂)₂] restante se evidencia que la
concentración de urea restante aumenta (pendiente positiva) debido a que está siendo
catalizada por la enzima ureasa, hasta llegar a un punto en el cual su concentración
permanece constante, esto es posible debido a la pérdida de actividad de la ureasa para la
hidrólisis de la urea en amonio.
$30.00
$25.00
1/Velocidad
$20.00
$15.00
$10.00
$5.00
$-
0.0E+00 2.0E-01 4.0E-01 6.0E-01 8.0E-01 1.0E+00 1.2E+00
1/ concentracion
pH vs. Concentracion.
14 Con respecto a esta
12 gráfica se evidencia que
10
a pH de 1 la actividad
enzimática es bajita, de
8
Conc.
Velocidad vs Temperatura
0.2
0.15
Velocidad (ppm/min)
0.1
0.05
0
0 20 40 60 80 100 120
-0.05
-0.1
Temperatura°C
Conclusiones
Se lograron identificar ciertos factores que afectaron la actividad enzimática de la ureasa
como el pH, temperatura, delta de tiempo en incubación, concentración, por tanto se
establece los resultados óptimos para cada caso en los cuales se generaban mayor
concentración de amonio lo cual se facilitó con la construcción de cada una de las gráficas.
Se realizó la hidrólisis de la urea, catalizada por la enzima ureasa, obteniendo como
productos dióxido de carbono y amoniaco. Adicionalmente reconocer el amoniaco ya que
se caracteriza por dar un pH alto a la disolución y un olor característico.
De acuerdo al tratamiento estadístico realizado en los datos experimentales
correspondientes de la curva de calibración se obtiene una ecuación de la recta Y= (0,0056
± 0,000965) X - (0,0019 ± 0,00285) y un R2 0,9862, dicho valor permite establecer con
buena precisión y exactitud la concentración de iones amonio, en cada una de las variables
que afectan la actividad enzimática, por tanto se recomienda realizar de nuevo una curva así
mismo los blancos para cada variable.
Se determinó que el tiempo óptimo de incubación de la enzima ureasa se encuentra en el
intervalo de la variable tiempo de 20 a 30 min teniendo como resultado [13,193 - 13,827]
ppm. Por medio de los resultados experimentales se establece que el pH óptimo de la
enzima ureasa es pH 4 donde se generó una mayor concentración de iones amonio.
El comportamiento de la actividad enzimática con respecto al pH es similar al efecto de la
temperatura, esto quiere decir, que las dos aumentan la velocidad de reacción hasta
encontrar el valor óptimo y superando este, la enzima se desnaturaliza disminuyendo la
velocidad de reacción.
En este laboratorio no se realizó la comparación con inhibidor para hacer comparaciones al
respecto por falta de tiempo pero se logró realizar un trabajo aceptable de laboratorio y
partir de los datos experimentales se realizaron todos los respectivos análisis.
La actividad enzimática se ve afectada negativamente y positivamente por variaciones del
tiempo de incubación, pH, temperatura y el efecto de la concentración de enzima y sustrato.
Por ejemplo, en cuanto a la variación del tiempo de incubación de o a 25 min. se presenta
una afectación positiva, porque va aumentando la concentración de amoniaco. De tal forma,
se determinó que 25 min. de incubación sería el tiempo óptimo ya que presenta una
concentración más alta y al seguir aumentando el tiempo desnaturaliza la enzima, lo que la
afecta negativamente y esto se evidencia porque la velocidad de reacción disminuye.
Bibliografía
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