Documenti di Didattica
Documenti di Professioni
Documenti di Cultura
El tema será desarrollado por los estudiantes y defendido en una prueba corta en parejas.
Valor 15% de teoría del Primer Lapso.
UNIVERSIDAD NACIONAL EXPERIMENTAL RÓMULO GALLEGOS
ÁREA DE MEDICINA HUMANA – VALLE DE LA PASCUA
BIOQUIMICA.
1.1. CONCEPTO.
Las bases nitrogenadas son compuestos orgánicos cíclicos, con dos o más átomos de nitrógeno, que constituyen
una parte fundamental de los nucleótidos, nucleósidos y ácidos nucleicos.
Las PURINAS (adenina y guanina) son aminas heterocíclicas, que se caracterizan por que en su estructura
hay un doble anillo, ambas se localizan en los ácidos nucleicos, ARN y ADN.
Las PIRIMIDINAS (timina, uracilo, citosina) son aminas heterocíclicas que, a diferencia de las purinas,
cuentan únicamente con un
anillo en su estructura.
ESTRUCTURA PIRIMIDINAS
ESTRUCTURA PURINAS
La ribosa tiene cinco moléculas de carbono, 10 moléculas de hidrógeno y cinco moléculas de oxígeno y está
representada por la fórmula C5H10O5.
La desoxirribosa carece de una molécula de oxígeno en comparación con la ribosa y está representada por la
fórmula C5H10O4. La falta de la molécula de oxígeno extra significa que no tiene un enlace de alcohol con
una de las moléculas de carbono.
La ribosa proporciona un componente clave del ARN o ácido ribonucleico. El azúcar se une a un fosfato, así
como a una de cuatro bases: adenina, guanina, citosina y uracilo.
La desoxirribosa constituye un componente esencial del ADN o ácido desoxirribonucleico. El azúcar se une a
un fosfato, así como a una de cuatro bases: adenina, guanina, citosina y timina. La molécula de oxígeno que
falta es lo que impide que el azúcar se una con el uracilo.
La ribosa es una aldopentosa (cuenta con cinco átomos de carbono y un grupo funcional aldehído
La desoxirribosa es una aldosa (su molécula contiene un grupo aldehído)
4. NUCLEÓSIDO
Un nucleósido es una molécula monomérica orgánica que integra las macromoléculas de ácidos nucleicos que
resultan de la unión covalente entre una base nitrogenada con una pentosa que puede
ser ribosa o desoxirribosa.
RIBONUCLEÓSIDOS DESOXIRRIBONUCLEÓSIDOS
Veremos en la siguiente tabla las estructuras de Por su parte, los desoxinucleósidos se
los distintos ribonucleósidos. Obsérvese la denominan con el prefijo desoxi- delante
nomenclatura: se utiliza el sufijo osina sobre el del nombre del nucleósido. Se exceptúa el
nombre radical de la base en el caso de las desoxirribonucleósido de timina, que recibe
purinas, y el sufijo -idina en el de las pirimidinas. el nombre de timidina.
El ribonucleósido de timina recibe el nombre
Base Nucleósido
de ribotimidina. Por su parte, el ribonucleósido
de hipoxantina recibe el nombre de inosina. 1. Pirimidinas
Base Nucleósido Citosina Desoxicitidina ( dC )
1. PIRIMIDINAS Uracilo Desoxiuridina (dU)
Citosina Citidina ( C ) Timina Timidina (dT)
Uracilo Uridina (U) 2. Purinas
5
Timina Ribotimidina (m U) Adenina Desoxiadenosina (dA)
2. PURINAS Guanina Desoxiguanosina (dG)
Adenina Adenosina (A)
4.2. FUNCIONES
Guanina Guanosina (G)
5. NUCLEÓTIDO
5.1. DEFINICIÓN
Los nucleótidos son moléculas orgánicas formadas por la unión covalente de un monosacárido de
cinco carbonos (pentosa), una base nitrogenada y un grupo fosfato. El nucleósido es la parte del nucleótido formada
únicamente por la base nitrogenada y la pentosa.
PENTOSA BASE NUCLEÓTIDOS
NITROGENADA
5.2. TIPOS DE NUCLEOTIDO DEPENDIENDO
DE LA BASE NITROGENADA Y PENTOSA MONO~ DI~ TRI~
QUE CONTENGA Y FOSFATO. TABLA 9.1
Al igual que los nucleósidos, los nucleótidos pueden RIBONUCLEÓTIDOS
clasificarse en ribonucleótidos y
RIBOSA
ADENINA AMP ADP ATP
desoxirribonucleótidos según contengan ribosa o
GUANINA GMP GDP GTP
desoxirribosa respectivamente. Existen diversas
CITOSINA CMP CDP CTP
maneras de nombrar los nucleótidos; la de uso más
URACILO UMP UDP UTP
amplio y menor ambigüedad es la que se muestra en
la Tabla 9.1. En ella cada nucleótido se identifica
DESOXIRRIB
DESOXIRRIBO-NUCLEÓTIDOS
mediante tres letras mayúsculas, la primera de ellas ADENINA dAMP dADP dATP
es la inicial de la base nitrogenada, la segunda indica GUANINA dGMP dGDP dGTP
si el nucleótido es Mono~, Di~, o Trifosfato, y la CITOSINA dCMP dCDP dCTP
OSA
tercera es la inicial del grupo fosfato (en inglés, TIMINA dTMP dTDP dTTP
phosphate); en el caso de los desoxirribonucleótidos
se antepone una "d" minúscula a estas tres siglas.
Otra forma de nombrarlos consiste en anteponer la
palabra ácido y añadir la terminación - ílico al nombre
de la base nitrogenada correspondiente; así, por 5.3 FUNCIONES DE LOS NUCLEÓTIDOS
ejemplo, el AMP se puede denominar también como Los nucleótidos llevan la energía química en células
ácido adenílico, o, dado que a pH 7 se encuentra
Los nucleótidos son componentes de muchos
normalmente disociado, como adenilato; este sistema
cofactores enzimáticos
de nomenclatura resulta un tanto ambiguo ya que no
Algunos nucleótidos son intermediarios en la
especifica el número de grupos fosfato. También es
comunicación celular
habitual nombrar a los nucleótidos como fosfatos de
los correspondientes nucleósidos; por ejemplo, el ATP
es el trifosfato de adenosina o adenosín-trifosfato. La
Tabla 9.1 contiene un resumen de la nomenclatura 6. ÁCIDOS NUCLEICOS. DEFINICIÓN
más común de los nucleótidos y de sus constituyentes Los Ácidos Nucleicos son las biomoléculas portadoras de la
químicos información genética. Son biopolímeros, de elevado peso
molecular, formados por otras subunidades estructurales o
7. El ADN => ÁCIDO DESOXIRRIBONUCLEICO monómeros, denominados Nucleótidos, unidos
mediante enlaces fosfodiéster. Se forman largas cadenas;
Ácido nucleico que contiene las algunas moléculas de ácidos nucleicos llegan a alcanzar
instrucciones genéticas usadas en el desarrollo y tamaños gigantescos, de millones de nucleótidos encadenados.
funcionamiento de todos los organismos vivos y Existen dos tipos básicos, el ADN y el ARN.
algunos virus, y es responsable de su
transmisión hereditaria.
En los organismos llamados eucariotas, el ADN se encuentra dentro de un área compartimentalizada dentro de la
célula llamada núcleo. Debido a que la célula es muy pequeña, y porque los organismos tienen muchas moléculas de
ADN por célula, cada molécula de ADN debe estar empaquetada de forma muy compacta y precisa. Esta forma
superempaquetada del ADN se denomina cromosoma.
Las funciones biológicas del ADN incluyen el almacenamiento de información (genes y genoma), la codificación de
proteínas (transcripción y traducción) y su autoduplicación (replicación del ADN) para asegurar la transmisión de la
información a las células hijas durante la división celular.
El ADN existe en muchas conformaciones.27 Sin embargo, en organismos vivos sólo se han observado las
conformaciones ADN-A, ADN-B y ADN-Z. La conformación que adopta el ADN depende de su secuencia, la cantidad
y dirección de superenrollamiento que presenta, la presencia de modificaciones químicas en las bases y las
condiciones de la solución, tales como la concentración de iones de metales y poliaminas.36 De las tres
conformaciones, la forma "B" es la más común en las condiciones existentes en las células. 37 Las dos dobles hélices
alternativas del ADN difieren en su geometría y dimensiones.
La forma "A" es una espiral que gira hacia la derecha, más amplia que la "B", con una hendidura menor superficial y
más amplia, y una hendidura mayor más estrecha y profunda. La forma "A" ocurre en condiciones no fisiológicas en
formas deshidratadas de ADN, mientras que en la célula puede producirse en apareamientos híbridos de hebras ADN-
ARN, además de en complejos enzima-ADN.
Los segmentos de ADN en los que las bases han sido modificadas por metilación pueden sufrir cambios
conformacionales mayores y adoptar la forma "Z". En este caso, las hebras giran alrededor del eje de la hélice en una
40
espiral que gira a mano izquierda, lo opuesto a la forma "B" más frecuente. Estas estructuras poco frecuentes
pueden ser reconocidas por proteínas específicas que se unen a ADN-Z y posiblemente estén implicadas en la
regulación de la transcripción.
En 1953 el bioquímico estadounidense James Watson y el biólogo británico Francis Crick, a partir de estudios
cristalográficos realizados por Wilkins y Franklin (que sugerían que la molécula de ADN poseía una estructura
helicoidal) e inspirándose en las observaciones de otros investigadores (según las cuales los distintos ADN
examinados presentaban siempre un número de adeninas igual al de timinas y un número de citosinas igual al de
guaninas), propusieron asignar una estructura de doble hélice a la molécula de ADN.
De acuerdo con este modelo, el ADN es una macromolécula constituida por dos hebras o filamentos enrollados uno
sobre otro en sentido dextrógiro (es decir, en el del movimiento de las agujas del reloj), formando así una doble hélice.
Cada hebra está constituida por una larga secuencia de nucleótidos, que forman el esqueleto de la macromolécula de
ADN. Los nucleótidos se unen entre sí por un enlace fosfodiéster entre los azúcares (es decir, entre un grupo fosfato,
PO4-3, enlazado a un azúcar y un hidroxilo, OH, del azúcar del nucleótido precedente). La información genética está
contenida en las distintas secuencias de nucleótidos del esqueleto del ADN. Las dos hélices de ADN se mantienen
unidas por enlaces débiles de naturaleza física, los enlaces de hidrógeno, y por enlaces químicos débiles, los enlaces
de Van der Waals. Los pares de bases son perpendiculares al eje principal de la molécula: una vuelta completa de la
hélice sobre sí misma comprende diez pares de bases. Las dos hélices están polarizadas, es decir, poseen una
dirección, que viene determinada por el extremo libre del último nucleótido, el cual puede ser el carbono número 3 o el
número 5 de la molécula de desoxirribosa; en consecuencia, cada hebra de ADN poseerá una extremidad 5' - 3' y la
otra en dirección 3' - 5', y se dice que son antiparalelas.
La desnaturalización de ácidos nucleicos como el ADN por altas temperaturas produce una separación de la
doble hélice, que ocurre porque los enlaces o puentes de hidrógeno se rompen. Esto puede ocurrir durante
la reacción en cadena de la polimerasa; las cadenas del ácido nucleico vuelven a unirse (renaturalizarse) una
vez que las condiciones "normales" se restauran. Si las condiciones son restauradas rápidamente, las cadenas
pueden no alinearse correctamente.
La replicación del ADN es el proceso por el cual se obtienen copias o réplicas idénticas de una molécula de ADN. La
replicación es fundamental para la transferencia de la información genética de una generación a la siguiente y, por
ende, es la base de la herencia. El mecanismo consiste esencialmente en la separación de las dos hebras de la doble
hélice, las cuales sirven de molde para la posterior síntesis de cadenas complementarias a cada una de ellas, que
llevará por nombre ARNm. El resultado final son dos moléculas idénticas a la original. Este tipo de replicación se
denomina semiconservativa debido a que cada una de las dos moléculas resultantes de la duplicación presenta una
cadena procedente de la molécula "madre" y otra recién sintetizada.
La transcripción del ADN es el primer proceso de la expresión genética, mediante el cual se transfiere la información
contenida en la secuencia del ADN hacia la secuencia de proteína utilizando diversos ARN como intermediarios.
Durante la transcripción genética, las secuencias de ADN son copiadas a ARN mediante una enzima llamada ARN
polimerasa la cual sintetiza un ARN mensajero que mantiene la información de la secuencia del ADN. De esta
manera, la transcripción del ADN también podría llamarse síntesis del ARN mensajero.
Ácido nucleico formado por una cadena de ribonucleótidos. Está presente tanto en las células procariontes como en
los eucariontes, y es el único material genético de ciertos virus (virus ARN).
El ARN se puede definir como la molécula formada por una cadena simple de ribonucleótidos, cada uno de ellos
formado por ribosa, un fosfato y una de las cuatro bases nitrogenadas (adenina, guanina, citosina y uracilo). El
ARN celular es lineal y monocatenario (de una sola cadena), pero en el genoma de algunos virus es de doble
1
hebra.
La traducción es el segundo proceso de la síntesis proteica (parte del proceso general de la expresión génica).
Ocurre tanto en el citoplasma, donde se encuentran los ribosomas, como en el retículo endoplasmático rugoso (RER).
Los ribosomas están formados por una subunidad pequeña y una grande que rodean al ARN. En la traducción,
el ARN mensajero se decodifica para generar una cadena específica de aminoácidos, llamada polipéptido (el producto
de la traducción), de acuerdo con las reglas especificadas por el código genético. Es el proceso que convierte una
secuencia de ARN mensajero en una cadena de aminoácidos para formar una proteína.1 Es necesario que la
traducción venga precedida de un primer proceso de transcripción. Las fases de la traducción son tres: iniciación,
elongación y terminación, 2durante los cuales se va dando el crecimiento del polipéptido.
9. EL CÓDIGO GENÉTICO
El código genético es el conjunto de normas por las que la información codificada en el material genético
(secuencias de ADN o ARN) se traduce en proteínas (secuencias de aminoácidos) en las células vivas. El código
define la relación entre secuencias de tres nucleótidos, llamadas codones, y aminoácidos. Un codón se corresponde
con un aminoácido específico.
La síntesis de proteínas se conoce también como traducción, dado que es la transferencia de información de los
nucleótidos al de los aminoácidos, por lo que es considerada la actividad sintética más compleja que ocurre en la
célula. En tanto que otras macromoléculas de las células se elaboran por medio de reacciones enzimáticas
relativamente directas, el ensamblado de una proteína requiere todos los diferentes RNAt con sus aminoácidos
unidos, ribosomas, RNA mensajeros y algunas proteínas con varias funciones, cationes y GTP (Karp, 1998; Curtis y
Barnes, 2001).
El proceso de traducción en las células eucariotas es similar en las células procariotas, la diferencia principal es que la
traducción en células eucariotas implica numerosos factores proteínicos solubles (no ribosómicos) (Karp, 1998). En
este proceso de traducción intervienen los tres tipos de ARN: ribosomal, de transferencia y mensajero. En los
eucariontes, la síntesis de proteínas se lleva a cabo en tres etapas distintas: iniciación, elongación o alargamiento y
terminación.
INICIACIÓN
En eucariontes, la iniciación comienza cuando la subunidad ribosómica pequeña reconoce primero el extremo 5´ del
mensaje que precede al casquete de metilguanosina, y luego se desplaza a lo largo del RNAm hasta alcanzar una
secuencia de nucleótidos (típicamente 5´-CCACCAUG-3´) que contiene el tripleto AUG en un contexto en el cual se le
puede reconocer como codón inicial (Karp, 1998; Curtis y Barnes, 2001).
A continuación, el primer ARNt iniciador se coloca en su lugar y se aparea con el codón iniciador del ARNm. Este
codón iniciador que habitualmente es (5´)-AUG-(3´), se aparea en forma antiparalela con el anticodón del ARNt (3´)-
UAG-(5´). El ARNt iniciador entrante, que se une al codón AUG, lleva una forma modificada del aminoácido metionina,
N-formilmetionina o fMet. Esta fMet será el primer aminoácido de la cadena polipeptídica recién sintetizada que es
rápidamente removido.
El ARNt iniciador está ubicado en el sitio P de la subunidad mayor, uno de los dos sitios de unión para las moléculas
de ARNt. Luego, se liberan estos factores de iniciación y la subunidad ribosómica mayor se une a la subunidad menor.
La energía para este paso la suministra la hidrólisis del trifosfato de guanosina (Curtis y Barnes, 2001).
ELONGACIÓN O ALARGAMIENTO
Una vez que el ribosoma completo se ha ensamblado en el codón de inciación, comienza la etapa de elongación o
alargamiento. Durante esta etapa, elsitio A de un ribosoma será ocupado transitoriamente por sucesivos
aminoacil.ARNt.Los aminoacil-ARNt que ocupen el sitio A serán aquellos cuyo anticodón sea complementario al
codón que queda expuesto en ese sitio. La entrada del aminoacil-ARNt al sitio A del ribosoma requiere su unión previa
con una proteína llamada factor de elongación, que en su forma activa será unida al GTP. Al aparearse el ARNt con el
ARNm, se dispara la hidrólisis del GTP por parte del factor de elongación que luego se disocia, permitiendo que el
aminoacil-ARNt permanezca unido por un corto período al ARNm.
Cuando los sitios A como P están ocupados, una enzima, la peptidil transferasa, que es parte de la subunidad mayor
del ribosoma, cataliza la formación de un enlace peptídico entre los dos aminoácidos, acoplando el primero (fMet) al
segundo. El primer ARNt, entonces se libera. El ribosoma se mueve un codón a lo largo de la cadena de ARNm; en
consecuencia, el segundo ARNt, al cual ahora se encuentran acoplados la fMet y segundo aminoácido, se transfiere
de la posición A a la posición P. Un tercer aminoacil-ARNt se ubica en la ahora vacante posición A, apareado al tercer
codón del ARnm, y se repite el paso. La posición P acepta al ARNt que carga con la cadena polipeptídica creciente; la
posición A acepta al ARNt que porta el nuevo aminoácido que será añadido a la cadena.
A medida que el ribosoma se mueve a lo largo de la cadena del ARNm, la porción iniciadora de la molécula de ARNm
es liberada y otro ribosoma puede formar con ella un complejo de iniciación. Un grupo de ribosomas que leen la
misma molécula de ARNm se conoce como polisoma (Curtis y Barnes, 2001).
TERMINACIÓN
Cuando el mensaje llega a un codón de terminación, ya no hay ningún ARNt que tenga su anticodón, de manera que
ya no se agrega otro aminoácido a la cadena. Se libera el polipéptido formado, la proteína. Se separan las dos
subunidades del ribosoma y el ARNm es liberado ( Curtis y Barnes, 2001; Velázquez, 2007).
La regulación génica es el proceso que controla qué genes en el ADN de una célula se expresan (se utilizan para
hacer un producto funcional como una proteína). Diferentes células en un organismo multicelular pueden expresar
grupos muy diversos de genes, aun cuando contienen el mismo ADN.El grupo de genes expresados en una célula
determina el grupo de proteínas y de ARN funcionales que contiene, y le da sus características únicas.En los
eucariontes como los humanos, la expresión de los genes involucra muchos pasos y su regulación puede ocurrir en
cualquiera de ellos. Sin embargo, muchos genes se regulan principalmente en el nivel de la transcripción.
La regulación génica es la forma como una célula controla qué genes, de los muchos genes en su genoma, se
"encienden" (expresan). Gracias a la regulación de los genes, cada tipo de célula en tu cuerpo tiene un conjunto
diferente de genes activos, a pesar de que casi todas las células del cuerpo contienen exactamente el mismo ADN.
Estos diferentes patrones de expresión génica causan que tus diversos tipos de células tengan diferentes conjuntos
de proteínas, lo que hace que cada tipo de célula sea exclusivamente especializada para hacer su trabajo. Por
ejemplo, una de las funciones del hígado es eliminar las sustancias tóxicas como el alcohol de la sangre. Para ello, las
células del hígado expresan genes que codifican las subunidades (piezas) de una enzima llamada alcohol
deshidrogenasa. Esta enzima descompone al alcohol en una molécula no tóxica. Las neuronas en el cerebro de una
persona no eliminan las toxinas del cuerpo, así que mantienen estos genes sin expresar, o "apagados". Del mismo
modo, las células del hígado no envían señales utilizando neurotransmisores, así que mantienen los genes
neurotransmisores apagados.
La expresión génica en eucariontes implica muchos pasos y casi todos pueden regularse. Diferentes genes se regulan
en diferentes puntos y no es poco frecuente que un gen (particularmente uno importante o poderoso) sea regulado en
múltiples pasos.
NUCLEÓTIDO
SIGNIFICADO DE LAS SIGLAS COMPOSICIÓN FUNCIÓN
NO NUCLEICO
NAD Nicotinamida Adenina Está compuesto por Su función principal es el
Dinucleótido un dinucleótido, es decir, por intercambio de electrones y
Difosfopiridina Nucleótido dos nucleótidos, unidos a protones y la producción de
Coenzima I través de grupos fosfatos: uno energía de todas las células
de ellos es Oxida
una base de adenina y el otro, los alcoholes a aldehídos o cet
una nicotinamida. onas.
NADP Nicotinamida Adenina
Dinucleótido Fosfato
FMN Flavin Mononucleótido
riboflavina-5′-fosfato
Fosfato de Lactoflavina
FAD Flavín Adenín Dinucleótido El FAD es una molécula El FAD es una coenzima que
Dinucleótido de Flavina y compuesta por una unidad interviene como dador o
Adenina de riboflavina (vitamina B2), aceptor
unida a un pirofosfato (PPi), de electrones y protones (poder
éste unido a una ribosa y ésta reductor) en
unida a una adenina. reacciones metabólicas redox;
La función bioquímica general
del FAD es oxidar
los alcanos a alquenos
ATP Trifosfato de Adenosina Está formado por una base Es la principal fuente de energía
nitrogenada (adenina) unida al para la mayoría de las funciones
carbono 1 de un azúcar de celulares.
tipo pentosa, la ribosa, que en
su carbono 5 tiene enlazados
tres grupos fosfato.
COENZIMA A Su molécula consta de ácido Puesto que la coenzima A es
pantoténico (vitamina químicamente un tiol, puede
B5), adenosín reaccionar con los ácidos
difosfato y cisteamina. carboxílicos para formar tioésteres,
de modo que actúa como un
portador del grupo acilo.