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TEMA 4: Aminoácidos y Proteínas.

4.1 Aminoácidos: estructura y función.


4.2 Proteínas: estructura y función.
4.2.1 Estructura primaria.
4.2.2 Estructura secundaria.
4.2.3 Estructura terciaria.
4.2.4 Estructura cuaternaria.
4.2.5 Plegamiento proteico, desnaturalización y
renaturalización. Priones.
4.2.6 Proteínas globulares y fibrosas de interés
biológico.
4.3 Proteómica
TEMA 4.1 Aminoácidos: estructura y función.

PROTEINAS son polímeros de aminoácidos, dónde cada aminoácido se une al


siguiente mediante un enlace peptídico.

ESTRUCTURA PRIMARIA

ESTRUCTURA SECUNDARIA

ESTRUCTURA TERCIARIA
La estructura 3D de una proteína depende de su
secuencia de aminoácidos (estructura primaria)

ESTRUCTURA CUATERNARIA
La función de una proteína depende
de su estructura 3D, que en
ocasiones conlleva la
interconversión entre dos formas
estructurales
TEMA 4.1 Aminoácidos: estructura y función.
20 AMINOACIDOS COMUNES
Tienen una estructura general que consiste en un grupo carboxilo y un grupo amino unidos a un
mismo carbono al que denominamos CARBONO ALPHA. Los aminoácidos difieren entre sí, por su
cadena lateral o grupo R.

ESTRUCTURA GENERAL

Cada aminoácido: Fenilalanina


Abreviatura de 3 letras Phe El sistema de numeración y las letras griegas
ayudan a especificar los átomos.
Símbolo de 1 letra F
TEMA 4.1 Aminoácidos: estructura y función.
ESTEREOISOMERISMO EN LOS α-AMINOÁCIDOS
En todos los aminoácidos excepto la GLICINA, el carbono α es un centro quiral, por tanto los aa
tienen dos posibles enantiómeros con propiedades ópticas distintas (sistema D, L, Fisher).

Las formas D se forman a partir


de la forma L por la acción de
una enzima LA RACEMASA que
es frecuentemente objetivo
farmacológico antibacteriano.

LOS AMINOÁCIDOS PRESENTES EN LAS PROTEÍNAS SON EXCLUSIVAMENTE


ESTEREOISÓMEROS L
TEMA 4.1 Aminoácidos: estructura y función.
CLASIFICACIÓN DE LOS AMINOÁCIDOS
Los aminoácidos se clasifican en base a las propiedades de su grupo R, en particular, su
polaridad
Tienden a agruparse y
estabilizan la estructura de
proteínas por interacciones
hidrofóbicas

Reduce la flexibilidad
estructural de algunas
regiones polipeptídicas

Aa aromáticos que absorben


la luz UV

Aminoácidos con carga a pH=7


TEMA 4.1 Aminoácidos: estructura y función.
CLASIFICACIÓN DE LOS AMINOÁCIDOS
Los aminoácidos se clasifican en base a las propiedades de su grupo R, en particular, su
polaridad

Grupo Indol
Grupo Tioéter

Ala, Val, Leu e Ile tienden a agruparse dentro de la proteína, estabilizando la estructura de
la misma mediante interacciones hidrofóbicas.
Pro, su estructura cíclica es rígida y reduce la flexibilidad en la cadena polipeptídica.
Phe, Tyr, Trp son aminoácidos aromáticos.
TEMA 4.1 Aminoácidos: estructura y función.
CLASIFICACIÓN DE LOS AMINOÁCIDOS
Los aminoácidos se clasifican en base a las propiedades de su grupo R, en particular, su
polaridad

Grupo sulfhidrilo

Puentes de disulfuro

Los puentes de disulfuro juegan un papel


fundamental en el mantenimiento de la estructura
de muchas proteínas, ya que es una interacción
covalente entre distintos polipéptidos o entre partes
de un mismo polipéptido.
TEMA 4.1 Aminoácidos: estructura y función.
AMINOÁCIDOS AROMÁTICOS

ESPECTRO DE ABSORCIÓN

ESPECTROFOTÓMETRO

Los aminoácidos aromáticos absorben


luz a diferentes longitudes de onda, con
un pico de absorción máximo a 280 nm. La cantidad de luz a 280 nm que es absorbida por una
La Phe contribuye poco al espectro de solución de proteína es directamente proporcional a
absorción. su concentración.
TEMA 4.1 Aminoácidos: estructura y función.
CLASIFICACIÓN DE LOS AMINOÁCIDOS
Los aminoácidos se clasifican en base a las propiedades de su grupo R, en particular, su
polaridad

Grupo
Imidazol

pH= 7 - - + +
Grupo
+ Neutral

Guanidinio pKa ≈ 7
TEMA 4.1 Aminoácidos: estructura y función.
CLASIFICACIÓN DE LOS AMINOÁCIDOS
Los aminoácidos se clasifican en base a las propiedades de su grupo R, en particular, su
polaridad
Tienden a agruparse y
estabilizan la estructura de
proteínas por interacciones
hidrofóbicas

Reduce la flexibilidad
estructural de algunas
regiones polipeptídicas

Aa aromáticos que absorben


la luz UV

Aminoácidos con carga a pH=7


TEMA 4.1 Aminoácidos: estructura y función.

LOS AMINOÁCIDOS SON ANFOLITOS, (sustancias anfotéricas)


Los grupos carboxilo y amino de los aminoácidos funciona como ácidos y bases débiles.

CUANDO UN AMINOÁCIDO, QUE CARECE DE GRUPO R IONIZABLE, SE DISUELVE EN AGUA A pH≈7,


EXISTE EN SOLUCIÓN COMO UN IÓN DIPOLAR O FORMA ZWITTERION, QUE PUEDE ACTUAR TANTO
COMO UN ÁCIDO O COMO UNA BASE.

pH≈ 7
Actúa como una BASE Actúa como un ÁCIDO
Forma Zwitterion

pKa1 pKa2

ÁCIDO ÁCIDO/BASE BASE


(anfolito)

pKa: Es la medida de la tendencia de un grupo para donar un protón. Cuanto menor es el pKa, mayor
es la Ka, mayor es la tendencia a ceder protones.
TEMA 4.1 Aminoácidos: estructura y función.
CURVAS DE TITULACIÓN DE AMINOÁCIDOS Titulación de un grupo amino

Titulación de un grupo carboxilo

-DIPRÓTICO: 2 H+, 2 pKa, 2 regiones


buffer.
- El grupo caboxilo es mas acido que
el grupo amonio.

Gly esta forzada a estar


en muy bajos pH

Pequeñas adiciones de ácidos


fuertes o bases aportan un pequeño
aumento o no cambian el pH Pequeñas adiciones de ácidos fuertes o
bases producen grandes cambios en el pH
REGIÓN AMORTIGUADORA
TEMA 4.1 Aminoácidos: estructura y función.
CURVAS DE TITULACIÓN DE AMINOÁCIDOS Titulación de un grupo amino

Titulación de un grupo carboxilo

Concentraciones equimolares
Concentraciones equimolares

Forma Zwiterion

Forma totalmente protonada

Pequeñas adiciones de ácidos


fuertes o bases aportan un pequeño
aumento o no cambian el pH Pequeñas adiciones de ácidos fuertes o
bases producen grandes cambios en el pH
REGIÓN AMORTIGUADORA
TEMA 4.1 Aminoácidos: estructura y función.
CURVAS DE TITULACIÓN DE AMINOÁCIDOS

Concentraciones equimolares
Concentraciones equimolares Carga -
Carga +
SIN CARGA NETA

Punto isoeléctrico
Forma Zwiterion

pI= ½ (pKa1 + pKa2)


Forma totalmente protonada

pH< pI pH= pI pH> pI


CARGA= + CARGA= 0 CARGA= -
TEMA 4.1 Aminoácidos: estructura y función.
CURVAS DE TITULACIÓN DE AMINOÁCIDOS

Concentraciones equimolares
Concentraciones equimolares Carga -
Carga +
SIN CARGA NETA

Punto isoeléctrico
Forma Zwiterion

pI= ½ (pKa1 + pKa2)


Forma totalmente protonada

La curva de titulación de un aminoácido aporta:


1.- Una medida cuantitativa del pKa de cada grupo ionizante.
2.- Regiones con poder amortiguador (se extienden 1 unidad de pH a ambos lados del pKa)
3.- Relación entre su carga neta y el pH de una solución. Punto Isoeléctrico.
TEMA 4.1 Aminoácidos: estructura y función.
CURVAS DE TITULACIÓN DE AMINOÁCIDOS

TODOS LOS AMINOÁCIDOS DIPRÓTICOS


TIENEN LOS MISMOS VALORES DE pKa?

El entorno químico afecta a los


valores de pKa
TEMA 4.1 Aminoácidos: estructura y función.
CURVAS DE TITULACIÓN DE AMINOÁCIDOS

Los residuos de Tirosina y Cisteína


son encontrados con frecuencia
en el sitio catalítico de enzimas

Ácido Base

Lys (K)

Arg (R)

His (H)

Cys (C)

Tyr (Y)

Asp (D)
Glu (E)
-COOH
TEMA 4.1 Aminoácidos: estructura y función.
CURVAS DE TITULACIÓN DE AMINOÁCIDOS

AMINOÁCIDOS SIMPLES (diprótico) AMINOÁCIDOS COMPLEJOS (con un grupo ionizable)

pI= 7.59

pI= 3.22

Las variaciones de los valores de pKa para grupos α-COOH (pKa: 1.8-2.4) y grupos α-NH3 (pKa: 8.8-
11.0) en aminoácidos son debidos a interacciones intramoleculares que dependen de la cadena
lateral R
Si tenemos ácidos o bases adicionales que aparecen en la cadena lateral de los aa…
… EL PI ES LA MEDIA DE LOS PKA'S DE LOS DOS ÁCIDOS O BASES MÁS SIMILARES.
TEMA 4.1 Aminoácidos: estructura y función.

AMINOÁCIDOS ESENCIALES Y NO-ESENCIALES


La mayoría de los aminoácidos son esenciales, es decir deben obtenerse de la dieta.
TEMA 4.1 Aminoácidos: estructura y función.
AMINOÁCIDOS MENOS COMUNES PRESENTES EN PROTEÍNAS
Además de los 20 aa más comunes, las proteínas pueden contener residuos aminoacídicos
modificados.

Colágeno Protrombina
Colágeno

Lys Este residuo es


introducido durante la
síntesis de proteínas.
Miosina

Elastina

Otras modificaciones de los aminoácidos incluyen la inclusión de un grupo:


Fosforilo Metilo Acetilo Acilo Adenilación

R-

Acil-AMP
TEMA 4.1 Aminoácidos: estructura y función.

AMINOÁCIDOS MENOS COMUNES NO PRESENTES EN PROTEÍNAS

Urea cycle
TEMA 4.2 : Proteínas: estructura y función.

PROTEINAS son polímeros de aminoácidos, dónde cada aminoácido se une al


siguiente mediante un enlace peptídico.

ESTRUCTURA PRIMARIA

ESTRUCTURA SECUNDARIA

ESTRUCTURA TERCIARIA
La estructura 3D de una proteína depende de su
secuencia de aminoácidos (estructura primaria)

ESTRUCTURA CUATERNARIA
La función de una proteína depende
de su estructura 3D, que en
ocasiones conlleva la
interconversión entre dos formas
estructurales
TEMA 4.2 : Proteínas: estructura y función.
PÉPTIDOS Y ENLACE PEPTÍDICO
La formación del ENLACE PEPTÍDICO es un
OLIGOPÉPTIDO: Unos pocos aminoácidos se
ejemplo de reacción de condensación.
unen mediante enlace peptídico
POLIPÉPTIDO/PROTEINA: Miles de amino
acids unidos por enlaces peptídicos

Nt Ct
ACID general, el extremo amino libre de
Por consenso
la cadena peptídica (N-terminal) se escribe a la
dehydratation
izquierda y el extremo carboxilo libre (C-terminal)
se coloca a la derecha.

Algunos péptidos con importante actividad biológica incluyen:


insulina, glucagón, corticotropina, oxitocina, glutation.
TEMA 4.1 Aminoácidos: estructura y función.
PEPTIDOS Y ENLACE PEPTÍDICO
TEMA 4.1 Aminoácidos: estructura y función.
CLASIFICACIÓN DE LOS AMINOÁCIDOS
Los aminoácidos se clasifican en base a las propiedades de su grupo R, en particular, su
polaridad
Tienden a agruparse y
estabilizan la estructura de
proteínas por interacciones
hidrofóbicas

Reduce la flexibilidad
estructural de algunas
regiones polipeptídicas

Aa aromáticos que absorben


la luz UV

Aminoácidos con carga a pH=7


TEMA 4.1 Aminoácidos: estructura y función.
PEPTIDOS Y ENLACE PEPTÍDICO
TEMA 4.1 Aminoácidos: estructura y función.

EL ESTADO DE IONIZACIÓN DE UN PÉPTIDO DEPENDE DEL pH

Totalmente
protonado

Totalmente
desprotonado
TEMA 4.2 : Proteínas: estructura y función.
PÉPTIDOS Y ENLACE PEPTÍDICO

3 ROTACIÓN LIBRE
2 Los 6 átomos asociados Entre N-Cα y Cα-C.
en el enlace peptídico son ÁNGULO DIHÉDRICOS:
coplanares Ф (phi) ψ (psi)

Ct

Nt
FORMAS RESONANTES
El átomo de oxígeno ENLACES C-N CON
está en trans con el
1 CARÁCTER PARCIAL DOBLE
átomo de hidrógeno No tiene rotación libre

El esqueleto de una cadena polipeptídica es una serie de planos rígidos que comparten un punto
en común de rotación en el Cα, limitado el rango de conformaciones posibles.
TEMA 4.2 : Proteínas: estructura y función.
PÉPTIDOS Y ENLACE PEPTÍDICO

DIAGRAMAS DE RAMACHANDRAN
ÁNGULOS DIHÉDRICOS:
En principio Ф (phi) y ψ (psi) pueden tener
cualquier valor entre -180º y +180º, pero
muchos de estos valores están prohibidos por
impedimento estérico entre los átomos

Las regiones en azul representan las


conformaciones que implican poco o
no impedimento estérico
Las regiones en amarillo son
conformaciones que NO ESTÁN
PERMITIDAS.
TEMA 4.2 : Proteínas: estructura y función.
ESTRUCTURA SECUNDARIA

31
TEMA 4.2 : Proteínas: estructura y función.
ESTRUCTURA SECUNDARIA
Se refiere a la disposición espacial local de segmentos dentro de un polipéptido, sin tener en
consideración la conformación de sus cadenas laterales. Las estructuras secundarias se deben a la
formación de puentes de hidrógenos entre el grupo N-H de aa1 (dentro del enlace peptídico) y el
grupo C=O del aa4.
α-HELICE LAZOS y β-TURNS

LÁMINA-β
TEMA 4.2 : Proteínas: estructura y función.
ESTRUCTURA SECUNDARIA: α-HÉLICE (dextrógira)
En cada vuelta de hélice, entre 3-4 puentes de hidrógeno Los cuatro residuos aa en los
estabilizan la estructura. los puentes de hidrógeno ocurren extremos de la α-hélice no
entre los grupos C=O y N-H del enlace peptídico. participan en los puentes de
hidrógeno de la hélice.
ÁNGULOS DIHÉDRICOS:
Ф (phi)= -57°
ψ (psi)= -47°
Non-hydrogen
bonded groups

Las cadenas laterales se


orientan hacia afuera del
esqueleto helicoidal
Unidades
repetidas

Cada enlace peptídico funciona como un dipolo


La hélice se distribuye eléctrico. Estos dipolos se alinean a través de los
alrededor de un eje imaginario. puentes de hidrogeno resultando en un DIPOLO NETO.
TEMA 4.2 : Proteínas: estructura y función.
ESTRUCTURA SECUNDARIA: LÁMINA-β
El esqueleto de la cadena polipeptídica se extiende en estructura zig-zag, dispuesta de lado a lado
recordando una estructura en láminas que pueden ser PARALELAS o ANTIPARALELAS.

Ct Ct
Nt Nt

Nt Nt Ct
Ct
Ct Nt Ct
Nt

Los puentes de hidrógeno se forman entre segmentos adyacentes de la cadena polipeptídica.


La cadenas laterales R de aminoácidos adyacentes protruyen de la estructura en zigzag en
direcciones opuestas
TEMA 4.2 : Proteínas: estructura y función.
ESTRUCTURA SECUNDARIA: β-LAZO
Los lazos son elementos de conexión que unen estructuras sucesivas de hélices-alpha y láminas beta.
La estructura consiste en un giro de 180° que implica cuatro residuos aminoacídicos uno de los cuales
es una Prolina (Tipo I) o una Glicina (Tipo II). El lazo beta de tipo I ocurre con mas del doble de
frecuencia que el lazo de tipo II.
Se forma un puente de hidrógeno
entre el aa1 y el aa4.

La Prolina está ciclada y es muy rígida. La glicina es pequeña y muy flexible.


El grupo imino de la Pro asume una configuración
cis que es particularmente propensa al giro.
TEMA 4.2 : Proteínas: estructura y función.
ESTRUCTURA TERCIARIA
Disposición en el espacio 3D del polipéptido. Los aminoácidos que están lejos entre sí, en la
secuencia primaria e incluso secundaria, pueden interaccionar en la estructura terciaria.
ESTRUCTURA CUATERNARIA
Algunas proteínas están compuestas por dos o más polipéptidos o SUBUNIDADES que
interaccionan para dar lugar a una proteína funcional.

Interacciones iónicas
Interacciones
hidrofóbicas

Puentes Disulfuro

Puentes de hidrógeno
TEMA 4.2 : Proteínas: estructura y función.

CLASIFICACIÓN DE PROTEÍNAS SEGÚN SU COMPOSICIÓN


HOLOPROTEINAS: Naturaleza exclusivamente proteica
HETEROPROTEINAS: Compuestos por una parte proteica y otra no proteica

CLASIFICACIÓN DE LAS PROTEÍNAS EN BASE A SU ESTRUCTURA

PROTEÍNA FIBROSA PROTEÍNA GLOBULAR


Cadenas polipeptídicas ordenadas Cadenas de polipéptido plegadas en
siguiendo un elemento simple de diversos tipos de estructura
estructura secundaria que se repite secundaria

HEBRAS LARGAS O LÁMINAS FORMA ESFÉRICA O GLOBULAR

FUNCIÓN ESTRUCTURAL ENZIMAS, PROTEÍNAS MOTORAS, PROTEÍNAS DE


TRANSPORTE, PROTEÍNAS REGULADORAS,
Soporte, Conexión, Protección IMMUNOGLOBULINAS…
externa y estructural
TEMA 4.2 : Proteínas: estructura y función.
PROTEÍNAS FIBROSAS: α-Keratina (pelo, uñas, garras, cuernos de mamíferos… )

CADENAS POLIPEPTÍDICAS ENLAZADAS POR ENLACES COVALENTES: PUENTES DE DISULFURO

FORMACIÓN DE LA KERATINA
1.-Dímeros compuestos por α-hélice girando a derecha
organizados como subunidades unidas cola-cola.
2.-Dos dímeros asociados para formar unos superenrollamientos
cola-cola a izquierdas denominados protofilamentos.
3.-Varios protofilamentos organizados para formar un complejo
supramolecular grande denominado protofibrillas. 7 RESIDUOS QUE SE REPITEN (ABCDEFG) DENTRO DE
4.-Las protofibrillas forman tetrámeros denominados LA REGIÓN CENTRAL DE LA SUBUNIDAD.
microfibrillas. Los residuos a y d son hidrofóbicos y responsables de
5.- Las microfibrillas se asocian en macrofibrillas. las interacciones dentro del dímero.
TEMA 4.2 : Proteínas: estructura y función.
PROTEÍNA FIBROSA: COLÁGENO (tendones, cartílago, córnea…)

UNIDAD QUE SE REPITE: TRIPÉPTIDO Gly-X-Y

X e Y son los aminoácidos Pro / 4-HyP


o Lys/HidroxiLys.

α-hélix a izquierdas con tres


aminoácidos por vuelta.

CADENAS POLIPEPTÍDICAS ENLAZADAS


Gly POR ENLACES COVALENTES

3 HÉLICES QUE SE SUPERENROLLAN


Y EMPAQUETAN FORMANDO LAS
MOLÉCULAS DE TROPOCOLÁGENO.
TEMA 4.2 : Proteínas: estructura y función.
PROTEÍNAS FIBROSAS: FIBROINA DE LA SEDA (insectos, gusanos, arañas…)

SECUENCIA QUE SE REPITE

La seda consiste en dos proteínas principals, sericina y La fibroína consiste en una secuencia recurrente de
fibroina, con una capa de secreción similar al aminoácidos (G-S-G-A-G-A) dispuesta en capas de
pegamento de sericina recubriendo dos filamentos láminas beta antiparalelas.
individuales de fibrina.
LAS LÁMINAS BETA SE MANTIENEN UNIDAS MEDIANTE
PUENTES DE HIDRÓGENO E INTERACCIONES DE VAN DER WAALS

CONFORMACIÓN EN LÁMINA-β DE CADENAS POLIPEPTÍDICAS CAPAS ANTIPARALELAS DE LÁMINAS-β CON ORGANIZACIÓN


INTERCALADA DE LOS GRUPOS R
TEMA 4.2 : Proteínas: estructura y función.
PROTEÍNAS GLOBULARES: MOTIVOS ESTRUCTURALES
Las proteínas globulares presentan una estructura terciaria compleja con el ensamblaje de segmentos
polipeptídicos en alfa hélice y/o láminas beta unidas por segmentos de conexión. Los patrones de plegamiento
reconocibles implican 2 o más elementos de estructura secundaria conectados entre ellos.

Horquilla - β Dedo de zinc Barril-β Motivo en lazo Psi

Meandro- β Motivo en llave griega Motivo α-hélice-giro-hélice


TEMA 4.2 : Proteínas: estructura y función.
PROTEÍNAS GLOBULARES: HEMOGLOBINA (Hb)
La hemoglobina es la proteína que transporta oxígeno (O2) por la sangre desde los pulmones a los
tejidos del cuerpo, por lo que se encuentra en alta concentración en los eritrocitos. La hemoglobina
es un tetrámero con 2 subunidades alfa y 2 subunidades beta, cada subunidad es capaz de unir una
molécula de oxigeno en su grupo hemo.

LAS SUBUNIDADES SE MANTIENEN UNIDADES MEDIANTE: Cada subunidad contiene un grupo prostético hemo
-INTERACCIONES HIDROFÓBICAS (principalmente en las con un átomo de hierro en su estado ferroso Fe2+, que
interfases) es coordinado con un residuo de histidina en la
-PUENTES DE HIDRÓGENO proteína.
-PUENTES SALINOS
TEMA 4.2 : Proteínas: estructura y función.
PROTEÍNAS GLOBULARES: HEMOGLOBINA (Hb)
La hemoglobina cambia de conformación con la unión del oxígeno: estatados R y T. Cada transición
de estado conlleva un cambio desde el estado de baja afinidad (estado T) hasta el estado de alta
afinidad (estado R) a medida que las siguientes moléculas de oxígeno se van uniendo.

NO UNIDA A OXÍGENO UNIDA A OXÍGENO

ESTADO T ESTADO R
Baja afinidad por oxígeno Alta afinidad por oxígeno
EL OXÍGENO SE PUEDE UNIR A LA HEMOGLOBINA EN CUALQUIER
ESTADO PERO….
EL ESTADO R TIENE MÁS AFINIDAD POR EL O2 QUE EL ESTADO T.
TEMA 4.2 : Proteínas: estructura y función.
PROTEÍNAS GLOBULARES: HEMOGLOBINA (Hb)
La hemoglobin debe unir oxígeno de manera eficiente en los pulmones (p O2 = 13.3 kPa) y
liberarlo en los tejidos (p O2 =4 kPa). La hemoglobina une oxígeno cooperativamente, uniendo la
primera molécula de O2 afectamos a la unión de la siguiente molécula de O2 en otro sitio.

MODELO SECUENCIAL DE LA UNIÓN DEL OXÍGENO CURVA SIGMOIDAL DE LA UNION DE OXÍGENO

BAJA AFINIDAD ALTA AFINIDAD

1.- La primera molécula de oxígeno se une débilmente a una


subunidad de la hemoglobina en forma T.
2.- Se induce la transición entre la forma R (baja afinidad) y la
forma T (alta afinidad).
3.- Los cambios conformacionales se comunican a subunidades
adyacentes.
4.- La transición entre las formas T y R ocurren más rápido en
las demás desoxisubunidades.
5.-La cuarta molécula de oxigeno se une para formar la
proteína completa en estado R.
TEMA 4.2 : Proteínas: estructura y función.
PROTEÍNAS GLOBULARES: DOMINIOS ESTRUCTURALES
Un dominio proteíco es una parte de la secuencia proteíca que está conservada, que se pliega
y funciona independientemente del resto de la cadena polipeptídica.

DOMINIO 1

DOMINIO 2

DOMINIO 3

PIRUVATO QUINASA
TEMA 4.2 : Proteínas: estructura y función.
PROTEÍNAS GLOBULARES: PROCESO DE PLEGAMIENTO
Generamente las proteínas tienen un núcleo central de residuos hidrofóbicos rodeados por una capa
de residuos hidrofíliocos. El plegamiento es conducido por el entierro de las cadenas hidrofóbicas en el
interior de la molécula para evitar el contacto con el ambiente acuoso.
Núcleo hidrofóbico
(blanco)

Residuos cargados
(rojo/azul)

Conformación nativa

Las proteínas de la
membrana
plasmática siguen la
regla opuesta
Canal de Potasio
KcsA
TEMA 4.2 : Proteínas: estructura y función.
PLEGAMIENTO DE PROTEÍNAS

El plegamiento de muchas proteínas no es espontaneo, requiere chaperonas moleculares, que son


proteínas que facilitan el plegamiento correcto y el ensamblaje de proteínas oligoméricas.

Familia Hsp70 (Heat shock Proteins)


Unen regiones de proteínas sin plegar
que son ricas en residuos hidrofóbicos,
previniendo la agregación inapropiada.

Chaperoninas
Las proteínas sin plegar entran en el
bolsillo GroEL, suceden cambios
conformacionales GroEL/GroES
facilitando el plegamiento por un
proceso desconocido.
TEMA 4.2 : Proteínas: estructura y función.
PLEGAMIENTO PROTEICO, DESNATURALIZACIÓN Y RENATURALIZACIÓN

La desnaturalización de las proteínas es toda pérdida de la estructura 3D suficiente para provocar


una pérdida de la función. Los agentes desnaturalizantes, que incluyen el calor, pH, urea,
detergentes y agentes desnaturalizantes como la urea o el hidrocloruro de guanidinio…

NO ROMPEN ENLACES COVALENTES, SÓLO INTERACCIONES


DÉBILES. Algunas proteínas pueden RENATURALIZARSE si se
reestablecen las condiciones nativas.
TEMA 4.2 : Proteínas: estructura y función.
PROTEÍNAS GLOBULARES: HEMOGLOBINA (Hb)
La hemoglobina también transporta H+ y CO2, de hecho, el 40% de los H+ totales y el 20% del CO2 total
es transportado por la hemoglobina desde los tejidos hasta los pulmones y los riñones.

EFECTO BOHR: La unión y liberación de oxígeno por la hemoglobina es un proceso muy


influenciado por pH y CO2. La afinidad de la hemoglobina por el oxígeno disminuye a medida que
los H+ y el CO2 se unen, y el O2 es liberado a los tejidos.
TEMA 4.2 : Proteínas: estructura y función.
PROTEÍNAS GLOBULARES: Miogoblina vs Hemoglobina

Miogoblina: Hemoglobina:
Hemoproteína monomérica. Hemoproteína tetramérica.
Función: almacenamiento de O2 en el músculo Función: Transporte de O2 y CO2 entre los
pulmones y los tejidos,
Peso molecular de 45000 daltons

MIOGLOBINA HEMOGLOBINA
TEMA 4.2 : Proteínas: estructura y función.

ANEMIA FALCIFORME
Es un desorden hereditario de la sangre, caracterizado por la presencia de la molécula de
hemoglobina mutada. Los eritrocitos afectados se asocian y se pegan en las pareces de los vasos
sanguíneos bloqueando el flujo sanguíneo. Pueden causar dolores severos y daños permanentes en el
cerebro, corazón, pulmones, riñones, hígado y bazo. Esta enfermedad se asocia con infecciones
severas, tienen crisis vaso-oclusivas, y se incrementa el riesgo de muerte.
TEMA 4.2 : Proteínas: estructura y función.
PLEGAMIENTO DE PROTEÍNAS
En las células vivas, las proteínas se pliegan desde su secuencia primaria de aminoácidos a unas
tasas muy elevadas. No es posible la existencia de un proceso aleatorio en el que todas las
posibles conformaciones son probadas en un proceso de ensayo-error hasta que se encuentra su
estructura nativa.
TERMODINÁMICA DEL PLEGAMIENTO PROTEICO
Alta energía, alta entropía de
estados desplegados

EMBUDO
1.- Forma con estructuras secundarias locales. DE
2.-Ensamblaje de estructuras seguida por tasas de interacciones mas altas para ENERGÍA
formar estructuras supersecundarias o motivos. LIBRE
2b.- “colapso hidrofóbico”, interacciones hidrofóbicos que conducen el proceso
de plegamiento.
3.- El plegamiento continua hasta completar la formación del dominio.
4.- Se consigue la conformación nativa.

Baja energía, baja entropía


de estados plegados en
estructura nativa
TEMA 4.2 : Proteínas: estructura y función.
PRIONES
Una proteína en estado desplegado actúa como un agente infeccioso. Los priones son
responsables de la transmisión de la enfermedad Encefalopatía espongiforme de los mamíferos y
la enfermedad de Creutzfeldt-Jakob (CJD) en humanos. Si un prión entra en un organismo sano,
induce que proteínas correctamente plegadas adquieran la forma priónica desplegada.
PROTEÍNA PLEGADA CORRECTAMENTE FORMA PRIÓNICA DESPLEGADA

Prion disease animation: https://www.youtube.com/watch?v=Xws0_I-xyOI


https://www.youtube.com/watch?v=hywcyZbWIeg.
TEMA 4.3: Proteómica
Conjunto de técnicas que se usan para el análisis sistemático del conjunto de proteínas
que se expresan en una célula= Proteoma
Se basa esencialmente en:
– Electroforesis mono y bidimensional
– Espectrometrías de masas
– Técnicas bioinformáticas

La purificación de una
proteína es el primer
paso para comprender
su función 56

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