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Individualizar la atención del paciente, mediante la Medicina Predictiva. Un reto para nuestra
empresa.
Antecedentes:
La medicina predictiva, permite evaluar los factores de riesgos de cada persona frente a la
enfermedad, con base en su información genética, permitiendo una acción terapéutica
individualizada.
.
Objetivo
Análisis de los estudios genéticos de carácter predictivo practicados.
Material y Métodos
-Diseño:
Estudio observacional transversal.
-Muestra poblacional:
Protegemos 803.629 trabajadores en 394 puntos asistenciales implantados a nivel
nacional, durante el año 2017.
-Material y Métodos
Durante el examen de salud, cada trabajador es sometido al cribado individual de sus
factores de riesgos, mediante anamnesis y exploración. Atendiendo a la información obtenida,
personal sanitario cualificado ofertando el estudio genético acorde;
- Metilación del Gen de la Septina 9, asociado al cáncer de colon.
- Thromboincode ( Genotipando 12 variantes genéticas), asociadas al riesgo del evento
tromboembólico.
- Estudio de los genes BRCA1, BRCA2 y MLPA, asociados al cáncer mama y
ovario.
Resultados
Analizamos 523.957 trabajadores sanos, que acudieron a examen de salud en el año
2017. Con distribución etaria, 216.782 ( menores 40 años), 282.319 (40-60 años), 24.776
(mayores 60 años).
Se practicaron 21.615 estudios analíticos, fuera del protocolo de vigilancia de la salud.
219 (1 % ), correspondieron a estudios genéticos;
212 (96 %), Metilaciones del Gen de la Septina 9 (PCR). 31 (14,6 %), en mujeres,
con edad media de 47 años. 1 (menor 40 años), 25 (40-60 años), 5 (mayor 60 años).
Resultando 1 positivo.
181 (85,3%) en hombres, con edad media 54 años. 6 (mayor 40 años), 147
(40-60 años), 28 ( mayor 60). Resultando 2 positivos.
3 estudios, de los genes BRCA1, (secuenciación masiva), en mujeres, con edad media
50 años, todos con resultado negativo.
4 estudios Thomboincode (genotipado), todos en hombres, con edad media 49 años
y resultados negativos.
Conclusión
Los estudios genéticos permiten el diagnostico precoz de patologías prevalentes.
Nuestra empresa desea individualizar la atención al paciente, mejorando su calidad
asistencial, para ello, el uso de estudios genéticos predictivos o de susceptibilidad, son una
herramienta clave.
1
Enfermedad cardiovascular 119.718 (29%) fallecimientos. 1ª causa
mortalidad
Cancer 2ª causa mortalidad (27,5%)
Cancer colon 11.821 fallecimientos
2º causa de mortalidad por cancer en hombre.
Cancer mama 6.477 fallecimientos
1ª causa de mortalidad por cancer en mujer
2
HLA del donante, al ser diferentes de las del receptor, se perciben como
extrañas e inducen la respuesta inmunitaria que conduce al rechazo del trasplante”.
Unos años después, en 1965, al dar a conocer las leyes de la histocompatibilidad en el hombre
por el sistema HLA, Jean Dausset afirmó: “Si los leucocitos de dos personas son compatibles,
sus tejidos también lo son”. Todo el reconocimiento de lo “no propio” se hace en el contexto del
sistema HLA, por lo que desempeña un papel primordial en la inducción de la respuesta
inmunitaria específica. Demostró que el tiempo de supervivencia de los injertos era
inversamente proporcional al número de incompatibilidades entre los genes HLA donante-
receptor. Los descubrimientos del Profesor Dausset causaron honda impresión, le valió un
editorial en The Lancet y sus trabajos fueron los más citados durante años en las revistas
médicas
Posterioremte se observo que detrminado antigenosde histocompatibilidad se unian a
determinadas enfermedades.
3
Medicina preventiva: hace referencia a todas las medidas que se puedan tomar
para prevenir enfermedades con acciones como las vacunas, protectores
solares, vitaminas etc.
2)Proteonomica
Test inmunohistoquimico
Secuenciacion de proteínas
3)Metabolomica
Perfil metabolico.
4)Bioinformatica
BIG DATA
Objetivo
Análisis de los estudios genéticos de carácter predictivo practicados.
Material y Métodos
-Diseño:
Estudio observacional transversal.
-Muestra poblacional:
Protegemos 803.629 trabajadores en 394 puntos asistenciales
implantados a nivel nacional, durante el año 2017.
-Material y Métodos
Durante el examen de salud, cada trabajador es sometido al cribado
individual de sus factores de riesgos, mediante anamnesis y
4
exploración. Atendiendo a la información obtenida, personal sanitario
cualificado ofertando el estudio genético acorde;
- Metilación del Gen de la Septina 9, asociado al cáncer de colon.
- Thromboincode ( Genotipando 12 variantes genéticas), asociadas
al riesgo del evento tromboembólico.
- Estudio de los genes BRCA1, BRCA2 y MLPA, asociados al
cáncer mama y ovario.
SEptina 9
Tecnica:
La tecnica consiste en la determinacion mediante reaccion en cadena de la
polimerasa (PCR) de la forma hipermetilada de determinados genes
(SEPT9, ALX4, TMEFF2 y NGFR) que se liberan al torrente sanguineo
considerados biomarcadores tumorales con caracter predictivo para el
cancer colorrectal que se liberan al torrente sanguineo1-6. Se han
establecido dos tipos de hipermetilacion: la tipo A o forma fisiologica
(presente en tejido sano) y la tipo C, especifica del cancer, que afecta a
genes implicados en la carcinogenesis y es menos frecuente7. Este
fenomeno se relaciona especificamente con la metilacion de residuos de
citosina de secuencias ricas en CpG (islas CpG), cambios que se han
reconocido como aberraciones moleculares habituales y tempranas en el
cancer colorrectal, destacando una posible utilidad clinica en la deteccion
precoz de este tipo de cancer8. No obstante, existe otra metilacion, la tipo
A, forma fisiologica a lo largo del genoma, sin asociarse estrictamente con
la aparicion de cancer y, por tanto, estando presente en tejido sano.
El gen SEPT9, que codifica a una clase de GTPasas relacionadas
con numerosos procesos celulares. Se ha demostrado que este gen
tiene multiples transcripciones que codifican al menos 5
polipeptidos designados como diferentes isoformas (v1-v5). La
isoforma v4 se relaciona con cancer de ovario, la v1 con cancer de
mama y la v2 con cancer colorrectal, el cual se asocia con la
hipermetilacion aberrante durante su transcripcion9
1. Recogida y almacenamiento de las muestras sanguíneas
Se requiere muestras de plasma humano (recogidos en tubos que usan
K2-EDTA como aditivo), de al menos 4 ml para que pueda ser procesado.
Para su obtencion desde las muestras de sangre periferica, estas se deben
procesar y almacenar antes de transcurridas 24 horas de la extraccion
sanguinea. Deben conservarse a una temperatura entre 2-8oC antes de la
centrifugacion y mantenerse a una temperatura entre 15-30oC durante
aproximadamente 3 minutos justo antes de la centrifugacion, que se realiza
en tubos tipo Vacutainer a temperatura ambiente durante 12 minutos.
Las muestras se pueden conservar a una temperatura entre 2-8oC hasta
18 horas o entre -15oC y -20oC hasta 7 dias. Si se necesita una conservacion
mas larga, deben mantenerse a una temperatura igual o inferior a -70oC.
5
3. Extraccion del ADN del plasma
Se utiliza la tecnologia de particulas magneticas que capturan el ADN
del plasma. Para ello, se incuba con agitacion y posteriormente una
sustancia imantada captura las particulas unidas al ADN y se elimina el
sobrante no ligado a las particulas. Despues, se realiza la elucion del ADN
para separar el ADN de las particulas magneticas.
4. Bisulfito conversion y purificacion del ADN
Se trata el ADN con una alta concentracion de bisulfito sodico, de
manera que la citosina no metilada se convierte en uracilo (los cuales
cambian a timidinas durante el proceso de PCR), mientras que la citosina
metilada no se afecta. De este modo, los patrones de metilacion se
transforman en secuencias de informacion que pueden ser discriminadas
por medios tecnologicos, como la PCR. Tras la incubacion con bisulfito
sodico, el ADN es purificado usando particulas magneticas de manera
similar a la extraccion de ADN del plasma.
5. Amplificación del ADN purificado por PCR
Durante la reaccion en cadena de la polimerasa, primero se utiliza una
temperatura elevada para separar las dos cadenas del ADN
(desnaturalizacion) y despues, se emplea una temperatura baja para que
los cebadores o iniciadores hibriden con su secuencia complementaria en
el ADN molde.
Si el ADN esta sin metilar, la hibridacion no se produce por la accion
de un oligonucleotido bloqueador especifico de la metilacion, que impide
la union de los cebadores con el ADN, de manera que no se observa la
senal; pero cuando el ADN esta metilado, el oligonucleotido bloqueador
no puede actuar permitiendo que se unan los cebadores al gen
determinado. Los cebadores se elongan para generar productos de ADN
de cadena doble gracias a la participacion de la polimerasa. La
amplificacion exponencial del producto se consigue mediante la repeticion
de ciclos de ascenso y descenso de la temperatura realizados por el
termociclador, dando lugar a una amplificacion de las secuencias diana
6
• Resultado negativo: una muestra obtiene un resultado negativo si
la senal para el gen es negativa y los tres replicados de la muestra
tienen un control interno valido.
• Resultado no valido: una muestra es erronea y necesitara ser
reanalizada cuando no se detecta el gen y la senal del control
interno no sea valida.
Lamb, Y.N. & Dhillon, S. Mol Diagn Ther (2017) 21: 225. 02 February 2017 Epi
proColon® 2.0 CE: A Blood-Based Screening Test for Colorectal Cancer
BRAC
La mayoría de los cánceres de mama son esporádicos y el 15-20 % están
asociados con alguna historia familiar pero no evidencian la transmisión
autosómica dominante
Una pequeña proporción (5-10% del total de los cánceres de mama), son
atribuíbles a mutaciones en la línea germinal en genes de susceptibilidad al
cáncer como BRCA1 y BRCA2, con herencia autosómica dominante. Dos
genes de alta penetrancia de susceptibilidad al cáncer de mama, BRCA1 y
BRCA2, situados en los cromosomas 17q21 y 13q12-13, respectivamente, han
sido identificados y caracterizados. Otros, como el BRCA3 está todavía en
estudio. BRCA1 y BRCA2 están implicados en la detección y reparación de
DNA dañado, es decir genes que aseguran la integridad del DNA. Existe un
gran número de mutaciones distintas en éstos genes, que resultan en una
7
forma truncada de la proteína, lo que se traduce en la incapacidad del
mantenimiento de la integridad genómica de las células. En el 20 al 40% de los
cánceres de mama hereditarios aparecen mutaciones en BRCA1, y en 10 al 30
% en BRCA2, presentando un carácter autosómico dominante.
Dada la frecuencia del cáncer de mama, no es raro que en una familia pueda
haber más de una mujer afecta. Esto no significa que se trate de una forma
familiar.
Existen niveles de riesgo de padecer cáncer de mama, con distintos modelos
para ser calculados. Los dos modelos más frecuentemente usados son el
Modelo de GAIL y el de CLAUS. El primero tiene en cuenta la historia familiar,
junto con otros factores de riesgo y el segundo solamente la historia familiar.
Atendiendo a la historia familiar las mujeres pueden incluirse en tres
grupos de riesgo:
2.-Riesgo Moderado:
En este grupo se incluyen mujeres con posibilidad de padecer cáncer de
mama (con un riesgo entre el 12 y el 20%). Incluye a las mujeres que tienen:
- Una o dos familiares de primer grado diagnosticadas de cáncer de mama
antes de los 50 años o bien
- Dos o más familiares de segundo grado, de la misma rama familiar,
diagnosticadas de cáncer de mama u ovario.
En este grupo, que supone aproximadamente el 4% de las mujeres, se
recomienda vivamente asistencia a los programas de detección precoz además
de eliminar otros factores de riesgo (anticonceptivos, THS, alcohol, ..) y
consulta si se observan cambios en el pecho.
No se aconseja estudio genético.
3- Riesgo Alto: Incluye a las mujeres cuya historia familiar sugiere una
posibilidad de uno sobre tres, de pertenecer a una familia con alteraciones
genéticas. Son mujeres que tienen:
- Tres o más familiares de primero o segundo grado, del mismo lado de la
familia, con cáncer de mama u ovario o bien
- 2 o más familiares de primero o segundo grado de la misma rama de la familia
con cáncer de mama u ovario, si además presentan alguna de las siguientes
características:
- Haber sido diagnosticadas antes de los 40 años
8
- Tener cáncer de mama bilateral - Tener cáncer de mama
y ovario en la misma rama familiar
- Que uno de los familiares sea un varón con cáncer de
mama
- Que la mujer sea de raza judía ashkenazi Menos del 1%
de mujeres entran en esta categoría y no todas tienen que
desarrollar cáncer. El riesgo está entre el 25 y el 50%.
Este grupo de mujeres (que en Asturias pueden ser unas 100-200 mujeres)
deben ser identificadas y enviadas para seguimiento a las unidades de
patología mamaria. Las mujeres incluidas en este grupo de alto riesgo son
las que pueden ser enviadas para estudio genético, si así lo desean. Si se
detectan reordenamientos BRCA, el riesgo de padecer un cáncer de
mama puede ser hasta del 80%
9
el 60% de la predisposición a la trombosis es atribuible a factores genéticos10.
Para ilustrar esta situación basta recordar que los factores genéticos de riesgo
trombótico conocidos sólo se identifican, en el mejor de los casos y
dependiendo de la población estudiada, en el 50% de las familias con
trombosis hereditaria.
El genotipo está determinado por algún tipo de polimorfismo genético,
principalmente variaciones de un solo nucleótido, conocidas como single
nucleotide polymorphism (SNP). Existe asociación cuando la distribución
(frecuencias alélicas) de este marcador es diferente en los casos y los
controles para un determinado nivel de significación estadística. El marcador
genético es un polimorfismo dentro o cerca de un gen candidato, definido como
un gen específico relacionado biológicamente con el proceso de la enfermedad.
Este tipo de diseño fue el usado para identificar el FVL 4 y la mutación
G20210A en el gen de la protrombina5. Más recientemente, también ha
permitido la identificación de las mutaciones A384S en el gen de la
SERPINAC111, que codifica para la AT, y la R67X en el gen SERPINC 10 que
codifica el inhibidor de la proteína Z12 asociadas a un incremento del riesgo de
eventos trombóticos.
multifactorial compleja, en la que múltiples interacciones entre factores
genéticos y ambientales contribuyen al desarrollo de la enfermedad. Sin
embargo, pese a los grandes esfuerzos invertidos en la última década al
estudio de la enfermedad trombótica, nuestros conocimientos sobre la base
molecular de esta afección son escasos y sólo conocemos seis o siete factores
genéticos que incrementan el riesgo de trombosis. Estos defectos genéticos
sólo explican una parte pequeña de los casos de trombofilia hereditaria.
Además, es improbable que estos defectos genéticos conocidos, con sus bajas
frecuencias en la población, constituyan la influencia genética primaria del
riesgo de que se desencadene un evento trombótico. El gran reto actual de los
investigadores es la identificación de nuevos factores genéticos que contribuyan
a la variación interindividual del riesgo trombótico
Resultados
10
Analizamos 523.957 trabajadores sanos, que acudieron a examen
de salud en el año 2017. Con distribución etaria, 216.782 ( menores 40
años), 282.319 (40-60 años), 24.776 (mayores 60 años)
REsultados
Resultados
Metilación Septina 9
212 Test:
- 31 (14,6%) , Mujeres, edad media, 47 años.
- 181(85,3 %), Hombres, edad media, 54 años. 1 caso (+)
Discusion
Discusion
11
Al hacerse en poblaciónes determinadas no podemos extrapolar los
datos.
Criterios de inclusión
. Tasas de participacion:
Para Screening de SOH, en España, se consideran
aceptables (>45 %).
Nuestro caso (<5 %)
Causas:
Coste,
Escasa concienciacion,
Escasa confianza en el metodo.
13
Como se ve, la lista asciende a 21
biomarcadores(más 16 SNPs de riesgo CCR)
y este es un número demasiado grande si
pretendemos utilizarlos todos para hacer un
cribado(screening) para CCR de la población
de riesgo. Resultaría demasiado costoso y laborioso,
a no ser que hubiera algún método que
pudiera evaluarlos todos o casi todos a la vez y
fuera económicamente viable. O bien tendríamos
que seleccionar los más apropiados y recortar
esa lista, pero lo ideal sería incluirlos todos
para no dejar escapar ningún caso de CCR.
Por otro
lado, es muy probable que la tecnología NGS
aporte nuevos descubrimientos en genómica y
biomarcadores de CCR en un futuro.
Sería conveniente hacer un estudio comparativo
de costes de colonoscopia vs. NGS-CCR
con fines de aplicación y establecimiento de
un cribado/screening de CCR en la población
de riesgo. Dadas las dimensiones sociales que
está alcanzando esta enfermedad tal vez fuera interesante introducir la tecnología NGS,
menos
invasiva, cada vez menos costosa y más
ágil en la obtención de resultados analíticos de
diagnóstico precoz. Seguramente en un futuro
muy cercano los costes sean equiparables.
Además, un correcto diagnóstico previo conlleva
un correcto y más racional
tratamiento posterior del paciente,
con el consiguiente ahorro en costes
de sobretratamiento inadecuado
o de insuficiente tratamiento.
Se trataría de darle al diagnóstico
precoz de CCR en España un
enfoque similar al que se le da al
diagnóstico precoz de cáncer de
14
mama, y más teniendo en cuenta
que actualmente no en todas
las Comunidades Autónomas se
realiza un programa de detección
precoz del CCR,sólo en a Para ello aseguran debería realizarse en la población
de 50 a 69 años este cribado mediante
el test de sangre oculta en heces (SOH) y
cada dos años..De manera que en 10 años la
cobertura sea prácticamente total en todo el
territorio.El gran inconveniente es que el test
SOH es una prueba o test inespecífica pudiendo
dar lugar a resultados falsos positivos y falsos
negativos, descartándose con ello algunos
pacientes incorrectamente diagnosticados de
cáncer colorrectal.Por otro lado,el plazo de 10
años para la cobertura total del cribado de CCR
es demasiado largo.Sería más conveniente recurrir
a test genéticos de diagnóstico precoz del
tipo NGS (secuenciación masiva de genómica de individuos)
para realizar un adecuado y verdadero
cribado del cáncer colorrectal.en la población
de riesgo”.
a. Criterios de inclusion
15
Indicacion Indicacion del test genetico:
Si ……..“Cribado oportunista”
Criterios
100%(4), antecedentes personales (+).
- Debe realizarse Cribado oportunista .
- No puede ser utilizada como cribado poblacional.
16
Conclusion:
La curación mejora, con el diagnóstico precoz.
Medicina predictiva, ofrece:
- Precocidad (sobre paciente sano).
Individualiza, (diagnóstico/tratamiento).
Herramientas (no invasivas /sin preparación
previa/sencillas).
17
enfermedades que aquejan al ser humano) y no mendelianos,
así como a fenómenos como los polimorfismos
genéticos, el hecho que enfermedades de una
misma categoría diagnóstica son variables en el origen
genético y las complejas interacciones con el medio
ambiente, además de dos fenómenos adicionales: la
Penetrancia y la Expresividad.
Por penetrancia se entiende la capacidad que tiene
un gen patológico de expresarse en un individuo o en
una población y hace referencia al hecho que no todas
las personas que tienen un determinado genotipo,
expresan el fenotipo asociado con éste; se habla de
penetrancia completa, cuando todas las personas que
tienen un genotipo lo expresan en su fenotipo, como
es el caso de la enfermedad de Huntington y penetrancia
incompleta o reducida cuando una persona portadora
del gen de una enfermedad nunca lo expresa
como es el caso de la hemocromatosis
(Galán E et al, 2012: 11-12). La Expresividad,
es entendida como la fuerza con la que se
expresa un determinado gen y se relaciona
con la intensidad de las manifestaciones
clínicas; por ejemplo, en la neurofibromatosis
algunas personas que la padecen no tendrán ningún
signo físico, o los neurofibromas afectaran uno o
dos órganos o podrá manifestarse severamente como
es el caso del Hombre elefante (Andreasen, N.2001:
113-114). La Penetrancia y la Expresividad, dificultan
identificar los patrones clásicos de herencia mendeliana
y, de otra parte, dejan en claro que no es posible hacer
predicciones absolutas desde los resultados de las
pruebas genéticas (con la excepción de las enfermedades
con total penetrancia y expresividad, aunque la mayoría
de enfermedades no corresponde a este patrón); una persona puede ser portadora de una mutación y
nunca expresarla fenotípicamente pero también puede
ser asintomática y transmitirla a su progenie quien sí
podría expresarla. De otra parte, las susceptibilidades
genéticas asociadas a las enfermedades comunes tienen
poca penetrancia, es decir, un efecto muy leve sobre
el fenotipo (Penchaszadeh, V.,2009: 49).
18
Futuro de la Medicina Genómica
Algunos de los retos más importantes de la
Medicina Genómica en el futuro incluyen: Identificación
de las variables alélicas más comunes
en los seres humanos y su correlación con determinadas
enfermedades a través de estudios de
genética poblacional, el por qué y cómo se activan o
desactivan determinados juegos de genes (transcriptómica),
así como la comprensión de las bases molecular
es de las enfermedades (medicina molecular), entre
otros (Alcala, O.,2009: 21-23).
Acorde con los posibles desarrollos en genómica y
las ciencias genómicas relacionadas, líderes del Proyecto
Genoma Humano en el Instituto Nacional de Salud
han establecido los posibles logros a mediano plazo en el
terreno de la Medicina Genómica: Para el año 2010 se esperaba
poder disponer de técnicas para la determinación
de las características genéticas individuales asociadasdeterminadas patologías, para
su aplicación en cualquier
momento de la vida e incluso en el ámbito de las
técnicas de procreación humana asistida. Para el 2020
se contara con medicamentos individualizados con
base genética, se podrá establecer el origen genético
de los tumores para el desarrollo de terapia antineoplásica
y a el diagnóstico y manejo de enfermedades
mentales; para el 2030 se conocerán los factores ambientales
determinantes en las enfermedades genéticas
con un entendimiento del polimorfismo genético
de las personas y desarrollo de la medicina preventiva
individualizada (Ortega,M.2009 43-71).
Se consideran como las tecnologías genómicas
más promisorias para los países en desarrollo (dado el
riesgo de acceso equitativo) a: el diagnostico molecular
de las enfermedades, la secuenciación del genoma de
patógenos y el desarrollo de vacunas, entre otros (Daar
A. et al., 2004: 213-225).
Potencial
La Medicina Genómica y sus variantes, representan
en su conjunto un cambio de paradigma de la medicina
moderna, con un gran potencial respecto a la promoción
de la salud, la predicción, la prevención, el diagnóstico
y el tratamiento de las enfermedades (entendiendo
que el proceso salud-enfermedad es un continuó en
el que inciden factores genéticos y ambientales con
diverso grado de influencia). Permiten que las acciones
de salud sean predictivas e individualizadas, amplían
su campo de acción a cualquier momento del ciclo vital
de una manera más efectiva y segura. Sin embargo, la
información que las acompaña puede transformar de
manera permanente la vida de los individuos, sanos y
enfermos, o ser empleada inadecuadamente con fines
deterministas, eugenésicos, reduccionistas o de perfeccionamiento.
La Bioética y el Derecho en asocio con
la Ciencia y los ciudadanos deben reflexionar y desarrollar
19
marcos jurídicos que permitan el balance entre
el desarrollo científico a favor de la salud humana y la
protección de los derechos individuales y colectivos
20