Exonucleasa

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Exonucleasas 3' ? 5'asociada con Pol I

Las exonucleasas son enzimas que funcionan escindiendo nucle�tidos uno a uno a
partir del extremo terminal (exo) de una cadena polinucleot�dica. Estas enzimas
catalizan una reacci�n de hidr�lisis que rompe los enlaces fosfodiester ya sea en
el extremo 3' o 5'. Se encuentran estrechamente relacionadas a las endonucleasas,
las cuales rompen los enlaces fosfodiester en el medio (endo) de la cadena
polinucleot�dica. Tanto los eucariotas como los procariotas poseen tres tipos de
exonucleasas involucradas en la maduraci�n normal del ARNm: la 5' a 3' exonucleasa,
la 3' a 5' exonucleasa, que es una prote�na independiente y la exonucleasa 3' a 5'
espec�fica de poli A.1?2?

Tanto en arqueas como en eucariotas, una de las principales rutas de degradaci�n

del ARN es llevada a cabo por el complejo exosoma un complejo multiproteico que
consiste a grandes rasgos en un gran n�mero de exorribonucleasas 3' a 5'.

�ndice
1 Importancia en relaci�n a las polimerasas
2 Tipos de exonucleasas presentes en E. coli
3 Descubrimientos en humanos
4 Descubrimientos en levaduras
5 Enlaces externos
6 Referencias
Importancia en relaci�n a las polimerasas
La polimerasa de ARN tipo II es conocida por desempe�ar una funci�n durante la
terminaci�n transcripcional, esta enzima funciona en conjunto con una exonucleasa
5' (en humanos codificada por el gen Xrn2) degradando el transcripto reci�n formado
aguas abajo, dejando el sitio de poliadenilaci�n y disparando simult�neamente la
polimerasa. Este proceso implica que la exonucleasa debe ser capaz de atrapar a la
polimerasa II y terminar con la transcripci�n.3?

Luego, la Pol I coloca nucle�tidos de ADN en el lugar ocupado por el iniciador de

ARN que acaba de ser removido. La polimerasa de ADN I tambi�n posee actividad
exonucleasa 3' a 5', la cual es utilizada en la edici�n y en el mecanismo de
correcci�n de errores del ADN.

Tipos de exonucleasas presentes en E. coli

WRN Exonucleasa con sus sitios activos en color amarillo

En 1971, Lehman descubri� la polimerasa I en E. coli. Desde aquellos d�as, ha
habido muchos nuevos descubrimientos entre los que se incluyen la exonucleasa II,
III, IV, V, VII y VIII. Cada tipo de exonucleasa tiene una funci�n o requerimiento
espec�ficos.4?

La exonucleasa I rompe las hebras de ADN monocatenaro en direcci�n 3'?5', liberando

deoxiribonucle�sidos 5'-monofosfato, uno detr�s de otro. Sin embargo es incapaz de
actuar sobre hebras de ADN sin los grupos terminales 3'-OH ya sea que se encuentren
bloqueados por un grupo fosfor�l o acetil.5?
La exonucleasa II se encuentra asociada a la polimerasa de ADN tipo I, la cual
posee actividad exonucleasa 5' que es capaz de cortar el iniciador de ARN ubicado
inmediatamente corriente abajo de un sitio de s�ntesis 5' ? 3' del ADN.
La exonucleasa III posee cuatro actividades catal�ticas:
Actividad exodeoxiribonucleasa 3� a 5�, la cual es espec�fica para ADN doble cadena
Actividad RNAsa
Actividad 3� fosfatasa
Actividad endonucleasa de tipo AP (m�s tarde llamada actividad endonucleasa de tipo
II).6?
La exonucleasa IV es una hidrolasa que a�ade una mol�cula de agua, de modo que es
capaz de romper el enlace fosfodi�ster de un oligonucle�tido para formar un
nucle�sido 5'-monofosfato. Esta exonucleasa requiere de Mg2+ para su funcionamiento
y trabaja a temperaturas mayores que la exonucleasa I7?
La exonucleasa V es una enzima hidrol�tica con actividad exonucleasa 3� a 5� que
cataliza la degradaci�n tanto de ADN doble cadena como de ADN de cadena simple,
requiere de Ca2+ para su funcionamiento y es extremadamente importante en el
proceso de recombinaci�n hom�loga.8?
La exonucleasa VIII es una prote�na dim�rica con actividad 5� a 3� que no requiere
de ATP, ni brechas ni saltos en la cadena para actuar, aunque si requiere de un
grupo 5'OH libre para desempe�ar su funci�n.
Descubrimientos en humanos
Las endonucleasas de tipo 3' a 5' son conocidas por desempe�ar un papel fundamental
para el correcto procesamiento del transcripto primario de ARNm para histonas, en
el cual las riboprote�na U7 perteneciente a las riboprote�nas nucleares peque�as
(snRNP) dirige el proceso de ruptura simple. A continuaci�n elimina el siguiente
producto de escisi�n, la exonucleasa 5' a 3' contin�a quitando nucle�tidos al ARN
hasta que es completamente degradado.9? Esto permite la reutilizaci�n de los
nucle�tidos. La exonucleasa 5'a 3' est� relacionada con la actividad de escisi�n
postranscripcional que act�a como precursora para el desarrollo de extremos 5'
desprotegidos, de modo que la exonucleasa quede capacitada para degradar el
producto de escisi�n aguas abajo. Esto da inicio a la terminaci�n transcripcional
ya que no es conveniente que las cadenas de ADN o ARN se acumulen en el
organismo.10?

Descubrimientos en levaduras
El CCR4-NOT es un complejo regulatorio general presente en levaduras. Se ha
encontrado que este complejo se encuentra relacionado con el metabolismo del ARNm,
tanto con la iniciaci�n de la transcripci�n, como con la degradaci�n del mismo. Se
ha demostrado tambi�n que el complejo CCR4 posee actividad exonucleasa 3' a 5'
tanto para ARN como para ADN monocatenario.11? Otro componente emparentado con el
complejo CCR4 es la prote�na CAF1, la cual ha demostrado tener actividad 3' a 5' o
5' a 3' en Mus musculus y en Caenorhabditis elegans.12? Esta prote�na no ha sido
encontrada en levaduras, lo que sugiere que es probable que CCR4 posea un dominio
exonucleasa anormal como la que se observa en los metazoos.13? Las levaduras
contienen adem�s las exonucleasas Rat1 y Xrn1. La Rat1 funciona de la misma manera
que la Xrn2 humana, mientras que la actividad de la Xrn1 se encuentra en el
citoplasma donde degrada ARN ribosomal de tipo pre-5.8s y 25s en ausencia de
Rat1.14?15?