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En las células eucariotas existen tres polimerasas de ARN distintas (Pol ARN). Cada una de ellas es
responsable de la transcripción de distintos genes y genera distintos tipos de ARN: la Pol ARN I
genera ARNr (ARN ribosomal), la Pol ARN II genera ARNm (ARN mensajero), y la Pol ARN III general
ARN de transferencia (ARNt) y otros ARNs pequeños. Un factor de transcripción es, por definición,
cualquier proteína necesaria para iniciar el proceso de transcripción. Muchos de los factores de
transcripción actúan mediante el reconocimiento de posiciones en cis que forman parte de los
promotores o intensificadores de los genes. Sin embargo, un factor de transcripción no solo actúa
por medio de su unión física al ADN. Un factor puede reconocer a otro factor o a una de las
polimerasas de ARN. Sin embargo, en eucariotas, los factores de transcripción, más que tener una
función enzimática su función es reconocer los promotores.
Los factores de transcripción son capaces de unirse a grupos concretos de secuencias cortas
conservadas que se encuentran dentro de cada uno de los promotores de los genes. Algunos de
estos elementos y factores son comunes a varios genes, y se encuentran en una cierta variedad de
promotores que hace que se utilicen de manera constitutiva. Por el contrario, otros son bastante
específicos, lo que hace que su utilización esté bastante regulada.
Los factores que ayudan a la labor de la Pol ARN II pueden dividirse en tres grupos:
Factores generales, necesarios para el comienzo de la síntesis de ARN a partir de todos los
promotores de clase II (genes codificantes). Junto a la Pol ARN II forman un complejo
alrededor del punto de inicio de la transcripción, y determinan en punto concreto de inicio
de ésta; este complejo constituye el complejo de transcripción basal.
Factores corriente arriba,(upstream) o situados en 5', son proteínas de unión al ADN que
reconocen secuencias consenso cortas específicas situadas corriente arriba o en 5'
(proximales) del punto de inicio de la transcripción (p. ej. Sp1, que se une a la caja GC). Estos
factores son ubicuos y actúan sobre cualquier promotor que contiene el lugar apropiado de
unión al ADN. Su función es incrementar la eficiencia del comienzo de la transcripción.
Factores inducibles, que funcionan de manera semejante a los factores corriente arriba, pero
con un papel más regulador. Se sintetizan o activan en momentos específicos en tejidos
determinados. Las secuencias a las que se unen se denominan elementos de respuesta.
Fases de la transcripción
b) La región codificadora es la parte del gen que contiene la información para lasíntesis de la
proteína. En la región codificadora van a existir fragmentos de ADN que no contienen información:
los intrones, y fragmentos que sí que contienen información: los exones. Considerando la hebra 5'-
>3', el principio de esta región viene marcado por la secuencia de bases nitrogenadas ATG y el final
por una de estas tres tripletas: TAA, TAG, TGA; tripletas que se denominan de paro, sin sentido o
secuencias stop.
Al igual que en la replicación, existen diferencias entre procariotas y eucariotas, siendo las
principales, la existencia de varias RNA-polimerasas en eucariotas y, sobre todo, la necesidad de que
se produzca una "maduración", un procesamiento de algunos RNAs debido a la existencia de los
intrones. El proceso se divide en tres etapas:
LA INICIACIÓN
Fase más compleja.
Antes de que comience, el enzima ARN-polimerasa tiene que reconocer una región del ADN , centro
promotor, es decir, señales con determinadas secuencias cortas de bases nitrogenadas.
La enzima ARN-polimerasa cambia su configuración y desenrolla una vuelta de hélice del ADN, esto
crea una burbuja de transcripción, Esto permite que la secuencia de bases del ADN quede expuesta y
se puedan incorporar los ribonucleótidos que se van a unir.
Esta burbuja se forma en el inicio y durante la elongación, se desplaza a lo largo del ADN, junto con la
ARN-polimerasa.
- Eucariotas: Centro promotor más frecuente es compartimento TATA.
LA ELONGACIÓN
La enzima ARN-polimerasa lee el ADN en la dirección 3´à5´. Pero el crecimiento del ARN (adición de
ribonucleótidos) se realiza en sentido 5´à3´
Maduración del ARN o procesamiento postranscripcional, que tiene lugar en el núcleo. Solo
cuando se ha completado este proceso, las moléculas de ARN maduro pueden ser transportadas al
citoplasma a través de los poros, donde ejercen su función.