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ENZIMAS

Son biomoléculas cuya función es


aumentar la velocidad de las reacciones
bioquímicas, actúan por lo tanto como
catalizadores biológicos.
¿Cuál es su naturaleza química?

La gran mayoría de las enzimas son


proteínas.
Sin embargo existen algunos ARN que
pueden actuar como enzimas (ribozimas)
ENZIMAS: PROTEINAS
TRIDIMENSIONALES

CENTRO ACTIVO
¿Cuál es la estructura de una
proteína?
Las proteínas son macromoléculas,
polímeros de aminoácidos
Analizando estas palabras…
Makrós: grande
Polymerés: compuesto de varias partes

Son cadenas simples, no ramificadas, de


aminoácidos unidos unos a otros.
¿Cuál es la estructura de un
aminoácido?
Todos los aminoácidos están formados
por un grupo amino y un grupo carboxilo.

Amino Carboxilo
¿Cómo actúan las enzimas?
Las enzimas son catalizadores y como
tales aumentan la velocidad de la reacción
química, sin modificar su resultado.
No modifican la energía de los reactivos ni
de los productos pero sí disminuyen la
energía de activación, una especie de
barrera energética que deben pasar los
reactivos para convertirse en productos.
¿ Una misma enzima cataliza las
distintas reacciones?

No, las enzimas son específicas, cada una


cataliza una determinada reacción.
La alta especificidad
se debe a que su
estructura terciaria
le permite formar
cavidades llamadas
sitios activos, lugar
donde se ubica el
sustrato durante el
proceso de catálisis.
La enzima se une
específicamente a las
moléculas denominadas
sustratos, formando un
complejo enzima-sustrato y
favoreciendo su transformación
en productos
sustrato

Complejo
enzima-sustrato

productos
Una Reacción
Enzimática:
SISTEMA ENZIMATICO
• SUSTRATO. Es la molécula sobre la que actua la enzima

• Producto. Es la molècula resultante de la acción de


la enzima sobre el sustrato

• Apoenzima: Es la parte proteìnica (a la apoenzima se une


intimamente el grupo prostético de naturaleza no
proteinica

• Cofactor (iones metálicos) o Coenzima (moléculas


orgànicas)

.
SISTEMA ENZIMATICO
•HOLOENZIMA: apoenzima + cofactor o + Coenzima
•Centro Activo. Es el lugar en el que el sustrato se une a la enzima
•Proenzimas o zimogenos. Son precursores inactivos (sin
función catalíticas se activan en algún momento.

•Isoenzimas. Son diferentes formas moleculares de una enzima, con una


misma actividad enzimàtica (diferentes velocidades de reacciòn)
SISTEMA ENZIMATICO
•Inhibidores: son sustancias que disminuyen la velocidad de
la reacción
•Reversibles
•Competitivos. (antagonistas)
•No competitivos
•Irreversibles

•Activadores. Son iones (Mg, Ca, K, Na etc) que aceleran la velocidad


de la reacción

•Moduladores. Son moléculas que actúan sobre grupos de enzimas


oligomèricas con características de cooperatividad funcional
(enzimas alostéricas
ESTRUCTURA DE UN HOLOENZIMA
ENZIMA = HOLOENZIMA

APOENZIMA
COFACTOR
(PROTEÍNA TERCIARIA)

METAL COFACTOR ORGÁNICO: COENZIMA

GRAN PARTE DE SU MOLÉCULA ES UNA VITAMINA


5.1.C.-ESTRUCTURA DE UN HOLOENZIMA
SUSTRATO

CENTRO ACTIVO

COENZIMA/ VITAMINA

APOENZIMA
5.1.C.-ESTRUCTURA DE UN HOLOENZIMA

ENZIMA SUSTRATO

PRODUCTO

INHIBIDOR
¿La velocidad de una reacción
catalizada por una enzima es
siempre la misma?
No, depende de muchos factores entre los
que se cuentan:

Concentración del sustrato


Temperatura
pH
Concentración de sustrato

A mayor concentración de sustrato es


mayor la velocidad.
Pero no aumenta indefinidamente, cuando
no hay más enzima para unirse al sustrato
se alcanza la velocidad máxima
pH
Cada enzima tiene un pH óptimo en el
cual la actividad enzimática es máxima
Temperatura
Cada enzima tiene una temperatura
óptima en la cual su actividad es máxima
De modo que …

si variamos el pH o la temperatura, la
velocidad de la reacción catalizada por
una enzima también varía.
Los valores de pH y temperatura óptima
son aquellos a los cuales se alcanza la
máxima actividad enzimática o la mayor
velocidad de reacción
Desnaturalización de una Proteína

Estado Nativo Estado Desnaturalizado


Se llama desnaturalización de las proteínas a la pérdida de las
estructuras de orden superior (secundaria, terciaria y
cuaternaria), quedando la cadena polipeptídica reducida a un
polímero estadístico sin ninguna estructura tridimensional fija
Desnaturalización de
la ribonucleasa. En
general, la
desnaturalización fuerte
produce una destrucción
permanente de la
molécula

Agentes desnaturalizantes: Se
distinguen agentes físicos (calor) y
químicos (detergentes, disolventes
orgánicos, pH, fuerza iónica).
Cofactores Enzimáticos
Cofactor (Coenzima): Átomo, ion o molécula que participa en el
proceso catalítico sin ser enzima ni substrato.

Los cofactores participan de dos maneras distintas:

1. A través de una fijación muy fuerte a la proteína y salen


sin ser modificados del ciclo catalítico

2. Como un segundo substrato; salen modificados del ciclo


catalítico y por lo general requieren otra enzima para volver
al estado original.
Aminoácido
LAO Cetoácido
R CH COO- + O2 + H2O R CO COO- + H2O2 + NH4+
NH3+

LAO: L-aminoácido oxidasa: es una flavoproteína

Las flavoproteínas tienen un grupo prostético flavínico,


que interviene en el proceso catalítico sin salir modificado
del mismo
O
H3C N
NH

H3C NH N O
Los cofactores enzimáticos suelen ser moléculas complejas,
que nuestro organismo no puede sintetizar, por lo general.

Por esa razón muchos cofactores enzimáticos deben ser, en


todo en parte, ingresados con la dieta; muchos de ellos son, por
lo tanto, vitaminas.
Ni todos los cofactores son vitamínicos ni todas las vitaminas
son cofactores enzimáticos
Cofactores de naturaleza vitamínica; ejemplos

1. Hidrosolubles
Tiamina Tiamina pirofosfato B1
Riboflavina Flavinas: FAD, FMN B2
Piridoxal Piridoxal fosfato B6
Cobalamina Coenzimas cobamídicos B12
Ác.Ascórbico Ac. Ascórbico C
Nicotinamida NAD+, NADP+ PP
Ác.Lipoico Lipoamida
Ác.Fólico Coenzimas folínicos
Ác.Pantoténico Panteteínas (CoA, p.e.)

2. Liposolubles
Naftoquinonas g-Carboxilación K
Cofactores de naturaleza no vitamínica: ejemplos

Hemo Hemoenzimas, citocromos


Complejos Fe-S Ferredoxinas
Quinonas Tr.electrónico mitocondrial y fotosintético
Glutatión Redox; transporte de aminoácidos
ATP Transf.de fosfato y/o de energía
UTP Transf.de grupos glicosídicos
PAPS Transf.de grupos sulfato
S-AM Transf.de grupos metilo
Carnitina Transportador de grupos acil-
Vitaminas que no forman parte de cofactores enzimáticos

Liposolubles

Retinoides vit. A
Calciferoles vit. D
Tocoferoles vit. E
Teorías de la Acción
Enzimática
Modelo de Llave y Cerradura (Emil Fischer)
Substrato y enzima se acoplan de
forma estereospecífica,
de la misma manera que una
llave se ajusta a su cerradura.
Modelo aceptado durante mucho
tiempo; hoy se considera
insuficiente al no explicar
algunos fenómenos de la inhibi-
ción enzimática.
Modelo de Ajuste Inducido (Koshland)

Tanto la enzima como el


substrato sufren una
alteración en su estructura
por el hecho físico de la
unión.

Está mucho más de


acuerdo con todos los
datos experimentales
conocidos hasta el
momento.
La teoría del Ajuste Inducido se amplía en la actualidad
definiendo la acción enzimática como

Estabilización del Estado de Transición

Según lo cual, el Centro Activo enzimático es en realidad


complementario no al substrato o al producto, sino al
estado de transición entre ambos.
O
R C O R' Substrato: un éster

O-
Estado de transición:
R C O R' intermediario tetraédrico,
inestable
O-

O
-
R C O HO R' Productos
Clasificación y
Nomenclatura de
Enzimas
Nombre sistemático: Grupo transferido

ATP: hexosa fosfotransferasa

Donador Aceptor

Grupo Subgrupo
Número sistemático

Enzyme
EC 2.7.1.1 Enzima
Comission
Sub-subgrupo

Nombre común: Hexokinasa


Clasificación de enzimas: Grupos
1. Oxidorreductasas

2. Transferasas
•grupos aldehidos
•gupos acilos
•grupos glucosilos
•grupos fosfatos (kinasas)

3. Hidrolasas
•Transforman polímeros en monómeros.
Actuan sobre:
•enlace éster
•enlace glucosídico
•enlace peptídico
•enlace C-N
4. Liasas
•(Adición a los dobles enlaces)
•Entre C y C
•Entre C y O
•Entre C y N

5. Isomerasas
•(Reacciones de isomerización)

6. Ligasas
•(Formación de enlaces, con
aporte de ATP)
Entre C y O
•Entre C y S
•Entre C y N
•Entre C y C
Inhibición Enzimática
Inhibidor:
Efector que hace disminuir la actividad enzimática, a través de
interacciones con el centro activo u otros centros específicos
(alostéricos).

Esta definición excluye todos aquellos agentes que inactivan a


la enzima a través de desnaturalización de la molécula enzimática
De esta forma, habrá dos tipos de inhibidores:
I. Isostéricos: ejercen su acción sobre el centro activo

II. Alostéricos: ejercen su acción sobre otra parte de la molécula,


causando un cambio conformacional con repercusión negativa en la
actividad enzimática.

Activador alostérico: Inhibidor alostérico:


favorece la unión del impide la unión del
sustrato sustrato
Los inhibidores isostéricos pueden ser de dos tipos:

1. Inhibidor reversible: establece un equilibrio con la enzima libre,


con el complejo enzima-substrato o con ambos:

E+I EI

ES + I ESI

2. Inhibidor irreversible: modifica químicamente a la enzima:


E+I E’
Inhibición reversible
(a) El inhibidor se fija al centro activo
de la enzima libre, impidiendo la
fijación del substrato: Inhibición
Competitiva

(b) El inhibidor se fija a la enzima


independientemente de que lo
haga o no el substrato; el inhibidor,
por tanto, no impide la fijación del
substrato a la enzima, pero sí impide
la acción catalítica: Inhibición No
Competitiva
(c) El inhibidor se fija únicamente al complejo enzima-substrato
una vez formado, impidiendo la acción catalítica; este tipo se
conoce como Inhibición Anticompetitiva
S
E ES E+P
I
Inhibición
Competitiva

EI

Las fijaciones de substrato e inhibidor son


mutuamente exclusivas; el complejo EI no es productivo
S
E ES E+P
I I
Inhibición
S No Competitiva

EI ESI

El inhibidor se fija
indistintamente a la enzima
libre E y al complejo
enzima-substrato ES; ni el
complejo EI ni el complejo
ESI son productivos
S
E ES E+P
I
Inhibición
Anticompetitiva
ESI

El inhibidor sólo puede


fijarse al complejo ES;
el complejo ESI no es
productivo
Inhibición Competitiva
S
E ES E+P
I
Se define una constante de [E] [I]
equilibrio de disociación del Ki =
EI inhibidor: [EI]

Características:
- Las fijaciones de substrato e inhibidor son mutuamente exclusivas
- A muy altas concentraciones de substrato desaparece la inhibición
- Por lo general, el inhibidor competitivo es un análogo químico del
substrato.
- El inhibidor es tan específico como el substrato
O O
H2N C H2N S NH2
O- O

4-aminobenzoato
4-aminobenceno
sulfonamida
H 2N N N
H
N N
N CO OH
OH CH2
CH2 Ác. Fólico
C NH C H
O COO-
n
H 2N N N
CH3
N N
N CO OH
CH2
CH2 Methotrexate
C NH C H
O COO-
n
O
Análogos de base
CH3
HN

O NH Timina

O
Br
HN
5-Bromouracilo
O NH
NH2
Análogos de
O nucleósido
HOCH2 O N

Citidina

OH OH

NH2

O
HOCH2 O N
OH Citosina
arabinósido
OH
Inhibición Irreversible
- Los inhibidores irreversibles reaccionan con un grupo
químico de la enzima, modificándola covalentemente

- Su acción no se describe por una constante de equilibrio Ki,


sino por una constante de velocidad ki:

E+I E’
- A diferencia de la inhibición reversible, el efecto de los
inhibidores irreversibles depende del tiempo de actuación
del inhibidor.

- Los inhibidores irreversibles son, por lo general, altamente


tóxicos.
Algunos tipos de inhibidores irreversibles

1. Reactivos de grupos -SH

2. Organofosfóricos

3. Ligandos de metales

4. Metales pesados
Regulación de la Actividad
Enzimática
Regulación alostérica

Procesos a nivel celular; regulación de ajuste fino


de la actividad enzimática, a través de efectos de
retroalimentación (negativa o positiva)

Regulación por modificación covalente


Procesos a nivel supracelular (orgánico); regulación
a gran escala de actividades enzimáticas, a través de
modificación covalente de enzimas, provocadas por
señales (transducción de señales)
Regulación alostérica
Retroalimentación negativa en vías metabólicas, 1

Síntesis de Isoleucina

Thr a-cetobutirato Ile


Treonina
desaminasa

El producto final de la ruta, Isoleucina, inhibe a la primera


enzima de la misma, Treonina desaminasa
Regulación por modificación covalente

Suele haber fenómenos de modificación covalente de


enzimas en la respuesta celular a señales químicas:

1. Neurotransmisores
2. Hormonas
3. Factores de crecimiento
4. Estímulos morfogenéticos y de diferenciación
5. Muerte celular programada (apoptosis)
6. Estímulos antigénicos
7. Luz y otros agentes físico-químicos
EFECTO DE LA MODIFICACIÓN COVALENTE
SOBRE LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA

Elementos de la reacción

La Enzima no La enzima fosforilada


fosforilada es inactiva es activa
COENZIMAS

Son moléculas orgánicas débilmente unidas al apoenzima. No


suelen ser específicas de un solo tipo de apoenzima, hay algunos
coenzimas que pueden unirse a más de 100 apoenzimas distintos.
Los coenzimas se alteran en el transcurso de la reacción enzimática,
pero una vez finalizada ésta se regenera rápidamente volviendo de
nuevo a ser funcionales.
Entre los coenzimas más conocidos, está el NAD+, el
NADP+, el FAD+ que capta hidrógenos transformándose en NADH2
y los trasporta hasta un aceptor final de H.
Otros coenzimas importantes son los Coenzimas A
encargados de transferir grupos acilo ( - CO-CH3 ) y el ATP
que transfiere grupos fosfoto.
CINÉTICA ENZIMÁTICA

[E] . [S]
Km=
[E:S]
FACTORES QUE INFLUYEN EN LA VELOCIDAD DE LAS
REACCIONES ENZIMÁTICAS

1. La [ S ]:

2. El pH:

3. La temperatura:
REGULACIÓN DE LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA

1. Activación Enzimática.:
son sustancias que se unen a la
enzima, que se encuentra
inactiva, cambiando su
estructura espacial activándola
2. Inhibición Enzimática:
•I. Reversible:
•Competitiva
•No competitiva
•I. Irreversible : “
envenenamiento de la enzima”

3. Alosterismo
3. Enzimas Alostéricas:
Tb se les conoce como
enzimas reguladoras, y tienen :
• un C.A. por el que se
unen al S
• un C. R. o Alostérico
por el que se unen al
modulador : este modulador
puede ser positivo o puede ser
negativo. En este último caso
cuando el inhibidor de la
reacción enzimática sea el
propio producto final de la
reacción o de una cadena de
reacciones recibe el nombre de
retrorregulación o feed-back.
La cinética de estos enzimas no es hiperbólica, sino sigmoidea, es
decir, que , por la interacción de otras moléculas, el aumento
inicial de la concentración del sustrato provoca un menor
incremento en la velocidad de la reacción
NOMENCLATURA Y CLASIFICACIÓN DE LAS ENZIMAS

Las enzimas se nombran añadiendo la terminación asa, bien al nombre del


substrato sobre el que actúan( sacarasa), al tipo de actuación que realizan
(hidrolasas), o ambos (ADN polimerasas).

En función de su acción catalítica específica, los enzimas se clasifican en 6 grandes


grupos o clases:
•Clase 1: OXIDORREDUCTASAS
•Clase 2: TRANSFERASAS
•Clase 3: HIDROLASAS
•Clase 4: LIASAS
•Clase 5: ISOMERASAS
•Clase 6: LIGASAS
NOMENCLATURA Y CLASIFICACIÓN DE LAS ENZIMAS

Clase 1: OXIDORREDUCTASAS
Catalizan reacciones de oxidorreducción, es decir, transferencia de hidrógeno (H) o
electrones (e-) de un sustrato a otro, según la reacción general:

AH2 + A+
B BH2
NOMENCLATURA Y CLASIFICACIÓN DE LAS ENZIMAS

Clase 2: TRANSFERASAS
Catalizan la transferencia de un grupo químico (distinto del hidrógeno) de un
sustrato a otro, según la reacción:

A-B + C A + C-B

Un ejemplo es la glucoquinasa, que cataliza la reacción representada en la Figura de la derecha:

ADP + glucosa-6-
glucosa + ATP
fosfato
NOMENCLATURA Y CLASIFICACIÓN DE LAS ENZIMAS

Clase 3: HIDROLASAS
Catalizan las reacciones de hidrólisis:
A-B + H2O AH + B-OH

Un ejemplo es la lactasa, que cataliza la reacción:

lactosa +
glucosa + galactosa
agua
NOMENCLATURA Y CLASIFICACIÓN DE LAS ENZIMAS

Clase 4: LIASAS

Catalizan reacciones de ruptura o


soldadura de sustratos:
A-B A+B

Un ejemplo es la acetacetato descarboxilasa, que cataliza la reacción:

ácido acetacético CO2 + acetona


NOMENCLATURA Y CLASIFICACIÓN DE LAS ENZIMAS
Clase 5: ISOMERASAS
Catalizan la interconversión de isómeros:
A B
Son ejemplos la fosfotriosa isomerasa y la fosfoglucosa isomerasa, que catalizan las reacciones representadas en la tabla inferior:
fosfotriosa isomerasa fosfoglucosa isomerasa

gliceraldehído-3- dihidroxiacetona-
fosfato fosfato glucosa-6-
fructosa-6-fosfato
fosfato
NOMENCLATURA Y CLASIFICACIÓN DE LAS ENZIMAS

Clase 6: LIGASAS
Catalizan la unión de dos sustratos con hidrólisis simultánea de un nucleótido trifosfato (ATP,
GTP, etc.):

A + B + XTP A-B + XDP+Pi

A + B + XTP A-B + XDP + Pi


Un ejemplo es la piruvato carboxilasa, que cataliza la reacción:

piruvato + CO2 + ATP oxalacetato´+ ADP + Pi


VITAMINAS:
Sustancias orgánicas de naturaleza y composición variable , que son indispensables para el
buen funcionamiento del organismo. Es imposible de sintetizar por determinados
organismos, y debemos por lo tanto, ingerirlo con la dieta.

Son moléculas muy lábiles, soportan mal los almacenamientos prolongados y el calor.

 Avitaminosis: ausencia total de vitaminas

 Hipovitaminosis: hace referencia a las carencias vitamínicas , generalmente por


malnutrición , y da lugar a determinadas enfermedades carenciales

 Hipervitaminosis: hace referencia a un exceso de vitaminas en la dieta, y puede originar


igualmente transtornos mucho más graves en las vitaminas liposolubles que tienden a
acumularse, no así en las hidrosolubles que se eliminan con facilidad.

 Según su solubilidad en agua, se clasifican en:


Hidrosolubles: Son la vitamina C y todas las vitaminas del complejo B. TODAS
ELLAS ACTÚAN COMO COENZIMAS O PRECURSORES DE COENZIMAS.
Liposolubles: de naturaleza lipídica, y son la A, D, E y K. Exceptuando la K , el resto
no se comportan como coenzimas.
vitamina Función biológica Hipovitaminosis

C ( ácido •Coenzima de enzimas peptidasas ESCORBUTO


ascórbico) intracelulares.
•Participa en la síntesis del colágeno
•Y en la de la sustancia intercelular cementante
en los capilares sanguíneos
•Estimula las defensas contra las infecciónes.
•Indispensable para le buen funcionamiento de
las hormonas antiestrés ( de las glándulas
suprarrenales)

B1o Tiamina • Coenzima de enzimas descarboxilasas BERIBERI(degener


(Antiberibérica) • Fundamental en el metabolismo ación neuronal y
oxidativo de los Hidratos de Carbono afecciones del
corazón)

B2( Rivoflavina) • Forma parte de los coenzimas FAD


y FMN
•Participa en el transporte
electrónico, reacciones redox
•Indispensable en la respiración
celular
•Mantenimiento de piel y mucosas
Vitamina Función biológica Hipovitaminosis

B3 (niacina, ác. • Constituyente de los coenzimas PELAGRA(Enferm


Nicotínico o factor NAD,NADP edad de las tres Ds)
PP)
Antipelagra
• Interviene en el transporte
electrónico, reacciones redox
• Imprescindible para el normal
funcionamiento del SN, piel, lengua
y sistema digestivo
B5 (ác. • Es uno de los componentes de la SINDROME DE
Pantoténico) CoA LOS PIES
• Necesario para la síntesis de ARDOROSOS. (
hormonas antiestrés a partir del Dolor, quemazón y
palpitación de los pies)
colesterol.
• Síntesis y degradación de los
ácidos grasos.
• La formación de Ac
• Síntesis del neurotransmisor
acetilcolina
• Biotransformación y detoxificación
de sustancias tóxicas
Vitamina Función biológica Hipovitaminosis

B9(Ac. Fólico) • Coenzima de enzimas transferasas ANEMIA


• Interviene en la síntesis de purinas PERNICIOSA
y pirimidinas, por tanto en la sínteis
de ADN, ARN y proteínas
• Factor necesario para la
hematopoyesis
B12 ( • Coenzima de enzimas transferasas ANEMIA
Cobalamina) de grupos –CH3 PERNICIOSA
• Síntesis de ADN, ARN y proteínas
• Eritropoyesis
•Síntesis de neurotransmisores
¿Por qué Popeye consume espinacas?

Popeye"el marino" no
consume espinacas para
obtener fuerza
sobrenatural, no no no,
lo que pasa es que su
consumo està asociado
al rico contenido de
vitamina c.

La deficiencia de vitamina C causa escorbuto, que se reconoció por


primera vez en los siglos XV y XVI como una enfermedad grave de los
marinos en viajes largos por mar, pues no tenían acceso a alimentos
frescos, incluyendo frutas y verduras.
Lesiones cutáneas en el Escobuto.
Síntomas
Los síntomas del beriberi seco abarcan:
•Dolor
•Hormigueo
•Pérdida de la sensibilidad (sensaciones) en las
manos y en los pies
•Daño muscular con pérdida de la función
muscular o parálisis en las extremidades
inferiores
•Vómitos
•Movimientos extraños de los ojos (nistagmo)
•Confusión mental/dificultades con el habla
•Dificultad para caminar
•Coma
•Muerte

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