1. Desequilibrio de ligamiento: Segregación de 2 marcadores no al azar
2. Polimorfismos de nucleótido simple 3. STR: short tandem repeat de 2 a 6 bases. No codifican ni estan en un gen pero pueden identificar un gen con potencial de enfermedad. Se deben buscar estos strs distribuidos por todo el genoma. 4. Haplotipo 5. Hap Map 6. Frecuencia alélica 7. Frecuencia genotípica 8. GWAS