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Characterization of bioactive compounds derived from food and agricultural by-products. View project
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La bacteria
Agrobacterium tumefaciens
como herramienta biotecnológica
E
l proceso de transformación genética (la introducción específicos demostraron que esta alteración del
de ADN extraño a una célula) es un evento que se pre- crecimiento es consecuencia de un desequili-
senta en forma natural en algunos seres vivos y ori- brio de fitorreguladores (compuestos orgánicos
gina cambios en sus características. Los procesos de distintos de los nutrientes, que en pequeñas
infección viral y la resistencia adquirida de las bacterias a anti- cantidades estimulan, inhiben o modifican al-
bióticos son ejemplos bastante contundentes. Sin embargo, un gún proceso fisiológico de las plantas). Los estu-
proceso también común, pero más visible por su efecto en las dios moleculares, por su parte, demostraron que
plantas y aún no totalmente elucidado, es la transferencia y trans- estas bacterias son únicas por su habilidad de
formación genética llevada a cabo por las bacterias del géne- transferir material genético entre especies de di-
ro Agrobacterium, (A. rhizogenes, A. tumefaciens y A. vitis) sobre ferentes reinos, en este caso entre procariontes
organismos eucariontes, específicamente plantas y algunos hon- y plantas, lo que permitió explicar la aparición
gos (que, a diferencia de procariontes como las bacterias, tienen de los tumores. A la fecha, esta característica es
un núcleo definido por una membrana). Este grupo de bacterias utilizada como herramienta para estudios bio-
pertenece a la familia Rhizobiaceae, donde también se incluyen tecnológicos de introducción de material gené-
a Rhizobium y Phyllobacterium. Agrobacterium sp. abarca bacterias tico en células (transformación). En los últimos
patógenas, gram-negativas, no esporulantes, móviles, que crecen años se ha demostrado la posibilidad de trans-
en el suelo. Inicialmente estas bacterias fueron conocidas por su formar genéticamente células de hongos y ani-
capacidad de causar tumores en plantas. Posteriormente, estudios males (Kunik y colaboradores, 2001).
En este trabajo se analiza brevemente el pro- ron que los tumores presentaban alteraciones en el metabolis-
ceso mediado por Agrobacterium tumefaciens, mo de sus fitorreguladores y sintetizaban unas sustancias llama-
se presentan ejemplos de su empleo como he- das opinas, compuestos que las bacterias utilizaban como fuen-
rramienta biotecnológica, se plantean algunos te de carbono y nitrógeno (figura 1). Estas bacterias, además de
de los hallazgos más recientes y se comentan su cromosoma circular, poseen material genético extracromo-
las nuevas perspectivas que derivan de estos somal de forma circular con un tamaño de aproximadamente
hechos. 200 kilobases, el cual, por ser responsable de los efectos on-
cogénicos, ha sido llamado plásmido Ti (del inglés Tumor In-
ducing, inductor de tumores) o Ri (Root Inducing, inductor de
EL PROCESO DE INFECCIÓN
raíces) según pertenezca a A. tumefaciens o A. rhizogenes, res-
POR AGROBACTERIUM
pectivamente. Análisis más finos demostraron la existencia
Históricamente, Agrobacterium ha sido cono- de un proceso de transferencia de la bacteria hacia las células
cida como una bacteria fitopatógena capaz de vegetales de una secuencia de ADN llamada T-ADN (del inglés
ocasionar la aparición de agallas y tumores, e Transferred DNA, ADN transferido) presente en el plásmido que
inclusive la muerte de las plantas infectadas, poseen. Esta secuencia, delimitada hacia ambos extremos por
principalmente en dicotiledóneas y algunas una franja repetida de 25 pares de bases, tiene un tamaño de
gimnospermas. Los estudios iniciales indica- aproximadamente 35 kilobases. La información genética trans-
NH2 NH2
C NH (CH2)3 CH COOH C NH (CH2)3 CH COOH
NH NH
NH NH
COOH
CHOH (CHOH)3
N
NH
N NH O
H (CH2)2 CONH2
COOH CH2 CH2 COOH
Cucumopina Agropina
NH
Figura 1. Estructura química de algunas opinas, moléculas que funcionan como fuente nutricional para Agrobacterium tumefaciens.
II Compuestos fenólicos
VirA
VirG
Región Vir
I Citoplasma
BD
BI
Núcleo
T-ADN ChvA
ChvB
5´ 3´ III V
3´ 5´
VirD1 +
VirD2 poro
5´ 3´ IV celular
VirE2 Pilus de infección
VirD2 Cadena-T
T-ADN
Importinas integrado
Complejo T
inmaduro VirD4
VirB
Membrana plásmica
Pared celular
Figura 3. Modelo del proceso de infección de las células vegetales por Agrobacterium tumefaciens. Etapa I, percepción de los compuestos fenó-
licos y adhesión de la bacteria a la pared celular vegetal. Etapa II, modulación de la expresión de los genes de virulencia de la bacteria, (El ope-
ron vir, se encuentra ubicado en el plásmido Ti). Etapa III, formación del complejo de transferencia de T-ADN. Etapa IV, formación de un canal de
transporte en la membrana celular bacteriana. Etapa V, integración del T-ADN al genoma de la célula vegetal, proceso que supone una participa-
ción activa de las proteínas vegetales (Tomado y modificado de Tzfira y Citovsky, 2002).
así como por otras proteínas, principalmen- señales de localización nuclear que permiten dirigirlas y trans-
te VirB4 y VirB11, que tienen actividad de portarlas al núcleo, y por tanto pueden interactuar con proteí-
ATPasa, logrando que cuando se transporta el nas similares a las chaperonas. Por último, la integración del
complejo de transferencia de ADN, se produz- T-ADN al genoma de la célula vegetal no se ha elucidado del to-
ca energía en forma de trifosfato de adenosi- do. Algunos descubrimientos aislados permiten dar una expli-
na, o ATP. Otras proteínas involucradas son cación general. Por ejemplo, se ha encontrado que la proteína
VirB6, VirB7 y VirB9, que forman un canal de VirD2 posee adicionalmente actividad de ligasa (enzima que
transporte en la membrana celular bacteriana une fragmentos de ADN) y de integrasa, mientras que VirE2 pa-
(véase figura 3, etapa IV). rece estar involucrada en el proceso de integración. No se sabe
La entrada del complejo de transferencia si existen otros factores, ni cuál podría ser su actividad, aunque
del T-ADN se ha explicado con base en la se- los últimos reportes indican una participación activa de proteí-
cuencia de aminoácidos encontrada en las nas vegetales en estos procesos, ya sea como proteínas chape-
proteínas VirD2 y VirE2 (que se unen a la ca- ronas o como componentes de la maquinaria celular de repa-
dena sencilla de ADN). Estas proteínas poseen ración de ADN (figura 3, etapa V).
AGROBACTERIUM TUMEFACIENS
COMO HERRAMIENTA BIOTECNOLÓGICA
CUADRO 1.
Ejemplos prácticos del uso de A. tumefaciens como herramienta biotecnológica
una monocotiledónea ornamental cuyo valor Sin embargo, los hallazgos recientes permiten visualizar más
como fuente de compuestos cetónicos con aro- allá de la simple producción de plantas transgénicas y el mejo-
ma de violetas es de gran importancia en la in- ramiento genético, como se discute a continuación.
dustria cosmética y perfumería. Esta planta, sin
embargo, presenta problemas de incompatibili-
LOS NUEVOS HORIZONTES
dad interespecífica, por lo que los trabajos de
transformación abren nuevas posibilidades El poder de la transformación genética va más allá de una sim-
de mejoramiento genético. Estos estudios de- ple herramienta. Se vislumbra como una alternativa para la elu-
muestran el alcance de la transformación gené- cidación del papel de los diversos componentes celulares en
tica mediada por A. tumefaciens, además de que procesos hasta ahora poco comprendidos o estudiados. Por ejem-
plantean la posibilidad de un impacto econó- plo, se ha reportado la transformación genética del hongo fito-
mico en la productividad de dichos cultivos. patógeno Mycosphaerella graminicola, generando mutantes debi-
do a la integración del gen ABC, que normalmente codifica
para una proteína membranal de transporte. Estos transforman-
tes son de gran valor para estudiar y desentrañar los mecanismos
moleculares de patogenicidad del hongo.
Por otra parte, otros estudios han demostrado que una mu-
tante de Arabidopsis thaliana afectada en el gen de la histona
H2A es resistente a la transformación mediada por A. tumefa-
ciens. Lo anterior permite establecer la hipótesis de que las his-
tonas desempeñan un papel crucial en la recombinación ilegí-
tima de la cadena sencilla de ADN en el genoma de las plantas
El poder de la transformación durante el proceso de transformación, al modificar la confor-
genética va más allá mación de la cromatina. Asimismo, ensayos realizados con la
de una simple herramienta. proteína VirE2 y mediante experimentos con bicapas o vesícu-
las lípidas han demostrado que esa proteína se puede insertar en
Se vislumbra membranas artificiales y formar canales específicos para cade-
como una alternativa nas sencillas de ADN. Estos resultados demuestran la función de
para la elucidación VirE2 como transportador transmembranal de ADN de cadena
del papel de los diversos sencilla, y por lo tanto su posible empleo como herramienta en
trabajos de direccionamiento e inserción de ADN en genomas
componentes celulares
de diferentes especies. En relación a este punto, Ziemienowics
en procesos hasta ahora y colaboradores (2001), estudiando las proteínas VirD2 y VirE2
poco comprendidos en la importación del T-ADN hacia el núcleo celular, encontra-
o estudiados ron que VirD2 es suficiente para transportar al núcleo oligonu-
cleótidos, mientras que para secuencias más largas se requieren
ambas proteínas, y concluyen que VirE2 participa activamente
en la translocación del complejo por interacciones específicas
con el canal del poro. Los resultados obtenidos les permiten pro-
poner un modelo en el cual el complejo protegido por VirE2 es
dirigido hacia el PORO nuclear debido a las señales de locali-
zación nuclear de VirD2, reconocidas por un receptor llamado
importina α. El complejo unido a la importina α se dirige hacia
el poro, posiblemente a través de otra importina hipotética, y el
extremo 5’ es dirigido hacia el poro, donde se inicia la translo-
cación del complejo. Este trabajo permite plantear un posible bién células animales y de hongos, con el fin
“aprendizaje” por parte de los patógenos respecto al funciona- de estudiar los procesos moleculares en las
miento de la maquinaria celular de sus hospederos y el modo células, desarrollar la terapia genética, apren-
como ocurre la cooperación entre proteínas procarióticas (de der a expresar o silenciar genes, etcétera. Las
A. tumefaciens) y eucarióticas (del hospedero), por lo que se oportunidades para ampliar los usos de Agro-
puede considerar la factibilidad de transformar genéticamente bacterium como herramienta biotecnológica
otros tipos de células incluyendo las células humanas. son inmensas.
Recientemente, Kunik y colaboradores (2001) lograron ob-
tener células humanas genéticamente transformadas mediante
el empleo de A. tumefaciens, encontrando además ciertos ele-
mentos similares a los que ocurren en células vegetales. Este es-
tudio abre una amplia gama de posibilidades. Por ejemplo, la
terapia genética, que podría llevar a la cura de enfermedades
como el cáncer y el reemplazo de genes defectuosos (como en
enfermedades como hemofilia, fibrosis quística, etcétera).
Colateralmente surgieron otros resultados y otras interro-
gantes no menos importantes, como el hecho de que las célu- Recientemente,
las humanas se hubieran transformado tanto en presencia co- Kunik y colaboradores (2001)
mo en ausencia de acetosiringona, un inductor del operon vir lograron obtener células
de A. Tumefaciens. Lo anterior lleva a plantear la posibilidad de
humanas genéticamente
que las células humanas (y por extensión las animales) tengan
ciertos elementos que les permitan integrar el T-ADN indepen- transformadas mediante
dientemente de la acción de los genes vir. el empleo de A. tumefaciens
Finalmente, un aspecto que permanece poco conocido es la
integración del T-ADN en el genoma de la célula. A pesar de que
VirD2 funciona como ligasa, cabe la posibilidad de que otras
enzimas estén también involucradas en el proceso, como las
polimerasas, enzimas cuya función es convertir en cadena do-
ble la hebra sencilla del T-ADN integrado. Además, el proce-
so en sí requiere de otras proteínas involucradas en el cambio
Bibliografía
conformacional de la cromatina, el corte de las hebras de ADN
durante la integración y el transporte intranuclear del com- Gelvin S. B., (2000), “Agrobacterium and plant genes
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plejo T-ADN. Adicionalmente se ha planteado que la integra-
nual Review of Plant Physiology. Plant Molecular
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Luis Carlos Rodríguez Zapata actualmente es investigador del CICY. Cursó la licen-
ciatura en Biología de la UADY y el doctorado en Ciencias y Biotecnología de Plantas
en el CICY. Realizó dos entrenamientos posdoctorales en el Instituto de Biotecnolo-
gía de la UNAM y en la Universidad Estatal de Nueva York en Stony Brook. Su interés
se centra en la transformación de cultivares de plátano. lcrz@cicy.mx