Bioquímica: Tema 3

1. Proteínas: Biomoléculas orgánicas más comunes en los seres vivos. Hay más abundancia que
de genes debido al splicing alternativo. Está formada por aa que se unen adquiriendo una
estructura tridimensional.

El proteoma es el estudio de la expresión de las proteínas y la proteómica es el conjunto de

proteínas.

2. Aminoácidos (aa)

-Son anfóteros, es decir, pueden actuar como ácido y como base.

Al PI se llega cuando: 1) la concentración catiónica sea igual a la aniónica o 2) cuando predomine

la forma neutra.

-El C(alfa), el cual se une covalentemente al H2N y al COOH,

es asimétrico excepto el de la glicina, lo cual genera que
sean esteroisómeros (solo cambia la distribución espacial
de los grupos) moleculares especulares no superponibles
o enantiómeros (desvían la luz polarizada, pudiendo ser
dextrógiro (D) o levógiro (L))

Los aa que lo forman pueden ser;

-Alifáticos: Cadenas hidrófobas (Ej; glicina)

-Polares: Ej; metionina

-Aromáticos: Tienen anillo aromático (Ej: triptófano)

-Cargados, que pueden ser: Lisina (positivo) que tiene un grupo amino extra o Aspartato
(negativo) que tiene un grupo hidroxilo extra.

Los aa se pueden clasificar en:

-Esenciales: no podemos sintetizar, por lo que los ingerimos en la dieta.

 -No esenciales: los podemos sintetizar a partir de rutas metabólicas a partir de
biomoléculas

-No estándar: se forma a partir de un esencial y otro grupo. Ejercen 1 función especial

3. Enlace peptídico

En él se implican 4 átomos y se pierde una molécula de H2O. El primer aa es el amino-terminal

mientras que el segundo es el carboxi-terminal.

Propiedades:

-Es covalente, por lo que es resistente a hidrólisis.

-Direccional: crece por el extremo C-terminal

-Carácter parcial de doble enlace: Al estar cambiando de lugar continuamente, los 4

átomos son coplanarios por la rigidez que otorga. Como consecuencia de este carácter, tienen
también una estructura tridimensional particular.

-Rotación de lo enlaces N-C(alfa) y C(alfa)C

4. Niveles estructurales de las proteínas

Estructura y función siempre ligadas.

A) Estructura primaria: secuencia de aa. Contine toda la información para que una proteína
adquiera su conformación nativa.

B) Estructura secundaria: Se estudia el esqueleto peptídico; la estructura tridimensional pero sin

tener en cuenta las cadenas laterales

-Hélice alfa: la cadena se enrolla sobre sí misma adquiriendo forma de Hélice dextrógira.
Las cadenas laterales quedan hacia fuera y se generan PDH entre los CO y NH intracatenarios, lo
cual da estabilidad. El extremo amino-terminal queda de forma positiva y el carboxi-terminal
negativo.

-Hoja en B: estructura más distendida con forma de Zigzag, cuyas cadenas laterales son
perpendiculares al plano. Formada por varias láminas o hebras B. Puede tener dos formaciones:

-Formación paralela

-Formación antiparalela: es más estable porque la distancia entre los H y los O

es menos y por tanto es más común.

C) Estructura terciaria: Distribución tridimensional de la cadena polipeptídica donde Lo tenemos

todo en cuenta.

-Determinada por la A

-Conformación nativa biológicamente activa

-Interacciones entrecadenas laterales de residuos alejados: Se producen interacciones

entre aa que en A quedaban alejados (interacciones de largo alcance)

Interacciones covalentes:
-Puentes disulfuro

Interacciones no covalentes:
-Puentes de Hidrógeno(PDH): entre cadenas laterales de distintos aa o entre aa y _______

-Puentes salinos, que son fuerzas electrostáticas.

-Interacciones hidrofóbicas: entre cadenas laterales de aa hidrofóbicos

-Fuerzas de Van Der Waals: Son débiles y se dan entre distancias cortas.

Dominios: Modelos de estructura empleados para definir a las proteínas, pues se repiten en
ellas. La presencia de un dominio puede relacionarse con la función.
Dominio no es lo mismo que estructura terciaria; una Estr. Terc. puede tener 1 o varios domin.

D) Estructura cuaternaria: Interacción entre diferentes subunidades proteicas. Se estabiliza

mediante las mismas interacciones que en la terciaria y esta aparece en proteínas formadas por
más de una cadena polipeptídica.

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-Proteína monomérica: formada por una única subunidad

-Dímero: heterodímero (dos subunidades diferentes) u homodímero (dos sub. iguales)

4. Clasificación de las proteínas según su estructura

-Globulares: Combinación de helices alfa y hojas B. 30-40% son los lazos que conectan las
estructuras secundarias.

-Fibrosas: Alargadas. Formadas 100% por Hélices alfa u Hoja B (o sea, una única estructura
secundaria)

*Alto contenido de aa hidrofóbico, Función estructural, son extracelulares, carecen de E

terciaria porque no hay interacciones a largo alcance, sí tienen E cuaternaria porque diferentes
cadenas polipeptídicas con E. secundaria interaccionan entre sí.

Ejemplos: Alfa-queratina: presentes en vertebrados.

-Hélice dextrógira: se van uniendo dos hélices dando lugar a un

superenrollamiento de 2 cadenas. Se forman parejas dando lugar a protofilamentos, los cuales
se agrupan formando la protofibrilla.

-La diferencia entre la queratina de las uñas y del pelo se debe a la presencia de
puentes disulfuro.

Colágeno: La más abundante en seres vivos.

-Hélice alfa levógira. 3 fibras de colágeno forman el tropocolágeno son

superenrollamiento dextrógiro.

-Cada 3 aa hay una glicina: La glicina es importante porque al ser pequeña su

cadena lateral, las fibras de colágeno se pueden enrollar siendo así su anchura omogénea.
Ademas, el H de la glicina puede formar PDH con otros de la fibra.

5. Desnaturalización proteica

Pérdida de la estructura secundaria, terciaria o cuaternaria --> pérdida de la función. Se debe a

un aumento de la temperatura, cambios de PH (porque los aa son anfóteros y cambiar el PH
supone un cambio importante), agitación...
No suele perderse la estructura primaria porque los enlaces peptídicos son muy fuertes, aunque
pueden perderse debido a la presencia de las proteasas.

-Reversible (renaturalización): muy difícil

-Irreversible: lo más común.

6. Proteínas en la sangre (mioglobina y hemoglobina)

-Sangre: elementos formes (glóbulos rojos, blancos y plaquetas) + proteínas

-plasma: sangre sin elementos formes

-Suero: sangre sin elementos formes ni fibrinógeno (precursor de la fibrina y responsable ede la
formación de coágulos de sangre)

-Proteínas plasmáticas: secretadas a la sangre, no derivan de lesiones o alteraciones celulares,

ejercen su función en el Sistema vascular y presentan mayor concentración en el plasma

-proteinograma: Representación de la separación electroforética de las proteínas plasmáticas.

Grupo prostético: Elemento extra que está en la proteína y que ejerce una función determinada.
Encontramos el Grupo prostético hemo, el cual está dentro de la proteína y el entorno donde se
encuentra es hidrofóbico. En esas condiciones, el átomo de hierro que está en el centro, está en
estado ferroso, teniendo un índice de coordinación de 6

Si el Fe se oxida a estado férrico su índe de coordinación cambia y no puede unirse al oxígeno. Si

esto sucede tendríamos una hemoglobina que no es funcional.

-Cuando la hemoglobina tiene unida un oxígeno: oxiemoglobina.

-Cuando no lo tiene: desoxihemoglobina.

-En el caso de que el Fe esté en estado férrico (FE3+): metahemoglobina.

-Hemoglobina: Tiene 4 GPH. Muestra cooperatividad, pues está formada por más de una
subunidad (proteína alomérica), lo cual hace que sea un buen transportador de O2

-Mioglobina: Solo tiene un GPH. No muesta cooperatividad al ser monomérica, por lo que no es
un buen transportador de O2

Tipos de hemoglobina:

-HbA1: es más abundante en adultos y tiene dos subunidades alfa y dos betas.

-HbA2: 2% en adultos y tiene dos subunidades alfa dos betas.

-En el feto: Predomina la hemoglobina fetal, que tiene 2 subunidades alfa y dos gamma.

En la edad postnatal la hemoglobina fetal disminuye y aumenta la HbA1

Alteraciones patológicas de la hemoglobina

-Hemoglobinopatías: alteración en la estructura de la Hb

*Anemia falciforme: Mucha incidencia en países africanos. La cadena alfa sufre una
mutación, pues hay una tinina en lugar de una adenina. Esto produce un cambio en un aa, pues
pasa de ser Glu a ser Val. Este cambio hace que las proteínas de la Hb se agreguen y precipiten.
De este modo tenemos glóbulos rojos que se pueden llegar a alisar. Por eso se suele llamar
también anemia hemolítica.

Estas personas son resistentes a la malaria y, además, es una enfermedad genética recesiva, por
lo que hay que ser homocigóticos para ese gen para desarrollarla.

-talasemias: disminuye la velocidad de síntesis de alguna de las cadenas que forman las Hb. La
estructura de la Hb no sufre alteraciones. Existen diferentes grados. Es genética, pero de forma
indirecta, pues se debe a un error de traducción o transcripción del gen. Se tiene cansancio o
fatigas

*Alfa-Talasemias: HbF y HbA. No se sintetizan cadenas alfa. Para solventar el problema

se forma tetrámeros de cadenas _______

*Beta-Talasemias: HbA A nivel estructural es imposible que se formen la unión de los

tretrámeros, lo cual da lugar a una proteína no estable. Para solventar el problema seguimos
manteniendo la expresión de las cadenas gammas en la edad adulta, o sea, mantener la HbF

Inmunoglobulinas: 20% de las Proteínas plasmáticas. Son las únicas que no se sintetizan en los
hepatocitos, sino en los linfocitos B. Existen diferentes tipos, teniendo todas en común la
estructura:

-Dos cadenas ligeras

-Dos cadenas pesadas(unidas entre sí mediante puentes disulfuro, interaccionando con una de
las cadenas ligeras con puente disulfuro)

Tipos de inmunoglobulinas

Im: se genera como consecuencia de una respuesta a un antígeno

IG:

IH:

IA:

IE: