Reportes de Avances en Investigación 2017

CLASIFICASION DE LA ORQUIDEA CATTLEYA TRIANAEI Y SUS

VARIEDADES MEDIANTE SU PATRON COLORIMETRICO

Manuel G. Forero1, Carlos E. Beltrán2 Armando Troncoso1

2 Facultad de Ciencias Naturales y Matemáticas. 1 .Facultad de Ingenieria.

Palabras claves: Cattleya trianae, imágenes, colorimetría.

La familia Orchidaceae posee el mayor número de especies de cualquier familia del reino vegetal. (25.000 -
30.000) y ha recibido gran atención debido a su enorme valor económico y social comparado con otras
especies. Hay evidencia de que las orquídeas están sujetas a un alto peligro de extinción, ya sea por causas
naturales o antropogénicas. En años recientes muchas especies parecen estar en un nivel crítico pues las
estrategias de conservación de las mismas son complicadas debido a su ciclo de vida complejo y éstas no
pueden llevarse a cabo sin un estudio poblacional.
Sin embargo, la mayor parte de las investigaciones sobre orquídeas se han limitado a estudios de población o
caracterización de especies terrestres o de hábito epifito y litófico de forma visual. Su distribución se restringe
a la cuenca alta del río de la Magdalena, especialmente en los departamentos del Tolima, parte del Huila y
Caquetá y en menor extensión en Cundinamarca, en altitudes entre los 600 y 1940 metros.
Las caracterizaciones visuales hechas a Cattleya trianaei, la describen con pétalos, de color lavanda, donde
éstos son dos veces mayor que los sépalos. Hay variaciones de color dentro de la especie, se conocen entre
otras las siguientes variedades: estándar o tipo, semi-alba, alba, concolor, amesiana, coerulea, sangre toro o
rubra y con splach; diferentes todas entre sí, en relación a la intensidad o distribución del color en los pétalos y
más generalmente en el labelo. Esta caracterización y clasificación taxonómica de las orquídeas hecha en la
mayoría de las veces en forma visual por su patrón y morfología, requiere también de otros tipos de
caracterización, mediante otra clase de métodos objetivos, tales como los que pueden realizarse empleando
técnicas basadas en el procesamiento digital de imágenes y el reconocimiento de patrones. Luego de una
exhaustiva revisión bibliográfica, no se encontró referencia alguna en donde estas técnicas hayan sido
utilizadas para la caracterización; como por ejemplo en el labelo de la Cattleya trianaei. Por lo tanto, se
propone desarrollar un método para identificar Cattleya trianaei estándar o tipo y sus variedades utilizando
técnicas de procesamiento de imágenes y reconocimiento de patrones.

Planteamiento del problema

La identificación de algunos tipos de plantas, flores y semillas que presentan alta variabilidad, como las
orquídeas, se ha realizado en algunas variedades mediante metodologías de genética molecular (Musselman,
1989, Joel, Portnoy & Katzir, 1996, Paran, Gidoni & Jacobsohn. 1997), quimiotaxonomía (Endo & Ohashi,
1997), o bioquímica (Velasco, Goffman & Pujadas-Salva, 2000). Otras de escaso tamaño (como las orquídeas
pertenecientes al género Orobanche) pudieron ser identificadas alternativamente por la ornamentación de la
cubierta (Joel, 1987). Estas dificultades plantean el uso de metodologías de apoyo como el análisis de
imágenes.
Estos estudios son subjetivos, pues el análisis se hace únicamente de forma visual. No se encontró en la
literatura algún estudio que emplee técnicas objetivas, independientes del usuario y por lo tanto reproducibles,
dado que los estudios anteriores dependen del concepto visual de cada especialista. Por lo tanto, el estudio
propuesto basado en el análisis colorimétrico a partir de fotografías del labelo bajo condiciones controladas de
iluminación es un paso necesario y novedoso para la caracterización del labelo de C. trianaei que puede ser
extendido en el futuro al estudio de cualquier variedad de flores.
Objetivo General
Caracterización de los labelos de Cattleya trianaei de variedades endémicas del departamento del Tolima
mediante la utilización de técnicas de procesamiento de imágenes y reconocimiento de patrones.

Objetivos Específicos
 Elaboración de un protocolo para la toma de muestras y fotografía de los labelos de Cattleya trianaei
y constitución de una base de datos.
 Obtención de perfiles significativos de labelos de Cattleya trianaei.
 Clasificación según la colorimetría del labelo de Cattleya trianaei tipo y variedades endémicas del
departamento del Tolima.

Metodología

Para el desarrollo de la investigación fue necesario tener acceso a la población de orquídeas objeto
de la investigación, afortunadamente la Universidad de Ibagué actúa como reserva natural para las
orquídeas, lo cual nos permitió poco a poco reunir muestras poblacionales de la Cattleya trianaei.
Con el fin de establecer un protocolo para la toma de muestras, se fotografiaron labelos de orquídeas de las
variedades Concolor, Concolor Schroderae, alba y tipo. Las fotografías fueron adquiridas en formato RAW,
dado que no introduce pérdidas por compresión y almacena toda la información recogida por el sensor de la
cámara. Las imágenes fueron tomadas con una cámara Canon 7D, la cual tiene una resolución de 18
megapíxeles, utilizando un lente Canon EF 100mm f/2.8 Macro USM empleado en la investigación biológica
para documentar los estudios en especies vegetales permitiendo apreciar detalles que a menudo pasan
desapercibidos y permitiendo adquirir imágenes a distancia cercana con baja distorsión cromática y enfoque
en toda la imagen. Las fotografías fueron adquiridas usando la mínima sensibilidad disponible (iso 100) para
minimizar la amplificación del ruido. La apertura fue ajustada de manera que toda la región de interés quedara
enfocada, siendo en general de f/11 o mayor y la velocidad de disparo fue fijada de manera que la orquídea
apareciera bien iluminada evitando la saturación del histograma y utilizando el máximo rango dinámico
disponible. La velocidad en general se ajustó en un valor de 1/8 seg por lo cual se empleó un cable disparador
para evitar el máximo movimiento de la cámara durante la adquisición de las muestras fotográficas. Se
probaron varios valores de apertura y velocidad, además de técnicas de iluminación en ambiente controlado
hasta que se obtuvieron imágenes adecuadas de buena calidad. Se encontró que la mejor iluminación se
daba con luz natural, sin exposición directa del sol, usando para ello un parasol. Fueron necesarias 58
imágenes para ajustar el protocolo y garantizar que en todos los casos se adquieran imágenes de buena
calidad que pudieran ser utilizadas para el estudio.
Con el fin de clasificar e identificar cada variedad de C. trianae, se estudiaron algunos algoritmos de
clasificación más populares, entre ellos se decidió usar para este trabajo una máquina de vector de soporte,
conocida por su sigla en inglés como SVM.
Para entrenar la SVM, se utilizaron las 26 muestras obtenidas por cada canal como descriptores de
características. De esta manera, se formó un vector de descriptores de 78 características, al que se adiciono
un valor más que indica la variedad a la que pertenece el vector de entrenamiento (grupo 1, 2, 3, 4).

Resultados parciales
Como se mencionó en la sección anterior, se calcularon las correlaciones entre los perfiles. Tabla presenta las
correlaciones promediados entre variedades C. trianae. y el perfil promedio de los valores de cada uno, donde
se observa que se obtiene la mayor correlación entre el perfil de la media con los perfiles de sus variedades.
Estos valores permiten verificar que el eje central del labio es una opción viable para una clasificación y la
identificación de las variedades de área C. trianae.

A continuación; Se presenta la tabla de valores promediados de las correlaciones entre variedades de C.

trianae y el perfil promedio de cada una de ellas, en la que se observa, que las más alta correlación siempre
es entre el perfil promedio con los perfiles de sus respectivas variedades, con estos datos se verifico que el
eje central del labelo es una zona viable para realizar una clasificación e identificación.
 Concolor
Orquídea Tipo Alba Concolor
Schroderae

Tipo 0.901 0.209 0.473 0.659

Alba 0.1993 0.955 0.768 0.675

Concolor 0.462 0.827 0.899 0.718

Concolor
0.639 0.732 0.720 0.9
Schroderae

La figura muestra las gráfica de los vectores de descriptores de la variedad estándar o tipo obtenidos, donde
la curva representada con asteriscos negros corresponde al valor promedio de esta variedad.

Referencias

-Arditti, J. 1967. Factors affecting the germination of orchid seeds. Botanical Review. 33:
1-97.
-Berggren, G. 1981. Atlas of Seeds and Small Fruits of Northwest-European Plant Species
(Sweden,
-Endo, Y. & H. Ohashi.1997 Cladistic analysis of phylogenetic relationships among tribes
Cicereae,
-Kruse, M. 2000. The effect of moisture content on linear dimensions in cereal seeds
measured by image analysis. Seed Science and Technology. 28: 779-791.
-Maravall, D. 1993. Reconocimiento de formas y visión artificial. Madrid. RA-MA Editorial.
-McKendrick, S., J. Leake, D. Taylor & D. Read. 2000. Symbiotic germination and
development of myco-heterotrophic plants in nature: ontogeny of Corallorhiza trifida and
characterization of its mycorrhizal fungi. New Phytologist 145:523-537.
-Musselman, L. 1989. Orobanche ramosa and Orobanche aegyptiaca in Flora Palestina.
Progress in -Orobanche Research. K. Wegmann und L.J. Musselman Editors,
Obermarchtal, FRG.
-Sako, Y., E. Regnier, T. Daoust, K. Harrison & M. McDonald. 2001. Computer image
analysis and classification of giant ragweed seeds. Weed Science 49: 738-745.